4HT3A

The crystal structure of salmonella typhimurium tryptophan synthase at 1.30a complexed with n-(4'-trifluoromethoxybenzenesulfonyl)-2-amino-1-ethylphosphate (f9) inhibitor in the alpha site, internal aldimine
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
268
structure length
268
Chain Sequence
MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLADGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLSRSGVTGAENRGALPLHHLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASRA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
publication title Allostery and substrate channeling in the tryptophan synthase bienzyme complex: evidence for two subunit conformations and four quaternary states.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tryptophan synthase alpha chain
total genus 102
structure length 268
sequence length 268
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2012-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4ht3A00
1BEUA 3QSTA 2YYUA 3TC7A 4O1DA 4XBSA 2QKFA 4JD4A 2QR6A 3NQMA 2CFFA 2VELA 3W70A 5G5IA 4HSOA 3UY8A 4Q32A 3S1VA 2QAPA 2JBMA 1TPUA 1H60A 5F1UA 3BO9A 3UWZA 3ELFA 5K4XA 1YPFA 4FX7A 2FPVA 5U7SA 1QDSA 3G18A 2OT1A 2GJNA 1SZGA 1GVRA 1XBVA 3W1PA 3DFNA 3ATYA 1O5XA 2A6LA 1F73A 3O8AA 2E77A 3P74A 4AHOA 1B4KA 1LBMA 3QMSA 4O18A 1TV7A 4GBUA 2NUWA 3TSMA 2HS6A 1FWNA 2VENA 1J5TA 1K8ZA 3VCRA 3STGA 2E6DA 5EBUA 3W7EA 1NVMA 2GVLA 3B03A 3CHVA 1RQBA 3GNNA 1GWJA 1Q45A 4Y6GA 3BARA 2GQAA 4L4LA 3LCIA 6ALDA 3B06A 1IGSA 3PM6A 1H61A 3RF9A 5BRBA 1FDZA 4GUJA 3W1LA 2X1UA 4UMCA 4O52A 4LVAA 5AB3A 4CQ9A 1IXNA 4N9CA 3RLUA 2R14A 3O06A 3YPIA 5CZSA 4LVGA 1T99A 3PY2A 2NWSA 3EWXA 3NPVA 3W75A 3SSJA 4CCEA 5IM51 1I2OA 1KM0A 1Q6LA 5GVJA 2C6QA 3TSDA 4AWUA 4C1KA 2W79A 2QCFA 2WSRA 3IEBA 1VGAA 4HNUA 3MI3A 1OHLA 2OJPA 4O15A 5HQEA 1QOPA 3LV6A 1YPIA 2OMAA 5D32A 1ICPA 3O6DA 1LROA 4Z1BA 4JDBA 2YW4A 3LHVA 2Z6IA 2AQWA 4WY0F 1TQJA 3LCLA 1K7XA 3DI1A 4QM1A 4UMAA 3O05A 4OQVA 5EL1A 1KFCA 3W7CA 5TQLA 3B04A 4HT3A 3HB9A 3KX6A 3FS2A 3H53A 4IMGA 3CT7A 4LRSA 1YDOA 5IBXA 3GNDA 2NXGA 2O7QA 3FYPA 5LHEA 1ZJIA 1ZENA 3P80A 3W71A 5IBXC 4LS1A 3T40A 3GKFA 1F05A 4CQAA 3E02A 3RK8A 2V9DA 3W76A 1MXSA 2QCDA 5I3JA 2ZTKA 3PUDA 3Q37A 3BW2A 4POCA 1LCOA 4N6EA 2G97A 4H6KA 3Q94A 1R46A 1RQEA 3NQCA 2WNZA 4JTHA 2CZDA 1GZGA 2ISVA 4QSHA 4H4IA 3JS3A 1A50A 4LUJA 3LHZA 1FX6A 4WUIA 2DORA 3W7HA 1R47A 3WJZA 3TIMA 3G0SA 1TRIA 2VEKA 5G2WA 1W3IA 4U28A 4OBTA 2ATMA 4GNJA 1MZHA 4DBDA 5HWMA 4JTGA 1GG1A 4IUOA 4RR4A 2Z0IA 1JRCA 2RKXA 1AMKA 4IQLA 4LVBA 4Z08A 4ORIA 1P0KA 1G7VA 3TMLA 4MFEA 1LDCA 5AHIA 1TIMA 3DXIA 5G2IA 1DJQA 3MP5A 3UD6A 3LV5A 1GEQA 2B7OA 4PA8A 3S5YA 3EXRA 3HPZA 5CZJA 3C56A 2CLEA 1MEWA 3BVJA 1BWKA 1KTNA 2YXGA 3M5VA 2FB2A 2BX7A 3TQKA 4O4VA 2YYTA 3E0IA 1MEHA 4JTJA 3P84A 3STFA 4GJ1A 1KBJA 2Y6ZA 5I3GA 2RDWA 1KLZA 3MYOA 2ISSA 3CIXA 4UNLA 1JRBA 2ABAA 2V2DA 2VC6A 5AHNA 3N73A 3GLCA 2E6YA 2OZ0A 3SY5A 4RLIA 3BGGA 2FJKA 3DGRA 3N9RA 2RH9A 5HUOA 1KFLA 2FPYA 3PSWA 2Q3OA 3I6RA 1K7EA 3LXAA 3V1PA 1UCWA 4ORMA 3NG3A 4FX8A 4FNPA 4JGDA 4NVTA 2X1SA 2YDAA 1G4EA 3LXCA 1W0MA 4EOUA 4A3UA 3OA3A 5D2XA 4ZMGA 3BGJA 3A5FA 1XBXA 3UXAA 5KTLA 1U5JA 2R91A 5BW6A 3OIXA 3HG5A 3C2RA 5FF0A 1SW7A 3K30A 1ME9A 4NJIA 2ZZ7A 2OT0A 4TX9A 1WXJA 4QAIA 2CLHA 3G1YA 3NDOA 2CLFA 3NL3A 2X1RA 2ZRWA 3A22A 1M7OA 5HWNA 1OFPA 1RZMA 2VFHA 5H2ZA 1U83A 1VHCA 4N2YA 3N14A 2VFEA 2DP3A 3MP3A 4PH6A 1W5QA 5F2GA 1PVNA 5F2MA 3W7DA 5HR6A 5E0KA 2X2GA 1BWLA 1SO5A 4HIBA 4CCDA 2ZZ4A 4I7UA 5DCDA 4NJGA 3UPBA 1O4UA 4JTIA 3G1VA 2G95A 4MYXA 1JCJA 1JJKA 4I7VA 3TCEA 4TMCA 5BNKA 5FEPA 5AC8A 4FNRA 1D9EA 4HN4A 3EWWA 5U4NA 2QCCA 2WV8A 1OX4A 5I3FA 3LBCA 3BW3A 3GXPA 4LNYA 4KFNA 3MI2A 3OEXA 3TSBA 3F03K 1FWTA 4O12A 1CX9A 2Y61A 3WJYA 4AHQA 4RXFA 2A7PA 2TYSA 1TPVA 1VS1A 2H8XA 3W9ZA 5MHBA 1K02A 4N4QA 4X9SA 1GVSA 2TRSA 3TMQA 2XN1A 1B3OA 4O11A 1KV8A 3TROA 1FCBA 4AVFA 3AO0A 1ICQA 2NWRA 4DF1A 1N7KA 2B7PA 2ZQ0A 5C5YA 3NL5A 4UR7A 1EWEA 2ZA3A 3BW4A 1GVQA 3I7RA 4GUGA 4YMZA 2EGZA 3QFEA 4WOQA 3PG9A 2HS8A 3W3OA 1KTBA 4JN6A 2QCNA 4JTKA 4QITA 1QPNA 1O60A 2EKCA 2VOMA 1H7NA 3VFLA 4O14A 4QJ1A 2DZTA 3S8HA 2VEPA 3FJLA 3IIPA 5AHMA 2QCDB 4LC6A 3GDTA 4MJMA 1WA3A 1LZOA 3P5ZA 3NZ1A 3NAVA 4FEZA 3PR2A 5DY2A 3W1RA 3LHUA 3MWAA 4C1LA 4WQ6A 5DN1A 1ZY9A 1PCKA 2GJLA 4MJZA 1TO3A 1JULA 2ZZ3A 3IIXA 1SZFA 4M19A 1PV8A 4EIVA 2CLMA 4AEOA 2WO5A 1VCVA 5TBOA 1Z42A 3E96A 1AW2A 3LRMA 4LWWA 4IMFA 4IX2A 4XQ6A 1H62A 4A22A 4HKPA 5CSRA 3RFAA 1H50A 2GQ9A 3C2VA 3W1AA 4EF9A 2Y85A 1TTJA 1I2QA 3P8IA 2P10A 3G3MA 4MY8A 4WXZA 5EKYA 4ALDA 4EVZA 1QMLA 2X30A 3C52A 4QNWA 4M6PA 5BOOA 5HWJA 4NXKA 3PBVA 1TPEA 3W2UA 3T55A 4JTSA 1O5KA 1YTDA 1EP3A 1G4PA 2J9YA 5L9FA 5LSMA 1L2UA 1FCVA 4O1AA 5J5DA 1NFBA 3TJLA 3QM3A 5K7JA 3DKJA 3MUXA 1CW2A 4MLRA 4DXVA 1QO2A 3GKAA 2V82A 1KTCA 2C18A 4IGHA 3GX9A 1P1XA 4L4MA 3MJYA 4RK8A 3SI9A 5FEZA 2KZHA 1H1ZA 3L2IA 3MHUA 3F4WA 4UTJA 4DEFA 3B0VC 1QOQA 1SO6A 2ZZ2A 3IVUA 4FXRA 1DKWA 5G1TA 4LY8A 5C2XA 1DL3A 3DHFA 3I7SA 3M7WA 3W2LA 2NUYA 1JCYA 1W5MA 3U8GA 3TXZA 1LOLA 5LHFA 2WKJA 4O8RA 3HF3A 1IXQA 3T78A 8TIMA 5I3KA 3RMJA 3U2OA 1ZALA 2H3BA 3DH7A 5D2VA 3PBUA 4AAJA 1H1YA 3G8EA 5DLCA 3U6WA 2QEZA 1GTEA 3DFTA 4HSNA 3CWNA 3OVQA 2CU0A 3W6YA 4BI6A 1OFQA 1I8JA 3PC0A 3EEGA 3FIGA 3B0PA 1VLWA 1I2PA 1SPQA 2F7FA 5F2IA 5HINA 3I68A 1SFJA 1A5SA 3GB6A 3SZ8A 3PBWA 3W83A 1KM1A 3WJWA 5CKSA 5F4WA 1AG1O 3QPZA 1TTPA 3C3NA 1Q3NA 3I7QA 2VFDA 3EB2A 1H63A 4UFJA 1DJNA 1LOQA 1XBZA 3M5YA 3LOTA 1ML1A 5DELA 2H90A 3C2FA 1LRTA 3R13A 4O53A 3VI2A 4GRSA 4IWWA 4I7WA 3T7VA 4HHPA 3W2JA 3MBFA 3JRKA 1DQWA 3MO7A 3F4NA 4K7YA 1WBHA 2QUUA 5I3HA 2GOUA 2VEIA 2EPHA 3IVSA 1OFBA 4Z0JA 4WZHA 1L6WA 3W7JA 1Z44A 1Y0EA 1W31A 4S2CA 3A23A 2B4GA 4WY0A 2DZWA 1J4EA 3HG3A 5HJLA 2AGKA 2GVJA 3W88A 2RDUA 2DZPA 3TNOA 3QZEA 4YCOA 3GAYA 2E6AA 1OK4A 1OX4B 3WK3A 3PG8A 5LNRA 5D04C 4CNPA 4ZQCA 3CPRA 4M7TA 4NNAA 5K9CA 4DPQA 3NQEA 1F76A 1R2TA 2PRHA 2CZ5A 1W5NA 2VXNA 5DY3A 4XZ9A 5DBTA 3SR7A 3TAOA 4NZFA 4WOZA 4A21A 1Z41A 3MYPA 2FQIA 1LBFA 1OG0A 1OF8A 4XUGA 4UTUA 1JR1A 2V5LA 4UTHA 4JX5A 3DAQA 1G69A 3QC3A 2B7QA 3SGZA 3INPA 1QPQA 1IIGA 2P0OA 2TSYA 4FNUA 1P5BA 1T0OA 1LORA 5D33A 1TPWA 4PL2A 3W7QA 5CPLA 4AXKA 1G4SA 3CEPA 4UFHA 1KM6A 2ABBA 4M5PA 3W84A 3OVPA 1DHPA 3SECA 1WQ5A 2G96A 4LS2A 3WJSA 4RZ6A 4MVAA 4RZ4A 3LBMA 4UTKA 2ZTJA 1EP1A 1G67A 4PTNA 5F1VA 2Y7DA 2FPTA 2Z6JA 4WXYA 4A29A 4JX4A 5BMXA 2O7SA 1T96A 1ICSA 5AYZA 3JR2A 4R33A 3HO8A 2LLEA 1SSDA 2QDGA 3DI0A 2DZVA 3N2MA 1SU5A 2PURA 1RPXA 1THFD 3CLMA 5E1QA 3KRSA 5KITA 3LCFA 1QWGA 4NT0A 5CZ0A 1OVDA 1SZEA 3S5ZA 3VE9A 3IGSA 3EWYA 3T4CA 4OE7A 2C14A 1FUYA 2EAWA 4MY9A 1M7PA 3IV3A 3GDLA 4ADSA 3CU2A 2GUUA 3MI6A 4M6VA 4MUZA 1F5ZA 3T44A 3G3DA 2Y7GA 2C19A 3TU9A 3VNDA 4ZZ9A 3RU6A 1KM5A 3P62A 4N4PA 2A5HA 3BLEA 3NR0A 3KVJA 1FCUA 3QQ1A 4UC5A 2A0NA 3CWOX 3W07A 3EKLA 5EYWA 4NJKA 3W1MA 1EA0A 2F84A 2JKEA 3IIZA 3PB2A 2FB3A 3G1XA 1YTKA 5EMUA 5AHLA 4LVDA 3W1QA 3L5LA 5K2ZA 1TB3A 1T8XA 1SR9A 2PRMA 2QCLA 4QNEA 1L6YA 2V8ZA 3PUEA 5AHFA 1AL7A 4W9TA 4BI7A 1RQHA 5C6MA 2NXIA 2Q8LA 1S5WA 3CQ0A 2E68A 4LS0A 3BLIA 4CNNA 1LOSA 3PSVA 3THQA 5LGZA 4Z1AA 1IXOA 3M1ZA 1ALDA 2QF7A 2Y88A 4EWND 4IX0A 3ABSA 4GE8A 1MSSA 1P0NA 1VYSX 3UWUA 1I2RA 5K4ZA 3S1WA 2CLKA 1GT8A 5FI8A 1SUXA 4O50A 4KKXA 4E2DA 1VYPX 4PODA 3C8FA 4IMEA 2EF9A 3QF0A 3IVTA 2YX0A 1R2SA 2H8ZA 1IF2A 4HPXA 3PF3A 2A85A 5CZTA 2QUVA 3TFXA 1G4TA 3EWUA 3GYEA 3USBA 2RFGA 1K7FA 2ALDA 3OVRA 5D05A 5K3VA 3UWYA 3UY7A 4P61A 1TPB1 4OWGA 4PL1A 4O4WA 2ZRYA 1W37A 4KWWA 2QDHA 3CC1A 4TIMA 4X2RA 3LXBA 4ZQRA 3SGUA 1QPOA 3LTYA 1UUMA 5BMWA 1W5OA 3LB0A 4XTDA 4K8HA 4G1KA 3ZWSA 4O17A 4UNKA 4ZVJA 3EWZA 3UYCA 4Y90A 2A1YA 1JCXA 3L0KA 1H7PA 1VQTA 2NX9A 4JNMA 2R8WA 2Q8ZA 5D2TA 1ADOA 3THAA 4O1CA 4OHQA 2WJZA 3TA6A 1W1ZA 3C2EA 1B9BA 3ZS4A 4LUIA 2A4AA 2VFIA 3L0NA 3W1XA 2RHGA 3W1NA 3WK2A 2QCEA 1N55A 1BKSA 2C16A 4O54A 1A5CA 1AW1A 1LLZA 3TR2A 1EIXA 2Y62A 3KRUA 3GXNA 4K36A 3HQ1A 4AF0A 1PE1A 3DFSA 3QH2A 3NL6A 4WY0B 1X1ZA 1D3HA 2WSYA 4GXMA 2DZUA 3DENA 5FF2A 2WNQA 1XKYA 4AMAA 4R34A 3FJ6A 1ME8A 1TTIA 2GPTA 4RX0A 3W7LA 2ZRUA 4LV4A 3M47A 3QW4B 4HNNA 1GVOA 1NF7A 2E1DA 2H6RA 4OU1A 1RR2A 1OABA 3L68A 4YLWA 3ZR4A 1XBYA 1DVJA 3TH6A 1DBTA 1JCMP 2YR1A 3LTPA 3M44A 3P8JA 1HL2A 3O6YX 4ICNA 3C4UA 2ZA1A 3G22A 1QPRA 1B4EA 3LCXA 4DBEA 4MOZA 4JIPA 2ISWA 1YXDA 4BR1A 1SZNA 3E12A 3P5YA 4DF2A 1PL9A 5DXYA 4DO5A 3BG3A 3OG3A 4JY9A 4M7SA 1A5AA 4DQWA 3UPWA 3W7OA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3RYS A;  3MMD A;  3QST A;  3URB A;  3REQ B;  3U2E A;  1JAE A;  4FLR A;  4XBS A;  4Z42 C;  3UY8 A;  2YBV A;  1TPU A;  1VB9 A;  5F1U A;  2XH4 A;  4HU0 A;  3AI0 A;  1AJ2 A;  4LAN A;  4FX7 A;  5FJT A;  1WUE A;  1EH9 A;  3G18 A;  2E67 A;  3WH6 A;  3AU2 A;  1RCQ A;  2A6L A;  1CDG A;  2DFA A;  3VNY A;  4W86 A;  3OLG A;  2QMJ A;  1F07 A;  1LQA A;  3P2V A;  4LNC A;  2PAJ A;  2E6D A;  5CGM A;  3U7B A;  4EE9 A;  2XIB A;  3SCN A;  1EEX A;  4QE1 A;  5AC5 A;  1WZM A;  2OLH A;  1GWJ A;  4C7G A;  2CLP A;  4E5T A;  3UG8 A;  4P8X A;  2QF8 A;  1E72 M;  3PZI A;  4Q4S A;  4GUJ A;  2V3F A;  4UMC A;  4CEX C;  2VP8 A;  4CQ9 A;  4AIO A;  3T8L A;  2D2G A;  3PY2 A;  1NQ6 A;  3CHE A;  3EWX A;  3NPV A;  3SSJ A;  5C70 A;  2INZ A;  1KBK A;  2C6Q A;  3QLD A;  4GQB A;  3TSD A;  3CHD A;  3IEB A;  6REQ B;  1VGA A;  3QBU A;  4HNU A;  1OHL A;  2OJP A;  4O15 A;  4RUB A;  1QOP A;  2PEV A;  1YPI A;  4F48 A;  1E9I A;  2F6K A;  5D32 A;  3BIC A;  1LRO A;  4QDM A;  2PBG A;  2YW4 A;  3LHV A;  2Z6I A;  2AQW A;  1TQJ A;  4MB5 A;  4BZY A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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