1GWJ | Genus

Total Genus 132

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	132
sequence length	374
structure length	374
Chain Sequence	TSFSNPGLFTPLQLGSLSLPNRVIMAPLTRSRTPDSVPGRLQQIYYGQRASAGLIISEATNISPTARGYVYTPGIWTDAQEAGWKGVVEAVHAKGGRIALQLWHVGRVSHELVQPDGQQPVAPSALKAEGAECFVEFEDGTAGLHPTSTPRALETDGIPGIVEDYRQAAQRAKRAGFDMVEVHAANACLPNQFLATGTNRRTDQYGGSIENRARFPLEVVDAVAEVFGPERVGIRLTPFLELFGLTDDEPEAMAFYLAGELDRRGLAYLHFNEPDWIGGDITYPEGFREQMRQRFKGGLIYCGNYDAGRAQARLDDNTADAVAFGRPFIANPDLPERFRLGAALNEPDPSTFYGGAEVGYTDYPFLDNGHDRLG

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Pseudomonas putida
publication title	Crystal Structure of Bacterial Morphinone Reductase and Properties of the C191A Mutant Enzyme. pubmed doi rcsb
molecule keywords	MORPHINONE REDUCTASE
total genus	132
structure length	374
sequence length	374
ec nomenclature
pdb deposition date	2002-03-18

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00724	Oxidored_FMN	NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1gwjA00

4TMBA 4RCXA 1JR1A 1SO4A 5HWMA 2B7NA 1EUAA 4FXSA 4NXSA 3VKJA 1ZCOA 1NF0A 4XKYB 2QDHA 2QR6A 2AAMA 2ZYFA 3NA8A 3G1AA 5LHFA 3W1UA 1EP2A 1IXPA 1W5QA 4GNJA 1W3IA 3S1WA 2V5BA 2TRSA 3DZ1A 1QFEA 2VENA 3OHIA 3PSWA 1GZGA 2PE4A 3DFPA 2CU0A 3W2UA 2ATMA 1YTEA 4BF9A 5SWUA 4WXYA 3A5FA 1H5YA 3G1SA 2R8WA 2Y7FA 4M7SA 5D2TA 3W73A 2E5BA 4KKXA 4WQ6A 3MW7A 4JY9A 1KBJA 2VC6A 3GXTA 1R30A 1GWJA 3RU6A 1LORA 3N3MA 4I7WA 4X3ZA 4QIUA 3QRHA 1DQXA 4QNEA 2TYSA 1TTIA 4NXKA 1ZFJA 1O5KA 3S1XA 4FNUA 3B05A 4JTLA 3EX4A 4FIQA 5AHLA 3NVTA 3NEVA 3QFEA 1VCFA 2QCCA 4YWIA 1ONRA 3G24A 1MEIA 4H4IA 1TV8A 2NZLA 2Y85A 4RXFA 1SSGA 3T7VA 1OF8A 4UFLA 3AO0A 1H1ZA 1EA0A 1Q3NA 5BMXA 1GJPA 3M5VA 1P5BA 1QCWA 3HG5A 3L0KA 3SGUA 1S5TA 5KZMA 1GQNA 4ORMA 3NM3A 3W7OA 4U28A 5LSMA 5E1QA 3IVTA 3G1XA 4Q4KA 2J9YA 4S2CA 3MUXA 3N34A 2C19A 3BV4A 1SO3A 3PF3A 4FEZA 3BG3A 1ZJIA 2YGYA 4MZYA 3W7CA 4GUGA 1KM0A 2WSYA 3RNDA 2EPHA 3CEPA 3VFLA 1VR6A 2W79A 2Y70A 1N8FA 3F1QA 1OVDA 3MI3A 5K2ZA 4PL1A 4E38A 4JTIA 3WK3A 3DH7A 4UTWA 3NAVA 2NX1A 1AW1A 3KVMA 1VHNA 4MPQA 5EPDA 3HBLA 1CI1A 2A5HA 1OYCA 4H3DA 4HPJA 3H55A 3KAOA 3PB2A 2V82A 3GK0A 3R12A 1NFBA 4KFNA 4IXHA 2ZZ3A 3E0IA 2A85A 3LCGA 4IMGA 5F4WA 3LLFA 5HINA 5IM51 2DORA 4BWLA 2C14A 1W3TA 4AVFA 1H61A 2FQIA 1SZGA 3MWAA 1DJNA 1I2RA 4UTTA 1EWDA 5CPNA 4FX7A 1RV8A 2CFFA 3UPBA 1RQEA 5K9DA 2I14A 1TRDA 4FNRA 1Q6LA 3KX6A 2ZFAA 5EKYA 2DP3A 4ZZ9A 4GBUA 3ABOA 1W5OA 1WX0A 3I65A 2UV8G 2X1UA 1YXYA 3OVRA 5D2VA 4NJJA 3L66A 1ICSA 3M47A 3QF0A 3UXDA 3BG5A 3B04A 3GVGA 2NXGA 5HMSA 2VFEA 3LTPA 3FJLA 5AN7A 3GDTA 4OBTA 4Y90A 1X7FA 3MHUA 2NXHA 3TXVA 3INPA 3G18A 1UJPA 1TO3A 4DO4A 4XTDA 1B3OA 3EX6A 2EHHA 4A29A 1PCKA 4JYDA 3ZR4A 4E0CA 3UWZA 3F4NA 1K8YA 4AWUA 2YZRA 4OGZA 3CPRA 3TAKA 1UB3A 1K03A 1FQ0A 2X30A 1DKWA 1XUUA 2DZUA 3L5AA 4ML9A 1EX5A 1FXPA 3LHUA 5F1UA 3LRKA 4LRSA 4JY8A 3UWUA 4UNKA 4OE7A 1DL3A 2A1YA 1YXCA 3MI2A 4N4QA 3W88A 5AHNA 1R2RA 3LTSA 3JR2A 1PHQA 2NV2A 3N9SA 5L9FA 1NAL1 3G1YA 3EX2A 4GFSA 5MHBA 1ZHAA 1R2TA 4MUZA 1TCDA 4DO6A 4HNVA 1ZAHA 3A21A 4BI6A 5CPMA 3CLMA 3CIWA 1LLWA 2XFWA 4IUOA 5TBOA 1VYPX 3LV5A 4R7JA 1LOQA 1WV2A 1YTKA 5DN1A 3W1AA 5I3JA 2GVGA 4MY1A 5HWJA 3GR8A 1W8SA 3FS2A 4O10A 4RZ6A 1H63A 1MSSA 2JKAA 2PURA 4JTHA 3STCA 1PE1A 3TQVA 1ML1A 5KZEA 5DCBA 1ME9A 3TW7A 1FWRA 5DELA 1UUOA 3DFNA 3HG4A 2ZRWA 3TKFA 1OX6A 3G22A 1LYXA 5LNRA 1XDMA 5D09A 1HTIA 2GJLA 3HQ1A 5F2MA 2E5DA 1SUXA 1K8XA 1F05A 3MP3A 4GJ1A 3TJXA 1EUNA 4K8HA 1TPB1 3LRLA 3P61A 4JR5A 3V1PA 1Y0EA 3T44A 4G1KA 3NQVA 2GOUA 4HT3A 2V0TA 3W7GA 3ZWTA 5D2WA 2QCDA 3FYOA 2WQPA 3TROA 2NX3A 4TU1A 3UD6A 3ATZA 1TPEA 2O7SA 1RVGA 4WY0B 4UFHA 5HUPA 3SFKA 4FIRA 4JXCA 3EXSA 3LM7A 4N2YA 4JTKA 1PVNA 3NZ1A 4TR9A 3PG8A 1LBMA 3G1DA 1P4CA 1TJPA 3TIMA 3CWNA 1T99A 3MMTA 2WO5A 3NXFA 5CZ0A 3MBDA 1QMLA 1KLYA 2JKPA 3C2FA 5HULA 2VKZG 3SIZA 2QKFA 4R34A 4Z1AA 3FEMA 2NV1A 3HB9A 3W1TA 5FF7A 1XBXA 2H6RA 5FF3A 3DXIA 4DPPA 3P81A 5AOUA 5DBUA 2Y7DA 2HSAA 2GVJA 1C8VA 3W75A 4IQLA 3WK2A 5C55A 1GVOA 2CZ5A 2JGQA 1FDZA 1PIIA 1P0NA 1OYAA 1OFBA 4W9TA 2FFCA 4BI5A 4O54A 4K38A 3LHVA 3BPWA 1FDYA 3NL2A 2GUUA 4NZFA 5HUOA 2E77A 1F73A 3OEXA 3I7RA 4FNSA 1TQXA 2NLIA 3B0PA 2P0OA 2IQTA 1H7PA 1KFLA 3QH2A 4XQ6A 4UMBA 1J4EA 1DQWA 4ZMGA 5FI8A 1WYIA 4HNTA 3KVLA 1K7EA 3LV6A 5G2WA 5U7SA 2QF7A 4ZL1A 1AW2A 3OG3A 3C52A 1LM1A 4O14A 1JUEA 1TQJA 2F84A 4UCGA 5CZJA 1OX4B 3BG9A 3NPWA 3GLCA 3QMRA 3THQA 4IMCA 1S5VA 4MYAA 3S0CA 4IMEA 3C2EA 3G0XA 3R89A 2H3DA 3WK1A 3MI6A 3LCLA 2CLIA 3WK0A 1F2JA 2BTMA 3R8RA 4WJEA 4WZHA 1XUZA 1VCGA 5HR6A 1J2WA 5BOOA 3IIXA 2DZWA 3W70A 4GWEA 3W7JA 4NT0A 3W7PA 2PCQA 1TV7A 4RXGA 3KHJA 1G7VA 4QJ1A 2ZZ5A 5C54A 3LB0A 3NL3A 2J9ZA 3P84A 2H8ZA 1G4TA 4CNNA 3QYQA 5FF0A 4Z08A 3R2GA 2GQ8A 1F6KA 5GVJA 3VI2A 1F74A 4I7UA 4Z0SA 3LOTA 3SSJA 2E6FA 3NDOA 3HPXA 3GZ3A 3GXNA 5D30A 5KZDA 3W71A 1LDCA 4XBKA 1GVSA 3BVJA 3QPZA 3C8FA 2C0AA 5LGZA 3HO8A 2O7QA 2VEMA 3MHFA 2E6DA 4AXKA 1DOSA 4JTSA 4O13A 1KTCA 5H91A 4A22A 1W1ZA 3FYPA 5G4EA 2I9EA 3PBYA 3HPSA 2A7RA 4FO4A 4O19A 1GTHA 4M6PA 2QUTA 1AK5A 3EX1A 3KRZA 2Y61A 1W5PA 2DZPA 5K4XA 2Y7GA 4JYFA 3V75A 3QW4B 1WBJA 4GUIA 5D38A 4JTGA 1VHCA 3SECA 4LOCA 4AHOA 2J24A 4RJEA 4IXXA 4RX0A 3PBWA 1H7XA 3TE9A 2WKJA 5DY3A 3TC7A 1W54A 3TCEA 1XBZA 5CZTA 3NQ6A 4R33A 3UWQA 4ZQPA 1K3UA 1YLVA 2V8ZA 3QZEA 4N4PA 2VXNA 1OJXA 3HG2A 1FCVA 4NU7A 2CZFA 4ONVA 3LTYA 3W7LA 4XUGA 3R13A 3KVJA 4UIOA 4L4MA 3MHGA 1VS1A 2NX9A 4O57A 1HFBA 1G6CA 3LX9A 3W1MA 1YTDA 1XFBA 3HF3A 3NQAA 3W7HA 1R46A 3N73A 4MZ8A 3DENA 4N9EA 4NNCA 1RPXA 2YCEA 1AW5A 2FJKA 1ICQA 4IGHA 3B0VC 4ADTA 3L67A 4YL2A 5IBXA 4CQ8A 4HNNA 3W6YA 4K8EA 1LBLA 1ME7A 4MFEA 3FLUA 2DZTA 1QR7A 1TYGA 2Y63A 3E49A 1LP6A 2DJLA 4IPJA 3LCIA 4PODA 1XCFA 1MEWA 3W7DA 3JS3A 1FWSA 5K9CA 3HGJA 3LHTA 4GUJA 3ZS4A 1FCBA 5K4ZA 1JCYA 1KLZA 2E68A 3HPZA 4O53A 5D2YA 5I3KA 3FA5A 3TAOA 1RR2A 3DFQA 2DZXA 4PA8A 3QQ0A 5AC8A 3E02A 4AHPA 3MYOA 5LHEA 1A5SA 4QM1A 3BLFA 1TV5A 2KZHA 3IVSA 1IXOA 4AF0A 3ZFHA 3PSVA 3GIYA 3TFXA 4K36A 2G97A 4JICA 1WAUA 2NWSA 1FUYA 3I68A 4MLRA 1R2SA 1WXJA 3G0SA 1F6PA 1Z44A 2CZDA 3DFTA 1EB3A 3IGUA 4NZJA 2ZTKA 1KM4A 4AWSA 4GC4A 1BTMA 3NQFA 1Q6RA 3ANYA 2NUYA 3VE9A 3LXCA 3DKLA 2VELA 2E6YA 5EL1A 2Q8LA 2V2CA 4ADUA 2QUVA 1KV5A 3USBA 4N6FA 4IX0A 1CX9A 3C56A 3L68A 1D9EA 2FB3A 3LHWA 1GPWA 3LXAA 4I7VA 2ZA3A 5LZLA 3IIOA 1KFJA 3A24A 3NNTA 7TIMA 4OQVA 1T0OA 6TIMA 2TMDA 2BXVA 3LGEA 5C5YA 3ABQA 5LNSA 3R5EA 3EWZA 4S2BA 3BO9A 4LRTA 1VJIA 3SZ8A 3W2JA 1XBYA 3PBUA 2A2IA 4M19A 3WJZA 4CQ9A 4UFKA 5F2IA 1B9BA 4LV9A 4EWND 3UQNA 2A7PA 3C2VA 3KOFA 4O11A 4LV4A 3GXPA 1MO0A 5C6MA 4UFIA 1FDJA 1VYRA 4O1BA 1A5AA 3I6RA 4K7VA 4LUIA 3C4UA 4NQ1A 5C2XA 4UMAA 4UMCA 5HJLA 3PVFA 5G2HA 3BK0A 4DF0A 4OU1A 3NQMA 4RR4A 4BR1A 4CCEA 1L6SA 1GVQA 2Q3RA 1OFRA 8TIMA 3LHZA 4RZ4A 2J9XA 4O1DA 3UWYA 2CLLA 3LCHA 4MVAA 1O5XA 1W31A 2G96A 4JTUA 4X9SA 4CQAA 4K7YA 4DEFA 3O6DA 1TPUA 2OMAA 3SY5A 1YPIA 1JJKA 1JRBA 3NPUA 3QC3A 2RDTA 3S5YA 2V9DA 2VOMA 3IIPA 4MY9A 3RLUA 2Z1BA 5I3HA 4JS3A 3NL5A 1T96A 2QUUA 2CLFA 1IXNA 1O95A 1L6YA 3MYPA 1KV8A 3DGRA 4WXZA 2A6LA 3F03K 5DXYA 4DBEA 2C16A 1J5TA 3UWWA 4ZQMA 5KITA 2ZZ6A 1TTQA 1TB3A 3G1VA 4O8RA 1EIXA 3LI1A 3W1RA 3S42A 1SU5A 1EP1A 4ZQRA 1JVNA 3PR2A 1VZWA 3QM3A 5DXXA 1PS9A 4DXVA 1LRNA 5CPOA 5FEZA 1EP3A 4K39A 1H7RA 1SFJA 4BK9A 3BW2A 5DCEA 1WOAA 4WY0F 3LLDA 1UASA 3DHDA 4JNMA 1ZENA 2BZNA 4MYXA 3QSRA 1M5WA 1IF2A 3C61A 3B8DA 4GE8A 1GG0A 4JGDA 1S5WA 4LS2A 1D3GA 3LBMA 5TQLA 4S1FA 3NGJA 2XN2A 2OT1A 2QDGA 1DHPA 3FFSA 3W1XA 1HG3A 4AH7A 2OZ0A 5U4NA 1EEPA 3L5LA 4QSHA 4BFAA 2FPTA 1OFDA 3CB8A 2QCGA 3T4CA 5G5IA 3WJXA 1T8XA 2Z2UA 2ZTJA 1SW7A 2JKEA 5HR7A 1I4NA 3TMLA 3M9YA 5HWNA 5FF4A 3W85A 3Q58A 3RLVA 3P8IA 4DBDA 4DPQA 1AMKA 4Y9AA 1GYNA 1OFPA 3U2OA 2Z6JA 3QQ1A 3JRKA 4JTFA 3LXBA 4O1CA 2XN0A 1X8FA 3M6YA 2VFGA 3BW3A 1KTNA 1G67A 4HSOA 4RLIA 4PCFA 1VGAA 1GYLA 3N9RA 2RFGA 2NWRA 2AGKA 4HKPA 1A53A 1DV7A 1RD5A 4JYEA 1O4UA 2J27A 4Z1CA 1JUKA 4MJMA 4EF8A 3O6YX 1SZEA 1LTDA 3M5YA 1H50A 2ALDA 2A21A 2W6RA 2EF9A 4FNQA 4O12A 3P60A 5DY2A 2D73A 2WV8A 4M7TA 2ZQ0A 4HN4A 3TDFA 1N55A 1Z41A 2X1RA 2YSWA 4YLWA 3P8JA 2QCDB 1EPXA 2X16A 3LHYA 5HNRA 4O1AA 3PG9A 3HGSA 4WOZA 4LS0A 1W0MA 3BLIA 5AHEA 4NNAA 3WFAA 1C9DA 3SI9A 1X6UA 1M7OA 3T55A 5LNWA 4IX2A 4CNPA 5CGQA 2ISSA 1V5XA 1YADA 1JUBA 3TSBA 4IJBA 1LROA 3EWUA 4ZQNA 3W7RA 1FBAA 5E93A 3O63A 1VLIA 5D02A 3VE7A 4XZ9A 1UCWA 2A6NA 1K7FA 1QDSA 2Y6ZA 1Q6OA 3PC0A 3DKJA 1SR9A 2QCHA 3P80A 4ICNA 2ISVA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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