1B57 | Genus

Total Genus 138

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	138
sequence length	358
structure length	346
Chain Sequence	SKIFDFVKPGVITGDDVQKVFQVAKENNFALPAVNCVGTDSINAVLETAAKVKAPVIVQFSNGGASFIAGKGVKSDVPQGAAILGAISGAHHVHQMAEHYGVPVILHTDHCAKKLLPWIDGLLDAGEKHFAATGKPLFSSHMIDLSEESLQENIEICSKYLERMSKIGMTLEIELGCTGGEELYTQPEDVDYAYTELSKISPRFTIAASFGNVHGVYKPGNVVLTPTILRDSQEYVSKKHNLPHNSLNFVFHGGSGSTAQEIKDSVSYGVVKMNIDTDTQWATWEGVLNYYKANEAYLQGQLGNPKGEDQPNKKYYDPRVWLRAGQTSMIARLEKAFQELNAIDVL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	The crystal structure of Escherichia coli class II fructose-1, 6-bisphosphate aldolase in complex with phosphoglycolohydroxamate reveals details of mechanism and specificity. pubmed doi rcsb
molecule tags	Lyase
source organism	Escherichia coli
molecule keywords	PROTEIN (FRUCTOSE-BISPHOSPHATE ALDOLASE II)
total genus	138
structure length	346
sequence length	358
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date	1999-01-12

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01116	F_bP_aldolase	Fructose-bisphosphate aldolase class-II

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1b57A00

1GTEA 4LVFA 2ZTKA 1EIXA 1FBAA 4JTTA 4MJMA 4I7VA 3S1VA 3LHTA 5DXYA 3GKAA 3C2EA 3S1WA 1SO4A 3TXVA 2ZTJA 2VXNA 3BG5A 4MZ8A 3HGRA 3NQ8A 1TV7A 3PVFA 3B03A 2E09A 1LP6A 2ZRYA 3TKFA 5LZLA 5G5IA 3G18A 2C18A 2Y7GA 2JBMA 1KTBA 3DXIA 1A5AA 4AWSA 4JYDA 1GVRA 1TB3A 3O8AA 4LW7A 2QCMA 5EYWA 2BWGA 3GAKA 4AHOA 1VJIA 5C55A 4C1KA 4UTKA 3G0SA 1DJNA 1VHCA 3OBKA 1FWNA 4P2VA 7TIMA 3NQ2A 1I45A 3NQ7A 1RQEA 1IXNA 4GNJA 1EP3A 1ZAHA 4UUIA 4CCDA 1H7NA 5K3VA 2WNZA 4DQWA 1OFAA 2KZHA 1XBZA 2PCQA 3TAOA 1ZAJA 1W31A 4Z1BA 4IPIA 3O6CA 4NQ1A 2QEZA 4K8EA 3DI0A 5FEZA 3VE9A 3DKLA 4NXSA 4Y90A 5AC8A 4FIQA 2YXGA 4AWTA 2GQ9A 2A6NA 1OHLA 4O14A 1O95A 4JTSA 3DFPA 1GVFA 3GDLA 3WK1A 1KM5A 3BGJA 5DN1A 3N14A 1B4KA 2C15A 3JS3A 4PCFA 1I2PA 2C16A 3MWAA 5KZDA 5D04C 4UMCA 3KRZA 4K38A 3TIMA 4FX6M 5C54A 5DXXA 3N19B 5IM51 2Y7DA 2C3ZA 3A21A 3R12A 4OV9A 2QCDB 3VCRA 2AAMA 3T40A 3O6DA 3P8JA 4NJKA 1N8FA 1XFBA 1TO3A 3I7RA 3QMSA 1SZFA 1ZALA 3ZWSA 1GVOA 3UD6A 4JTHA 3PB0A 4NUWA 4DPQA 2A4AA 2ZRZA 1XBVA 2HS8A 1GG0A 4AWUA 3LM7A 4NJJA 5LNRA 3P7YA 3QRHA 2QJGA 1ZNNA 4UNLA 1TPB1 2FB2A 4TX9A 1E51A 4X22A 3W2MA 4LOCA 4YCPA 4RXGA 1MEIA 2GVLA 4EWND 2O7QA 3ABQA 1CW2A 4Z1AA 4A22A 2ZZ5A 2V2HA 2J6XA 4JTFA 3W1UA 2WSYA 1KM2A 1R47A 4QJ1A 3BG3A 1PS9A 3DFTA 3WK0A 3V1PA 4OV4A 1L6YA 1F73A 4XBSA 4P61A 2YX0A 4WD0A 3PC0A 5KTLA 1TPUA 3ATZA 1M7OA 4ADSA 5CPLA 3GDTA 3P61A 2VENA 5EA9A 4FNSA 2NX9A 1M7PA 1A5BA 3NQAA 3G1XA 3NQFA 2QUTA 2WNNA 4LV4A 3UQNA 1TIMA 4GBUA 4E0CA 1S5VA 1KFCA 2Y88A 4I7UA 1DQXA 1VYSX 3L0NA 5CSRA 1GYLA 3C2VA 1TV8A 4X3ZA 1JJKA 3E12A 4WXYA 3QSTA 5CSSA 1F5ZA 3QYQA 2J9ZA 5I3HA 1KFJA 3NQGA 3SGUA 3WJZA 1Z44A 4EOUA 1FWSA 3TFXA 3NZRA 2V81A 3Q37A 3HJZA 4NT0A 4E38A 1V5XA 4GFSA 4O52A 4E2DA 3CIXA 1WA3A 4MY9A 1OFEA 3FYPA 3CEUA 3G1HA 1QO2A 1TTJA 3L5AA 3CQ0A 2DZWA 3ZWTA 3EX2A 4GUFA 4BI6A 1WV2A 2CU0A 3G1VA 5CZSA 3HQ1A 4MLRA 3S5ZA 1XM3A 4N4QA 4FIRA 5AN7A 4N2YA 2ZA2A 2ISVA 2NZLA 4KFNA 2TRSA 2VFDA 3DFQA 2BLEA 5BRBA 4CQAA 1QWGA 2QCEA 5K9CA 1GZGA 4LTSA 3KHJA 3L66A 3TROA 3M47A 3ZFHA 4RKAA 3FIGA 3CC1A 1LRNA 3W1NA 1XXXA 1Q6OA 4JYFA 4LVBA 1KFKA 4UMAA 4UFLA 1N55A 1MEWA 3W7IA 5DCDA 2Z1BA 1KM4A 1Q6QA 3TE9A 1AW5A 3PAJA 4HNUA 4WQ6A 3DHDA 5AHMA 1AL7A 1QFEA 2EGZA 5DELA 2GUUA 3EKZA 1NSJA 4FHAA 3TX9A 2VEIA 1G4EA 2P0OA 2CLKA 2PRHA 1FCUA 5DBUA 2H8ZA 1XL9A 4ZMGA 3W1XA 5J5RA 3TQVA 1S5WA 2I14A 5BMXA 4XWUA 2QF7A 4O1AA 4O11A 5K2ZA 5AB3A 4LVDA 1H7XA 1MEHA 2ZCGA 2E6DA 2ATMA 3KAOA 3S42A 3STFA 1OFOA 3BLIA 1SU5A 4JTKA 1PHWA 2G95A 3KFTA 1G4TA 5KZMA 4O4WA 3E0IA 3LCWA 2C1HA 1WOBA 5A8GA 3DENA 4LC8A 3KRSA 4Z08A 3HGJA 3VE7A 1RZMA 3NQ6A 3NVTA 3UZ5A 4UFKA 2NUWA 2QCDA 5D02A 2QJIA 3RK8A 5BW6A 3WJXA 3DHFA 2A5HA 3IRDA 3KVJA 4MY1A 5LKYA 3Q2DA 4GRSA 4O17A 5EY5A 1KFBA 1TPWA 4GUGA 5U7SA 3G3DA 1YYAA 5D33A 4Q33A 3BK0A 3LDVA 3QFEA 4HSOA 5AOUA 1H61A 4JICA 2OZ0A 1VQTA 4JX5A 3DKJA 1RR2A 1Q45A 1T8XA 1R30A 3W2LA 4JX6A 2DZSA 4BR1A 4NZJA 1LDCA 2ALDA 2QJHA 1AW1A 3M16A 3T55A 1TTQA 2YPIA 5KSWA 4GUIA 3UXDA 1W1ZA 5AHIA 3UWZA 1FDYA 2JKPA 4CLMA 3HPXA 1OK4A 5I3JA 3W6YA 1F74A 2XN1A 3NPUA 2CLIA 3THQA 2ZRXA 1J4EA 1EPXA 4J9JA 3F4WA 4O53A 3FS2A 4JTJA 3W2KA 3EXTA 3NM3A 1ZCOA 1ZY9A 1EWDA 1TYGA 5D03A 1JCNA 1K8XA 2PURA 4LUIA 3LCXA 1D9EA 4CCEA 2ZZ1A 3BW3A 2X1SA 1B4EA 3RMJA 4Z1CA 2Y7EA 5A5WA 5D09A 3QQ0A 3IVTA 3N34A 1VCFA 1C29A 3O1NA 1GOXA 3BV4A 4NVTA 1JRBA 4O12A 3R8RA 1FQ0A 4O13A 4YMZA 2NV1A 3S9YA 5FF3A 5E0KA 4LVAA 2H90A 3LCHA 1LORA 1DV7A 1MSSA 2Y63A 1SO5A 5LHEA 3GYEA 1AW2A 2W6RA 5BOOA 4N6FA 1KA9F 5DY3A 3MYOA 3KOFA 5G4WA 1BEUA 4IMFA 4BFAA 3G0UA 3STEA 3IGXA 1F6KA 2ZRUA 3RU6A 3MBFA 3P62A 1W5OA 2JKEA 4LNYA 4YWIA 5AYXA 3NQVA 1G7UA 4ZQRA 3HOJA 2V82A 5D2YA 3USBA 3E96A 3U2OA 3QQ1A 3TW6A 3NR0A 2X16A 3NQMA 1H1ZA 4JGDA 2QUVA 4OU1A 1FWRA 1TQXA 2C0AA 3A22A 5FEWA 3SSJA 3M41A 1YPIA 4ZQCA 2C14A 3C4UA 1IIGA 4AXKA 2Q3OA 3LRKA 3LHZA 1K8YA 1SFJA 4PC8A 4IWWA 4CQ8A 1FXPA 1P1XA 1PCKA 2EF9A 3V75A 3N2MA 4FXRA 4O8RA 3IEBA 3OVRA 1JCMP 3KXQA 3GKFA 4ZZ9A 3LTYA 2ZYFA 3O63A 4JEQA 4JY9A 4PODA 5BMWA 1IXPA 1EEPA 4U4MA 4POCA 1Z42A 1H7OA 1KBIA 2NXIA 2VFGA 1UCWA 3W2NA 4HNVA 5SWUA 3OEXA 4H4IA 3P60A 5D2XA 4O19A 2HTMA 4O16A 1FDJA 2EAWA 3L2IA 3NYZA 1BKSA 3W23A 1W0MA 3SIZA 3TUUA 2WPBA 2C6QA 1VR6A 1ZJIA 4FNRA 4PL1A 3LBCA 1OX5A 1VCVA 1FDZA 4PA8A 3W70A 4MZYA 4UC5A 2P1FA 3OG3A 4XZ9A 3QMRA 1I8JA 4O15A 3TV8A 2OCZA 1YLVA 4RLIA 4XQ6A 3G8RA 5AC6A 2Y61A 2QCCA 4A2SA 3TH6A 1DL3A 3NA8A 4NJGA 4Y9AA 5H2ZA 4AHPA 1OYAA 2VC6A 3EWZA 3W87A 1KM1A 3WJWA 3YPIA 4MVAA 5D37A 3W1MA 3D0CA 4IGHA 2QAFA 1CX9A 2C13A 4O0ZA 1EP1A 2FLIA 4LY8A 3QZEA 4WX2A 4GJ1A 3TK7A 1IIHA 1W5NA 3C6CA 3W74A 3W7KA 3AJXA 3N9SA 2VEPA 5D2WA 2J9XA 4WJEA 5G2HA 1VZWA 4IPJA 1VHNA 1TSIA 4LU0A 2DJLA 4JR5A 1H51A 1ZHAA 2CZEA 5LHFA 2B7PA 5FF7A 5KITA 1KLYA 2VEMA 4ZQPA 4RK8A 3BG9A 2A85A 1ICQA 1VS1A 1LOLA 1WDWA 4MIMA 1LZOA 5HINA 5L9FA 1ICSA 5FF2A 1W54A 1EA0A 4DEFA 4UFJA 1EWEA 3EWUA 3W1RA 4UTTA 1FCQA 3GXTA 1W3NA 1SSDA 3KVMA 2X1RA 2TYSA 1TMHA 1TTIA 2X2GA 3R89A 3L0KA 3NEVA 1JUBA 2ZDRA 2ZA1A 3W88A 4N9EA 3S1UA 3WJSA 4UTTC 2Q8LA 4KWWA 3UYCA 2QDGA 4MFEA 2BTMA 4M6PA 2OMAA 1G4PA 3TMQA 5G1YA 3TA6A 4O1DA 2GJLA 1LBFA 3JRKA 3I7SA 1K7EA 1JCXA 3CHVA 3EKLA 2ABAA 3M44A 1IF2A 3PG9A 2OX1A 1TPEA 3P5YA 3W86A 4K39A 1P0KA 3P81A 2B7NA 2E5DA 3IV3A 2RHGA 4UTJA 2ZZ6A 2V5LA 4H3DA 5BNKA 1H60A 4FF7A 3I6RA 1ADOA 5I3GA 5F4SA 4LUJA 1TTPA 3QH2A 2H3BA 1GPWA 3QPYA 2YSWA 4N9DA 2Z6IA 3LTPA 4TIMA 1Z41A 1XUUA 3PF3A 1Z48A 4UTMA 1XKYA 3TSMA 1ME8A 5D05A 3GDKA 1WAUA 3W7MA 6TIMA 2A21A 4O4VA 4A29A 4LVGA 1X7FA 1BWLA 5IBXA 5G2IA 1B3OA 1IGSA 3R5EA 1H62A 3OVQA 4GC4A 2E6YA 3W7QA 3DBPA 4UTWA 3MMTA 3W2JA 4KKXA 2R91A 3O07A 1YDNA 4XKYB 5IBXC 3G22A 1SUXA 1KFEA 2RDUA 3W7NA 2OT1A 5T26A 1OF6A 1PCWA 3QJAA 3UWUA 3G1AA 3CWNA 3UWYA 3PR2A 3WK2A 4GXMA 3NGJA 1QOQA 3PBYA 1ALDA 4FEZA 1OFPA 4OE7A 3NQCA 1QPOA 3QW3A 5D2VA 4A21A 3GXNA 4YL2A 3U8GA 4AAJA 1A5CA 3NZ1A 1PE1A 5KMYA 4PTNA 4JTGA 5LNVA 4M6QA 1QR7A 2J9YA 2PE4A 3JR2A 2VFEA 2Y6ZA 3BO9A 1IXOA 1O5KA 3GDMA 4AF0B 1T99A 3UNDA 1B9BA 3P82A 3Q58A 1BWKA 3T7VA 1OX4B 5EKYA 3DFNA 1W3IA 2B0MA 5KINA 4HKPA 1RD5A 1K3UA 2FDSA 1KV5A 4YCOA 4ONVA 2WO5A 4M7TA 3PB2A 1K7FA 1UBSA 2X1UA 1VPXA 1WXJA 2F7FA 3T44A 3IIPA 1QPRA 2VEKA 3MBDA 3CPRA 1ME7A 1O4UA 5E1QA 2DP3A 1GWJA 1SZEA 1OVDA 3ANYA 4Z0SA 4QNWA 3EWWA 3A9IA 3LI1A 2YW3A 3EX3A 3B4UA 4DBDA 3I65A 1OJXA 2I9EA 5D32A 2Z0IA 3HGOA 3VFLA 3UY7A 4FNQA 1TPH1 4JY8A 1JUKA 4OBTA 4RZ4A 3H53A 3O6YX 2EPHA 4R53A 3IIOA 4H6KA 1XUZA 5EMUA 2BSLA 1WOAA 1YTEA 3P67A 3L67A 4TR9A 4HPJA 1GTHA 1Q6RA 2NLIA 3S6DA 3LLFA 4GE8A 1W5PA 3P80A 3HG3A 2B7OA 1DOSA 1SW0A 3W7LA 3MO7A 2J24A 3W3OA 2A0NA 3W73A 3LHVA 5HQEA 3LXBA 1FX6A 4KFPA 2DZVA 3L0GA 1OFQA 1R2RA 3L5MA 3N2XA 1RVGA 5MHBA 2NWSA 5HJLA 3A5FA 4UTIA 3LV6A 2TMDA 1UASA 4K37A 3HGSA 4AMAA 4JTEA 1NVMA 1LRTA 1J5TA 2WQPA 3PBVA 3I68A 1W56A 3TR2A 8TIMA 2ZA3A 1BTMA 2WSQA 1KW1A 1NF0A 2NV2A 2QCNA 3MI6A 4ZQOA 3C3NA 4C1LA 3W1TA 3F1QA 1YXDA 3VI2A 5G1TA 3DAQA 1EUAA 4MYXA 2FPYA 1QMLA 4QISA 2E6AA 1SQ7A 3LHUA 1I4NA 4CNPA 3O06A 4PH6A 5FEXA 4FNPA 5F2IA 1JQXA 1C9DA 1H63A 3NAVA 3S5NA 3UWQA 3LRLA 3B06A 3FEMA 4FB7A 2Y85A 4FO4A 3THAA 2RDTA 4XKYA 1TPDA 2YGYA 4RV8A 4U28A 2V5BA 1H5YA 4MUZA 3PUOA 2TPSA 3W1AA 2BXVA 1OF8A 3FYOA 4CNOA 4JX4A 3NXFA 1M6JA 1UUMA 3L9CA 4R34A 3OVPA 2OT0A 3UPWA 4DELA 3DZ1A 4DO4A 2DORA 1JULA 5K7JA 4DO5A 3RLUA 2FTPA 3R13A 5E93A 2X1TA 4N02A 1MZHA 4IXHA 1LTDA 4HNTA 1LBLA 4NNAA 3MP3A 5AHNA 3INPA 3C52A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1B57A

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