3AFB | Genus

Total Genus 113

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	113
sequence length	300
structure length	300
Chain Sequence	GPNANPIPEHFFAPYIDMSLSVHKPLVEYAKLTGTKYFTLAFILYSSVYNGPAWAGSIPLEKFVDEVRELREIGGEVIIAFGGAVGPYLCQQASTPEQLAEWYIKVIDTYNATYLDFAIEAGIDADKLADALLIVQRERPWVKFSFTLPSDPGIGLAGGYGIIETMAKKGVRVDRVNPMTMDYYWTPSNAENAIKVAENVFRQLKQIYPEKSDEEIWKMIGLTPMIGVNDDKSVFTLEDAQQLVDWAIQHKIGSLAFWSVDRDHPGPTGEVSPLHRGTNDPDWAFSHVFVKFMEAFGYTF

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Hydrolase
source organism	Pyrococcus furiosus
publication title	Kinetic and crystallographic analyses of the catalytic domain of chitinase from Pyrococcus furiosus- the role of conserved residues in the active site pubmed doi rcsb
molecule keywords	Putative chitinase
total genus	113
structure length	300
sequence length	300
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date	2010-02-25

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	3afbA00

2RGMA 4PSRA 1CXIA 3OA5A 3W28A 3WF1A 2D0GA 5ABFA 2CCRA 3CZJA 2VZTA 1UWRA 3QHMA 4MB1A 5A2AA 1JZ7A 4P8VA 4BQ4A 1QW8A 4AZCB 3WH7A 5D9OA 5I77A 1CGXA 1B1YA 3DYOA 4WLCA 1E4IA 3WDHA 2YJQA 4D1IA 5C70A 4TVUA 4Z2GA 4U2YA 1W3KA 2AAAA 3BMWA 3WDJA 4EK7A 1ITCA 2CBUA 4AIEA 2VZUA 3CZKA 1V0NA 3MUAA 1JF6A 4PMYA 2X09A 2DSVA 2PWFA 3AXHA 3RO8A 2WB5A 3F5JA 1EO7A 1B3YA 3UETA 1GONA 1ITXA 5A2BA 3KZSA 3T0AA 3OLEA 2D1ZA 5DT7A 5F7UA 2C8NA 3VILA 4DWSD 1FA2A 3FHAA 3AOFA 1PZ2A 1H41A 3K4DA 6CGTA 1B31A 2VRKA 1QBAA 4OUEA 4R5EA 4QLJA 5D4YA 1LG1A 1CXKA 1VBRA 1UR9A 4W84A 1E40A 4HMDA 3WH6A 2XSBA 1QPKA 4X9YA 3WEOA 3ARTA 1XRVA 2ZUNA 3CZGA 3L2MA 4W87A 1YQ2A 2QMJA 2WHMA 4HA1A 2DSUA 3L4XA 3ARUA 2FGZA 3K1DA 2ZIDA 1VJZA 1J0ZA 1DHKA 2MANA 1E15A 2W5FA 3L4TA 1IZJA 2FHBA 5BXPA 3CUIA 1H49A 3QR3A 5A6LA 5CPSA 4D6JA 2X8RA 4RL3A 1HL9A 7A3HA 1PX8A 1LQ0A 1MQPA 4QCEA 3GTNA 4UOZA 2GJPA 3WD2A 2FHCA 4CD4A 2JE8A 2VCBA 1NH6A 1X6NA 2OSXA 2WM0A 1QW9A 3W25A 4HA3A 3WBAA 1UH3A 5M17A 4UOQA 3ZT7A 1QI2A 4FLOA 4BCEA 4LQ1A 4NF7A 4BA0A 4J27A 5A6AA 3HMCA 1W2PA 4U3CA 1B3WA 3OGSA 3N04A 2J7HA 3TTOA 2WLYA 4EE9A 1JFHA 4WK9A 4W7UA 3AIUA 4S3KA 3GH5A 1WZLA 1V3MA 3SUUA 4PTXA 2Y2WA 4P8WA 1BYBA 2QPUA 5JIWA 3VIHA 1V03A 3SUWA 2D0HA 4H41A 1E70M 5BWFA 3WDQA 5I3DA 4FLRA 1CECA 5CG0A 3AMCA 3WF3A 4UFIA 1BAGA 1UKSA 4CN4A 1UH2A 3T2PA 4ACZB 1QHZA 3N17A 3WIJA 1J01A 2V3GA 1VJSA 1HIZA 1JF5A 3RCNA 4HOZA 3CPUA 1B30A 1GW1A 3OGVA 3ZO9A 2D3LA 2XUCA 4IUGA 5CLWA 2FH6A 1HKKA 5I2UA 3CMGA 2PWHA 3AZSA 2WHKA 2BFGA 2UWFA 3M07A 3DYMA 1H3GA 2DIEA 1FH9A 2E8ZA 5A1AA 3NSXA 3J7HA 4PUEA 2WMGA 3RDKA 3ZOAA 1UR1A 4MAVA 5BRPA 3CHCA 4W89A 3GXFA 2CEQA 1I75A 1W3HA 2QPSA 4Z2KA 5IHRA 3FN9A 2O9TA 1FOBA 2WBKA 5CXPA 1R86A 4EKJA 4XUYA 2EPLX 2A3CA 4HU8A 1MW2A 1A3HA 2VZVA 1J0YA 1R8LA 4QAWA 3VIPA 3TTYA 4GI8A 3U57A 2W66A 4PMQA 3M6DA 3FXYA 2V38A 1JZ3A 2VVSA 3W29A 4U3AA 2WVSA 1V02E 3GYCA 3ZJKA 1J10A 1R85A 2JF7A 3EDEA 3W6MA 1HKIA 3W82A 4U5KA 2QV4A 2V3FA 1OT1A 4AZCA 3SCVA 3ZMRA 1CXFA 2ZX9A 3N13A 4HZ7A 4IM4A 4ZENA 1M04A 4E4PA 2VCCA 1BYCA 1G01A 1B0IA 4PMNA 2GFTA 1CGWA 1J0KA 3WY1A 5E6YA 4TVDA 4J3WA 1U33A 4WKHA 1OINA 4QDMA 3VKKA 4B3KA 1TUXA 4HMCA 2DT2A 3AMKA 1DWFM 3NUKA 1SR0A 3VD7A 4TX6A 2J25A 1K9FA 5FL0A 4EANA 1J0HA 4GINA 1TE1A 3A4AA 4MDOA 5A6KA 3WD0A 2NSXA 3MO4A 3AHVA 3WDPP 3BCFA 1PX3A 5FD0A 1W2VA 2UY4A 4AIUA 5AYIA 2PBOA 1WNOA 2OWXA 1UKPA 3ARRA 3SCSA 2ZX7A 3S6TA 4LX4A 2VCAA 2GK1B 1GPFA 1KXHA 1B3XA 4WKAA 2ZE0A 1MXGA 5CGMA 1QHOA 4WIWA 3CGTA 2JEPA 3WENA 4HOXA 2EPNA 1H0GA 4URIA 3AIEA 3QHNA 3L4VA 1WDRA 1J0IA 1DWJM 2W92A 2CXGA 1C91A 3CUJA 1EHAA 1KB3A 3ALGA 1TMQA 1GQJA 1LWHA 1M7XA 2XWDA 3N9KA 1JAEA 5DT5A 2VVNA 3QOKA 3T0BA 2WYSA 2Q8XA 1GOOA 1BPLB 1C8XA 1E1FA 5LA1A 3NIYA 3RM4A 3A3HA 4KH2A 4A3HA 3WKZA 1OGBA 3AS2A 2YA0A 4OBRA 4XZBA 1CXHA 1E6NA 1K9EA 1ZBVA 1E4MM 1OIFA 3AIVA 1CPUA 3WL0A 4PYSA 1XD1A 4JCMA 4TTGA 1EDTA 4KMQA 5I6SA 4W5UA 1L8NA 1UA3A 3OG2A 1E0WA 1UH4A 3GNPA 4XX6A 1O6IA 2DGAA 4M1RA 2QLYA 1CZ1A 1VEMA 1OWQA 4CGTA 2WC4A 4E8DA 4B9ZA 1EGZA 1H09A 2XM1A 2NT1A 1V3KA 2OSYA 4JFTA 3WD1A 2PWGA 3T08A 3HN3A 4U31A 4N42A 1RP8A 1HJQA 4JFSA 2PI6A 5BXTA 3EMCA 3KL0A 3PZNA 4UOJA 1SMAA 3AYSA 1W9UA 2Z1KA 1W1PA 1MFUA 2EPKX 4AMCA 2PWDA 1WP6A 2XVPA 3CUGA 3VM5A 3GNOA 2XSAA 1E43A 4FK9A 4F9DA 4HZ6A 1TA3A 5D9NA 4YN5A 5AY7A 1WAWA 2BY0A 4JIEA 4AW7A 2BXYA 3AHZA 3WF0A 1H1NA 3BCDA 2O9OA 3VD5A 2O92A 1BVZA 1MW3A 4HU0A 4H8UA 1OGSA 2J62A 1UKTA 2JIWA 1BYAA 2E8YA 3LPPA 4UFHA 2EBNA 5DEZA 5IDIA 4Z2IA 1VF8A 1LJYA 2GJRA 3VGHA 2YLAA 3O2LA 1E56A 1FFRA 4P7LA 4GZJA 4GKLA 1D3CA 2V5CA 3F5LA 4YPJA 3OLDA 1JXJA 3CTTA 2VR5A 4MJ2A 2WMHA 2VURA 5FL1A 5A3HA 4J7RA 3T09A 1V6UA 4AY1A 3SURA 1E0VA 2A3BA 2DT3A 1CWYA 1QHPA 1RH9A 1GHRA 4MNMA 1DWGM 1V3HA 4J3UA 1EIBA 2BHZA 1M53A 3UERA 3UR7A 1PIFA 1V08A 4OKDA 3JUGA 4D6HA 1OIMA 2QHAA 1WO2A 5A6BD 4J3XA 3WQ4A 4AD3A 3N1AA 1I1XA 4JFUA 1C8YA 3IAQA 4YHEA 3AI0A 2W62A 1H4PA 2DH3A 4JL1A 1KCKA 2E4TA 4AWEA 1GQIA 1WZMA 2Y8KA 3RM8A 3AJ7A 5I23A 1NQ6A 4D71A 1PZ3A 2VX5A 2ZUVA 1FHDA 3D3AA 9CGTA 3ZJ7A 3ARYA 3MS8A 1EO5A 3OZPA 3WMSA 3SCRA 3IAPA 3BAYA 2YL5A 4PMOA 1KGUA 2EPMX 3AZTA 1UYQA 3UG5A 4B15A 3ARZA 2XJ7A 1EDGA 2DSZA 4B3LA 3WFLA 4X0VA 7CGTA 4Y7EA 5E0FA 5GPRA 2ZUWA 1JZ5A 2W4XA 2IUZA 4W7VA 1UD8A 5D9MA 1K9DA 2DT1A 2ZWYA 2UY5A 1C8QA 1V3IA 2BY2A 2XVNA 1WZAA 3CH9A 1UR4A 3ALFA 2WKLA 3SCNA 1GJUA 2BY3A 3ZR6A 5BRQA 1XSKA 2X0HA 4QCFA 3O9NA 2GK1A 2WW5A 4PSPA 4HTYA 4LPCA 2AOSA 4DWSB 1GORA 1V0MA 2IXUA 3W0KA 3ZJ8A 1PPIA 1CGUA 5I0DA 1XGZA 1VEOA 2J75A 4WKFA 1XCWA 1PEZA 4ZFMA 2CHNA 2WMIA 3KL3A 5E70A 1K6AA 2XHYA 3I3BA 4Z2HA 1VFOA 2WBGA 4CN1A 3PZ9A 1KXTA 1QNQA 1NWUA 3LPGA 3I3DA 1HNYA 1BTCA 5E6ZA 4GIAA 2CETA 4J3SA 4TXEA 2X05A 3RILA 2YL6A 1J12A 4OIFA 3PZUA 1UWIA 1JI1A 2WSPA 1ZU8A 3VIOA 1HP4A 4MJ4A 3BAXA 4U33A 1AQHA 5DMYA 4E8CA 2OLHA 5LYRA 2ZX6A 4JHOA 2CITA 4PMZA 2BVDA 3NYDA 4NI3A 4F79A 2CYGA 1E0XA 3WF2A 2WHLA 1EH9A 3TTSA 2J7BA 1GCYA 2CKSA 2VZSA 1JAKA 3TA9A 3W6LA 3POCA 3MUIA 4UZUA 1DWHM 2FHFA 1WDSA 3EDJA 4J3TA 2VO5A 1BQCA 4ZE5A 1WCGA 4M8UA 5A8OA 4AZIA 4AIOA 3AICA 1BGGA 1FH7A 2D20A 5D8WA 2G3JA 5IFTA 4AZ7A 1HT6A 1OD0A 5BXRA 4GO8A 3QOMA 2EO7A 1E73M 4PEEA 1JDCA 2VC9A 3IJ7A 4CVUA 1V0LA 5EBAA 2CPUA 3PZMA 1E3ZA 4A4AA 5HDRA 4Z2LA 5BROA 2YLLA 3WH9A 1I1WA 2VRQA 4CD6A 2JALA 3GH4A 2BNJA 3WN6A 4PN2A 5DO8A 3WQWA 4JKMA 1VIWA 5FIPA 5IHSA 4CUCA 2XPKA 1B3VA 2E9MA 3FHQA 3BC9A 2D2OA 3WUGA 1H5VA 1TA3B 1HP5A 3GBEA 1W3JA 4ACYA 1TG7A 5AC5A 1KQYA 1BF2A 4P7RA 1CTNA 4M80A 1HVXA 3MUY1 4W88A 1H0IA 4F8XA 3CUFA 1WKYA 3VIGA 2YA1A 1KWGA 1RPKA 1R7OA 2QMKA 4BQ3A 1UOKA 2D3NA 1UQZA 5ECUA 4ZEPA 1V0KA 5C8BB 3ARWA 2WC3A 1V6YA 1VBUA 1NWTA 2G3IA 3ARSA 1JYXA 5E9AA 2YL8A 2D0FA 1C7TA 1EHNA 3T2OA 1XH1A 3MU7A 1HL8A 2DQXA 1UWTA 3POHA 1BFNA 1XSIA 4PTWA 1JNDA 2WC7A 2YBUA 3K8LA 4UQAA 1V6WA 3W4RA 1EXPA 2YKKA 4P7OA 4DWSC 3UG3A 2GJXB 3TP4A 1F4AA 1W9XA 1DEDA 3PTKA 4HPHA 4UQDA 4D6GA 3UCQA 4AEEA 1W32A 1NOWA 1ISWA 3B9EA 3VPLA 1Q6FA 3AIQA 4UCFA 5A6BA 2VMFA 1JFXA 1FP8A 4UQ9A 3OBAA 3CMJA 3A4WA 4RE4A 1GUVA 4PBGA 4Q22A 2V5DA 3SCOA 4V28A 1E5JA 2VI0A 1LLOA 1E4LA 1BLIA 2WAGA 4KRUA 2ZUSA 3TOPA 4PMXA 1KXQA 4UNIA 4AC1X 1MQQA 5CZKA 2XVLA 2WMKA 2YL9A 3VGBA 2GDUA 3SEPA 2YA2A 2CESA 3RMEA 3W53A 3F4VA 3W24A 3OGRA 1JZ8A 4KGLA 3SCWA 3W37A 3VGFA 2YDQA 2ZXBA 2EXOA 1DWIM 3GDBA 1LL7A 5GNZA 2VX7A 3KE0A 3N15A 2G3MA 5LA0A 2VQUA 3AMGA 3U7VA 1LWJA 4AXNA 3HU7A 4BQ5A 1B2YA 5CGTA 5IXEA 1E72M 3LPFA 4R27A 1UWQA 1ZBWA 3AIBA 1EDQA 3NDZA 2G41A 2PB1A 1H11A 3MSDA 1UA7A 4DM2A 3AZRA 3AROA 2HVMA 4DWSA 3VOCA 1B90A 1NP0A 1US2A 1Q6CA 2XGIA 5KEZA 4GO9A 5BYWA 4MAZA 2DDXA 1RD6A 4GZEA 2BHUA 1GVYA 3CZLA 5M3WA 1GQKA 5HOSA 4N0RA 1R87A 3VX1A 1TVNA 1UWUA 2XG9A 4KGJA 3ZR5A 4FLSA 4D72A 2BXZA 1MXDA 1W9DM 3ZIZA 4UQEA 4MTVA 3PZQA 1BVNP 4UFLA 2TAAA 3MANA 2WMIB 2Y4SA 2Y24A 1UR8A 4JL2A 2WCSA 3SUVA 4AZHA 3ZSTA 3QGVA 4QLKA 4MB5A 1KBBA 1UKOA 3ARVA 3L2LA 3EMQA 5HPCA 2EEXA 3GZAA 3HJEA 1E4NA 1CIUA 2PF0A 1BG4A 2A3EA 3QHOA 1US3A 2WKGA 3DC0A 4OZOA 4JKKA 3AXIA 3AS1A 1ZJBA 1JZ2A 4UFJA 2G4FA 3VU2A 2BV9A 1E3XA 1FP9A 4ZXLA 2XM2A 3APGA 2VL4A 2ZXDA 4GI9A 3BAIA 1E6QM 3SIMA 1PJ9A 4AISA 4ATLA 1AQ0A 2CBIA 4HOWA 1XC6A 4Z2JA 1W1YA 3EMZA 3VUPA 1ZS2A 4CCCA 5M5DA 3LPOA 3VM7A 1U2YA 4MADA 1UQYA 3CZEA 3NSMA 2GVYA 2Z1SA 1Q6GA 3U5UA 3A4XA 1V3JA 4JCLA 4NRRA 1KR1A 1ZB5A 2OWWA 5C71A 1GOWA 1PIGA 5I24A 1GOKA 3AMLA 3L4WA 3VVGA 3IJ8A 1EOKA 3GBDA 3WMCA 3ZJ6A 2WSKA 1HKMA 2J79A 3N11A 3WH5A 1KCLA 1NM9A 4UFMA 2J7CA 3II1A 1KBKA 1QBBA 4F66A 1P6WA 5ABGA 1GOMA 4GI6A 4ZXOA 1GVIA 4HP5A 4DUWA 1W9PA 2CBJA 2WVVB 3WNOA 4M24A 1N82A 4ML4A 2J78A 1ZJAA 3EDKA 1VB9A 3PBGA 2O9RA 4AD5A 1IV8A 5A6MA 5DF0A 4CN6A 5CSUA 2WXDM 3BLPX 4ZE4A 2YDRA 3VX0A 3ZSSA 3WNKA 4W86A 2FDMA 1ISXA 1CDGA 1OBAA 1OB0A 1CNVA 2GUYA 2X0YA 3TONA 2DPEA 1NARA 4CU6A 1UHVA 2VQTA 1UR2A 2E9LA 1VENA 4J3VA 3EYPA 3AYRA 1PX4A 1HJSA 3G6LA 2B31A 1S46A 2GJXA 4D6CA 4PTMA 3W38A 2YBTA 3A6OA 3VGGA 1W1VA 1GNXA 2O9PA 4P8XA 1ISVA 1JL8A 2XFYA 1HKJA 2VNCA 4NSBA 3VMOA 2WCGA 1GQLA 3RM9A 2WMJA 7TAAA 3RJXA 4PRWA 1NWRA 1WDPA 1AQMA 4PUDA 3DHPA 5LA2A 2X2YA 2BY1A 1HJWA 1CBGA 1KWKA 4W7WA 1XV8A 1DTUA 2WZIA 4V2XA 3SCPA 3VIMA 1CXLA 1TCMA 3BXWA 1E55A 1TZ7A 1J11A 2EQDA 1HX0A 3AIRA 2CIPA 4PCTA 4C7DA 1BSIA 1WDQA 4KWUA 1ODUA 4CU8A 1AVAA 1JYWA 2Y5EA 3WMBA 2ZWZA 4AD0A 3WD4A 3PZTA 1HJUA 1NOFA 1G0CA 1NWSA 1EOMA 3BAWA 1W91A 1JIBA 3AIWA 2E9BA 2ZX8A 3VGEA 3U5YA 4MPKA 4CCEA 1BHGA 1VRXA 3N18A 4H7VA 1G9HA 4OBSA 4BS0A 5A8QA 1H2JA 2ZXQA 4QLLA 3ARXA 3E1F1 1RP9A 2BVYA 1MYRA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3AFBA

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