4UNLA

Crystal structure of a single mutant (n71d) of triosephosphate isomerase from human
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
246
structure length
246
Chain Sequence
SRKFFVGGNWKMNGRKQSLGELIGTLNAAKVPADTEVVCAPPTAYIDFARQKLDPKIAVAAQNCYKVTDGAFTGEISPGMIKDCGATWVVLGHSERRHVFGESDELIGQKVAHALAEGLGVIACIGEKLDEREAGITEKVVFEQTKVIADNVKDWSKVVLAYEPVWAIGTGKTATPQQAQEVHEKLRGWLKSNVSDAVAQSTRIIYGGSVTGATCKELASQPDVDGFLVGGASLKPEFVDIINAKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
source organism Homo sapiens
publication title Crystal Structure of a Single Mutant (N71D) of Triosephosphate Isomerase from Human
rcsb
molecule keywords TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE
total genus 89
structure length 246
sequence length 246
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.3.3: Methylglyoxal synthase.
pdb deposition date 2014-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4unlA00
1PE1A 2O7QA 1JCNA 4WD0A 5HQEA 1KTBA 1Q6LA 3I7RA 2E6AA 4O28A 2E6FA 1S5VA 2RHGA 3KX6A 3QMSA 3ANYA 4NJJA 1XBXA 2IQTA 2VFDA 1UJPA 1C9DA 3BARA 3UD6A 1DQWA 3A5VA 4O54A 3R13A 1FCQA 1X7FA 2OZ0A 4JTLA 4ZZ9A 1WQ5A 3UQNA 1G6CA 4Z0JA 5H91A 4WZHA 5LNVA 3W87A 1LORA 3UY7A 3L5MA 4XQ6A 2ATSA 3C2OA 1M7OA 6ALDA 8TIMA 3N73A 3TCEA 2XN2A 1VS1A 3O06A 5D2VA 2VEPA 3NPVA 3W1PA 3ATZA 4JX6A 4Y6GA 1PS9A 1YADA 3G0UA 4UTUA 5CG7A 5CKSA 2ZZ3A 3A22A 2CZFA 4U4MA 2QCEA 4IOTA 2P10A 4UTWA 3TK7A 1GTHA 4HT3A 1LRQA 3TSMA 5E0KA 3FJ6A 4KKXA 3PUEA 1W5NA 4EF8A 1OFAA 4LS2A 1FUYA 4AHOA 2ZZ5A 1EP2A 5K4ZA 2E6YA 4N9EA 3RLVA 1W5PA 2QJIA 3MP5A 3DHDA 2GQ9A 4LNYA 3G3MA 3CQ0A 2DZPA 2QCNA 1XBYA 5DELA 2JK2A 3F4NA 1TQJA 1W8SA 1WAUA 1SFJA 3LCHA 1ADOA 1FDZA 5E93A 1RV8A 3W1AA 3NG3A 1YTDA 3W88A 3L67A 3CC1A 4PC8A 5D38A 4UTHA 3DKLA 1JCMP 3HJZA 3W2KA 1SQ7A 1O5KA 5AHFA 3W07A 1G4TA 3QSRA 2KZHA 1MSSA 4QITA 1LLWA 1EP1A 3TQVA 2GJLA 4DBDA 4RX0A 4AMAA 3H55A 1JVNA 3C2EA 3EWWA 3NZ1A 4AF0B 4G1KA 3W1RA 3LCXA 2G5WA 2WPBA 5IBXC 1RD5A 3MYOA 3QQ0A 3HPXA 2W6RA 5HULA 5AC8A 2ZRVA 5D04C 2BTMA 1TSIA 2A0NA 1WBHA 5SWUA 5F2MA 2QDHA 5AHNA 2PC4A 4OV9A 5EA9A 4MKNA 4JD4A 1KM5A 1TPB1 5K7JA 2A6NA 2Z6JA 4CQ8A 2GVJA 5DCEA 2BSLA 3QFEA 2JKAA 3LXAA 4UFLA 4DO5A 3BW4A 3W71A 1W31A 4AHPA 2VC6A 1E51A 3NPUA 1P4CA 3T44A 5HR7A 3V75A 3TAKA 3S0CA 1SO6A 5DCDA 2ZRXA 1VYPX 4GUHA 4JTIA 4IUOA 3G1HA 1KLZA 1V7YA 1GYNA 2CLLA 4ZQMA 3O6DA 1ME8A 5I3HA 3GK0A 4JTJA 4LUJA 1B57A 3CHVA 3IGSA 4FXSA 2G95A 1J4EA 2ALDA 4DO6A 3FFSA 4MVAA 3IEBA 3NQFA 2FJKA 3G24A 4K6AA 4BI5A 4RZ4A 3GNDA 3R12A 2V2DA 1OX4A 2C13A 4IX0A 1DBTA 4TR9A 3B0VC 2ZRYA 3LI1A 3W7RA 3STFA 1YTKA 4XUGA 1X1ZA 1XL9A 2DU2A 4ADTA 3DFOA 3UY8A 3NL5A 5LNUA 1W3NA 1RVGA 3GX9A 3LCGA 1VCFA 4OT7A 3CEPA 3RU6A 3IIVA 3H54A 2VENA 2FIQA 4DXVA 4IX2A 2V82A 2FPYA 5G1TA 3TAOA 4MLRA 4TO8A 3HGSA 2CWNA 1L6WA 4W9TA 1U83A 3KVKA 3HIJA 2Y88A 2ZZ2A 3KVMA 4NJIA 2NX3A 4DPPA 5D32A 3TROA 4I7UA 5AC6A 4MIMA 3LERA 4Z08A 4I9AA 4L4LA 4LT9A 5HMSA 1GG0A 3IIPA 3MI6A 5FF4A 4ZVJA 4JIPA 2QCHA 5DY3A 1VRDA 4YCOA 4O4WA 4PA8A 5EY5A 1VHCA 1XDLA 2QCMA 4CNNA 3C2VA 3WK2A 3SJ3A 3W2LA 1NEYA 2Y62A 4LV4A 2V81A 3FJLA 1FDYA 1FXQA 1GVSA 2A2IA 3W7GA 4HNVA 3S5NA 1A5AA 4AH7A 2VFFA 3PB0A 3U2OA 2VEMA 1XM3A 5T26A 2Y85A 1LBFA 3N9RA 1IXOA 4NNCA 4O15A 2EPHA 4NU7A 1LLZA 3NM3A 5C5YA 3STGA 2CZEA 4K8EA 3P5ZA 3NL2A 3NYZA 2PRLA 4O16A 2WNQA 3NNTA 4IMDA 1G7VA 4DQWA 2Z2UA 4FNUA 1TPC1 2V5BA 3DBPA 4FNQA 2GQAA 4NT0A 3S42A 1ZAHA 2ZA2A 5AHLA 5KMYA 4POCA 1T99A 4JTHA 3W1NA 4RLIA 2A85A 2E09A 3E02A 4MJMA 3EXTA 2NUXA 4MPQA 1F5ZA 1FCUA 3TNOA 2YPIA 1IF2A 1B4KA 1VLWA 2JKPA 1OYBA 2YZRA 3O6CA 3IIZA 2RDWA 3SZ8A 1EPXA 4N02A 3W1TA 3LXCA 2QCDA 3LGEA 1VR6A 4PH6A 2QJHA 3LTSA 2E77A 5LSMA 4IWWA 5AC7A 4K7VA 5DBUA 2JBMA 2P0OA 2G96A 4N2YA 4EIVA 1F6PA 3CB8A 4QIUA 3W1XA 4AWTA 3LLDA 1KTCA 3GDLA 1KA9F 4N9BA 5KZEA 5FF7A 2DJLA 1OFRA 5D33A 3ZS4A 3LHUA 5DLCA 4X2RA 3QMTA 5CZ0A 3PY2A 3P67A 1SPQA 1J5TA 2OT1A 3LTYA 5LNSA 4XKYB 4ADSA 1I4NA 2ZQ0A 3M47A 4XTIA 5L6UA 2QJGA 2ZRWA 2DP3A 4K38A 3HQ1A 1GJPA 3ELFA 3RNDA 3UXAA 3NGJA 1I2QA 1L6YA 3THQA 1ZALA 3NQEA 1QO5A 2E68A 5KTLA 1B3OA 1W1ZA 4FNRA 5LZLA 2FB3A 1TPH1 1EEPA 4JTGA 2YXGA 4PEKA 1IXQA 3USBA 5D2WA 3NPXA 4KFNA 3TDFA 3W7PA 2B7NA 2AGKA 3Q37A 3L9CA 5I3JA 2DORA 4E0CA 2CZ5A 2TYSA 2UV8G 2VKZG 3EWYA 3L21A 4N6EA 2WSYA 4IPIA 2NZLA 2W0UA 3WJZA 3FKKA 5D37A 1R47A 2H3DA 2TRSA 3M5YA 2E6DA 4GBUA 3R89A 3LLFA 2NUWA 3N2MA 4L4MA 3EEGA 5D03A 2H8XA 3O07A 1KM6A 3FA5A 1SSDA 3R2GA 2B7PA 2J9XA 1N7KA 3T55A 3HBLA 4NX0A 3NL6A 2V5LA 3IV3A 4OGZA 1TMHA 5H2ZA 3SIZA 1H51A 3MO7A 3O1NA 4N6FA 2NLIA 2B7OA 3LXBA 5LHEA 1RZMA 4S2CA 1JJKA 4NXKA 5F2IA 1EWEA 4QNEA 2WQPA 3W75A 2I9EA 4XBKA 3GNNA 5BOOA 4OBTA 3F1QA 3EWUA 5AHIA 1OG0A 4WY0F 4HSOA 2YR1A 3S8HA 1KBIA 4LVDA 3BGJA 4JTSA 3T78A 3GKFA 2J27A 1F7BA 3B06A 2ABBA 3NEVA 4GUIA 4GUJA 3M9YA 3L65A 3P8JA 2VFEA 4TX9A 1VLIA 3DAQA 5EBUA 1A50A 2WSQA 1KFJA 4E38A 1FWNA 5CPLA 5E1QA 3IRDA 4DPQA 4Q4KA 1F76A 1NF7A 1T0OA 3RLUA 5FF0A 1LOSA 4WXZA 4P2VA 1SFLA 3G8RA 4ZQNA 5EKYA 2FQIA 2NXIA 3PBYA 4IGHA 4JICA 1KM3A 3W6YA 5KZDA 4QJ1A 1L9WA 3WK0A 3SFKA 3A5FA 2ZA1A 1EA0A 2YCEA 1A5SA 2RFGA 1SW7A 2X16A 4O19A 1SO5A 5C55A 5C2XA 1DKWA 3IVUA 4BWLC 1B9BA 5A8GA 4A3UA 1JUKA 3FLUA 4TMCA 3TFXA 3W7EA 3NQMA 4LS0A 1W5OA 3UZJA 2VFIA 1G4EA 3EWXA 3BG9A 2YFNA 4NQ1A 4MYAA 2QUUA 1SO4A 1Q6QA 5G1YA 1QPRA 2OX1A 4S2BA 4KFOA 3Q58A 1Q6RA 2H8ZA 5K9DA 3G1VA 4HPXA 2X1TA 4JTTA 3W83A 4LC6A 3VE7A 2XN1A 3ZWTA 1O94A 4O8RA 1K7FA 3GDMA 2FB2A 3G22A 3BK0A 1YXDA 3VI2A 4KWWA 3LBCA 3SR7A 4FXRA 1UUOA 1ZAIA 3C56A 4LWWA 2HMCA 3W7OA 1OX4B 5AFDA 1KV8A 5DXYA 5BW6A 3PSVA 3UYCA 3W70A 1FCVA 4K7YA 5D2YA 4AWUA 2ABAA 4FX6M 1D3GA 3B03A 4RCXA 3IGUA 1IXNA 4HKPA 1FBAA 2V8ZA 4UFJA 1M7PA 5F2GA 1QMLA 1OK6A 2DZVA 4DELA 5C6MA 3WJSA 1LOLA 2HS6A 4KFPA 3N9SA 4ZL1A 2EKCA 4UCGA 4JTKA 1XXXA 2D73A 3RMJA 1H7NA 3AO0A 3QQ1A 1I2PA 4GRSA 2Y89A 2R8WA 4N9CA 1TTQA 1JUEA 3HO8A 5BMWA 1FDJA 1NFBA 2QKFA 4IPJA 2BX7A 1PL9A 3GDRA 4UTLA 5I3IA 3DFPA 1AL8A 4RKAA 2RDTA 3GXTA 1C8VA 3DFSA 4FHAA 2Q8ZA 5F1UA 2Q3OA 3OVQA 1Q6OA 1QOQA 3M41A 2FFCA 2H6RA 3HF3A 3KVLA 4O14A 2J9ZA 3W1QA 3W72A 1A5BA 1HO4A 4BFAA 4AEOA 1GWJA 2PURA 3QPYA 3QC3A 4A29A 3RFAA 2P1FA 3V1PA 3WK1A 4A22A 1FCBA 3NM1A 3JS3A 2E5BA 3MW7A 1SSGA 4S1FA 3W9ZA 3GVGA 4O0KA 4FX8A 3M6YA 5D02A 1XFBA 2C18A 2GUUA 4BR1A 3O63A 3C0JA 1QO2A 3WK3A 1GG1A 4DF1A 1KM1A 4MY9A 1KLYA 1NAL1 3OVPA 1GT8A 2XFWA 2OMAA 4CNOA 2CLKA 1XUUA 1YPFA 3H53A 2Y7DA 4MZ8A 1T96A 5DXXA 4MY1A 3M0ZA 3S5OA 3OIXA 1TRDA 3W1LA 3GAKA 3P62A 1K8XA 4M6PA 3FEMA 4GUFA 2JKEA 5FF3A 4I7VA 5F4WA 1ME7A 2YX0A 4EWND 3M5ZA 1KBJA 5K4XA 2TMDA 2QEZA 1DJQA 3ABSA 3OHIA 4HN4A 4MFDA 4C1KA 4Y90A 4WXYA 4GXMA 3OBKA 2QR6A 4LVGA 1ZJIA 4MOZA 3STEA 3TH6A 1FY6A 5K2ZA 2ZZ6A 4RV8A 3BLEA 1OFEA 3FS2A 1VQTA 1YYAA 4Q32A 2NX9A 3DHFA 5FESA 1WX0A 1KFEA 5LNRA 2J24A 3VKJA 1MEHA 5EL1A 2YW3A 2QUTA 3BG3A 1TPEA 4CQAA 2Y70A 1GVRA 1K7XA 3L5LA 3CU2A 4HSNA 2OT0A 2ZZ1A 3ZR4A 3WFAA 1I2RA 1WBJA 3EKZA 1KW1A 3DI0A 5EYWA 3OVRA 3W7QA 5LHFA 1BTMA 2NV1A 1LBLA 1QCWA 2C0AA 3S1UA 2ZZ7A 3NZRA 4IMEA 5HR6A 1HFBA 2EAWA 2V2CA 1LROA 2FTPA 4UFKA 1Q3NA 3PULA 1IIHA 4HNTA 4HHPA 5G2HA 5LKYA 1GVOA 1VPXA 1I2OA 1OHLA 4O1CA 3T4CA 1ZY9A 4GC4A 4YMZA 3DENA 4ORMA 2TPSA 2WOQA 1H7RA 3W86A 1W3IA 3PM6A 1H62A 1TV5A 3P74A 4RR4A 4Y96A 4NVTA 2OCZA 3NXFA 2X30A 1YXCA 3PR2A 4QAIA 3NDOA 1L2UA 4JDBA 3FIGA 1J2WA 1PCKA 3PWAA 4JNMA 1ZENA 1UASA 3WJYA 1ALDA 4LRTA 5I3GA 5TBOA 1OF8A 2ZCGA 5CZJA 1ICPA 4A21A 4EF9A 5AYZA 2DZWA 3N3MA 4O10A 4HIBA 3S6DA 4YL2A 3A24A 1ME9A 4CCDA 1KFBA 1JCXA 3SGUA 2X1RA 3C4UA 4WX2A 1SZNA 3PF3A 1F6KA 5DY2A 3OG3A 5HWNA 4XWUA 2CFFA 4Z1AA 1IGSA 2VFGA 2A5HA 1TJRA 3TUUA 3DFQA 3NQCA 3A21A 4LOCA 4Y8FA 3W1MA 4EOUA 1MZHA 2HTMA 4JYDA 4JTEA 4EVZA 1S5TA 5I3FA 2Y7EA 2CLIA 2YYTA 3QZEA 1RQHA 3TXVA 4CNPA 1FWWA 1AL7A 2C6QA 1TQXA 4DF0A 5K3VA 3WJXA 1R2TA 2V30A 1U5JA 1KM2A 1RR2A 1H7OA 1WYIA 1TPDA 3W23A 1D9EA 2WV8A 4UFHA 5MHBA 3HG3A 4FO4A 5I3KA 3AJXA 3NQAA 3NR0A 1Z48A 3C2RA 2PRHA 3VCRA 5C54A 4IXHA 5FEXA 4UC5A 3SECA 3CEUA 4O12A 4UMCA 1P5BA 2HS8A 1F74A 2F84A 3W7NA 2J6XA 1CI1A 4NXSA 4O0ZA 3W84A 3O8AA 3FYPA 3GIYA 3HGJA 3EKLA 4Q33A 2E5DA 3TSDA 4OV4A 4AF0A 1JULA 1QPQA 5FF2A 1YTEA 1MXSA 1TRIA 4MJZA 4GWEA 1JCYA 4UFIA 4WJEA 3C2FA 4LY8A 4GFSA 1LM1A 1LCOA 3TMQA 3DFNA 1QFEA 3BG5A 4YLWA 2QF7A 1TPWA 1N55A 1OABA 3HPZA 4K36A 4N9DA 2C14A 2ZRUA 3W22A 2QAFA 5LGZA 2QCGA 4IMGA 3O6YX 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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