1TZ7 | Genus

Total Genus 184

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	184
sequence length	488
structure length	488
Chain Sequence	GSHMRLAGILLHVTSLPSPYGIGDLGKEAYRFLDFLKECGFSLWQVLPLNPTSLEAGNSPYSSNSLFAGNYVLIDPEELLEEDLIKERDLKRFPLGEALYEVVYEYKKELLEKAFKNFRRFELLEDFLKEHSYWLRDYALYMAIKEEEGKEWYEWDEELKRREKEALKRVLNKLKGRFYFHVFVQFVFFKQWEKLRRYARERGISIVGDLPMYPSYSSADVWTNPELFKLDGDLKPLFVAGVPPDFFSKTGQLWGNPVYNWEEHEKEGFRWWIRRVLHNLKLFDFLRLDHFRGFEAYWEVPYGEETAVNGRWVKAPGKTLFKKLLSYFPKNPFIAEDLGFITDEVRYLRETFKIPGSRVIEFAFYDKESEHLPHNVEENNVYYTSTHDLPPIRGWFENLGEESRKRLFEYLGREIKEEKVNEELIRLVLISRAKFAIIQMQDLLNLGNEARMNYPGRPFGNWRWRIKEDYTQKKEFIKKLLGIYGREV

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Transferase
source organism	Aquifex aeolicus
publication title	Structural influences on product specificity in amylomaltase from Aquifex aeolicus rcsb
molecule keywords	4-alpha-glucanotransferase
total genus	184
structure length	488
sequence length	488
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.4.1.25: 4-alpha-glucanotransferase.
pdb deposition date	2004-07-09

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF02446	Glyco_hydro_77	4-alpha-glucanotransferase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	1tz7A00

4XZBA 1LF1A 5A6JA 2WMGA 4W7UA 4HZ8A 3MUIA 1QNRA 1GNXA 4D71A 3DHUA 3CZKA 4W7VA 3WDJA 5F7UA 2X8RA 1V3MA 3W28A 2VOTA 5GNYA 1VFOA 1W2PA 2IUZA 2PWDA 3VD4A 3JUGA 1H4PA 2XUCA 1EDGA 4HMDA 1GQLA 5JBFA 4ACZB 2MANA 4S3KA 4C7DA 3GBDA 3S6TA 4KH2A 3F4VA 3WQWA 1PZ3A 4M82A 3VIGA 2YDQA 1C91A 1UWSA 1E6NA 1W9UA 1EDTA 2IXUA 2OWWA 1US2A 3WD0A 2QMJA 4CCCA 4CVWA 4URIA 2GJPA 3BAYA 3VGFA 1QNOA 1KQYA 2PB1A 1E3XA 2ZX5A 2BV9A 4FLQA 2WANA 1JZ8A 3ZSSA 3AZSA 2XIIA 1E3ZA 2OSYA 3SCQA 4Z2JA 4MDOA 1UD4A 1SYTA 1WO2A 4OJYA 2JEPA 3PTKA 3RO8A 3CZEA 1CXKA 3WQVA 4B16A 2XWEA 2WHKA 1JI2A 3AS2A 1MFUA 3CUJA 4W87A 3VM5A 2WMIB 3BGAA 3L2MA 4X9YA 1JNDA 3SCVA 4MJ2A 1W1YA 4JFUA 3WUGA 1XSKA 3MUZ1 1UA3A 4D1JA 5HOSA 1JZ6A 1BYDA 2OWCA 1XH2A 3AMLA 2DH2A 4U3AA 5AYIA 5BXTA 1QNPA 3LPPA 1FH7A 1CZ1A 2WKGA 4NSBA 2DQXA 2VL4A 1QNQA 1JFXA 1OT2A 3CMGA 2G3JA 3IAPA 2VZTA 4GZJA 2VZOA 1EHNA 3A4AA 1UHVA 3BLPX 1MW1A 1XC6A 4CN1A 1VEOA 3WF4A 4ZE4A 1BVNP 1UWUA 2WMHA 2ZUTA 2F8QA 3WH8A 3EDJA 3BSHA 4AZCB 3AHYA 2VVSA 4NRRA 1I75A 4WJXA 3WEZA 1U2YA 4TXEA 4CD6A 1J0YA 1QHZA 2V3EA 1HJSA 2CIPA 1KCKA 2WMJA 4JHZA 2XFFA 3A4WA 1FFQA 2FGZA 3ARVA 1QHOA 3KWXA 4BQ4A 3AYRA 5E0FA 3MV01 5BXSA 2XJ7A 2FH6A 3QHNA 1W9BM 3T2PA 5KEZA 2QMKA 4JFWA 3ARQA 4Q22A 4JKMA 2DT3A 1XSJA 2OYKA 2J62A 4BA0A 1FH9A 1QVBA 3W37A 2E9BA 1GW1A 3GXDA 5I3DA 3FAXA 5D4YA 4W5UA 4NF7A 3L4YA 5IDIA 3NCOA 1MVYA 1UWRA 1CYGA 1B2YA 1JDAA 4CGTA 1R86A 2CBJA 1KXVA 4ACZA 1AQMA 1QPKA 1SR0A 4UOQA 4XUYA 3RMEA 1C93A 2WCSA 4CU6A 3UR7A 4PUEA 4ATWA 1UZ4A 1E40A 1W1TA 2C7FA 1FP8A 2XFYA 3L4UA 2BS9A 2VUYA 1V6VA 3CZJA 4FLOA 2G3MA 1HN1A 2DEPA 3EYPA 3WNKA 1VEMA 2WWCA 3NJ3A 4PRWA 1E1FA 1H0IA 1CGXA 1CNVA 1XRVA 5ABFB 3WEMA 4JFVA 5GNXA 3HU7A 3OLIA 2DSKA 1V02E 1E6ZA 1GJUA 2UY3A 2VCAA 2XGBA 2ZICA 3NDYA 2C0HA 5CPTA 2BHUA 2UY2A 4JHOA 3WF2A 1RD6A 1W3JA 3D5HA 2XVKA 4U2ZA 2UWFA 2CESA 1XV8A 1QBAA 4UZSA 1WDRA 3BAWA 2XWDA 4M29A 1XD0A 1CIUA 5FD0A 2WMIA 1HJQA 2DT2A 2ZWYA 1V3KA 2A3HA 3BMVA 5IHSA 2WZIA 3RJXA 5A3HA 2NT1A 4D1IA 5GNZA 1CPUA 4H8HA 5ECUA 1GHSA 3PN8A 3M07A 1Y7VA 2E8YA 1PPIA 4YPJA 2A3AA 4DUVA 3F5JA 4IPNB 5ABHA 1OB0A 1R7AA 2DT1A 4PBGA 2VCCA 3ZJ6A 3WNPA 2D2OA 1V0MA 2ZX9A 2QHAA 5FIPA 3II1A 3AMKA 1G0CA 3WD2A 4L4PA 3WH9A 2CETA 5AY7A 3ARWA 3OLDA 2PBGA 1B3WA 1NWRA 2W5FA 2WC7A 5HDRA 5C70A 2O9PA 3MU7A 3W81A 1HIZA 4DWSC 2VJXA 4OIFA 4AZCA 3CTTA 1OD8A 4JKKA 4AD2A 4MB1A 3ARTA 1QI4A 2YBTA 4CVUA 1AQ0A 2WCAA 1JAKA 1MWOA 3WSUA 2V5CA 3TTYA 2DH3A 1DWAM 3CUHA 3UG3A 3VTRA 4AZBA 5A1AA 1UWIA 4AZ5A 3MMUA 1KXTA 5CGTA 3BAKA 1RPKA 2WNWA 5A94A 2E8ZA 3CH9A 2EPKX 3U57A 3WNLA 2CKRA 2Y5EA 1DWGM 2OYMA 4BS0A 1VJZA 3BSGA 5FL0A 4GZIA 3WNMA 1PAMA 5E70A 2XHYA 2E3ZA 3A47A 2UY4A 2EPNA 1QI3A 4CU8A 1EA9C 1HJWA 3QHOA 1XCXA 4P8XA 1GOOA 4UQBA 3WIJA 1E6XM 3MS8A 4V28A 4YHEA 5I79A 1CGVA 1EXPA 4Y7EA 4D72A 3W26A 1HKJA 3E1F1 5KZ6A 1J11A 3QOMA 3QHMA 1U33A 2ZXBA 3WDHA 2XSBA 3F5KA 4IPLA 4W86A 3WH6A 1V0NA 2DIJA 3T0BA 3UETA 1JYXA 4GO9A 4OKDA 1OGSA 3B9DA 4KWUA 4DM2A 4B15A 1DWHM 3MUAA 1OBAA 1VEPA 3FHQA 1NH6A 1E43A 1C8QA 1VBUA 1W3KA 1C8YA 3SCTA 4GI8A 1M03A 1ZBCA 3WDPP 4EK7A 5A2CA 2A3CA 3WNNA 2GJXB 1CXEA 3CLWA 2ZXQA 1QI5A 1DWJM 2BHYA 1VAHA 2JF6A 2WHMA 2QLYA 4LYPA 4OBRA 4ATLA 3SCSA 3UERA 4FLSA 5ABFA 4QAWA 2F61A 1ODZA 5DF0A 1C3FA 1ZBVA 2GUYA 5CPQA 3POHA 1JXKA 3WH5A 1BYBA 1RP8A 5BROA 3APGA 3VX1A 3N17A 2JF7A 3RDKA 1M01A 2HVMA 1DEDA 2AAAA 5A8OA 4W85A 4XX6A 3VIPA 3WQ8A 1PX4A 1GZJA 3EDFA 3OGSA 2O92A 3VKKA 1B9ZA 1HX0A 3T2OA 1UR1A 4MAVA 4LGXA 1GOWA 2VX4A 4M80A 2ESCA 3MANA 1EIBA 3B9EA 1UKOA 1CTNA 3WEOA 1NARA 1CWYA 4ATDA 1MQQA 1BGGA 2CHNA 3VX0A 2CYGA 2J8FA 2J77A 4TUFA 1H09A 1LLOA 1W1PA 1QW9A 3WQ4A 4AZ6A 3VMPA 3QOKA 4B9ZA 2EEXA 1GPFA 2J74A 1NM9A 3SUTA 1GOIA 2VR5A 3MV11 4E4PA 4H04A 4D6JA 4R5EA 1CEOA 4J3VA 4P7RA 2J78A 1E5JA 3CZLA 1H49A 1FOBA 1V3LA 4AIUA 4HPGA 5HXMA 3CHEA 1AQHA 4PMOA 1VENA 1YHTA 1MW2A 2D20A 3UR8A 4J28A 3VUPA 5CLTA 2YBUA 1J0JA 3SCRA 3WD4A 3SEPA 2E0PA 2D22A 1J0IA 2W62A 3ALGA 4TVCA 3HN3A 4AISA 4KGJA 4KGLA 1CLXA 3W24A 2VVNA 4WKAA 1B0IA 1JD9A 1UR8A 2RGLA 3AOFA 4V2XA 1KB3A 5M17A 3PZIA 3T09A 1J0ZA 1FP9A 1GOKA 3F5LA 1A3HA 3FY1A 3W6LA 4EAMA 3ARUA 4P7OA 3ZT6A 3J7HA 2O9TA 4BQ5A 1BTCA 1JIBA 1UKPA 1LL7A 3WENA 1JXJA 2EPOA 3PTMA 5D9MA 3N1AA 1B1YA 1NQ6A 3BMWA 3N12A 4B3KA 3ZJKA 1RH9A 1MYRA 3AXXA 1TVNA 4V27A 3QR3A 2YA2A 1W9PA 3WDIA 4ZXLA 4EE9A 3T2QA 4JCLA 4MNLA 4AW7A 2J8GA 4MNMA 3VVGA 4HMEA 1BVZA 2YDRA 1C92A 1JZ3A 3VIMA 1B31A 1W2VA 1G1YA 1XYFA 1MXDA 3AMDA 3AZTA 4JCMA 2XM2A 1LWHA 1W32A 3KZSA 3WKZA 4HU8A 4QCEA 1W9DM 4LXFA 3W38A 2DSVA 3ARSA 4UFIA 4JZ5A 2CKSA 3RPMA 1NP0A 1ECEA 3M6DA 4CD8A 1VRXA 2O9OA 8A3HA 2W63A 4H7VA 4IISA 2CPUA 2EXOA 2GJXA 2ZXAA 1J01A 2J7BA 2XYLA 1E4IA 2FHBA 3TOPA 3BC9A 1WCGA 1E6SM 1OM0A 4ML4A 1H11A 3GM8A 1CECA 3RM9A 3ZT7A 2WZHA 2W66A 3L4ZA 1ZL1A 3PZTA 1OGBA 1V02A 3FW6A 2WBGA 4PMZA 3AS1A 3NUKA 1BAGA 4UNIA 1K6AA 4N42A 3AJ7A 4WSKA 2E9MA 2WBKA 4AWEA 3M46A 1X1NA 5D9OA 2D3NA 1DTUA 1WDQA 1CLVA 2DSUA 4AIEA 4PMXA 1ISWA 4PMVA 1OCQA 1GQIA 1QI0A 1G94A 1VB9A 2VZVA 3AIQA 2ZUVA 1BGAA 4L4OA 3VIIA 2GDUA 3L4VA 1EDQA 1A47A 1W9XA 2JIWA 1XHGA 2WVVB 4AXNA 3B8SA 1B3YA 3CUIA 4TOQA 4OOZA 2UY5A 3GYCA 1HVXA 2WHLA 3VD9A 1J0KA 2ZIDA 1J0HA 1CENA 3U7BA 4KRUA 4MB4A 1SMAA 3AI0A 3WQ6A 2XPKA 4UR9A 6A3HA 1N82A 2E4TA 2XGIA 4H8VA 2PF0A 1C90A 4AD1A 3OBAA 1WE5A 1TA3B 1H41A 3AIUA 2Y2WA 4W5ZA 2VZUA 2YIHA 4JFTA 1GHRA 3FHAA 3NSMA 4P8VA 3D3AA 1I1XA 4W8LA 5I77A 4WK9A 3TTQA 1E73M 2OSXA 2WVUA 4CN6A 4MTVA 1W3HA 3U5YA 3VNYA 3VNZA 3W25A 5DT7A 1JD7A 5GQBA 4WKHA 1YQ2A 5E0CA 1KR0A 4FLRA 4A3HA 3GXFA 1BSIA 1HKMA 2VQUA 3ARZA 2WB5A 1NP2A 8CGTA 1OSEA 4M1RA 1OIMA 2PWHA 4TX6A 4F9JA 2YLLA 5CG0A 1B3VA 3GNRA 3MSGA 3AROA 3VGHA 3CMJA 9CGTA 1V6UA 3PZGA 3T0AA 1HJVA 5M3WA 3OZPA 1WNOA 4UFKA 1E0XA 1E4NA 4J27A 4CN4A 4W84A 3AS3A 4RE4A 2BNJA 3ALFA 4IUGA 3AQUA 1GOQA 1HP5A 2J25A 2BY2A 5A8PA 4YN5A 5ABGA 1LQ0A 2VI0A 4UFJA 4AEEA 5BYWA 1BYCA 4CUCA 1UD6A 3SUWA 4U5IA 5JUVA 2GFTA 1XH1A 3MMDA 1BG9A 4QLKA 2WHJA 3W29A 1JG9A 1O6IA 4D6DA 3W0KA 5LA1A 3W53A 7CGTA 2WWDA 3EBVA 5I0DA 5HNNA 1E1EA 3U5UA 3RILA 3PZVA 3GH4A 2D1ZA 1FH8A 3G6MA 5E6ZA 1UD2A 4JL2A 2ZX6A 1B30A 5I2UA 1GVYA 3I3DA 2WVSA 2CNCA 2EPLX 3WMCA 2V3DA 1NWUA 2WSPA 4AD4A 1WZKA 3HMCA 1OIFA 3WBAA 3GH7A 1ITXA 1XD1A 5CSYA 2IXVA 3ZSTA 3CHDA 4C7GA 3ARRA 1ISXA 4S3JA 4CD4A 4D6IA 1E0WA 1TZ7A 1UH2A 4AIOA 3ZR5A 7TAAA 1E9LA 4QFUA 2BY1A 3WH7A 1L8NA 4D6EA 3LPOA 4CD5A 1JYVA 3OLGA 3AHVA 4OOUA 3O9NA 3IJ8A 2ZX7A 1JF5A 1E55A 2VX5A 5BRPA 2ZUNA 4N0RA 4X0NA 3K8MA 3ZIZA 3AMGA 3L2LA 3KE0A 2ZUSA 2EQDA 3AXHA 2WCGA 2WVVA 4DWSB 4HMCA 2C8NA 1V03A 4JKLA 2QPUA 1WDPA 1WP6A 1S46A 4PTXA 1Q6EA 1LG2A 4GKLA 4NZCA 4HZ7A 3DYMA 4TX8A 1CDGA 1SMDA 3ZO9A 2X09A 4M81A 3GBEA 2W67A 3FNDA 3PZUA 1DWFM 3KEHA 1DP0A 4GI6A 1DWIM 3ECQA 2J7DA 4UOZA 1UR4A 4UZUA 1TA3A 1ZU8A 4PMUA 3UESA 2J7EA 3AISA 1E6RA 2EPMX 2PI6A 3OB8A 1JZ5A 2G41A 4E2OA 4NRSA 2DSWA 4OZOA 1BFNA 1G9HA 4QDMA 4IM4A 1EOKA 2J7CA 1WDSA 1Z32X 4HTYA 3VDAA 1BHGA 3WBEA 1Q6GA 4BZYA 2ZX8A 1FHDA 3PZMA 1IZKA 4PN2A 1V3HA 2CEQA 2VRKA 4JL1A 5I23A 1UD3A 2VR4A 2WSKA 4AYSA 2VURA 1HKIA 1XH0A 3NDZA 2WVTA 1IZJA 2EBNA 4PMQA 4GQQA 4WKFA 1KCLA 1E70M 5I24A 3VIJA 5C8BB 2X05A 1HL9A 3N18A 5CQ1A 2Z1KA 3UCQA 5LA0A 2XVGA 4F66A 1HJUA 4DM1A 3WUFA 1JYWA 4M24A 1US3A 1EO7A 1TR1A 3OA5A 4PCTA 5BRQA 1MQRA 2BHZA 4D6GA 5HPOA 1UH4A 1OINA 3VGDA 4M56A 3ZR6A 4UQCA 3WUEA 2FH8A 5ABEA 1GQKA 2YKKA 2WPGA 1JZ4A 3OLEA 3OZOA 5A6KA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1MW3 A;  3DEC A;  1UUQ A;  4AZG A;  5E09 A;  6TAA A;  4P8U A;  1XSI A;  1X6N A;  4MNJ A;  3VMO A;  1XCW A;  3EDK A;  4XZW A;  5A8M A;  2YL6 A;  2QPS A;  4PSR A;  1TUX A;  3EMQ A;  3CHC A;  1K9E A;  5HBF A;  5C71 A;  2D3L A;  3GNO A;  1B3Z A;  4B3L A;  1ZBW A;  1QHP A;  2JIE A;  5BXR A;  2PC8 A;  1PEZ A;  4NI3 A;  2DSZ A;  5AC5 A;  3IAQ A;  4HPH A;  2V3G A;  2D23 A;  2BVY A;  2B31 A;  2DIE A;  1CXF A;  1OGG A;  2W4X A;  2G8Z A;  1FFR A;  4PTM A;  2D0F A;  7A3H A;  2W92 A;  2WYS A;  3K1D A;  2ZUW A;  3WFZ A;  1LWJ A;  1KBK A;  4Z2L A;  4TVD A;  1DHK A;  1JGI A;  1V6X A;  1RP9 A;  3VOC A;  4LYQ A;  1WB0 A;  3THD A;  2CXG A;  3WF0 A;  4J3W A;  1JDC A;  2V38 A;  5BXP A;  1D3C A;  3ARY A;  4UQE A;  4W93 A;  4AZH A;  5JIP A;  3WD3 A;  3EDD A;  3SUR A;  2BVT A;  3DC0 A;  4MPK A;  3DHP A;  2QV4 A;  3WF3 A;  4GI9 A;  4F9D A;  4HOX A;  3GXI A;  1R87 A;  1GJW A;  1KBB A;  3LMY A;  3BCF A;  1PIG A;  3DYO A;  5D8Z A;  3MKK A;  3WFL A;  3K8L A;  3SIM A;  2JEQ A;  3WNO A;  2BVD A;  3A4X A;  2BXY A;  3VIO A;  3CBW A;  3ZJ8 A;  1VJS A;  1E0V A;  4C7F A;  3GDB A;  1VBR A;  2G4F A;  1GQJ A;  2G3I A;  4HA4 A;  5HPC A;  4B9Y A;  4QP0 A;  4LPC A;  1WPC A;  2VX6 A;  2PWG A;  2YJQ A;  4MJ4 A;  4U2Y A;  4PUD A;  2PWF A;  1HT6 A;  3SUV A;  1LL6 A;  1V3J A;  4PMD A;  1E71 M;  2W91 A;  4H2C A;  4FF5 A;  4KMQ A;  4R27 A;  3AHX A;  2Y8K A;  5A8Q A;  4ZFM A;  3SUS A;  1E56 A;  3ARX A;  4MAZ A;  1JF6 A;  3WQ5 A;  1BG4 A;  5D9N A;  2VO5 A;  1VFF A;  4WIW A;  3CPU A;  4GXP A;  2TAA A;  4GO8 A;  3VIL A;  4E8D A;  2VQT A;  3L4T A;  1IT0 A;  3AFB A;  2G3N A;  2D0H A;  4FK9 A;  2GSJ A;  2GJR A;  3EMC A;  4PTV A;  2YL8 A;  2GDV A;  1HP4 A;  2GK1 A;  2WLY A;  1KWK A;  3VD5 A;  1ESW A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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1TZ7A

Total Genus

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