2A6NA

Dihydrodipicolinate synthase (e. coli)- mutant r138a
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
292
structure length
292
Chain Sequence
MFTGSIVAIVTPMDEKGNVCRASLKKLIDYHVASGTSAIVSVGTTGESATLNHDEHADVVMMTLDLADGRIPVIAGTGANATAEAISLTQRFNDSGIVGCLTVTPYYNRPSQEGLYQHFKAIAEHTDLPQILYNVPSATGCDLLPETVGRLAKVKNIIGIKEATGNLTRVNQIKELVSDDFVLLSGDDASALDFMQLGGHGVISVTANVAARDMAQMCKLAAEGHFAEARVINQRLMPLHNKLFVEPNPIPVKWACKELGLVATDTLRLPMTPITDSGRETVRAALKHAGLL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Escherichia coli
publication title Role of Arginine 138 in the Catalysis and Regulation of Escherichia coli Dihydrodipicolinate Synthase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Dihydrodipicolinate synthase
total genus 110
structure length 292
sequence length 292
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.3.3.7: 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase.
pdb deposition date 2005-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2a6nA00
3FFSA 1GVFA 2A6LA 4O1AA 4S1FA 4RZ6A 2XN2A 3OVQA 4KKXA 4HPJA 1D3HA 1VLIA 3LHWA 4JTSA 4R53A 3GR8A 4M6PA 4XQ6A 5AC8A 1CW2A 1HTIA 3A5VA 1VCGA 3VI2A 2Z6JA 1OF8A 2FB3A 5D38A 4DO5A 2Q8LA 4PC8A 1YXCA 5FF4A 4U28A 1LROA 3G18A 3TQKA 1MXSA 3G1DA 4LVDA 4IMGA 4BI7A 1DJNA 4JX5A 5C6MA 2TSYA 3CU2A 2VFIA 4MY8A 2C19A 3STGA 3VKJA 4FNSA 4Z1CA 4ADSA 3L9CA 4WD0A 4Z1BA 3NPWA 2DJLA 3NQ2A 2A5HA 1JUBA 3N9SA 3WK3A 2O7QA 4FIRA 3W7LA 5U7SA 2RKXA 1OF6A 4LY8A 3S1XA 5A8GA 4IX2A 1T99A 3HPXA 4UFIA 3LM7A 4MFDA 1ZHAA 2CWNA 1EX5A 1SFJA 4MYAA 3LCHA 3R8RA 3ZWTA 4OU1A 3W75A 3IVTA 1TYGA 1SR9A 3GXNA 5CZJA 1SO5A 4BF9A 4POCA 3DAQA 3ELFA 4LT9A 2H3BA 2ZZ6A 3P5YA 3I7QA 4IMDA 2OZ0A 3P80A 5D04C 1W5PA 3EWUA 4LC6A 3N2MA 3MJYA 5D2TA 4Z08A 3LERA 1U83A 2ISSA 3W1XA 3HGRA 1ADOA 1YDVA 4OE7A 1YTEA 3QF0A 1NSJA 1QNVA 3T40A 3LCLA 1UUOA 7TIMA 3MHUA 3SSJA 3QYQA 3W1AA 3HGOA 3S9YA 1A50A 2JKEA 3CM4A 2CLOA 4GXMA 2GQ8A 5FF7A 4QISA 2NXHA 1VCFA 4A2SA 3CQ0A 4PL2A 4Y8FA 1YPFA 3IIVA 2VC6A 3O07A 3C61A 1LRNA 3SGUA 3TDFA 4UTTA 1FY6A 3W71A 1G4TA 3B4UA 3LHUA 3NL5A 4FIQA 1LBMA 4WOQA 3GDRA 3FEMA 1R2TA 3TJXA 5F2GA 4FNQA 4IXHA 4CCDA 4N9DA 5EKYA 2NZLA 2WQPA 1SZEA 3HG4A 1M7OA 3P82A 1LBLA 1WDWA 3G1HA 4NNCA 5HR7A 2Y7FA 3W7GA 3WK2A 1EPXA 4PEKA 3C2FA 3I65A 4QIUA 5IBXC 1MEIA 3RLUA 1PL9A 1K7XA 5I3FA 2ZA1A 2WNNA 1KM1A 4EIVA 5LNWA 3U6WA 1GOXA 1JRBA 4N9CA 4O18A 2VEMA 3CC1A 2FIQA 3ZS4A 4XKYB 2WSQA 3QW3A 5I3JA 3LGEA 2QCDB 2WSRA 5HMSA 1DKWA 2X1UA 4XKYA 3LCGA 1FWRA 2QCDA 3QSTA 2Q3OA 1OX6A 5CKSA 4MY9A 4NNAA 1KFBA 3TJLA 3DFQA 5HUOA 3TC6A 3W7RA 5DXYA 1OX5A 4YXGA 2V2CA 2YDAA 1LDCA 3HJZA 3LHVA 1GYNA 5F1UA 3K30A 1TRIA 3PBWA 3NQ8A 4YCOA 3H54A 2YR1A 1X1OA 4N4QA 2ZZ3A 1QOQA 1EP2A 1UJPA 2Z0IA 3UPWA 1JVNA 2E5CA 4AMAA 3GNDA 3KRSA 1ME7A 4ICNA 3OHIA 2XN1A 2WOQA 2BXVA 2V8ZA 3HG3A 3NQDA 1JCXA 4G1KA 3W3OA 3SI9A 1JCLA 3N14A 2RDUA 4O53A 1Q6QA 4AVFA 3HG2A 2BX7A 3IEBA 3W1UA 6ALDA 4HKPA 3TV8A 1SZFA 3LV6A 4UTMA 4RR4A 3JR2A 4OGZA 4GRSA 2ZYFA 3PG8A 4P61A 2B0MA 4GUJA 4N4PA 3TUUA 1WV2A 3L5AA 5SWUA 3QSRA 5MHBA 2QCNA 5ABTA 2E6DA 1AK5A 3U8GA 2A6NA 2DU2A 3M5YA 3LCIA 2ATMA 3W7CA 3KVJA 4WY0B 4NJKA 4QNWA 3S5YA 4M19A 4AWTA 5TQLA 4FNPA 2Y6ZA 1I2QA 4JTUA 2QAPA 4UNKA 4LOCA 4IPJA 1H50A 4D2JA 1ZFJA 1DOSA 2NUXA 4TO8A 3W87A 4WOZA 5L9FA 3DBPA 3G8RA 1SO4A 3LLFA 1M5WA 3GAYA 4E38A 3EX4A 3GK0A 4MKNA 1VHCA 1W1ZA 4ZZ9A 3E02A 3W1TA 3CLMA 4A21A 1IXPA 4TX9A 1QMLA 3W2LA 2Y63A 4E2BA 1RQEA 2V30A 3FJ6A 3EX1A 1I4NA 5F2MA 2WNQA 4OV4A 4LV9A 4X2RA 1W31A 5FESA 1I2PA 2X2GA 5K3VA 3N2XA 3TA6A 2FPYA 1MO0A 3MI6A 4QSHA 4LRTA 1DV7A 5CGQA 3HOJA 1YPIA 5F1VA 3BV4A 1L6WA 3W9ZA 4LNYA 2GVLA 2HS8A 2QCHA 3NYZA 4AF0B 1H63A 3E12A 1D9EA 1J4EA 3VE9A 4J9JA 4AF0A 2ZA3A 1EP1A 1TB3A 3UXDA 1L6YA 1GPWA 3NQAA 2ZDRA 3G0XA 3G8EA 1NF7A 4OT7A 5D30A 1MEWA 1VJIA 1K8YA 1H61A 3IVSA 1PVNA 2X1RA 3M0ZA 1FDYA 4DO6A 2XFWA 1NF0A 2ABAA 5KITA 5AHLA 1QR7A 3PVFA 3EWBX 1OFEA 4AEOA 1DVJA 3MP4A 1KA9F 3O6YX 3P5ZA 3GDTA 4FNTA 1D3GA 4LU0A 1ZCOA 4XBSA 3SFKA 2VELA 5G2WA 1KV5A 3MWAA 4DO4A 3O05A 5AHIA 3SY5A 3LRKA 5FEWA 1LLWA 1ZAIA 3PULA 1TTPA 5F4WA 1GYLA 1PV8A 3TKFA 3RLVA 3H53A 3B8DA 2B7NA 2BTMA 4K8EA 4LVAA 3LBCA 5J5DA 3DGRA 1F2JA 5C2XA 3EX3A 1N8FA 3BARA 1NAL1 3W07A 2DZTA 3HQ1A 4N2YA 4DBEA 1FDJA 1JQVA 2QCFA 1GZGA 1FCVA 4NNBA 4Y6GA 4UFHA 4O28A 5HINA 4M7TA 1OVDA 3QQ1A 3RF9A 3HB9A 5BMXA 4A2RA 5FF0A 2J6XA 5HR6A 1VHNA 2P1FA 3LCWA 3O1NA 5AN7A 5L6UA 1R46A 1AMKA 5BMWA 3LBMA 3NO5A 3B0UX 1AL7A 3MO7A 2ZBTA 4GE8A 4PFMA 2D73A 5HWNA 4NJJA 4LS0A 2JBMA 3DKJA 1W5QA 4K6AA 4TMBA 3W2KA 1H1YA 2VENA 4U4MA 2E5DA 1YDOA 1ZALA 5AB3A 4XWUA 3SECA 3M5VA 1R30A 3TNOA 5FEZA 3LTYA 3DI1A 1TTIA 1O60A 4MFEA 3AJXA 1OYCA 5H2ZA 3FJLA 3PF3A 2DZWA 1C9DA 4DELA 5LNRA 1O94A 4KFPA 3G24A 1SFLA 2FPTA 4ZQOA 3NXFA 1OYAA 3TC7A 5G1TA 2TRSA 3DU0A 3BGGA 2JKAA 2ZRZA 2WO5A 1XCFA 2DP3A 2PRHA 4NXSA 4MZ8A 1R2SA 3LX9A 1WBHA 1JCNA 4ZL1A 2EKCA 3TXZA 4NX0A 3USBA 5LSMA 2E6AA 1W5MA 2V0TA 4DF2A 5E1QA 3DHFA 1UASA 4NJIA 1LCOA 4MVAA 4RXFA 1IXQA 4DQWA 3T55A 3IV3A 1G67A 1F05A 1Z44A 2QCEA 3P62A 2RDWA 1QCWA 1DQWA 1XXXA 4PTNA 3GLCA 4H3DA 2CLIA 1X6UA 1F7BA 4JDYA 1XI3A 4NUWA 3I7RA 5LGXA 1Z48A 3M6YA 3W7EA 4HSNA 3Q2DA 3TCEA 5CZTA 4RZ4A 4YMZA 3GAKA 1TPDA 3GVGA 1YDNA 1TV5A 1KFCA 3PB2A 2F7FA 1TTQA 3NAVA 4LUJA 1BWLA 3G22A 5AHEA 2OMAA 1O5KA 4N9EA 3QQ0A 3S5ZA 1OYBA 3LHYA 1EUNA 2DZVA 3GR7A 4MUZA 5FEPA 2Z2UA 2I9EA 3GZ3A 4GC4A 1H7WA 1X8FA 4QAIA 2A7RA 2A7NA 1KM4A 4NQ1A 3CHVA 4JTFA 1W3TA 3B04A 1ML1A 2QR6A 3O6DA 4JTHA 3W23A 3NPUA 1TPWA 2OT0A 2Y88A 3CT7A 5GVJA 1XUUA 3GDMA 4I7VA 4GNJA 1FCUA 1I2NA 4ZQCA 1VYPX 3C2EA 2V5LA 3ZFHA 1H60A 3L66A 1RR2A 2CLMA 4R7JA 2CLHA 2YZRA 4BR1A 1VZWA 2X30A 2DZUA 5EL1A 3LCXA 2AAMA 2VFGA 4NJGA 4MLRA 1B4KA 1KFKA 2P0OA 2QKFA 4N9BA 1KW1A 1W0MA 1QWGA 1UCWA 3HGJA 3W7PA 4W9TA 4Z0SA 3IVUA 4HNNA 2FLIA 3ABSA 1PCWA 3B0VC 1P0KA 1QFEA 2YFOA 3TXVA 3NZRA 5DY3A 4RJEA 4OQVA 4GJ1A 5DELA 3W2UA 3I6RA 3EXSA 2XN0A 1K7FA 1LOLA 1OX4B 3T7VA 4X3ZA 2YGYA 2G96A 3W72A 4FX6M 1OX4A 1PS9A 5T26A 2YFNA 4WXZA 1JCMP 2YX0A 5D05A 3GB6A 1IIHA 4KWWA 4Z1DA 5KINA 4QJ1A 1LLZA 2X1SA 4JTEA 4O8RA 2H8XA 5K7JA 3PBVA 3G1YA 3A23A 4JD4A 3S6DA 4K36A 1TPVA 4IXXA 2H3DA 3LXCA 2ZRYA 4N6EA 3C8FA 2X1TA 1DBTA 3QZEA 3G0SA 3OEXA 4RX0A 4S2CA 5C5YA 3HMJG 3KVLA 1IXNA 1HL2A 2WPBA 3BO9A 1XC4A 5AYXA 2B7QA 4E0CA 2ZA2A 1O5XA 1AW2A 3FIGA 3OIXA 4UFLA 4QITA 4UFMA 1VQTA 3W22A 3PSVA 1F73A 3CIWA 3HPSA 3MYPA 4JTGA 4UFKA 2ZTKA 4UTWA 1K03A 4O57A 3LHZA 3W1NA 3TH6A 1WYIA 3IIOA 5LGZA 1KBJA 1TO3A 3NQ6A 4FXSA 4IMEA 5LZLA 1L2UA 2J88A 1VS1A 5G2IA 3M44A 2YYTA 5G4WA 1IF2A 2PURA 2ZZ4A 5AYZA 3WFAA 3LRMA 3THQA 3ABRA 4O17A 1GQNA 3E96A 3NOEA 4PL1A 3NQEA 1A53A 5CZ0A 1QAPA 1XKYA 1C29A 3C4UA 3STFA 3MI3A 4JTKA 1SW3A 1MEHA 1QPNA 3EWWA 3KRUA 4TMCA 3A22A 1FCQA 3NPXA 3PS7A 4UTTC 4JTLA 1TPFA 1LTDA 3TAOA 3THAA 5I3GA 3AO0A 5LHEA 3KX6A 1GTEA 5K9CA 1TCDA 3C56A 4AAJA 5I3KA 1EEPA 5U4NA 5DN1A 3MMTA 2W6RA 1JCJA 3OA3A 1O95A 4O12A 3PY2A 4UCGA 5IM51 3M5ZA 4GUIA 4O52A 3PAJA 4GUHA 5DBUA 1ICPA 2GQAA 1OK6A 2WNZA 1JR1A 4NXKA 3I68A 4CCEA 4EOUA 5FEXA 3TMLA 2CZFA 3QRHA 4MLJA 4IGHA 3PB0A 3TFXA 4JTTA 3PSWA 1OABA 1RV8A 3PBUA 3DH7A 5H91A 2YYUA 1YXYA 3VE7A 1ONRA 3W74A 2F84A 3KXQA 3HPZA 1THFD 2FFCA 4AH7A 1W8SA 3STEA 3IGUA 3KRZA 2NXIA 4IMFA 2VFHA 1WBJA 1TREA 4ZQPA 1R47A 2EAWA 2ISVA 1UBSA 2B7OA 4XBKA 3DFSA 3L0GA 1K8XA 4UUIA 2C0AA 3G1XA 1Q6RA 5AHFA 1GVSA 1PIIA 2J24A 2CU0A 2QAFA 3SR7A 4GFSA 4WY0A 4HIBA 1NVMA 1OFBA 2GVGA 4DF1A 1ICQA 3A9IA 4UFJA 3GNNA 4FX7A 3W1QA 2OJPA 4HPXA 3O6CA 1M6JA 1XBYA 1S5VA 3QM3A 3U2OA 4Z0JA 3FLUA 2JGYA 1GVQA 1VC4A 4UMBA 5D33A 1R2RA 1GT8A 1OK4A 3QPZA 3S1VA 1LBFA 2E77A 3NQFA 5HQEA 5CPMA 2PC4A 4O14A 4XTDA 5F2IA 1FWTA 1H7PA 4ZMGA 1SO3A 1G4SA 5D2VA 5CPLA 2VOMA 3BK0A 1PE1A 4IPIA 1H1ZA 4EWND 2ZZ5A 5K9XA 1P5BA 1LRQA 4BI6A 2A0NA 3NR0A 2QDGA 2V2DA 3DI0A 3P74A 4YL2A 3NPVA 3FKKA 5G2HA 4TU1A 4HT3A 3HF3A 1G7UA 2PE4A 3UWQA 1GJPA 4BFAA 1TPC1 3HBLA 1XL9A 2V5BA 4P2VA 2EF9A 3HG5A 3UZJA 2PRMA 1LOSA 2DZSA 4JS3A 3W7JA 4LV4A 3KAOA 1WQ5A 4KFOA 2CFFA 1NEYA 3P8JA 4L4LA 1JQXA 1RQBA 2G5WA 2NV2A 4LTSA 1VR6A 1CI1A 4M6VA 1XBXA 3TAKA 3N34A 3WK1A 1K02A 4FHAA 2C3ZA 1I8JA 1ICSA 1K7EA 4BWLA 4MIMA 3NEVA 3H55A 1OFRA 5HNRA 1FWWA 1TPEA 1H7OA 3DXIA 4KWVA 2Q3RA 3NA8A 3OG3A 1TTJA 3HO8A 4NT0A 3HGSA 2H6RA 4IOTA 2NV1A 2O7SA 3PBYA 4ORIA 3KVMA 1YADA 2OT1A 1VPXA 4OBTA 4AHPA 3GXPA 4CQAA 3GIYA 2VEIA 4CQ9A 1W5OA 2ISWA 3LB0A 5AFDA 2E6YA 1KM5A 3DFOA 4ZQNA 3IRDA 4Y9AA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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