4MDOA

Crystal structure of a gh1 beta-glucosidase from the fungus humicola insolens
Total Genus 192
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
192
sequence length
477
structure length
477
Chain Sequence
SMSLPPDFKWGFATAAYQIEGSVNEDGRGPSIWDTFCAIPGKIADGSSGAVACDSYKRTKEDIALLKELGANSYRFSISWSRIIPLGGRNDPINQKGIDHYVKFVDDLIEAGITPFITLFHWDLPDALDKRYGGFLNKEEFAADFENYARIMFKAIPKCKHWITFNEPWCSAILGYNTGYFAPGHTSDRSKSPVGDSAREPWIVGHNILIAHARAVKAYREDFKPTQGGEIGITLNGDATLPWDPEDPADIEACDRKIEFAISWFADPIYFGKYPDSMRKQLGDRLPEFTPEEVALVKGSNDFYGMNHYTANYIKHKTGVPPEDDFLGNLETLFYNKYGDCIGPETQSFWLRPHAQGFRDLLNWLSKRYGYPKIYVTENGTSLKGENDMPLEQVLEDDFRVKYFNDYVRAMAAAVAEDGCNVRGYLAWSLLDNFEWAEGYETRFGVTYVDYANDQKRYPKKSAKSLKPLFDSLIRKE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-glucosidase
publication title Structural basis for glucose tolerance in GH1 beta-glucosidases.
pubmed doi rcsb
source organism Humicola grisea var. thermoidea
total genus 192
structure length 477
sequence length 477
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-08-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4mdoA00
4MB1A 2E3ZA 3A4AA 1EHAA 1B3ZA 1OGGA 4F9JA 1U33A 4UOQA 3CUHA 2BXZA 3CBWA 4UR9A 1ITXA 3L4WA 3L4YA 1EDGA 2WCSA 2PB1A 4MNLA 5HOSA 3N17A 4AISA 5A1AA 1O6IA 1VEMA 1JIBA 5GPRA 4QFUA 5A6SA 3ARUA 3WIJA 1LWHA 2YL5A 2FHFA 4ZFMA 2XSBA 2WVVA 4A3HA 3BSGA 5CQ1A 2AAAA 4N42A 4AZIA 4M8UA 2WSKA 2VCCA 3T09A 1J01A 3UCQA 4LYRA 4GQQA 1XHGA 3AHVA 3CZEA 2J7DA 2WZHA 3WMCA 1SR0A 2DQXA 2J75A 2YA2A 3GXDA 2VQTA 5BXTA 4D6IA 3WDHA 5A6BD 3ZM8A 3W82A 1OIMA 5FCZA 1NWUA 2WC7A 5JBDA 2Y5EA 5D9OA 1V3HA 1BYCA 5C70A 2XYLA 4X9YA 4P8VA 4FMVA 4UTFA 1H0IA 2XG9A 3GH5A 1W9UA 3AYRA 3GDBA 3KEHA 4FLOA 4LPCA 3CGTA 4IPLA 3VU2A 2CETA 1QBBA 1VEPA 3L4VA 4DWSA 2JEQA 2O9TA 1LJYA 3MU7A 1KGUA 3OGRA 2VZVA 3L4XA 1VFFA 3CMGA 4ZXOA 1C92A 5TD4A 3VX1A 1MQRA 1EHNA 1HJWA 2DT1A 2E8YA 1HNYA 5HPCA 1LL4A 1QNRA 2YBUA 1TCMA 2JF6A 4J3XA 3AS0A 3VGHA 2C8NA 5CLWA 1HKJA 2VZSA 5AY7A 1V3IA 3VMOA 2UY5A 3VVGA 4TUFA 1OT2A 3PZTA 2ZUTA 2J77A 3BSHA 1OBAA 1PX3A 1M03A 2CHOA 2G3NA 3DHUA 4JL2A 2VNCA 1LF1A 2VR4A 2Y8VA 3AISA 1NWTA 1QPKA 4H2CA 1JXKA 2BHUA 4AXNA 5A6JA 3F5LA 2Q8XA 4H04A 1EO5A 3WBAA 4D6JA 2J8FA 1DHKA 5DF0A 2OSWA 1N82A 1CLXA 4WSKA 3WY1A 4PMZA 4GI8A 1KWGA 3PZMA 1DWHM 5CPSA 3WNNA 4OZOA 3WD1A 2ZOXA 1V3LA 2GUYA 5A6BA 4UZSA 1X1NA 4R27A 1JXJA 5AYIA 4UQDA 3WSUA 1GQLA 1B30A 4GZEA 1HL9A 1NWSA 1PJ9A 4JIEA 2E9BA 5CGTA 4W93A 1KQYA 4Z2IA 4PEEA 1NWRA 2CIPA 1HJUA 2VX6A 2VO5A 3QHMA 1UR8A 2NSXA 2CXGA 4NF7A 3CZGA 3CIVA 2YA0A 1E4NA 2FGZA 2WMFA 1E6XM 4AZGA 2VTFA 1BYAA 3WDRA 2XGIA 4AD2A 3KL3A 2BV9A 1UH3A 3AI0A 1QW8A 3WENA 3TTOA 3AMDA 4HA1A 5ABHA 3NCOA 2V5CA 1KFWA 3BMVA 4PMVA 1VF8A 1JD7A 3GBDA 3ALGA 2J8GA 4HOXA 4PMYA 1EXPA 1PIGA 3VIGA 2DSWA 5GNXA 4UFKA 5FKYA 5CLTA 3QHNA 3NSMA 2E9MA 3GH7A 3K1DA 4JZ5A 1B3VA 5A6AA 4D6EA 3BLKA 5E70A 4MB5A 2O92A 4NI3A 4CU6A 3TTSA 3VNYA 4DM1A 1HXJA 4Q22A 3BXWA 4M81A 3EMQA 1HT6A 2XWEA 1W9BM 1JDCA 3AZRA 2PBOA 2D3NA 4CVWA 4WK9A 1V08A 2VVSA 1GZJA 1E0VA 3WQ4A 3K8LA 1TE1A 1U2YA 2ZWZA 1GQKA 3M7SA 1Y7VA 1E4LA 2PF0A 3EDKA 3N1AA 1MW0A 1GOWA 3GZAA 1IT0A 1GJWA 1C90A 4D71A 4U3CA 1ZL1A 1XCWA 1UH4A 3UG5A 4D6FA 1CWYA 3PZVA 2PWEA 3MUIA 5F7UA 3U7BA 4RE3A 1E56A 4PRWA 3NSXA 3WFZA 5A8QA 4OOZA 2WZIA 2WANA 4JHZA 4PTVA 2VX4A 3A47A 3VILA 3EMZA 2VRQA 1UWRA 2FH8A 3ZQ9A 3AHXA 4HOWA 1LG1A 4M82A 4DM2A 4W84A 3OG2A 3CHEA 1CGTA 1JD9A 2VUYA 4HZ7A 1ZJAA 4MJ2A 4UQEA 2GJXB 3AOFA 5JIWA 2WMKA 3AS3A 4AWEA 3ZR6A 3VDBA 3VGEA 5E09A 1V3JA 5LYRA 2ZXBA 3OZOA 4MB4A 1UWUA 3K8MA 1CXEA 4E4PA 1QHOA 2OSYA 3EDJA 1TVPA 2DH2A 1ZB5A 4LXFA 1B31A 4WJXA 4PN2A 3WH6A 2YA1A 3GNRA 1V0KA 1HKKA 1W9VA 4UCFA 1IV8A 1J9YA 4AZ6A 1UOKA 1FOBA 3BLPX 4AD4A 3ZJ6A 1XD0A 2X0HA 3MMDA 4F9DA 3W53A 5IXEA 3LPGA 2CCRA 3SCSA 1HP5A 2D20A 3NDYA 1JDDA 1W3HA 1W9PA 5M17A 1O7AA 4URIA 2QPSA 4W87A 1PIFA 2A3HA 3A3HA 2VVNA 3PZIA 4M1RA 1E6ZA 1EDQA 1CGYA 3NIYA 3AHTA 4PUDA 1G0CA 5A6LA 3PZUA 3AJ7A 4LGXA 8CGTA 3FY1A 1JNDA 3FAWA 1WDQA 1AVAA 3W25A 4HOZA 1MYRA 1JYNA 5A69A 1BAGA 2X2YA 4HMDA 3ZOAA 3CHFA 3GM8A 4PMRA 5I78A 3RILA 5GNZA 1ISWA 3S2CA 2WWCA 2WMIB 3T2OA 1RP9A 3WF1A 2CESA 5BXPA 2YLLA 2DSVA 1Q6FA 1C8QA 1HL8A 4V28A 4QCEA 2NT1A 5BXSA 4P7RA 5FD0A 1IZJA 1HP4A 5E0CA 3SCUA 3AMGA 1MFVA 3WUGA 3WF0A 4TX8A 1GJUA 4PCSA 2V3GA 1EIBA 2F2HA 4JFVA 3GYCA 4BZYA 4WIWA 4UQCA 1UZ1A 3IAPA 2GVYA 4C7FA 1JZ8A 4GZIA 4QLLA 2YIHA 3OB8A 4PMXA 3ZSTA 4C7GA 1EGZA 1E72M 1NOWA 1ECEA 3OLGA 1GOQA 4CN6A 2AOSA 1HKIA 3WL1A 3CPUA 1UKOA 4FLSA 4H8UA 3GXMA 2JIWA 1WB0A 4RL3A 2VCBA 1FA2A 1W9XA 4RE2A 2X0YA 2PC8A 3MSGA 1MXDA 1KR0A 2AMGA 1VRXA 2J7EA 3AZTA 1QI0A 4J3WA 1H2JA 4D1JA 3WN6A 1OD8A 3LPFA 4PMNA 5KZ6A 1EQCA 1E40A 4M29A 1G01A 3VIFA 1R7AA 1VEOA 4AD3A 4D6DA 2XVLA 2XSAA 1BSIA 2FH6A 2X05A 4AZHA 1JDAA 5E6ZA 3VIPA 5DO8A 1XCXA 2ZX9A 2ZUSA 3WFLA 4ZXLA 4JKMA 1E73M 4JAWA 1SYTA 4W89A 4CCEA 3VGGA 7A3HA 2ZXDA 1QI2A 1NP0A 5JIPA 1TZ7A 5A2AA 2DSZA 3W4RA 1DWIM 2YBTA 1YHTA 1SFSA 3KL0A 1Z32X 4KGLA 3ARWA 4CU8A 1C8XA 1WO2A 2W62A 1UD8A 2FGLA 1E15A 4CUCA 3OIHA 4PSPA 4PMUA 3VKKA 2D1ZA 4PMQA 5IHRA 2WVUA 3W26A 3W29A 5I24A 3L4TA 4QAWA 3AMKA 5FIPA 2VCAA 4CD6A 1GONA 3CHCA 3F4VA 3VD4A 4HA3A 2BY2A 1JFXA 1JZ3A 1DWGM 3VD5A 5EMYA 4NRRA 1J0KA 1E1FA 3SCNA 4F66A 4MNMA 1I75A 5M5DA 2JFEX 2VX5A 3A6OA 1H11A 1VBUA 2FHCA 5M3WA 4LQ1A 1QW9A 4IM4A 1HJXA 1UWQA 1ZU8A 2XUCA 1E6QM 2EEXA 1XV8A 2OYLA 3WDQA 2PWDA 3OLDA 3WQWA 3SEPA 1XC6A 5A8NA 3QOMA 1UQYA 1X6LA 1K9FA 4YHGA 1S46A 3POCA 3UESA 1XSIA 2WSPA 4MDPA 3NDZA 3FHQA 4PUEA 2WW5A 1MW2A 4HP5A 3WUEA 5EFDA 3EYPA 4B16A 1B1YA 1B3WA 1RH9A 3ZT5A 3RDKA 1GPFA 4UFIA 5DMYA 3T2QA 3IJ9A 4MAZA 2WPGA 3MUY1 1H41A 4UOJA 2J7CA 1D3CA 3GTNA 4XZBA 3BAKA 1K6AA 1TG7A 2IXVA 3WUFA 1WZKA 4W8LA 5A6KA 1E6RA 1KCKA 1EQPA 2YDQA 5LA0A 3GXFA 3PN8A 1J11A 3T0BA 4QP0A 3WD2A 2WWDA 1XH0A 2CYGA 3GNOA 1DEDA 4U2ZA 1US3A 1H4PA 3D3AA 2CKSA 3AIWA 1VJSA 2WHMA 3RMEA 4CD5A 3LPPA 1UKTA 2GJRA 3EMCA 1W1TA 3VIJA 3AIQA 2CBIA 4BCEA 2A3AA 3PBGA 3WF4A 2XTKA 3T0DA 3WD4A 4A4AA 2WHJA 4ATWA 1CIUA 1ISZA 1UR4A 2JEPA 4EK7A 2J4GA 3VD7A 2DT2A 2J7BA 1BLIA 3AS2A 5DT5A 1KBKA 3O6AA 3ZIZA 1C91A 4H41A 4GPNA 1V6UA 2C7FA 3HU7A 1XSKA 1GOMA 1VAHA 2J7HA 2WVTA 2DEPA 1OCQA 3ZT6A 4B9YA 1DTUA 2E8ZA 1JNEA 2VURA 2OWWA 3GXIA 2CNCA 4PMOA 1B0IA 4JKLA 2WC3A 4BQ2A 3BGAA 5M03A 2DSKA 4D6HA 5KEZA 2UY4A 1PBGA 3BC9A 1E55A 2VOTA 4QCFA 3II1A 4GKLA 2B31A 3N9KA 4GZJA 5A8PA 3HJEA 1OIFA 2D3LA 1UWTA 3RIKA 1C7SA 4MADA 2BVYA 3ZJ7A 3WNOA 2O9RA 1UKPA 4HMCA 3W38A 1TMQA 4BA0A 1GORA 2WVVB 3SCTA 2VR5A 2YL9A 5ABGA 3IK2A 3TP4A 4B15A 5I77A 2F8QA 3J7HA 2Z1KA 3W28A 3WH9A 3MKKA 3SIMA 3SCRA 4KWUA 4AW7A 1WDPA 3WF2A 5I0DA 4W85A 1NP2A 4PTWA 1KBBA 3ZR5A 5JBEA 2ESCA 4QDMA 4DUWA 4U5KA 1JFHA 1JAEA 2VQUA 1CGVA 3CZLA 4FF5A 1WKYA 3WMBA 1R7OA 1PX4A 1E6SM 5ABEA 1MW3A 3MSDA 4EAMA 4H7VA 3WD0A 3VO0A 4BF7A 2X8RA 3SCPA 3PZOA 1RP8A 4W7WA 3TONA 1AMYA 3UERA 1OSEA 1CXHA 2GFTA 5CGMA 1UKQA 1J18A 2EJ1A 1MWOA 4DWSB 3EDEA 3MMUA 3MMWA 4AMCA 3MUAA 4ACZB 1PZ2A 4TX6A 4BQ3A 4OOUA 4K68A 3RM4A 3NJ3A 1E70M 3AXIA 4CCDA 3UR7A 1CXLA 1WNOA 4X0NA 5IFPA 2WMJA 2WKGA 3SUUA 4Z2LA 1SMAA 5HPOA 2EPLX 5IFTA 1JF6A 1ISYA 4ZENA 3AXXA 1CPUA 5EFFA 2A3BA 2G3IA 2ZUNA 4YN5A 1KGXA 1QNQA 2ZXQA 2GJXA 1LG2A 3UR8A 3FAXA 3SCWA 1W32A 5GNYA 4TVUA 1E0XA 3CUGA 5BRQA 3ZMRA 3WDIA 1WE5A 4KMQA 1XYZA 3WH7A 3PTMA 1EH9A 3E1F1 4L4OA 1QI3A 4JCLA 3VGBA 3VIHA 3WQ6A 3ZT7A 1NARA 5ECUA 3ZJKA 4CCCA 5DFAA 2WMGA 5A8OA 5ABFA 1M04A 4HZ6A 4OBSA 1EOMA 3OA5A 1H49A 5BWFA 2O9OA 4UQAA 1XYFA 1H3GA 4AIEA 3UETA 2EBNA 3U57A 3NSNA 1NOFA 3MO4A 3SUSA 1NM9A 1W3JA 1GNXA 5CZKA 3A4WA 2DSUA 4GI6A 1Q6DA 3SUWA 5EB8A 4HTYA 3LPOA 4PMDA 1E5JA 4BQ5A 1BQCA 5LA1A 2W92A 2JF7A 1MXGA 2OWXA 4J27A 1MQPA 3FHAA 1UG6A 2V3DA 2A3CA 3VIIA 3MV11 4H8HA 4ATLA 3WL0A 4P8WA 4UFJA 2CBVA 4ACYA 3BAIA 4V27A 1W1PA 4DUVA 1PAMA 3ALFA 3SUVA 3AYSA 1FH9A 1BG4A 3G6LA 5E0FA 2GSJA 4F79A 1UD6A 4FK9A 2WMHA 1KB3A 4F8XA 4S3JA 2Y24A 2PBGA 1JYVA 4P7NA 3NUKA 2PI6A 4PTMA 3WMSA 2VI0A 3T0AA 5D9PA 1VFMA 1XGZA 3WH8A 2WKLA 4W7UA 4AZCA 2QMKA 5A3HA 4HU0A 3KZSA 1F4AA 3AHYA 1HN1A 2WAGA 3SCOA 3W27A 2EPOA 3AZSA 5I3DA 3T08A 1GOOA 2PWHA 4J3VA 3CLWA 1LWJA 1CDGA 3O2LA 3M6DA 2GDVA 4RE4A 1J0IA 3WUBA 4M56A 2JE8A 3KE0A 1CECA 1HVXA 3POHA 5I6SA 4KGJA 3APGA 4JFUA 1XD1A 1U30A 3RPMA 7TAAA 1ZBWA 2J79A 2XM2A 3N04A 4LYPA 2W66A 5GQBA 5JBFA 5D9NA 3B9EA 1LLOA 3BAJA 5AC5A 4DUXA 1CEOA 3PTQA 1KQZA 4JFWA 4U33A 2OYKA 4AZ5A 2NT0A 2FDMA 2WNWA 2XGBA 2V3EA 5LA2A 3VMNA 1HVQA 3W81A 3VDHA 3QR3A 3QGVA 2YKKA 3AMCA 1JYXA 4AD1A 2WK2A 3PZQA 1PZ3A 3W6LA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4MB1 A;  2E3Z A;  3A4A A;  1EHA A;  1B3Z A;  1OGG A;  4F9J A;  1U33 A;  4UOQ A;  3CUH A;  2BXZ A;  3CBW A;  4UR9 A;  1ITX A;  3L4W A;  3L4Y A;  1EDG A;  2WCS A;  2PB1 A;  4MNL A;  5HOS A;  3N17 A;  4AIS A;  5A1A A;  1O6I A;  1VEM A;  1JIB A;  5GPR A;  4QFU A;  5A6S A;  3ARU A;  3WIJ A;  1LWH A;  2YL5 A;  2FHF A;  4ZFM A;  2XSB A;  2WVV A;  4A3H A;  3BSG A;  5CQ1 A;  2AAA A;  4N42 A;  4AZI A;  4M8U A;  2WSK A;  2VCC A;  3T09 A;  1J01 A;  3UCQ A;  4LYR A;  4GQQ A;  1XHG A;  3AHV A;  3CZE A;  2J7D A;  2WZH A;  3WMC A;  1SR0 A;  2DQX A;  2J75 A;  2YA2 A;  3GXD A;  2VQT A;  5BXT A;  4D6I A;  3WDH A;  5A6B D;  3ZM8 A;  3W82 A;  1OIM A;  5FCZ A;  1NWU A;  2WC7 A;  5JBD A;  2Y5E A;  5D9O A;  1V3H A;  1BYC A;  5C70 A;  2XYL A;  4X9Y A;  4P8V A;  4FMV A;  4UTF A;  1H0I A;  2XG9 A;  3GH5 A;  1W9U A;  3AYR A;  3GDB A;  3KEH A;  4FLO A;  4LPC A;  3CGT A;  4IPL A;  3VU2 A;  2CET A;  1QBB A;  1VEP A;  3L4V A;  4DWS A;  2JEQ A;  2O9T A;  1LJY A;  3MU7 A;  1KGU A;  3OGR A;  2VZV A;  3L4X A;  1VFF A;  3CMG A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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