2NZL | Genus

Total Genus 131

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	131
sequence length	358
structure length	339
Chain Sequence	RLICINDYEQHAKSVLPKSIYDYYRSGANDEETLADNIAAFSRWKLYPRMLRNVAETDLSTSVLGQRVSMPICVGATAMQRMAHVDGELATVRACQSLGTGMMLSSWATSSIEEVAEAGPEALRWLQLYIYKDREVTKKLVRQAEKMGYKAIFVTVDTPYLGNRLDDVRNRFKLPPQLRMKNFGLAAYVAKAIDPSISWEDIKWLRTSLPIVAKGILRGDDAREAVKHGLNGILVSNHGARQLDGVPATIDVLPEIVEAVEGKVEVFLDGGVRKGTDVLKALALGAKAVFVGRPIVWGLAFQGEKGVQDVLEILKEEFRLAMALSGCQNVKVIDKTLVR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Homo sapiens
publication title	Crystal structure of human hydroxyacid oxidase 1 rcsb
molecule keywords	Hydroxyacid oxidase 1
total genus	131
structure length	339
sequence length	358
ec nomenclature	ec 1.1.3.15: (S)-2-hydroxy-acid oxidase.
pdb deposition date	2006-11-24

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01070	FMN_dh	FMN-dependent dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2nzlA00

1DHPA 1W8SA 3UZ5A 2I9EA 2ZRYA 4IQLA 3GVGA 1YDVA 3W1TA 2G5WA 3TIMA 2GQAA 1PIIA 3AJXA 2YGYA 5ABTA 1HG3A 1M6JA 1UB3A 3W7GA 2YW3A 3O6CA 5AFDA 1K3UA 3W2JA 1OYAA 3SY5A 3OIXA 3WJYA 3HGRA 5A5WA 1ZHAA 2CLEA 3LHTA 1H1ZA 1AL7A 4WOQA 3PBVA 4YCOA 1R30A 1F6KA 3L68A 3Q37A 4YMZA 1F5ZA 2B7QA 4U28A 3DKJA 1M5WA 1KBJA 3QPYA 1J5TA 1OK4A 5LNVA 2NX3A 1O60A 1GYNA 2C18A 2NV1A 1KLZA 1QOPA 3DKLA 4GUJA 4LVAA 5DLCA 4R34A 4Z1BA 4WY0B 5D09A 4A29A 3LBCA 4JY9A 3SI9A 3RMJA 2EKCA 5HUOA 1QPOA 1U83A 1OYBA 1XFBA 4EOUA 1NEYA 2QJGA 4JTKA 4QJ1A 4Z1AA 3QEZA 2WOQA 3G1HA 2Z2UA 4BFAA 2VENA 1KFBA 1KW1A 3UY8A 1VLIA 4Y9AA 3UY7A 4X9SA 5F2IA 1HL2A 4L4MA 1OVDA 2ZRUA 3BLFA 4UMCA 5CZJA 3W1UA 5KINA 4UIOA 3LHVA 4TIMA 2E6FA 4PTNA 3O16A 2E5BA 3VCRA 3W7RA 3A5VA 3M5ZA 4GE8A 3ANYA 1SQ7A 1A5SA 3EX3A 5D38A 5U7SA 2Q8LA 1FUYA 3NG3A 3W76A 1XKYA 3I7QA 2GOUA 3GXTA 2VFGA 3LDVA 1GG1A 2VXNA 2AQWA 2TYSA 1G4TA 2NX9A 3G3MA 5FF0A 3SSJA 1SZFA 3G0SA 4QSHA 4RKAA 3IGXA 4R7JA 1IIGA 2DZPA 3MUXA 3HPXA 4FX6M 4HHPA 3M41A 4XKYB 1KTBA 1ZAIA 4JS3A 3IGUA 3HOJA 1GTHA 5FEXA 1KV5A 1WDWA 1SSDA 6TIMA 2FDSA 3HIJA 1I2QA 1F6PA 4XUGA 7TIMA 3BO9A 3GNDA 4N02A 3M0ZA 4AWSA 5EBUA 3STEA 3EB2A 2OX1A 4Y90A 2A7PA 5DBTA 4DO5A 3I7RA 1L9WA 5EY5A 3CPRA 3GKFA 2GVGA 3W84A 4B5NA 1TIMA 1K7EA 4JX6A 3T40A 5C54A 1S5WA 3P81A 3M5VA 3PULA 5DY2A 3KX6A 3LHYA 1KTNA 4N9DA 1TPFA 4JTFA 2RKXA 4Z0JA 4LS0A 4AWUA 2Y89A 3W07A 1ICQA 3PBWA 3QSTA 5AOUA 3W2KA 4WJEA 3NQCA 3UWUA 1ME8A 2ATSA 1GEQA 4RZ4A 1W5PA 3PUOA 2NXHA 1UCWA 3S42A 3STCA 4XWUA 4AAJA 3BW2A 3MYOA 2ZZ1A 2CZFA 3QH2A 3R89A 1OX5A 5EKYA 5EYWA 2FPTA 3L0NA 2A4AA 4UTJA 2E5CA 4QITA 4P2VA 1TPVA 1GVRA 3W7EA 1ZJIA 3PC0A 5LNSA 1GVFA 2EGZA 2V8ZA 3UWQA 3W85A 3N2MA 2PCQA 1TV7A 4GXMA 3P8IA 2B7OA 3DBPA 3IIXA 1QPRA 1I2NA 4E2BA 3ATZA 5F1VA 5BMWA 1TYGA 2R91A 3DFTA 3HF3A 4BI7A 4LY8A 4JNMA 1RQBA 4UR8A 5K9DA 1V7YA 2ZZ4A 4FEZA 1SW3A 3NYZA 4EVZA 1HTIA 3KRZA 3T44A 3MP3A 1GQNA 1ALDA 3LXAA 3W88A 3EX1A 2WSQA 1OX4A 3TKFA 4HN4A 3L21A 3NXFA 4DF1A 4BWLC 5HNRA 2GVJA 4WXZA 3O07A 3EWZA 1O4UA 2ABBA 3CT7A 3GAYA 3ATYA 3STGA 5HULA 3BK0A 4Q33A 2Q3RA 3CWNA 1PVNA 3P67A 4M5PA 1KA9F 4K39A 3HGOA 4NJGA 2YCEA 1H63A 4MY8A 2VOMA 3NPUA 1HUVA 3IIZA 1G69A 3LLDA 4WUIA 3LHUA 1F7BA 4PL1A 1T99A 3JRKA 1A5BA 5G2HA 3STFA 3B03A 3EXRA 5LKYA 3C52A 3KAOA 3R12A 4JTEA 3NQVA 2WO5A 2D73A 1ML1A 4PCFA 4L4LA 3EXSA 3TDFA 3WJWA 2GJNA 1H7PA 4BF9A 3W7IA 1MXSA 4MJZA 3T55A 1P1XA 3N3MA 2Z6IA 2A5HA 3P5YA 1QWGA 4CQ8A 3NR0A 3EX6A 3PG9A 1H61A 1LORA 4KFPA 1R2RA 5D32A 3U6WA 3UWWA 4NX5A 3S5YA 2EHHA 3DXIA 3TROA 3T4CA 4M7SA 1AG1O 2Y6ZA 2J9YA 4MJMA 1W0MA 3S5OA 4IMDA 5I3GA 1OFQA 1P4CA 3UWZA 4ZMGA 2QCMA 1T96A 2TSYA 3SJ3A 2E5DA 1BWLA 1ME9A 3LCLA 1CX9A 5FF2A 1EUAA 2C3ZA 4OBTA 5LHEA 1OYCA 1Z41A 1X8FA 2E09A 4NZJA 1QO2A 1DBTA 1OABA 1E51A 3TXVA 5CKSA 4IOTA 4DPQA 3HPSA 2ZRZA 4IMEA 1I2OA 3Q94A 1JR1A 4Y6GA 2YDAA 3MWAA 4Y8FA 3IVTA 2BWGA 3SGUA 1Z44A 3MJYA 4YLWA 1NSJA 4IX2A 4H3DA 4RXFA 4A2RA 3LOTA 4UMAA 4U4MA 3UPWA 2RHGA 3TAOA 2WV8A 4CCEA 2QCLA 2AGKA 3GR7A 3LI1A 5HUPA 4GFSA 5F2GA 1TPC1 3CC1A 1VYRA 3BV4A 3A21A 4DEFA 1GG0A 2F84A 1TREA 1OX4B 1JUEA 4PL2A 2CWNA 4CCCA 2XN1A 4XBSA 1UBSA 2DJLA 3RFAA 4ALDA 2X30A 4LU0A 1LP6A 3OBKA 1I4NA 3BGGA 4IWWA 2A6NA 3USBA 4PH6A 3HGSA 4FNPA 5LHFA 4LW7A 4JTJA 4FXRA 3QZEA 1B9BA 1TPWA 1YYAA 1DORA 3SR7A 1OFOA 1JULA 5G5IA 3HG4A 1XXXA 1GYLA 1W3TA 2BSLA 1S5TA 3VNDA 2WQPA 4QM1A 3QQ0A 4KWVA 2YYUA 3FLUA 2WSYA 2FJKA 1SO3A 3C4UA 4O1AA 2OMAA 2EF9A 1K8YA 3LRLA 1W3IA 1W56A 3PF3A 4LVGA 1KBIA 4NXSA 4C1LA 1WBHA 4LVDA 1QPNA 3M6YA 1EB3A 3C2VA 5FEZA 1X6UA 2P1FA 3CWOX 3UXAA 1FCQA 4CQ9A 4ORIA 5D2XA 1T8XA 3UWYA 4LT9A 3EWUA 3W9ZA 5LGXA 4O50A 4DELA 3O05A 5DXXA 3KXQA 1VYPX 3L0GA 3KVKA 1QOQA 4JYEA 4LVBA 1YADA 3W1LA 1KM0A 1BEUA 3S1XA 3WK3A 1PCKA 3W74A 4JGDA 1FWRA 3E49A 1R2SA 2V30A 2NXGA 1DV7A 2QCCA 5K2ZA 1T0OA 4XQ6A 1EIXA 3GYEA 4LWWA 5G1TA 4DF0A 3LXBA 3PG8A 2WNQA 4I7WA 2DZTA 3FJLA 1PHWA 3L5LA 2R94A 4UFIA 4YXGA 3DHFA 3NQFA 4FNRA 5DY3A 5DELA 3R5EA 3TW6A 4AVFA 1G7VA 3BVJA 3LV5A 1GT8A 3W87A 5U4NA 1DL3A 2G95A 1ZENA 1JCJA 2OJPA 3SZ8A 2H6RA 1W5NA 2C16A 4IXHA 4JN6A 3NPVA 1IF2A 1QFEA 1SO4A 2X1UA 5EA9A 4TX9A 5D04C 4DXVA 1AW2A 2FLIA 1SU5A 1UUMA 1VCVA 2E6DA 5G1YA 3W1XA 4NQ1A 1EP2A 4GUIA 2BLEA 2ZRXA 4O0KA 1QCWA 2C15A 1C8VA 2H8ZA 3S1UA 3TJLA 5FEWA 1ICPA 5C6MA 5DCEA 2HTMA 2ZZ3A 3QW3A 4RK8A 2AAMA 4JYDA 4K8HA 1G4EA 1M7PA 3EWBX 3M5XA 2VEIA 4RV8A 1XC4A 3OHIA 1SZGA 1YTDA 2G96A 1IXQA 4LS1A 3LHWA 4GBUA 3FKKA 2VC6A 4AHOA 2QR6A 3W6YA 1L2UA 2WPBA 1W31A 2PURA 1LOQA 4O1BA 2Y7DA 4GUGA 3CEUA 2Q8ZA 3W7LA 3M43A 5E93A 5K9CA 4FIRA 3HBLA 2O7SA 4MFDA 3CEPA 2CLIA 4JX5A 3BLIA 3EX4A 4AXKA 3O15A 4ZQPA 2BXVA 2RDUA 3H55A 2P10A 2DZVA 5T26A 5CSSA 1H7WA 1MEIA 4UR7A 1Q3NA 2LLEA 3FJ6A 1UUOA 4JYFA 1ZAJA 3THQA 4UTMA 3M9YA 1JCNA 1OFRA 4GUFA 3TSDA 2XN0A 3IGSA 2VELA 4A3UA 3LCIA 1UJPA 5CGQA 3EWWA 3O06A 3NVTA 3ZWSA 1A50A 5L6UA 2XFWA 4N9CA 5HR7A 2A85A 3I68A 4MFEA 3TJXA 1W37A 4QQ3A 4LTSA 3QRHA 5AHMA 3W7DA 2CFFA 4AMAA 5CSRA 1XM3A 3LXCA 3TFXA 5I3HA 1H60A 1RV8A 5LGZA 1BWKA 4N2YA 2DZWA 3W70A 5AHFA 4N6FA 3CLMA 4LC6A 2NZLA 3MI3A 4NXKA 4MOZA 4O52A 5K4XA 2C19A 4CQAA 4O13A 3TA6A 3M1ZA 1I2RA 2X1TA 3NQAA 1M7OA 3PS7A 2V5BA 4KFOA 5LNUA 4FHAA 2YFOA 1SR9A 3HQ1A 4LC8A 5IM51 2E68A 4ADUA 2YSWA 2A0NA 2YX0A 1GOXA 4MZ1A 3WK2A 5MHBA 3W23A 3L0KA 3QYQA 1VGAA 1YXDA 4G1KA 1OFPA 5J5DA 3TR2A 1YXYA 3PUEA 3VKJA 2GQ9A 3NAVA 1XUUA 1LBFA 3KFTA 3E0IA 5AB3A 1Q6LA 1FX6A 2QCGA 4WZHA 4M6QA 5C5YA 3N9SA 5AC8A 1ZCOA 2QCHA 5TIMA 4Z0SA 2V2DA 3W73A 1I2PA 2A2IA 1BKSA 2PC4A 3F4NA 2ZDRA 5DXYA 3QQ1A 1F76A 2ISSA 3T7VA 3E9AA 4MY9A 1N7KA 3GKAA 1H51A 4LVFA 4Y96A 2BX7A 4ZQRA 2YZRA 4MYXA 4ADTA 5FI8A 1LCOA 3MBDA 3NQDA 1JCLA 5SWUA 4CNOA 1TPEA 3ZR4A 4LUIA 1UASA 3LB0A 4KWWA 3W2NA 4RX0A 4NUWA 1XDLA 4O14A 3MO7A 1FXQA 4HNTA 1AW5A 5HMSA 1GJPA 3I6RA 5A8GA 2CLKA 4K6AA 2E77A 3F4WA 3GIYA 4JTIA 3TC7A 2C6QA 4MPQA 3NM3A 3NL3A 1KFLA 2E1DA 3DENA 3B4UA 1MZHA 4HIBA 1RPXA 1GWJA 1K7XA 1LDCA 1WYIA 1XBXA 1VS1A 1Z48A 4ZQMA 5GVJA 4HPJA 4EWND 3KRUA 3NQMA 4ZL1A 1FWNA 3TU9A 1ZALA 5CPOA 4IMFA 1OF6A 1TQJA 2GQ8A 3SIZA 1TQXA 2ALDA 2FFCA 5CZTA 1D3GA 3P84A 3S5ZA 1H7RA 1VHNA 4OU1A 1H62A 3LLFA 2NUYA 3G18A 5D2TA 1FCVA 4UCGA 2Y7GA 1XL9A 3NPWA 4D2JA 3HB9A 3NPXA 2FB3A 2EAWA 3S9YA 2CZ5A 3CTLA 2Y88A 4BK9A 5H91A 3W7PA 1C9DA 4LOCA 2JK2A 4JICA 4ICNA 3GDKA 3LBMA 2PRLA 2VKZG 2G97A 2H90A 3BGJA 2QDGA 1VCGA 3C2EA 4N6EA 3O6DA 3TUUA 4O1CA 1A53A 3W3OA 1DJNA 2YR1A 2GPTA 5C55A 1K8ZA 3CM4A 4AB4A 3CU2A 3IVSA 3TC6A 4UTKA 3WFAA 4TMCA 1ONRA 1SW7A 2C0AA 3G8EA 2NV2A 5CZSA 1ME7A 4LV4A 3GDRA 4DF2A 3GDTA 1G4SA 4QIUA 1Z42A 4A22A 2QAFA 5F4XA 2VEPA 4JX4A 5LNRA 1VZWA 4P61A 3A9IA 3CQ0A 1EP3A 3GXPA 4FF7A 1TTPA 5G4WA 1JRBA 4UFLA 3TCEA 1A5CA 2E6AA 5H2ZA 2QUVA 5AYYA 3IV3A 1SFLA 2DU2A 4UFHA 4JTHA 3SW6A 3EKZA 3NQ8A 4E38A 1KFJA 1DVJA 4JXCA 1SO5A 3P5ZA 1FWTA 2HS6A 1H1YA 4C1KA 1VH7A 3DI0A 4ZQOA 2DZUA 5F4SA 3QJAA 3KVMA 1LOLA 5TBOA 1KM1A 3PB2A 3DH7A 3LTSA 2CLMA 2J6XA 3PAJA 4R53A 3UNDA 3BW3A 1ZY9A 3W2UA 3PVFA 2QKFA 1H7NA 3TE9A 2F7FA 4A21A 2VEMA 3K30A 1D3HA 3LERA 3G1SA 3W86A 1C29A 3PY2A 4MUZA 1QO5A 3G22A 1Q6QA 4O10A 5DBUA 1GZGA 1DJQA 2HS8A 2QUTA 2WNNA 4O19A 5BW6A 1VCFA 3HG2A 3GX9A 4M7TA 1B4KA 3BARA 2UV8G 3FEMA 3KRSA 1TTQA 3TAKA 3FA5A 1GVOA 1Q6RA 3QF0A 1EWEA 3MBFA 4E0CA 2DJXA 2RH9A 3TH6A 4QAIA 3L2IA 3LCGA 4N4PA 5CPLA 4ZVJA 1LLWA 3RF9A 3W7KA 1EA0A 5LSMA 4AF0A 3MMTA 2CLLA 3G1DA 1N8FA 4S2BA 2Y70A 1LTDA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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