2Y88A

Crystal structure of mycobacterium tuberculosis phosphoribosyl isomerase (variant d11n) with bound prfar
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
244
structure length
244
Chain Sequence
MPLILLPAVNVVEGRAVRLVQGKAGSQTEYGSAVDAALGWQRDGAEWIHLVDLDAAFGRGSNHELLAEVVGKLDVQVELSGGIRDDESLAAALATGCARVNVGTAALENPQWCARVIGEHGDQVAVGLDVQIIDGEHRLRGRGWETDGGDLWDVLERLDSEGCSRFVVTDITKDGTLGGPNLDLLAGVADRTDAPVIASGGVSSLDDLRAIATLTHRGVEGAIVGKALYARRFTLPQALAAVRD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Bisubstrate Specificity in Histidine/Tryptophan Biosynthesis Isomerase from Mycobacterium Tuberculosis by Active Site Metamorphosis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PHOSPHORIBOSYL ISOMERASE A
molecule tags Isomerase
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 95
structure length 244
sequence length 244
ec nomenclature ec 5.3.1.16: 1-(5-phosphoribosyl)-5-
pdb deposition date 2011-02-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00977 His_biosynth Histidine biosynthesis protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2y88A00
8TIMA 2P10A 1FQ0A 1DJQA 3LTPA 4Z0SA 1QPQA 1X1ZA 5AFDA 3E49A 3D0CA 4HNNA 3G1AA 1YDVA 2YFNA 5G2IA 3W73A 5F4WA 4GUJA 2WPBA 5FEPA 4UTMA 2E09A 1F73A 2X1RA 2VFGA 2TRSA 1K8XA 3NDOA 2PCQA 5AYYA 3HOJA 4X9SA 3ZS4A 4UTLA 3KX6A 3N19B 4UCGA 2NWSA 3CIXA 1FX6A 1FWNA 1A53A 1KW1A 3KRSA 3WJXA 3HG2A 1SO6A 1GOXA 3RNDA 4HNVA 1GG0A 4QITA 4JTKA 4K8EA 1TJPA 1JJKA 1AMKA 4XKYA 2DZWA 4QM1A 2ZRZA 1X1OA 1NF0A 4O57A 3HJZA 3NQAA 2ZTKA 4LUJA 5G2HA 1LCOA 3KHJA 3PS7A 3ELFA 3WFAA 1OYCA 2EAWA 3U8GA 3OVPA 5SWUA 1TV7A 3E9AA 3W2NA 3UWWA 4GUGA 5AB3A 4B5NA 2A21A 2X1UA 1KV5A 2GVGA 5KINA 3NQGA 4DPQA 2BWGA 4HNUA 3B03A 3NOEA 3LHUA 3INPA 1JUKA 1W8SA 4UTJA 4HPXA 5BOOA 4FIRA 1U83A 1AW5A 3S1WA 3ABRA 1BKSA 1OFDA 4ZQNA 4QNWA 2DZXA 4FXRA 1HTIA 1XC4A 3GDMA 4K6AA 2W6RA 1EB3A 2VEPA 3R5EA 1H1YA 1YPIA 4AAJA 3NG3A 1SZEA 3NQVA 5LSMA 3SY5A 4X3ZA 3W7OA 1LBFA 1F76A 4JNMA 4TX9A 2P0OA 5TQLA 1Q6OA 4AB4A 4LC8A 2Y61A 3UWQA 2C18A 2YFOA 2VOMA 5I3KA 3L5MA 5CKSA 3G1DA 3W7GA 5FF7A 2YW3A 3NQMA 1RQBA 3M5YA 3W1RA 2E68A 3C3NA 4JY8A 4GNJA 3W71A 3VI2A 5AC6A 3SI9A 3LCLA 2CLMA 2ISVA 3P81A 2XN0A 3DFNA 3WJYA 4LS0A 1G6CA 4E0CA 3STGA 2Y85A 4AHOA 3KVLA 3ATZA 1F6PA 1SSGA 3L5AA 4O50A 4ALDA 3SECA 3P60A 2OT1A 2QCDB 2RKXA 3A9IA 3STFA 3UXDA 4O16A 1FUYA 3IEBA 1JCYA 2YX0A 2YW4A 2NV1A 3DI0A 4AF0B 1QWGA 5FI8A 1MSSA 3MI3A 2NZLA 3TUUA 4PL2A 3MMTA 3GDLA 3T78A 3BG9A 4FNUA 3O6YX 4NZFA 3GNDA 5C6MA 1QFEA 3N2MA 4MUZA 1SO5A 1L6YA 3CEPA 4WXYA 3MJYA 4LY8A 3LHTA 3PBUA 1LRNA 4O19A 1YPFA 4MZ1A 3S0CA 1XBXA 3RFAA 3ATYA 4QQ3A 1W5MA 4CQ9A 3M41A 4ZQPA 1DORA 3C2EA 1PS9A 1B57A 1EP3A 2HS8A 3UY7A 5HR7A 3PBYA 2DJXA 1MEHA 5DBUA 1P0KA 5D2VA 3NM3A 1RQHA 4U28A 2V9DA 2B7PA 1TYGA 3TROA 1I4NA 1LP6A 1JRCA 3SZ8A 5E93A 2PC4A 1S5TA 4NNBA 3V75A 3NL5A 1ICSA 3BG3A 5F2LA 3Q37A 3P84A 3OVRA 4RV8A 4LRSA 1KTBA 3QYQA 4CCEA 1XL9A 5CGQA 2ZDRA 4ZQOA 3L2IA 2KZHA 3TSDA 3O05A 3LCXA 1JCXA 1W5NA 4IPJA 3G1HA 4IMGA 1R2TA 5L9FA 2FTPA 2JKPA 3O06A 3GR7A 1TCDA 3CWOX 5G1YA 4DO6A 3LDVA 1HO1A 2BXVA 4DO5A 5E0KA 2ZA1A 1VLIA 3QSTA 1OYAA 3P74A 4HPJA 4WOQA 1HO4A 1K7XA 1YTDA 2JBMA 3BLEA 2Y6ZA 3FLUA 1JUBA 2DZTA 2V5LA 3W3OA 1D3HA 1KM1A 4O1CA 1W0MA 3LRKA 2QCLA 1ZFJA 3TKFA 2QCNA 1I2NA 3G1FA 4O1AA 5HNRA 1VRDA 3OA3A 1K3UA 3PB0A 1WXJA 3C6CA 5F4SA 1NAL1 4JXCA 5C5YA 3GYEA 4FB7A 1B3OA 3HGRA 3MUXA 4OU1A 3S1XA 3TH6A 2Y7DA 4TIMA 5LZLA 2FPYA 4AWTA 5EY5A 1KM5A 3LV5A 1LLZA 5I3JA 3P61A 3PF3A 2GJLA 4YLWA 1VCGA 3UPWA 2GQ9A 4O18A 5I3FA 1THFD 1W1ZA 3G24A 3GDTA 4UMBA 3W23A 2QCCA 3I7RA 3IRDA 3W7JA 4YCPA 2FFCA 4MFDA 3FYPA 1H5YA 1G7VA 2J9XA 2ABAA 3LBCA 3C56A 3BO9A 4K39A 4GJ1A 2YYUA 1SZNA 2QCDA 4GBUA 5BW6A 2CLOA 3T7VA 3MW7A 1M5WA 2V2DA 5G4EA 4AF0A 1QCWA 4JTTA 5KITA 3G0UA 5U7SA 1H62A 1PVNA 2V30A 3CHVA 2VFEA 4IMEA 2E6FA 2Y7EA 3W75A 4PFMA 4M7SA 1VCFA 4Q4KA 1KFJA 4AHQA 2CU0A 5ABTA 2XN1A 5CSSA 3NQ2A 4LC6A 4YWIA 2Z2UA 1PCWA 1OFPA 3E96A 1UCWA 4E2DA 3DFOA 3M9YA 5DCEA 1VPXA 4JTUA 1SR9A 2DZSA 3Q58A 4HT3A 3NO5A 2GOUA 4LVFA 3TW7A 3OG3A 4KWVA 5DXXA 3PR2A 3FKRA 3UPBA 3LI0A 3JS3A 2ISWA 3KAOA 3TX9A 2P1FA 2V2CA 1OK4A 1VYSX 5C54A 1WBJA 5AHEA 2GQAA 2Q3RA 5G4WA 3BLIA 1OHLA 2CLHA 5D2WA 5AN7A 1L2UA 1B4EA 1IIGA 5DY2A 3W7PA 4UTKA 1Q6QA 1W5PA 4LVBA 4DO4A 1JVNA 3OHIA 4K7VA 1VCVA 3W2UA 1PE1A 3FKKA 3C2RA 4H3DA 4JS3A 1BWKA 2EPHA 4FEZA 1LYXA 4BFAA 2ZZ7A 3PUEA 4RLIA 4QIUA 2WKJA 1QO2A 3LV6A 3JR2A 4N02A 3W7DA 1TTPA 5D03A 3QSRA 4CQAA 2A7RA 5CSRA 1LRQA 3SW6A 2C15A 3QRHA 1K8YA 2ZRWA 2QAPA 3NQ8A 1QMLA 2R94A 4PA8A 4X22A 3RLVA 3C2OA 5HMSA 2NX1A 3SIZA 4CNPA 3DAQA 5FF2A 2V2HA 5TBOA 3NQEA 3WJSA 2AGKA 4GWEA 4NJGA 4EWND 3IIXA 5I3HA 5AHMA 4BF9A 1SW0A 4JTIA 3FYOA 5K4XA 3CQ0A 4KFOA 4UC5A 4FX6M 2VEMA 1YADA 1KFCA 2JKEA 3HIJA 4OHQA 2GVJA 4QNEA 1KFKA 2DZVA 3EX2A 1AW1A 1KFEA 4JICA 2RDTA 3W1MA 2ZQ0A 2VKZG 3MHUA 4I7VA 3LCGA 3G8RA 2Q3OA 1EWDA 3TSBA 3TAKA 2PRLA 2FLIA 3KFTA 3B05A 1FDZA 3W1QA 4BWLA 1XUUA 4MZYA 4RCXA 2H90A 1D9EA 3ANYA 1W5OA 2PE4A 3PUOA 1NFBA 3P62A 2V8ZA 5CPOA 4LOCA 3PWAA 5DCBA 3W83A 4JYDA 6ALDA 3W7QA 3W1UA 4NZJA 4OQVA 4UUIA 1VR6A 2CZEA 3LERA 3T44A 3W72A 3O1NA 4HN4A 4ORIA 3C4UA 2Y70A 2ZZ5A 4R34A 2OCZA 1RPXA 1Z48A 4JIPA 1FXQA 5D2YA 1KM0A 2OX1A 3P8JA 4K36A 3CC1A 4Z1DA 4XTIA 1RZMA 4LT9A 3QM3A 1TPEA 4WY0B 3CM4A 1KV8A 4R7JA 4UMCA 3ABOA 3QPZA 2A1YA 5AHLA 3W22A 4JDYA 2B4GA 1OX4B 1GYLA 4O4VA 4IX2A 3HGSA 2C16A 1SO4A 2QAFA 2C1HA 2ZA3A 4E38A 1I2RA 5TIMA 4JGDA 4UTHA 3W85A 5KZDA 3TV8A 4QISA 4O11A 3LCWA 2VC6A 4O54A 1AG1O 3ZFHA 1EA0A 2J9YA 3NXFA 5EA9A 1TPVA 2A7PA 3PM6A 3QF0A 3EXTA 3SFKA 1M7PA 5KZEA 2D73A 1TV5A 4IUOA 2NV2A 1JUEA 4NQ1A 3EWWA 4PTNA 3A22A 3G3MA 3SGUA 3H55A 3N14A 2QEZA 3M44A 1VH7A 3NAVA 4BWLC 3LXCA 4R53A 5MHBA 2A6NA 1M6JA 4N6FA 3U6WA 3W84A 3M0ZA 4UTWA 4FF7A 1GYNA 1FWWA 4RZ4A 2A85A 1ZHAA 2E77A 3NNTA 2RDUA 1H7RA 1QAPA 3G22A 5FF0A 1WA3A 4JTLA 3IIOA 3EWUA 1T0OA 5D04C 5L6UA 1MEWA 4DELA 4UMAA 4Z1BA 2QUUA 2O7SA 1JRBA 3UZJA 5LKYA 2Y89A 2H3DA 3EXSA 3GXPA 1OG0A 2E6DA 3GR8A 5FF4A 1XKYA 3G1YA 1AK5A 1H50A 3W1LA 3HQ1A 3N3MA 3QW4B 2I9EA 1Z41A 5F1UA 1SFLA 4H4IA 2ZRUA 4N4QA 4Y8FA 1EX5A 3N73A 1TO3A 1R47A 1FCBA 5CPMA 3S8HA 1G4PA 3UY8A 4K7YA 3E02A 4NNCA 1H61A 1P4CA 1I45A 2QCHA 4PH6A 3ZWTA 3GAYA 3G18A 1XFBA 2NUYA 5H91A 3WK0A 3FOKA 3M5ZA 1HFBA 1ZAJA 2BSLA 2YGYA 4KFPA 4CNNA 2WJZA 2DORA 1FXPA 3H53A 4LW7A 1JULA 1G4TA 2ZRYA 5BRBA 1A5BA 3HPXA 1F5ZA 1F74A 2JGQA 1LBLA 1NSJA 3S5OA 2EHHA 3IVUA 3B06A 1F7BA 4I7WA 2BZNA 3W1XA 3S9YA 3TK7A 3W7CA 3NEVA 4UTWC 1H7WA 1KM6A 1GPWA 4E2BA 1RV8A 3H54A 4X2RA 1R30A 3WK2A 4Y9AA 1DKWA 3NZ1A 4OV9A 3A5VA 3I7SA 3TR2A 5FF3A 4IXXA 3MYPA 3NQ7A 5HWJA 1SZGA 1P1XA 1WAUA 2R8WA 4IQLA 1AL7A 5DY3A 2WV8A 5BNKA 3HG5A 2LLEA 2ZA2A 1DL3A 3W7MA 4MYAA 3DFSA 1G4SA 3N9RA 3UQNA 3W76A 5I3GA 1LM1A 1QPRA 3W1AA 3HB9A 1GJPA 3LXAA 1BEUA 1KBJA 4YMZA 3TJLA 1J5TA 4MJZA 4MY9A 1B9BA 1OX4A 1T96A 2A6LA 2A4AA 1ZALA 1GVSA 3A5FA 1QNVA 4N9EA 4MZ8A 1Q6RA 4M19A 4M6VA 3W7EA 4IOTA 4XZ9A 1N55A 3GVGA 4A21A 1OF8A 3HF3A 3FEMA 2J24A 3NA8A 4UFMA 4EF8A 5DXYA 3AO0A 3EWXA 4HSOA 5AYXA 1FBAA 1MEIA 1D3GA 3TNOA 2V81A 4EIVA 3KXQA 4ZQMA 4OBTA 1YTKA 3F1QA 1ICPA 3PULA 4NJIA 4O28A 4EVZA 3MO7A 3S6DA 3W2LA 3LCIA 1W37A 4UNLA 3S5ZA 1FCQA 1SFJA 4PEKA 4WZHA 4LVAA 4K38A 5KSWA 1KLZA 1QPOA 1P0NA 3B0PA 4IMCA 3O15A 1HUVA 4J9JA 4R33A 1QO5A 3IIVA 1OVDA 2O7QA 2DZPA 3FS2A 3PVFA 3I65A 3IV3A 1PL9A 4FXSA 5T26A 1WV2A 3W1NA 1ZNNA 3VNDA 5F2GA 3GIYA 4ADTA 1GZGA 3O07A 3OBKA 5EMUA 3F4NA 3PSWA 2WOQA 3VKJA 2QDHA 3LLFA 3UD6A 1VLWA 4GUHA 3G3DA 4FNRA 4OWGA 4OE7A 1H63A 3Q94A 2OT0A 3GXTA 4XUGA 4LRTA 5G2WA 2JGYA 1WOBA 4O17A 1EEPA 3PG9A 3W7KA 1DQXA 1EP1A 1YDNA 2X16A 4N9BA 4RKAA 2JKAA 4WD0A 5K9XA 3EB2A 3PG8A 1KM3A 1I8JA 4ZQRA 1TPUA 1YYAA 4KWWA 2OZ0A 3DH7A 5K9CA 3IVSA 4XQ6A 2QDGA 3IVTA 4Z0JA 4Y90A 5K7JA 4NU7A 4UNKA 1DQWA 2VFIA 5D37A 4AWUA 1VHCA 1QOQA 3A24A 1YTEA 2E6AA 3IGUA 1J2WA 1F05A 3HGOA 3W7IA 3TAOA 5HJLA 3P82A 1K7EA 4MPQA 4N4PA 4LS1A 1PIIA 4IGHA 1SUXA 1UUMA 1Y0EA 1WBHA 3TFCA 1FCUA 4Y6GA 3M47A 5EYWA 1UJPA 4CNOA 4IJBA 3QEZA 2G5WA 1GTHA 3O8AA 4GRSA 4IMFA 3W1PA 3L0GA 1OK6A 2AQWA 5F2IA 4IPIA 1LROA 1K7FA 3KRZA 4Z1CA 2X1SA 1T99A 3UNDA 1K02A 1ZENA 1SW7A 3O6DA 3LBMA 3R8RA 2VEIA 2H3BA 4ZQCA 1H7XA 2YR1A 3LB0A 5EBUA 1V5XA 4UR7A 4Y96A 4M5PA 2ZFAA 2QF7A 4WOZA 2JK2A 2UV8G 3TXZA 3L67A 1IF2A 4I9AA 4QSHA 3A21A 5AC7A 4GUIA 3DBPA 1QPNA 3EX1A 3KVKA 4RXFA 1X6UA 4JTFA 2RFGA 2NXGA 1VHNA 2NXIA 3R2GA 1KTCA 3UYCA 1O95A 1K03A 2NUXA 1IXNA 3QH2A 3P5ZA 3DFTA 4UIOA 2B0MA 1GG1A 5LHEA 1TQXA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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