5H2ZA

Crystal structure of human dihydroorotate dehydrogenase (dhodh) with 7gf
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
364
structure length
364
Chain Sequence
TGDERFYAEHLMPTLQGLLDPESAHRLAVRFTSLGLLPRARFQDSDMLEVRVLGHKFRNPVGIAAGFDKHGEAVDGLYKMGFGFVEIGSVTPKPQEGNPRPRVFRLPEDQAVINRYGFNSHGLSVVEHRLRARQQKQAKLTEDGLPLGVNLGKNKTSVDAAEDYAEGVRVLGPLADYLVVNVSSPNTAGLRSLQGKAELRRLLTKVLQERDGLRRVHRPAVLVKIAPDLTSQDKEDIASVVKELGIDGLIVTNTTVSRPAGLQGALRSETGGLSGKPLRDLSTQTIREMYALTQGRVPIIGVGGVSSGQDALEKIRAGASLVQLYTALTFWGPPVVGKVKRELEALLKEQGFGGVTDAIGADHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structure of Human Dihydroorotate Dehydrogenase (DHODH) with 7GF
rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial
total genus 138
structure length 364
sequence length 364
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2016-10-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5h2zA00
1SO5A 1GVFA 2NV1A 1VLWA 3O6YX 4LT9A 2F7FA 4NVTA 1DOSA 1PHQA 3N9SA 5G2HA 4MPQA 3KVKA 1YADA 5KZMA 3HF3A 3WJZA 3G0XA 1NFBA 1HFBA 5H2ZA 1OX6A 3UY7A 1ICQA 3LV5A 4H3DA 1XBVA 3C3NA 4RXGA 3NVTA 5MHBA 1KM3A 5F4WA 3STEA 3FJLA 3M5ZA 2EGZA 2OZ0A 3LGEA 2J6XA 3JS3A 1FXPA 3W83A 3GAYA 4O11A 3UNDA 2AGKA 4XQ6A 1PCWA 1XBXA 2X30A 4N02A 1TSIA 5F2LA 4RK8A 2E6AA 4HT3A 1QPOA 4FNSA 1PV8A 2TRSA 3W7QA 3NPVA 1PIIA 5AC7A 3UPBA 1VS1A 3L9CA 3BGGA 1TQXA 3PBYA 4JDBA 4UMCA 2V2DA 1L6WA 5KINA 3PULA 1P0NA 1LBMA 1OABA 1YXCA 2YW3A 5K3VA 2XN1A 3LTPA 5DLCA 4O53A 2FB3A 2C14A 2ZRXA 3BK0A 3PUEA 1H63A 1QMLA 2V0TA 2E6DA 3P62A 4MUZA 5HNRA 2A85A 3FS2A 4ADUA 5CSRA 2C18A 3QW3A 3R2GA 4K6AA 1A5AA 3EWWA 4M5PA 5C5YA 4JTJA 1M7OA 1TPDA 5TIMA 3PG8A 2Z2UA 3PS7A 3QMTA 5EY5A 4L4LA 5E93A 5F2IA 3LHVA 3PC0A 1ML1A 5HWMA 4JEQA 1LRQA 5DN1A 4NZJA 3QRHA 4CCDA 2ZZ1A 4A21A 3BO9A 4JS3A 1S5WA 4IMCA 3KVMA 1SR9A 3GYEA 4GXMA 3W7NA 1P4CA 3RNDA 1G4EA 4FIRA 1JCLA 4MJMA 1K3UA 2VELA 2X1SA 3M5VA 2A6NA 3EX3A 3NQ7A 1B57A 1W3TA 4S2BA 1X6UA 1U5JA 2E1DA 3W2MA 2CLLA 3VKJA 1FXQA 1LLZA 3H55A 4PCFA 3I6RA 4UUIA 1K8XA 3R13A 3MI3A 5LSMA 5I3IA 3W75A 1YTDA 4EIVA 2JBMA 1CI1A 4ZQOA 1GTHA 1TPVA 1U83A 5A5WA 3GXNA 3CEPA 1KTBA 3N14A 2WV8A 4UTTC 3W85A 5FESA 4FNUA 3LRLA 3WJXA 3NO5A 3P61A 2CLHA 3WK1A 3S1VA 4MIMA 3NL3A 3TA6A 2J9ZA 4GJ1A 1Q6OA 4U4MA 3CQ0A 2RH9A 3THQA 4Y8FA 5BMWA 3NQDA 5AHMA 3GXTA 3THAA 4IX2A 4Y90A 4GWEA 4I7VA 1EPXA 3LERA 3S9YA 3G1FA 4U28A 7TIMA 3GNDA 4X3ZA 4MVAA 3TJLA 3Q37A 3MMTA 1RV8A 4LC6A 3CC1A 1SZFA 1WV2A 1OFDA 3CTLA 3C52A 2OCZA 1CX9A 5BW6A 5HUOA 3IRDA 3QF0A 3NOEA 3DH7A 1XKYA 4C1LA 3M44A 4UXDA 5LKYA 4FB7A 4G1KA 1XFBA 2VFDA 4Z0JA 3CWNA 3LHZA 3TV8A 3NL2A 3Q94A 3N73A 4CQ9A 4JTFA 3TMQA 2H8XA 3NPUA 4N4PA 3HG3A 1KFCA 4JYDA 4UFIA 2CLFA 2CLMA 3SJ3A 4YCOA 1B4EA 4FEZA 3LCLA 1I2PA 1OK4A 4MJZA 1A5BA 3GDTA 1W3NA 1QR7A 3ZWSA 1KTCA 4K37A 4POCA 3OBKA 3E49A 3G24A 3UXDA 4RKAA 2I1OA 3UZJA 1WDWA 2YW4A 2V5BA 3LM7A 2TMDA 1F74A 5LGXA 2ZZ6A 2CU0A 3P5ZA 3ABRA 2PE4A 3L2IA 3SW6A 3LTSA 2BSLA 3W7LA 3W86A 2RKXA 5KITA 2H6RA 4GUGA 1BEUA 2HSAA 3LCGA 2UV8G 5BRBA 3O8AA 4K7YA 2YSWA 1FDJA 1ZENA 3B03A 5LHFA 1XUZA 3BG9A 4DPQA 1UUOA 2DZPA 2HS8A 3W23A 5LGZA 1XC4A 4ADTA 5FF3A 3S42A 4I7WA 3FYOA 1VH7A 4BI5A 4WX2A 4E0CA 4CQAA 3EWBX 2CLEA 2J27A 2NXHA 1XL9A 4DF0A 3GKAA 5I3GA 5I3HA 5HUPA 4O8RA 3DAQA 3BV4A 3CWOX 2A0NA 2V5LA 1L2UA 4GUFA 3UYCA 3W84A 1GQNA 3QQ1A 5AC6A 1KTNA 4LVGA 4GUHA 4N4QA 1AG1O 4QM1A 1KW1A 4GRSA 1W5PA 4UTHA 5DXXA 3NPXA 2CZFA 2FJKA 2ZTKA 1VZWA 1O5XA 3M43A 3PVFA 3UWYA 1H50A 1MEHA 3W2UA 1WQ5A 3TR2A 1GG0A 3IGUA 3GX9A 3RLUA 1LTDA 3B4UA 3EWYA 4HNUA 1TPWA 4H6KA 1TV7A 1OFRA 1TMHA 2ZTJA 3W1NA 1DHPA 4CCCA 1SW3A 2Y89A 2ZFAA 3M9YA 3PB2A 4NJIA 2ABBA 1SPQA 4LVBA 1DBTA 3RMJA 3DFNA 1WYIA 4BF9A 4MFDA 2CLIA 2E5BA 4FX6M 2CLKA 2WNZA 2V2HA 3MHUA 3TQVA 3WJWA 1QDSA 3GAKA 3HG5A 2QCHA 2R94A 2ZRWA 3EEGA 1OK6A 3NEVA 1GZGA 3PSVA 2GPTA 5TBOA 1G7UA 1G4TA 1OYCA 3V1PA 1BWLA 4FNTA 3LOTA 2QCGA 2Y85A 1PS9A 2AAMA 4MY8A 3W88A 2EAWA 3STCA 3DZ1A 4HNTA 1LLWA 2NWSA 4JTEA 5D02A 3DFTA 1K8YA 3G3MA 2V9DA 1SO4A 2WNNA 3IIOA 5AC8A 2QJIA 1FCQA 1V7YA 1TYGA 2PC4A 4O50A 3O63A 4LW7A 5CPNA 2YR1A 3AJXA 5U4NA 4B5NA 5E1QA 3JRKA 2Y63A 4O0KA 4UFJA 3HGSA 3HBLA 3VE9A 2NZLA 3IIZA 5G5IA 6TIMA 2OMAA 3M41A 3CIXA 3QH2A 4GFSA 4MOZA 4UTLA 3W7JA 4R53A 3UWQA 3TSDA 5L9FA 1EP1A 3FA5A 3SSJA 3G8EA 4ORIA 2C3ZA 4ZQPA 1FCVA 2FQIA 4X9SA 5HMSA 3HG2A 1FWTA 3IVUA 4JY8A 1GT8A 2DZTA 1SZGA 1E51A 4J9JA 3W7KA 4IPJA 4DEFA 3USBA 3H53A 2DP3A 1K8ZA 3DFSA 4WXYA 3M1ZA 2OX1A 4QNWA 4CNOA 3QC3A 1OX4B 2ATSA 1UBSA 5K9XA 1Q45A 1W3IA 4JDYA 2DJLA 5FI8A 1Q3NA 4ONVA 2DZSA 1EUAA 4ADSA 4YMZA 1R2SA 4AVFA 3TFCA 4MKNA 3BLEA 4QQ3A 3W7PA 1LDCA 1JRCA 2CLOA 4UTTA 3TUUA 4M6QA 4D2JA 2H3DA 1A5SA 1GVOA 5CZJA 2KZHA 5I3FA 4UR7A 4YXGA 1TPH1 1QO2A 4UTUA 1L6YA 3GXPA 3N34A 2DZXA 3BW2A 1H7OA 1N55A 4NUWA 4Y96A 3W7CA 1THFD 1H60A 4MFEA 4UR8A 2FFCA 3S1XA 1VYSX 4PFMA 4UFMA 3M47A 3TQKA 4LRSA 1T99A 4NXSA 2CW6A 3NQVA 5DCDA 4O4WA 1ZAIA 3L0KA 2C6QA 4LV4A 1VJIA 4OBTA 5C54A 5L6UA 1FWSA 5F4XA 3L67A 1SZNA 1H1YA 5K7JA 4BWLC 2Q3OA 2E6FA 2TSYA 2NXGA 2WJZA 5D2YA 3A5VA 1IXNA 3QFEA 3TCEA 1SSGA 4M7TA 1ONRA 4GUJA 2OJPA 4HPJA 4WJEA 3Q2DA 3CB8A 1IGSA 4QJ1A 4HKPA 3LBCA 1FX6A 2WKJA 5IBXC 2ZDRA 3P67A 1X1ZA 3IGSA 4R33A 3NQ6A 4M6VA 3C61A 2A21A 3ATYA 4XTIA 1W5OA 3P74A 1H7RA 1LZOA 2WNQA 1Q6QA 3PY2A 5CPMA 2YX0A 4JTLA 3DHFA 5G4EA 4UFLA 3EKZA 3N2MA 3R8RA 1KM2A 1VCFA 2XFWA 2G95A 3O07A 3BG3A 1OFQA 3KAOA 1PCKA 3TU9A 4DPPA 3EB2A 3G1DA 3LXCA 2ZQ0A 1JCJA 4TIMA 4IMEA 3QMSA 4EVZA 3ANYA 4N6EA 2DZUA 2GVGA 3F4NA 4O1AA 1A53A 3O16A 3LHWA 2B7OA 1H7WA 1LROA 1VYRA 1ADOA 1UB3A 3W6YA 3W7EA 1TRDA 1AL7A 2X1TA 5F2MA 1TTQA 5D2WA 4IJBA 1IIGA 4I7UA 3DU0A 3LLDA 1X1OA 2JKPA 3O1NA 2A4AA 1DVJA 2V82A 5KZEA 1BKSA 1TQJA 3W71A 1LRTA 4UTMA 5BOOA 3EXRA 3UZ5A 4R7JA 2ISVA 1RQEA 2C13A 3NQCA 4DBDA 5KMYA 1OFBA 4Z08A 3T78A 3IIPA 1OX5A 1H61A 4RCXA 3MUXA 4NT0A 1VC4A 1T96A 5K9DA 3WJSA 1KFJA 4JNMA 4IOTA 5DCBA 3HMJG 3F1QA 3LHTA 3MHFA 2B7QA 4PL2A 5J5DA 4HN4A 4OGZA 1UCWA 3N9RA 3S8HA 5LZLA 3QSRA 3TQ0A 1WBJA 4LS0A 4AWTA 1QPRA 3LTYA 4KWWA 3BG5A 1JCMP 3E12A 1MZHA 1LBFA 2NLIA 1YXYA 1Z48A 2VFFA 3UY8A 1M6JA 1VQTA 3KHJA 3QQ0A 2R14A 3DHDA 4LS2A 4OHQA 1VHCA 2Y7EA 4GUIA 4X22A 2LLEA 1O60A 2ZZ7A 3DKLA 3G1XA 3KX6A 3OA3A 1OHLA 3W72A 4PEKA 1GPWA 4FHAA 2YXGA 3SIZA 2YCEA 4O28A 4WY0F 2VEIA 5D2TA 1KFEA 2PRLA 3NG3A 3QEZA 3IV3A 2GUUA 1M5WA 2C19A 2Z6IA 3HB9A 3L68A 1H7PA 4WOQA 3S1WA 1XI3A 1LOLA 5G4WA 3W70A 2B7PA 2WSYA 2A1YA 4PTNA 3HIJA 4TX9A 5G1YA 1JVNA 4HSOA 1ZNNA 3LRMA 4UTJA 4ML9A 3P80A 4ZL1A 4NJGA 3NGJA 4NZFA 2NX1A 3O6DA 4QIUA 3S5YA 4QSHA 4XKYB 2GOUA 3O06A 4Z1CA 3WK0A 3W7MA 3LCWA 4HSNA 4MYXA 3CHVA 1H7NA 2VEKA 2OT1A 3M16A 3QSTA 3BPWA 3TAKA 3LLFA 5D37A 1W8SA 2QCEA 4WD0A 5D2XA 1J4EA 3M0ZA 3L5AA 3ZS4A 5AYZA 3KRSA 1WAUA 1YYAA 1J2WA 1OX4A 3W7IA 2QAPA 3WFAA 1PE1A 3G1AA 3ZWTA 1TJRA 2FPTA 3ABQA 3H54A 5GVJA 1F76A 3LXBA 2QCCA 1W0MA 1TJPA 3JR2A 4O4VA 5ABTA 1S5TA 2H90A 1M7PA 5DY3A 3TJXA 2OT0A 4WXZA 4JTHA 4W9TA 3T40A 4AB4A 2NX3A 2QDHA 3CEUA 3NQ8A 1W1ZA 2Y62A 4BI7A 3LRKA 4NNCA 2E6YA 3LDVA 4IPIA 1Z44A 2H8ZA 3C2VA 3PR2A 2QCLA 4MY1A 3LB0A 4XBKA 3DENA 2NUWA 3O05A 4CQ8A 2RDUA 3L5MA 2B7NA 4P2VA 4KKXA 1OFOA 5EBUA 3M6YA 3G8RA 1ME9A 1X8FA 1FQ0A 1AW1A 2ZA3A 3P8IA 4BFAA 5EL1A 2J88A 4FF7A 3DFQA 3EWUA 1YPFA 3MBFA 1AK5A 3I7RA 4N6FA 2W0UA 4PODA 4OWGA 3HJZA 4HIBA 4IWWA 2VXNA 1I45A 1DQXA 1RR2A 1A5CA 1SQ7A 4JIPA 2A7RA 4XBSA 1KFKA 4ZQRA 3PBUA 3W1PA 4OE7A 1L6SA 4ZVJA 1XBZA 5D04C 3W1AA 1W54A 1G69A 4BWLA 5DXYA 3EX2A 5I3JA 5FEZA 1JRBA 3G1HA 1AW2A 2RDWA 2ZCGA 3LCFA 3DFPA 3KOFA 2F84A 4RXFA 1KFBA 2J9XA 1YXDA 2ISSA 4LUJA 2C15A 2R8WA 1FDYA 3U8GA 2BTMA 3DGRA 2CZ5A 2NX9A 3LV6A 1TCDA 4P61A 5IBXA 3TFXA 4IXXA 4ZZ9A 4RZ6A 5FEWA 1MEWA 3SGUA 3FFSA 5FEPA 1G4PA 1ZHAA 3OVPA 3C2RA 4OU1A 3KRUA 4IXHA 3NM3A 1ZJIA 5AHNA 2A7PA 3MO7A 4GBUA 1IXOA 2FPYA 1EUNA 3GB6A 3GVGA 3ATZA 3BVJA 3TXZA 3WJYA 1TTJA 2ALDA 2Z0IA 1KV5A 2HTMA 1K03A 2NV2A 1R47A 3NQMA 5F2GA 3W1RA 3RF9A 3VI2A 3OHIA 3Q58A 2VOMA 4O13A 1KM6A 4WUIA 5LNVA 3HPXA 3E9AA 1N8FA 4N9CA 1D3GA 1AMKA 1IXPA 3S5ZA 1C9DA 2DU2A 1B4KA 1LM1A 1RVGA 3MHGA 1F6PA 3MI6A 3C6CA 3T7VA 4RZ4A 3O6CA 3W1XA 3NPWA 4K38A 1I4NA 2C16A 1ZALA 2X2GA 3STGA 2WOQA 3O15A 2Q8ZA 3TK7A 3SGZA 1GVSA 2QKFA 3DI0A 4UIOA 3B8DA 1F5ZA 2P0OA 3GDRA 3MJYA 3L0GA 3M5YA 5D33A 3D0CA 4LVFA 4JX4A 1F05A 3C2FA 3RU6A 3R89A 2ZA1A 3FKKA 2ZRYA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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