5BMXA

Crystal structure of t75n mutant of triosephosphate isomerase from plasmodium falciparum
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
247
structure length
247
Chain Sequence
ARKYFVAANWKCNGTLESIKSLTNSFNNLDFDPSKLDVVVFPVSVHYDHTRKLLQSKFSTGIQNVSKFGNGSYNGEVSAEIAKDLNIEYVIIGHFERRKYFHETDEDVREKLQASLKNNLKAVVCFGESLEQREQNKTIEVITKQVKAFVDLIDNFDNVILVYEPLWAIGTGKTATPEQAQLVHKEIRKIVKDTCGEKQANQIRILYGGSVNTENCSSLIQQEDIDGFLVGNASLKESFVDIIKSAM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
source organism Plasmodium falciparum
publication title Probing the role of highly conserved residues in triosephosphate isomerase - analysis of site specific mutants at positions 64 and 75 in the Plasmodial enzyme
pubmed doi rcsb
molecule keywords Triosephosphate isomerase
total genus 98
structure length 247
sequence length 247
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2015-05-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5bmxA00
1FWTA 2G97A 4JX5A 3IGUA 4R7JA 2ZCGA 5BOOA 1Q6RA 4CLMA 4Q33A 1A50A 3N34A 3L21A 1LCOA 2NXIA 1QO2A 1TSIA 1FDZA 3BK0A 3W7CA 4JEQA 1OVDA 1GG1A 1W5QA 2DU2A 1VC4A 5TQLA 1XC4A 1EUAA 1JQXA 3TV8A 4XUGA 1QCWA 1NFBA 5AYZA 2WNNA 4DBEA 1TPWA 3G1FA 1OJXA 3MI3A 4K6AA 1RVGA 1SZFA 1H7RA 4LUIA 2ZZ7A 2Y7FA 3LCFA 3GKAA 3JRKA 3BPWA 3EWBX 4WOZA 2WO5A 5C55A 3DXIA 2X1SA 3NZ1A 4EIVA 2QKFA 4AWUA 3W7IA 1C29A 4BK9A 4MUZA 2FTPA 5BMXA 3S6DA 1W8SA 4OBTA 4ORIA 3A9IA 2A0NA 3HF3A 1QWGA 3TQ0A 3I7RA 5BNKA 1PE1A 4UTLA 3LLFA 1C9DA 1QOQA 4BI5A 3CC1A 5D33A 4QITA 3T78A 4RXFA 8TIMA 3P7YA 4W9TA 1ME8A 2NX3A 4LC8A 2Y88A 4LT9A 1UCWA 4MY8A 4UTKA 4DF2A 3W84A 4UNKA 2W0UA 5E0KA 1ADOA 2VEMA 2QUTA 2WJZA 3H54A 4DBDA 5CZJA 4HNNA 1EIXA 1THFD 5FEPA 4NU7A 1IXPA 3NDOA 4BWLA 4Z1AA 1A5AA 2EF9A 5FF0A 1DHPA 3EX6A 3UWVA 4UXDA 4KFOA 4IX0A 1ONRA 3LTSA 3DZ1A 3W1QA 4WX2A 3W7OA 2R91A 4N6EA 3F03K 1ICQA 4TIMA 1RD5A 2YR1A 3EWUA 1AG1O 5BMWA 1LORA 1X1ZA 1TREA 3P62A 2QCEA 3LRLA 3NQEA 4LV9A 3AJXA 3SFKA 3SJ3A 4M5PA 1HFBA 5KTLA 5T26A 2BX7A 3L68A 4WUIA 3TX9A 3W7GA 1VQTA 5KITA 1ZNNA 4K36A 4FIRA 2B0MA 4C1LA 4NNBA 1EP2A 2ZRYA 3FLUA 4NX0A 1GTHA 4YXGA 4S2CA 4LS1A 4XWUA 3G8RA 2ZZ1A 3QYQA 4UCGA 1ZHAA 4A3UA 1GEQA 3WFAA 2HTMA 5C54A 4GJ1A 1JCXA 4GWEA 4PA8A 3PWAA 1PV8A 1QMLA 4JYDA 2JK2A 4Z0SA 1JCJA 1VCVA 3QJAA 3W1UA 1LYXA 4AF0B 2VFDA 2G96A 3PUEA 1R2SA 1SSDA 2YFOA 1KM4A 2ZA1A 1TTJA 2NV1A 5EL1A 1SR9A 5I3JA 2CWNA 4MZYA 1Q6OA 1DVJA 2VEKA 4M19A 4RZ6A 3R12A 2H90A 1KM5A 3STFA 3LHZA 2A21A 1D3HA 1G67A 3CHVA 1O94A 3RK8A 4ADUA 3C0JA 5LNUA 1FBAA 1M6JA 4JTKA 4AH7A 3HGRA 1TRDA 1WAUA 4ADTA 4JTEA 1VH7A 4N4PA 4ONVA 3NQFA 1XUZA 1A5BA 3B03A 4ZQPA 4DO4A 3WJYA 1I8JA 3W1XA 5AC7A 4UTWC 3KFTA 1EP1A 1WQ5A 2Y6ZA 3ZWTA 2FPVA 1OHLA 2J9XA 3DU0A 1TTIA 4LS2A 4CNNA 1FCBA 5D2VA 1HUVA 2B7NA 3GYEA 1P0NA 3CT7A 2EPHA 4GXMA 4Z1DA 3LB0A 2NUWA 4CNOA 3OIXA 3UD6A 3P8IA 5J5RA 3PC0A 3NR0A 1O5XA 1W56A 4LVGA 4RLIA 1YDVA 3PBUA 1AL8A 3WJZA 2V2DA 1YTKA 3LXCA 2WV8A 1DOSA 3HG5A 2Y70A 5LNWA 1GJPA 4OE7A 2FQIA 3LHVA 1X1OA 2VFGA 1E51A 1I2NA 1W31A 1SQ7A 3DHDA 4FNTA 5F1VA 1TPVA 2FPTA 4YMZA 3RLUA 3THAA 4BFAA 3EWYA 1DJQA 3HB9A 4NXSA 2GVGA 1PL9A 5AHFA 2P10A 4O53A 1Z48A 3WJSA 3LCWA 1JCLA 1OK6A 2QJGA 5AHLA 4WD0A 4O17A 4CCDA 2VFFA 2NZLA 3OHIA 5HWJA 3TSDA 3PR2A 3LHYA 2QEZA 1GYNA 3ZFHA 1PIIA 5D09A 3S5YA 2FLIA 4IMEA 1B4EA 4RCXA 5DY2A 4AEOA 1TPDA 3NM3A 2V0TA 3DFQA 4FNUA 4O28A 2HS6A 2PRLA 2NX1A 4IMGA 2W6RA 3M43A 3RNDA 3TSBA 2V82A 4NQ1A 2J9YA 3WK1A 3OBKA 4M7TA 5E1QA 1BWKA 2ALDA 4NVTA 3O07A 1VCFA 4FF7A 1DJNA 3IIOA 3GAYA 2BTMA 2IQTA 4GFSA 2ISWA 1H60A 4IXHA 3VI2A 4XQ6A 3LHWA 1LLZA 2TSYA 3C2RA 1KFJA 4K37A 3IGSA 3I65A 3LTYA 5HULA 3C6CA 3E02A 1R2TA 3EX4A 3TUUA 4OGZA 5EKYA 1F7BA 5F2LA 5G2HA 3MYOA 3TFCA 2DZUA 2ISVA 2OCZA 2O7QA 3HGOA 4IX2A 4MVAA 1LDCA 3MO7A 1ME9A 4GBUA 4Z1BA 2YX0A 1Z44A 3B04A 3P81A 4CQ9A 1JUEA 2JKAA 2CZFA 1LM1A 2QCFA 2XN0A 1I2PA 4MYXA 3W07A 3TAOA 1B4KA 3M6YA 3E49A 3A24A 1H7PA 5H2ZA 3EXTA 3G22A 4YL2A 4NJIA 2YFNA 4QM1A 5AFDA 5K4XA 4IPJA 3W3OA 4TMBA 2H3DA 5EPDA 3GVGA 1W5PA 3SW6A 1GPWA 3EKZA 4JIPA 2GQAA 1Q3NA 3LTPA 1TPC1 3W7NA 1B57A 3BLFA 2Y7GA 4XBKA 1EA0A 3GXTA 4Z1CA 2VEPA 1O5KA 4E38A 3CB8A 2D73A 4AF0A 4N9CA 1ALDA 4U28A 5DXXA 5HWMA 4XBSA 1WYIA 4FO4A 2VFHA 3NNTA 4O16A 3NQ6A 3T4CA 2Z0IA 2W79A 3G1XA 4RZ5A 4LTSA 3LXBA 3NM1A 2E6DA 3MP5A 2GJNA 5D30A 2YCEA 2Q3RA 4JY8A 4FNSA 1PS9A 4QAIA 4I7VA 4XTIA 3IRDA 1FX6A 2NXHA 2YZRA 3W6YA 2WQPA 3LI1A 5U4NA 3TAKA 2HMCA 1UUMA 4PL2A 4KWVA 2CLFA 3OVRA 2HS8A 1SZNA 3A5FA 2OZ0A 5LKYA 1KFCA 2ZYFA 2QJHA 3ATZA 2QCNA 1B9BA 3L2IA 1QPNA 4AMAA 2PURA 3JR2A 3O1NA 3QEZA 1P4CA 1Q6LA 2DP3A 3BV4A 3GNDA 4Z0JA 1I2OA 4LVDA 1R30A 5C5YA 2B7QA 1RV8A 1JUKA 2TYSA 1SFLA 3EB2A 2CLEA 5HUPA 1YADA 3W70A 1H50A 4N6FA 4MZ8A 4O1DA 1KM3A 1K3UA 4N9EA 3WK0A 5L9FA 1EUNA 2RKXA 1VYSX 3TMLA 1R46A 1A5SA 4UTWA 3KVMA 3HG4A 2GPTA 4A21A 2CZDA 4CNPA 1VLWA 4JTLA 5K4ZA 4GC4A 4JTIA 3W88A 4ZQNA 1I2RA 5FF2A 4LU0A 4LUJA 4Y90A 1UB3A 2YYUA 4MJZA 3N3MA 1F05A 4JS3A 2X1TA 3L66A 4UTTC 5F4XA 1SO6A 3MMTA 5BW6A 4DF0A 3G0XA 3W2LA 1GZGA 2YDAA 3A21A 3VCRA 5HMSA 3R5EA 4UFLA 1KTNA 3VKJA 3TIMA 2DZSA 3A5VA 3Q2DA 2DJLA 3F1QA 1KM0A 3NPUA 2X1RA 3M5XA 2G5WA 3C56A 4KKXA 2ZRWA 5H91A 2Q8LA 3W1NA 5U7SA 3SI9A 4JYFA 3JS3A 3QQ0A 4Q32A 4Y96A 4IGHA 3VE7A 1MEIA 1SSGA 4WY0F 2C19A 3H53A 4EF9A 3C52A 4BR1A 4NUWA 4K7VA 4JGDA 1GVQA 1S3HA 5G2IA 4Y8FA 5CPNA 4EWND 4UMAA 1AL7A 1W3IA 1LOLA 4R34A 3QZEA 1TV5A 4HPJA 1WXJA 2B4GA 2FB3A 3TDFA 1NSJA 4N9BA 3UQNA 3W1LA 1TPEA 1PCWA 1YDOA 4N2YA 4UTUA 1K8YA 4PH6A 4NX5A 3HO8A 5D32A 1TPB1 3WJXA 4NZJA 3Q37A 3Q58A 4LOCA 1QNVA 3P5YA 3S42A 1BEUA 2B7PA 1XL9A 3IV3A 5MHBA 3SR7A 3NVTA 1PHQA 1XCFA 4IXXA 1F2JA 2RFGA 2ZZ3A 4LC6A 1TCDA 3EXSA 4OV9A 3MP4A 2YW3A 3NAVA 1SW3A 4O4WA 3R8RA 1QFEA 3FJLA 1FXQA 4MZ1A 3MYPA 3L0GA 3UZJA 2H3BA 1JJKA 4O57A 3BARA 4DELA 2BXVA 4M7SA 4M6VA 5AYXA 2C1HA 2GQ9A 2QR6A 4NZFA 4JTHA 3P74A 4O15A 5L6UA 4ZQCA 5FEXA 4PFMA 1Q6QA 2I14A 5FF3A 1SW0A 1TV7A 5C2XA 2Q8ZA 4HNTA 3CPRA 1ME7A 1I4NA 5LNSA 5CPOA 1F74A 1W0MA 2NUXA 3W1PA 2JBMA 3EWWA 5G1YA 4QQ3A 1EB3A 3M47A 4PODA 3NQ8A 3LCIA 3I68A 2QUUA 3ZS4A 4ZMGA 1FDJA 3B0PA 3ABSA 3P67A 1N8FA 1RZMA 3NOEA 1H7WA 5LHFA 1ZAJA 3P82A 3UY8A 3HJZA 2XN2A 3GXPA 5SWUA 4IWWA 4IMFA 3LGEA 3S0CA 1EWEA 1H1YA 4Y6GA 4D2JA 2R8WA 3UPWA 4EF8A 4UTMA 1BTMA 5FESA 5D37A 1W54A 4RZ4A 5DELA 4HSOA 3O63A 5IM51 2V81A 3W83A 4POCA 3R89A 3E9AA 2CLKA 3B4UA 3UY7A 3QMRA 1OX6A 1K7XA 1XBZA 2X16A 2C16A 5IBXC 1F76A 3KX6A 2OMAA 1OFEA 1H7XA 1XI3A 3PUDA 3M5ZA 1G4PA 1QPRA 2A6LA 1K8XA 2ABBA 4LS0A 3KRSA 1FUYA 3N19B 4HNUA 3LBCA 1G7UA 2QUVA 4JTUA 1A5CA 2Y85A 3SECA 3VE9A 4AHPA 3NQVA 5AC6A 3LM7A 4CCEA 3STEA 2GQ8A 1W5NA 2QCGA 4NT0A 2RDUA 1G4EA 1G7VA 3MJYA 4NNAA 1O60A 4QJ1A 5LGZA 2QDGA 3MP3A 4O13A 1DKWA 1JRCA 3TK7A 3GDRA 3GDLA 2GVLA 3P5ZA 4IJBA 3CIXA 5EYWA 4CQ8A 3NYZA 5BRBA 4TX9A 1YXCA 3BLIA 3E0IA 4UFKA 4LV4A 5DBTA 3S5OA 3NL2A 3HOJA 3IGXA 5EA9A 5K9XA 1R2RA 4JY9A 2Y63A 3HG3A 1FY6A 2Z6IA 1H7OA 3EKLA 3G0UA 3NGJA 4HSNA 2JGQA 4UTTA 3E96A 2WPBA 1W1ZA 1V7YA 3M7WA 2C14A 4RV8A 3W73A 3TE9A 4TO8A 3S9YA 1WOAA 3BG5A 2WSYA 1SZGA 3KVLA 5CPMA 2ZTJA 1RQBA 4IUOA 1TQJA 2YXGA 3W2KA 1G4TA 3G3DA 3V1PA 1OX4A 3NQ7A 3MHFA 4RJEA 3INPA 1GG0A 3P84A 4K8EA 3BG3A 3PBWA 4O18A 4FXRA 1TPH1 4LRSA 1DL3A 2Y7EA 3U8GA 1WBJA 2WNZA 3TH6A 4MPQA 3FA5A 1OYAA 5CPLA 3G24A 5G1TA 4JTTA 2Z2UA 2VKZG 5KSWA 3KAOA 1ICPA 1FWRA 1LOSA 1CW2A 2JKPA 2Y89A 3PG9A 3C61A 2FFCA 4KFNA 5EY5A 4WZHA 5DXYA 5D05A 3GAKA 1KTCA 1PVNA 1KV8A 3NQDA 4NJHA 2A6NA 1L6SA 3S5NA 2ZA3A 4L4MA 4OU1A 3M16A 4UMCA 3GDTA 2YGYA 3W7DA 1TIMA 1VCGA 3MHUA 3QF0A 4JN6A 3EXRA 4IMDA 1JQVA 5F2MA 1B3OA 3I6RA 4AVFA 4FB7A 1O95A 2ZDRA 1GOXA 2X1UA 1NF7A 3QM3A 3I7SA 4E2BA 1IIHA 3DFOA 2OJPA 3DI1A 3LXAA 5DCBA 1L2UA 2QF7A 5F2GA 1EPXA 1WX0A 2H6RA 3P80A 3QQ1A 3ELFA 4U4MA 1ICSA 3TU9A 1QR7A 4GUIA 1H51A 4K7YA 4OT7A 2J88A 4JTGA 3C2OA 3W22A 4FNPA 4DQWA 1U83A 4LRTA 1XBXA 3QH2A 4L4LA 2J9ZA 2E6FA 3K30A 3A22A 1SPQA 5I3FA 3NPVA 5ABTA 3LBMA 1XDLA 3TMQA 3TSMA 3SY5A 1S5WA 3GNNA 5G4WA 3TJXA 1LLWA 1YTEA 2ZRVA 3TC7A 1GVSA 2F84A 1DQWA 5F4SA 5AC8A 1KFKA 2E5DA 3C8FA 4X9SA 3NPXA 2ZRUA 3CQ0A 3B05A 4WY0B 4QSHA 3ZWSA 3N2MA 3M41A 4B5NA 1VYPX 3ATYA 3A23A 3GR8A 5TIMA 4ZL1A 3BVJA 4IOTA 3NL3A 1SFJA 3MHGA 1IIGA 1LROA 1TB3A 3TFXA 4GRSA 3G1SA 4A29A 1P1XA 4IMCA 2ZBTA 3WJWA 1JCMP 4FNQA 4JDYA 3ABRA 2A1YA 4Y9AA 3UWQA 3LCHA 3EWZA 1AW5A 5FEZA 2DZPA 1J2WA 4JX6A 1TPUA 2DZXA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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