2WNQA

Structure of the e192n mutant of e. coli n-acetylneuraminic acid lyase in space group p21
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
299
structure length
299
Chain Sequence
HHHATNLRGVMAALLTPFDQQQALDKASLRRLVQFNIQQGIDGLYVGGSTGEAFVQSLSEREQVLEIVAEEAKGKIKLIAHVGCVSTAESQQLAASAKRYGFDAVSAVTPFYYPFSFEEHCDHYRAIIDSADGLPMVVYNIPALSGVKLTLDQINTLVTLPGVGALKQTSGDLYQMEQIRREHPDLVLYNGYDNIFASGLLAGADGGIGSTYNIMGWRYQGIVKALKEGDIQTAQKLQTECNKVIDLLIKTGVFRGLKTVLHYMDVVSVPLCRKPFGPVDEKYLPELKALAQQLMQERG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Escherichia coli
publication title Structural Insights Into Substrate Specificity in Variants of N-Acetylneuraminic Acid Lyase Produced by Directed Evolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords N-ACETYLNEURAMINATE LYASE
total genus 113
structure length 299
sequence length 299
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.3.3: N-acetylneuraminate lyase.
pdb deposition date 2009-07-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2wnqA00
2J6XA 5AHLA 3Q37A 3TNOA 3DFQA 2O7SA 5D03A 1UUMA 3W7DA 5AFDA 3UWUA 1TTPA 1OYAA 1OHLA 4DEFA 5CSRA 2X1RA 4TX9A 3MI3A 1KTNA 3RLVA 3W7HA 1H7RA 3GDRA 4IUOA 4JTLA 4JX4A 3EXTA 1A5SA 3RNDA 3MBFA 5CZSA 1XBYA 3L0GA 4ZQPA 1TPEA 2YZRA 4UNLA 1RQBA 2QEZA 1QPRA 3IIOA 3JRKA 4W9TA 3HF3A 3SY5A 1IXQA 1ICQA 3FKKA 4ZL1A 2ZQ0A 1A5BA 1JCLA 2C15A 5G2HA 3QZEA 2WV8A 3GIYA 4AXKA 5EBUA 2X1UA 5CKSA 3NXFA 1YTDA 2WNNA 3R2GA 5HUPA 3L5AA 3NZ1A 3LCLA 4PH6A 1S3HA 3LHWA 4LT9A 4A22A 1Z42A 4WY0B 1VRDA 5K2ZA 4MKNA 4P2VA 1VQTA 3DGRA 4HNTA 2FLIA 3NDOA 5AC8A 5AYYA 1C9DA 1EWEA 4B5NA 2XN2A 1JR1A 1SO5A 3OVQA 1AG1O 5E93A 3P62A 4MYXA 2ZRXA 3S1WA 2HMCA 1ZHAA 3VCRA 2QCDA 3R12A 4JTJA 3G22A 3P7YA 1KM0A 4XZ9A 3UZ5A 1L6SA 3PSWA 4NXSA 2B7PA 1ZY9A 4FIQA 1JCXA 1R47A 3BO9A 1G4TA 3W1TA 2NXIA 2J27A 1DOSA 3WJWA 3UYCA 1I2RA 5FF3A 4XBSA 3R8RA 2ABAA 4ZQCA 1TPWA 3FLUA 3INPA 4M6QA 4IWWA 1YADA 3KVMA 5CSSA 2YPIA 3LCHA 4ML9A 2NV1A 1H5YA 4M6VA 3CEUA 4KWWA 4DF0A 3B0VC 3IVUA 5I3GA 4UC5A 3ANYA 1H51A 3EWZA 1WBHA 3W84A 4XQ6A 3N19B 4ZZ9A 5I3KA 4AF0B 4K8HA 3GDMA 5IBXC 1VC4A 2V81A 3U2OA 3L2IA 5FF7A 3L0KA 1B4KA 3DKJA 2GVJA 1Y0EA 1YDNA 1Q45A 4KFOA 4NT0A 4UTJA 5LZLA 1X1ZA 1YDVA 1WOBA 2QCMA 1BWKA 3TSMA 5EMUA 2IQTA 4JY9A 1EUAA 3NYZA 1OJXA 1WOAA 4LC8A 1WV2A 2QCGA 4WOQA 2YSWA 2VFDA 1FWNA 4DF2A 2ABBA 1IF2A 4QITA 1GQNA 1QPNA 4JTGA 4GBUA 1AL7A 3TU9A 2ZTJA 3PB0A 1PHWA 2JKPA 4NJKA 3PWAA 3NEVA 5DCEA 3W9ZA 1JVNA 1XDLA 3W2MA 2XN1A 4FX6M 3R89A 1RVGA 2ZA1A 3NM3A 2VXNA 1QOQA 2RH9A 1R2RA 3NZRA 5C54A 4KKXA 1BKSA 3T4CA 3L0NA 3NG3A 1WBJA 5FF0A 2J9ZA 1ZCOA 3NVTA 3KRUA 1H7XA 3LTPA 2VC6A 3TCEA 1WX0A 3M5VA 1JRBA 4S1FA 3W7RA 1HUVA 3LCXA 2DZXA 4UTHA 3FFSA 4R33A 4LUJA 1FWTA 1BTMA 5HINA 1PCKA 1B4EA 1EB3A 3V75A 4N2YA 1W5OA 3TJLA 1B9BA 3O6YX 1YLVA 3G1DA 4PC8A 2AQWA 1KFLA 2Y63A 4XKYB 3B06A 5D32A 1VCGA 2V2DA 4IMDA 5F4WA 2DJXA 3MI6A 1GYLA 4LOCA 2V82A 2H8XA 5H91A 3WK2A 1FY6A 3ABOA 3IVSA 2FFCA 1H7NA 3C6CA 1LZOA 4JDYA 2Y85A 2WKJA 3SJ3A 3F1QA 1JCMP 5FEPA 3W1PA 2GQ8A 1XXXA 2X30A 3MYOA 1OFPA 1ME9A 2CU0A 5T26A 3VE9A 4K6AA 3OG3A 4JIQA 1VJIA 1ZENA 2X1TA 4R7JA 4ICNA 3BW4A 1U83A 3BG3A 4GXMA 4MY8A 1LRTA 4IJBA 3TC6A 1P1XA 4HN4A 4KFPA 5L9FA 2Y6ZA 3BW2A 1YTKA 1VH7A 1W8SA 1CX9A 4N9DA 5AOUA 1AL8A 2CZDA 2V2HA 1EP2A 2NX9A 1FCUA 3QEZA 4ZQOA 3GNDA 3G1HA 3KAOA 1LBFA 1C29A 5HJLA 4UTTC 2A7NA 4IOTA 4Y8FA 1QPQA 3A5VA 1FXPA 2WO5A 1XFBA 3EWYA 1KA9F 3NOEA 3CEPA 2QUTA 3G1YA 1QOPA 2X1SA 3BLFA 1MEWA 2JK2A 1HO4A 1N55A 1TTJA 4Z0JA 3NQ8A 1GYNA 2JGYA 4ZMGA 4RLIA 1XM3A 3MJYA 1HL2A 5HMSA 3NL3A 4QIUA 1KM3A 3TK7A 3ELFA 3A24A 1I45A 3NO5A 2QCNA 3S1VA 3DFNA 4Y90A 4JIPA 5LNVA 1R2TA 2DZWA 1H7PA 5AHFA 2CZEA 3B0PA 3C2EA 5FF4A 3UWWA 1F73A 3EXSA 3C2RA 3I7RA 4EWND 2C6QA 3LV5A 3BG9A 3I6RA 5HR6A 2A1YA 2YR1A 3PBYA 3UD6A 3C61A 3P61A 4QNEA 1SW3A 4M7TA 4LVDA 2YW4A 1GT8A 2DORA 2X16A 3BG5A 3KHJA 4N6FA 3KOFA 1EP1A 3NPVA 3D0CA 3L67A 5DY2A 4Z1CA 1W3NA 3UXDA 3EX4A 1FCVA 3RFAA 3SR7A 2Z6JA 3NAVA 1W31A 4NX0A 1TQJA 2B0MA 3GXPA 1Z48A 2WQPA 3LCFA 1ZFJA 1KFBA 4WQ6A 1LOLA 4H4IA 3W1RA 3GAKA 1OX4B 3P5YA 2G95A 3BLEA 2B7NA 3EWWA 1M7OA 2E68A 4ADSA 3QQ1A 1LOSA 1TJPA 2B4GA 4CQAA 4GFSA 3TJXA 1YXDA 3O16A 3CTLA 1EX5A 4OU1A 3O6DA 4PTNA 1LRQA 1G7UA 1GG0A 4NJGA 3TSDA 2CLKA 1VGAA 3HQ1A 3W1AA 2QCCA 2ZRVA 1L2UA 4O1AA 3HG5A 4QISA 3PBVA 4GWEA 1IXPA 1DJQA 2C0AA 4OV4A 2ZTKA 4O57A 1I4NA 3N34A 1EEPA 1XC4A 1HTIA 3LXBA 3LOTA 1X1OA 4ZQMA 1TJRA 4E0CA 4PL2A 5AYXA 1OK6A 2DZTA 2GOUA 1Z44A 3LCWA 1NF0A 2NWRA 2G96A 4WJEA 1VYSX 4LVBA 3GXNA 1ZNNA 3G1FA 1AK5A 2WSYA 4IMFA 5C2XA 3W86A 1SW7A 2Z6IA 1KFJA 1JQXA 3U8GA 1VLWA 4C1LA 2C3ZA 1TPC1 4O0KA 5G1TA 5D38A 3TAKA 5KMYA 1B3OA 2FB3A 3W87A 3GK0A 1OFOA 1W37A 3TC7A 5AHMA 5LNUA 3OEXA 2GQAA 3LERA 3CU2A 3TW6A 3TKFA 4JYEA 4AF0A 2R94A 1RPXA 1F6PA 1LRNA 4UTIA 4O1BA 3HO8A 1SW0A 3WK0A 2C16A 4JN6A 3PC0A 2CLFA 1LBLA 3S1XA 1PHQA 4WUIA 3TUUA 1TPVA 5AYZA 2QAFA 3GDTA 2A5HA 3VFLA 1H7OA 1NAL1 1TTIA 5J5RA 1OYCA 4CNOA 5DCDA 5H2ZA 3EX6A 3S5NA 5F1VA 3NM1A 2EAWA 5FI8A 3BARA 1FDJA 4OWGA 3G0SA 4NNBA 3P8JA 3QPYA 3W76A 4NX5A 3C3NA 1VYPX 4IXXA 4UTLA 3I68A 1XUZA 1GPWA 3CM4A 4N9CA 1XBVA 1SZEA 4DF1A 3RK8A 4UTWC 3ZWTA 2ATMA 1MO0A 4LS0A 5A8GA 4R34A 5HQEA 2Z2UA 4O10A 3I7SA 4WXYA 2QKFA 3MHGA 3W2LA 4N6EA 3W7JA 1E51A 1QO5A 5HWMA 2OX1A 3G3DA 4TU1A 4FIRA 1ZAIA 4LVGA 1A5CA 4UTMA 2ALDA 2CWNA 1F6KA 1FX6A 1X7FA 1LP6A 4FXRA 4I9AA 4UR8A 1SU5A 3W7IA 4H6KA 1F74A 3FKRA 3DKLA 2NUXA 3QPZA 3BGJA 2QF7A 3PG9A 2GUUA 3LHVA 3T55A 3LXAA 3QQ0A 1HG3A 5KSWA 1UUOA 2C1HA 3BGGA 1FCBA 1RQHA 4U28A 1F5ZA 4AHQA 3DI0A 4XKYA 2Y70A 3B03A 3HGOA 4FO4A 4OQVA 1W0MA 3W72A 3M0ZA 5IBXA 3B4UA 1O60A 3C2OA 3IEBA 3I65A 5C6MA 3KFTA 4AAJA 4K38A 3IRDA 2V2CA 1J2WA 2JKEA 4CNNA 1P5BA 6ALDA 3HPXA 1OFBA 4Y6GA 3GX9A 1GVFA 3SECA 1XCFA 4BWLC 1IIHA 2EHHA 4AHPA 4YCPA 1K8YA 2ZRWA 1OFEA 3NQ6A 2CLOA 2A85A 2ZA3A 1KBJA 4FB7A 2CLMA 1N8FA 3CHVA 4IGHA 1G4EA 1J5TA 3W7QA 4BK9A 1OG0A 1S5VA 3Q58A 1F2JA 5I3JA 2NWSA 1Q6OA 1OF8A 3W7MA 5HNRA 3CLMA 1I8JA 3GVGA 3PUDA 1RZMA 2DP3A 3IIXA 4GE8A 3TX9A 2DJLA 2YDAA 1SFJA 3NQGA 4N9EA 1G69A 5TIMA 1JJKA 2CZFA 4N4PA 1Q6RA 3NGJA 2OJPA 1YPFA 1ML1A 3W22A 3GDKA 1MXSA 2ZZ3A 4WY0F 3TH6A 3MP3A 3S5OA 2R14A 3HJZA 5EL1A 4AWTA 3HG2A 4HNNA 2Y88A 3W1NA 3JR2A 2A0NA 3MP5A 3UPWA 4O14A 4YL2A 3YPIA 3T7VA 3W75A 2W0UA 2X2GA 3TE9A 3ATZA 2QUUA 4Q32A 3OIXA 1V5XA 3GNNA 2A7RA 3HGSA 2Y7DA 3S1UA 3UWZA 4NVTA 3OVRA 1L6WA 3LBCA 3LTYA 3TQVA 3L9CA 2ZA2A 3W07A 3G1VA 5DN1A 4FNRA 1D9EA 2GJLA 2YX0A 3B0UX 1LYXA 1PS9A 2E1DA 4E2BA 3W7OA 1LROA 3NQ7A 1KV8A 4A2SA 3DHDA 1DVJA 2TYSA 5D2TA 4MZ1A 1F7BA 4LVFA 1QMLA 3BV4A 4XWUA 3SIZA 3SFKA 3TW7A 3F4NA 3MMTA 4MY9A 3GR8A 3CWOX 4RR4A 3BVJA 3RLUA 2FDSA 4UFLA 2V5LA 4TMBA 3O1NA 2YGYA 3DENA 3FYOA 1UJPA 2GVGA 1G7VA 4FHAA 2CLLA 3VKJA 2RDUA 4YCOA 1OVDA 3CPRA 3IGUA 4LV4A 5AC7A 4GUJA 4PCFA 2PRMA 4A3UA 4KFNA 2VEKA 3WFAA 4ONVA 2J9YA 2FQIA 4JYFA 3BLIA 1OX4A 2GVLA 1T96A 4O0ZA 3BPWA 3WJXA 3EWUA 5FEXA 5DXXA 3QRHA 2ZZ5A 3EEGA 4WZHA 1G6CA 1XBXA 1TRIA 2PCQA 2EF9A 3MI2A 1G4PA 5CPNA 4O16A 3W7PA 3DHFA 1SSDA 4UTTA 4JTHA 4MJZA 4OHQA 5LHEA 3BW3A 3QC3A 2VEIA 2OCZA 1DQXA 1GOXA 5DY3A 1VPXA 2HTMA 4NU7A 1FDYA 5KTLA 1QNVA 3EKZA 4JICA 2HSAA 4EOUA 2CLIA 3KX6A 3P74A 5BMXA 3CC1A 4QM1A 3AO0A 4DXVA 2DZVA 3NQMA 5HR7A 1R2SA 1JUKA 5D2YA 3GLCA 4O1DA 1SUXA 1ME7A 2OT1A 4MZ8A 5LNRA 3SW6A 2PC4A 3HGRA 1QCWA 1QFEA 2J24A 2WPBA 1IGSA 4LU0A 4XUGA 3W71A 3JS3A 4GNJA 5A5WA 5D2VA 4JR5A 4WOZA 2I9EA 3LRLA 1YXCA 2V0TA 4RZ6A 1VYRA 3MW7A 2VELA 2ZZ6A 3G8RA 3PF3A 5U4NA 1ZAHA 3G8EA 1DBTA 2H6RA 5G4EA 5IM51 3ZWSA 2E5CA 2E5BA 4UTUA 5F2MA 1THFD 1I2PA 1C8VA 2QCFA 4I7WA 3W70A 1JQVA 2H8ZA 4NQ1A 4CCCA 3P8IA 5FF2A 2OT0A 2PRLA 3W85A 4JEQA 1K8ZA 2A4AA 1KBIA 1NVMA 5F4XA 3ABSA 4TR9A 3UWYA 3EX2A 3H54A 1GZGA 1QPOA 3LI1A 1FBAA 1ICPA 3EX3A 1LTDA 1OFDA 1SZNA 4UFHA 4CQ9A 1W54A 3M47A 5HWNA 4RXFA 4GC4A 4HIBA 1KM2A 3GXTA 3HIJA 4HNUA 3UWQA 2J9XA 4Z1DA 3LHTA 3SSJA 4UMAA 5G4WA 3QMTA 4O52A 3OA3A 4YLWA 2YCEA 5D2WA 5DELA 4WX2A 1YYAA 2RDTA 4JYDA 3NNTA 1JUBA 3F03K 2Y89A 3LTSA 1TIMA 1LM1A 2FPYA 2W6RA 3ABQA 3O8AA 4XTIA 2ISVA 3W7KA 4JS3A 3E12A 4PA8A 1G67A 4UIOA 1JCJA 1TRDA 5CZTA 1DQWA 1I2OA 1VR6A 3W2KA 4A21A 4UR7A 3W2UA 4MIMA 1P4CA 3DI1A 4DELA 5DLCA 4K8EA 2F84A 1SPQA 2HS6A 4K36A 3NPWA 3SZ8A 5KZMA 1SO4A 5D30A 1VLIA 3O05A 1X6UA 4MLRA 3C2FA 4L4MA 3W74A 3T78A 1AW1A 1R46A 1DKWA 2WJZA 2WNZA 4IQLA 1KFEA 5HULA 1VHNA 5L6UA 4ZQNA 4NNAA 4N02A 4FXSA 4QJ1A 5LNSA 4RV8A 4MPQA 3QMRA 4I7VA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3T2O A;  1TWW A;  3DGB A;  4GK8 A;  1P48 A;  3CAV A;  5AFD A;  3UWU A;  1MDL A;  4H9M A;  1JD7 A;  4ZTY A;  4J28 A;  3MI3 A;  1MRQ A;  1Z7A A;  3WUF A;  4IUO A;  4CUC A;  1XYB A;  2F38 A;  3EXT A;  1X97 A;  1RQB A;  1QPR A;  3WNK A;  3ITC A;  2JQX A;  3RGT A;  4L9Z A;  3IIO A;  5BCA A;  3VM7 A;  3V5C A;  1JAE A;  3HF3 A;  3SY5 A;  3R7M A;  1A5B A;  3VGG A;  2ZWY A;  3KBV A;  4AXK A;  2X1U A;  2DEP A;  2PDQ A;  3NXF A;  1M04 A;  3UJ2 A;  1QNS A;  4RDZ A;  1S3H A;  4Q4Q A;  4D6F A;  1HGW A;  3NEH A;  4XBJ A;  1QHP A;  3QGA C;  1YNP A;  1XCW A;  1VRD A;  4KIR A;  2FHB A;  2BOD X;  4GIE A;  4P2V A;  2FLI A;  3MTW A;  1C9D A;  1EWE A;  4B5N A;  5H1W A;  3OVQ A;  1GVI A;  4BQ2 A;  2ZRX A;  3QR3 A;  3G22 A;  4O1E A;  4XZ9 A;  3B9A A;  2XH0 A;  1CEC A;  1I1W A;  2YA0 A;  4NXS A;  2B7P A;  1R9Y A;  1JZ3 A;  1JCX A;  1R47 A;  1WZK A;  4PE8 A;  1K6W A;  3WJW A;  2ZUM A;  1AVA A;  3S6O A;  4U2Y A;  1TKK A;  3UYC A;  3PZU A;  1JG9 A;  4I5X A;  1EJT C;  3KTX A;  1XLD A;  2IQD A;  4UZU A;  3UP8 A;  5B80 A; 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