1MYRA

Myrosinase from sinapis alba
Total Genus 190
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
499
structure length
499
Chain Sequence
EITCQENNPFTCGNTDGLNSSSFEADFIFGVASSAYQIEGTIGRGLNIWDGFTHRYPDKSGPDHGNGDTTCDSFSYWQKDIDVLDELNATGYRFSIAWSRIIPRGKRSRGVNQKGIDYYHGLIDGLIKKGITPFVTLFHWDLPQTLQDEYEGFLDPQIIDDFKDYADLCFEEFGDSVKYWLTINQLYSVPTRGYGSALDAPGRCSPTVDPSCYAGNSSTEPYIVAHHQLLAHAKVVDLYRKNYTHQGGKIGPTMITRWFLPYNDTDRHSIAATERMKQFFLGWFMGPLTNGTYPQIMIDTVGARLPTFSPEETNLVKGSYDFLGLNYYFTQYAQPSPNPVNATNHTAMMDAGAKLTYINASGHYIGPLFESDGGDGSSNIYYYPKGIYSVMDYFKNKYYNPLIYVTENGISTPGSENRKESMLDYTRIDYLCSHLCFLNKVIKEKDVNVKGYLAWALGDNYEFNNGFTVRFGLSYINWNNVTDRDLKKSGQWYQKFISP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Glycosidase
publication title The crystal structures of Sinapis alba myrosinase and a covalent glycosyl-enzyme intermediate provide insights into the substrate recognition and active-site machinery of an S-glycosidase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MYROSINASE
total genus 190
structure length 499
sequence length 499
ec nomenclature ec 3.2.1.147: Thioglucosidase.
pdb deposition date 1997-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1myrA00
2NT0A 1GVYA 2IXVA 1SMDA 5HOSA 4MADA 4EKJA 1E71M 4P7RA 1GOOA 4JFUA 4BQ5A 1BG4A 1R85A 3MS8A 3MUAA 4LXFA 4CD8A 4MPKA 4AIUA 3J7HA 3TA9A 5A1AA 3AOFA 4KGLA 1E1FA 1HF6A 4ML4A 2J77A 2EQDA 1GOMA 1ISXA 3CHDA 3KEHA 5A6KA 3SCSA 3WQVA 2TAAA 4HA4A 2DEPA 2YA0A 3OGVA 1E4NA 1G0CA 2WNWA 3FY1A 4U31A 1NM9A 4W84A 1E0XA 4PMVA 3AXIA 2WK2A 3GXIA 1GCYA 4MB1A 1ZS2A 1XHGA 1CTNA 1MQPA 4FLRA 2BXZA 1VIWA 1C90A 4D6IA 4P8WA 2CHNA 1FA2A 1VB9A 1XYZA 1IZJA 4PTXA 1W3LA 3VUPA 1MW0A 1FFRA 2W62A 2ZUUA 1ZBKA 3ZT6A 4AEEA 3AZTA 3UETA 3A3HA 1XRVA 5A2AA 2WHJA 5M17A 4JFTA 2BY3A 3CLWA 1VBUA 2DH3A 5LA2A 3TONA 5CQ1A 1MXDA 1ECEA 1QHZA 3POHA 1B3YA 2C7FA 3FAWA 1LF1A 5AC5A 1E4MM 2XVLA 3ARWA 2W61A 4XB3A 2DH2A 2WMJA 4H04A 4PBGA 3AMLA 3WFLA 1UR9A 2D3NA 3S6TA 4J3UA 1ZL1A 5KEZA 4M80A 2CBVA 1I1WA 5LA1A 2V3GA 1Q4NX 2VC9A 1JL8A 2ZX8A 4MAZA 1W1VA 1UD4A 2XFFA 2VUYA 1VEPA 2V3EA 1GOQA 5CG0A 3AS0A 3MSGA 2BNJA 4MNJA 4JFVA 3ZSSA 4WF7A 1XD0A 3ZSTA 1J18A 3WMBA 1JG9A 2DIEA 1CWYA 4U5KA 4ZXOA 1NOUA 2BVDA 2O9OA 4P7QA 3EDDA 3RDKA 1I1XA 1UD8A 1JYVA 1JNEA 4FK9A 1XYFA 6CGTA 2FHFA 1WDRA 2WZHA 4PMZA 1H49A 1PJ9A 4A4AA 3BAJA 1E6SM 4PMXA 1R86A 1UHVA 4AZ5A 2XGIA 1WCGA 3WF0A 4B3KA 1QI2A 2J25A 2WW5A 1XCWA 1JZ6A 4M82A 1G5AA 3AI0A 1H4PA 2VX4A 3UG5A 2GJXA 1E72M 3PZQA 1NWTA 2GDVA 4TVUA 4TX8A 2YL8A 3VGDA 1LWJA 2VRJA 1J11A 1V0MA 2J7BA 3VIIA 1E5JA 1MXGA 5CJ5A 1JYXA 3M07A 2YLLA 2XVGA 1WZAA 2DSUA 3GNOA 3RJYA 1N82A 1JXJA 1TG7A 1HKJA 4UFJA 4TUFA 5DFAA 1XSJA 4DWSC 2XSBA 2XWEA 1GQKA 3CZ8A 4J3TA 1AQHA 1QW8A 2YA1A 1V0NA 4W7VA 3WH6A 4AZ7A 4WK9A 1JF5A 1TMQA 3PBGA 2WLZA 2WMFA 4R5EA 1CGVA 1XV8A 4WJXA 1B3ZA 4MNKA 2X09A 3K8KA 3MV01 4JFWA 2VRQA 2J79A 1I75A 4GI6A 1BYCA 1GQIA 1VENA 3MV11 3U57A 3L4YA 4W86A 4P8XA 4ATWA 4UOQA 3THCA 4PMYA 3AXXA 1O6IA 3WDPP 5I3DA 3CMJA 4E2OA 3W26A 1CYGA 2YL9A 1QNSA 2BY0A 2HVMA 4WLCA 5A8QA 3UESA 1GNXA 4JKKA 4LQ1A 2W92A 4PYSA 5I77A 4KRUA 1J12A 3GM8A 3K46A 1OINA 3AIUA 3APGA 4YPJA 3ALFA 5CGMA 3GXMA 4UTFA 5GNXA 1KFWA 2WWCA 2CYGA 4DUWA 3F5JA 1TFVA 7A3HA 3VMOA 2XUCA 1NP0A 2ZX5A 1J0IA 4B9ZA 4IPLA 2ZUVA 2WCSA 1E43A 3L2LA 3QHOA 2ZX7A 4Z2GA 3A4XA 3B8SA 4AD2A 4BQ4A 1YQ2A 3BXWA 1WNOA 1QNOA 3QOMA 4F9DA 4HPGA 5E6ZA 5FD0A 4W8LA 4KWUA 1DWAM 1OD8A 1GOWA 2CBJA 2E0PA 3KWXA 4OIFA 1EIBA 1OT1A 1V3KA 2NT1A 3N11A 3ZJ6A 4CCCA 4D6DA 2J4GA 4HMDA 4QLLA 1BF2A 2OWWA 4M29A 4YN5A 5A2BA 1UD3A 1V3LA 2D23A 2EBNA 3CGTA 3WD3A 1SFSA 1W32A 1X6LA 3AXHA 3UERA 3GYCA 4JAWA 3VD9A 2CKSA 4JFSA 1C7TA 1B31A 4OUEA 4AY1A 2XVNA 1W2PA 1G1YA 5I0DA 5A6AA 4CD7A 1KGUA 2CITA 5D9NA 5CPTA 1IT0A 1OCQA 2VZSA 2VCAA 2DQXA 4LYQA 5CGTA 3DYMA 2VX7A 3TOPA 4YHEA 1C91A 3EBVA 2J8FA 1ISWA 2YIHA 2AAAA 1PEZA 4DWSA 3CTTA 1Q6DA 2Y2WA 3AIVA 3WH8A 1R7OA 1LL4A 2YBUA 5EMYA 3GBEA 1H0IA 2WZIA 3SCQA 4EANA 1J0KA 8CGTA 4XUYA 1PZ3A 5A8NA 4S3JA 1BYDA 1UR1A 3RILA 3W29A 1C7SA 3IJ8A 3EDJA 1Q6EA 1Q6GA 5AC4A 1MYRA 3VIMA 3AIQA 4BCEA 1TVPA 1J0JA 1DTUA 2CERA 5FCZA 1EXPA 4Q22A 3VTRA 4H41A 5I24A 4N0RA 1L0PA 3CHFA 1CPUA 2EPOA 1XH1A 1DWHM 1XSIA 3VILA 1RP8A 4V28A 3VDHA 1LL7A 3CIVA 4U3AA 2W91A 4TXEA 2VNCA 3ARQA 1KBBA 1CLVA 5GNZA 1GZJA 1K9FA 2CBUA 3RMEA 5JIPA 2V5CA 3OA5A 3EDFA 3OLIA 4AISA 3NSXA 1PIGA 1JD7A 1VJSA 3FAXA 1GOKA 2W66A 2WC4A 2W5FA 1HN1A 1UOKA 3B9AA 4W89A 3U7VA 1QVBA 2VX5A 5M5DA 1JAEA 4OBRA 2GFTA 4HZ6A 3HU7A 3G6MA 1L8NA 3GZAA 4CCEA 1ESWA 3WNOA 1GJWA 4HOZA 1WB0A 5BRPA 2XTKA 1C93A 3MO4A 1TR1A 2CEQA 2JEQA 2D20A 3TTSA 3ZJ8A 1HVQA 3WD1A 3MANA 4C7DA 4W88A 2GVYA 4HTYA 2XPKA 3AHVA 1WDSA 2WAGA 1FHDA 4URIA 1V6UA 1U33A 4UNIA 4IUGA 2WM0A 1F4HA 2ZOXA 1JZ8A 1OGGA 3NIYA 2O9RA 3OGRA 2GJXB 3CH9A 4AMCA 2BHZA 5DF0A 3SUVA 4CVUA 4UQCA 4D6HA 2QHAA 2UY4A 3M7SA 4KH2A 1C8YA 1VFOA 4FMVA 4UQBA 3WMCA 2FGLA 3MUZ1 1V6XA 1V0LA 1JZ2A 1KB3A 4FF5A 3ARXA 1BVZA 1TUXA 2WANA 2DT2A 3ZOAA 1OD0A 1CGXA 4D72A 4J7RA 1KXVA 5IHSA 3VM7A 4GO9A 1MFVA 2VRKA 1MQRA 2GK1A 3UG4A 3AYSA 3QHMA 3QOKA 3A4AA 3CUJA 4DM2A 4TX6A 1HNYA 1P6WA 4H7VA 5CSUA 4PCSA 1EO7A 3WH5A 4GO8A 5D9MA 3QR3A 3OBAA 1B30A 1LL6A 3VIOA 5LYRA 1KCLA 3VIPA 3MUY1 4U5IA 6TAAA 1K6AA 3RIKA 4UFMA 2PWFA 1SYTA 3VD5A 1ISVA 4U3CA 4AD5A 4J3VA 5ABHA 4W7UA 1ZBWA 2WYSA 4AC1X 2UY2A 3WBEA 1E70M 2E8ZA 3VDCA 1Z32X 4CU7A 1DWGM 3II1A 3T0DA 2VQTA 1CGUA 1JZ3A 3WDHA 1OIFA 1WDQA 3VNYA 3BC9A 3AIBA 1HJVA 1MW1A 3GNRA 2EXOA 4PUEA 5CZKA 1M04A 2EPLX 4NI3A 5KZ6A 1EHNA 5JBDA 2XHYA 5E09A 5EBAA 1US2A 3TP4A 1DEDA 3AMCA 5DEZA 4ATLA 3F5KA 5C70A 2WSPA 3BAWA 1X1NA 3L4UA 1H0GA 2Y8KA 1E40A 3GNPA 4D6GA 1CXKA 4HZ8A 3VIGA 3PHAA 2WSKA 3VDAA 2VCCA 4U2YA 4B9YA 3K8LA 1WE5A 1BG9A 1DHKA 2Y8VA 5I78A 1PX4A 3MSDA 3VIJA 1KXTA 2VCBA 4NZCA 2DSKA 4ZEPA 1CENA 3WL1A 4D6EA 4MJ4A 3E1F1 4AZBA 2VURA 1UH4A 3DC0A 3VIFA 4PSPA 1ZBCA 5F7UA 3UR8A 4UZSA 5BXPA 3AISA 5IDIA 1FP9A 1UKOA 1G01A 1W9UA 5BXSA 2PBGA 3CUFA 4CUCA 3OZPA 4MDPA 2PF0A 3N13A 4C7FA 4PUDA 4WSKA 3LPFA 3UG3A 3MU7A 3L4WA 2D0HA 4AZGA 3RM4A 4E4PA 1EO5A 4J3SA 4JL1A 4DWSB 3AS1A 5IHRA 3K1DA 4AIOA 4V2XA 4ACZA 3WNLA 3AMKA 1CXLA 4PTWA 4W5ZA 5CLTA 3VINA 1RPKA 2WBGA 3AMGA 4UOJA 2E9LA 1E0VA 1VBRA 3T09A 4N42A 5A8MA 4W5UA 3SCUA 2CXGA 3B9DA 1JDAA 1EDQA 3BMWA 1E6ZA 1E3XA 3PTKA 3WBAA 1JIBA 1D7FA 1TZ7A 2A3AA 3NDYA 3CZEA 3ZJ7A 4F8XA 2WVTA 3OLGA 5E6YA 3W37A 4Y7EA 4AXNA 3KL5A 1JXKA 1PIFA 4PMOA 3W6LA 1GW1A 3SCNA 4MNLA 1XC6A 2DT3A 2ZX9A 5TD4A 2NSXA 4M8UA 2X0YA 1TVNA 2WXDM 1H1NA 3AROA 2D22A 3KZSA 1CLXA 3WUFA 1FFQA 2PC8A 2ZUNA 3MUIA 3SCTA 2JALA 3WDQA 4P8UA 3ARPA 2MANA 4RE4A 1B9ZA 2GJRA 4F9JA 2E40A 4CN1A 2CCRA 4AEFA 2VVNA 4HMCA 1GOIA 3L4ZA 2DSZA 2ZUSA 4UQ9A 2WVVA 1MQQA 2DDXA 3ARUA 4J3XA 2D24A 4JKMA 1Q6FA 2Y4SA 2WBKA 4ZFMA 4WKFA 2OSWA 3W53A 1SMAA 2UY5A 4FLSA 1E1EA 5D9PA 1AVAA 2D2OA 2WVSA 2CPUA 5GNYA 1KQYA 1CXFA 1JGIA 3CPUA 3GH5A 1KGWA 1QHPA 2W63A 2VX6A 4BQ2A 3ECQA 4HOXA 2ZUMA 1WZMA 3PZTA 1E3ZA 1UA3A 4U33A 1JZ7A 5HDRA 1K9EA 3NSNA 4HA3A 3VU2A 1KR1A 2OYKA 3WFZA 1UKQA 1JNDA 3VOCA 1FP8A 2ZXDA 1V0KA 2D1ZA 4GZJA 1RP9A 1GUVA 2W67A 2Y24A 4CCDA 1W1TA 3AHZA 1UR4A 1QI5A 3WNNA 1W1PA 3JUGA 1NP2A 4JCLA 3BMVA 3SCVA 4HMEA 2C0HA 3FNDA 1J10A 2O9TA 3W38A 3CZJA 3L4XA 4PEEA 5CPSA 1UWTA 1FH9A 4PSRA 5D9OA 4KRTA 2A3BA 3AIEA 1UR8A 4S3KA 1KCKA 3K4AA 5A6BA 3W28A 2GK1B 4AD3A 3SUUA 3IAPA 1VF8A 3A4WA 1OSEA 3HJEA 1DWJM 3ZT7A 1H41A 4D6CA 1JYWA 3OGSA 2O92A 2ZE0A 3NJ3A 4D1IA 2WC7A 3MMWA 3WD4A 2IXUA 2PB1A 4EE9A 4Z2IA 4QCEA 1HXJA 1U2YA 3GBDA 3GXFA 5I23A 4GKLA 1JYNA 1QBBA 3AICA 1J9YA 4PTMA 1J0HA 2O9PA 4OOUA 1M53A 3DHPA 2CKRA 4W7WA 2J74A 2VQUA 3M6DA 3W81A 2ZIDA 1UYQA 2Z1SA 2G8ZA 4AD1A 1BGGA 1NWSA 4P7LA 1GQJA 1MWOA 2C8NA 2V3FA 3W24A 3VGHA 1WDPA 4WKAA 3K8MA 1PBGA 2YL6A 1DP0A 4HU0A 1IV8A 1E9LA 1V3IA 3A47A 4P7OA 3W4RA 2DT1A 1E6XM 3N17A 1JZ4A 1QPKA 4JZ5A 4ATDA 1W3JA 4QP0A 3WF1A 3LPPA 3ARYA 1GORA 1V6VA 1M01A 3PZIA 3IJ9A 5A8OA 1ISZA 4ZENA 4ZE4A 3BCDA 1V6WA 3BAYA 4MTVA 1E6NA 1JFHA 4GXPA 4QLJA 4Z2HA 1HKKA 4DUXA 1GJUA 1JF6A 2GSJA 1MW3A 1E0WA 4L4OA 1VJZA 3U5YA 1V03A 1OM0A 4OJYA 2XSAA 2OYLA 1H09A 5DT7A 5FKYA 5ECUA 2RGMA 3ZO9A 3WQ4A 2QF8A 3CZGA 2YOCA 5EFDA 1C3FA 1QI0A 2E8YA 3VMPA 5JBFA 4L4PA 1V6YA 1V3HA 3BH4A 1HIZA 2JE8A 7TAAA 1WP6A 2GUYA 4DUVA 3L4VA 1EH9A 2WC3A 1ODZA 4KGJA 1UA7A 3DECA 1FH7A 5AYIA 1G94A 3VM5A 5A3HA 2XFRA 3WL0A 4AIEA 1BQCA 4QDMA 5JUVA 2VOTA 1QHOA 1ZBVA 5IFPA 2PWEA 5A6MA 2JIWA 1CGYA 4IPNB 3L2MA 4PMDA 2NW0A 2WCAA 3UCQA 1OBAA 1W3KA 3I3BA 1WKYA 3ZJKA 4ACZB 1CXHA 1D2KA 2VJXA 3AHYA 1MFUA 1GHSA 1H5VA 4H2CA 5HPOA 1KXQA 2XVKA 4WIWA 3TTOA 2YKKA 2WKGA 3KL3A 1M03A 3WF4A 3TTQA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2NT0 A;  1GVY A;  2IXV A;  1SMD A;  5HOS A;  4MAD A;  4EKJ A;  1E71 M;  4P7R A;  1GOO A;  4JFU A;  4BQ5 A;  1BG4 A;  1R85 A;  3MS8 A;  3MUA A;  4LXF A;  4CD8 A;  4MPK A;  4AIU A;  3J7H A;  3TA9 A;  5A1A A;  3AOF A;  4KGL A;  1E1F A;  1HF6 A;  4ML4 A;  2J77 A;  2EQD A;  1GOM A;  1ISX A;  3CHD A;  3KEH A;  5A6K A;  3SCS A;  3WQV A;  2TAA A;  4HA4 A;  2DEP A;  2YA0 A;  3OGV A;  1E4N A;  1G0C A;  2WNW A;  3FY1 A;  4U31 A;  1NM9 A;  4W84 A;  1E0X A;  4PMV A;  3AXI A;  2WK2 A;  3GXI A;  1GCY A;  4MB1 A;  1ZS2 A;  1XHG A;  1CTN A;  1MQP A;  4FLR A;  2BXZ A;  1VIW A;  1C90 A;  4D6I A;  4P8W A;  2CHN A;  1FA2 A;  1VB9 A;  1XYZ A;  1IZJ A;  4PTX A;  1W3L A;  3VUP A;  1MW0 A;  1FFR A;  2W62 A;  2ZUU A;  1ZBK A;  3ZT6 A;  4AEE A;  3AZT A;  3UET A;  3A3H A;  1XRV A;  5A2A A;  2WHJ A;  5M17 A;  4JFT A;  2BY3 A;  3CLW A;  1VBU A;  2DH3 A;  5LA2 A;  3TON A;  5CQ1 A;  1MXD A;  1ECE A;  1QHZ A;  3POH A;  1B3Y A;  2C7F A;  3FAW A;  1LF1 A;  5AC5 A;  1E4M M;  2XVL A;  3ARW A;  2W61 A;  4XB3 A;  2DH2 A;  2WMJ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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