4F66A

The crystal structure of 6-phospho-beta-glucosidase from streptococcus mutans ua159 in complex with beta-d-glucose-6-phosphate.
Total Genus 186
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
186
sequence length
478
structure length
478
Chain Sequence
AMSKLPENFLWGGAVAAHQLEGGWQEGGKGISVADVMTAGRHGVAREITAGVLEGKYYPNHEAIDFYHHYKEDVKLFAEMGFKCFRTSIAWTRIFPKGDEAEPNEAGLQFYDDLFDECLKYGIEPVVTLSHFELPYHLVTEYGGFTNRKVIDFFVHFAEVCFRRYKDKVKYWMTFNEINNQANYQEDFAPFTNSGIVYKEGDDREAIMYQAAHYELVASARAVKIGHAINPNLNIGCMVAMCPIYPATCNPKDILMAQKAMQKRYYFADVHVHGFYPEHIFKYWERKAIKVDFTERDKKDLFEGTVDYIGFSYYMSFVIDAHRENNPYYDYLETEDLVKNPYVKASDWDWQIDPQGLRYALNWFTDMYHLPLFIVENGFGAIDQVEADGMVHDDYRIDYLGAHIKEMIKAVDEDGVELMGYTPWGCIDLVSAGTGEMRKRYGFIYVDKDDEGKGTLKRSPKLSFNWYKEVIASNGDDI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title GH1-family 6-P-beta-glucosidases from human microbiome lactic acid bacteria.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative phospho-beta-glucosidase
molecule tags Hydrolase
source organism Streptococcus mutans
total genus 186
structure length 478
sequence length 478
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.86: 6-phospho-beta-glucosidase.
pdb deposition date 2012-05-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4f66A00
3KL3A 1B31A 1UWIA 5E0FA 4BCEA 2X1IA 1CLXA 1BTCA 3LPGA 1WP6A 2BVTA 1XCXA 1O7AA 2BHUA 1US3A 3NDYA 3VTRA 2W62A 2G41A 4PMQA 1XYZA 4JFTA 4JKKA 1I1WA 5EFFA 4L4PA 4A4AA 1C8XA 2XSBA 4W88A 1W3LA 4BA0A 4PCSA 4HU8A 4D6CA 1W9UA 5BCAA 1B3WA 3U57A 2BVDA 3WDQA 1GVYA 1UWSA 1M04A 3EMQA 5CZKA 3WQ5A 2G4FA 5IHRA 2VQUA 5JUVA 4KRUA 3T09A 3SCPA 5A6JA 1PX3A 3ZQ9A 5D9NA 2GFTA 1C7TA 1J0YA 1TG7A 2DPEA 2Y8KA 4UCFA 1Q6CA 2WK2A 4ATWA 5DT5A 2FGLA 4MAVA 4N0RA 1FP9A 5A95A 3CGTA 1NWRA 3M07A 4HZ7A 1QNRA 2DSVA 2WHLA 3L4WA 2DT0A 3SCQA 1GPFA 7CGTA 4TTGA 1JGIA 1UR4A 1V3KA 1U2YA 2VTFA 3AIEA 4W5ZA 1UUQA 3PZUA 4U3AA 4GO9A 4HA3A 1Q6GA 3BMWA 4OKDA 2DSWA 3AISA 2ZXQA 3FXYA 1RD6A 3ZO9A 1GQIA 1OCQA 4GZIA 4P7NA 2WHKA 5DEZA 5D9OA 4ZXLA 1F4HA 5LA1A 2C0HA 5LA2A 4TVUA 1RH9A 2EPNA 3VIIA 1OB0A 1GOQA 1BVZA 4CD5A 3IJ8A 2XPKA 3CUFA 5CGTA 3AI0A 4QCFA 1B3YA 3ARZA 1C8QA 4TVCA 3WNMA 1PZ2A 1GQLA 4R27A 1PIFA 3MO4A 3GBEA 3CTTA 1NP0A 4AEFA 1JD7A 1RP9A 1E70M 3BC9A 3AZRA 4Q7NA 5HNNA 1RP8A 3WUEA 2F61A 2V5CA 1MFUA 1VEMA 4H2CA 3CHCA 3DHUA 2A3AA 1KGXA 2W67A 1GJUA 2D3LA 3CZEA 5DO8A 2ZUWA 1LJYA 1V0LA 1ODUA 1W1TA 3WL0A 1R7AA 3WUBA 1EHAA 4J28A 4CD8A 4IPLA 1WDRA 3L4TA 2QPSA 4DM2A 2VI0A 1B2YA 2D3NA 2VCCA 1LWJA 2VZOA 3WF4A 4JKMA 3KE0A 3CMJA 1PAMA 1E9LA 1JZ6A 1OINA 2TAAA 3N17A 4MNJA 1V6VA 2EPMX 3K4DA 3I3EA 1WO2A 4H41A 1B3XA 3ZMRA 1GJWA 4MNLA 1UQYA 3VIHA 1W3KA 1KR1A 3GH4A 5JIPA 3VO0A 1EDQA 2J62A 1G9HA 3WIJA 1E6QM 4UNIA 1AQ0A 1ISZA 2WZHA 5I24A 5ABEA 3CZJA 1ZJBA 5ABGA 2CHNA 3CZLA 1UD3A 1DWAM 4QLLA 3AHXA 3MKKA 4TX6A 3UERA 3OLEA 4OUEA 1C3FA 2J7CA 1G1YA 2YBUA 1LL6A 2OYLA 2UWFA 4RE4A 3BAYA 4Z2IA 1E6ZA 1MQPA 3MMWA 2BHZA 4PMVA 2ZUTA 2V5DA 1UHVA 3WF1A 1CNVA 4R5EA 2WHJA 3L2LA 2BY2A 3S6TA 3ARWA 5I78A 2YL9A 4QLKA 4D71A 1ZU8A 1VFFA 4E8DA 2GSJA 3B9EA 2D1ZA 1KB3A 1W1YA 3AMGA 3IAQA 3ZSTA 1V03A 4V27A 1SR0A 1BSIA 2OWXA 2FGZA 3O9NA 4J3SA 1UA3A 4JIEA 1X1NA 1HT6A 1BHGA 3VD9A 3HMCA 5DF0A 3ALGA 5BWFA 3LPPA 1B3VA 3W53A 3ZSSA 4TVDA 4X0VA 1VFMA 2WMFA 2XWDA 3BXWA 5FL0A 2PBGA 1VEPA 3BAIA 5A1AA 1HKJA 3RPMA 4WKHA 1JIBA 4MDPA 3AMLA 2VO5A 3WEZA 4M81A 1ZL1A 4D6IA 3ZJ7A 1UOKA 3PTKA 2YKKA 1W32A 2VZTA 3GXMA 5AYIA 5FCZA 2D0HA 3NIYA 4LXFA 4RE2A 4CVWA 3I3DA 1KXHA 3AZSA 5CJ5A 4MB1A 3AHTA 4U2YA 1JNDA 1EH9A 1JDCA 1OIFA 1RPKA 4DM1A 2PBOA 1EOMA 2J77A 1KGUA 3ZR6A 2DGAA 4CU8A 5FL1A 1JF6A 2OSWA 1CGYA 1ISXA 2NT0A 5TD4A 3QGVA 2F8QA 5DFAA 3SCVA 3PZ9A 3SUTA 2UY5A 1WAWA 1E3XA 2YBTA 4WKFA 3WD1A 1V3LA 1J9YA 3AFBA 5EFDA 4AISA 3WD4A 2XTKA 3LPFA 4MJ4A 1QI2A 2ZX9A 4WF7A 1PX8A 3W28A 3VD7A 2XVGA 3SCUA 3A4WA 4J7RA 2VX5A 1VRXA 2XGBA 4HA1A 2V38A 3WD0A 3ZJKA 2AOSA 2JF6A 5KEZA 5BXRA 4JCMA 2IXUA 3TTYA 3TTQA 4AZ6A 4FMVA 3GDBA 1W9DM 1V08A 1DTUA 2ZXDA 4ZXOA 4LX4A 3ZT6A 1EOKA 2XJ7A 3UR8A 1V6YA 3AMKA 1C90A 2X0YA 3CUIA 2A3CA 3IANA 4HMDA 1CXFA 1LQ0A 1WDPA 3UCQA 3VD3A 4ZE4A 3OGRA 1JYVA 4MB4A 3ALFA 4PMOA 4D6GA 1CGTA 3SUSA 2WVTA 5AY7A 1B30A 1YQ2A 3T2OA 1UKTA 2PWHA 3WUGA 1ZB5A 4AD2A 1GZJA 2J4GA 1GQJA 5HPOA 1EA9C 3WDIA 3GM8A 1QHPA 3GZAA 3DHPA 1WDSA 4X0NA 3TONA 2XYLA 3VNYA 1D7FA 1J12A 1EQCA 4CUCA 3KL5A 3ECQA 1AMYA 1DWHM 3RJXA 4AXNA 1J0IA 1E5JA 2PWFA 1JZ4A 4JL1A 2WVVA 4FF5A 1TVNA 1VBUA 2EBNA 1OGGA 2D20A 1UR8A 1K6AA 1QNSA 3CLWA 2O9RA 3N13A 4CGTA 5AYBA 5C8BB 2WHMA 1XCWA 3VPLA 5IDIA 2XVLA 4W7VA 3VIPA 5A8MA 4A3YA 4D1JA 3IAPA 3UETA 4J3UA 3CUGA 3BCFA 4UQDA 3CPUA 2CEQA 3IJ7A 3WEMA 4AD3A 5GQBA 3WD2A 2O9TA 3WQ6A 3KZSA 3SEPA 3ZOAA 1CBGA 1XH1A 4ATDA 1H11A 4MDOA 3N12A 4IUGA 5BRPA 1E73M 4PMZA 3DYMA 4C7GA 3MUAA 1QBAA 3MANA 4JKLA 1NWSA 1H0GA 3QR3A 3K8LA 3NSMA 5BYWA 1E1EA 1E0VA 5BXTA 1ZS2A 1HL8A 1LL7A 4HOWA 4PUEA 2XHYA 4XUYA 4KGJA 1ISVA 4WSJA 4CD7A 2Y4SA 4JZ5A 1E55A 4AZBA 3GXFA 4CD4A 2V3FA 4WSKA 5D8WA 1HIZA 2WW5A 4U33A 1FH9A 1KCKA 3AXXA 1LLOA 2O92A 1CGVA 3BAWA 3GNRA 4W85A 3MUZ1 2FH6A 2DQXA 2WXDM 2RGLA 3OB8A 4JHOA 1K9DA 2WLYA 1MQRA 2XVKA 2BXYA 4AD1A 2YDRA 3WDPP 1EGZA 9CGTA 3K46A 4AD0A 3GXDA 1KR0A 4V28A 4D6EA 4Z2JA 1M01A 1XGZA 3WH8A 1G01A 2CBJA 2E40A 4B9ZA 4IM4A 4FLQA 4MPKA 3DC0A 2WVVB 1JZ5A 4KRTA 1FA2A 3SCNA 1OGBA 3BLPX 3A6OA 2QV4A 4S3JA 2W91A 1V02E 5I2UA 1QHZA 3OIHA 1JFXA 2XSAA 2GVYA 3CUHA 2J7DA 3F5JA 4AD4A 5CPTA 3RM4A 3AS1A 1LG2A 1E4NA 3ARQA 3BMVA 2DT3A 2WYSA 2GJRA 3WH9A 3VDAA 4PYSA 1CTNA 1JAKA 1V6XA 4PMYA 5IXEA 4YHEA 5BXPA 4HZ8A 1UZ4A 1VF8A 3EDEA 4CCDA 4URIA 3ZJ8A 2E9LA 1UD5A 1QBBA 5EMYA 5CG0A 4HP5A 2GDUA 5E9AA 4E8CA 4QDMA 3VINA 1JG9A 3VIKA 3VD5A 2CKSA 3WNLA 1I1XA 4CN4A 4CU7A 3WH5A 1K9TA 1QNOA 2J25A 2WWCA 1UR1A 3PZNA 4PSRA 3RJYA 1OT1A 1NQ6A 4XZWA 3RMEA 4FLRA 2WC7A 2D2OA 3I3BA 3W27A 1ITCA 2W63A 1OWQA 5JBDA 1DHKA 1GUVA 2E3ZA 2GJXA 3AYRA 3TP4A 5AC4A 1Q6FA 2E0PA 1H0IA 3AZTA 4HTYA 1JXJA 4P8UA 1E3ZA 2G3NA 1E4MM 2CESA 4PMUA 1W91A 1R85A 1UD8A 3L2MA 5M3WA 1B1YA 3NJ3A 4EAMA 4ZENA 1CLVA 1XSIA 3T0AA 2ZXBA 3VGBA 1VB9A 3CHDA 2J75A 4Q22A 4BF7A 5I0DA 1J0ZA 2J79A 3DYOA 1ZJAA 3FNDA 1NP2A 3ARVA 1BYCA 3B8SA 4AEEA 1CENA 1AQHA 3PZOA 3CZGA 5A6BA 4BQ4A 3VX1A 3N15A 1LWHA 4M24A 1JFHA 2XVNA 5GNXA 1H09A 3BSGA 2G8ZA 2ZUVA 3UG5A 1J18A 1DEDA 3WF0A 4XV0A 3LMYA 4BQ3A 1IV8A 4ACYA 2UY3A 7TAAA 3RM9A 3G6LA 5GPRA 1J10A 2ZIDA 1DWJM 4ZFMA 4BZYA 1C8YA 1MXDA 1VJZA 3W37A 2YIHA 4D1IA 2OSXA 1UR9A 1BPLB 4UFMA 3T2QA 5A3HA 1VBRA 1L0PA 3DECA 4Z2HA 3VM5A 1BG9A 3EDDA 1EHNA 2VRKA 3MUIA 3OLIA 5E09A 3GYCA 1QI0A 3WKZA 3WBAA 1VEOA 3VILA 4QCEA 1NOUA 3ZJ6A 5A8OA 1PX4A 2G3JA 2WMJA 1H41A 1HP5A 1GVIA 3MU7A 2W5FA 3W24A 5M5DA 3VGFA 1E72M 5CSYA 1HJXA 4UZSA 2CIPA 2BS9A 2GJXB 1GOKA 2J78A 1TR1A 2W92A 3BCDA 1UQZA 4XZBA 4DUXA 3AIVA 2ZWZA 4MAZA 4PMDA 2EPLX 3F5KA 1XHGA 4OBRA 2ZOXA 3VVGA 1ECEA 5KZ6A 1E4LA 1E56A 4Y7EA 3NSXA 1BFNA 1KCLA 4QP0A 2VOTA 3MSGA 4OOZA 5EBAA 2E8ZA 1US2A 3AQUA 1FP8A 1CXHA 4KH2A 4EK7A 2C7FA 3WQ8A 3THDA 4UQCA 1QW9A 2X0HA 3N18A 3FHQA 1NOWA 2VC9A 1U33A 4WLCA 4YN5A 1EO7A 2BHYA 4E2OA 3A4AA 5JBEA 3FW6A 3MUY1 3HJEA 3POCA 3W4RA 2YA1A 1CXLA 1W2PA 1HXJA 3ARXA 1GOWA 3WD3A 4AZCA 1FHLA 2E9BA 5HOSA 3AHVA 4W8LA 1V02A 3BAJA 3PN8A 1B90A 4J3XA 4GINA 3EDJA 5E6ZA 3WH7A 3E1F1 3WMSA 4NF7A 4K68A 3WFLA 1SFSA 1JZ3A 5ECUA 4NZCA 2ZWYA 1V3JA 4AZHA 3WELA 2XFRA 3BAKA 1PZ3A 3VU2A 4HOXA 1HKKA 1DWFM 3CIVA 1CEOA 3CZKA 3WQWA 3AJ7A 5A94A 4EANA 2ZXAA 2A3HA 1Q6DA 5HDRA 2EEXA 5HPCA 2ZX7A 3PZTA 2QMKA 1C93A 3K4AA 3GNPA 4UQAA 2JFEX 3OA5A 2OSYA 3UR7A 4ACZA 2ZX5A 4LGXA 4UTFA 1KBBA 1E6SM 2AMGA 3IK2A 2XIBA 4UOZA 2VR4A 5M17A 1E43A 3PZMA 3SURA 3EMZA 2JEQA 3T0DA 3WF3A 2WANA 3OGSA 3L4YA 4UFKA 3UG3A 3WUFA 4TX8A 5GNYA 1Z32X 4JAWA 4PTMA 3T08A 4OIFA 2Y8VA 3J7HA 1KQYA 4KGLA 2VX6A 1J01A 1CYGA 1NWUA 4IPNB 1D2KA 2J7HA 1ZBVA 1TZ7A 1OT2A 1JL8A 4DWSA 3VIOA 1PPIA 5D4YA 1ITXA 5D9PA 4J3TA 2D24A 4ZE5A 1V0MA 1EO5A 5A6AA 1Q4NX 4JHZA 2B31A 4OBSA 2DSZA 3PTMA 2ZE0A 3W81A 1E6RA 3ZR5A 4PCTA 4CCEA 3OGVA 2V3DA 4W7WA 1IZKA 3VM7A 5F7UA 3A3HA 1UR2A 2UY4A 4M8UA 4AZCB 4MTVA 4UQBA 2Y2WA 3PBGA 1UKSA 1WCGA 2YDQA 3BGAA 1JI1A 2V3EA 1H3GA 2GJPA 3NSNA 4U2ZA 2PWEA 4AIOA 1KXVA 4AW7A 1IT0A 1E6XM 3FHAA 3OG2A 2J7EA 3PTQA 4CKQA 3HU7A 4KMQA 1WNOA 1HJQA 3SIMA 1BYAA 3KEHA 1ODZA 2BVYA 5A2CA 4OJYA 1HF6A 1V3HA 5HXMA 5A6SA 4MB3A 3BSHA 4D6DA 2WB5A 2C8NA 4XX6A 4ACZB 2O9PA 2CCRA 1EIBA 2XUCA 2WCAA 5I77A 4GI9A 3WN6A 2VL4A 4F79A 1Q6EA 4UZUA 3WBEA 1V6UA 4H7VA 5FOOA 2WC3A 1B0IA 5A2BA 4PEEA 6A3HA 3WMBA 1NH6A 1NWTA 2WVSA 4MNMA 1PJ9A 3W82A 3QHNA 1OM0A 1U30A 2YA0A 2WBGA 2YL5A 1G0CA 2JE8A 1HNYA 1TA3A 2F2HA 1WDQA 1KBKA 4DWSB 2YL8A 5D8ZA 4J3VA 4L4OA 1HVXA 2XM1A 1EXPA 1WZLA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3KL3 A;  1B31 A;  1UWI A;  5E0F A;  4BCE A;  2X1I A;  1CLX A;  1BTC A;  3LPG A;  1WP6 A;  2BVT A;  1XCX A;  1O7A A;  2BHU A;  1US3 A;  3NDY A;  3VTR A;  2W62 A;  2G41 A;  4PMQ A;  1XYZ A;  4JFT A;  4JKK A;  1I1W A;  5EFF A;  4L4P A;  4A4A A;  1C8X A;  2XSB A;  4W88 A;  1W3L A;  4BA0 A;  4PCS A;  4HU8 A;  4D6C A;  1W9U A;  5BCA A;  1B3W A;  3U57 A;  2BVD A;  3WDQ A;  1GVY A;  1UWS A;  1M04 A;  3EMQ A;  5CZK A;  3WQ5 A;  2G4F A;  5IHR A;  2VQU A;  5JUV A;  4KRU A;  3T09 A;  3SCP A;  5A6J A;  1PX3 A;  3ZQ9 A;  5D9N A;  2GFT A;  1C7T A;  1J0Y A;  1TG7 A;  2DPE A;  2Y8K A;  4UCF A;  1Q6C A;  2WK2 A;  4ATW A;  5DT5 A;  2FGL A;  4MAV A;  4N0R A;  1FP9 A;  5A95 A;  3CGT A;  1NWR A;  3M07 A;  4HZ7 A;  1QNR A;  2DSV A;  2WHL A;  3L4W A;  2DT0 A;  3SCQ A;  1GPF A;  7CGT A;  4TTG A;  1JGI A;  1UR4 A;  1V3K A;  1U2Y A;  2VTF A;  3AIE A;  4W5Z A;  1UUQ A;  3PZU A;  4U3A A;  4GO9 A;  4HA3 A;  1Q6G A;  3BMW A;  4OKD A;  2DSW A;  3AIS A;  2ZXQ A;  3FXY A;  1RD6 A;  3ZO9 A;  1GQI A;  1OCQ A;  4GZI A;  4P7N A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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