4N9BA

Fragment-based design of 3-aminopyridine-derived amides as potent inhibitors of human nicotinamide phosphoribosyltransferase (nampt)
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
479
structure length
469
Chain Sequence
EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Fragment-based design of 3-aminopyridine-derived amides as potent inhibitors of human nicotinamide phosphoribosyltransferase (NAMPT).
pubmed doi rcsb
molecule keywords Nicotinamide phosphoribosyltransferase
total genus 163
structure length 469
sequence length 479
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2013-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04095 NAPRTase Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A PF18127 DUF5598 Domain of unknown function (DUF5598)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4n9bA02
3FEMA 2CLMA 4MY9A 2H3DA 4NU7A 4Z0JA 1EWDA 3I7SA 3W7EA 3S42A 2B7QA 4UFMA 2R94A 1VH7A 5D33A 4X22A 1YTKA 3PVFA 1KFCA 1R30A 1ZNNA 4IMCA 1GYLA 2E6DA 1OYCA 2VFHA 4AXKA 5EKYA 2CZ5A 1VYSX 4N9EA 4I7WA 1IIHA 3A21A 1I2NA 2CLHA 5F1UA 4WXYA 1GZGA 3W2UA 3VI2A 3PWAA 2A2IA 1RZMA 2Q3OA 4PL2A 4UTTC 5HNRA 5U7SA 3C6CA 4IPIA 1XBZA 3DFSA 4RZ6A 2PCQA 5AHFA 3HOJA 2VELA 1V5XA 4JYEA 3TJLA 2QDGA 4HN4A 1J4EA 5DN1A 2F7FA 2Z1BA 1OFRA 1W1ZA 3EX2A 4Z08A 3UPWA 3DBPA 2OCZA 5DCDA 3CPRA 3BW4A 3HG2A 1OG0A 1FCBA 3TIMA 2FDSA 1R2RA 4GUHA 2BXVA 1X1OA 4IMEA 3S9YA 1SU5A 1SW3A 5I3FA 2G96A 5IBXC 5LSMA 1SZGA 3DXIA 4FX6M 1NF7A 3QQ0A 1SW7A 4AHPA 3THAA 2XN0A 4JTJA 2Y7DA 1LOSA 4X3ZA 3UPBA 3TFCA 2JKPA 2VENA 1KM1A 5FF3A 2CWNA 1KA9F 2NX3A 2JKEA 4ORMA 3NQ7A 3LM7A 3M47A 4OV4A 4B5NA 4N6FA 4NT0A 1MEWA 3W07A 3W1RA 5D32A 3LXBA 2GQAA 5HULA 3GNNA 4AWUA 4X9SA 4U4MA 1K7EA 3EXTA 2GQ9A 4UFIA 2A5HA 3L9CA 2ISWA 5LHEA 1DQWA 5F2MA 5H91A 1ADOA 2WPBA 4O1DA 4NJHA 2YGYA 4Y6GA 4QSHA 2ZRYA 1OX4B 2NUXA 2A85A 3DFTA 3UY7A 2DZSA 1WYIA 2BX7A 1DBTA 4R33A 3W1XA 3M41A 3PUDA 4TMCA 1LRTA 1W3IA 1LLZA 3DKJA 3P82A 4L4LA 2QCGA 3W1TA 1S5VA 1SFJA 2NXGA 2Y88A 2YX0A 3DZ1A 3IVSA 3TU9A 1A5SA 4CLMA 4ONVA 2YZRA 3HGJA 3CIXA 1GEQA 4FIQA 2B7OA 2ZZ4A 1WBHA 4O1AA 4ICNA 1OF6A 3LDVA 1ZJIA 1P0KA 5D30A 2CLKA 3BGGA 3B06A 4BFAA 2NXIA 1MEIA 1H7XA 2QUUA 3TK7A 3CWOX 3IIXA 1N8FA 2D73A 1OX6A 3FOKA 3W2NA 5K4XA 5G4WA 3W84A 3QC3A 3GZ3A 4GRSA 2Y7EA 1W5NA 3SSJA 3NQAA 4MJMA 5LNUA 5BNKA 1SO3A 4DF0A 5KZDA 4M5PA 3OBKA 4UTJA 4YL2A 1KFEA 1H50A 3SZ8A 3TAKA 4LVDA 2ZDRA 3WJYA 2A4AA 2ZZ6A 3UWYA 3W75A 1TQJA 4ZQNA 2ZBTA 5J5DA 1BEUA 3S1XA 1FWRA 3LHTA 3G3MA 4CQ9A 4ZQOA 1EWEA 3EEGA 1SO6A 3E49A 1RR2A 2X30A 3KVKA 3T4CA 4C1LA 5DLCA 4FB7A 4ZQRA 4MUZA 3F03K 3G3DA 4PH6A 1LOQA 4Y8FA 4FNUA 3WFAA 2E6AA 3QMSA 4R53A 3LTSA 4JTHA 4WOZA 1QDSA 4FXRA 1GG0A 5D38A 2ISVA 4PCFA 3W2LA 1PVNA 1TPUA 4LVBA 3LLDA 3HPXA 3NVTA 1F5ZA 4GXMA 1AK5A 2ZRZA 2CU0A 2C14A 3BLEA 5CSSA 3STGA 1TPEA 4PEKA 3TNOA 1WA3A 2CZDA 3GVGA 3PY2A 3OVRA 1QOPA 2YFOA 3LI0A 3NM1A 4MLRA 3STCA 1OFBA 1KM3A 2ZA2A 1L9WA 1XL9A 5BRBA 3TAOA 3LOTA 1H7WA 3L68A 5AHMA 5EYWA 2QKFA 3VE9A 2ABBA 2NUWA 1NAL1 2DJXA 4AH7A 4GUJA 4S2CA 1LLWA 4JIQA 4IGHA 4FF7A 4EOUA 4K7YA 1YPFA 1DQXA 5F2IA 3PG9A 5I3GA 3KHJA 5AYYA 3DH7A 2CLIA 1MEHA 1B3OA 3EWUA 2CLFA 2OX1A 4O12A 1RQHA 1PHWA 5IM51 4DXVA 3ANYA 3FKKA 3L5MA 2B0MA 3V1PA 4KFNA 1AMKA 1VRDA 3LX9A 3LRKA 4O53A 2QJGA 4IMFA 2E6FA 1KTCA 4N9CA 4A22A 4HSOA 1O60A 1TPDA 2HS8A 2IQTA 4KKXA 2O7SA 3TXVA 4JNMA 4DPQA 3W7OA 5BOOA 1ZALA 1EP3A 3RK8A 1ME8A 3UWQA 3FFSA 4RV8A 2DZWA 1NEYA 2WQPA 3QFEA 3DFPA 3GR8A 3UWZA 4E2DA 3KVMA 1UJPA 3BPWA 3G1HA 3NQCA 3CB8A 3QMRA 1R46A 3FJLA 4FXSA 2BZNA 3LERA 3FJ6A 5E93A 1KBJA 5CZJA 5BMWA 3R5EA 3DU0A 1IXPA 5CPOA 1H63A 1TQXA 3TROA 5LNVA 1FX6A 1VC4A 4ML9A 3O06A 2QJHA 1XDMA 4NJGA 3NPXA 3ZFHA 1O94A 3F4WA 4JX4A 3TQVA 1TYGA 2TYSA 4IXXA 2E5DA 3TC7A 2X1UA 1GOXA 1A5CA 1FDZA 2R8WA 1THFD 1AG1O 4DPPA 2EPHA 1QPOA 3PSVA 5F4XA 2ZRXA 2FFCA 1JQVA 4GC4A 3CTLA 1ONRA 4WY0B 5HMSA 3S1UA 2YPIA 3S8HA 2VEMA 2G5WA 1PV8A 2RDUA 4O1BA 3GDTA 1S5WA 4M6QA 2CFFA 5KTLA 4QNWA 3DI1A 3RNDA 1H7RA 3PB2A 5AC8A 2Z6JA 4RZ5A 3JRKA 2RKXA 1L6SA 3N73A 1GTEA 2VC6A 2V2DA 1AW2A 1YTEA 4JTFA 3ABQA 4N4QA 3IGUA 2FTPA 1EIXA 5CZSA 4WOQA 3TQ0A 1K8YA 2FB3A 3T78A 4XBKA 3WK3A 3G22A 5CG7A 4DO4A 5HWJA 1A50A 1F73A 3P5ZA 4BWLA 3E12A 2X1TA 4AMAA 3M9YA 1C29A 3STEA 4E0CA 1OFOA 4JTTA 3NO5A 3P80A 2B7NA 3GDLA 5I3JA 4K6AA 3P67A 2JKAA 2RDTA 4ADTA 2Z6IA 4RCXA 3ATZA 3MP4A 1KV8A 3O6DA 3NL3A 3NL5A 1X6UA 3VNDA 1B4KA 3PSWA 5D37A 3IGSA 4IX0A 4PA8A 2EAWA 3CWNA 2J27A 3DENA 2CLOA 2E1DA 4HPXA 1VCGA 2V81A 4XQ6A 5I3KA 3KRSA 5FEWA 2YXGA 1JCNA 4O8RA 4O13A 3W7JA 3EXSA 4BI5A 1GTHA 4ADUA 1D9EA 3S5OA 5MHBA 1I2RA 1JULA 3NQ8A 4LVFA 2NX9A 1I2OA 3BV4A 2PRHA 1IXOA 1TPVA 2YYUA 4TIMA 3N2MA 1UB3A 4A2RA 3S1VA 1TTJA 2P0OA 6TIMA 2YCEA 2I14A 2WOQA 4PC8A 1Y0EA 3YPIA 2B4GA 4IJBA 1Q6OA 3N9RA 2QCMA 4CNPA 4OBTA 4UNKA 4Z0SA 1RD5A 5G5IA 4LRSA 2FPTA 3F4NA 4JGDA 4XKYB 2VFIA 2GUUA 3NQGA 3Q2DA 1SO5A 1LYXA 2YDAA 4A29A 4MFDA 2ZYFA 3TV8A 2RH9A 4UFLA 2Y70A 5BW6A 1SZEA 4JXCA 1TIMA 4NZJA 1UBSA 1K8XA 1UASA 1HL2A 3B0VC 1HFBA 3G1YA 5FF4A 1TREA 3M5XA 1B57A 3EWWA 4UTWA 5CKSA 5D2YA 2EKCA 2Y85A 2A7RA 1W5PA 1W3NA 1ZAIA 4NJKA 1SFLA 1WOBA 4JTIA 5G1TA 5HWMA 4JTKA 3PG8A 1X8FA 3MMTA 5K9DA 3O16A 1CW2A 2KZHA 3LCIA 2BTMA 4K37A 5D05A 1XM3A 3WK1A 3BW3A 1BWLA 5LKYA 1IGSA 5K7JA 3TC6A 1ML1A 3PM6A 2QCFA 4WD0A 3HGRA 1YYAA 1H1ZA 5F2LA 3O1NA 1G4TA 2QUVA 1BTMA 3NQ6A 4CNOA 2VXNA 3F1QA 3LCHA 4GNJA 2J9XA 3G0SA 3LBCA 1SSDA 3NR0A 3CU2A 1G6CA 4Q32A 3W85A 3A9IA 1DKWA 2C3ZA 5J5RA 4Y90A 4FNPA 5AHLA 3GAYA 2O7QA 5AYZA 4OWGA 1VGAA 1TTIA 3N9SA 5TIMA 1WAUA 1QPRA 4UMCA 2NX1A 1P0NA 1LOLA 1EPXA 3FKRA 3UD6A 2ZZ2A 4FIRA 3C2VA 4CCEA 2C18A 1W0MA 2PC4A 4J9JA 4FO4A 1TB3A 1TV5A 3T40A 3NAVA 1GVRA 4WX2A 2YR1A 3R13A 1TPFA 3GB6A 2B7PA 2E5CA 1I8JA 3UWWA 2PRLA 1IIGA 2GJLA 2ZCGA 3O15A 5C5YA 5C6MA 3KRUA 1F74A 3W7NA 2BLEA 4EF8A 3EB2A 4O15A 1TJPA 2ZTKA 2VOMA 4IPJA 3NPWA 2XN2A 1PCWA 1KTNA 1O5XA 3W1LA 1XKYA 3TR2A 3NG3A 2E77A 3NQMA 5D2VA 1GWJA 2LLEA 1FXQA 2P1FA 3N19B 2WO5A 2EF9A 3INPA 3TMQA 3BG3A 4M19A 2PURA 8TIMA 5KITA 3QPYA 3MHGA 4ALDA 2QCCA 1YPIA 4NQ1A 3T55A 1XBXA 1G4PA 2QJIA 4O52A 1SQ7A 5DCEA 3IIOA 2TPSA 4LU0A 3ZS4A 3G8EA 1TV8A 1VCVA 3E9AA 4PODA 2QCEA 3W7DA 4P2VA 3S5NA 2A6NA 3G24A 1JQXA 5ABTA 3NDOA 1QO5A 1HG3A 5D09A 4NUWA 3NM3A 1ME9A 4BK9A 5FF2A 3FIGA 3O05A 2J88A 3GXNA 3O8AA 3O63A 3C4UA 3LRLA 1Z41A 4JN6A 1W37A 3GDRA 1OJXA 4TR9A 1D3HA 1PHQA 3EKLA 5F4WA 1XFBA 3Q94A 1KBIA 1GVFA 4O17A 2VKZG 3N34A 1I2QA 5G4EA 1JCJA 1ZFJA 5K3VA 2OZ0A 4OHQA 1G4SA 1OABA 3NYZA 4NNCA 3NEVA 4D2JA 4FX8A 4LVAA 3TSDA 3CLMA 3LBMA 5D2WA 1QR7A 1R2SA 5AHNA 1MSSA 4UR7A 5AFDA 5G2HA 1O5KA 6ALDA 1JRCA 3VKJA 4QM1A 1YDOA 3M0ZA 3ATYA 4WY0A 4I7VA 1TCDA 3VFLA 2NWRA 1TJRA 1H51A 2QAFA 5DXYA 4MVAA 3W7MA 1KM6A 4Z1BA 3LTYA 3K30A 1KLYA 3GLCA 3BK0A 1KFKA 4Z1CA 3C52A 1CX9A 3MHFA 5KZMA 4ZQMA 3OHIA 3L5LA 5E0KA 2ZA3A 1KM0A 3GKFA 1FCQA 1QCWA 4A3UA 1SZFA 1YDNA 4DF2A 5CGQA 2ZTJA 5TQLA 4NX0A 1FDYA 4TMBA 2DORA 5D02A 4UTMA 4QITA 4X2RA 5U4NA 1FUYA 4MYAA 1ICSA 4JDYA 3TA6A 3EX6A 1DHPA 1W5MA 3E0IA 3S1WA 3C2FA 4IMDA 2J9YA 1TPC1 4QISA 2XN1A 4O19A 3GKAA 1BWKA 5LNRA 1G7VA 3UZJA 5DY3A 3DI0A 4N02A 5EY5A 3LGEA 3NNTA 4QJ1A 3KVJA 3GIYA 1JCYA 1SPQA 2VFFA 1TO3A 3L0KA 3FA5A 2CZEA 4XWUA 3RFAA 1W5OA 1QAPA 4O0ZA 3P7YA 2QUTA 1MZHA 1WQ5A 3A24A 2FQIA 3QMTA 3QZEA 3BVJA 1LCOA 3DKLA 1HTIA 2OMAA 2J9ZA 4MZ8A 2YSWA 3TKFA 4JTEA 5K9CA 4UFHA 5CPNA 1LP6A 3JS3A 1X1ZA 2X1SA 4LUIA 1SO4A 1OYBA 2VEKA 3W7LA 4LW7A 3E96A 1ZHAA 4OE7A 1F2JA 1C8VA 1J2WA 3HGOA 1Q6RA 2BSLA 5FEPA 3N3MA 5DCBA 3PF3A 4LS2A 1UUMA 3EKZA 3EWXA 4MJZA 3FYOA 3BLIA 4LC6A 2DZTA 3T7VA 1B4EA 2W6RA 4XKYA 4LC8A 1P1XA 3HIJA 4Y9AA 2A0NA 3U2OA 1QPQA 3H54A 2DJLA 4JTSA 3W23A 1AW5A 3UQNA 2V5BA 3Q58A 3C61A 3LXAA 4RJEA 3NL6A 1WV2A 4LY8A 3NQ2A 1KV5A 1TPB1 2E68A 4RXGA 4GFSA 3R89A 1VZWA 5FF7A 3WK2A 4AEOA 5HWNA 5HR6A 3NQDA 2QCLA 5K2ZA 4I7UA 1ZENA 3MI6A 4MY1A 4JEQA 3GXPA 3PAJA 4QNEA 1QOQA 3E02A 3EWZA 2JGQA 4FNQA 4EIVA 1MO0A 1GVSA 3B4UA 2A7NA 2WNQA 2QCHA 2V2CA 1YXDA 3DHFA 3OVQA 4FNTA 3TDFA 1TRIA 3WJZA 3EX3A 1IXNA 1ZY9A 1B9BA 3TE9A 3LHWA 5EBUA 3W2KA 4U28A 3QW3A 3CQ0A 3RLUA 1P5BA 1OYAA 3TJXA 4HHPA 2Y63A 1XUZA 3GNDA 3L65A 2GPTA 4FX7A 3QM3A 4LV9A 7TIMA 3LXCA 4RKAA 3B8DA 4GUFA 3PC0A 1FXPA 3QJAA 4JS3A 1YXYA 3DFNA 4JD4A 4OV9A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2GJN A;  1K7F A;  4LOC A;  3W1A A;  2NXH A;  3T44 A;  1H7P A;  2ABA A;  2I1O A;  1W5Q A;  1AL7 A;  5D2T A;  3UZ5 A;  3FYP A;  3BW2 A;  5I3I A;  4AB4 A;  1C9D A;  5HUP A;  5AC7 A;  2NV1 A;  2DZP A;  2H8Z A;  3TUU A;  2DZX A;  2ISS A;  1TTP A;  5LGZ A;  1PS9 A;  1EP1 A;  4AVF A;  1GG1 A;  1GT8 A;  2V2H A;  1TTQ A;  4ZZ9 A;  4BI6 A;  3O6C A;  3IIV A;  2DU2 A;  3TH6 A;  3LCG A;  5BMX A;  3BO9 A;  1U5J A;  2QF7 A;  4I9A A;  1JRB A;  1A53 A;  1YTD A;  4UC5 A;  4H3D A;  3W7P A;  3QH2 A;  4HNV A;  1DOS A;  3W1M A;  1YLV A;  1DOR A;  3B03 A;  2V8Z A;  3MO7 A;  3P74 A;  3QW4 B;  2QCD A;  1EUN A;  3UY8 A;  3STF A;  4MY8 A;  5C2X A;  3HGS A;  4N9D A;  1DVJ A;  4O4W A;  1JCX A;  1AW1 A;  4AHO A;  2NWS A;  3L0N A;  1RQB A;  3G1S A;  1VLI A;  3W88 A;  3BGJ A;  5KIN A;  3TSM A;  4UTI A;  1CI1 A;  2AQW A;  4DBD A;  1BKS A;  4H4I A;  3C2O A;  1MXS A;  1OFE A;  4QIU A;  2NUY A;  3L0G A;  3W3O A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 2CLM A;  3WNN A;  2H3D A;  4Z0J A;  1EWD A;  1S2W A;  4LBU A;  2V67 A;  5D33 A;  3RHG A;  5BWA A;  4TVD A;  3E1F 1;  1Q8J A;  1PKM A;  1KFC A;  1ZNN A;  3QY8 A;  4IMC A;  1FHD A;  4QGC A;  3CO8 A;  3VX0 A;  3DBN A;  2YXX A;  4LB4 A;  1GZG A;  3SCU A;  1Y5W A;  3N1A A;  1J6P A;  2PUZ A;  3PWA A;  2A2I A;  4LSB A;  3GW3 A;  4IPI A;  1XBZ A;  4N7Q A;  3DFS A;  4IFO A;  1JDA A;  4WJ8 A;  4MWA E;  1UR4 A;  1V5X A;  2FVK A;  1QOX A;  2AL2 B;  3W00 A;  1OFR A;  3EX2 A;  3UPW A;  4B5W A;  4EPK A;  4CNT A;  1R2R A;  3CBW A;  3EKG A;  2E9L A;  2BXV A;  4RDY A;  1CWY A;  5LA0 A;  4M6U A;  4JHO A;  3VXG A;  2NVD A;  5LSM A;  4XIM A;  3CL6 A;  1QWK A;  3QQ0 A;  4GIA A;  3B9A A;  4DLF A;  1LOS A;  1NP0 A;  1QAS A;  3B8W A;  2JKP A;  3OG2 A;  3WLI A;  1PBG A;  2NX3 A;  3HMC A;  3ITV A;  4GQ0 A;  2GGH A;  8A3H A;  4DWS B;  2WSP A;  1V3L A;  1B0I A;  2QVH A;  4AU0 A;  4N6F A;  1J9Y A;  4NT0 A;  4OJY A;  4REQ B;  3W1R A;  5D32 A;  3IK2 A;  1AQH A;  1QHO A;  1RCX B;  3EXT A;  3WD3 A;  3SRH A;  4HNL A;  3L9C A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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