1WBHA

Crystal structure of the e45n mutant from kdpg aldolase from escherichia coli
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
sequence length
213
structure length
213
Chain Sequence
MKNWKTSAESILTTGPVVPVIVVKKLEHAVPMAKALVAGGVRVLNVTLRTECAVDAIRAIAKEVPEAIVGAGTVLNPQQLAEVTEAGAQFAISPGLTEPLLKAATEGTIPLIPGISTVSELMLGMDYGLKEFKFFPAEANGGVKALQAIAGPFSQVRFCPTGGISPANYRDYLALKSVLCIGGSWLVPADALEAGDYDRITKLAREAVEGAKL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Escherichia coli
publication title Mechanism of the Class I Kdpg Aldolase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords KHG/KDPG ALDOLASE
total genus 73
structure length 213
sequence length 213
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 4.1.2.14: 2-dehydro-3-deoxy-phosphogluconate aldolase.
pdb deposition date 2004-11-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01081 Aldolase KDPG and KHG aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1wbhA00
3IIZA 5DXYA 3EX6A 3W2JA 1T0OA 1TPH1 3IEBA 3V75A 2R94A 3K30A 3TC7A 3TSDA 3KOFA 4U28A 4DF1A 2OT1A 3MYOA 5BMWA 3NQ8A 4QQ3A 4GFSA 1XDMA 4QM1A 3GAYA 2RDWA 4A21A 2GQ8A 1QR7A 3S1UA 3HBLA 4XTIA 1GG0A 4IUOA 1S5TA 1F7BA 3LRMA 2HS6A 3OIXA 3PY2A 1S3HA 1YXYA 5G5IA 4X22A 2I9EA 4NJHA 3W75A 4RXGA 2XFWA 4POCA 1DKWA 1DJNA 1HUVA 5K9XA 3W23A 3QPZA 1ZCOA 1LCOA 2RDUA 1SPQA 2PURA 3WJXA 1XXXA 1JQXA 1Q6LA 2ISWA 2PRHA 3NPUA 5K7JA 5LGXA 1EUAA 1FUYA 2ZCGA 3QSRA 4M6PA 4WXZA 2YYUA 5AYYA 1O94A 2C3ZA 3UXAA 3P81A 4NZJA 4NJGA 5GVJA 5IM51 5HUOA 5U4NA 2A6NA 5G4EA 5AHMA 3WFAA 4N6EA 3GYEA 2YCEA 5I3GA 3BV4A 1DOSA 1TPWA 4ALDA 3B0VC 1O4UA 1O5KA 1Z41A 4LVDA 3C0JA 5LNVA 4H4IA 4JD4A 5EKYA 5D05A 4MY9A 1YXDA 2ZZ7A 5AHIA 5CSSA 5DBUA 3G0UA 3E02A 3O16A 3SR7A 5C55A 3WK0A 3G1DA 3N9RA 3BO9A 1YDOA 4O53A 2A4AA 2FTPA 3NQMA 4O18A 1I8JA 3WK1A 4HNVA 3LCFA 4HNNA 3UZJA 1F74A 2FLIA 3NNTA 1LYXA 4Z1AA 1WQ5A 4JGDA 3Q58A 1GVQA 3BW3A 3UWUA 1CX9A 1YTKA 3DZ1A 3SGUA 1W5OA 4JNMA 2W6RA 3S1WA 5J5DA 3RU6A 3SSJA 2D73A 4WJEA 2QUTA 4UFHA 3W70A 3T55A 1EWEA 3LHWA 3LXCA 2PRMA 4TO8A 3JRKA 1OVDA 4LTSA 3IVTA 2E5DA 2C15A 3LM7A 4X3ZA 4QITA 1NEYA 1G4PA 2NX3A 3CPRA 2CW6A 1W3NA 2CLLA 4IMFA 5HMSA 2FIQA 3VNDA 4ZMGA 3L0NA 2Y6ZA 1SSGA 1I2RA 4AF0B 1XCFA 4JIPA 4ADUA 3DFQA 1D9EA 1ML1A 4K37A 3NO5A 1LOSA 1ZALA 1OFAA 3W72A 1J2WA 5DBTA 4PCFA 4Y6GA 3W1PA 3KVMA 4PA8A 2V8ZA 2TYSA 1KV8A 3EX3A 4O52A 4GUFA 2CFFA 3M5XA 3W2UA 4LU0A 4HPXA 4AXKA 1SW7A 3O1NA 3GDLA 3E0IA 2QKFA 3MHUA 3CM4A 5HQEA 5BNKA 1EX5A 4ZVJA 2F7FA 1TTJA 2NV2A 3UWYA 5AOUA 2NX9A 1FX6A 3PWAA 3QSTA 1IIGA 3STFA 4OBTA 1LP6A 4JEQA 4YCOA 2YYTA 4CNPA 5D2WA 1P0NA 3BW4A 1RD5A 4TU1A 5FF4A 1DL3A 4M6VA 3W2KA 1TPUA 1GT8A 2WNNA 2VFEA 2V81A 4G1KA 3QC3A 5AC7A 1KTNA 3LTSA 2DZXA 1QFEA 3EX1A 4O4WA 1TTPA 2WO5A 3MP5A 3EXSA 1GYLA 3OVRA 4Y8FA 3W1AA 3S1VA 1TSIA 3W1MA 4YLWA 1MEWA 4EVZA 3QJAA 2B7QA 3F4NA 3TW7A 1EWDA 3UPWA 3GLCA 4FHAA 3LCIA 4FX6M 5EY5A 3N19B 5CSRA 1EB3A 5DCBA 1L6WA 2DZPA 3QEZA 1A50A 1VCGA 3W1XA 2VXNA 2V2HA 4O1BA 3U6WA 1LZOA 5BW6A 7TIMA 2NXGA 1KM1A 5D37A 2E77A 4ZQRA 1ALDA 3DENA 1TPB1 2A2IA 4IXHA 1QNVA 2E6DA 4WD0A 3EWUA 4NX5A 1LDCA 3W85A 5A8GA 3PF3A 3T4CA 2WPBA 3SIZA 5BMXA 1X6UA 4DQWA 1HTIA 2BLEA 5AB3A 1I2OA 4PTNA 3BLIA 3M44A 1TTIA 1LLWA 3EKLA 4UTIA 4E38A 4AHPA 1WDWA 4CCCA 3W7PA 1HL2A 3MBDA 3GB6A 2WV8A 5KMYA 3BVJA 4RKAA 1FCUA 3T44A 4O10A 4UNKA 3W7QA 1OFQA 4LT9A 4Q33A 2NWRA 3EWBX 1ZAJA 1AL8A 3PSVA 4UTWA 4JTIA 4CCEA 4XUGA 5ABTA 1TO3A 2GVGA 3P67A 3STEA 1L2UA 2A7NA 4MZ8A 3STGA 3N34A 4GWEA 4QIUA 2DZWA 4LW7A 1GJPA 5BOOA 3PAJA 1YADA 3C4UA 3BK0A 3N2XA 4O15A 1GEQA 1N7KA 4LRSA 4Y9AA 2WSYA 2ZZ5A 2FQIA 4AWSA 3B4UA 3KRSA 4XTDA 2Y62A 3DFSA 3R2GA 4MFDA 1L6YA 4UMCA 2C6QA 4O1DA 3MI2A 3D0CA 3TU9A 3C6CA 3SW6A 5H91A 1TPDA 2HS8A 3G1HA 4ML9A 1F5ZA 2TMDA 2BTMA 3N9SA 3TMQA 1VCVA 2Y7DA 1TJPA 3FJ6A 1KW1A 5LNSA 2QUUA 3MW7A 3P8IA 1KFJA 3HGSA 2OMAA 2YXGA 4LVFA 1OF6A 1RQBA 3RMJA 4BK9A 3W7OA 3Q37A 2X2GA 1YTDA 3G24A 2Y85A 1RQEA 4HNUA 4OQVA 3W7NA 4DO4A 1U5JA 5D03A 2Q3OA 3M6YA 4JR5A 4ONVA 5FF3A 2GPTA 1I45A 3HO8A 1XUZA 3HIJA 3BGJA 1TRIA 4LC8A 3LLFA 1N8FA 4Z1BA 3O8AA 3NL3A 1TIMA 4KKXA 2AGKA 3H54A 3W76A 1B4EA 3C2FA 4O4VA 5HR7A 3W9ZA 1SUXA 4RCXA 3HGJA 3MMTA 3FKKA 2Y70A 2VOMA 4FX7A 2QUVA 5AC6A 3KAOA 4M19A 4TR9A 4LV4A 3PC0A 3RLVA 1WV2A 1QPQA 2B7NA 1PV8A 2E6YA 3PBYA 2G96A 1VCFA 3NZ1A 4RK8A 4DPQA 2PCQA 3A22A 5F4WA 1QAPA 5E1QA 5U7SA 3TSMA 6TIMA 5HWMA 1YDNA 1PHWA 2JGYA 2E68A 4BFAA 2QCNA 1EEPA 4X2RA 3W7KA 4ZQPA 4JTTA 3P5ZA 2V2CA 1G7UA 5D09A 3LBCA 1K8ZA 1D3GA 4GE8A 1F05A 2A21A 1LOQA 1W3TA 1SQ7A 4K8HA 4O8RA 3ABQA 2JKAA 3CTLA 4FNRA 3QYQA 4O1CA 4Z1CA 1W56A 3G1AA 5KZDA 1LM1A 1BTMA 4UTKA 4RXFA 1DV7A 4CQ8A 1SW0A 3AJXA 1K02A 1RVGA 1H7WA 5EA9A 3ANYA 1W5QA 2CLKA 1QO5A 2NZLA 1H61A 2VENA 2YW4A 4DBDA 1O5XA 4M7SA 5D2XA 2ALDA 3BLFA 4NNAA 5CKSA 4UCGA 1TCDA 4BI5A 4PFMA 2VFFA 4JTFA 2ZFAA 2QF7A 1KM5A 3W7MA 3HG3A 4MZ1A 4WUIA 1W5MA 3P74A 3CLMA 3P84A 3ABOA 2EKCA 4I7VA 1VYRA 1XKYA 3W84A 4BR1A 3W1RA 1JCJA 3TW6A 1Q6RA 3A24A 2A5HA 3BG3A 5DLCA 1S5WA 3P7YA 4GUJA 3FS2A 3HMJG 1SZEA 1F6PA 4TMBA 1ME9A 5EYWA 2E09A 1BWLA 3KXQA 3W83A 1THFD 5KZMA 1EP3A 2XN1A 3GNDA 3GR7A 4PEKA 4CQAA 2FB3A 3UWZA 4AVFA 2QCLA 1GVOA 4RJEA 4PC8A 5HINA 1KLZA 3FEMA 1LTDA 3M0ZA 3UWQA 3T78A 2IQTA 4JYFA 1GTHA 3B0PA 3UXDA 4LWWA 4N6FA 1E51A 1FWNA 2Z2UA 3TX9A 2Z1BA 4XKYA 1I2NA 3NQDA 1WBJA 2QCFA 3KHJA 1KBJA 2OZ0A 3L5MA 1R2SA 2B7PA 3VFLA 1SR9A 3NQ6A 1VPXA 2H90A 1QDSA 2CU0A 3LBMA 1QO2A 1W1ZA 5CZJA 1SO3A 3W7HA 1DBTA 2Z6IA 3GK0A 3LI0A 5LNRA 1K8YA 3W7RA 2PE4A 5TQLA 4JXCA 5EMUA 3UY8A 5KSWA 3A9IA 1KFKA 1VZWA 5FF7A 5I3IA 2G95A 3M5YA 1FDYA 1DORA 1UASA 4N2YA 4KFPA 3FA5A 1TPVA 1QWGA 2P1FA 2Y61A 4ORIA 2NWSA 4LVAA 3PB0A 3W2NA 3TJLA 3MO7A 3G0SA 3ZWSA 1PE1A 3E9AA 1OABA 3A21A 4O28A 3L66A 2BXVA 3ZWTA 3G22A 4K6AA 3CWNA 3NQAA 4IPJA 4XBKA 1KBIA 3W7LA 2FPTA 3M7WA 4O14A 3LRKA 2C14A 1FBAA 1M6JA 4MJMA 2J9YA 5LZLA 3O07A 4GRSA 1I4NA 2C19A 3M9YA 3GZ3A 4MY1A 3NOEA 2VELA 3G3MA 4C1KA 3GDTA 1A5SA 1XL9A 3F03K 4UTJA 1SZGA 3FFSA 1NSJA 1WX0A 5LNUA 1VHCA 1ZENA 2ISVA 3DI0A 1F2JA 4P2VA 2B4GA 3W1NA 5AYXA 5HUPA 3KVKA 2XN0A 5I3HA 4O0ZA 2VFGA 3W7GA 2DJXA 4ZZ9A 1OX6A 3DFNA 1M7OA 2FB2A 1OK6A 4NUWA 4GUIA 5DXXA 1JVNA 4AB4A 3P80A 2WKJA 4HNTA 3WK3A 1KM0A 1DHPA 4R7JA 1RPXA 3C2EA 1R2TA 1G6CA 4BF9A 1Q6OA 2ZRWA 2NV1A 1OX4A 4JY9A 3TNOA 4A2SA 2QAPA 2QCHA 4QNWA 3DH7A 3LCLA 5FEXA 5G1YA 3SJ3A 1GG1A 1G67A 2HMCA 2BSLA 3LXAA 3RK8A 3UWVA 1B57A 4R33A 4RR4A 2QCDA 5K2ZA 2YSWA 3W71A 4JIQA 3O15A 4FB7A 3HB9A 3TCEA 1VJIA 4DELA 1T99A 1FCQA 3USBA 2CZ5A 5K3VA 4HT3A 2VFHA 2RKXA 3IIXA 5F2MA 3MJYA 3W88A 4E0CA 3NQ2A 1NFBA 5F2GA 2CZFA 3IV3A 3OBKA 2Z6JA 2ZRUA 1H7PA 3B06A 3GKFA 4XBSA 2QJHA 1H51A 4ZQNA 3W74A 3TXZA 3W7DA 2ZA1A 2TPSA 3B8DA 2V0TA 1KFLA 1TTQA 2CLFA 4R53A 3UD6A 2ZRYA 3O63A 3L5LA 4UFLA 3SFKA 4N02A 5FF0A 4IX0A 2EHHA 3O06A 3TSBA 5HR6A 4K38A 3ABSA 1TRDA 3MP4A 1IF2A 3QF0A 1GYNA 4MYXA 4LUJA 1TPEA 2A6LA 3UNDA 2ATSA 3W2MA 3VE9A 4FO4A 3DHFA 3OHIA 1Z42A 1KFCA 3DHDA 4K7YA 1H1YA 4UTTC 5C5YA 4O54A 3E49A 1LBFA 2GVLA 3PULA 4R34A 1O60A 3CEPA 3NQ7A 3R13A 3PUDA 4K7VA 1SFLA 3BGGA 1AL7A 3E12A 4Q4KA 4NJIA 1YYAA 3NM1A 4L4MA 4FNQA 2ZQ0A 4LS2A 1QCWA 1B4KA 4MVAA 8TIMA 2WNZA 5J5RA 1Y0EA 3GXTA 3FYOA 2CLMA 4PL1A 5H2ZA 5EL1A 1SW3A 3I7QA 2ZZ4A 3TQVA 3YPIA 2CLIA 4HN4A 1YPFA 1VYSX 2Y89A 3NG3A 1P4CA 4ZQOA 3W7CA 5LGZA 4TIMA 3SGZA 3NQVA 2ZA2A 2XN2A 1JQVA 4ADTA 1WYIA 3GAKA 1JRBA 2QAFA 6ALDA 3UZ5A 3G3DA 1VS1A 3LV5A 4TX9A 1W54A 2HSAA 1JUKA 3BG9A 4H6KA 4MOZA 4JYDA 3L65A 1XBYA 2GJLA 3G0XA 1HFBA 2RHGA 3L21A 1OK4A 4QNEA 3HJZA 1MZHA 4O57A 4LNYA 2V30A 4FIQA 2OJPA 1FDJA 2ZZ2A 4ADSA 5I3JA 4JTEA 1GPWA 3DKJA 4EWND 5L9FA 1LRNA 1MO0A 2ZZ1A 4A3UA 4B5NA 2Q3RA 2RFGA 1TPC1 2H6RA 1IXPA 1KM4A 4UMAA 1MSSA 4ORMA 3R8RA 1SO4A 5AYZA 4CNOA 1OFRA 4N9CA 1Z44A 3MWAA 2RDTA 3W7JA 1V5XA 4JTKA 4MPQA 4A22A 4FF7A 4HPJA 1H5YA 3NPWA 3GDRA 2YW3A 3ZFHA 3TFCA 1C29A 3EKZA 3KVJA 2GUUA 3I7RA 3NA8A 4AMAA 5CPLA 1W5PA 1WOAA 1XDLA 3WJYA 1ZAIA 4HKPA 1P0KA 3GX9A 4O17A 1WXJA 3Q2DA 3ATZA 5KTLA 2DZSA 1HO4A 2ZRXA 3W73A 5G2IA 1PVNA 1IIHA 1TQXA 4UIOA 4KFNA 3QZEA 3TC6A 3QMTA 1L6SA 1GVSA 5CZSA 1LRQA 5FEPA 3UY7A 4CQ9A 1IXNA 3LHUA 1K7EA 5D32A 5F2LA 1JCLA 1KM6A 5D04C 1JR1A 4H3DA 1TV7A 4XKYB 1O95A 4ICNA 1QPRA 3M47A 4N9EA 1TV5A 4D2JA 3TIMA 1UJPA 3HG4A 4RZ5A 3NVTA 2NUXA 1SZNA 5LNWA 3FLUA 2NX1A 1QOQA 5HULA 3QMSA 1EUNA 2P10A 1VC4A 3S5ZA 3QQ0A 4LUIA 3G18A 1EP1A 3LRLA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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