1J4E | Genus

Total Genus 142

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	142
sequence length	341
structure length	341
Chain Sequence	HPALTPEQKKELSDIAHRIVAPGKGILAADESTGSIAKRLQSIGTENTEENRRFYRQLLLTADDRVNPAIGGVILFHETLYQKADDGRPFPQVIKSKGGVVGIKVDKGVVPLAGTNGETTTQGLDGLSERCAQYKKDGADFAKWRCVLKIGEHTPSALAIMENANVLARYASICQQNGIVPIVEPEILPDGDHDLKRCQYVTEKVLAAVYKALSDHHIYLEGTLLKPNMVTPGHAATQKYSHEEIAMATVTALRRTVPPAVTGVTFLSGGQSEEEASINLNAINKAPLLKPWALTFSYGRALQASALKAWGGKKENLKAAQEEYVKRALANSLAAQGKYTP

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Snapshots of catalysis: the structure of fructose-1,6-(bis)phosphate aldolase covalently bound to the substrate dihydroxyacetone phosphate. pubmed doi rcsb
molecule keywords	FRUCTOSE-BISPHOSPHATE ALDOLASE A
molecule tags	Lyase
source organism	Oryctolagus cuniculus
total genus	142
structure length	341
sequence length	341
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date	2001-09-19

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00274	Glycolytic	Fructose-bisphosphate aldolase class-I

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1j4eA00

3WJXA 2WOQA 3TX9A 1WOBA 1A5SA 3LHTA 3WK2A 4PL1A 1F5ZA 4AAJA 5DXYA 4IX0A 4LNYA 1SO6A 3G1HA 3G1YA 3INPA 2OMAA 1TCDA 4FF7A 1LROA 4IMGA 3IIPA 1GT8A 1A5BA 1IXNA 3LV5A 5J5DA 2ALDA 4QITA 1U83A 1ZAJA 4JTUA 4AHPA 2FPVA 3NQVA 2YDAA 4FHAA 4DF1A 1VLIA 1FWNA 4RJEA 2CLIA 1K7EA 2OX1A 3QYQA 2Y7EA 4TMCA 1NEYA 1W31A 2WNNA 4AB4A 2VEIA 1QPOA 2C15A 2TSYA 1LOSA 4POCA 2WKJA 3QC3A 5L6UA 5F4WA 3WJYA 1GVFA 3MHFA 1QWGA 4RZ5A 3DKLA 1I2QA 1V5XA 3W85A 2B7OA 1TTJA 1H61A 5HR7A 2ZZ6A 1SSDA 3DFOA 4XBSA 1W3NA 1N8FA 2ISWA 4BK9A 4FX6M 3A23A 4UTLA 1Q6QA 1OFQA 1GWJA 3FYOA 3PS7A 3RNDA 1KM1A 5K9XA 4O13A 3TK7A 3NQGA 4KFOA 2RKXA 3GDRA 3LX9A 4NNBA 3BPWA 1QPQA 3P74A 1O95A 2HTMA 3NQCA 4PH6A 1B9BA 3O06A 1GVQA 3PSVA 3B4UA 3IV3A 1G4EA 1W5PA 4N6EA 4JY9A 2GJNA 1IXOA 2GOUA 4IJBA 3W74A 3GNDA 5KITA 3PM6A 3UZJA 3MWAA 3SI9A 1Z41A 3G1VA 3T55A 4WXYA 4EF9A 1IXQA 2Z1BA 1SR9A 1TMHA 3G1DA 5C54A 5G4WA 2C13A 2J88A 3DFSA 5EY5A 3BV4A 1TPEA 4NJIA 2BTMA 3LCIA 2FPTA 4ZQOA 1HO4A 1OABA 4AF0B 1KLZA 5AOUA 1WBJA 3KVMA 3MI3A 2DZTA 3ATZA 3SGZA 2RDTA 3HPSA 3LXAA 1GYNA 3M5VA 5CPLA 1SW0A 3QRHA 1FXPA 3B0UX 4FNTA 5LNSA 4OV9A 3LB0A 1HL2A 3TROA 1KM5A 4K38A 1PE1A 3I6RA 1AL8A 4O0ZA 3T78A 1RQHA 2EPHA 3DU0A 3W71A 3L5AA 3TMQA 3ATYA 3PUOA 3G1FA 4O50A 3P5YA 1ZAHA 2F7FA 1W3IA 1F6PA 2CZ5A 4NNAA 3W84A 3O1NA 2DU2A 4PC8A 2NUXA 3UXAA 3MYPA 1GEQA 4TIMA 4GXMA 3W3OA 3CT7A 6ALDA 4OE7A 1FCBA 2YGYA 3M0ZA 3PWAA 5I3IA 2WO5A 3VI2A 3A5FA 4N4PA 1GOXA 5DBTA 4D2JA 1Z42A 4AXKA 4EWND 1SFLA 4JEQA 2H6RA 3W2NA 3UQNA 3MI6A 3L5LA 3C56A 4LUIA 2YCEA 3CB8A 3GR7A 3S9YA 3L66A 1R2SA 1G67A 1CI1A 1YLVA 3NL5A 5SWUA 3TC6A 5LSMA 3C2EA 3GDTA 4DBEA 3PUDA 4K7VA 3M5YA 1F73A 3P67A 1LM1A 4YWIA 5EBUA 4Z1DA 2GQAA 4AF0A 3B03A 4NJJA 3NM3A 1KFJA 7TIMA 1TPC1 3S5NA 2RDWA 4HNVA 2WNZA 1RQEA 4ZQMA 2Y7DA 3G24A 3EWZA 3GR8A 3E96A 3NQEA 3W1TA 3W22A 3HB9A 4AEOA 3RFAA 3A22A 4LVDA 3N73A 4JY8A 1X6UA 5AB3A 2PRMA 3LHVA 3N3MA 2WV8A 1QPRA 4JTIA 1HO1A 1MZHA 1HTIA 4IOTA 5EYWA 5KSWA 4DPPA 2I9EA 1H62A 1LRNA 1QDSA 1BTMA 1JUBA 3VKJA 2V2HA 4YCPA 2XN1A 4ADUA 3U2OA 1JRBA 3PG9A 2ZQ0A 3SY5A 3STCA 3PY2A 5EPDA 1RZMA 4GWEA 1BEUA 3T4CA 3SIZA 1TQJA 3GYEA 3NXFA 4K36A 1QCWA 3B05A 2EHHA 1VR6A 3NPWA 1EP1A 1KTCA 3GNNA 3TC7A 1K8XA 1J5TA 3QPZA 3G8EA 1E51A 5CZJA 4WUIA 1FDYA 2VFFA 5CSSA 4RK8A 2DZSA 1JULA 2ZDRA 3T7VA 3NGJA 1GG0A 1VCFA 3W73A 1OX5A 3C61A 1EX5A 3L9CA 3GAKA 2V0TA 3SJ3A 1DKWA 3HG3A 5K4XA 2JK2A 2I1OA 3TJLA 4GJ1A 1ONRA 2V30A 3W7RA 1VQTA 3FOKA 2ZBTA 4U4MA 3LLDA 3RLVA 4HIBA 3DH7A 4XTDA 3IIZA 1FDZA 4KFPA 3RK8A 5LGZA 5CG7A 3HBLA 1WQ5A 3LHWA 1J2WA 2X1TA 4ICNA 4UTHA 5E93A 3B0VC 4MZ8A 4XUGA 5C2XA 4E0CA 1XL9A 3E49A 2QCHA 5HQEA 2ZRVA 1KM3A 5G2WA 4AHQA 4OHQA 1MEIA 1VC4A 3GKFA 3MHGA 2Y70A 4WJEA 1TPVA 3QQ1A 1ML1A 3M44A 3NR0A 4DBDA 3R8RA 1O4UA 2FIQA 2Q8LA 2GQ8A 4MVAA 4J9JA 2NZLA 1DBTA 4JD4A 1W5OA 5CGQA 5CSRA 4BWLC 1G4TA 4I7VA 3IGXA 1WXJA 4JDBA 1DHPA 4I9AA 3W76A 1BWLA 5KMYA 2CU0A 2ZTJA 3GXNA 2ZRZA 4O8RA 2DZPA 4O18A 4QIUA 1NF7A 5KZEA 3T44A 1WV2A 1YXYA 4C1LA 1LDCA 3UPBA 1XC4A 1G7UA 4XTIA 2VFEA 4LT9A 4FIQA 2V8ZA 1XXXA 3SR7A 1ZCOA 3EWUA 1GVRA 2X1UA 1LBLA 3A9IA 1SU5A 1W5MA 3G0XA 1PS9A 2CLHA 4UIOA 3R89A 1OF6A 1OFRA 1VH7A 3QH2A 3PB0A 5K7JA 3S1UA 4RLIA 1P0KA 2H3DA 2NX1A 1P4CA 3HPZA 5AYZA 3W07A 5A8GA 2QKFA 3DKJA 2X16A 2C6QA 4MFEA 3W7HA 4PODA 1DQWA 2FB3A 4PTNA 3W1MA 2DORA 1N55A 2FDSA 2NXHA 4IPJA 3UWYA 1B57A 5F1UA 2ZRYA 4HSOA 5AC6A 1HUVA 5LKYA 1JR1A 3M6YA 3PBWA 4UTKA 3G1XA 3HGRA 4ZL1A 2EGZA 4LVAA 3PVFA 1W0MA 3EKLA 3BLFA 5HMSA 2H8ZA 1T96A 1DJNA 2E6DA 1LRTA 1L9WA 3L65A 2HMCA 4BF9A 3B06A 4MJZA 5AHFA 1H7OA 5FI8A 5D33A 5LGXA 1PL9A 3WFAA 1G4PA 4GRSA 3QFEA 4NQ1A 1QNVA 1ICQA 2Z6IA 3ZS4A 3ZR4A 1I2RA 3UWZA 1KM6A 3PB2A 2ZRXA 3NQFA 3STFA 3QSRA 5C5YA 3R2GA 1TRIA 4LC6A 2NLIA 4ONVA 3SECA 5D2XA 3TV8A 2HS8A 4OT7A 3F4WA 4MY9A 5HWNA 5AFDA 4LV9A 5CZ0A 4YXGA 3G8RA 4CQAA 2YFOA 4MPQA 4R33A 3KX6A 1GJPA 3NZ1A 2GJLA 4TX9A 2YW3A 3HIJA 3TW6A 5FEZA 1H1YA 3L2IA 4NXSA 3KRSA 5G2HA 3NEVA 3C52A 2QCDB 1TPDA 4QNEA 1MSSA 1JJKA 3IVSA 3GZ3A 3KVJA 4BFAA 4NT0A 2CLLA 5AC7A 1KFLA 3RF9A 4O12A 3LCWA 1VPXA 4HNNA 4ZMGA 3N9SA 1ICPA 2VFIA 3C8FA 5EL1A 4JNMA 1OK4A 4IMFA 4O1CA 4YMZA 2A6LA 4JTKA 4MYXA 1VCGA 3NQ7A 2Y6ZA 4JTTA 4QNWA 5AN7A 1WOAA 3W7IA 2QJHA 1XBYA 1UCWA 3UZ5A 1HFBA 5AHEA 5FF2A 2B7QA 4R34A 1DORA 5LZLA 1JRCA 4MFDA 3E02A 3OVQA 4MZ1A 5AYXA 3MO7A 1F6KA 3TQVA 1QR7A 4UFIA 4N4QA 4WZHA 5KINA 4EIVA 1YDVA 1GG1A 1YDOA 2I14A 2BSLA 2G97A 1VGAA 3JS3A 3W7MA 1UBSA 3GDLA 1U5JA 1ZFJA 4O57A 1L6SA 1ZNNA 3JR2A 3EXRA 3IIXA 2GVLA 1GZGA 2AQWA 2A2IA 3L0KA 4OQVA 1I4NA 3W1RA 4CCDA 1TJPA 3DBPA 4A22A 4LTSA 4ZVJA 2Y63A 3K30A 2NV2A 4JX4A 1IXPA 3C2FA 1Q3NA 1RVGA 2ZYFA 1Z48A 1X1ZA 3S0CA 2QCDA 3Q58A 2VFDA 4ZQPA 4UR7A 2ATSA 4P2VA 3W1XA 4CCCA 1NSJA 3UY7A 1GTEA 4AWUA 3HG5A 2JGYA 3Q2DA 4JTFA 1KV8A 4KWVA 5G1TA 5HJLA 1O60A 5DCBA 4DF0A 3TAKA 1KFBA 3W23A 3M47A 5D02A 3FIGA 2ISSA 5LNRA 1JCNA 5CPMA 4ZQRA 4ZQCA 4FB7A 1OYAA 2QJGA 4C1KA 5MHBA 3A24A 3TJXA 4CQ9A 1K02A 5HUOA 2P10A 3O05A 3PBUA 4LVFA 2C1HA 1XUUA 5DCEA 4DXVA 4FNRA 3L67A 2NX3A 4Y8FA 5GVJA 3O8AA 4ADSA 3QF0A 3C2OA 3QMRA 2QCMA 1F74A 4JYEA 4IQLA 5G5IA 1H63A 4QJ1A 3P60A 3GVGA 2QDHA 1YXDA 1OX4B 1KM2A 4RCXA 3EXTA 3LTSA 1FWWA 4U28A 5AHIA 1RR2A 4UTMA 5BMWA 2Q8ZA 1H60A 2P1FA 4UMCA 2H8XA 3ELFA 2FLIA 2CW6A 1FX6A 3W7NA 2ZFAA 4IMEA 2QCNA 4EOUA 4LVGA 3U6WA 3TUUA 1AK5A 3L68A 4FEZA 1Q45A 4PA8A 3PBYA 1JQXA 3EWXA 4O54A 1PV8A 3SGUA 1TV5A 1ZALA 4JX6A 4UTWA 1S5TA 2QCLA 2OT1A 2WSQA 4XKYB 4Y6GA 1RD5A 1OFPA 2W6RA 4AHOA 1F76A 2XN0A 2OCZA 1DVJA 3UPWA 4UTTC 2Y61A 1K7XA 2VC6A 2WNQA 3SW6A 3UWWA 2QCGA 5D30A 4JICA 2WSYA 1D3GA 2JKPA 1K3UA 2WPBA 3ABRA 3LRMA 3FKKA 1L6YA 5DBUA 4GC4A 3G0UA 3HOJA 2RH9A 3BW2A 1K8ZA 2TPSA 1IF2A 2Y62A 2WJZA 4JIQA 3NPVA 3OEXA 2V2CA 4FNQA 4O0KA 3C4UA 1RPXA 3TSDA 3LHZA 3N34A 1OX6A 3V1PA 4CCEA 1BKSA 3MI2A 5T26A 4LS1A 3BGGA 3GXTA 1WAUA 3DGRA 3OBKA 2PRLA 5IM51 3QZEA 3S1WA 1AW5A 4OBTA 1W37A 4NZFA 5HULA 1PVNA 3GXPA 3NYZA 1OX4A 3P82A 3S8HA 3IGUA 3KAOA 1M7PA 2ZRUA 4LRTA 4A3UA 3UXDA 5FF7A 2HSAA 4GUHA 3HGSA 3B04A 4M6QA 2TYSA 1AW2A 4YCOA 3EEGA 4WQ6A 3P62A 1DOSA 1RQBA 3PR2A 5IBXA 1NVMA 3MJYA 3FKRA 4UFMA 4K39A 3EWWA 4Z08A 2JKAA 2YW4A 2G95A 3W1QA 3L21A 5D09A 4XKYA 4OU1A 1SW3A 3GDMA 4M6VA 1H7NA 2OJPA 2ZA2A 1A5AA 3L0GA 1O5KA 5G2IA 4LY8A 4JGDA 1EWDA 3E0IA 1TPUA 1GPWA 2GPTA 3IIVA 4JR5A 5K9CA 4L4MA 3BW3A 1Q6LA 3QSTA 2A7RA 2EAWA 4HHPA 1JQVA 2CFFA 3GDKA 5D32A 4DF2A 3C2RA 1ICSA 1EUAA 4M7TA 2A85A 1M5WA 4X9SA 1QFEA 3BG5A 4UFLA 1YPIA 5EKYA 4X3ZA 5U4NA 1OFOA 1EP3A 3HQ1A 3ZWTA 4IMCA 1VJIA 4MZYA 4DO6A 4LS2A 3W2KA 2QAFA 3KVKA 5I3KA 1KW1A 3DI0A 1KTBA 2NV1A 2VEPA 1TPB1 1FUYA 1QO2A 3FS2A 3W7GA 1HG3A 4OV4A 1UASA 3W86A 3TCEA 3TSMA 1GYLA 2B7PA 1P0NA 1FWRA 3LBCA 2DZVA 4JXCA 4R7JA 4WY0F 3W1LA 3CTLA 3W7DA 3IGSA 4NJHA 2QJIA 1SSGA 1R46A 2A0NA 4O53A 1H5YA 1THFD 4DEFA 1OFAA 3LRKA 4BI7A 1OVDA 5TBOA 3GLCA 4NZJA 2FQIA 2VKZG 4RZ4A 5CPNA 3MUXA 2YX0A 3NQMA 4Z1CA 1V7YA 3NAVA 5D2WA 3NQ2A 3OVRA 4K8HA 3IRDA 2YXGA 3C3NA 1TPFA 3LDVA 2A7PA 1H51A 1F2JA 3GKAA 3KHJA 4FXSA 3IIOA 1EP2A 3P84A 3R13A 2BZNA 3QQ0A 3EX6A 4G1KA 4JN6A 4Z1AA 2YYUA 4EF8A 2R94A 1PCWA 3CU2A 1GVOA 4ZZ9A 1LORA 2VFGA 1B4KA 4GUGA 2V82A 2FFCA 4N02A 2LLEA 1WX0A 3EXSA 4CQ8A 5I3JA 4JX5A 5AHMA 3DFPA 4HN4A 5D38A 1W1ZA 3R5EA 1DQXA 3LRLA 4TU1A 5H2ZA 3GIYA 2YSWA 1ZAIA 1W5NA 5F2MA 4UUIA 4IMDA 1EEPA 1KLYA 1R30A 4M19A 3TFXA 5L9FA 4O11A 3FEMA 1SO4A 4LWWA 2RFGA 3PULA 3TXVA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1J4EA

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