2CKR | Genus

Total Genus 134

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	134
sequence length	305
structure length	305
Chain Sequence	GTPVERYGKVQVCGTQLCDEHGNPVQLRGMSTHGIQWFDHCLTDSSLDALAYDWKADIIRLSMYIQEDGYETNPRGFTDRMHQLIDMATARGLYVIVDWHILTPGDPHYNLDRAKTFFAEIAQRHASKTNVLYEIANEPNGVSWASIKSYAEEVIPVIRQRDPDSVIIVGTRGWSSLGVSEGSGPAEIAANPVNASNIMYAFHFYAASHRDNYLNALREASELFPVFVTQFGTETYTGDGANDFQMADRYIDLMAERKIGWTKWNYSDDFRSGAVFQPGTCASGGPWSGSSLKASGQWVRSKLQS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	The Crystal Structure of the Catalytic Domain of Thermobifida Fusca Endoglucanase Cel5A in Complex with Cellotetraose rcsb
molecule keywords	ENDOGLUCANASE E-5
molecule tags	Hydrolase
source organism	Thermobifida fusca
total genus	134
structure length	305
sequence length	305
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date	2006-04-21

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	2ckrA00

1E4IA 1OWQA 4P7OA 2CETA 1KXHA 1ISVA 4TXEA 1AVAA 1OD8A 1VIWA 4IISA 4DUVA 1C8QA 2XFFA 2GDUA 3OLEA 1UKQA 2WHKA 1VFMA 4BQ3A 1GOQA 4F9JA 3PZIA 1ZBKA 4IPNB 3N13A 1JZ2A 3AHVA 1MW1A 2ZUMA 2XGIA 4WKAA 1HKKA 3N11A 1DWIM 1WP6A 2E40A 3GBDA 1ZBWA 3VIJA 1JZ7A 3VMOA 1CGUA 1OGSA 1L8NA 1PEZA 4RE2A 1ISYA 3WDHA 3AZSA 3LPGA 3WENA 1QNPA 5LYRA 1V6UA 5KEZA 1HVQA 2PBGA 4AIUA 3D3AA 3N9KA 3WH7A 1DWFM 5M5DA 1UKSA 4JHZA 3NYDA 5E6YA 2W63A 3ZIZA 1F4AA 3WD2A 3PZQA 2WHMA 2DDXA 4URIA 1R86A 4A3YA 3G6LA 1QI5A 2V5DA 3W4RA 3KE0A 1FFRA 5D4YA 4U31A 4EANA 5GNXA 1E55A 1H0GA 2VT0A 4PMZA 3BLPX 1Z32X 3CZLA 2O9OA 3WMBA 3FAXA 3WNPA 5JBEA 2A3AA 3A4XA 2YBTA 3SEPA 2BVTA 3THDA 2XVGA 1TG7A 2WLYA 4HP5A 1U2YA 3VIOA 4PTXA 5HPOA 4M8UA 2FH8A 2A3HA 1I1XA 3SUVA 2XVNA 2WPGA 2NT1A 2D3LA 3L4ZA 4M1RA 3AIQA 3W81A 2QF8A 3QHOA 2XHYA 2WLZA 1ITXA 2WZHA 3WIJA 2VZOA 2YOCA 3BAJA 3ZJ6A 4N0RA 1UD3A 5F7UA 4PRWA 1VEMA 3CUFA 1UA3A 1GCYA 1TA3A 2UY2A 3CBWA 2EPKX 1VEPA 1VFOA 2WMJA 3FHQA 4AW7A 3VOCA 3TP4A 4X0VA 1V03A 3GXFA 4H41A 2XUCA 2C0HA 3AJ7A 3WFLA 1C7SA 1LL7A 4D6IA 3ALFA 3IANA 2WSPA 2XTKA 3PZUA 5I23A 5C71A 2J7GA 5GNZA 4ZE4A 3RIKA 3T0DA 2V3FA 3W6MA 2VZVA 4NSBA 4TX8A 2OYMA 3MS8A 1C92A 1UD5A 1BVNP 1CGYA 3VD3A 3CH9A 4HMCA 2HISA 2YA1A 1PAMA 3W28A 1V3LA 2DIJA 2C7FA 1H1NA 1XYFA 4HTYA 1JZ3A 1UR4A 2G41A 5JIWA 4J3VA 3SIMA 1XV8A 5GNYA 1B1YA 1MXGA 1BTCA 1FFQA 3PZ9A 2RGMA 1D2KA 3N17A 4C7FA 2AMGA 2YDQA 2XVPA 3AXHA 3HN3A 3TA9A 3CUIA 1OGGA 3WN6A 5A1AA 4CKQA 4GQQA 5A6AA 1C93A 2W67A 3O6AA 2ZXAA 2WMIA 3T09A 1JYXA 3SCNA 1W9UA 3UESA 4U3AA 4QCFA 2E9LA 4W8BA 1TE1A 4J27A 1ESWA 1R85A 2J7HA 4UNIA 1CIUA 3NCOA 1NM9A 5TD4A 3SCUA 4UQ9A 4U5KA 4Z2HA 1US3A 1VENA 4ZFMA 2VQUA 2QPSA 4NI3A 2W91A 4EK7A 3K1DA 1EA9C 1W3LA 2ZICA 1CECA 1VF8A 4V27A 1LLOA 1ZJAA 1CNVA 3SUSA 4JFWA 2CBJA 5BWFA 1WCGA 1V0LA 3K4AA 3SCRA 4QLKA 1LQ0A 2O9TA 1N82A 4DUWA 2FGZA 2D2OA 3K46A 1TA3B 4FF5A 4LXFA 5FD0A 2WAGA 5CGTA 4GZEA 1UA7A 1W1VA 3W82A 2YL6A 1JG9A 1BYAA 1CXIA 5FIPA 2ZOXA 3WD1A 2ZWYA 3AIBA 4UTFA 3WDIA 4UOJA 3O2LA 2NSXA 4PSRA 1HJVA 1PX8A 1IT0A 3L4YA 1V6YA 1GQJA 5AYBA 4AZIA 2ZX5A 2BV9A 2VZUA 3OGVA 2J47A 5A8MA 3NJ3A 1MFVA 5CZKA 1LL4A 4FLOA 1HNYA 1US2A 2VX4A 5ABFA 1EH9A 2CXGA 3WBEA 2BY2A 1ODZA 3IAQA 3RCNA 2YDSA 4UFHA 4OUEA 2WSKA 2CBUA 3EMQA 1NWTA 1J12A 1JFXA 1KWGA 3BXWA 1PBGA 5A6MA 2G4FA 7CGTA 4AZCA 3EDEA 1V02E 2WMIB 4Z2KA 5CSUA 3RJYA 1KB3A 4GO8A 3ZM8A 2VUYA 2CKRA 5DEZA 1Q6FA 4HPGA 3BAIA 5CLTA 2DSKA 4W86A 4F8XA 2JALA 3MANA 3SCOA 1DWJM 4J3SA 4CN1A 1Q6DA 4CD4A 3AOFA 2OYKA 1Q6CA 2E9BA 1GVYA 1NOWA 3ZSSA 1WO2A 3IJ9A 2O9PA 3I3DA 3VM5A 4CD8A 4DWSA 2XVLA 8CGTA 3ARUA 2GK1A 3GDBA 2VZTA 4D1IA 4PSPA 4QDMA 3W27A 2PC8A 3WNLA 3ZJ7A 1HXJA 2GSJA 3UERA 2WBKA 3MUAA 4S3KA 1V0MA 1E43A 4P7RA 3WEOA 1E4NA 5E6ZA 2VL4A 2DH3A 3DC0A 4BQ2A 3JUGA 4ATDA 5BYWA 2X0HA 1UR1A 2D3NA 1CBGA 4TTUA 3WMCA 4AEFA 2CBVA 1Q4NX 4PBGA 1HKIA 1E9LA 1FH9A 3VDBA 3II1A 1CXEA 3PTMA 2D0HA 4IUGA 3DYMA 4ZXLA 4J7RA 3GXIA 2B31A 2VR4A 1E40A 3AHYA 3VD9A 1FP8A 1XH2A 3N12A 2PWEA 1BYCA 1LWJA 3ARPA 4W87A 3MV11 1B30A 2VC9A 5I77A 2YBUA 3HU7A 1VFFA 5LA0A 3L2LA 3AXXA 1MQPA 3F5LA 3LPPA 3UG5A 3FXYA 2C8NA 3CHCA 3WELA 1P6WA 2PB1A 5EFDA 1PZ2A 1J0ZA 3CZJA 3U5UA 1V0NA 1JZ4A 1FOBA 3SUUA 5ABFB 1MFUA 4LX4A 5ABGA 1E5JA 2QHAA 1B90A 3WUFA 1ZBCA 1ISXA 2YA2A 4Z2LA 3VILA 3VM7A 1JDDA 2Y5EA 5CPTA 5LA1A 5A95A 1M01A 4JKKA 2WMGA 5JUVA 3CIVA 3HJEA 5CLWA 4D6CA 4W5ZA 1M04A 2VQTA 4W8AA 1TUXA 1BPLB 2WNWA 4TVCA 3EBVA 4PCSA 4J3WA 6TAAA 3A4WA 3OG2A 4AYSA 5IXEA 2Z1SA 3TONA 2WVTA 4PTMA 1PX4A 3GBEA 3AHTA 4PMRA 3SURA 8A3HA 4XV0A 5D8WA 3AZRA 3UR8A 4DWSB 1RP8A 2GK1B 3MU7A 5BRQA 1V3IA 4QLLA 4GXPA 3W29A 1RP9A 1LF1A 4GIAA 1JAKA 2GFTA 4ATWA 3BAWA 5FCZA 1RD6A 4GO9A 4H2CA 2F61A 4TVDA 3VGDA 3WNKA 3BCDA 1GVIA 1SFSA 1XCXA 2Y24A 1J01A 5DO8A 1OB0A 3M46A 1UQYA 2XG9A 4MTVA 3MSGA 5EMYA 2RGLA 2NW0A 2BXZA 2F8QA 3WH5A 1HT6A 4ML4A 5DF0A 4Z2GA 3WDRA 1HL8A 3CZ8A 2EQDA 4JFSA 1XRVA 1TCMA 2VCBA 6CGTA 2XM2A 5JBDA 1GQLA 4MNMA 2ESCA 1ZU8A 2WZIA 1NP2A 1LL6A 2J25A 1H2JA 4OZOA 3T2QA 1QI4A 4GI8A 1V02A 1XSKA 2Y4SA 4UFIA 4FLQA 2DSWA 4AEEA 1CZ1A 2UY4A 5HOSA 1UOKA 3L2MA 1J11A 4CD6A 4TUFA 2DT2A 2OYLA 1C3FA 1EO7A 3F5JA 4JL1A 3WD3A 2J7CA 4W88A 3TTOA 3WFZA 4W8LA 4MB5A 4FLRA 4OBRA 1K9EA 1K9DA 4AZBA 1BQCA 4AC1X 3WNOA 3AYSA 2EXOA 4OOUA 4HU0A 4AZGA 1CYGA 1G94A 3PZNA 4AY1A 1W9VA 1MQQA 1FP9A 4CVWA 2GJXB 1D7FA 1VBUA 2XVKA 5JIPA 1G01A 4U3CA 3T2PA 1W1PA 4PTWA 2WMHA 2DSUA 5BCAA 5LA2A 5E9AA 2D0GA 3KEHA 3VVGA 4GI9A 3WUBA 1LG1A 1AQHA 4UFJA 3VINA 1VJZA 4H8VA 1BG4A 4V28A 1MW2A 3AS1A 3HMCA 3VUPA 2GVYA 1E56A 1O6IA 3OLGA 1WZMA 4WIWA 1QI0A 3AMKA 1W3JA 5D9PA 5HBFA 1GZJA 3N18A 4AZHA 4AD3A 4AD5A 4AD1A 1QVBA 4GZJA 3QHMA 2Y8KA 1H09A 4HMEA 3A4AA 2EPLX 4Q22A 2BFGA 1BLIA 1FHLA 3QOKA 2G3IA 2YLLA 3PZTA 3RDKA 5KZ6A 4UQCA 4OOZA 4CCCA 2E4TA 3VGGA 2WWDA 1Q6EA 2PWFA 2QPUA 2X8RA 5CG0A 5BXRA 1C7TA 1OIFA 2DH2A 4KRTA 1G5AA 3WDPP 5A3HA 3SCSA 5C8BB 2PF0A 1LWHA 2EBNA 2EEXA 4M80A 1GJWA 5AC5A 3BSGA 2DIEA 2QV4A 1WZLA 2E8YA 2WHJA 1OT2A 1VBRA 4NZCA 4MNJA 4ACZA 4GZIA 3MO4A 5I79A 4DUXA 3OGSA 2DT3A 1D3CA 3OLIA 5D9NA 1OIMA 1ISZA 1GUVA 3EDKA 2GJRA 4B9YA 2CESA 3T08A 4WSKA 3K8MA 1BF2A 1BGAA 5HDRA 1V3KA 1PX3A 3PBGA 2WMKA 2ZX7A 4NRRA 2BXYA 3CLWA 2WK2A 4E4PA 1UR2A 4AZ7A 3W37A 3CPUA 5I2UA 3FHAA 3WQ6A 3EDFA 1OT1A 2G3MA 4KH2A 4WLCA 2XYLA 3T0BA 4MB3A 1X6LA 3OA5A 5A2BA 2BHYA 5I5RA 4KMQA 4ATLA 2ZUSA 1CLXA 3WDJA 4AD4A 1ZS2A 2WC3A 2HVMA 3ZSTA 3WDQA 1UD6A 4M56A 1QNOA 4DWSD 1KWKA 3T2OA 2ZUTA 2WBGA 4P7NA 3MMDA 1A47A 2O92A 2VZSA 1K9FA 3QGVA 1DEDA 1DTUA 5IHSA 1WB0A 1HJSA 3W53A 1OSEA 3WQ5A 2GUYA 1W2PA 1GOWA 3LPFA 1J0YA 4JKLA 2J75A 1V3MA 3ZJ8A 2DSZA 2VVNA 2W66A 5HPCA 1JL8A 3OGRA 3G6MA 4PYSA 4AMCA 1V0KA 3K8KA 4JAWA 1B3ZA 2EPMX 4BZYA 4FLSA 3CZEA 1K9TA 5FKYA 3AFBA 1JI1A 3OBAA 4MNLA 3VDAA 3THCA 1JXJA 2VURA 4XX6A 3ZR5A 3CMJA 3BAXA 2IXUA 4JFVA 2OSXA 1BVZA 3OIHA 3VIMA 4MNKA 2V5CA 2Y2WA 2WW5A 1JYNA 1E6XM 3SCPA 3N1AA 3ECQA 1EQPA 4ACZB 1R7AA 1CWYA 1CXLA 2BS9A 4JL2A 4J3XA 1GQIA 2JF7A 2CBIA 4MADA 3CUHA 4LYPA 1W9DM 2FHCA 4X9YA 3AMGA 3RM4A 1JZ8A 2VCAA 1BYDA 2XM1A 3GNOA 1WAWA 4L4PA 4XZBA 3W0KA 4F9DA 1MWOA 3EMZA 5FOOA 1UWRA 2YL8A 3ALGA 3WUEA 1HVXA 4TTGA 4CU6A 5ABEA 5C70A 2CYGA 4Q7NA 1J9YA 4PUDA 3UG3A 1W32A 2YL5A 4JCLA 4PMVA 4ZXOA 5GPRA 1XC6A 3B9EA 2XWEA 2EO7A 2EPNA 1MVYA 3BC9A 1HF6A 4PUEA 2VJXA 1SMAA 2FDMA 5M17A 4AD0A 1W2VA 2JIWA 2UY5A 3MKKA 3VMPA 1EO5A 1UR8A 3L4XA 1NWUA 4E8CA 1HL9A 5A8OA 4GQRA 4CUCA 1MYRA 2DT1A 3FW6A 3CHDA 1GPFA 1M53A 3ARSA 4PMXA 5A2AA 3U57A 3WSUA 5A6LA 1J0KA 2J8FA 5IHRA 3W26A 1WDSA 2ZUNA 2V3DA 3BH4A 3GXDA 3WH9A 1ZJBA 3MMUA 3BGAA 1ZB5A 1W1TA 3T0AA 1J0JA 3UETA 3ARXA 1PIFA 3GZAA 4C7DA 2PWHA 4B3KA 4HPHA 3GYCA 1KFWA 1UWQA 4JFTA 2XSAA 1UD8A 2ZXBA 1W9BM 1UZ4A 1LJYA 1E3ZA 1XD0A 1E73M 2D23A 2FH6A 4H7VA 2OWWA 2V38A 2YL9A 1E70M 3VD4A 4H04A 4AXNA 1BAGA 3ARZA 4HA1A 1GOKA 4H8HA 1B0IA 3S2CA 1GHRA 3POHA 3AXIA 1QI2A 5AYIA 3I3EA 1X6NA 2VTFA 2OWXA 3VIKA 3MSDA 4UFLA 3U7VA 2QMJA 3MUZ1 1B3VA 2QLYA 3WH8A 4ZEPA 4U2ZA 2OWCA 5EFFA 1BYBA 3BSHA 2JF6A 1VRXA 1HKMA 2VR5A 4J28A 4BF7A 3ARWA 2DGAA 2PWGA 1NWSA 2WANA 1UH3A 2ZUWA 3N15A 1E6NA 2XJ7A 2J78A 2CIPA 3RM9A 1S46A 3DHUA 3WF1A 2JIEA 4D6JA 1V08A 3LMYA 4TX6A 3UCQA 3AMLA 3FY1A 2WB5A 1NWRA 3W24A 3W25A 1NH6A 4GINA 4E8DA 2ZUUA 5IFTA 1GORA 4AWEA 5A6KA 3PZVA 3ZO9A 4M29A 1WPCA 1TVPA 1E0WA 4HZ8A 4LYQA 3AS0A 2VRQA 3AIRA 5DT7A 1E6SM 4KWUA 1XH0A 1HP4A 3SCVA 5FL0A 5I24A 3VIPA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2CKRA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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