3W7K | Genus

Total Genus 107

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	107
sequence length	313
structure length	313
Chain Sequence	MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with MII-6-066 rcsb
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Trypanosoma cruzi
total genus	107
structure length	313
sequence length	313
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2013-02-28

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	3w7kA02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3w7kA01

1Q6QA 4UNKA 3LCWA 3HPSA 5LGZA 4BF9A 1LCOA 2ZTJA 3C8FA 1AK5A 1TTQA 1E51A 3U8GA 3NQMA 4QIUA 1G7UA 4OBTA 4JEQA 3UY7A 2QR6A 2DZVA 1R30A 4AH7A 3P82A 3T78A 2H3BA 4MZ1A 4I7VA 4UTJA 3MP5A 2E6FA 1DJNA 1W1ZA 4CNNA 4ORIA 1LBLA 2NZLA 2ISVA 4MFEA 3G1FA 3EB2A 2FFCA 5KINA 3LX9A 2B4GA 3FIGA 3O07A 2DZXA 2Q8LA 4A3UA 3B0UX 3EKLA 2E6AA 2XN1A 4NXSA 4IMDA 3GZ3A 3LERA 2BTMA 2C13A 4DBDA 2PURA 3NL2A 4CNPA 2X1UA 1YXYA 1OK4A 3N2XA 3RK8A 1M5WA 1KBIA 3I7SA 3C56A 4N9BA 2C6QA 2Y62A 3C52A 3UXDA 1VYSX 3WK3A 2V0TA 4N4QA 3TIMA 1YPIA 3HG2A 2G97A 3NQVA 1MXSA 4JN6A 4CCEA 3TROA 1XDLA 1FWRA 4EWND 1QMLA 4HNTA 1QAPA 3QYQA 1ML1A 1MEWA 3LHZA 1EB3A 4CQ8A 4K8EA 5D09A 5I3JA 1TPFA 1GJPA 3TC7A 4O19A 2QCLA 2J24A 1J2WA 4NJHA 1W3NA 2X1TA 3TH6A 4O1AA 1YTDA 4M6QA 1A5BA 3R89A 2CW6A 1WA3A 1UCWA 3B04A 2VXNA 2V2CA 5CSSA 1DVJA 4WXZA 3GR7A 2A7RA 1KM4A 4MY1A 2JKPA 3HIJA 5LGXA 3NM1A 3DBPA 1AW5A 1EP1A 4RJEA 5FF0A 2B7OA 3C4UA 4A29A 4UR8A 4FXRA 3LTSA 3EX4A 3GDLA 3P8JA 2Z0IA 4PA8A 2QEZA 5DN1A 1VCFA 2NX9A 3NQ7A 5F4SA 4FNTA 2QCNA 1SFJA 4RR4A 3OBKA 4MYAA 1GTHA 4QJ1A 1Q6OA 5AYYA 3C2RA 2FIQA 4JGDA 3NZRA 1DKWA 4A2RA 5KZDA 1KM0A 2YFNA 3CEUA 3L0GA 4XQ6A 4LVFA 3UWWA 3EX2A 2WNQA 1TJRA 2LLEA 3IVSA 1XL9A 3BG5A 3W7RA 4IGHA 4RZ5A 3K30A 3NPUA 5LNRA 1XFBA 1A5AA 1U83A 4DPPA 1Q6RA 4BI6A 3BW4A 3MI6A 2ABBA 3N14A 4GJ1A 3W7HA 4LRTA 3I65A 4K7YA 3DENA 3M43A 1GG0A 1B3OA 1ZAHA 3IIOA 5CKSA 4PTNA 3ANYA 3M5ZA 4XBSA 2ATSA 4K7VA 1W5MA 2UV8G 1KM6A 4WOQA 3IIPA 1O5XA 3C61A 2EHHA 3NNTA 1RQHA 1JCLA 3LTPA 3QPYA 4HHPA 4UTHA 2DORA 4FB7A 4WJEA 1HG3A 3KFTA 3W7CA 1JUKA 1BWLA 2YXGA 4FF7A 3KHJA 4O1DA 3GYEA 2J6XA 1SZGA 2DZTA 2ZA3A 3W1AA 1FCQA 4Z1AA 4IXXA 2B7PA 3LXBA 5AHNA 1VLWA 3OVRA 5C54A 1YXCA 7TIMA 1IXOA 1SR9A 1ZCOA 2B7QA 4AWTA 2DZPA 3HGSA 1ME7A 4PC8A 3QZEA 2I9EA 2Y7DA 1X6UA 3CT7A 1PIIA 1PL9A 2JK2A 1KFJA 4ALDA 3W76A 1TQJA 3P67A 3PM6A 1YXDA 3ZWSA 1ADOA 1FDYA 1QO2A 4ML9A 3NG3A 2RDTA 2WQPA 1CI1A 4D2JA 1JR1A 1HO4A 3BLEA 4UMCA 1DBTA 4O52A 1IXPA 4TX9A 5DBTA 3S0CA 5K9XA 1NVMA 3FLUA 5H91A 1KM2A 3PB2A 1TPC1 1KTCA 2V81A 4IPIA 2B0MA 4E2DA 2FB2A 4DO6A 3BGGA 2Z6IA 4MIMA 4XTDA 2FJKA 3LRKA 2J9XA 4O50A 3USBA 2Y6ZA 1IGSA 2GQ9A 3QH2A 4O14A 4KWWA 4EF9A 3VE9A 4Z0SA 5K3VA 2CU0A 4PCFA 4XBKA 3G8EA 4DXVA 5LSMA 5U4NA 3L65A 2ZZ2A 1PCWA 1KTBA 1IIGA 1YDNA 2ISSA 3W7LA 5CPOA 2ZRXA 3DFTA 3R12A 2GQ8A 2OJPA 4MPQA 2NX1A 3T44A 1A50A 1JRBA 3U2OA 2ISWA 1TRDA 5I3GA 3W7OA 4YXGA 1DL3A 2GVLA 3WJYA 2WV8A 1WXJA 3BPWA 2R91A 1TPH1 4RZ6A 3S1VA 3O06A 1YDOA 4C1LA 1GYLA 3NR0A 4JY8A 4UNLA 5HQEA 3S1XA 2NXGA 1W3TA 2Y89A 4RX0A 1TTJA 1L6YA 2P0OA 4UFMA 2J9YA 1W8SA 2EAWA 3JS3A 4LOCA 1W3IA 3TSMA 3W72A 3LOTA 4I7UA 4WZHA 4O4VA 1N55A 5G4WA 2Z6JA 1Q3NA 3HB9A 1OFOA 1KM1A 1TMHA 2OT0A 1JCJA 1ZY9A 1B4EA 2WNNA 3GK0A 2E5DA 3V75A 3DHFA 1SZEA 2A1YA 3LGEA 5F2LA 2TSYA 4AXKA 1ZALA 2FB3A 5D2TA 3SI9A 3M6YA 3O6CA 4LV9A 3S9YA 1VS1A 4N2YA 1UBSA 4IX0A 2BX7A 1L2UA 2NV2A 3NM3A 4HT3A 1QOQA 3BGJA 3L67A 4KFNA 2QJHA 3NAVA 1VCVA 3E96A 1L9WA 2OT1A 3W7JA 3M1ZA 4Y9AA 1I2OA 2VFEA 3I7QA 5F4XA 3NDOA 3OHIA 2ZA1A 3GAKA 4JYEA 3S1WA 1N8FA 4O8RA 4QISA 2YX0A 3L0KA 2W0UA 3EWYA 3DI0A 2W79A 2C14A 3CIWA 4UTWA 5K4XA 1QWGA 2E77A 3CU2A 4OT7A 5I3FA 1ZFJA 1EIXA 3E9AA 1R46A 1QO5A 1OFPA 1PE1A 3G22A 1OYCA 1AL8A 3M41A 3UWVA 2H6RA 3NQAA 4CQAA 4FX7A 3HJZA 3WJSA 2EPHA 4QQ3A 3N9RA 3TSBA 3W07A 1SO5A 1FWNA 1K8XA 1KBJA 5D2WA 4LNYA 1DQWA 1SW0A 1XI3A 2CLKA 2OCZA 1RD5A 4GUIA 2V2HA 4ADSA 3NEVA 1D3GA 2WOQA 3MMTA 4ZQCA 3I7RA 2CLEA 3EWWA 4NVTA 3NQ8A 3PG8A 2Y63A 3D0CA 3GNDA 4PH6A 2QKFA 2AAMA 3B06A 3BLFA 1KA9F 3DKJA 4PODA 3F4NA 3CHVA 3KRSA 2QDGA 1JUBA 3CM4A 4RK8A 4BI5A 3TJLA 3DFOA 1SO3A 3M5VA 1OYAA 1YADA 1OFRA 3STCA 3NO5A 4BWLC 4OQVA 3MHGA 1J4EA 4IX2A 4LTSA 2A21A 3TKFA 1OFQA 4BWLA 3SW6A 4DELA 5FF3A 1PCKA 1YPFA 1G69A 1W56A 2V5BA 1XCFA 5F2IA 3EX3A 5LKYA 3HGOA 4LW7A 3PBWA 2VFDA 1TV5A 2CLIA 1ZHAA 2D73A 5FEXA 5LHEA 3G3MA 1W54A 3HPXA 4KFOA 3KVLA 3C0JA 4NXKA 1UUOA 3P62A 4UFKA 5AN7A 2DP3A 4LS1A 1TTPA 4Y90A 4N9CA 1OX6A 3YPIA 2C18A 3L2IA 2Y7GA 4YLWA 1VC4A 1OX4B 1NF0A 3N19B 1J5TA 4TMBA 1X7FA 1I2RA 3Q37A 4QITA 1QPQA 4TR9A 4UTUA 2QCMA 1JQVA 4FIQA 1F05A 3LCFA 3LCGA 3H54A 2VFIA 3E49A 3ABRA 1JJKA 1G4PA 4OV9A 3RLUA 3KRZA 3W88A 4HNNA 4M6VA 1BTMA 4JTJA 3INPA 5BMXA 5D2XA 1EUNA 1RZMA 2J27A 3GX9A 3KAOA 3G1VA 4JD4A 3C6CA 4HNUA 3GDRA 4PL1A 3A21A 4ADUA 3W7PA 1OF6A 5EMUA 1FDJA 5DY2A 3LM7A 3W74A 3O15A 2VKZG 3PG9A 2CZ5A 2RH9A 1BEUA 5G2IA 2V2DA 3I6RA 2H8ZA 4P2VA 3NPXA 2CLHA 3QC3A 5AYZA 3HG4A 3CWNA 2NV1A 3LHYA 1RVGA 2JBMA 3FJ6A 3LBMA 1TV8A 4H6KA 4K36A 3GR8A 2G96A 3TMLA 1NSJA 1H60A 4GUJA 4IWWA 2J9ZA 5LZLA 1XKYA 2O7SA 1WAUA 1AL7A 4Z0JA 1H5YA 3DHDA 2NLIA 3MWAA 1LZOA 3W7MA 3NPWA 1JULA 4GXMA 1KLZA 3W6YA 4E2BA 1QPNA 1G67A 4IMGA 5I3IA 1L6WA 3W84A 1O5KA 3L5MA 1QDSA 4BR1A 5G4EA 4LS0A 2J88A 4S2CA 1T96A 2NWSA 5CZ0A 2TRSA 4DO5A 3W1MA 3PBUA 2X2GA 3UWUA 1P4CA 4J9JA 3E02A 1H61A 3O6YX 3P81A 2FQIA 1LOSA 1TTIA 4LU0A 3TXVA 4EOUA 4HNVA 1SUXA 4JDYA 4DQWA 1KFLA 3CIXA 1QCWA 2NUWA 5EYWA 3DAQA 1XUUA 4RV8A 1WQ5A 2RHGA 1OFBA 1BWKA 1FY6A 1ME8A 2V5LA 3BG9A 4WY0A 1YLVA 4OU1A 4DF1A 3GDKA 4AMAA 2XN2A 3PS7A 5DELA 2P10A 3MHFA 5D38A 1AW2A 1B9BA 1H1YA 4UUIA 5I3HA 4A2SA 2A0NA 3JR2A 1LP6A 4QSHA 3ZR4A 5FF7A 4O11A 3PUEA 3PF3A 4JNMA 5EL1A 5G2HA 4ADTA 3TFCA 4K39A 3C2EA 3GDMA 2WSYA 4HPJA 1TYGA 2XN0A 4O57A 3OEXA 4DBEA 1V5XA 3QQ1A 4FNPA 5KMYA 3T7VA 3STEA 3N9SA 3CPRA 4JTHA 3G1YA 5KTLA 2A2IA 2QUTA 4NJJA 1AMKA 1PHWA 3TNOA 2BLEA 4DO4A 5HUOA 1GWJA 4FX8A 2C16A 2Y85A 6TIMA 1OK6A 2OMAA 4X3ZA 1V7YA 1FXQA 3ABOA 3ATYA 4UTTA 2YYUA 3SGUA 5G2WA 3FYOA 3HO8A 1AG1O 1SZNA 1TIMA 4X9SA 4EVZA 1K03A 1LOQA 3BVJA 1RR2A 3W7NA 4JTTA 4OGZA 4ZQPA 3W1PA 1JCMP 1F73A 1RV8A 4ZVJA 1QFEA 1XXXA 3GKFA 2B7NA 3MI2A 4N02A 4PL2A 5H2ZA 3G3DA 4TIMA 2V9DA 3W7KA 1OX5A 1VGAA 3CLMA 4GBUA 3VCRA 2ZRVA 3FYPA 2PC4A 3STFA 3MBDA 1H50A 1S5VA 2VFGA 2Q3OA 2ZFAA 3BW3A 4JICA 2BWGA 1TB3A 2CLFA 5D2YA 2CZEA 3PSWA 1DORA 1MO0A 5D04C 4CNOA 1GOXA 2R8WA 5CZSA 3MUXA 5HMSA 3KX6A 3LCHA 3B4UA 1JRCA 3MP3A 4UFHA 4DF0A 1G4TA 4Y96A 2ZRZA 3IEBA 3PB0A 1LDCA 4H4IA 2WSRA 3HGRA 2R94A 2QCDA 3HQ1A 3TU9A 1H7XA 1ALDA 1RQBA 1GEQA 1F6PA 3LDVA 1Z41A 1WDWA 2ZDRA 4JX5A 3L66A 4NJIA 3WFAA 3BK0A 3QFEA 1GVFA 4POCA 3W7GA 3QMRA 3W23A 1L6SA 3CC1A 3OG3A 3ATZA 1WV2A 2GJNA 4AAJA 2CWNA 3UWYA 3PBVA 3W1QA 1U5JA 3G0SA 1O4UA 4NQ1A 2F84A 4LS2A 5D32A 1W0MA 4IMFA 2A7PA 1KV5A 2ZTKA 4JTFA 3QMSA 5DBUA 1FWWA 3ZS4A 1TPWA 1FXPA 3M5YA 4O10A 3W2LA 3SJ3A 1GVSA 5HWMA 3IIXA 4FEZA 1W5NA 2C15A 3O63A 3NQCA 1H7PA 3LLFA 3R8RA 3W86A 3W87A 2JGQA 5BRBA 3O16A 4NT0A 1OX4A 4MVAA 2C19A 5F1VA 1KFCA 3BO9A 3TDFA 3FFSA 4S1FA 4AF0A 1WBJA 2E09A 3QW3A 3DGRA 4O12A 5F1UA 5K2ZA 4NU7A 3EWBX 2ZZ7A 3P8IA 1Y0EA 3DXIA 3QPZA 4JX4A 1OVDA 1P0NA 3TXZA 4QAIA 4AHQA 3LBCA 4GC4A 1OFAA 2V30A 3KOFA 5FESA 3QW4B 1VHNA 4LUJA 4RXFA 2GQAA 2QF7A 2YDAA 5AYXA 3QM3A 4XKYA 1PV8A 3P61A 4IMEA 1F74A 1EA0A 6ALDA 2FPTA 3TCEA 5DXYA 1UB3A 3A5FA 4OV4A 1YDVA 3RU6A 3NA8A 3G1AA 3EXRA 3T4CA 4YL2A 4JYDA 3W2NA 5CSRA 1R2SA 4GWEA 2GPTA 4Q33A 1G4EA 3QF0A 2RDUA 1YTKA 5KSWA 1ICPA 1TQXA 3NQ6A 4GUHA 3P7YA 5HWJA 8TIMA 2CLOA 2GJLA 1S5TA 3BLIA 1F7BA 1PS9A 4FHAA 1EPXA 1WBHA 2NXHA 4O0ZA 4FXSA 1M7OA 3WJXA 5CG7A 5A5WA 1PHQA 3QQ0A 3UPWA 3LXAA 3GIYA 4CQ9A 2QJIA 2BZNA 3CWOX 1KW1A 3G18A 2RKXA 3LXCA 2VEPA 4ZQRA 3OVQA 2DJLA 3CB8A 4ZMGA 1T8XA 2WJZA 5KZMA 4WY0B 1UASA 4LC6A 2BSLA 3SFKA 3H55A 2QUVA 2I14A 1UUMA 4X2RA 1OYBA 4NUWA 3MW7A 1KFEA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3W7KA

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