3MUIA

Enzyme-substrate interactions of ixt6, the intracellular xylanase of g. stearothermophilus.
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
NSSLPSLRDVFANDFRIGAAVNPVTIEMQKQLLIDHVNSITAENHMKFEHLQPEEGKFTFQEADRIVDFACSHRMAVRGHTLVWHNQTPDWVFQDGQGHFVSRDVLLERMKCHISTVVRRYKGKIYCWDVINEAVADEGDELLRPSKWRQIIGDDFMEQAFLYAYEADPDALLFYNDYNECFPEKREKIFALVKSLRDKGIPIHGIGMQAHWSLTRPSLDEIRAAIERYASLGVVLHITALDVSMFEFHDRRTDLAAPTSEMIERQAERYGQIFALFKEYRDVIQSVTFWGIADDHTWLDNFPVHGRKNWPLLFDEQHKPKPAFWRAVSV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Geobacillus stearothermophilus
publication title Enzyme-Substrate interactions of IXT6, the intracellular xylanase of G. stearothermophilus.
rcsb
molecule keywords Xylanase
total genus 129
structure length 330
sequence length 330
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2010-05-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3muiA00
2NW0A 3BSHA 2BNJA 2J4GA 3AIQA 4DWSD 1UG6A 2B31A 1V0KA 3G6LA 2WMHA 2V5CA 3OLDA 2F61A 1D2KA 4LYQA 1JF6A 3OLIA 3ARSA 1V3IA 4U2YA 4ACYA 4TTGA 4UZUA 1H09A 1W3LA 2WBGA 5CGMA 4HU8A 3D5HA 4FLOA 4W89A 1CXLA 4MNMA 1GHSA 3GXDA 4BA0A 1H4PA 3EYPA 1E55A 5A2BA 1E9LA 1V3HA 1UZ4A 2AOSA 2WYSA 4NSBA 2Y2WA 3ARZA 2XIIA 4D6EA 1JF5A 2XFFA 3ARVA 3K1DA 4PMUA 1GOOA 1RH9A 1L0PA 2Y4SA 1E5NA 4QCEA 5M3WA 2E9LA 3NJ3A 2D0FA 4DWSA 4KMQA 2WHMA 3ZJ8A 1UOKA 2IXUA 3OZOA 1OCQA 2XIBA 4PMNA 2JE8A 4N42A 1UWRA 3BCFA 1BYAA 2QMJA 4BQ4A 1G1YA 5CG0A 1LL7A 2WC4A 3LPFA 2VTFA 4PN2A 1DWJM 5I77A 3KEHA 1PEZA 4HA4A 1KGXA 1PX4A 2A3CA 1VFOA 2XPKA 1X6NA 1G94A 1WPCA 2OWWA 2ZXBA 3WF1A 2VQTA 4U3CA 4K68A 2WCGA 3K4AA 1IV8A 4WJXA 1K9TA 1QW9A 1R7AA 8A3HA 1BVNP 2ZICA 3ZSSA 1JXJA 3RO8A 4AZIA 3WEOA 4AYSA 4P7RA 3SCWA 2EO7A 2VRKA 3RCNA 4PBGA 2WMIB 3OLEA 2PBOA 1MQPA 5I78A 2XM2A 1NARA 1E43A 1YHTA 3VIJA 3D3AA 4WK9A 1FA2A 1GPFA 5DF0A 4XX6A 2J47A 3L4TA 3ZJKA 3VGDA 2VMFA 3RM8A 4MDPA 3MUZ1 3AIEA 1EA9C 2VX5A 3WY1A 1LWHA 1D7FA 4YN5A 3T2OA 1QHZA 4AW7A 1QNRA 4AD0A 2VI0A 1BYBA 1QI5A 1GQIA 3F4VA 1XSKA 2NSXA 2A3BA 3NYDA 5EFDA 1E73M 2J75A 4CD7A 1GW1A 2V3GA 4LQ1A 4GXPA 3SCOA 2VQUA 1VJZA 1BTCA 2GJRA 1FHLA 3B8SA 1ZJBA 2CPUA 1RD6A 2WCSA 5E6YA 3MV11 4IISA 4AMCA 4H41A 1WB0A 3AIWA 2FDMA 3VDAA 3WNKA 4GZEA 3T0DA 1SR0A 1Q6CA 1M7XA 3MMDA 5BRPA 1R86A 2BY0A 3KWXA 2QF8A 2QPUA 4EAMA 5AC4A 2QPSA 3VMPA 3AMKA 3WKZA 3U5UA 2ZXAA 3WD1A 1E1EA 3BXWA 4RL3A 3WSUA 1JI1A 1Q6GA 1DP0A 4AD5A 2CKRA 5BWFA 3CMGA 2D20A 2WVSA 4QP0A 3M07A 1TG7A 1GQKA 3K46A 3NDZA 3TTOA 4CCDA 1V3JA 2EBNA 4J27A 4D71A 3WD2A 2V38A 3OGVA 2EPKX 1FFRA 4AD4A 5A94A 1C8YA 3DECA 4IM4A 4JFUA 3U57A 3MSGA 3WDHA 5JBEA 4U3AA 3CHDA 3WF2A 2QHAA 1GOKA 5I79A 2VZOA 5I3DA 1I1XA 4ACZA 2DSUA 3VGGA 1HJUA 3PZIA 2YA1A 4XZWA 4AXNA 2O9OA 3POHA 4F9JA 3TOPA 2W66A 2VX7A 3F5JA 1NM9A 1NWSA 3IK2A 2CYGA 1TA3B 2BHZA 5IXEA 4R27A 5LA0A 2XVKA 1QVBA 4PTXA 2OWXA 3IJ8A 3I3EA 1W9PA 5CQ1A 2BVTA 2J7GA 2ZOXA 4PMXA 3L4VA 2WHKA 1J11A 3M6DA 1ISXA 5I24A 4OBRA 4PCSA 1MYRA 2ZX7A 3GXMA 3RMEA 1JZ8A 4DUXA 1MVYA 4UQBA 1FP9A 1UKSA 2DIEA 5D9OA 1C92A 1B2YA 1NWUA 1HNYA 2ESCA 2J7FA 3EDEA 2WZHA 3GBDA 3UG4A 3GH7A 4WSJA 3EMCA 4JIEA 3S2CA 1UA7A 1B1YA 1BG9A 1B31A 2YDSA 4W88A 1RPKA 1MQRA 2D2OA 2C8NA 2EJ1A 4CVWA 4OZOA 1E4MM 1W9VA 1HJSA 4AD2A 4D1IA 4FF5A 1F4HA 1XH1A 4JFWA 4L4OA 4CD5A 3SCRA 4D6DA 2JF7A 2CBVA 1X1NA 5JBFA 3CLWA 2GDVA 3W29A 4MB1A 3PZQA 1I75A 1KFWA 5CPTA 2IXVA 1Y7VA 2E9MA 1WZMA 2YL6A 1LJYA 3WNOA 4MB5A 2XVNA 1ESWA 1KWGA 5AYIA 5CPSA 4TVDA 2BV9A 2CXGA 2W4XA 3DYOA 2DT3A 2WLYA 3VIGA 4LX4A 3M46A 3KL0A 1B3VA 5FD0A 4HZ8A 2JIWA 1V6UA 4DUWA 5C70A 2ZUUA 2DQXA 3MUAA 5BXSA 3ARXA 4DUVA 2VR5A 1EHNA 2GK1A 4AZHA 1QHPA 1C91A 1V6VA 1B90A 4ATLA 3NDYA 5TD4A 2YA2A 1B30A 1ZBVA 1CXIA 1LG1A 1OGBA 3L2LA 4QDMA 3CZKA 3CHCA 5D8WA 1WZKA 1GQLA 4ZXLA 3L4XA 3THDA 3WQ4A 1HKJA 1CECA 4JKLA 5E09A 2CITA 2BVYA 3VIKA 5E9AA 1DWHM 2D24A 1ZBCA 3POCA 2W92A 2W62A 4PRWA 1CGXA 4X0VA 3TTQA 1VBUA 5DEZA 1H3GA 3J7HA 4V27A 5EMYA 3WUEA 1I1WA 1ITCA 4E2OA 5CSUA 4DWSB 2VVSA 4Z2IA 2J7BA 4CN1A 1GOWA 1A3HA 1ZU8A 4C7GA 1WAWA 1C7TA 3DYPA 4JHOA 3VINA 1EOKA 3UG3A 5FOOA 3HJEA 1TCMA 2YIHA 1XYZA 3IAPA 1JYNA 1XSJA 3WH6A 4D6GA 4JKMA 3W0KA 1JYWA 3VD7A 1RP9A 3AYSA 3VIOA 3A4AA 3VM7A 1HL8A 5BXRA 4JFSA 1DWGM 3BLKA 3CPUA 1ODZA 2WSKA 4HOXA 5BXPA 2WKGA 1M04A 2Z1KA 1OINA 4EE9A 1KXHA 4CGTA 1UWSA 1CPUA 3K4DA 4LYPA 1NQ6A 3BAKA 3VTRA 2XG9A 4WSKA 2FHBA 4M24A 3EBVA 1BHGA 2WBKA 2VRQA 4N0RA 4TX8A 4AIUA 4NZCA 1QPKA 1HVXA 3VIPA 2EPOA 1Q4NX 2V3DA 3PTKA 1VFFA 1B3WA 4OOUA 3OIHA 1W91A 4MADA 3ARRA 2XWDA 2DT1A 3BCDA 2FH6A 3BAWA 3VIHA 4Z2LA 1M03A 2X0YA 3UR8A 5I2UA 1GNXA 3OGRA 2VZUA 2VCCA 1XH0A 1V0NA 5F7UA 1WO2A 1US2A 1F4AA 2UY4A 2WHJA 2ZUSA 3ARQA 2YDRA 5AY7A 4MDOA 4PMOA 3T08A 1MW2A 4AEFA 2WKLA 2YOCA 4W93A 1X6LA 5BCAA 2ZE0A 4W7UA 4LXFA 2G3NA 5A6SA 3CHFA 1B3XA 4ATDA 1SYTA 3PZTA 2BFGA 1UYQA 3AZSA 3AMDA 3SCUA 2XGIA 1AQMA 4NF7A 2G41A 1LG2A 3UG5A 5CJ5A 1ZS2A 1CXFA 2VO5A 3VGEA 2GJXB 2ZWZA 1VRXA 4Z2JA 1J12A 3WDJA 4W8LA 2XHYA 3PZVA 1FP8A 2VVNA 5C8BB 1CLXA 4MNLA 3WBAA 1HJXA 3WDRA 2A3EA 1E1FA 1SMAA 5GQBA 2HVMA 4D6HA 2QV4A 4J7RA 1A47A 4JKKA 1UHVA 1CGYA 4UZSA 4CKQA 2J78A 2J77A 3WQ8A 3GXIA 2EPMX 3GNRA 4M81A 2UY5A 2WMKA 4WKAA 2BVDA 2VURA 3VUPA 1E6ZA 1V03A 1CGTA 3FXYA 2BXZA 2FHFA 1JD9A 2D0HA 2Y8VA 3BGAA 4D1JA 3AIRA 4ACZB 4W7VA 3AXIA 1GUVA 1HXJA 3B9EA 3DHPA 4ZXOA 1GONA 4QFUA 3CBWA 1O6IA 1CENA 1Q6FA 1H2JA 4PMZA 4W87A 3W24A 5IHRA 1BF2A 1LL6A 3AXHA 4JCLA 2C0HA 5M5DA 3A3HA 2W61A 4P8XA 1EHAA 2YL9A 4HP5A 4P7OA 4P8WA 1DWFM 2GJPA 1QBAA 4ZENA 1UWUA 1WP6A 4UFKA 1CNVA 1E72M 1US3A 2VX4A 3UR7A 3CUFA 3VGHA 4JL1A 1E4IA 2CKSA 2VZVA 1EQPA 1EO5A 3EDKA 1UH4A 2W63A 4GZIA 1H0GA 3WH5A 1DHKA 4MAZA 3L4WA 3SCPA 3AZRA 3W28A 4YHEA 2D1ZA 1CTNA 1JG9A 1NWRA 2PWGA 2WAGA 1UD2A 2YLLA 5E0FA 4AZBA 4M1RA 4PYSA 2PWEA 1E6XM 1TVNA 1XHGA 4ZE5A 1J0HA 1MFUA 4F79A 1ZBKA 1OT2A 3W81A 3VO0A 2ZUWA 2ZWYA 2QLYA 2PI6A 1GQJA 1JZ4A 2CCRA 3WFLA 1XSIA 1PBGA 3ZM8A 4UQ9A 3AI0A 2GDUA 4KRTA 1EDTA 1JZ3A 3WQVA 5GPRA 1JIBA 4BQ3A 1QNSA 2WMJA 3FAXA 3CTTA 3WH8A 2G3IA 2ZUNA 4OOZA 3SUSA 3CGTA 1E15A 4C7FA 5D8ZA 2AMGA 4CCEA 1HIZA 3AS2A 3W6MA 1JXKA 1N82A 4TUFA 1DWAM 1EDGA 3WUGA 3AS1A 5GNYA 4KWUA 2JEQA 2OLHA 3TP4A 4U2ZA 5A8OA 3K8LA 3N17A 2Y24A 1KQYA 2GK1B 4FLSA 5A6AA 3PHAA 2ZUVA 4W85A 2E8YA 3AIBA 1MW1A 4D6CA 4MNJA 3RDKA 2YJQA 4PUDA 3RJXA 5KEZA 3ARUA 4HTYA 2ZX9A 2VUYA 1KWKA 3G6MA 4W84A 7TAAA 5A1AA 4D6JA 6TAAA 3O9NA 2PWHA 3NSMA 1JAEA 1VIWA 4Q22A 2ZUTA 4W5UA 2GUYA 5A95A 4MNKA 1W3HA 7CGTA 1GCYA 1ISWA 2XVLA 2VRJA 2OYMA 5DT5A 3UESA 2XVGA 5FCZA 4A3YA 3GBEA 3NUKA 5D9PA 1TFVA 2PWDA 1H5VA 3MV01 2G3MA 1NWTA 3ZMRA 4NRRA 3RJYA 5I23A 4TVCA 3WUFA 3ZO9A 3U7VA 5CZKA 1FH8A 1C3FA 1OIMA 3BAIA 1V6WA 4UR9A 3QGVA 3AMCA 5HDRA 3AQUA 2C7FA 3FNDA 1QNPA 2XFYA 3ARWA 1UH3A 4MAVA 3NIYA 3LPGA 1W3JA 2DEPA 1E6RA 3IANA 4ATWA 4WKFA 1FOBA 1V3KA 5CLTA 1K6AA 5JIWA 1OGGA 1K9EA 1VFUA 4CU7A 3KE0A 2W67A 2HISA 1FHDA 1LWJA 4UQEA 1WCGA 4TXEA 3WFZA 3OGSA 1H41A 1UR0A 3II1A 3WELA 2JF6A 1XRVA 2EEXA 1W32A 1JYVA 4J3WA 3W4RA 3WEMA 1W2VA 4PMVA 4TVUA 1UR1A 3SUWA 1HKKA 2WMGA 5I0DA 4FMVA 1OT1A 3VD5A 4UFLA 1E0VA 3W37A 4OUEA 4LYRA 2F8QA 1PZ3A 3WH7A 3VX0A 1E4LA 2E0PA 4UQAA 1QI2A 1CGVA 1EIBA 1CGUA 1PAMA 3MANA 3WQ5A 1UR8A 2VT0A 1QW8A 3AHXA 5A6KA 3WD4A 4BQ5A 4PUEA 4HU0A 3VGFA 3F5KA 3MMUA 3BMWA 1E0XA 1U33A 3IAQA 1OBAA 1HP4A 1BLIA 5BRQA 2XFRA 4E8CA 4F9DA 1VEMA 3CZLA 2FGZA 1BG4A 1S46A 1UKPA 2XSBA 4DM2A 3F5LA 3LPOA 3AMLA 1VB9A 3CUJA 5A6JA 5A2CA 5EBAA 4EKJA 4B9YA 2V3FA 1JNEA 3NSXA 3ZR5A 2GSJA 3DHUA 1UR2A 1MW0A 1HVQA 1E6NA 2A3HA 4H8VA 3WN6A 1KXVA 1V0MA 1QI3A 1UA3A 3N12A 4JZ5A 4J3UA 5HXMA 4MTVA 1ZL1A 4B3KA 4UOJA 1HX0A 3SCSA 3BAJA 1J9YA 3VX1A 2CNCA 1WDSA 4CU8A 1EO7A 1NOUA 1B0IA 4IUGA 4UFJA 3ZSTA 5M03A 3WDPP 1JL8A 4X0NA 4GO8A 2CHNA 1NH6A 1H0IA 1QI0A 4AD1A 1V0LA 3ZR6A 3O6AA 1JAKA 4M29A 3SEPA 4AY1A 4BQ2A 1UD3A 3PBGA 3VMOA 2JIEA 2D23A 2WC3A 4JHZA 1QI4A 4C7DA 1BPLB 4TOQA 2O9TA 3ZOAA 1TMQA 1CWYA 1B3YA 2WNWA 4U5KA 1HJVA 4AC1X 3SCQA 3SURA 4AIEA 5E6ZA 1QNOA 1CXKA 1E40A 2XUCA 1PIGA 1WE5A 4IPNB 3DYMA 2DGAA 1E4NA 4ZEPA 4GI8A 4HMCA 4E8DA 1UZ1A 1V02E 5A8NA 5CGTA 1VFMA 2V5DA 5ABEA 4KGLA 1UKQA 2WC7A 1Q6DA 2EPLX 3PN8A 1WDQA 2E9BA 2CEQA 1H11A 2D22A 1CXHA 1CDGA 1PZ2A 4BCEA 3W82A 3GXFA 3TONA 5ABHA 1XC6A 2BS9A 3AHYA 3VIMA 3MUIA 4XB3A 1JZ7A 4NI3A 2DSZA 3WF3A 3MSDA 2E4TA 4AEEA 1ISZA 4PMQA 4HPGA 1G0CA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2NW0 A;  3BSH A;  2BNJ A;  2J4G A;  3AIQ A;  4DWS D;  1UG6 A;  2B31 A;  1V0K A;  3G6L A;  2WMH A;  2V5C A;  3OLD A;  2F61 A;  1D2K A;  4LYQ A;  1JF6 A;  3OLI A;  3ARS A;  1V3I A;  4U2Y A;  4ACY A;  4TTG A;  4UZU A;  1H09 A;  1W3L A;  2WBG A;  5CGM A;  4HU8 A;  3D5H A;  4FLO A;  4W89 A;  1CXL A;  4MNM A;  1GHS A;  3GXD A;  4BA0 A;  1H4P A;  3EYP A;  1E55 A;  5A2B A;  1E9L A;  1V3H A;  1UZ4 A;  2AOS A;  2WYS A;  4NSB A;  2Y2W A;  3ARZ A;  2XII A;  4D6E A;  1JF5 A;  2XFF A;  3ARV A;  3K1D A;  4PMU A;  1GOO A;  1RH9 A;  1L0P A;  2Y4S A;  1E5N A;  4QCE A;  5M3W A;  2E9L A;  3NJ3 A;  2D0F A;  4DWS A;  4KMQ A;  2WHM A;  3ZJ8 A;  1UOK A;  2IXU A;  3OZO A;  1OCQ A;  2XIB A;  4PMN A;  2JE8 A;  4N42 A;  1UWR A;  3BCF A;  1BYA A;  2QMJ A;  4BQ4 A;  1G1Y A;  5CG0 A;  1LL7 A;  2WC4 A;  3LPF A;  2VTF A;  4PN2 A;  1DWJ M;  5I77 A;  3KEH A;  1PEZ A;  4HA4 A;  1KGX A;  1PX4 A;  2A3C A;  1VFO A;  2XPK A;  1X6N A;  1G94 A;  1WPC A;  2OWW A;  2ZXB A;  3WF1 A;  2VQT A;  4U3C A;  4K68 A;  2WCG A;  3K4A A;  1IV8 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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