2QEZ | Genus

Total Genus 155

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	155
sequence length	453
structure length	439
Chain Sequence	MILKTNLFGHTYQFKSITDVLAKANEEKSGDRLAGVAAESAEERVAAKVVLSKMTLGDLRNNPVVPYETDEVTRIIQDQVNDRIHDSIKNWTVEELREWILDHKTTDADIKRVARGLTSEIIAAVTKLMSNLDLIYGAKKIRVIAHANTTIGLPGTFSARLQPNHPTDDPDGILASLMEGLTYGIGDAVIGLNPVDDSTDSVVRLLNKFEEFRSKWDVPTQTCVLAHVKTQMEAMRRGAPTGLVFQSIAGSEKGNTAFGFDGATIEEARQLALQSGAATGPNVMYFETGQGSFGVDQVTMEARCYGFAKKFDPFLVNTVVGFYDSKQVIRAGLEDHFMGKLTGISMGCDVCYTNHMADQNDVENLSVLLTAAGCNFIMGIPHGDDVMLNYQTTGYHETATLRELFGLKPIKEFDQWMEKMGFSENGKLTSRAGDASIFL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal structure of ethanolamine ammonia-lyase heavy chain (YP_013784.1) from Listeria monocytogenes 4b F2365 at 2.15 A resolution rcsb
molecule keywords	Ethanolamine ammonia-lyase heavy chain
molecule tags	Lyase
source organism	Listeria monocytogenes serotype 4b
total genus	155
structure length	439
sequence length	453
chains with identical sequence	B, C, D, E, F
ec nomenclature	ec 4.3.1.7: Ethanolamine ammonia-lyase.
pdb deposition date	2007-06-26

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.220.70	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Annexin V; domain 1	lyase	2qezA02
2.30.170.30	Mainly Beta	Roll	Ribosomal Protein L24e; Chain: T;	ethanolamine ammonia-lyase heavy chain domain like	2qezA01
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	2qezA03

3A21A 3B0VC 4IXXA 4JTGA 2DZXA 1K7FA 4O17A 2CU0A 4QAIA 5D2TA 4PH6A 5I3JA 2I1OA 2J6XA 4B5NA 5FI8A 2QUTA 3ZWTA 2EGZA 5G4EA 3LBMA 4J9JA 3M9YA 3P80A 2BXVA 1LOSA 1YYAA 3KVKA 3Q2DA 1KTBA 1Q3NA 4LVBA 4HNVA 1UBSA 3UWZA 4MYAA 3MJYA 4JGDA 2DJXA 3G1HA 2Z2UA 3HQ1A 1LBFA 1KA9F 3W2MA 3BG5A 5BOOA 3N9RA 3F1QA 3EWWA 5DY2A 2YYUA 5I3HA 4UTLA 4OE7A 4ONVA 2TMDA 3S5ZA 3KXQA 3MI3A 3STCA 2ZRVA 1TQJA 2AAMA 1MEWA 1R2SA 3W7QA 4JTTA 2QUVA 2GVGA 8TIMA 3N2XA 4N02A 3LTPA 1H50A 2WNQA 1JCLA 3STEA 3EKZA 1LTDA 5G2HA 2C6QA 2O7QA 4NJKA 4AHOA 3ZR4A 4QIUA 4JTJA 5MHBA 2WOQA 1S5WA 3Q58A 1YPIA 3W7GA 2VXNA 1XBXA 5C54A 4OHQA 1FDJA 3M44A 5D33A 2CLOA 1OFPA 3SGUA 3LCLA 1R30A 1UUOA 2A0NA 1RZMA 4JN6A 4JTFA 1D3HA 1R47A 3EX2A 2ATSA 2DU2A 2VOMA 3DFTA 3HG2A 1OYCA 5EMUA 1DQWA 1WXJA 3NQ6A 1SW7A 1KFJA 1YDVA 4MZ1A 3DFQA 4K37A 3WJSA 3QC3A 4WXZA 4PODA 3LCWA 4AF0A 4DF2A 1K03A 4O12A 3LBCA 3FYPA 4RZ4A 4A2RA 4H6KA 3IIPA 2A6LA 3NQDA 2YYTA 1LCOA 5FF7A 3W07A 4XTDA 2OT0A 4IMDA 4HNNA 5D2WA 5G2WA 1VHCA 4S1FA 1GQNA 3UZJA 3TQKA 3NQ8A 4N4PA 4ZQMA 1ZAHA 3LM7A 1KM5A 3HGOA 1F6KA 4ICNA 2CZDA 1IIGA 4POCA 3NPVA 4FNPA 1SO5A 2WSQA 3C56A 1EP2A 3R5EA 4O57A 1OYBA 3G8EA 1NEYA 3DFNA 4OBTA 4E2BA 4MIMA 2ZZ2A 5HWNA 3RLUA 1Q6QA 1PS9A 2J27A 3ATYA 3KRSA 5LKYA 5K4XA 3T55A 1ZNNA 2WNZA 2G95A 3GKFA 3I65A 2PRHA 4Z1CA 5DBUA 4Y96A 4LVFA 1EA0A 1EPXA 4KWWA 1WOAA 1H63A 3QMTA 2FLIA 5H2ZA 4AAJA 5D04C 2YR1A 3UWUA 2H3BA 4AHPA 5AYZA 4UFMA 2V5LA 3NNTA 3P74A 5BW6A 2J9XA 1SSGA 1F73A 3IIXA 4GFSA 4MZ8A 4DELA 1A5AA 4R34A 3VE9A 2QAPA 2RDWA 1PV8A 4XTIA 1M5WA 1SZEA 2IQTA 4LC8A 5AHEA 3TUUA 1YLVA 2NUWA 3NDOA 1IF2A 2NXGA 3C61A 3L68A 1TPFA 3W7EA 3DXIA 1WDWA 3N14A 3P5YA 3W22A 4AH7A 4UXDA 1OVDA 4GWEA 5FEXA 4RXFA 4M6VA 1VRDA 4FXSA 3S1XA 1FY6A 1K7EA 3SZ8A 2Y70A 4O28A 4Z0JA 3PSWA 3LB0A 3E12A 1TPVA 2Q8LA 3WJZA 4ORIA 1KFEA 4UCGA 1FBAA 2ZYFA 1JCXA 4HT3A 4IPIA 4XBKA 1BKSA 1R2TA 2CFFA 5F2MA 4P2VA 3MI2A 5LNWA 1FDYA 3FA5A 3ELFA 4WY0A 3UZ5A 2E09A 3GDLA 1T99A 4YCPA 4PC8A 4M6PA 4LS2A 4UTJA 3W6YA 5AHNA 1A53A 4LUJA 3FEMA 3L65A 3R89A 3WK1A 1X1OA 3HG4A 5FEWA 4N2YA 3C6CA 3NL2A 2CW6A 3W88A 1UASA 1W5OA 3NQ2A 4IX2A 3EWYA 1I2OA 4N9BA 1K02A 3CIWA 3HO8A 3LTYA 3GAKA 2QCFA 1P5BA 4UUIA 4MJMA 3BVJA 2QAFA 1JQVA 5GVJA 1QO2A 1OABA 3CQ0A 2C0AA 4LUIA 3C2VA 1EB3A 3N2MA 1QAPA 5HR6A 1FWSA 1X7FA 4OV4A 3G0XA 3KX6A 1I2PA 3GNDA 1WAUA 4LC6A 4UTKA 4QJ1A 4UMBA 3LHZA 1VCFA 1V7YA 1VPXA 2Y85A 2NX9A 3PM6A 5LNRA 6ALDA 1DBTA 3PC0A 4IX0A 4PFMA 7TIMA 2RDTA 1I4NA 2NLIA 3EWXA 3EWZA 3MP5A 3VNDA 1G4PA 3IGSA 1JR1A 2JKEA 2QDGA 1AL8A 3HGSA 2X30A 3KOFA 5HMSA 4GE8A 3DFOA 1QO5A 5D38A 5D2XA 3TSBA 1GVFA 2Z6IA 4Q4KA 3W1MA 1JUBA 1G4TA 3EX6A 2VC6A 1DL3A 3P8JA 1JQXA 3B06A 4NNCA 3QSRA 2ISVA 2E68A 4C1LA 4Z1AA 4EWND 1LRQA 4PA8A 3G1FA 3M0ZA 4W9TA 2OCZA 5AHMA 5FF2A 4JYEA 1QDSA 4X3ZA 3QF0A 2R8WA 4UFLA 3W86A 4TIMA 5G4WA 1W3IA 2BWGA 2A5HA 4NJGA 4E2DA 5HULA 3W7OA 2NXHA 4DPPA 2VEKA 3LLDA 3PBWA 4A22A 4EIVA 2YFNA 2WKJA 3RK8A 3O05A 3QRHA 1AW5A 2E6FA 2HS6A 3GXNA 1YXDA 2QCGA 3G0UA 3W76A 3T78A 1OFDA 1MEIA 3S8HA 1OF8A 4NQ1A 3OEXA 3UWQA 1LBMA 3N9SA 5LZLA 3PG9A 3U6WA 4NU7A 3CB8A 1TTJA 4JTHA 2W6RA 1EEPA 2ZRZA 3EKLA 3L66A 4MFDA 2GPTA 2QEZA 4MUZA 2V2DA 5LNVA 1TPB1 3TX9A 2V81A 3BG9A 3OA3A 4GXMA 3G3MA 1A5BA 5LNSA 1SFLA 3OBKA 4EOUA 1DVJA 5J5DA 2ZBTA 2A6NA 1ICPA 1IGSA 1FCBA 4N9EA 5KINA 1OFOA 4O19A 1KTNA 4ZZ9A 4JD4A 5FF3A 3R13A 3W73A 2E5BA 2XFWA 1P1XA 1F2JA 4Y90A 2C3ZA 5EKYA 2WSRA 3S42A 4A21A 3P61A 3DENA 4CNPA 4Q32A 4O1AA 3U8GA 1DOSA 1YDNA 2QCCA 3TMLA 5CZTA 5BNKA 2Z0IA 2VFIA 3GDKA 4TO8A 4R33A 2FIQA 3TNOA 1BWLA 1OFAA 2C15A 4HSOA 4EF9A 2QCHA 3BLFA 1A50A 5D09A 2Y7FA 3DKJA 2JGYA 1T96A 4JYFA 1TPDA 2PRMA 1LLZA 1H62A 4ZQNA 3W2UA 4AHQA 1B4KA 3NM3A 4O0ZA 5T26A 3MHGA 3JR2A 1LORA 3RMJA 3S5OA 3P84A 2Y63A 2EAWA 1WV2A 3KRZA 5SWUA 4UR8A 2ZA1A 1UUMA 5K9XA 3GX9A 3RNDA 3MBDA 1VH7A 3CC1A 3ZS4A 2P0OA 2NWSA 4K8HA 3LOTA 4MYXA 1BEUA 3W1PA 4GRSA 1FWNA 3QPYA 5HWMA 2YXGA 3IV3A 3TCEA 2A7RA 3MYPA 1SUXA 1NAL1 3BV4A 1QPRA 3LHYA 3ZFHA 1VGAA 4N9CA 5K9CA 4HNUA 4DO6A 1UB3A 3DI1A 4IMEA 5KZDA 2AGKA 4M19A 1TV5A 4FXRA 1VZWA 1KBIA 3LXBA 4CLMA 5AC8A 3M7WA 4ORMA 1T0OA 1VQTA 1LRNA 1HO4A 1CW2A 1TTQA 1WOBA 1LM1A 3O07A 4JTSA 3NO5A 4ZQOA 4XKYB 5A5WA 1FWWA 3O1NA 3E96A 4HPXA 3W7HA 2W0UA 3PB0A 3W83A 5KTLA 4ALDA 3A22A 3INPA 5E93A 4UTWC 3HG3A 4X2RA 1RQEA 3W23A 3LGEA 1Q6RA 3W7RA 3LV5A 1TTIA 4JY9A 2GQ8A 4FO4A 3V1PA 3UPBA 1W0MA 4ZVJA 5DBTA 3LXAA 5KSWA 4MY8A 2J24A 4FF7A 3LTSA 3M5XA 1RQHA 4IMCA 3HIJA 5L9FA 2JKPA 1NF0A 4ADTA 2FPVA 4YLWA 2E6AA 4IQLA 3DBPA 2C16A 3NZ1A 1OX4A 3W1QA 1GZGA 1LROA 1YADA 4GUJA 2C1HA 3ATZA 3NQMA 1LLWA 1SZGA 2PURA 3GDTA 4CQ8A 2EPHA 4UTIA 5D05A 1OX6A 1EWDA 3CM4A 4JTIA 2X16A 3R8RA 2WV8A 4YWIA 3BW3A 4NVTA 2VEIA 1ONRA 5IM51 3SR7A 3DFPA 4O15A 3C8FA 2V5BA 2HS8A 2Y7DA 4FHAA 1AW1A 2UV8G 4KFNA 3FS2A 5TBOA 1LBLA 1WA3A 3N34A 4JX5A 2Y61A 5F2IA 4BFAA 4MVAA 1LDCA 1L6YA 1ZHAA 2I14A 5FEZA 3TC6A 1ZFJA 3DZ1A 2E1DA 5DELA 3HPXA 4DXVA 1MO0A 3P5ZA 4IXHA 4JXCA 3MUXA 2C14A 3CIXA 3LHTA 2Y6ZA 2Q3RA 4CCCA 2ZDRA 3IGXA 1IIHA 3CTLA 3K30A 3HPZA 1HG3A 3F4WA 3LLFA 2TYSA 5K9DA 3QH2A 1PHQA 3TXVA 2B7PA 1YTKA 1OX5A 1TSIA 1W54A 1H1ZA 4NX5A 4C1KA 3GR7A 2QUUA 2DP3A 1TJPA 3NQGA 4JICA 3PBVA 2BLEA 4GC4A 1QMLA 5DN1A 4TR9A 3GR8A 3GXTA 3GYEA 3DU0A 4AMAA 1TPEA 2I9EA 1KTCA 1FWRA 3SIZA 2JKAA 3E49A 3HBLA 4NXKA 1H7OA 4OT7A 1CI1A 2ABBA 2A1YA 4MKNA 5EYWA 5C55A 1O94A 3CPRA 3FJ6A 2X1UA 1FX6A 2HTMA 4Z08A 4RZ5A 3HPSA 4H4IA 4DO5A 3CU2A 1H7RA 1Y0EA 3TSDA 1QPQA 2FQIA 4HHPA 3QPZA 3T7VA 3Q94A 1VR6A 4QM1A 4OV9A 5FF0A 4WJEA 1LZOA 2CLKA 1FXPA 2JBMA 3T40A 2VFEA 4IJBA 4ZQRA 2PRLA 5LHFA 2ZA3A 4GJ1A 1LP6A 5F4XA 1ZENA 3QFEA 3BARA 4JX4A 4O54A 5CZJA 4NNBA 3CEUA 1F76A 2QJGA 2OMAA 2A85A 3W1XA 3TIMA 2ZTKA 5F4SA 4XWUA 2ISSA 4GUFA 3UY8A 5IBXC 5LHEA 3SJ3A 3W3OA 5J5RA 2B7NA 3G3DA 1JULA 2DZSA 3C3NA 3S1UA 2V2HA 4O10A 3M5VA 2BTMA 5CGQA 3FYOA 3MWAA 3W70A 4JTUA 1FCQA 2X1TA 3G18A 2QCNA 1F7BA 3W7LA 3GXPA 1GTEA 2QCEA 1VLIA 3TW6A 3SY5A 4IGHA 3W2NA 1THFD 5DY3A 3LI0A 4WUIA 3SSJA 3I7QA 5G1YA 3TH6A 2P1FA 1SO6A 4YMZA 3LCXA 2GQAA 3LRMA 2BSLA 3C4UA 2NUYA 2WPBA 3W1LA 1QPOA 2DORA 3JRKA 2YDAA 3L0NA 4RXGA 2QCMA 3UQNA 1SQ7A 2PE4A 3IVSA 3LXCA 3O16A 1ME9A 2NX3A 3BPWA 1PE1A 5D32A 2WQPA 4FIQA 4O1CA 1ME8A 3A5FA 4NJJA 3FJLA 3W9ZA 4XQ6A 4I7VA 1L6SA 3F4NA 1N8FA 3ABOA 4LVGA 4PTNA 4LNYA 4EF8A 2QR6A 1GYNA 1KM6A 2Y88A 3MYOA 1W3TA 1W5NA 1AL7A 3CEPA 4YCOA 1QR7A 3C2OA 3W85A 4LVDA 4ZL1A 5D2YA 1QNVA 4MPQA 1XUUA 1TO3A 5BMXA 1VLWA 2Y62A 4TMBA 3KRUA 3A23A 3L5AA 3S5YA 2AQWA 4K38A 4OU1A 3TJXA 3BLEA 5LNUA 5K2ZA 4TMCA 1PCWA 3FFSA 1XFBA 4FX7A 4UC5A 4K8EA 1VJIA 3OVRA 3GZ3A 2QJIA 5DCEA 1W5QA 4O53A 4XZ9A 3ABQA 1MEHA 1L2UA 4DF0A 4O18A 1L9WA 4QITA 1TRIA 3Q37A 3G1VA 3VFLA 4MY9A 1TYGA 4O50A 3NL5A 3P81A 4KFPA 5AC7A 3NZRA 1H7NA 3QW4B 3NGJA 5CZSA 1TTPA 5EY5A 5TQLA 3DHDA 3PBYA 3C0JA 2ZRXA 4M7SA 3NG3A 1J2WA 4LWWA 3KAOA 1FXQA 1BWKA 2ZZ5A 3ABSA 3VKJA 3W1AA 3HJZA 1ADOA 4O52A 2NXIA 3WJWA 1SZNA 4K6AA 3THAA 1QWGA 1H7WA 5D2VA 5H91A 3RFAA 3NEVA 3WJYA 3HMJG 3UWVA 3UYCA 1N55A 1PHWA 4DBEA 3M5YA 3PAJA 3EX1A 3P8IA 2ABAA 1DQXA 3EXSA 4L4LA 2ISWA 2V2CA 1GOXA 1W5PA 1F6PA 1A5CA 3NQVA 4LT9A 1GVRA 1UJPA 1C29A 2E77A 4AB4A 3B8DA 4NXSA 5C6MA 3M16A 1P4CA 5KMYA 5EBUA 5F2GA 1G7VA 1KBJA 4ML9A 4JDYA 2RH9A 3OVQA 4UTTA 5C5YA 2G97A 3PUEA 2CLFA 4I9AA 3L67A 2ZRWA 1SO3A 1V5XA 1MZHA 3PUDA 3W2JA 1DJQA 1F74A 4JIPA 4Z0SA 3W7MA 5LSMA 3QZEA 6TIMA 5HINA 3NL6A 4BI5A 1PVNA 1AW2A 4FIRA 3KFTA 3TMQA 1KFKA 1TB3A 4CQ9A 1GEQA 3O6CA 3CLMA 3LDVA 4IWWA 1O5KA 4TU1A 3VCRA 5KITA 3PB2A 4LRTA 5E0KA 4G1KA 1RD5A 3QW3A 1I8JA 3ABRA 1YPFA 1SFJA 2BZNA 5CSRA 3FKRA 1KM0A 4MLJA 2Z1BA 1VC4A 4TX9A 3BO9A 3S5NA 3NPWA 5AB3A 3NQCA 4R7JA 3UXDA 3B03A 3C2FA 3G24A 3T4CA 4QNWA 4JY8A 1H5YA 5CZ0A 2ZZ7A 1E51A 1OX4B 1Q6OA 4JR5A 1QCWA 2V8ZA 3WK2A 1YTDA 5AOUA 1GWJA 3UNDA 3BK0A 2RHGA 1DORA 3I7RA 1KFLA 5AN7A 4O14A 4JTEA 4Z1DA 5D02A 1OFBA 4RCXA 2ZFAA 4LS0A 2RKXA 3RLVA 3M43A 3NQEA 1VCVA 1WBHA 3USBA 4U28A 1FUYA 1RV8A 3PSVA 5FEPA 1BTMA 4FEZA 1OK6A 1O95A 4UFIA 3GK0A 1ZCOA 4IMGA 2OJPA 3OVPA 3TROA 1SU5A 5BRBA 3PY2A 4IPJA 4O13A 1W8SA 5ABTA 3NPXA 2CZFA 1JRCA 3O63A 1GVSA 4K7YA 1D3GA 3S1VA 5F4WA 2FB3A 2J9YA 4UFJA 5EPDA 3G1XA 1JCJA 1ZAJA 4JTKA 4Q33A 2F84A 4RJEA 1Z41A 3L5LA 3G1AA 3H55A 4UMCA 3W2LA 4PEKA 1LRTA 3EWBX 4X9SA 1PIIA 1DV7A 4M6QA 3KVJA 2F7FA 1XUZA 3LCIA 3A9IA 2VEPA 2ZCGA 3TJLA 1LOLA 5CPOA 1F05A 3DKLA 2ZRYA 4LRSA 3QQ0A 1U83A 1JCYA 4O1DA 5G2IA 2E6DA 3EXTA 3MHUA 2ZZ6A 1ZAIA 4AF0B 1U5JA 1Z44A 5CKSA 4I7UA 1TIMA 4YXGA 1M6JA 4WOZA 2D73A 3PR2A 1G69A 1GG1A 2WNNA 1IXOA 3EEGA 4QSHA 2TPSA 3QMSA 5HNRA 2J88A 3IGUA 1TPC1 4UTMA 1XC4A 3W7KA 4NNAA 3B05A 3TFXA 1O5XA 2QCDA 3LCHA 3NQ7A 2YW3A 3W7CA 1KM1A 4BK9A 1YXYA 2YW4A 2VFGA 3SGZA 1I2QA 2HMCA 1R2RA 3A5VA 1W31A 2NV1A 2CZEA 3W7IA 2V9DA 4WY0F 1EP3A 2YFOA 1I2NA 3I68A 2H3DA 3NOEA 3GDRA 1KV8A 3L2IA 2C13A 1EWEA 3WJXA 4UFHA 2VELA 4AWUA 3EB2A 4M7TA 4WZHA 3O6YX 3O15A 1JCNA 5C2XA 1N7KA 1W37A 2ALDA 1M7OA 2QDHA 3DI0A 3TAOA 4GUGA 1RR2A 1H1YA 1VYPX 2V0TA 1I2RA 2GJNA 2Y7GA 1JRBA 4RX0A 3EX4A 3N3MA 1EX5A 1OK4A 3W74A 5E1QA 1X6UA 3PBUA 2B7QA 4RR4A 1KM3A 3P60A 3LX9A 3MMTA 3G1DA 3RF9A 5I3GA 1P0KA 1XDLA 5HJLA 3UD6A 5I3FA 3YPIA 1EIXA 3G1YA 2NWRA 1O60A 4S2BA 4UNLA 4RZ6A 3TAKA 3BG3A 4NT0A 3T44A 1GJPA 3HGJA 2C18A 2YPIA 3FOKA 3B04A 3PF3A 4LW7A 3W7NA 1TV7A 5CG7A 1SW3A 1JVNA 3H54A 5I3IA 1JUEA 2H6RA 2R94A 3TQVA 1A5SA 1XXXA 1SZFA 4UMAA 3E9AA 4R53A 3W7JA 4IMFA 2H8ZA 3E02A 3AJXA 3HB9A 4WOQA 5AHIA 3E0IA 3MP4A 1FCUA 1Z48A 2A7NA 1DJNA 1TREA 3C2RA 5K4ZA 1HTIA 4UNKA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2QEZA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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