2B7NA

Crystal structure of quinolinic acid phosphoribosyltransferase from helicobacter pylori
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
273
structure length
273
Chain Sequence
MEIRTFLERALKEDLGHGDLFERVLEKDFKATAFVRAKQEGVFSGEKYALELLEMTGIECVQTIKDKERFKPKDALMEIRGDFSMLLKVERTLLNLLQHSSGIATLTSRFVEALNSHKVRLLDTRKTRPLLRIFEKYSVLNGGASNHRLGLDDALMLKDTHLRHVKDLKSFLTHARKNLPFTAKIEIECESFEEAKNAMNAGADIVMCDNLSVLETKEIAAYRDAHYPFVLLEASGNISLESINAYAKSGVDAISVGALIHQATFIDMHMKMA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Helicobacter pylori
publication title Crystal structure of quinolinic acid phosphoribosyltransferase from Helicobacter pylori
pubmed doi rcsb
molecule keywords Probable nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
total genus 88
structure length 273
sequence length 273
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 2005-10-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2b7nA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 2b7nA01
4K37A 2GJNA 4MVAA 3TW7A 2E1DA 1OF6A 1TRDA 3LERA 4LUJA 4NX0A 4YWIA 4MZYA 4RZ4A 1K8YA 5H2ZA 3GVGA 1YTEA 3NL2A 4O0KA 2X30A 3T55A 2P0OA 4K7YA 2NUWA 3W2UA 4AAJA 3NZRA 3CEPA 2JGYA 3E9AA 3N3MA 4O28A 3W7HA 1LDCA 1ZAJA 3WJYA 4MZ1A 3S5ZA 4ZQPA 3W7QA 2FPTA 1PIIA 3W1NA 3M9YA 4GBUA 3STFA 4UMBA 1JCYA 3TKFA 3QMTA 3NL3A 1S3HA 4LS2A 3PUEA 1TV7A 1NF7A 3N9SA 3W86A 2GQ8A 1I2OA 2BXVA 2X1UA 4FNPA 4NZFA 1E51A 4KFPA 3ABRA 5LHEA 4TX9A 3B04A 1FCQA 3CIWA 3G0UA 3W7GA 3BK0A 2RKXA 3BLEA 4FIRA 4UTUA 4LVAA 2Y61A 1JVNA 2Q3RA 4UFLA 4JGDA 4M19A 2V8ZA 3W75A 1OFOA 2NX3A 4MIMA 3H54A 3B03A 3UXAA 4X9SA 1OYBA 1VS1A 3B0PA 4UTHA 2ALDA 2OJPA 1Z48A 4GE8A 2QCGA 3S0CA 3G1XA 3LB0A 3AJXA 1RQEA 3GKAA 2OZ0A 2QDGA 3VFLA 1H50A 3DBPA 3KRUA 3G3MA 1D9EA 2FPVA 4PL2A 4I9AA 3TW6A 4UC5A 2R14A 3QH2A 3NQ8A 4UMCA 3LBCA 3B06A 4Z1AA 3F03K 4NNBA 5D04C 5FF7A 1OFDA 3TDFA 3TSBA 3U2OA 1OFEA 3M5VA 5IM51 3W1LA 4ZQMA 2EAWA 1VYPX 4Z1CA 1THFD 5DELA 1IXPA 2RDUA 5AOUA 1X1ZA 1K03A 4ADSA 1SO3A 1AK5A 1T8XA 2QJIA 3N14A 5D02A 4A2SA 2B7QA 4KWWA 1QPOA 1PCKA 4LVDA 1IF2A 1L2UA 2ZBTA 4UTLA 3EWZA 3O15A 4NT0A 4WJEA 2ZTJA 4DO6A 1TYGA 4PH6A 5D03A 3P60A 2EGZA 4TMCA 4OQVA 4IX0A 4M7SA 4OT7A 1DJNA 5D38A 4AWTA 1B3OA 2Y63A 4FEZA 5F2MA 3HBLA 4EOUA 3GXNA 1M6JA 1ME8A 4DF1A 4IPJA 4JTHA 3WK0A 1EP2A 4UTMA 3FIGA 1GYNA 1SW3A 1ZHAA 3HGOA 3ABSA 4UFHA 4IMFA 4FNSA 3NM1A 3W1UA 3A24A 4LRSA 1SU5A 5F4SA 2YGYA 3ZFHA 3IGSA 2YCEA 3QSRA 1MEWA 2WQPA 3IVUA 4EF8A 3NM3A 1CI1A 4BFAA 3W7KA 1YYAA 2WSQA 1L9WA 4TO8A 1JCMP 1SSGA 3BLIA 2GVGA 4JTLA 4NJHA 5G1TA 3LCXA 4K6AA 1RD5A 2TMDA 3HPZA 1H7OA 4JIPA 3TK7A 5FEWA 3I68A 1FCVA 3HIJA 1QDSA 1W3IA 1H7PA 4PODA 1H7XA 1T96A 5KZDA 4JTTA 3L5AA 5BW6A 3T44A 5HWMA 3TU9A 1O5XA 3LX9A 4PEKA 1GOXA 1BEUA 2O7QA 1YTDA 4ZQCA 5KZEA 3W2MA 2A7PA 1VCVA 4DO5A 1GWJA 4M5PA 5I3JA 4I7UA 5H91A 4POCA 4XTDA 3FKRA 1CW2A 3DKJA 4R34A 4DELA 4O57A 2Z2UA 1XXXA 2I14A 1DV7A 2OX1A 3KXQA 5KSWA 2NXIA 4UNKA 4QQ3A 4O1DA 5I3KA 1ICSA 3HPSA 2QAPA 4WD0A 3P81A 1VC4A 1J2WA 3NXFA 1OX6A 3BV4A 2FJKA 4JX5A 3C2FA 4JYEA 1KM3A 3VCRA 5LNRA 2Y7DA 1LCOA 1W1ZA 3GR7A 3STCA 1R30A 3TNOA 4N2YA 4CQ9A 2Q8ZA 4ZVJA 3W72A 4JIQA 3GDMA 2PURA 3TH6A 1K8XA 2ABAA 4A22A 4XTIA 4NZJA 4O12A 1X6UA 2CWNA 2FDSA 1V5XA 4NNCA 4JYDA 3HJZA 3G1DA 1DKWA 1R2TA 4I7VA 4NJJA 1KV5A 3SFKA 4HPJA 3NQDA 1P0NA 1KM6A 3P74A 3RK8A 1LOQA 3BVJA 2FLIA 5CGQA 2FIQA 3TFCA 4X3ZA 1QO2A 1KM4A 1XBXA 3PBVA 2J6XA 1YXYA 2RDTA 1WOAA 1VYRA 3KVLA 3IIXA 5HUPA 1EPXA 2CLLA 3TROA 2Y7FA 3ELFA 5LGXA 3C0JA 3G1HA 3WK1A 3UD6A 3LCWA 3CB8A 2YSWA 2QJGA 3NQAA 4YMZA 5K9DA 1MEIA 4S2BA 1EWEA 2NXHA 1TV5A 3W7RA 3A23A 3IV3A 3LHYA 2PE4A 2YYUA 3NPVA 3HG5A 5DN1A 1QO5A 1H62A 4WXZA 5C2XA 5K3VA 4ZZ9A 3FYPA 3KAOA 4GUJA 1TPUA 1S5TA 4IXXA 4WY0F 3UZ5A 1GTEA 1SO6A 2Y88A 4MUZA 4FXRA 5IBXC 2E5BA 2X1SA 4GUFA 2DZTA 2V2DA 3W85A 4I7WA 3SECA 4RKAA 4WOQA 4DPPA 2NV2A 3FJ6A 3NGJA 1Z44A 1KM5A 1VHNA 3QQ0A 4N4PA 5DBTA 2E77A 3EKZA 2VFDA 1PE1A 2XN0A 3UWVA 3SGUA 6TIMA 3H55A 3P8JA 2QR6A 4PA8A 3U8GA 1R46A 5LHFA 2JKEA 3OVQA 3EX2A 3GK0A 4NJGA 4N6EA 5G1YA 2VXNA 1UB3A 4HSOA 3S1XA 1TCDA 1EX5A 3GDTA 3EX1A 5EYWA 3L9CA 3B05A 1KM0A 4DPQA 3GIYA 1YDNA 5AHLA 2EPHA 3Q2DA 2C18A 3MJYA 2B7OA 1KFJA 2OT1A 3CC1A 1NF0A 2P10A 4AHQA 4O54A 5K2ZA 1YXCA 3LDVA 2Y70A 1LRTA 1SZNA 4H6KA 3TMLA 4ADTA 3MYOA 3A21A 1JUKA 3TIMA 3N2XA 4WOZA 4UXDA 2RFGA 4AXKA 1GJPA 1X1OA 1HL2A 3BW2A 1QMLA 2CZEA 3SGZA 3I65A 2E6FA 2VC6A 3TAOA 2CLMA 1B9BA 3RMJA 4N4QA 4YLWA 3DZ1A 2YFNA 3BO9A 1J5TA 2PCQA 3TJXA 1R2SA 3IGXA 3NZ1A 3A22A 1X8FA 3LTSA 1G4PA 1H5YA 5I3FA 1Z41A 5FEZA 3G1SA 2W6RA 1KFLA 3SW6A 4ORIA 2V9DA 2XFWA 1PHQA 1JRBA 1XBVA 2Y89A 1OFQA 3TSMA 3BLFA 3NQCA 3DGRA 2A6LA 3O06A 3IVSA 3ATZA 1W8SA 1FWTA 1TREA 1FDJA 4FIQA 1KV8A 4D2JA 3LV6A 5DCEA 3RNDA 4LUIA 4MY1A 1LBLA 1Q6QA 3MW7A 2CU0A 2DZWA 1QOPA 1XM3A 2QCDA 1YPIA 4ONVA 3E49A 3BG3A 1H7WA 2AAMA 3QMSA 4BF9A 3TE9A 3P5YA 4JD4A 5K4ZA 3G1YA 1GEQA 2DZVA 5FEPA 1RQBA 2GVLA 3A9IA 4XBKA 5DY2A 4QAIA 3B4UA 2EF9A 3S5YA 4ADUA 1Y0EA 3NR0A 3QMRA 2C0AA 2RDWA 1LLZA 2W79A 5CKSA 3S8HA 2NLIA 5EMUA 4LU0A 2CLKA 5D37A 1LRQA 3WJSA 1F2JA 4TU1A 2QEZA 3MHUA 1XL9A 4UNLA 4AWUA 4UTWC 1BWKA 4MYXA 1SZFA 2PRLA 4MYAA 4NVTA 4IX2A 3W1TA 2RH9A 4DEFA 2A0NA 4UR8A 3O8AA 3GZ3A 2BX7A 1XDMA 4RCXA 3C6CA 3NAVA 4O13A 3CPRA 1B4EA 1FDZA 2V81A 2QDHA 3W1RA 3Q94A 3W7MA 1ZFJA 4UUIA 3TMQA 1UUMA 3DFOA 4UTIA 2X16A 1S5WA 1GT8A 1P1XA 1VRDA 3N34A 2QCFA 3C56A 2CLOA 4ICNA 1HO1A 8TIMA 3QFEA 1XKYA 3PUOA 4R7JA 3L68A 4S2CA 4EVZA 3D0CA 1WDWA 3IVTA 4QITA 3GLCA 3HO8A 3W76A 3PWAA 3DU0A 1ONRA 2HS6A 3QPYA 4MJZA 1W5QA 2NWRA 1FY6A 3O07A 3IIPA 1S5VA 1TMHA 5ABTA 4NXSA 2FQIA 3Q58A 5AFDA 4WQ6A 4Q32A 3PBYA 1EWDA 4EWND 3PBWA 1KFKA 3L67A 3P82A 1YPFA 1PV8A 2VEIA 4NJIA 1DQWA 4WUIA 4RR4A 4HNNA 2IQTA 3THQA 3UPWA 4M6VA 4CCDA 1DL3A 1TRIA 3EEGA 4M6PA 3S6DA 3G8RA 4ALDA 1F73A 4FNUA 3GX9A 3M5ZA 4A21A 3C2OA 3UPBA 2ZRWA 3EWBX 1TPC1 3W1PA 3WJXA 3C3NA 2VFGA 3UWZA 1KTCA 1KTBA 1G4TA 2JKAA 2YXGA 1C8VA 2WNNA 4FNRA 1UASA 1ICPA 4MLRA 5CZTA 4HIBA 1XC4A 4GJ1A 4LY8A 1IGSA 4GFSA 3G3DA 1TPFA 4JNMA 4Q33A 4LTSA 2GPTA 3W7CA 1JUEA 3LTPA 3CM4A 3TFXA 4EIVA 4K39A 2G95A 3L0GA 4K38A 3EKLA 3M47A 4G1KA 3W7OA 1GQNA 2I1OA 4LS0A 5CZJA 3MP4A 1EB3A 4Z1BA 5F4XA 1ME7A 4N02A 1HTIA 3V75A 5LNVA 4LC8A 4W9TA 2JKPA 3RFAA 4HNUA 3RLUA 4YCPA 2V2HA 1F74A 4FNTA 3IEBA 1EP3A 2A5HA 3TV8A 3I7SA 1G69A 1VZWA 3W7JA 3W2NA 2PRHA 2CZ5A 3NQFA 1VQTA 3S5OA 1QCWA 5U7SA 4A2RA 1VR6A 4CQAA 3A5VA 3L21A 3OEXA 2E6DA 3QW3A 2ZA1A 3THAA 5C55A 1XCFA 3S1VA 3UY7A 1H1ZA 3QEZA 1OVDA 2VFHA 3ABQA 3M7WA 1JCNA 1UJPA 4BR1A 3MUXA 3PSWA 1TPDA 5LNSA 1PVNA 3UZJA 3P84A 3N73A 4O4WA 1SZEA 1NSJA 3INPA 5AYXA 2DU2A 2E5CA 5AHIA 2F84A 1R2RA 4E2BA 3L0NA 1WBJA 2ZZ7A 2J24A 5CSSA 2D73A 4LOCA 1UCWA 3M16A 1GG1A 1OFPA 3B0UX 2ZA3A 2DZUA 3LCFA 1PL9A 3RU6A 4JXCA 3NQMA 2A7NA 3GYEA 4DF2A 1TB3A 1GVOA 1W5NA 4UFJA 4O10A 1RZMA 4B5NA 3HGJA 4KFNA 3UYCA 2DZSA 1AL7A 4L4LA 5HJLA 2GJLA 3LOTA 4PCFA 3FEMA 3PY2A 4UCGA 3W3OA 4JEQA 3P61A 2WV8A 3G0XA 3FJLA 3LBMA 4O19A 4RXGA 2FB3A 3W22A 4JTEA 3LXCA 4AB4A 2VEMA 4NNAA 4O14A 4IUOA 4AHOA 1K7EA 2QKFA 3N19B 4XZ9A 1W31A 1LOLA 3C52A 4Y6GA 4LS1A 4MY8A 3LTYA 4GC4A 2C16A 2H8XA 2P1FA 3EWXA 4O1CA 2Z1BA 5DBUA 3JRKA 5F2LA 5HINA 3SI9A 3P67A 4JX6A 5FF3A 3UWQA 2C19A 3OVPA 4MFEA 2XN2A 2NZLA 3CU2A 3MMTA 4UFIA 5E1QA 4MFDA 3W70A 3LCLA 1KBJA 3W7LA 2GQAA 2DJXA 3ABOA 5LKYA 3O63A 3IIZA 3UY8A 3FA5A 5TIMA 1LRNA 2HMCA 1OK4A 2E09A 1TPH1 4XKYA 2WPBA 3H53A 3LCGA 4RXFA 2FTPA 1XI3A 5K9CA 4A29A 5G2IA 4CCEA 2Y85A 1TSIA 1OG0A 5F1VA 5D32A 3W7PA 1A50A 1W5PA 5KINA 3P62A 3G22A 2CZDA 2WOQA 3NQEA 1H61A 3I7QA 1SO5A 1XFBA 4Z0SA 1M5WA 1J4EA 3GXPA 1TQXA 4MKNA 3G8EA 4WY0B 2PRMA 2W0UA 4BWLA 4NQ1A 1FBAA 1FDYA 1OFRA 3BARA 3QSTA 3G1VA 4MLJA 5DCDA 4ML9A 3HGSA 5FESA 1AL8A 3PULA 2X2GA 1RVGA 3DKLA 3IIVA 4S1FA 2DZPA 4LW7A 2A6NA 2QCEA 4HN4A 2C1HA 1WAUA 2YW3A 1FWRA 2E6YA 3NO5A 2QF7A 5AC8A 3OHIA 4N9CA 1QR7A 3NPUA 1SFJA 3STEA 2QCCA 3CT7A 4ZQNA 3LLFA 4QNEA 3W88A 3EWYA 1JUBA 5DY3A 3SJ3A 3ZWSA 5MHBA 4LVFA 2QCNA 1G7UA 3JS3A 4Y9AA 5F4WA 2B4GA 3QYQA 1DBTA 1V7YA 2GUUA 3E02A 1UBSA 2Z0IA 4AMAA 3HGRA 2Q8LA 1FCBA 5C5YA 3P8IA 1PCWA 4LNYA 2YFOA 2ZCGA 1UUOA 2E68A 2NUXA 3QW4B 1K7FA 3GDLA 5AHNA 4O4VA 4IPIA 4UIOA 1LP6A 4JDBA 2Y7EA 3W2KA 4UTTA 3EX6A 2V82A 4PFMA 5U4NA 3NEVA 4GUIA 5BOOA 3OVRA 1ZALA 5LZLA 5HR7A 2HS8A 1TTIA 1DVJA 3F1QA 4AVFA 4FX7A 4O1BA 3CQ0A 1F5ZA 3MO7A 2ISVA 3NL5A 1TPB1 3C2VA 1GZGA 2ABBA 1SW7A 4IQLA 4JY8A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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