2B7NA

Crystal structure of quinolinic acid phosphoribosyltransferase from helicobacter pylori
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
273
structure length
273
Chain Sequence
MEIRTFLERALKEDLGHGDLFERVLEKDFKATAFVRAKQEGVFSGEKYALELLEMTGIECVQTIKDKERFKPKDALMEIRGDFSMLLKVERTLLNLLQHSSGIATLTSRFVEALNSHKVRLLDTRKTRPLLRIFEKYSVLNGGASNHRLGLDDALMLKDTHLRHVKDLKSFLTHARKNLPFTAKIEIECESFEEAKNAMNAGADIVMCDNLSVLETKEIAAYRDAHYPFVLLEASGNISLESINAYAKSGVDAISVGALIHQATFIDMHMKMA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of quinolinic acid phosphoribosyltransferase from Helicobacter pylori
pubmed doi rcsb
molecule keywords Probable nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
molecule tags Transferase
source organism Helicobacter pylori
total genus 88
structure length 273
sequence length 273
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 2005-10-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2b7nA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 2b7nA01
3N2MA 5LHFA 3A23A 1OFOA 3QJAA 3M9YA 3W7IA 6TIMA 5MHBA 1KBJA 5IBXA 2Y61A 5EKYA 3NQMA 1X8FA 2X16A 3HBLA 2B0MA 3LHZA 4CQ9A 3LXCA 4P2VA 1QOPA 1VCFA 5DLCA 3W84A 3FJ6A 1JVNA 2VENA 5DBTA 1TPB1 4HNVA 2FDSA 4MY8A 4UTWA 2E5CA 2WV8A 5AN7A 1H5YA 1L6WA 4AWTA 4LW7A 1VYRA 3GDRA 3O63A 3W7EA 3W2MA 3P67A 3NL6A 3PC0A 4GXMA 1KFKA 3PUDA 1K8XA 4O0KA 1TV7A 1NEYA 2WSRA 1OFRA 1LTDA 1TB3A 4EF8A 3NOEA 3S5OA 4N4QA 1NFBA 1I2OA 3MMTA 3R89A 1YPIA 3EWUA 2Y88A 4RJEA 1H60A 2HS6A 1R47A 1JCNA 2HSAA 5TIMA 4I9AA 1A5AA 1OYBA 1W5PA 2DZVA 3TV8A 2EGZA 5C5YA 2VOMA 1TPVA 3TU9A 1RQEA 3BK0A 2P10A 4JICA 1JCLA 4R33A 4JTTA 5E0KA 4IMCA 2FB3A 5KZDA 4FIQA 3C2VA 3NQGA 3PG9A 5KZEA 4JXCA 4ADUA 2GOUA 3STEA 1W5MA 4C1LA 2QKFA 4IJBA 1JCJA 1ADOA 3E9AA 1F6PA 5HWMA 4IOTA 3FYPA 3LCGA 4EIVA 1P0NA 1VS1A 3MHUA 2X1UA 2BX7A 1KLZA 2NUXA 5AHNA 1S5WA 1VCVA 3STFA 4JIPA 4O12A 3TKFA 2OT0A 3UYCA 2Z6JA 3G1FA 4JTSA 4QITA 3MP4A 1EA0A 1S3HA 3DFOA 5K4XA 4GNJA 4PFMA 3YPIA 1N8FA 3M7WA 5T26A 2DP3A 3HPSA 4BWLA 1OFQA 4PTNA 3W7LA 2QCDB 1BTMA 5L6UA 4H4IA 2CLKA 2YXGA 1IGSA 5EMUA 4MLJA 1JUEA 3LHUA 3CWOX 3LTYA 1PIIA 3LHTA 4L4LA 3P5ZA 1XKYA 4JTIA 4NZJA 4RKAA 5K3VA 5FF7A 2VFIA 1K02A 3C2OA 1TPDA 5HNRA 1EPXA 5DELA 2QCFA 4IX0A 3DENA 4PL2A 1R2SA 4WXYA 4E2BA 4AAJA 3HG2A 1A5BA 4UXDA 5EBUA 3W7JA 2VEMA 5HQEA 1YTKA 1W0MA 3QW4B 3LCFA 1F76A 3NL2A 4CNPA 1FWSA 4LWWA 4R7JA 4UTKA 3HB9A 4MIMA 2D73A 2J9XA 2EAWA 1YDOA 1XUUA 1W1ZA 3DFSA 3GXTA 3TAOA 3G22A 3TIMA 1EX5A 3GLCA 5AYZA 3W07A 1WQ5A 1OHLA 1VLWA 1K8ZA 4CCCA 3IRDA 4WQ6A 3CIXA 4FXRA 1WBHA 3P82A 4JNMA 3W7HA 3W70A 2Y63A 3MYOA 4JY9A 3LCIA 3W7CA 1GYLA 1GOXA 1O5XA 3TW6A 1DVJA 5CZ0A 5D05A 2A1YA 4GUHA 1K8YA 2LLEA 5I3JA 2PC4A 4ZL1A 3UZ5A 1VGAA 5I3GA 3GXPA 5H91A 4JTUA 1I2NA 4N02A 1Z48A 4A21A 2A85A 3SECA 2RKXA 4MZYA 3W1LA 1E51A 4Q33A 3SZ8A 3C3NA 3HJZA 1J2WA 3TROA 3TH6A 2Z1BA 4QISA 5LHEA 3Q58A 3PSVA 2R14A 4RZ6A 2QCHA 1FCQA 3QQ0A 5HWJA 1H7OA 1NF7A 1EB3A 2PRMA 3LXBA 2W6RA 3TQ0A 1CX9A 4MFDA 1A53A 1TPFA 2EF9A 2JBMA 4QNWA 3RLVA 5D38A 2WPBA 2QAPA 4XTIA 4OE7A 5AHMA 3EXTA 1YXCA 4AXKA 3TC6A 1X1OA 1IIHA 4ZQRA 1DJQA 1DQWA 3A5VA 4IXXA 1KFEA 3KRZA 4JS3A 1L2UA 2C0AA 4RV8A 1VJIA 5ABTA 2ZRYA 3DHFA 3L67A 3LHVA 4LUJA 3W1MA 1LBLA 3GDMA 2ZZ5A 3LM7A 1QO5A 2WSQA 1JCXA 4JTJA 4ONVA 2FTPA 3OHIA 2J9YA 3LI0A 2H8ZA 3NQDA 3FKKA 1R2TA 4CCEA 8TIMA 1WOBA 2Y7GA 3CM4A 4XWUA 4LVFA 1H7WA 5BMWA 1TV5A 1I45A 3NQ6A 5D09A 2NWSA 4GUFA 4UFKA 3B8DA 4Q4KA 1WV2A 1JCYA 1Z44A 4G1KA 3E02A 5AHLA 4LS1A 2CZ5A 1C29A 3NVTA 3MBFA 1D3HA 4K39A 3IGUA 1YXYA 2R94A 2V2HA 1JQVA 4XKYA 2ABBA 5AHFA 1MEHA 2C18A 1OYAA 2NV1A 2A5HA 1ZNNA 1TRDA 4M6PA 4OV4A 3TMQA 3ANYA 1JQXA 3E49A 3W7QA 3TJXA 1W3TA 3LDVA 3C2EA 1H7NA 2QJGA 1KTBA 4RZ5A 3MUXA 4IMFA 3RF9A 1NSJA 3LTSA 3C52A 3KVJA 3W71A 4ZQOA 5FF2A 1KLYA 1FDZA 4YL2A 3GNNA 4O8RA 2ZDRA 3ATYA 5DY3A 1TJPA 3S42A 1SW7A 4NXSA 2WKJA 5KSWA 1I8JA 2CW6A 4QJ1A 5K9DA 3MI6A 1GYNA 1K7XA 2CU0A 5IBXC 3HG4A 3W2NA 4Y6GA 4TX9A 4Z0SA 1MSSA 3T55A 2RDWA 3L21A 4HT3A 1KTNA 3WJZA 2BWGA 4BI6A 3BLIA 3A21A 3W7OA 3QFEA 4N4PA 3TFXA 2YDAA 5HINA 5J5DA 3EXRA 5E1QA 1TJRA 3CEUA 4YMZA 4XBKA 3OEXA 4QAIA 3QQ1A 1BWKA 3BGJA 2PRHA 3HGRA 2I1OA 1ZAHA 1YLVA 3UNDA 3I7RA 4DO4A 3RLUA 1WXJA 2ZTJA 2YZRA 2GVGA 1GQNA 3CPRA 4ALDA 3CHVA 4N9BA 1BWLA 4IPIA 3TJLA 4EF9A 2ZFAA 3KVMA 3NR0A 3TNOA 1GJPA 5C55A 5G2IA 3NZRA 5G2HA 1BEUA 2V5LA 1PHQA 3O05A 3W7GA 2DZWA 3BO9A 1LOQA 3N9SA 1H51A 4DEFA 1FDJA 4AB4A 1JCMP 1H63A 4RCXA 2G95A 2GPTA 3I7SA 5KTLA 3LBMA 2C14A 2NUYA 1K3UA 3CC1A 3EKZA 3IVSA 5I3FA 4K8HA 2A0NA 3G1VA 3O06A 2AAMA 4LNYA 4DBDA 3R2GA 1A5SA 2YCEA 1GZGA 5KMYA 1G4TA 4M7SA 4MJMA 4WY0A 3NAVA 1DKWA 3O6CA 3IGSA 3DXIA 5CPNA 3DAQA 4POCA 3UWZA 1WBJA 2B7QA 3L65A 2NLIA 1H1ZA 3UPWA 3HIJA 1XFBA 3VKJA 1H62A 1TTJA 3DGRA 3B06A 2H6RA 2E1DA 3LCHA 4UUIA 4LV4A 4HIBA 4EVZA 2X2GA 5D2XA 3W1PA 1UUMA 3G1XA 3NQ7A 1OJXA 5F2MA 3W9ZA 3NL5A 2J27A 5CZJA 4BWLC 3GX9A 4RK8A 4HPXA 3DFNA 3C6CA 3O6DA 3G18A 5FF4A 1VH7A 1YXDA 2QR6A 1F74A 1PL9A 1FQ0A 3G3DA 2CLHA 5HMSA 3HQ1A 4ZQNA 1VC4A 1C9DA 5CZSA 3OVQA 3G1YA 4UNLA 1XBYA 3QZEA 1U83A 3NM1A 3PR2A 1SFJA 3PM6A 4Y8FA 2QUTA 5HULA 1EP2A 1B4EA 2E6DA 3MHFA 3TC7A 2YYTA 2DZUA 2VFDA 3THQA 3TX9A 1IXOA 3DKJA 1QDSA 1P0KA 3G0UA 4JN6A 1LORA 4Z1CA 3P61A 5CZTA 2ZZ6A 3F4NA 2KZHA 1LROA 4MY1A 4MFEA 4DBEA 1LBFA 3NEVA 1OX5A 5CSSA 2ZRVA 1FCUA 3W6YA 2DZPA 4DELA 3GKAA 1SO3A 4K7YA 3DFPA 1A5CA 1DV7A 3EWBX 3CT7A 2H90A 3GIYA 2A2IA 2ISWA 3LV5A 2C6QA 1HFBA 2J6XA 4LRSA 3TSDA 3R13A 4JDBA 4FNQA 4K38A 2VC6A 4MYXA 4WUIA 1IF2A 1MEIA 1PHWA 4DO6A 1G4SA 3H55A 5C6MA 4QM1A 4MVAA 3W23A 1AW2A 1FWWA 3P84A 5BMXA 1LYXA 3N2XA 4AWUA 1ALDA 1QPNA 1D3GA 1LLZA 2ZRXA 4NNBA 1F7BA 3IIOA 1RPXA 3KXQA 3H53A 3LCLA 4Q32A 3W87A 1DHPA 3P74A 4RXGA 3NQVA 3DBPA 5I3HA 3SGZA 1TPH1 4NZFA 4ADSA 4HSOA 3EX1A 4UTIA 5TBOA 1JR1A 5G1YA 2WOQA 4UFIA 7TIMA 2I14A 3BGGA 5DCDA 4FNRA 2Y7EA 1UCWA 2CZDA 4A3UA 5DY2A 5HR7A 1XCFA 3QH2A 4JTEA 3UPBA 4O1BA 3EX2A 2Y7FA 3IV3A 4LT9A 1SPQA 2NX9A 4UFMA 1YPFA 1I2QA 3O16A 3ABQA 5D30A 1UB3A 1VRDA 1VYPX 1SZNA 3TR2A 3LHWA 4U4MA 1I2RA 5DN1A 4O1AA 5EL1A 4FX8A 3USBA 2YGYA 2VEIA 1THFD 4O10A 4M6VA 4K7VA 5F2GA 2YFOA 4UFJA 1HUVA 5FF3A 4O18A 1OX4B 2ZZ4A 2B7OA 4HNTA 5HWNA 2PE4A 2X30A 2DORA 4AVFA 2ZCGA 3UD6A 4FX7A 5F4XA 2G5WA 2VEKA 1KM6A 2QCLA 2A4AA 3UY7A 3TMLA 4KWVA 5K9CA 2EKCA 1SUXA 3S5NA 5G4EA 1U5JA 4GFSA 1M7OA 3G0XA 3Q94A 1DQXA 4MJZA 2ZA2A 3U6WA 5D2YA 3NDOA 4MZ1A 1UASA 4I7VA 3GYEA 4IX2A 1ICSA 1LRTA 5AB3A 5A5WA 4Z1AA 3M44A 4JYEA 3RFAA 3FKRA 4O53A 4R53A 5FEZA 4X22A 2V9DA 3NXFA 2NZLA 5HJLA 5AFDA 2DZTA 4PODA 3UWQA 4MY9A 3W7PA 3CEPA 3LXAA 3WJWA 3FFSA 5F4WA 4JIQA 3E96A 1AK5A 4D2JA 2F7FA 1FUYA 2QDGA 4XQ6A 1KV5A 1H7PA 3L68A 4LS2A 5TQLA 1FXQA 4JTFA 4FNPA 3S8HA 1YADA 3N19B 1GPWA 1ML1A 3PG8A 1XI3A 4LOCA 2ZBTA 1TREA 1AG1O 4JYDA 3TCEA 3ZWSA 1G67A 1W54A 3GXNA 1GVQA 4TMCA 3NL3A 5LGZA 4TR9A 1LOLA 3EXSA 5IM51 2CFFA 1SSDA 3M16A 1T0OA 1S5TA 2QCMA 1XL9A 1EUNA 1F05A 1OF8A 3S5ZA 2Y85A 5FESA 3SSJA 5KITA 1HTIA 3M5YA 4NJJA 3M47A 5CKSA 3W88A 1W31A 4RX0A 3NM3A 3P5YA 3OBKA 2XN0A 3PSWA 5F1VA 5LSMA 1GT8A 3TQVA 3ABSA 3DFTA 1PCWA 4FEZA 4U28A 2FPVA 2JK2A 4GRSA 3LV6A 4Z08A 1KM1A 3O8AA 5DCEA 2OCZA 3GKFA 1JUKA 4LVAA 3W7DA 4GE8A 5LGXA 1TPEA 4JX5A 2RH9A 3GAKA 1W5OA 1VLIA 2Z6IA 3BW4A 4NJKA 4UFLA 4I7UA 1AW5A 1PS9A 5BOOA 1B57A 2QCEA 1GTEA 2E6AA 2ALDA 2ZQ0A 2Q3OA 3GR7A 4ORMA 2E6FA 3HGOA 5G2WA 4Y90A 3FJLA 2XN1A 2V5BA 2GJLA 4LVDA 1H1YA 3IGXA 4FNTA 4FX6M 3LRMA 3FYOA 4WXZA 3E0IA 3GZ3A 2QCDA 5HR6A 4O15A 3G1SA 1RV8A 1OVDA 1B9BA 4GBUA 1T99A 4EWND 3B04A 2VFEA 2WNNA 1O94A 4RXFA 2I9EA 3DH7A 3RU6A 1IIGA 2BXVA 3KFTA 1RD5A 4KKXA 3FIGA 3VE7A 4ML9A 1JJKA 1ZY9A 1H7XA 1M6JA 2GQAA 3L5MA 2QCCA 1KBIA 3LBCA 2RFGA 3TFCA 5FEPA 4MUZA 1SO5A 1SO6A 5I3IA 3M5XA 3PAJA 4WY0F 4QNEA 3G8RA 5BNKA 1N7KA 3GB6A 3BVJA 3NGJA 2YSWA 4UNKA 4UMBA 1VCGA 3L0GA 2CLEA 4E38A 4OHQA 2QF7A 5FEXA 4AF0B 1VR6A 5H2ZA 2QEZA 2C3ZA 3C8FA 4O1CA 1LBMA 4PCFA 4OV9A 5G4WA 3NQCA 1OFDA 4AHQA 4JD4A 3B0UX 3TE9A 3HGSA 3W22A 3P62A 4NT0A 3VCRA 3KVKA 4JR5A 5K2ZA 1FCVA 1EIXA 4NXKA 4P61A 4AH7A 1P1XA 3Q37A 5DCBA 3I7QA 4N6FA 2E5BA 3LRKA 1OX6A 1WX0A 1X1ZA 4UC5A 4IUOA 2C13A 3RMJA 5CPOA 2NXGA 1OFPA 2G97A 2Q8LA 4NVTA 3GDTA 3HG5A 3CQ0A 4X3ZA 3O1NA 1QMLA 1LCOA 1TYGA 2CLFA 3VE9A 3W85A 4K37A 3NQ8A 3GAYA 1TRIA 1P4CA 3B03A 1FDYA 1OFAA 5FEWA 5F2IA 1VQTA 4Z0JA 2CLOA 1YDNA 3PBWA 1JRBA 4DPPA 4UR7A 4UTTA 4O19A 3M5VA 3ZR4A 3LX9A 3IIXA 3NQAA 3PB2A 1QNVA 4B5NA 3PUEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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