1TMLA

Crystal structure of the catalytic domain of a thermophilic endocellulase
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
286
structure length
286
Chain Sequence
NDSPFYVNPNMSSAEWVRNNPNDPRTPVIRDRIASVPQGTWFAHHNPGQITGQVDALMSAAQAAGKIPILVVYNAPGRDCGNHSSGGAPSHSAYRSWIDEFAAGLKNRPAYIIVEPDLISLMSSCMQHVQQEVLETMAYAGKALKAGSSQARIYFDAGHSAWHSPAQMASWLQQADISNSAHGIATNTSNYRWTADEVAYAKAVLSAIGNPSLRAVIDTSRNGNGPAGNEWCDPSGRAIGTPSTTNTGDPMIDAFLWIKLPGEADGCIAGAGQFVPQAAYEMAIAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Beta-amylase
source organism Thermobifida fusca
publication title Crystal structure of the catalytic domain of a thermophilic endocellulase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDO-1,4-BETA-D-GLUCANASE
total genus 102
structure length 286
sequence length 286
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 1993-06-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01341 Glyco_hydro_6 Glycosyl hydrolases family 6
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.40 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel 1, 4-beta cellobiohydrolase 1tmlA00
1QK0A 3RU8X 1OCJA 2BVWA 4I5RA 4AVNA 2BOEX 3VOJA 1TMLA 1HGYA 1QK2A 3RPTA 3VOGA 2BODX 3ABXA 1OC6A 2BOGX 4A05A 3VOFA 4AVOA 1UOZA 1BVWA 1OC7A 3A64A 4AU0A 2BOFX 3VOIA 4B4FA 1UP3A 1OCNA 1UP0A 1UP2A 3VOHA 1CB2A 1DYSA 1OCBA 3A9BA 4AX7A 4B4HA 1QJWA 1HGWA 1OC5A 4I5UA 4AX6A 1GZ1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DJEA 4JKMA 4HN4A 3SCUA 1XGZA 3YPIA 4EE9A 1UB3A 5DXXA 2ZX7A 2YW4A 1ZBWA 4PMOA 1JD7A 4MKVA 5JBDA 1GGOA 3VCNA 3GB6A 3SQLA 1ZCOA 1U30A 5AHNA 2A5HA 3OEXA 3UGRA 4L6DA 1LDCA 3NCOA 2JALA 1TWIA 1JQXA 1XGDA 4QEEA 2GQ8A 3EKLA 2UY2A 1ZSXA 1V3MA 1BTCA 1FWEC 1R0MA 4H19A 4YYFA 1KFWA 4Q8WA 3EB2A 3ARWA 1LRNA 3Q4DA 3H23A 2Z2AA 1F4AA 3CQ0A 5CPNA 3VC5A 1JRCA 2HQAA 1YDVA 1Y65A 3MUXA 1KC7A 3LBMA 2IKJA 5E0CA 1ITXA 3LNMA 1ADSA 3OBKA 4IIHA 1Q6DA 3QZ6A 4XZMX 4AZCA 3M0JA 5CLWA 3VIGA 1C92A 2DY3A 2WZMA 1EJTC 4DUOA 4R9XA 3GC4A 2J74A 2PTWA 3TOPA 3ZS4A 3QM3A 1Z9AA 5C9UA 1SFLA 3GDLA 4Q22A 3LHUA 1H50A 1XIFA 2QF8A 1AMYA 2WNWA 2UY5A 3UR8A 3L0KA 5IDZA 2WOQA 1EHNA 3ZWTA 4O53A 3TE9A 3F03K 2WMFA 3NQCA 1DYSA 2PDHA 4FLOA 3GU9A 5XIMA 3U5YA 4PULA 3C0QA 4LT9A 1PKNA 1KBJA 3HGJA 1ZPTA 1PTAA 3T09A 5BRPA 3STCA 2AQVA 2OZ8A 3WLOA 1D3HA 3KCLA 4HSNA 1M7OA 1IE7C 4ERAA 3QXBA 4OVXA 2GK1A 3HPXA 3P62A 4J2PA 4DBDA 2WSKA 1J79A 2D69A 5I09A 1EGZA 3FXYA 2X1RA 4JIHA 5EGRA 4C6BA 3P84A 3EGJA 4PUNA 4DF1A 4IJCA 4MSSA 2XGIA 4UXDA 4KIRA 2Y8VA 1SJDA 2G41A 2GQ3A 4Q32A 4C6NA 4QQ3A 3P67A 2Q01A 3GHUA 1E1EA 3FFSA 3AHYA 1H7NA 1PO9A 1PTDA 2TMDA 3HTWA 2FGBA 3IGHX 1E9LA 4HNLA 3IGXA 1LWJA 1E4LA 3W82A 2VWTA 4Z0JA 2EAWA 3H4GA 2GGEA 4OZOA 1QNOA 3SIZA 2TAAA 4P7RA 1N8WA 1XD1A 2F8QA 1M3UA 1ITQA 5TNVA 3V0TA 3FN9A 4DJDD 4CGTA 1H7RA 3FHAA 4H6KA 1X96A 3C4UA 3PBMA 5FF3A 3P14A 3QN3A 1JGMA 2ALDA 3V3WA 2PF8A 1HO4A 2NQ5A 4PFHA 3OVRA 1XM3A 4I9JA 4XSLA 2ZXDA 3M0LA 5A8OA 3NEVA 4Z2GA 1LLOA 1NQKA 2PI6A 3S1GA 1EJ7L 3W7LA 2Y8UA 4LVFA 4JQ3A 4D6HA 2FH6A 2HV5A 3ABOA 1W3HA 5D9MA 4FNQA 3NTYA 3TYAA 3TTOA 5E5CA 4LV4A 3RM9A 2J47A 2ANUA 4XTIA 3WENA 5AB3A 1D3CA 1ISVA 2VDHA 1BKHA 3QRHA 4LQ1A 1S1RA 4FK9A 5HR7A 1E70M 1TWZA 1JCLA 1IT7A 4L56A 4ZODA 3CUJA 4UTJA 2FJKA 3UZ5A 2VD8A 3TP4A 4N2YA 2BY0A 4WY0F 3AS1A 1YADA 1FHVA 5FAGA 2J7HA 2WMHA 3KVJA 1PYMA 4BQ4A 2V5KA 3KRSA 4ZQOA 2X1IA 4V28A 1T8XA 3GC2A 3W70A 3RRXA 4DI9A 3TA6A 1W0MA 3WK0A 5LA2A 3WKZA 1M01A 3VXGA 2V63A 1MSSA 4ADUA 3SQMA 2UWFA 3W86A 1G4EA 4LSBA 4U5KA 4HQVA 2E1WA 2VCAA 4LB4A 4BF7A 1K8YA 4DXVA 2NQHA 3W1TA 3H22A 5C0QA 1JFHA 1V0MA 4PMNA 1DXIA 1G0CA 5A6BD 4XD5A 3LZ3A 2F61A 4PYSA 2W3ZA 4AF0A 3DESA 4Q8MA 1EJVC 4NKCA 1RCXB 3M07A 3ZJ8A 4OJYA 4C6PA 4FLSA 4AWSA 1ML1A 1L9WA 4NJGA 5G1TA 4MZ8A 3CV2A 4IICA 5HNTA 3QPEA 4XZLX 1GW9A 3W2UA 1QOPA 4WJ8A 2GVEA 3VFLA 5FEWA 1V0KA 2VEKA 4FLQA 3HPFA 2POTA 2FFIA 1AJ2A 4JQAA 3TYUA 1F61A 5M17A 3SN4A 4D72A 3WQVA 1XQKA 2DP3A 3TLQA 1VFSA 2Z4GA 2VP8A 4IIDA 3GG7A 1CECA 4KCWA 3UWZA 4BQ2A 3CAWA 2X30A 1S2UA 2E9MA 3VNDA 4A05A 4LCQA 3K5XA 2Y1HA 4DO4A 2Y7EA 1R86A 4FXFA 1GUVA 3W76A 3F2CA 4JNZA 1YE4A 2W63A 2PA6A 5HQEA 2IKIA 3THAA 4A3QA 2WXDM 4W7WA 2VX6A 4DWSC 1VEMA 1EA9C 5CPQA 3ZFHA 1OG6A 4M19A 5K4ZA 4Z1BA 2VHLA 3RJXA 2G0WA 3TYEA 4NNAA 1KLYA 2G4JA 4Q7IA 4X9SA 1U33A 4WSKA 1FHLA 3IVTA 3REQB 1XS2A 1HKKA 2WMGA 1Y8BA 1HG3A 3L4TA 1UROA 1X6UA 1NFBA 1FKXA 4MNJA 1MQQA 4AWUA 1R5YA 1SW3A 3VZZA 3F1QA 5LNVA 1GYNA 3I10A 4BY3A 1XBZA 4WXYA 3GD6A 1W1YA 2E5BA 2XVLA 3M0YA 3VNMA 1J10A 4J1OA 3RU6A 1PKYA 1B5TA 3F2DA 5CJNA 3FJ6A 3HBLA 2WQPA 5I07A 3BCFA 4L9XA 4DZ5A 4IIFA 4JOMA 4A35A 2AMXA 3U57A 2BVWA 2YL6A 3FJNA 3ZWSA 2PCEA 1WDRA 5DXYA 2NQZA 1YTDA 1UASA 2PWEA 1QU4A 1BG9A 2WMKA 3RNDA 5BROA 4IT1A 4Q4QA 4PSRA 4ORIA 4LTSA 2PP1A 3BWWA 1W1A1 3ABZA 4HA3A 1VFMA 2EBNA 4IP5A 3W7GA 4F0LA 2QUVA 1EBGA 1EDQA 2WVSA 3SO7A 4S3GA 2DT3A 1GORA 2YBTA 4CN6A 1PUDA 4F9DA 3F4WA 2G95A 1LL4A 4KEUA 1SPQA 2NVAA 2VX4A 2Q8LA 5A2CA 3A4WA 2WM1A 3ARPA 1UUOA 2PLKA 2DDXA 4R3UA 1JQVA 4XO7A 3KHDA 4IPPA 3AYRA 4KWOA 3B0YA 3BC9A 5IHRA 4G1NA 3E49A 1EHAA 4O8RA 1Q4NX 4MKNA 3WQDA 1IT0A 1Q6GA 2VDIA 4RDZA 1BYDA 1UR1A 4ES4A 2BGNE 4BFAA 4RJEA 2NX1A 2QPUA 3N19B 4HZ7A 4K3ZA 4DBSA 1IT8A 4MB5A 3PBUA 3WJXA 4U3CA 3WLRA 3OVPA 2GGIA 1Q2RA 2YCLB 2VOMA 4UQCA 3ONBA 1JYVA 4E5TA 4NZ4A 4FHAA 1SR9A 3IIPA 1S5TA 3QC0A 2XFYA 3WF0A 4S3CA 3S42A 4BCEA 1HKMA 4XKYA 3GY1A 3S3GA 4ICNA 1OGSA 4KW2A 4U31A 4JNMA 4O1FA 3G1RA 1XDMA 4NJJA 2OYLA 1Z7AA 2CZVA 5JQ9A 1U5VA 5CBJA 4Z1DA 4AH7A 1F7BA 4FOJA 1EDGA 4GACA 1O6IA 1HO1A 1Z8AA 2V30A 3V7PA 3FK4A 4LBRA 5EKYA 4YVVA 1WDDA 4A4AA 3WQCA 5C54A 3LHVA 1JVNA 1JDAA 2NT1A 3BLLA 1XLCA 1WZKA 3H4WA 2XIIA 1TJRA 4QROA 3DG3A 1W9BM 4ZFMA 3WQPA 4C6QA 3PULA 4NP7A 1J5TA 4GJ1A 3LG3A 1RD6A 4UIOA 4H01A 1SO4A 3SCSA 1JG9A 2ZX5A 3C0SA 1F6PA 3OLDA 3ZM8A 2DUXA 3LV5A 3W27A 3ZOAA 2UY3A 3W71A 3HO8A 2AGKA 3NEHA 1P7TB 3A5FA 1W3IA 2FHBA 4GO8A 2VFHA 5BWFA 1R3YA 2R94A 1TELA 3VD7A 2CYGA 1XBYA 4PMDA 5A6BA 4JTHA 1XIJA 3VKBA 1EF3A 2VUNA 4MGGA 4TX9A 3DBPA 1RBLA 3DG6A 2XGZA 3TMLA 1XHGA 4C7FA 3UU0A 4O54A 3OPSA 3VUSA 4C6EA 1WZAA 3QHNA 1FWDC 1XYMA 3N29A 2DVXA 2EPOA 4LAOA 4XAGA 4H41A 3W38A 2YX0A 2WVUA 1I1XA 2YL5A 3KS6A 4I5UA 2GJPA 3KP0A 2C1IA 3G1VA 3W87A 2OQYA 1KKOA 4OU1A 4B16A 3WBYA 1B9ZA 1W9DM 1AFSA 4GZIA 3LA4A 3BV4A 2B7QA 3DAQA 3T81A 3O06A 2PDGA 1D3GA 5D9NA 2XSXA 4E4FA 1OGGA 2E8YA 1WB0A 4M80A 3L7RA 3T6CA 3N17A 1I1WA 1LJYA 1P7TA 3KLLA 1ZTVA 3B9AA 1FY6A 2NVDA 3TC7A 3PTQA 1RV8A 2O7SA 2DSVA 3HF3A 3H7VA 3I7RA 4AZHA 2J9ZA 3LY0A 4J9JA 1I9CB 3OGRA 1X39A 2YR1A 1LROA 2RDUA 3W3OA 1NDVA 4XV0A 3EYPA 1TJPA 4IMGA 2BY2A 1UOKA 4MUPA 3HJZA 4HU3A 4EPDC 4LGXA 4JS3A 1XIGA 3K8KA 3SN1A 2PDCA 3KBSA 4Q8NA 5JBFA 2WKJA 1NP2A 5C70A 2HK1A 1NF0A 2DIKA 4KESA 2WPBA 2HXTA 3FYYA 3ONCA 1JAKA 3NA8A 4QDMA 1W9PA 2W92A 4HZMA 1JCMP 3VNJA 1DJGA 1MDRA 2FTWA 2ADAA 1GVSA 3KZSA 4LCRA 5CJ5A 3EDKA 2DZWA 3VK5A 3LU2A 3VIKA 3CT7A 2DZVA 3EBVA 2OWWA 3E02A 2WBKA 3LV6A 1VBGA 4Y9AA 3MI3A 2ISFA 3G1FA 2BOEX 4PTXA 3G18A 3I3EA 2F6XA 2A7PA 3K8MA 4LAZA 4RE4A 4ZB0A 3WLIA 2E5CA 3U2OA 2VRKA 4NG3A 3IIZA 4DWSA 3A64A 2I57A 4S3AA 3WIJA 3E6EA 2YCIX 5EY5A 3GR8A 1XLFA 3ZYZA 3LHZA 2X1UA 4AYSA 1H7XA 3KWXA 5FJTA 3TR9A 4HMCA 3AS0A 4Q8TA 3SCTA 5DQPA 3GO2A 3SURA 4B3ZA 3VUPA 4XD4A 3BXWA 4P61A 3RM4A 2AOSA 4MZ1A 3XISA 2A2IA 4O10A 4B9YA 1JUKA 4EOUA 4K2SA 4PBGA 3TN3A 4A3UA 3PJUA 3GH4A 3TDFA 2DZBA 1OC6A 1KRMA 2QCFA 1E1CB 1L2QA 2J4GA 5FL0A 2EG8A 2DH2A 3IRSA 3UXIA 5K7JA 3QV8A 1K8XA 4GZEA 4UTHA 1K9DA 5CXPA 3ZLFA 2ZDRA 1M5WA 4UTKA 2Z1SA 1P6BA 4JBRA 2HS8A 4R88A 1OM0A 5LIWX 2HISA 3GXPA 1W6TA 3QY8A 2OLAA 1TWWA 3DI1A 3GTNA 1IR2A 3M64A 2J79A 3P81A 4IGMA 3RX4A 1NY1A 5AC8A 2HMCA 1BSIA 2DIEA 4QS5A 1E40A 4PTNA 3K1DA 2ZE0A 2YA1A 3LRKA 2X8RA 3NQFA 3JR2A 3S8HA 4Q4RA 3UWUA 1E73M 1MW1A 1EP3A 3GU2A 3M5YA 4X9YA 3EMQA 3L4XA 3T55A 1ZB5A 2BXVA 1HJUA 1E6SM 2ZXQA 1Z6KA 5HA7A 1XLGA 2E09A 2P3ZA 4MHBA 4AD2A 1OABA 1OYBA 1GVEA 1CPUA 1WAWA 4S23A 1P1XA 2BY3A 1IZJA 3W7OA 3K2GA 4HYRA 2PDYA 2VC6A 2X7VA 1B31A 2JK2A 4MB1A 1KQZA 4H2CA 1HQTA 2PDXA 2DV0A 3JW7A 1ONRA 3NQVA 3P61A 2WHMA 4MADA 5AZ0A 1SFTA 1WP6A 3M0HA 1OINA 4LS1A 1JAEA 2QHAA 4AB4A 3E3HA 4Q4SA 4M6UA 1R2TA 4JIEA 2DQWA 1Y5WA 2H8XA 4M0XA 1W17A 2DUZA 4O17A 3PZGA 1UIOA 3O1NA 2EPLX 1CGYA 2A3CA 2ISSA 2PTZA 4D1IA 4CU6A 1H7PA 3CXOA 3R6IA 2GYIA 1ECEA 1UZ4A 3AQUA 1BQGA 4O1CA 3CASA 5FEPA 3LMZA 4LEFA 2X2GA 4D1JA 4MIMA 2NV2A 2C8NA 1UYQA 4ASTA 1OHLA 1F07A 3H7RA 3GS6A 3D47A 3FDKA 1GQJA 4NY2A 3BAKA 1TWSA 1UH2A 1YEYA 2ZZ2A 1DV7A 3GFZA 2WV8A 1E4IA 4GY1A 1X6NA 4NRSA 4XD3A 4ML9A 5CC7A 4CNTA 1NVMA 2J77A 3FDGA 1ZFJA 3VCRA 1VD6A 4GI9A 3EOUA 2XFRA 2FVMA 2E6YA 4M8UA 3RO8A 3UPWA 5CGTA 3BW4A 1UBPC 2CBIA 3BW3A 3NYDA 3MKKA 1E6RA 2B7OA 1JDEA 5G5IA 3NURA 1FWBC 1VJSA 2PDQA 3AYSA 1F74A 3NZPA 4K38A 3CM4A 2QJIA 2GSJA 2SFPA 4PE8A 2R1KA 4BJHA 3M0ZA 4AFYA 1RVGA 1UMLA 4GUGA 3AMKA 1JD9A 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