4DM1A

Contribution of disulfide bond toward thermostability in hyperthermostable endocellulase
Total Genus 144
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
144
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
QTPTGIYYEVRGDTIYMINVTSGEETPIHLFGVNWFGFETPNHVVHGLWKRNWEDMLLQIKSLGFNAIRLPFCTESVKPGTQPIGIDYSKNPDLRGLDSLQIMEKIIKKAGDLGIFVLLDYHRIGCTHIEPLWYTEDFSEEDFINTWIEVAKRFGKYWNVIGADLKNEPHSVTSPPAAYTDGTGATWGMGNPATDWNLAAERIGKAILKVAPHWLIFVEGTQFTNPKTDSSYKWGYNAWWGGNLMAVKDYPVNLPKNKLVYSPHVYGPDVYNQPYFGPAKGFPDNLPDIWYHHFGYVKLELGYSVVIGEFGGKYGHGGDPRDVIWQNKLVDWMIENKFCDFFYWSWNPDSGDTGGILQDDWTTIWEDKYNNLKRLMD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Pyrococcus horikoshii
publication title Contribution of disulfide bond toward thermostability in hyperthermostable endocellulase
rcsb
molecule keywords 458aa long hypothetical endo-1,4-beta-glucanase
total genus 144
structure length 377
sequence length 377
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2012-02-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4dm1A00
1PX8A 1UWQA 2BY3A 3TOPA 3WIJA 1ZBVA 3N17A 4P8VA 3AZRA 4LPCA 3VIPA 4C7GA 1E0VA 2DH2A 1E0WA 1UR9A 1JGIA 1CGTA 1GOIA 3DECA 5AC5A 1V0MA 1UR4A 1SR0A 1E6QM 1NWUA 2D0GA 1QW9A 4ZFMA 4NSBA 1GW1A 1JYXA 4N0RA 4NRSA 1J0YA 1EIBA 2VX5A 2EPLX 1JZ8A 3A6OA 3UESA 4YN5A 3AZSA 1EGZA 3K4DA 3EDKA 1WZKA 3QOKA 4OBSA 3M7SA 2WLZA 3WDQA 4Z2IA 3ZR5A 1W3HA 1FA2A 1UWIA 1JFHA 4AZIA 4Y7EA 1RP8A 4L4OA 3IK2A 1CGUA 3BCDA 1HJWA 1Q6CA 2XIBA 2ZUVA 1PPIA 3IAPA 1V6YA 1J9YA 4D6GA 1C8XA 1OB0A 4MB4A 1KXHA 5A8QA 5A8OA 2VNCA 2CESA 1EDTA 1JAEA 4PN2A 3OGVA 4CD5A 1E1EA 2ZUUA 4JFVA 2GFTA 2YDRA 2VZVA 4H8VA 5A94A 3EMQA 1XCXA 1QBAA 2BHZA 1XD1A 1BFNA 3N12A 2EPKX 1GOWA 2XUCA 4ATWA 4CD4A 3TP4A 1XYZA 1XD0A 2XVGA 4PTWA 4H04A 1ITXA 1B3YA 4UOQA 5IFPA 4X0VA 1JI2A 1WZAA 1VJSA 4D1JA 1VBRA 2J7HA 5I3DA 3BAJA 1CTNA 3WDPP 5M03A 2VT0A 3D5HA 4AZCA 4PEEA 3D3AA 2XVPA 3CHDA 1JIBA 4FMVA 1H5VA 5BXSA 2WM0A 4GI9A 3WF0A 4AYSA 3WNKA 4UFLA 4LYRA 1HVQA 1ODUA 1E6PA 2E40A 3CZJA 4Z2JA 3ZT5A 1R86A 4M81A 3W29A 4CCEA 4UFMA 1V3JA 2EQDA 5C8BB 1W9XA 3W26A 3KEHA 1JZ6A 4UFIA 2V5DA 2W67A 1ZS2A 4Z2GA 3GH4A 3AMGA 2VCCA 3FN9A 1PIFA 5FL1A 4OBRA 5HXMA 1EQCA 2PBGA 4UR9A 1E6ZA 3SCOA 3MMWA 4L4PA 1IV8A 3MMUA 5CSYA 5A6JA 3VUPA 5A6KA 4HU8A 3GBDA 2OLHA 2VI0A 4PSRA 4W7WA 5EFFA 1AVAA 3WKZA 2WB5A 3OLGA 5AYBA 4MDOA 1OGBA 1M04A 3OLDA 2VQTA 4GIAA 1ISWA 2DGAA 1MW1A 4AD2A 4BQ3A 1IT0A 1TFVA 5HPOA 1GCYA 3W6LA 5CLTA 3MS8A 2PWDA 1B9ZA 1HP5A 1UD4A 4E8DA 4W8LA 4WK9A 1PZ3A 1H3GA 1UOKA 2ZX5A 3WD1A 4GKLA 4MAZA 2VZOA 5I23A 4PCTA 3SCRA 3K4AA 1E56A 3AIWA 3VGGA 3NJ3A 3VIOA 1UHVA 5BXRA 3EDEA 3OGRA 4U2ZA 2D20A 1KWKA 3DYPA 1NWSA 3AIBA 4Z2LA 1WPCA 3SUWA 2X0HA 2X2YA 4JHZA 4GI6A 1JDDA 3PZOA 1RH9A 2GDUA 1YHTA 3NYDA 2VL4A 1PZ2A 2FHCA 2XWEA 4UFKA 2WC3A 3WH9A 1V3KA 2GSJA 5AYIA 3GYCA 3SCPA 3AS3A 3EMCA 1N82A 4U31A 4UQEA 3ARTA 3WEOA 1JD7A 1CXKA 1JNEA 1OSEA 1PAMA 1NP2A 3W24A 4PMZA 5FD0A 1Q6FA 1MQPA 5I78A 3VKKA 4KH2A 2WVUA 1D3CA 4TVCA 4WLCA 4GZJA 3MSGA 3M07A 2VQUA 1LL4A 2WHMA 2CCRA 4M82A 5D9NA 3AICA 2UY3A 4YHGA 1HJQA 5DO8A 3AHTA 2YL6A 5ABEA 4MJ2A 3KL0A 2AOSA 3CUJA 1F4AA 3CZKA 3T2QA 4BF7A 4R27A 3CZGA 3POHA 3SUTA 2WVSA 5BYWA 1E71M 1FHDA 4MNMA 1KBKA 3ARUA 5BRPA 1BHGA 1LLOA 2UWFA 4QP0A 4ACYA 1KGXA 3FHQA 1UD8A 1EH9A 1W3KA 3VIGA 4YPJA 4UOJA 4U5IA 2BNJA 4W8BA 3CTTA 4GPNA 2BV9A 3VGHA 1CECA 4IUGA 1J0IA 2E0PA 1J18A 2XVNA 1JZ4A 1RPKA 1ZBKA 2YA2A 2WKGA 2JIWA 3BAKA 5D8ZA 4DWSD 5D8WA 1HJXA 3KE0A 3T0AA 4HTYA 4WF7A 2YDQA 4BQ4A 3W82A 1HKKA 1KR0A 2WMIB 2XYLA 2DPEA 4CD8A 5CJ5A 1E4NA 2CBUA 2XHYA 2O92A 4PMVA 3PZ9A 3NDYA 1VIWA 2YJQA 2IXVA 4Q22A 5BCAA 5A2BA 2BVYA 3FAXA 1WO2A 4UQCA 2YLLA 1R87A 5A6BD 3CLWA 4DWSB 1MYRA 2CHNA 2XM1A 4KRUA 4MTVA 2DIEA 2WCAA 2VRKA 4PTMA 3B8SA 1ZJBA 2XWDA 1PBGA 2DH3A 3VIFA 1XC6A 4GINA 2FHFA 3WENA 2EPNA 1TR1A 1VRXA 2GK1B 3AISA 1BYAA 2VTFA 3OA5A 3U7VA 4RE4A 4HP5A 4V27A 1UH2A 5E0CA 4W84A 1H0GA 1MFUA 2PB1A 2UY2A 1GJWA 1HL9A 4PTXA 1E43A 1B2YA 2O9TA 3S6TA 1J0KA 1JG9A 3MV11 2D2OA 3THDA 2Z1KA 4JKMA 3DHUA 4QCEA 4HA3A 3VX1A 1GUVA 3VGDA 1E55A 4C7DA 3BH4A 2VZSA 3VD4A 5M17A 3VNYA 3ZO9A 1Q6GA 3B9EA 4NRRA 3OZOA 2OWWA 4CN6A 4H8UA 4BA0A 2G8ZA 1ESWA 1PIGA 1HKMA 7CGTA 1H2JA 1V3IA 4QLKA 3L4WA 1UR8A 2Q8XA 1W9VA 4FLRA 2WSKA 3ARVA 5CSUA 1JF5A 1MWOA 3BAIA 1C8YA 3UR8A 4EE9A 3UG5A 2GJRA 2NT0A 4OIFA 3ZT6A 2DEPA 3WD2A 4MB1A 1D2KA 2CKSA 2WLYA 5I5RA 3UG4A 4MB3A 3VX0A 4ZE4A 1UQZA 1ZBCA 2E9BA 2EPMX 2B31A 6A3HA 5HBFA 2ZUMA 2WWDA 3MSDA 4CKQA 1W32A 5I24A 5D9MA 2EXOA 1NWRA 3ZM8A 2NSXA 3QHNA 2ZUTA 3L4TA 1B1YA 2XSAA 1LF1A 1UD2A 1CLXA 5C70A 3W25A 3NCOA 2CBVA 4AMCA 2VC9A 4P8XA 3F5LA 1W1TA 1DHKA 4HMDA 4URIA 4W8AA 1WDPA 2EEXA 1WE5A 3DYMA 2MANA 2UY4A 2BXYA 1M01A 1JI1A 4HPGA 1V0NA 4LYPA 4CVUA 5IFTA 1EO5A 2WBKA 3VGFA 1E4LA 1CXHA 1QI3A 2GVYA 3WQ8A 2WKLA 4CD7A 2VURA 5I77A 3TTSA 4BCEA 1W9UA 4M29A 1BGAA 2YBUA 2EBNA 5DEZA 2V3FA 2V38A 3IAQA 1H49A 2JE8A 4P8WA 1GQJA 1V6XA 3CH9A 3FNDA 1CGYA 1MVYA 5JBFA 3LPFA 1H11A 1GHSA 3CMGA 1TA3B 2F8QA 1JZ7A 1LG1A 1JXKA 1C3FA 1DEDA 1TVPA 1BF2A 2J77A 3FY1A 1EXPA 3UG3A 3AHYA 3K8LA 4HPHA 2BFGA 3N13A 4W85A 1KWGA 3ARRA 1G9HA 2J47A 3SURA 1HVXA 1I1XA 3VU2A 3ARWA 1E6RA 2ZXBA 1ISYA 1GOOA 1HX0A 3LPOA 3KL5A 3VPLA 2VJXA 3VINA 4UFHA 3ZJKA 4H41A 1H4PA 4HA4A 1EQPA 3BLPX 2A3HA 1HN1A 1NOUA 2E8YA 4PMUA 4XZBA 4W93A 2DSKA 4PYSA 3L4VA 4J3SA 5A2AA 3VIKA 1V6UA 2HVMA 4KWUA 3QGVA 2WWCA 1OIFA 1ZJAA 3APGA 3EYPA 4DM2A 1EDQA 3MKKA 3IJ8A 1UYQA 4CD6A 2ZOXA 9CGTA 2CYGA 2RGLA 3AI0A 3WUGA 1XH0A 1WDSA 3AS2A 2G41A 3K8MA 4B9YA 5BWFA 1VEOA 2OYLA 3WF2A 1V03A 1VEPA 2ZIDA 4W7VA 2WK2A 1C93A 4AIUA 2DT3A 5CXPA 1H0IA 2WZIA 4JL1A 2QPSA 4GQQA 4UCFA 3A4AA 4LGXA 1EOKA 1W2PA 3VIIA 1UZ4A 2YLAA 1GOQA 1CDGA 4RE2A 4LX4A 4XZWA 1E6SM 4P7LA 4KMQA 1X6LA 4QFUA 1PX3A 4D71A 3BSGA 2QF8A 3NDZA 1WDQA 2X09A 2PWHA 3T2OA 4HZ7A 4GZEA 5C71A 5FCZA 1GVIA 2OWCA 1PJ9A 2XVKA 3M46A 4PUEA 3AS1A 1PEZA 2G4FA 2XVLA 4LYQA 1SYTA 3MV01 4P7RA 4J3TA 3WL0A 4AISA 3CIVA 3ARPA 3ARYA 1Y7VA 1WKYA 3RJXA 2Y4SA 3N18A 4WKFA 3WQ5A 3ARZA 3PTMA 1SMDA 1S46A 3II1A 5LA2A 2XM2A 3VOCA 4LQ1A 2C0HA 4AY1A 4OUEA 3W37A 4M80A 2ZWZA 1V6VA 5ABFB 3AXXA 3BC9A 4MPKA 2VMFA 3PZQA 3EMZA 1JZ3A 3O6AA 1KB3A 4S3JA 5E70A 2PC8A 3MUZ1 5DT7A 3GH5A 5A8MA 5CLWA 1IZKA 3WQ6A 1FFQA 2YL8A 4CUCA 4CGTA 1F4HA 4DM1A 3F4VA 5JUVA 2OYMA 1GJUA 1IZJA 2BVDA 4EANA 5CPTA 3RM4A 2WMFA 3KZSA 1M53A 3ARQA 4W89A 1BVZA 4NZCA 3BGAA 3WNPA 5I6SA 1OINA 3WMSA 5A69A 1NWTA 1X1NA 4ZXLA 4W7UA 2CBJA 4F79A 1XCWA 1B3WA 1BG4A 2WSPA 4B3LA 4UZSA 3HJEA 1JDCA 2WCGA 4AC1X 3SCVA 4W88A 3FHAA 4ZEPA 5CGTA 2J7FA 1NH6A 3VD9A 3L4XA 1BQCA 3CMJA 1UA7A 3VDAA 4RE3A 3WH6A 1V02E 5A3HA 1WP6A 3WBAA 1K9DA 4AD3A 5DMYA 1GNXA 1ZL1A 4JFUA 4XX6A 1ITCA 3PHAA 2CITA 2YBTA 3J7HA 2A3BA 1M03A 1GQKA 1PX4A 3U5UA 4OJYA 3ZOAA 1VFOA 2WMGA 1HJUA 2YL9A 3SCQA 1BYBA 2VUYA 3ZJ6A 2VX7A 3PZGA 5I0DA 1VFMA 3VGBA 1C7TA 3WL1A 3W28A 4HOXA 3PZNA 1GVYA 3G6LA 3SUUA 3O2LA 5IDIA 3QOMA 3O9NA 3BMWA 3FAWA 2WCSA 5CG0A 2PI6A 2ZX9A 2XGBA 4J28A 3DHPA 4QLLA 3VIMA 1UUQA 3GNPA 3ALGA 2WMIA 4ACZB 4Z2HA 4ZENA 1X6NA 4F9JA 2WC4A 4TTUA 3CBWA 4MB5A 4TVDA 1XRVA 2XFRA 2WW5A 2ZXAA 4KRTA 4AZBA 5A8NA 4MNKA 2AMGA 1UQYA 4DWSA 3WH5A 1UD5A 3SEPA 3KL3A 5D9PA 1LWHA 1RP9A 2WHKA 1JZ2A 4M1RA 1FH7A 3CZ8A 2X8RA 1CGWA 2CBIA 4PCSA 1G01A 2DSUA 2GJPA 2GK1A 1AQMA 3WDIA 2YDSA 2WMJA 4WKAA 1W1VA 4W5UA 2O9RA 3GNRA 3SUVA 4D6FA 4UTFA 5A6BA 2WYSA 1C92A 1BSIA 2JF7A 4U3AA 2WVTA 4B3KA 1CZ1A 3VVGA 2G3MA 2OSWA 1CLVA 1VB9A 3WNNA 2J74A 4AZGA 3L2MA 1UKOA 4OOUA 3RJYA 1LL6A 2DIJA 1HNYA 1UWSA 2G3NA 3AXHA 3N11A 5I79A 1QI4A 1B3XA 1FFRA 1JDAA 4KGLA 4PUDA 1BGGA 2YA0A 3TTQA 5AC4A 1V3HA 4GQRA 1WCGA 3PTQA 5JIPA 1JZ5A 2DDXA 4J3XA 1R7OA 3W38A 2CPUA 1Z32X 3AMDA 2XJ7A 1FH8A 3L2LA 4U3CA 3ALFA 3CZEA 5ABHA 4XB3A 3AHVA 3ZSSA 4XV0A 4CN4A 4JFTA 2BVTA 4M56A 3VNZA 4GI8A 1OM0A 2ZXDA 1UG6A 3VM7A 2WHJA 1VBUA 2WMKA 4YHEA 3UERA 5JBEA 1GHRA 1I1WA 1P6WA 3BCFA 3ZMRA 3PN8A 1R85A 2CHOA 3T0BA 2VR5A 2W63A 3S2CA 3RM8A 2XFFA 1CWYA 3AOFA 2JF6A 1MW2A 3GXDA 4JHOA 2J7GA 3LPGA 3F5JA 3N04A 3RDKA 2JEQA 1HP4A 1UKTA 4GO9A 4A3HA 2QLYA 4D72A 3BMVA 2V3DA 4D1IA 2Y8VA 3CGTA 5GPRA 1W2VA 2J62A 2PWFA 1GOMA 3AYRA 4PSPA 4WIWA 4BQ5A 4MAVA 1VFFA 4F66A 4ZE5A 4PMXA 1V6WA 1UKSA 2FGZA 4AIOA 1XSJA 2WPGA 4XUYA 4C7FA 5CGMA 2FH8A 1K9FA 1FHLA 2HISA 4Z2KA 1TA3A 5E9AA 3L4ZA 5IHRA 3NSMA 5FIPA 5FKYA 4D6EA 1BG9A 5A6LA 3KWXA 2YOCA 1E5NA 5AY7A 3NSNA 2ZWYA 2ZICA 3NIYA 3OBAA 2X0YA 2BXZA 2VZTA 4HMEA 5HDRA 4E2OA 5LYRA 2W91A 2ZUNA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1PX8 A;  1UWQ A;  2BY3 A;  3TOP A;  3WIJ A;  1ZBV A;  3N17 A;  4P8V A;  3AZR A;  4LPC A;  3VIP A;  4C7G A;  1E0V A;  2DH2 A;  1E0W A;  1UR9 A;  1JGI A;  1CGT A;  1GOI A;  3DEC A;  5AC5 A;  1V0M A;  1UR4 A;  1SR0 A;  1E6Q M;  1NWU A;  2D0G A;  1QW9 A;  4ZFM A;  4NSB A;  1GW1 A;  1JYX A;  4N0R A;  4NRS A;  1J0Y A;  1EIB A;  2VX5 A;  2EPL X;  1JZ8 A;  3A6O A;  3UES A;  4YN5 A;  3AZS A;  1EGZ A;  3K4D A;  3EDK A;  1WZK A;  3QOK A;  4OBS A;  3M7S A;  2WLZ A;  3WDQ A;  4Z2I A;  3ZR5 A;  1W3H A;  1FA2 A;  1UWI A;  1JFH A;  4AZI A;  4Y7E A;  1RP8 A;  4L4O A;  3IK2 A;  1CGU A;  3BCD A;  1HJW A;  1Q6C A;  2XIB A;  2ZUV A;  1PPI A;  3IAP A;  1V6Y A;  1J9Y A;  4D6G A;  1C8X A;  1OB0 A;  4MB4 A;  1KXH A;  5A8Q A;  5A8O A;  2VNC A;  2CES A;  1EDT A;  1JAE A;  4PN2 A;  3OGV A;  4CD5 A;  1E1E A;  2ZUU A;  4JFV A;  2GFT A;  2YDR A;  2VZV A;  4H8V A;  5A94 A;  3EMQ A;  1XCX A;  1QBA A;  2BHZ A;  1XD1 A;  1BFN A;  3N12 A;  2EPK X;  1GOW A;  2XUC A;  4ATW A;  4CD4 A;  3TP4 A;  1XYZ A;  1XD0 A;  2XVG A;  4PTW A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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