1BQCA

Beta-mannanase from thermomonospora fusca
Total Genus 134
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
134
sequence length
302
structure length
302
Chain Sequence
ATGLHVKNGRLYEANGQEFIIRGVSHPHNWYPQHTQAFADIKSHGANTVRVVLSNGVRWSKNGPSDVANVISLCKQNRLICMLEVHDTTGYGEQSGASTLDQAVDYWIELKSVLQGEEDYVLINIGNEPYGNDSATVAAWATDTSAAIQRLRAAGFEHTLVVDAPNWGQDWTNTMRNNADQVYASDPTGNTVFSIHMYGVYSQASTITSYLEHFVNAGLPLIIGEFGHDHSDGNPDEDTIMAEAERLKLGYIGWSWSGNGGGVEYLDMVYNFDGDNLSPWGERIFYGPNGIASTAKEAVIFG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
publication title High-resolution native and complex structures of thermostable beta-mannanase from Thermomonospora fusca - substrate specificity in glycosyl hydrolase family 5.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (BETA-MANNANASE)
total genus 134
structure length 302
sequence length 302
ec nomenclature ec 3.2.1.78: Mannan endo-1,4-beta-mannosidase.
pdb deposition date 1998-08-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1bqcA00
1UR8A 1YQ2A 3WD2A 2JFEX 3I3DA 1WZLA 2VCBA 1HJVA 1UA3A 2EPOA 4TTUA 2RGLA 1PX4A 4D71A 2VURA 3U5YA 3OZPA 2XFFA 1E4LA 2J8FA 3DHPA 3AMLA 2E8ZA 4PMXA 4D6GA 5FKYA 2ZWZA 5IXEA 2VT0A 2VQTA 1UWRA 1WCGA 1V02E 1JXJA 2XVPA 1GJWA 3WD1A 3WDPP 2J25A 1EH9A 4P8UA 1U2YA 2XWEA 5CJ5A 1UD5A 2GDUA 4GI9A 4W89A 1B9ZA 3GBDA 3U7VA 3RDKA 1CPUA 2YDQA 3WNKA 5EBAA 1E6RA 4GINA 1CNVA 2QF8A 5CSYA 3MKKA 2XIIA 1ZL1A 3AFBA 2XSBA 1JFHA 1DP0A 3OB8A 1XCXA 2OLHA 1W9PA 2V3GA 1K9FA 3AIVA 3OLIA 4M56A 1CEOA 2DH3A 3SCSA 2BNJA 4H8UA 1E72M 2ZXDA 1H4PA 3UETA 4PMQA 1KQYA 2E9MA 3OZOA 7CGTA 4MAVA 2BVYA 2WC7A 2EQDA 3EMCA 3VM5A 2W92A 2NW0A 4EE9A 3WF4A 4M1RA 3AQUA 1XD1A 3AJ7A 4W5ZA 1E5JA 4CU6A 1X1NA 4W86A 2D20A 3WF0A 1B31A 3GBEA 5AYBA 2PC8A 3VILA 3GNOA 1OINA 3EMQA 3T0BA 2OYLA 5D8WA 3TONA 4BQ3A 3M6DA 4J3UA 1XV8A 3FAWA 1BHGA 2E8YA 5D9OA 2WNWA 4JFUA 2OYMA 5LA1A 2XHYA 2OWWA 2E4TA 4GXPA 3BMWA 4U2YA 2WVTA 3K1DA 1DTUA 1O6IA 5A6AA 1L0PA 2CNCA 1GONA 3ZO9A 4PMNA 1OSEA 4J3VA 3UG3A 3CLWA 4A3YA 3CO4A 3KEHA 1GOMA 3VDHA 5ABGA 1GW1A 4BQ5A 4MAZA 3L2LA 4HOZA 1H0GA 1VFFA 3VIJA 4J27A 3DYPA 3T08A 3VU2A 3WMBA 4HMEA 1HJUA 2YA2A 4ACZA 2JF7A 2PBGA 2PWFA 3L4WA 2WK2A 4JFWA 3U57A 1ISZA 2BXZA 2D3NA 3QHNA 3BGAA 1OCQA 2FGZA 1UWQA 4WKAA 3AICA 3M46A 3GYCA 1FFRA 1HP5A 2B31A 5A8QA 5KZ6A 3VX1A 2VOTA 1MW2A 1TE1A 5CQ1A 5CGTA 1EDTA 3CHDA 4UZUA 4W85A 1F4AA 2ZWYA 3A4XA 3UG5A 3L4ZA 1UG6A 3CTTA 1NWSA 4U5KA 5HNNA 3KWXA 1XSIA 4PMYA 3AMGA 2JF6A 2QLYA 4U5IA 3K8MA 1FH7A 2DT0A 2W62A 3LPFA 2BVDA 2OSWA 4Z2IA 3RM8A 4L4PA 2GDVA 1UKQA 4AZCA 3WNNA 4GZEA 5GNXA 3BXWA 2WPGA 3SEPA 4AXNA 2XYLA 4QLLA 3DECA 4ZE4A 3AS2A 1GHSA 2ZX9A 2OYKA 1KWKA 3GXDA 4M29A 4OJYA 1H5VA 3MUY1 3FHAA 4W93A 1E6SM 3ZT7A 1VRXA 3EDJA 4PMUA 3UESA 4UQAA 1XH2A 4HA3A 5M5DA 5CZKA 2DH2A 3BCDA 1HXJA 4MNJA 5CXPA 1M01A 1ECEA 1H11A 5CPQA 3VDBA 2G8ZA 3W24A 3CMJA 2MANA 2A3HA 2D0FA 1NQ6A 1V03A 1R86A 4WSJA 1K9TA 1CENA 1LL4A 3IANA 3L4TA 1E43A 2YL8A 4BQ2A 5ABFB 5A6MA 3UR8A 3W6LA 1QOXA 1JZ3A 1UWUA 4Q7NA 3AISA 4EAMA 2XFRA 2J7HA 3WD3A 3SCWA 3ECQA 2ZUSA 5IDIA 1V3KA 2UWFA 3PZ9A 2DT1A 5DF0A 2ZOXA 3AOFA 2ZICA 2XG9A 3FHQA 2WKLA 2EO7A 4GI8A 4JKKA 5A2BA 1OB0A 2E0PA 2WBGA 1XYFA 4CCEA 4MADA 1KGWA 1QW8A 3KL0A 1B3ZA 1FA2A 2J4GA 2BY2A 1WDPA 4WLCA 3WEOA 5BYWA 4ZE5A 5A1AA 2DSWA 4H7VA 4CUCA 2W67A 3ZJ7A 4PUEA 3MMDA 3UEQA 3VIIA 1ISXA 2FDMA 5IHRA 2EPLX 1JYXA 3SCNA 1KXTA 2VVNA 1TCMA 5DEZA 4CVUA 1VB9A 4J3XA 4D6DA 2W66A 1KBKA 4UFKA 4UFHA 1DWJM 1LJYA 1EDGA 1UKSA 3PTMA 2J75A 4JHOA 3VNZA 4Y7EA 1VEOA 3GXMA 3AMDA 4DWSC 2EPMX 1CXIA 1M04A 4URIA 4YHEA 2AAAA 3CGTA 3ZMRA 1VBUA 5AY7A 4AZ7A 1MFVA 2VVSA 5I78A 1B3XA 4AC1X 2J7EA 3ARWA 1EOMA 1H1NA 1E0VA 2YL9A 2FHCA 2G4FA 4HPGA 1KGXA 1PIGA 1W1PA 4M8UA 4HU8A 3CMGA 4GIAA 4PTXA 4E8DA 1AQMA 1H09A 2FHBA 2VX5A 1E6PA 4TX8A 2A3AA 1VF8A 4L4OA 1XYZA 2XUCA 1PX3A 4FLSA 4PSRA 3TOPA 2WHLA 3VIPA 3SCOA 2G3IA 3CZGA 1CGVA 1U30A 3F5JA 1BGGA 1PZ2A 3ZJ8A 1MW1A 3TTSA 5FIPA 1EOKA 1JXKA 1BFNA 3MV11 3T2OA 4JL1A 3POHA 3VTRA 4HTYA 6CGTA 4TVCA 1JDDA 4E8CA 5JIPA 4XX6A 4A4AA 1DWHM 1ZU8A 3LPPA 2W61A 1JYWA 3GM8A 4AZIA 2WMHA 4CCCA 1VEPA 2WAGA 2VZOA 1TR1A 1B3WA 2EPKX 5ABEA 3RJXA 4CN4A 3WF3A 4V27A 4UNIA 1E9LA 5IFTA 1H2JA 1BG9A 5I3DA 4CN1A 3VVGA 1VJZA 2CBJA 2Y4SA 1EHAA 1QHOA 1EA9C 2WCSA 4H04A 4ACYA 4UOQA 4U33A 1E6XM 4PCTA 3I3BA 4UFJA 1HKIA 1OBAA 1OGBA 3HN3A 1UKPA 1NOUA 4JL2A 1ZS2A 4ZEPA 4PTMA 4HA4A 1E56A 4XV0A 1KR0A 1K9DA 4U3AA 5CSUA 5KEZA 1V02A 1PAMA 2PWHA 1GQJA 3W4RA 4HZ6A 1CYGA 1E71M 1LG2A 1R7AA 3ZJ6A 2C0HA 4UCFA 5GNZA 2XM1A 1VAHA 3L2MA 1WAWA 2NSXA 1HIZA 4P8VA 3VNYA 4HP5A 2IXUA 2D22A 3OLGA 2DSZA 4R27A 2GJRA 3AHZA 4LYPA 1R8LA 3AS0A 4N0RA 2WC4A 4D6IA 3WMCA 2V3FA 5EFDA 3EDKA 1V6WA 4BZYA 2YIHA 2WMGA 2VRQA 4TUFA 1JZ8A 4D72A 2UY2A 3AXXA 1ISYA 3FN9A 3POCA 1E4NA 4UQEA 1R85A 2WMIA 4V28A 3SCUA 1QHPA 5BCAA 4FK9A 1V6YA 1FOBA 1EO5A 4AZGA 4EANA 1NM9A 1NWRA 7TAAA 1JYNA 4J3WA 3SUTA 2GVYA 3NUKA 2ZUUA 4AZ5A 4W84A 3CPUA 1VIWA 2CERA 8CGTA 1GOKA 1AQHA 1BF2A 4AD1A 2JE8A 1OD8A 1QI0A 4AIEA 3W0KA 4QLKA 1HL9A 3ARQA 3BSHA 1MQQA 1PIFA 1WO2A 3KL3A 1G01A 1W91A 4DWSB 5TD4A 2ZXBA 4AIUA 1EQCA 2A3BA 3ZSSA 3VMPA 1MXGA 1MVYA 4A3HA 1J18A 2PWEA 1OT1A 1DWIM 2VMFA 2CITA 1KFWA 2YOCA 3F5KA 1OM0A 4PMDA 4D6HA 1LL7A 3WDQA 4ATDA 3VD7A 4H8HA 4XZBA 1GPFA 2YBTA 3N9KA 1GVYA 4GO8A 2VC9A 3GH4A 3VIKA 4K68A 1IZKA 3CBWA 4GO9A 1U33A 2WM0A 1V0KA 3O9NA 4S3JA 4JFVA 3AHXA 1VJSA 1H3GA 1MQPA 5BRPA 3O2LA 2E9LA 3AXIA 4WKHA 3VM7A 6A3HA 3BAJA 1EDQA 1CWYA 4W7UA 1ZJBA 1C7TA 1UYQA 5M3WA 1KWGA 2W91A 2XSAA 3RPMA 1AVAA 1K9EA 2PWDA 1HP4A 5AC4A 2X09A 2WB5A 4BF7A 1CXLA 3AIEA 4W88A 1KGUA 4BCEA 1LLOA 1QNOA 3ALFA 1MXDA 5FL0A 3PZNA 1E15A 4J28A 4HZ7A 1SYTA 3PTKA 4AD3A 3CUFA 1KCKA 2J47A 1CXFA 3VMOA 1ZJAA 4UOJA 4WKFA 1TVPA 3CHEA 3AROA 3N04A 1XGZA 4RE2A 5JBDA 4OUEA 3WBAA 4UR9A 1V08A 1Q4NX 2ZX8A 1UR9A 2J79A 4WSKA 3S2CA 5I79A 4UFMA 5A6BA 4ZXLA 1JFXA 1GVIA 1CXKA 2XWDA 3WD4A 4C7GA 1V3LA 4XZWA 1TMQA 2VZTA 5E6ZA 1OIMA 2A3CA 2FHFA 3MUAA 4C7DA 1G0CA 3WH5A 2X0YA 3DYOA 1BVZA 4UTFA 5BROA 2VX4A 2C7FA 4LX4A 4NRSA 2GJXB 4PMVA 3N1AA 1UWIA 4MJ2A 3NDZA 1UKTA 1E3ZA 4LYQA 3W25A 5A8NA 3IK2A 1SR0A 1TZ7A 4JCLA 4P7LA 4S3KA 1W9XA 3TTQA 1HN1A 3D3AA 2F2HA 4MDPA 1JI1A 1EXPA 4BS0A 1BYAA 3B8SA 4U31A 4ML4A 3ZM8A 1J0HA 3BSGA 1J01A 4D1JA 4B16A 5E70A 2BY3A 4JFSA 1JZ7A 4MNMA 2GFTA 2EXOA 4HMDA 1LWJA 1GZJA 2BVTA 1ITCA 4MB5A 3PZUA 2WHMA 1TG7A 3AYSA 5A8PA 7A3HA 2YA0A 2WCAA 3HU7A 1CXEA 1C7SA 4Z2LA 4FLQA 2DPEA 2WLZA 1M03A 1CLXA 4UZSA 4CGTA 4PCSA 4PMZA 3RO8A 4N42A 3IJ9A 4PBGA 5M03A 1UHVA 3CZ8A 1WZAA 2PI6A 1B1YA 1E3XA 3AS1A 1PJ9A 5HPOA 2C8NA 4OKDA 3IAPA 3QOKA 2CKRA 4AD4A 3BC9A 1W2VA 1QBAA 4ATLA 3BAXA 4BA0A 2O9RA 5ABFA 2YLLA 2O9OA 1TA3B 1ZBVA 2OSYA 2D0HA 2ZUWA 2W5FA 1NOFA 4GKLA 3VINA 3SUSA 3OA5A 1HJXA 5CG0A 2ZX5A 4M82A 4YN5A 3E1F1 1ISVA 1JI2A 3AZRA 1S46A 4QLJA 4PUDA 1JDAA 2J7BA 4YPJA 1BAGA 1Q6DA 4WJXA 3O6AA 4LXFA 3ARRA 1WE5A 3CUGA 3DHUA 3VOCA 3GH5A 4TTGA 3BH4A 2BHZA 3RM4A 3QR3A 5HXMA 2ZUVA 2XM2A 2CBVA 3DC0A 1BPLB 2WWCA 4GI6A 4D6CA 4AZCB 3MSGA 1E6NA 3FW6A 4Z2GA 3BLPX 4HMCA 4RE4A 1OD0A 3AZTA 1UH4A 1TFVA 5E9AA 2DGAA 2VX7A 1KB3A 1G94A 1NH6A 2QPSA 1V3JA 5M17A 4JAWA 1WPCA 1ZBWA 3MUZ1 5C71A 1LQ0A 1A47A 2QMKA 2V3DA 1WNOA 2Y8VA 2DIEA 3U7BA 5FL1A 1HNYA 2VL4A 2DSKA 1JZ2A 1US3A 2UY5A 4OZOA 4H41A 1J12A 1MQRA 4AZHA 5A6JA 1QNRA 1X6NA 3N15A 1ZBKA 1FP8A 4B9ZA 2J78A 4UQCA 1PPIA 3PN8A 2V3EA 5C70A 1BTCA 4D6FA 3WFZA 3VD9A 3K4AA 1XD0A 4DUWA 3T2PA 2JEPA 3AIUA 4MPKA 3WQWA 3VIGA 1G1YA 2WSPA 4CD6A 2WCGA 5HOSA 3A6OA 5HBFA 3VGFA 1B3YA 2YL5A 2CHNA 3G6MA 3HMCA 1TUXA 1W9BM 3WY1A 4AMCA 3T0DA 3KL5A 5BXRA 1HKMA 8A3HA 4RL3A 2WZHA 1D3CA 1QNQA 4OOZA 2DEPA 5GNYA 4IISA 3OGSA 1JNDA 3SURA 4WF7A 1HX0A 3QGVA 4E4PA 3N18A 1ESWA 3WDHA 1WP6A 3MMUA 5D4YA 4NI3A 3ARVA 1XC6A 4ZENA 1E4MM 1M7XA 5JIWA 3VUPA 5A95A 2BXYA 2WBKA 2V5CA 4M80A 4KGJA 4MB4A 5LA2A 1E6ZA 1P6WA 4HA1A 1DWAM 2VNCA 4UFIA 4QCEA 4PMOA 1RP8A 2WVVB 4X9YA 3GDBA 5I23A 4D6JA 2CXGA 4MTVA 2UY4A 2VCCA 3BAIA 4MB1A 1CDGA 1EO7A 3GXIA 4MDOA 1JAKA 4E2OA 5A6BD 2DDXA 5DMYA 5D9MA 1C93A 1CTNA 4NF7A 3SIMA 3VD5A 2VTFA 3THCA 1PZ3A 4CD8A 2XVGA 1JD9A 5A94A 1D2KA 2HISA 1TVNA 3AMCA 2D0GA 3FXYA 4KWUA 3SCTA 3BLKA 2D3LA 1H41A 2WANA 2VRJA 3WF2A 3QHOA 1F4HA 1LF1A 1GOQA 3ZT6A 1E1FA 2BHUA 3W37A 3SCQA 2Z1SA 3WNPA 2GK1B 3DYMA 4XB3A 3AS3A 1ISWA 5DFAA 4F9DA 5CGMA 1MW0A 4MNLA 5A69A 2VX6A 2Y5EA 2VZUA 1C8YA 1JF6A 1KR1A 1XSJA 2O9PA 2G3MA 1J0IA 2HVMA 3OG2A 4AISA 4TXEA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1UR8 A;  1YQ2 A;  3WD2 A;  2JFE X;  3I3D A;  1WZL A;  2VCB A;  1HJV A;  1UA3 A;  2EPO A;  4TTU A;  2RGL A;  1PX4 A;  4D71 A;  2VUR A;  3U5Y A;  3OZP A;  2XFF A;  1E4L A;  2J8F A;  3DHP A;  3AML A;  2E8Z A;  4PMX A;  4D6G A;  5FKY A;  2ZWZ A;  5IXE A;  2VT0 A;  2VQT A;  1UWR A;  1WCG A;  1V02 E;  1JXJ A;  2XVP A;  1GJW A;  3WD1 A;  3WDP P;  2J25 A;  1EH9 A;  4P8U A;  1U2Y A;  2XWE A;  5CJ5 A;  1UD5 A;  2GDU A;  4GI9 A;  4W89 A;  1B9Z A;  3GBD A;  3U7V A;  3RDK A;  1CPU A;  2YDQ A;  3WNK A;  5EBA A;  1E6R A;  4GIN A;  1CNV A;  2QF8 A;  5CSY A;  3MKK A;  2XII A;  1ZL1 A;  3AFB A;  2XSB A;  1JFH A;  1DP0 A;  3OB8 A;  1XCX A;  2OLH A;  1W9P A;  2V3G A;  1K9F A;  3AIV A;  3OLI A;  4M56 A;  1CEO A;  2DH3 A;  3SCS A;  2BNJ A;  4H8U A;  1E72 M;  2ZXD A;  1H4P A;  3UET A;  4PMQ A;  1KQY A;  2E9M A;  3OZO A;  7CGT A;  4MAV A;  2BVY A;  2WC7 A;  2EQD A;  3EMC A;  3VM5 A;  2W92 A;  2NW0 A;  4EE9 A;  3WF4 A;  4M1R A;  3AQU A;  1XD1 A;  3AJ7 A;  4W5Z A;  1E5J A;  4CU6 A;  1X1N A;  4W86 A;  2D20 A;  3WF0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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