2QJIA

M. jannaschii adh synthase complexed with dihydroxyacetone phosphate and glycerol
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
271
structure length
271
Chain Sequence
ELFKDIKNLGKLVRLERIFNRESEKTVIVPMDHGVSNGPIKGLIDIRKTVNDVAEGGANAVLLHKGIVRHGHRGYGKDVGLIIHLSGGTAISPNPLKKVIVTTVEEAIRMGADAVSIHVNVGSDEDWEAYRDLGMIAETCEYWGMPLIAMMYPRGKHIQNERDPELVAHAARLGAELGADIVKTSYTGDIDSFRDVVKGCPAPVVVAGGPKTNTDEEFLQMIKDAMEAGAAGVAVGRNIFQHDDVVGITRAVCKIVHENADVEEALKEIRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Methanocaldococcus jannaschii
publication title Structure of 2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonic acid synthase, a catalyst in the archaeal pathway for the biosynthesis of aromatic amino acids.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative aldolase MJ0400
total genus 91
structure length 271
sequence length 271
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L, M, N, O, P, Q, R, S, T
ec nomenclature ec 2.2.1.10: 2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonate synthase.
pdb deposition date 2007-07-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01791 DeoC DeoC/LacD family aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2qjiA00
4MFDA 1EWEA 1GYLA 2QCGA 3FJ6A 2BX7A 1OK4A 2DP3A 4O12A 1RD5A 4TR9A 4DELA 1IIHA 1VZWA 4MLJA 3DHDA 1Q6RA 3W7IA 5K9XA 4JTKA 3T7VA 3W1TA 3TQVA 3NDOA 2C1HA 1W3NA 4OV9A 3L9CA 3CIWA 2J9YA 3WK2A 4K7VA 3L5AA 4A21A 4UMBA 3P81A 3W9ZA 3B06A 3MWAA 2NX9A 4TX9A 1K03A 4DXVA 3I6RA 1TPUA 1M6JA 1QPNA 2RDTA 4LTSA 2XN1A 1NAL1 2B4GA 2R91A 3BGGA 2ZTJA 3EXRA 3P74A 5CZJA 2OX1A 1KFKA 3T40A 3A22A 3C0JA 3VE7A 3N9RA 3BG9A 5T26A 1B9BA 3TXVA 2DZVA 2TMDA 3W1XA 4IX0A 3KVMA 3GLCA 2HMCA 3NZ1A 4QQ3A 1I4NA 3MO7A 3OG3A 1EA0A 1BKSA 2C6QA 4XUGA 1WOBA 1WAUA 4GUGA 4IQLA 4YL2A 4N4QA 1H7PA 1I2QA 2EKCA 3G1AA 4ONVA 2RHGA 3OVQA 1WQ5A 1K8XA 3CPRA 1Q6OA 2HS6A 1FWWA 3TUUA 1YPFA 4PL1A 1UUMA 4PA8A 3LRKA 4AF0B 3EX6A 4NU7A 3DI1A 3AO0A 5CPOA 3TNOA 5G5IA 1TPEA 3HGOA 4IGHA 3NXFA 1S3HA 3G1HA 3C2OA 3WJYA 3W1MA 3W2UA 1EP2A 2X16A 5I3IA 4ZMGA 4KWVA 3FLUA 2PRMA 2ZZ5A 4O1BA 1OFBA 2V2HA 1UB3A 3NL6A 3FEMA 4LS1A 4UTTC 3NQEA 2CLLA 2J27A 4WXZA 3DGRA 2OCZA 5BOOA 1JCLA 1LBFA 3GVGA 2Z1BA 4CCCA 1SSDA 3T78A 4OHQA 4AB4A 3W1QA 4UUIA 2YDAA 4RR4A 1BTMA 5H2ZA 3DFQA 2JGQA 5AC6A 2E6YA 3HPSA 2Y89A 1FCBA 1X1OA 4ZQOA 3NM3A 3TC6A 4O4WA 2E5CA 5K3VA 2AAMA 2RDWA 1LRNA 3BVJA 3MI6A 5E0KA 3E49A 2ZRYA 1ZNNA 3EX1A 3M9YA 1G4TA 2A4AA 3IVTA 2ISWA 4LVGA 2Q3OA 3STCA 4JX6A 4GWEA 5D38A 5AYXA 3NM1A 4OBTA 1NVMA 2TYSA 4A3UA 1OK6A 2P0OA 4DPPA 1Y0EA 3KX6A 3E12A 3W7MA 3M5XA 2WNNA 2ATMA 4FNQA 2BSLA 3TAKA 4LRTA 3TDFA 4FX7A 2V2CA 3MI3A 1GVFA 5AHNA 3UZJA 1OFAA 2QR6A 2CLOA 3S5ZA 3PG8A 3QW4B 1PHWA 3GB6A 5HUPA 4JYFA 4RK8A 3W1UA 4MJZA 3HG2A 3S5OA 3UWQA 4QIUA 3CEUA 3HIJA 1YXCA 2IQTA 3EKLA 1AW5A 3DFPA 3W7NA 1FY6A 1SO4A 1EB3A 5F2GA 2Q8ZA 5I3KA 3IIZA 1I2OA 3MJYA 5TBOA 4K39A 1RZMA 4GJ1A 3W23A 5D32A 5AFDA 3ZS4A 4M6PA 3NQVA 3R2GA 2VEPA 4JGDA 4YCOA 5AC8A 2O7SA 3LB0A 1JRBA 3TSBA 1TQXA 2YFNA 2A7NA 1ZENA 4R33A 3W2NA 1QCWA 1GOXA 4AAJA 4GE8A 4AMAA 3C52A 1OX4B 3NNTA 2YSWA 4O0ZA 4BK9A 3OVPA 1SU5A 1KM4A 2O7QA 1JCXA 5EBUA 1WX0A 2ZQ0A 1TPC1 3KRZA 4C1KA 2F84A 4PC8A 3Q37A 4UFKA 1HFBA 4JX5A 5H91A 1LBLA 3DZ1A 4DEFA 4O52A 1P4CA 1MSSA 5DBTA 1UBSA 1FCUA 3HQ1A 5K2ZA 3S9YA 4GUFA 2C18A 3DFNA 3LI1A 4MVAA 1JCJA 1F05A 3L5LA 3PVFA 3SIZA 2ZZ1A 2CZEA 4FIRA 3LHVA 3SY5A 1O4UA 5DXYA 1T99A 1KBJA 2ZZ7A 3LHZA 3S8HA 5U4NA 3W2LA 2Y63A 1K8ZA 5LNVA 2TPSA 2WSQA 4CQAA 4C1LA 4AH7A 1GTEA 2R94A 1GG1A 2ZA2A 4IX2A 4O1DA 2C13A 5F4XA 3S42A 3EXTA 4K8HA 2VEIA 3PM6A 2JKAA 3V1PA 2VEMA 5HWNA 3L65A 1VQTA 4HN4A 3QMTA 2WNZA 2V81A 2RKXA 3MUXA 3S5NA 3USBA 3STEA 3TQ0A 3D0CA 1SW7A 1XL9A 4UFJA 1K7FA 1TJPA 1YPIA 3LXCA 1VCGA 4MFEA 5CPLA 3IRDA 3P7YA 1GEQA 3CU2A 4UMCA 4TIMA 4BI5A 4LC8A 2LLEA 1J5TA 3LHUA 4OU1A 1A5AA 1MXSA 1KBIA 3EKZA 3HG5A 3W7KA 5BMXA 2Q8LA 4AHPA 1LDCA 4LVDA 1LRTA 2V5LA 2ZA1A 5K9DA 2BZNA 4GFSA 1W56A 3LLFA 2NV2A 4O1CA 3PAJA 1SUXA 1QOPA 4M5PA 1ZAHA 3LTYA 1G67A 5SWUA 4QNEA 4HIBA 4AHQA 4K8EA 3UWUA 2E09A 3W22A 1XM3A 2ABAA 2G97A 2WJZA 1WBJA 1R46A 3P84A 1OHLA 2H8ZA 3GKFA 2GVGA 3CEPA 3W87A 3C4UA 3TV8A 2NUXA 4GNJA 3N2MA 5K4ZA 3A24A 2B7QA 6ALDA 2C3ZA 1IXNA 3TK7A 3O1NA 1SPQA 4CCEA 3BPWA 3BG3A 2NWRA 2FDSA 1ZY9A 4WZHA 2A7PA 4GBUA 1DKWA 3P8JA 3UNDA 4AVFA 4AWUA 1TO3A 5FESA 2NXGA 3LRLA 1LBMA 4IPJA 4Z1CA 3S1VA 2FQIA 1GQNA 5I3GA 2WKJA 4MZ8A 5EY5A 3R8RA 4UNLA 5AHFA 3KRSA 3LHWA 4NJIA 5FF2A 3G1DA 3SGUA 4AHOA 1AL7A 4MYAA 3W70A 5K4XA 1ONRA 5AYZA 2H3BA 1KTBA 4ZQMA 2CW6A 3G1YA 3G0UA 2YFOA 3NA8A 4JY9A 1TREA 1I8JA 2C15A 3TFCA 2V30A 4WOZA 1TQJA 3W7CA 4Y9AA 3LCXA 5DLCA 3T4CA 4G1KA 3ZFHA 5C2XA 2JKEA 4P61A 3C2RA 4UFMA 1W5OA 3W2KA 5CSRA 2VENA 5K9CA 2JBMA 1TYGA 3NQDA 1XUUA 4JS3A 4N9DA 2HSAA 4FX6M 1FWRA 1QPOA 1SW0A 4O57A 4NX5A 5EYWA 4IJBA 2WOQA 1XKYA 5G2IA 3TE9A 2FPYA 2GQAA 1VYRA 2QAPA 3DFTA 5IM51 1PVNA 4UTLA 2P10A 1OX5A 2OZ0A 1VYPX 3NG3A 2PRLA 4O53A 2DU2A 4LT9A 4XBKA 4O1AA 3PR2A 3MYOA 3A21A 4UNKA 3M5VA 2ZRXA 1OX6A 4NNAA 4NNBA 4QSHA 3SSJA 2ZDRA 4I7WA 3ZWSA 3O06A 2Y88A 3QF0A 1DBTA 2VELA 3BV4A 1D3GA 1DV7A 3PY2A 4LV4A 3GAKA 4KFNA 4LUIA 3QPZA 5FF4A 4EOUA 3LM7A 1FWTA 2FB3A 3S1WA 3FOKA 1B3OA 4FNPA 3VFLA 5C5YA 3NPXA 3BG5A 3W6YA 1EP3A 1F74A 2A6NA 1X8FA 3W7JA 2CZDA 4CLMA 5MHBA 1KFEA 1MEWA 2JKPA 1LCOA 4M19A 1XBYA 4PTNA 4CQ8A 4EF8A 3M44A 1QWGA 2RFGA 3TSDA 4DO6A 4RJEA 3K30A 3V75A 2P1FA 4MZ1A 5EL1A 2CLFA 3EX4A 5HNRA 1P0NA 2VOMA 1ZHAA 3NZRA 4UR7A 1YXYA 3TX9A 2ZA3A 1FX6A 2Z0IA 4FNUA 4WY0B 1ZALA 2WV8A 3RNDA 1PCKA 1EEPA 1CW2A 3IIXA 4QM1A 3N19B 2WSYA 2DZSA 3GDRA 3QRHA 3HF3A 1NEYA 4FNSA 1O60A 1OFQA 4NUWA 2ZRZA 3TIMA 3RLVA 5AHIA 2QCHA 3O6DA 4JICA 1PL9A 4YCPA 5A8GA 3L0KA 2C0AA 1PV8A 1UJPA 2I14A 2QCNA 3LRMA 1RQHA 3W85A 4GUHA 4LVFA 3B04A 3W72A 4AXKA 5CZTA 1NF0A 3NVTA 4LWWA 4HHPA 3OEXA 2HS8A 4FXRA 5KINA 3M47A 4O15A 2BWGA 2OT1A 5D33A 1O94A 2FLIA 2GOUA 1LOSA 5D30A 3G0SA 4MPQA 3VNDA 3W71A 4R53A 4MJMA 3NQGA 3STGA 3W7PA 1D3HA 4OWGA 2V0TA 1O5KA 3MP5A 3CQ0A 1KFJA 4FO4A 5DCBA 4ML9A 5D2VA 4M7SA 2YCEA 1TCDA 4UTIA 3HPXA 3BARA 2VKZG 3PC0A 1EIXA 2PCQA 1D9EA 3RK8A 1HTIA 3UY7A 2ZRWA 3TA6A 1RV8A 4Y90A 1XFBA 4O4VA 1TJRA 1DJNA 2J88A 1FUYA 3GDMA 5TIMA 1JRCA 3W7RA 4WUIA 5K7JA 2A2IA 1P5BA 3UXAA 3HOJA 3LCFA 3LOTA 4I7UA 3M7WA 1KM5A 3QFEA 4UMAA 3GDLA 3ZWTA 1F73A 1NFBA 3BW4A 3W86A 3MHGA 3W74A 3HG3A 3L67A 4M6VA 4O28A 1VYSX 5D05A 1K8YA 5DELA 5LHFA 1HG3A 1K3UA 2XN2A 2FJKA 3MHUA 3KVKA 1H51A 3LERA 1TTQA 4XZ9A 1T96A 2G95A 3IV3A 4UTUA 1M5WA 3SJ3A 5G1TA 3PUEA 3LTSA 4XWUA 5F1UA 1JCNA 3PSWA 3MBDA 4UTWA 2V5BA 5D2XA 3BLEA 1I2PA 3N3MA 5LZLA 1ZJIA 2QDGA 2A6LA 4MZYA 3NL2A 3MP4A 1CI1A 3BLFA 3P60A 1H50A 3O15A 2KZHA 2AGKA 1R47A 1FQ0A 2DJXA 4GRSA 4CNNA 1TRIA 1PE1A 4ICNA 1RQBA 2GUUA 1EUNA 1LZOA 4LRSA 3BW3A 3QEZA 3U2OA 2YYTA 4D2JA 5F2MA 3WFAA 4JD4A 3DFSA 1R2SA 3UD6A 4MY9A 3QQ1A 2GQ9A 3SR7A 1FXPA 3W1NA 3HBLA 2FFCA 4UTJA 4N4PA 1SW3A 2C14A 3TJLA 3GYEA 4E0CA 3Q94A 3KVLA 1YDVA 3MYPA 4JTGA 2Y7FA 3WJSA 4DF1A 3NAVA 3LXAA 3UYCA 1JVNA 5FEWA 4Z08A 1J2WA 1GVOA 3T55A 5LNRA 1EX5A 3E9AA 3FIGA 2DZXA 1OFOA 1S5WA 3C2VA 2H6RA 1UUOA 1OF8A 5C6MA 4O14A 5U7SA 3B4UA 4RZ4A 4N9BA 3FYPA 3PULA 2CFFA 4XKYA 1P0KA 1JCYA 3RLUA 3YPIA 1H7NA 3OVRA 2VFEA 3G18A 1JULA 2CLKA 1N7KA 3GKAA 1G4EA 3N34A 1WYIA 2A21A 3NQ6A 2A0NA 3HGJA 1WOAA 1L6YA 5I3HA 3MBFA 2YW4A 3TR2A 1ICQA 2B7OA 2VEKA 1KM2A 4JXCA 2BTMA 3W2JA 1VS1A 2CLHA 5GVJA 3KFTA 3N14A 4P2VA 4UFIA 4FNRA 2H3DA 1AMKA 1AL8A 1VPXA 1QMLA 2X1TA 3QC3A 1VLWA 1YDNA 3NYZA 3W7EA 3STFA 5HJLA 4ZQCA 2E5DA 3CM4A 1DORA 4NXKA 4UTWC 3EX2A 2ZRUA 4A22A 3ABOA 1YTKA 3DKJA 3W1PA 5G2HA 3FS2A 4HPJA 1K02A 4JTFA 4Q33A 5AC7A 1TPH1 3M0ZA 3ABRA 2QJIA 4RZ6A 3O8AA 4H6KA 3KXQA 3W2MA 1SR9A 3TJXA 4S2BA 4IMGA 3B0UX 3ATYA 3NPUA 4LVBA 1JR1A 4AWTA 1ZAIA 2QCCA 2V82A 3H55A 1PS9A 1W5QA 3THQA 5C54A 3O6YX 3B0PA 2QEZA 4WX2A 5D2YA 3PG9A 5CG7A 2QDHA 4ADTA 5CZSA 2R8WA 4O8RA 3G1FA 5HWJA 2J6XA 3MMTA 4POCA 1TIMA 4TMCA 3OHIA 2J24A 4B5NA 3KRUA 4ZVJA 4X2RA 4KFPA 4DO4A 1WXJA 2Z2UA 5AYYA 3W07A 2X1SA 4TU1A 3IVSA 4NVTA 5E1QA 3W1AA 2ZZ2A 1LORA 1VCVA 3LTPA 2ZTKA 4ORIA 1JQVA 1Q45A 4X3ZA 2NXHA 1YTDA 5D09A 4J9JA 5F4WA 4JX4A 3G3DA 1OYBA 2R14A 6TIMA 1VLIA 3WK3A 3G22A 1LP6A 1G7UA 3L5MA 3S6DA 3WJZA 2A85A 1H1YA 5EA9A 2ZZ4A 2WPBA 1HL2A 1VRDA 4KWWA 1KA9F 1P1XA 3JS3A 5CPNA 3W7HA 1H7WA 4YXGA 1VR6A 4QJ1A 1F5ZA 1RR2A 1T8XA 1Q6LA 3N9SA 1H60A 4JTHA 2DORA 1JJKA 4Y8FA 3O07A 3DENA 1SFJA 2B0MA 4EWND 3T44A 4PL2A 2GVLA 2F7FA 4K37A 4DQWA 3PBVA 1L6WA 3UXDA 4JIPA 4NJGA 1XI3A 1LOQA 3EWWA 2WNQA 3IVUA 5AOUA 1TPVA 3W1LA 1KLYA 3NEVA 1K7EA 3L0NA 2ZRVA 3KOFA 4UFHA 3VI2A 1QDSA 4MUZA 2QCDA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2VM8 A;  3IJ6 A;  2GSH A;  2BVW A;  2DP3 A;  3GHT A;  1RD5 A;  4DEL A;  1IIH A;  1VZW A;  2EBN A;  3DHD A;  3GNP A;  2D2J A;  3MPG A;  3W7I A;  5M03 A;  3O0K A;  1UR8 A;  3W1T A;  1D8W A;  3UWE A;  8CGT A;  4RPQ A;  4UMB A;  1G9H A;  4U31 A;  2NX9 A;  4TX9 A;  4DXV A;  1QPN A;  3IUD A;  3VVG A;  3ITY A;  3M64 A;  3P0W A;  1UWT A;  4BZY A;  2PTX A;  5CZJ A;  3QV9 A;  4Z2G A;  4YHG A;  4KER A;  2GOK A;  3VE7 A;  4H8H A;  5A3H A;  2TMD A;  2Y8U A;  3KVM A;  5CPT A;  5AYI A;  3LZ3 A;  3OG3 A;  3EOE A;  4HBK A;  4Z2J A;  2Z27 A;  2ZX7 A;  6REQ A;  3OHM B;  4YL2 A;  4XZL X;  2BGN E;  4ONV A;  4C7D A;  2ZXQ A;  5I79 A;  1ONW A;  1K8X A;  1TX2 A;  1KR1 A;  5JBE A;  1EJT C;  3TUU A;  5CGM A;  3CAQ A;  1YPF A;  1I0D A;  1VFH A;  4NU7 A;  1H2J A;  1H49 A;  1HZY A;  5G5I A;  3HGO A;  4IGH A;  4JKK A;  2PF8 A;  3G1H A;  1W9V A;  3EPN A;  1BSL A;  4AXN A;  3FLU A;  5D8W A;  3KL3 A;  4O1B A;  3BUR A;  2UBP C;  1VB9 A;  3NL6 A;  1O68 A;  4WXZ A;  1X96 A;  2WWC A;  2OCZ A;  4GYP A;  2FZM A;  3H24 A;  1CGU A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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