2BXVA

Dual binding mode of a novel series of dhodh inhibitors
Total Genus 133
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
133
sequence length
367
structure length
360
Chain Sequence
MATGDERFYAEHLMPTLQGLLDPESAHRLAVRFTSLGLLPFQDSDMLEVRVLGHKFRNPVGIAAGFDKHGEAVDGLYKMGFGFVEIGSVTPKPQEGNPRPRVFRLPEDQAVINRYGFNSHGLSVVEHRLRARQQKQAKLTEDGLPLGVNLGKNKTSVDAAEDYAEGVRVLGPLADYLVVNVSSPNTAGLGKAELRRLLTKVLQERDGLRRVHRPAVLVKIAPDLTSQDKEDIASVVKELGIDGLIVTNTTVSRPAGLQGALRSETGGLSGKPLRDLSTQTIREMYALTQGRVPIIGVGGVSSGQDALEKIRAGASLVQLYTALTFWGPPVVGKVKRELEALLKEQGFGGVTDAIGADHRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
publication title Dual binding mode of a novel series of DHODH inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords DIHYDROOROTATE DEHYDROGENASE
total genus 133
structure length 360
sequence length 367
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2005-07-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2bxvA00
3Q94A 3G0UA 4A21A 3MI3A 3HB9A 4XBKA 2WSQA 2YDAA 5HINA 5KZDA 1F76A 4RJEA 1G4PA 3LRLA 2Q8LA 2QCDB 1FWSA 5D03A 2BXVA 1B57A 1X6UA 1YTDA 5F2IA 3TIMA 2GOUA 4A2RA 3CWNA 1ME7A 1W5QA 3EKLA 1H7XA 4NNBA 4S2BA 1GG1A 5F2GA 2WOQA 3G1AA 4CNOA 2ALDA 4RLIA 2V0TA 1TPC1 5I3JA 2JGQA 1NVMA 4JYDA 2P1FA 4MFEA 5ABTA 4DBEA 1AMKA 1EUAA 2VENA 1DQWA 2FLIA 2NX9A 2C3ZA 4OE7A 2PE4A 5FF2A 1R46A 1PHQA 5D09A 4I7VA 1AW1A 5AC6A 1KFLA 4AMAA 5FEWA 2RFGA 1O95A 3LCXA 2DJLA 4UTJA 4N6EA 1Q45A 1T99A 1TQJA 3W7EA 3W7OA 1OX6A 4MY8A 4RKAA 1GTHA 1TB3A 4CQ9A 1OFBA 3W3OA 5BW6A 3HGJA 1GYLA 2ZRWA 3PBYA 1DL3A 1XM3A 3O6YX 4PH6A 3W71A 4HSNA 2WPBA 5CPLA 2DZUA 1I45A 3LRKA 2I1OA 4FB7A 3C61A 3N2MA 1A5SA 4FIQA 2YFNA 4GUFA 2F84A 8TIMA 3SIZA 2V9DA 3G1HA 3B0UX 3E0IA 1IIHA 2ZZ7A 2OT0A 2BWGA 5BMXA 4UIOA 1UUOA 5I3KA 1J2WA 4OHQA 3USBA 3GR8A 3S9YA 5HR7A 3M16A 1PL9A 4JX4A 5K3VA 4GRSA 3NPXA 2A2IA 1EP1A 3EWZA 2FPYA 1AK5A 3OVQA 3W2NA 2ZYFA 3C2OA 4M6VA 2B7NA 3EXRA 3B4UA 3M5VA 4QIUA 3G1YA 1SSDA 3N3MA 4ZL1A 1IXNA 2NV1A 4Y8FA 2ZQ0A 3LHZA 4AXKA 4HNTA 4GUHA 1VLWA 4CQAA 5C6MA 4P61A 4RK8A 5EKYA 3NG3A 3CTLA 1RPXA 4NJGA 2Q3OA 4A3UA 2B0MA 4U4MA 1OFAA 4JY9A 2NX1A 2FPVA 3G22A 5D05A 4ADSA 1XC4A 3PULA 2QCMA 1F05A 1DOSA 3NNTA 2ZZ4A 5FEXA 5LHFA 3FEMA 4QNWA 1P0KA 4X9SA 1TQXA 2X1TA 1DHPA 2ZDRA 3HG5A 1KBJA 4H3DA 1QO5A 4K38A 4POCA 3FYOA 4K7YA 1DKWA 1KA9F 3GVGA 5AHMA 2DZXA 2QCNA 3NO5A 3A23A 1XI3A 5LKYA 1OYCA 2VFIA 2RDTA 1LORA 4I7WA 3IV3A 1YDVA 1S5VA 2E09A 2X30A 3M9YA 2FTPA 3G0SA 4MY9A 3M5XA 3DFPA 1XBZA 5C54A 1SQ7A 1TSIA 1OHLA 3FKKA 3BARA 3IGXA 2DZPA 4KFPA 4QNEA 4ORMA 5D30A 1AG1O 1G69A 1LM1A 2YFOA 4NX0A 1FCQA 3SI9A 4O4WA 4BI5A 5BNKA 5LNUA 3NQDA 5HULA 1F5ZA 1JVNA 2AAMA 4XKYA 4ZQCA 4JDBA 4LV4A 4N9CA 3W9ZA 4O12A 4O1CA 1XBYA 4IMGA 1LBLA 1W37A 3MJYA 1PIIA 2P0OA 1OFOA 4NJKA 1SFLA 5A8GA 1TJRA 1XDLA 4ICNA 3DBPA 1EWDA 4JD4A 2Q8ZA 3LCLA 4UTLA 3PWAA 3STCA 3MI6A 2WJZA 3NQ6A 3BG9A 1HO4A 3UWZA 3W6YA 3PBWA 3STGA 1AL8A 3LHYA 4MIMA 2E5BA 4JEQA 3L66A 1LRTA 3NQFA 4FEZA 2VEPA 5F2MA 1JCLA 2RH9A 5F1UA 2BZNA 3NQ7A 3WK1A 3W85A 3GKAA 1YPIA 3S5NA 2C0AA 3SFKA 2OCZA 3GDTA 3PVFA 2XN2A 3CC1A 3TX9A 4XKYB 3WJSA 4AF0A 2O7SA 3NGJA 5F4XA 4KFOA 5HJLA 3N34A 3MI2A 1J4EA 4N9EA 4B5NA 4L4MA 1TPB1 4JDYA 1G4TA 3W23A 1TYGA 2EGZA 1I4NA 3S42A 3MBDA 5FF3A 1L6WA 3N2XA 2QUUA 1ME9A 1S3HA 2NUWA 2OJPA 1QWGA 3DXIA 4O13A 4UTTC 3RF9A 3W7CA 3IIVA 3QQ1A 4XTIA 3QW4B 2VEMA 3W76A 5LNWA 3NAVA 5EMUA 2UV8G 5AFDA 3L67A 3W74A 4X22A 3WJYA 4EOUA 1OX4B 4M19A 1LZOA 1JUBA 4LVDA 1O5XA 1YLVA 4MYAA 3UZJA 5AYZA 4NVTA 5F4WA 3TROA 1ICQA 1DJNA 1YPFA 5FI8A 3Q2DA 1E51A 5DBUA 1KBIA 1WV2A 2VFHA 1ZALA 3P8JA 3W7PA 1EIXA 4PL1A 5C5YA 1C9DA 1NF0A 3NQMA 3T55A 3PUDA 4UMAA 5KINA 1K8YA 5CZTA 5AYXA 2TPSA 2GQAA 1SR9A 3LCIA 3MP5A 3P61A 3E96A 5C55A 1TTIA 4WX2A 3DI1A 4GUJA 3NYZA 3SGUA 3P74A 3HGRA 1EA0A 4XQ6A 1YXCA 2ZZ3A 2A5HA 1H50A 4OGZA 1LBFA 1SUXA 3NR0A 2DZSA 1EUNA 4MKNA 3VCRA 1Q6RA 1VJIA 1IF2A 1WOBA 1TRIA 1KV5A 4MVAA 1ZY9A 4HT3A 1YTEA 1BEUA 4WOQA 2LLEA 5E1QA 3EX4A 4NU7A 4XTDA 3PF3A 4O0KA 4JN6A 3PUOA 1FXPA 4UNLA 5EBUA 2GPTA 2ZFAA 3W1QA 1TV7A 4UMCA 3HBLA 4BWLA 1A5BA 1ICSA 1MXSA 3MBFA 4DPQA 1H1ZA 5HNRA 5G1TA 3M47A 1OYAA 4MY1A 1W5MA 3LTYA 3QJAA 3H54A 5I3GA 4UXDA 5E0KA 3M44A 3TQ0A 3P82A 4XUGA 1TREA 2YW4A 4DEFA 4DBDA 4JYFA 1JCYA 3M1ZA 3O16A 1K8XA 3TKFA 3S0CA 4HHPA 3W7IA 1DV7A 3VE7A 3QSRA 4QAIA 4GFSA 1SW3A 1LBMA 3CU2A 1EEPA 4IWWA 1YDOA 5J5DA 1H1YA 1KTBA 2YCEA 2A85A 5AOUA 1XDMA 4JIQA 5CPOA 2C6QA 4RZ6A 1TPUA 2C14A 2QJGA 3KOFA 3BPWA 4ZQMA 4OT7A 1LLZA 5AC7A 2HMCA 3PAJA 4O4VA 2WSRA 2ISVA 5U7SA 4ZZ9A 2NZLA 4LU0A 3P67A 4WY0B 3EX1A 3THAA 4MLRA 2A7RA 3H53A 5DLCA 3SSJA 3I7SA 5GVJA 3EX3A 3LI1A 1Z48A 5I3HA 1OFQA 1YTKA 5K9XA 3PR2A 3TDFA 3U6WA 5F4SA 1O5KA 4AWTA 3LX9A 3CEUA 3DZ1A 5DCDA 3L0GA 1TO3A 2WNQA 5I3IA 2P10A 4JICA 1C8VA 3AJXA 3BGJA 1PCKA 3HG3A 3O63A 3RMJA 5D2YA 2QDHA 3UD6A 4IXHA 3KXQA 2ZRVA 2VFGA 5KSWA 3WK0A 3MUXA 1TPH1 5LNSA 3TR2A 4FF7A 1W56A 3KX6A 4X3ZA 1H7RA 4YCPA 2JKAA 1X8FA 5TIMA 5G2IA 2G95A 3GXPA 1HG3A 1OFPA 3I68A 3JS3A 1R30A 4Z0SA 1L6SA 1X1OA 4JTKA 5L6UA 2EHHA 3V1PA 2J9ZA 3EWWA 4DQWA 2V5LA 1P0NA 1ZAJA 3P7YA 3CEPA 1H61A 3S8HA 1RVGA 3UPBA 4N4QA 4TO8A 4R53A 3W88A 1P4CA 1MEIA 3G1SA 3H55A 4NJHA 4GUGA 3EWYA 3FYPA 4JTUA 3QM3A 3W83A 4UTMA 2A21A 2Y89A 1YYAA 1ZNNA 2VFDA 4O17A 5FEZA 1KM5A 2HS6A 2FDSA 1B4EA 4E0CA 2EKCA 2DJXA 3WK2A 1OX5A 5FF0A 3HPXA 3OIXA 1XCFA 4RR4A 3HPSA 4JR5A 4FX8A 1PS9A 3IEBA 2VFFA 4UUIA 2QAFA 3T4CA 1SU5A 2NWSA 2J9XA 4JX5A 4UTKA 3O6DA 2ZBTA 2QCLA 2TRSA 1A5AA 3ATYA 3RFAA 1PV8A 2J88A 3GAKA 4IMCA 1UB3A 3PG9A 4J9JA 3QPYA 4N2YA 1P1XA 1FWWA 2HTMA 5IBXA 2HSAA 3N19B 3UWVA 4GC4A 3LLFA 1WDWA 2CLEA 4IMEA 2Y7GA 1HFBA 1X7FA 4YLWA 3BK0A 2V5BA 5LZLA 4AWSA 3W7LA 3WK3A 1M7OA 5J5RA 5IM51 3BLIA 2GJLA 3S1XA 3TQKA 1IXPA 2JGYA 2CLOA 3K30A 1UCWA 3CQ0A 4FXSA 1XBXA 1OYBA 3HF3A 3GDLA 2X2GA 3BLFA 4UMBA 1K7XA 4O54A 1Y0EA 1HL2A 2R8WA 1OF6A 1QMLA 3M7WA 1LOLA 1VLIA 3UWWA 2VEIA 1I8JA 2V30A 5D37A 1JCMP 1R2RA 1C29A 4RXGA 4PL2A 3R89A 3VNDA 1KFEA 3GR7A 4ADTA 2QF7A 4ORIA 5AHIA 5LNRA 3LB0A 3PM6A 1GPWA 3W1PA 3BO9A 3A22A 1TCDA 2ZTKA 2XFWA 1ZJIA 2NWRA 4AVFA 4TMCA 3TNOA 2NXHA 4FNSA 4HN4A 1M5WA 1F6PA 2WNNA 5D2VA 3P5YA 4AAJA 1ZFJA 4O1BA 1TTPA 2ZCGA 3C2RA 4WOZA 3L21A 1GJPA 3C3NA 3TSMA 4LT9A 4O1DA 1B9BA 1VYPX 3B03A 3W1LA 4R7JA 5CSRA 4DF0A 4HIBA 2JKPA 6TIMA 4MUZA 4FNUA 1SZNA 1KTNA 1I2NA 2QKFA 2GVLA 1G67A 4JYEA 1X1ZA 3QRHA 5HR6A 5LNVA 3LTSA 3R13A 5EPDA 3W2JA 1FQ0A 4AH7A 2J9YA 3PBVA 3TH6A 2FB2A 2V8ZA 3G24A 1KFKA 3IRDA 1A5CA 1XL9A 4IMFA 1LYXA 3BW2A 3BW3A 5G5IA 2RKXA 3QMTA 4JTTA 2JK2A 4GBUA 3G1FA 3LM7A 3KAOA 4WXZA 2CWNA 4ML9A 3ZWTA 3MHFA 1MSSA 2FIQA 1XFBA 1QDSA 4Q32A 4JNMA 1F74A 1FCUA 4O50A 3DFNA 5FF4A 1JQVA 1TPEA 3G3MA 3FS2A 5DCBA 1QPQA 2V82A 4ADUA 1VGAA 2V2HA 5LHEA 3W2MA 4JTEA 1LCOA 1VHCA 1WYIA 4BI7A 3EWXA 3P80A 3QEZA 1W3TA 1JUKA 4O57A 1NAL1 3TJLA 4BR1A 3EX2A 4ZVJA 3ABQA 1WA3A 2GQ8A 1TPWA 4WXYA 4UR8A 1GEQA 3L9CA 4LY8A 4TMBA 1B4KA 1YXYA 1MO0A 1N55A 3QMSA 1F6KA 4UTHA 1HO1A 3W75A 2E6AA 3W1AA 1G4EA 3W70A 5LSMA 1FWRA 3TJXA 4UC5A 3D0CA 2Q3RA 3NQAA 5LGZA 1OK4A 2H8ZA 1NF7A 3MW7A 4A29A 1AW5A 4UFKA 4O15A 3G1VA 1SFJA 4S2CA 4QITA 3GKFA 3L0KA 1QFEA 2E6YA 3W2KA 1ALDA 1MEHA 3B04A 4KWWA 1UJPA 3OA3A 1RR2A 4GJ1A 3PSVA 2PC4A 4Q33A 3LCGA 3N9SA 3FIGA 1VH7A 2ISWA 4IUOA 4O19A 3GDRA 1LROA 1YADA 4TU1A 1SO6A 3W7MA 2VKZG 2QDGA 3A5VA 1KTCA 1GVFA 1N8FA 1VYSX 1R2SA 4C1LA 4N9DA 2I14A 3FOKA 2TSYA 3FJLA 3UWUA 3DFQA 1S5TA 5AHEA 3TC6A 1ZAHA 4NUWA 5EA9A 4K8EA 3HG4A 4NNCA 1K3UA 2CLFA 1LDCA 4EIVA 3PY2A 3TE9A 1THFD 1M7PA 3BG3A 4MOZA 3W1XA 1RQHA 3R2GA 4Y6GA 3SGZA 5K9DA 3DFOA 4GE8A 4UR7A 3TC7A 4I9AA 1I2OA 4E38A 4JTLA 3VKJA 1GOXA 3B05A 3UY8A 4AEOA 3C2VA 2DU2A 4DXVA 3DI0A 1LOQA 1DJQA 5DY2A 3W7JA 2OZ0A 3PSWA 5D02A 2YR1A 3P81A 5DXYA 3DFSA 4K6AA 3TSDA 1WBHA 3L2IA 3UWYA 2DORA 4K8HA 3QPZA 2Y7EA 4WQ6A 2C18A 5CKSA 1KLYA 4LTSA 2QJIA 1FCBA 5D32A 1VQTA 1LOSA 3G1XA 1EP3A 1U5JA 4O14A 5G4WA 3B0PA 2VXNA 1KM1A 4CNNA 3B06A 4MZ8A 1YXDA 1XBVA 4YWIA 5G4EA 3HOJA 2J27A 1IGSA 3GK0A 3OHIA 2E5CA 3OVPA 3KFTA 4UFIA 3LDVA 1WAUA 1OJXA 3UXAA 4E2DA 2BSLA 3LBMA 4AF0B 1Q3NA 3QYQA 1N7KA 3QZEA 3LLDA 5EYWA 3TU9A 4LOCA 1K7EA 3DFTA 4MZYA 1SZGA 1WQ5A 2D73A 5CPNA 3C8FA 2A0NA 2YX0A 4JS3A 1EPXA 3SZ8A 3THQA 2GQ9A 3T78A 3CHVA 3TW6A 4U28A 3MP3A 1Q6QA 1WOAA 5AHFA 3IIZA 4G1KA 4S1FA 3DAQA 5CGQA 3RK8A 3NOEA 3P62A 3MWAA 2JBMA 1BWLA 4PA8A 5K4ZA 1AL7A 2C13A 4BK9A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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