2PC8A

E292q mutant of exo-b-(1,3)-glucanase from candida albicans in complex with two separately bound glucopyranoside units at 1.8 a
Total Genus 150
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
150
sequence length
394
structure length
394
Chain Sequence
AWDYDNNVIRGVNLGGWFVLEPYMTPSLFEPFQNGNDQSGVPVDEYHWTQTLGKEAALRILQKHWSTWITEQDFKQISNLGLNFVRIPIGYWAFQLLDNDPYVQGQVQYLEKALGWARKNNIRVWIDLHGAPGSQNGFDNSGLRDSYNFQNGDNTQVTLNVLNTIFKKYGGNEYSDVVIGIELLNEPLGPVLNMDKLKQFFLDGYNSLRQTGSVTPVIIHDAFQVFGYWNNFLTVAEGQWNVVVDHHHYQVFSGGELSRNINDHISVACNWGWDAKKESHWNVAGQWSAALTDCAKWLNGVNRGARYEGAYDNAPYIGSCQPLLDISQWSDEHKTDTRRYIEAQLDAFEYTGGWVFWSWKTENAPEWSFQTLTYNGLFPQPVTDRQFPNQCGFH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Candida albicans
publication title Carbohydrate binding sites in Candida albicans exo-beta-1,3-glucanase and the role of the Phe-Phe 'clamp' at the active site entrance.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Hypothetical protein XOG1
total genus 150
structure length 394
sequence length 394
ec nomenclature ec 3.2.1.58: Glucan 1,3-beta-glucosidase.
pdb deposition date 2007-03-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2pc8A00
1GOIA 3GZAA 1WO2A 5CPSA 1CIUA 3BCFA 3IJ9A 1NM9A 4XV0A 2DEPA 1TFVA 2WHMA 3ZIZA 2CEQA 3ARPA 1ZBCA 2ZOXA 1BPLB 4GIAA 1X1NA 1EQCA 2EQDA 2YL5A 4AZ6A 2YA2A 1UH4A 4A3YA 2WNWA 3RCNA 5IFPA 1RPKA 1F4AA 2NW0A 4HMEA 1JDDA 2VI0A 4Q22A 1MW1A 3MSGA 4AMCA 1CXLA 1C3FA 4Z2HA 4MPKA 2WWCA 3ARVA 2VTFA 1OWQA 1RD6A 2ZE0A 3OLIA 3AIBA 3WY1A 3W25A 1M01A 3VIKA 2WMGA 3CZLA 2CNCA 1TG7A 1EO7A 4H41A 4GQRA 4QP0A 4CVWA 3WNLA 4W85A 2UWFA 3CLWA 3PTKA 2BVYA 2ZUVA 4XB3A 1O7AA 4PTVA 4UR9A 1CDGA 1TA3B 5A8PA 4JCMA 4AZGA 1MWOA 3PZQA 4J28A 1E6ZA 3WUBA 1DEDA 4TVCA 2W67A 3PZVA 2A3HA 3RDKA 4P7OA 4MB5A 1E6PA 3AHYA 1W3HA 4JIEA 3CZEA 5CG0A 1E6SM 3RM9A 4J3TA 1WDPA 3QOKA 1LL6A 3UETA 4TXEA 1UR9A 2PWFA 5EMYA 5M3WA 4D6JA 1K9FA 3WD2A 1E1FA 2DIEA 1GOMA 3VUPA 1CXFA 4ML4A 1KBKA 1ECEA 2ZXQA 4KMQA 4E2OA 4HU0A 2BY2A 4MNJA 5A94A 3PZNA 5GNYA 3ZR6A 4HA3A 4CD7A 3M46A 4AD2A 3PZMA 1ZB5A 1UYQA 3PZTA 1LLOA 1E0XA 1QNPA 2PF0A 3KWXA 5AC4A 3EDKA 3WQ5A 3WQ4A 2NT0A 1CXEA 3K8MA 5IHRA 2BV9A 2WZHA 3MANA 4OIFA 5ABFA 2OLHA 1TMQA 2CITA 3N11A 3W82A 2YL8A 3FNDA 3ZJ7A 1V02E 1JZ4A 4W84A 3F5JA 3ARZA 5M17A 4DUVA 3CUJA 3W27A 3WUEA 1GJUA 1UZ1A 2V3FA 2DT2A 1TE1A 4FLQA 4GI9A 1HJVA 3BAYA 2DDXA 2OWWA 1YQ2A 1C8XA 1FP8A 3VMNA 2X09A 3BGAA 3RM4A 3UEQA 2WVSA 1WKYA 1H5VA 3NUKA 1ZL1A 2X1IA 1UKSA 3MMUA 5GNXA 1SR0A 2X8RA 3CUIA 5A2CA 1VFUA 5DO8A 1B3XA 1H0IA 4IISA 2PWGA 4AIOA 4HU8A 2ZX5A 2PBGA 3WQWA 5ECUA 1PX3A 2IXVA 5E6ZA 5IXEA 2XFYA 4D1JA 3WNOA 1B2YA 5JBEA 4U31A 4CN4A 4URIA 3CMJA 2Q8XA 3CZJA 5A6KA 1UD8A 2D0GA 3WNNA 1RP9A 5FIPA 4C7FA 3BMVA 3KL0A 4PMDA 4AC1X 5BROA 2XHYA 3VD3A 1US3A 4PMYA 1XCXA 4BA0A 3WBAA 2V5DA 1CBGA 3DECA 1TCMA 1JXJA 3MS8A 1IZJA 3OLEA 1VFOA 2WCAA 1R86A 3UCQA 5I79A 3W4RA 4AISA 3LMYA 3PZIA 4FLSA 5AC5A 5EB8A 2PBOA 3BAKA 4WJXA 5D9OA 5A2BA 1HIZA 2E9BA 1V3IA 3ARXA 1TA3A 1KCLA 1VENA 1SMDA 2X0HA 1LL7A 3PN8A 2OWXA 1UKQA 4AZ7A 2GSJA 1EDQA 5A95A 2W63A 1BLIA 1XYZA 4RE4A 3VNZA 1SYTA 4WKHA 5DF0A 3VDHA 1JDCA 1NQ6A 2DT3A 4XUYA 4HA4A 3A4AA 2OYKA 1SFSA 1UKOA 2DH2A 3B9DA 3VDCA 4QFUA 3W29A 3AYRA 4F66A 1E4MM 3RILA 3SCRA 1V3JA 1JYWA 1OSEA 1OB0A 4WK9A 4GXPA 1PZ3A 2BXYA 3OIHA 2DSKA 2NSXA 2XIIA 1ZJBA 3CHCA 5A6BD 1K9DA 3WH6A 3MUIA 2J8GA 2YDQA 1HF6A 1VB9A 3N04A 1V3HA 4HZ6A 3OG2A 3CUHA 3MSDA 3WFZA 1HKJA 3BLPX 3VU2A 3GH7A 1BYAA 1MQRA 2YDRA 3BAJA 4LYPA 1G9HA 2C8NA 1JD7A 1KFWA 3NIYA 2WPGA 1EH9A 5ABGA 3EDFA 1GONA 2EO7A 4Y7EA 1J9YA 1LG1A 5IFTA 3WF0A 1V6XA 3WIJA 2ZX7A 1PAMA 3LPOA 4F9DA 3ECQA 3SIMA 4W5UA 1W9PA 5A6AA 2DH3A 1J01A 4WKAA 4C7GA 2O9PA 3VIHA 3WNKA 2Y24A 3N1AA 4UQ9A 4QCFA 4Z2GA 1HVXA 1J11A 3HJEA 1UR8A 4OJYA 2J4GA 3BSHA 2EPOA 2BHZA 2DQXA 1OIFA 4U33A 5ABHA 4UFJA 4ZEPA 2WMKA 3AMCA 4S3KA 3EYPA 3WENA 3TTQA 4AZIA 3CH9A 3CHEA 4HOZA 1F4HA 1HP4A 4B3KA 4BQ3A 3FAXA 7CGTA 2D1ZA 1J12A 2ZUMA 2EPLX 3WSUA 5KEZA 2VVNA 3T0BA 1UA7A 3K1DA 4ZFMA 1U2YA 2D0HA 2XSBA 4DM1A 4JFSA 3GNOA 3CUFA 4ATLA 2QLYA 4LGXA 1JXKA 4CN6A 3NSXA 1JDAA 1B3ZA 1XSIA 5A1AA 1BGGA 1EDTA 3ZO9A 2G3MA 1UR1A 2WC4A 4CUCA 1QPKA 4D6DA 5FL0A 3S2CA 3F4VA 2UY5A 1QNRA 1QHPA 4U5IA 1IV8A 2VZTA 1V0LA 4PBGA 5A8MA 1E71M 4MB1A 3OLGA 1KBBA 2D0FA 1L0PA 2E9MA 2CERA 4M80A 4W87A 2XFRA 5ABEA 3AHZA 1GW1A 1UR2A 1CWYA 4HP5A 2VUYA 2PI6A 2YLAA 1UWQA 2CESA 2YOCA 2QPUA 3SCWA 3CZKA 2ZUWA 1MFVA 3IJ7A 1GHSA 1W2PA 4MDPA 8A3HA 1LJYA 3GTNA 1OCQA 1H41A 1UD5A 3MUY1 4FMVA 2VX7A 1B0IA 5I3DA 6TAAA 3WQ6A 1WDRA 1FHLA 4JKKA 1U30A 1QBBA 3BH4A 4AZBA 1KGUA 3VX0A 1BAGA 3O9NA 2J8FA 2XGBA 5CSYA 3U5YA 2VZUA 1KGWA 3M6DA 4P7NA 4PCTA 4R27A 1WCGA 3BSGA 1MW2A 1ISXA 1S46A 2YLLA 5A8OA 2XGIA 5CLTA 2ZXAA 1UD2A 3GXMA 5I77A 1LQ0A 2F8QA 5C8BB 4HZ7A 4LQ1A 3FHAA 2XG9A 5HOSA 2JFEX 3FW6A 2EPNA 2QF8A 3ALFA 4BZYA 3CGTA 5FOOA 5E70A 3AIRA 2DSVA 3BCDA 4GO8A 2WMHA 4UQAA 4MJ2A 5DFAA 4EANA 1R7AA 3QR3A 4GZIA 3J7HA 2XM2A 3CIVA 2VT0A 3AS3A 4P7QA 2YA1A 3MV01 2BNJA 2CHNA 1E4NA 1W9UA 1UWTA 1QHOA 5M5DA 5BRQA 2GJPA 3GYCA 2Y5EA 4JFUA 4JHZA 3ZJKA 1V03A 2WSKA 4M81A 1MXGA 4F79A 1OM0A 3ZMRA 3ZT7A 1I1WA 2E3ZA 1Q6CA 3AXXA 3EMZA 4FK9A 1E72M 1C93A 1JNDA 1BG4A 1LG2A 2BY3A 1JGIA 4CD6A 1HX0A 5I5RA 4BQ2A 3VIGA 1JL8A 1QBAA 4IPLA 4DM2A 3BC9A 1E5NA 3PBGA 1YHTA 1EO5A 2YKKA 1QVBA 2ZX9A 2XFFA 1KXQA 3BXWA 1Q6FA 2GJRA 3WF2A 3WD0A 5DT7A 2YIHA 3K8LA 4CN1A 3BLKA 2BY0A 3B9AA 4UNIA 4DWSB 4WF7A 3ARSA 4X9YA 2ZWZA 1GPFA 1AMYA 3ARQA 1FOBA 1BHGA 2J7EA 4HZ8A 1L8NA 2PWHA 1VAHA 1EA9C 2CBUA 1E3XA 4RL3A 1UUQA 4JZ5A 1OD0A 4D6CA 3WDIA 3AIQA 4B16A 1C92A 1H2JA 1WE5A 2FH6A 3FHQA 1XCWA 3TTOA 1RP8A 4UQEA 2ZIDA 4NF7A 1NWRA 3T0AA 1TR1A 3AZTA 3WL0A 1QI4A 2VRQA 3ARWA 4W7WA 2G4FA 2C7FA 3MUAA 1NOUA 2WLZA 2XJ7A 3ZQ9A 4UFMA 4HOXA 1WZAA 4QCEA 1UWSA 3ZR5A 1VJZA 1W9VA 2ZUUA 3M7SA 2WKGA 4GKLA 3UR8A 4AD3A 2J7HA 1RH9A 5CPTA 3MUZ1 1E1EA 1FHDA 4W89A 2ZX6A 2WC7A 2YL6A 4OZOA 3BAXA 2X0YA 3W6LA 3AZRA 5A6MA 2OYLA 1OD8A 5A6LA 3VIFA 3A6OA 3L4TA 3W0KA 4AZCB 3UESA 4TX8A 4LYQA 3AMKA 2EPKX 2GJXB 1UH2A 4BCEA 3SEPA 3WN6A 4PMRA 4CD8A 1UKTA 1WZLA 4V2XA 3EMCA 1NP0A 4PSRA 1VBUA 3OZOA 4H8UA 1CXHA 2BVTA 4P8VA 4D6FA 3NSNA 4W8LA 4Q7NA 3UERA 1E70M 3CHDA 3PHAA 3WBEA 1JZ7A 1CYGA 1IZKA 4UFLA 4D6HA 4NSBA 3PZOA 3WQVA 2CIPA 3OGSA 5I24A 2CETA 3VMOA 4ATWA 2J62A 1KWGA 4V27A 2XIBA 1EOMA 2UY2A 3A47A 1ZBWA 2F61A 2WVVB 4JAWA 3GXFA 1XSJA 4J7RA 4A4AA 3N15A 3MKKA 4EAMA 2GFTA 2WZIA 1O6IA 5CXPA 1J18A 1GZJA 1E6XM 3NYDA 1CENA 2DSZA 1XRVA 4GO9A 1ZBKA 5FL1A 3I3DA 1D3CA 1JI2A 1UOKA 1E0VA 3RM8A 2G41A 4DWSA 1VFFA 4JCLA 3PTQA 4Z2KA 1EDGA 4YN5A 2G3JA 2W62A 6CGTA 1OINA 3F5KA 4Z2LA 1FH9A 2JF6A 1ITCA 1HL8A 3K8KA 1GORA 2YBUA 4CCEA 4PRWA 1CLXA 2CPUA 2ZUSA 1I1XA 3BAWA 4JFTA 3VIIA 1W91A 2XM1A 1Q6GA 2QPSA 5C71A 3ARYA 1CGVA 2VR5A 2BHYA 5JIPA 4AD4A 3K4DA 2DGAA 4UQBA 2CKSA 1MFUA 4QLJA 4C7DA 3SCNA 4DUWA 3AIVA 3IJ8A 2E8YA 4HA1A 2J7CA 1EHAA 1C8YA 2G8ZA 3II1A 4CKQA 3AICA 3KL5A 3SUVA 2WW5A 4H04A 4CVUA 4AEEA 5AYBA 2V3DA 3RJXA 1J0IA 4DUXA 4TX6A 3WD3A 1M03A 1HT6A 2VL4A 3ZSSA 3ZJ8A 2JALA 1MVYA 1R87A 1PJ9A 4E8DA 3KZSA 4M82A 2WHJA 2WC3A 4FLOA 2D22A 2VQTA 1LL4A 1VFMA 4PMXA 1QHZA 8CGTA 4YHGA 5GNZA 3TONA 2WLYA 1J0KA 4AZCA 1V6VA 4V28A 5A8NA 3CZGA 1AQHA 1GUVA 2XYLA 2GJXA 2O9RA 2EJ1A 3T09A 3G6LA 4OOUA 7TAAA 2FH8A 2ZXBA 1X6LA 2Y8VA 2OYMA 3K46A 3VGGA 3VO0A 1WP6A 5JUVA 4L4PA 4PN2A 3VTRA 4A3HA 7A3HA 5CLWA 3QHMA 2BHUA 4ATDA 5EFFA 1DP0A 3MMWA 2D24A 1G01A 2JEQA 2J7GA 1NWUA 3AFBA 3AXHA 4MNLA 1QI3A 2WVVA 2WWDA 1PIFA 1HKIA 4TVDA 1AQMA 3CPUA 3CZ8A 1V3LA 1P6WA 1EHNA 1HKMA 3TTYA 3VGEA 1CPUA 5D8WA 3WDRA 1R8LA 5HDRA 3AHTA 4LYRA 4CCCA 4PEEA 1W32A 1AVAA 2CBVA 1ODUA 2W92A 2VCAA 1J0JA 3ARTA 4PMVA 4AEFA 2JIEA 3WF3A 1DWIM 3OZPA 3OGRA 2BXZA 3UG5A 2QMKA 4ZENA 1H0GA 1XYFA 1NOWA 4ZXOA 1JZ2A 3SCPA 1E4IA 3TP4A 4MTVA 1W1PA 1GOQA 5E0FA 1X6NA 2VCBA 4B15A 3IANA 1UZ4A 1EQPA 3SUSA 4MNMA 3T2QA 1E5JA 2O9TA 4FF5A 4AZHA 4EKJA 1EXPA 4AXNA 1Y7VA 5LA1A 3WEZA 5CSUA 4UZSA 3CUGA 4ZE5A 1VF8A 4J3UA 5A2AA 1C8QA 4J27A 4W7UA 4NZCA 3AI0A 1E9LA 5D9NA 1K9EA 1TVNA 1HJSA 2D3NA 1PPIA 3CBWA 3DYPA 3VNYA 3WUFA 3VINA 2J79A 1C7SA 3T2PA 1OGGA 2WHKA 4MAVA 4W8BA 3VKKA 1KQYA 3B8SA 2BVDA 4JKLA 2DPEA 3RPMA 3WH7A 1UQZA 1XSKA 2WSPA 1R7OA 3AMGA 3O2LA 4NRRA 1BYBA 3EDEA 2EXOA 2BS9A 2WZEA 1GCYA 2WYSA 4UOZA 4HPHA 4U3CA 4PTMA 1HJWA 1CECA 3L4UA 3N13A 4TVUA 2X05A 5LA2A 3K4AA 5FD0A 3CMGA 3SCTA 2OSXA 2ZXDA 3L4XA 1E56A 3ZSTA 3I3EA 4UCFA 2XVPA 1DWAM 1GQLA 2GDVA 4S3JA 4KWUA 2WBKA 4MAZA 2XUCA 3TA9A 1W9BM 4OBSA 1KQZA 1JF6A 2E4TA 3VVGA 1E0WA 5DEZA 1B90A 1JI1A 2O9OA 4PMZA 1PIGA 3VDAA 1K6AA 5LA0A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1GOI A;  3GZA A;  1WO2 A;  5CPS A;  1CIU A;  3BCF A;  3IJ9 A;  1NM9 A;  4XV0 A;  2DEP A;  1TFV A;  2WHM A;  3ZIZ A;  2CEQ A;  3ARP A;  1ZBC A;  2ZOX A;  1BPL B;  4GIA A;  1X1N A;  1EQC A;  2EQD A;  2YL5 A;  4AZ6 A;  2YA2 A;  1UH4 A;  4A3Y A;  2WNW A;  3RCN A;  5IFP A;  1RPK A;  1F4A A;  2NW0 A;  4HME A;  1JDD A;  2VI0 A;  4Q22 A;  1MW1 A;  3MSG A;  4AMC A;  1CXL A;  1C3F A;  4Z2H A;  4MPK A;  2WWC A;  3ARV A;  2VTF A;  1OWQ A;  1RD6 A;  2ZE0 A;  3OLI A;  3AIB A;  3WY1 A;  3W25 A;  1M01 A;  3VIK A;  2WMG A;  3CZL A;  2CNC A;  1TG7 A;  1EO7 A;  4H41 A;  4GQR A;  4QP0 A;  4CVW A;  3WNL A;  4W85 A;  2UWF A;  3CLW A;  3PTK A;  2BVY A;  2ZUV A;  4XB3 A;  1O7A A;  4PTV A;  4UR9 A;  1CDG A;  1TA3 B;  5A8P A;  4JCM A;  4AZG A;  1MWO A;  3PZQ A;  4J28 A;  1E6Z A;  3WUB A;  1DED A;  4TVC A;  2W67 A;  3PZV A;  2A3H A;  3RDK A;  4P7O A;  4MB5 A;  1E6P A;  3AHY A;  1W3H A;  4JIE A;  3CZE A;  5CG0 A;  1E6S M;  3RM9 A;  4J3T A;  1WDP A;  3QOK A;  1LL6 A;  3UET A;  4TXE A;  1UR9 A;  2PWF A;  5EMY A;  5M3W A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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