4LVDA

Fragment-based identification of amides derived from trans-2-(pyridin-3-yl)cyclopropanecarboxylic acid as potent inhibitors of human nicotinamide phosphoribosyltransferase (nampt)
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
479
structure length
469
Chain Sequence
EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Identification of amides derived from 1H-pyrazolo[3,4-b]pyridine-5-carboxylic acid as potent inhibitors of human nicotinamide phosphoribosyltransferase (NAMPT).
pubmed doi rcsb
molecule keywords Nicotinamide phosphoribosyltransferase
total genus 168
structure length 469
sequence length 479
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2013-07-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04095 NAPRTase Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A PF18127 DUF5598 Domain of unknown function (DUF5598)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4lvdA02
2C14A 2CLFA 4GUHA 1LRNA 4ZQPA 3MMTA 3QQ0A 2VOMA 3C0JA 3IVSA 1D3GA 3WJXA 3P82A 4M6PA 3PG8A 3W7HA 3NL3A 1YDVA 2NX3A 1C9DA 3G0SA 4GJ1A 5DXXA 4K38A 4AWSA 3W87A 1KTCA 1GVOA 4AWTA 3B06A 5FF4A 4KWWA 4UNLA 2O7QA 4YL2A 2PURA 3M0ZA 2CLIA 1Q6OA 3WJZA 4UTLA 3NQAA 2ALDA 3WFAA 2QUUA 1I2NA 1GG1A 5DCEA 3T40A 3G0XA 3GDTA 4ADUA 3A21A 3GLCA 4UC5A 1HO1A 2ZZ2A 5LSMA 1H7WA 5BOOA 3L0NA 3O07A 1JRCA 4N2YA 3MI6A 2I1OA 3M44A 4UTIA 3LCLA 4FF7A 3BGJA 5IBXA 4Z1AA 1AG1O 1H7XA 2QCMA 1MEHA 4O13A 3SZ8A 1B3OA 5KTLA 1YLVA 4HNUA 3TCEA 2GPTA 1ZAIA 3LI0A 1RV8A 2V9DA 3DFQA 1GPWA 4MY1A 2PC4A 1WBHA 3N2MA 3W2KA 4LU0A 4O50A 3TW7A 2F7FA 4JYDA 4AMAA 2ISWA 3KVKA 5G1YA 1R47A 5DN1A 4EWND 1P0NA 3EB2A 3W7RA 3TR2A 5CPNA 3G1VA 3TSBA 4UFHA 1PIIA 4CNNA 3UWZA 1C29A 4N02A 3WK3A 1ZY9A 3TFCA 1W1ZA 1VRDA 3L65A 4BWLC 1F2JA 1EUNA 4OGZA 4ZQCA 5BRBA 5I3IA 5A8GA 2YXGA 3M9YA 2DU2A 1AW1A 2QAPA 1GVFA 2JGQA 3NQ6A 4O19A 1AW2A 1KM4A 1JCXA 4XTIA 4BK9A 2J9ZA 5J5RA 3O15A 3W70A 1FCQA 4GC4A 3W2JA 4RZ5A 3W1RA 2R14A 1U5JA 3GX9A 1YDNA 1CI1A 3S0CA 4UFJA 4LW7A 1ONRA 1B4KA 1TPVA 1YPFA 1W5PA 2A7NA 4QJ1A 1VS1A 5DBUA 4JTLA 5AHEA 1GEQA 1R30A 4K6AA 1TPC1 4YWIA 1X7FA 4U28A 3NVTA 2RDWA 4UFIA 3T4CA 1VPXA 1YXCA 4A2RA 1KM5A 1THFD 2A5HA 2ZRWA 4S2BA 1QNVA 3RMJA 4DELA 2JKAA 1EEPA 3JS3A 1B57A 2VEKA 1U83A 3KFTA 5F4SA 3BG9A 3DKLA 3GXPA 3EXRA 3BW4A 1KFLA 1OFAA 4BI5A 1G4SA 5BW6A 2V5BA 4H6KA 3N3MA 2A21A 4WZHA 5U4NA 4CCCA 1TO3A 3HG2A 1K8YA 3R13A 4AF0B 5KZDA 1JQVA 1M6JA 4PODA 3THAA 3W7CA 1G67A 4WY0A 5AOUA 1Y0EA 3EX3A 2H90A 3L67A 4UTKA 5AYXA 3EWUA 4RKAA 2Q8ZA 2BXVA 2Y7DA 5LZLA 1DORA 1QO2A 1FX6A 5HR6A 3I68A 3TMLA 3HOJA 1ME7A 3MUXA 4KWVA 5LNRA 4IWWA 3F4WA 3S5NA 1ZCOA 3W75A 4N4QA 2J9XA 4JNMA 3LXCA 4A22A 2Y85A 4ICNA 3PF3A 3TDFA 1L9WA 2YCEA 1SUXA 3ZWTA 4FO4A 5AHLA 1GVRA 3LDVA 1M7PA 4IMEA 3SECA 3O05A 2QJGA 1A5BA 1LM1A 1I4NA 1OABA 5CZSA 4E38A 4NVTA 5DY2A 1TPH1 3RF9A 1SU5A 4MJMA 2CW6A 3O6YX 3N73A 1AK5A 3LM7A 2Z6IA 3GIYA 3NXFA 3TMQA 4H3DA 2ZRVA 3W1LA 1E51A 2X1TA 2V30A 4R53A 3NOEA 3NM1A 3MJYA 4JDBA 4Z0SA 1S3HA 2A6LA 4MOZA 1G7VA 4NJIA 3W1PA 4BI7A 3DAQA 2AQWA 1LLZA 4UTJA 3LHTA 1VZWA 1W8SA 4P61A 3TW6A 4NNCA 3FJLA 1OK4A 3DFPA 3C3NA 1WXJA 2YDAA 3P62A 4JTHA 4LT9A 4EF8A 4X22A 3W1XA 2EHHA 4UFKA 3PSVA 1LORA 4POCA 2A7PA 2A0NA 1RD5A 1LBFA 4FHAA 2E5BA 5SWUA 3W1UA 1EX5A 1SR9A 3KHJA 2C3ZA 4JXCA 5HINA 5G2WA 1QCWA 4LNYA 4IUOA 1TIMA 5F1UA 4IXXA 1OFRA 1EWDA 2Q3RA 1KFJA 4OT7A 5EL1A 1Q45A 3PUDA 3CIWA 5FESA 4K7YA 1HG3A 5G2IA 4LVGA 2CU0A 4BWLA 3W2UA 5F1VA 1GQNA 4IXHA 4DBEA 1OX4A 5CPOA 3STCA 1TYGA 3RLUA 4D2JA 5L6UA 4TMCA 1JVNA 4O15A 5FEZA 2Q8LA 1H61A 3GKAA 2YFNA 4HIBA 4YXGA 1S5TA 4UNKA 1JUBA 3TSMA 3NQEA 3A9IA 3N19B 1W0MA 2ZBTA 5FF2A 5G2HA 1DOSA 2V2DA 3NQ7A 4A21A 1FCVA 2Y7GA 4DF0A 1VYPX 2PCQA 1TV7A 1TPB1 2DJXA 3LRLA 5CZ0A 3M47A 1PL9A 1VCGA 3B04A 1TRDA 3C4UA 8TIMA 1EPXA 2E6YA 3ATZA 2IQTA 4GFSA 3RFAA 1MEWA 3EXSA 4K8HA 4UXDA 4LC6A 4JEQA 3W72A 3W71A 5AHMA 2YGYA 3DFOA 3ABRA 3W7LA 3C2VA 3HJZA 5DCBA 3MYPA 3B03A 1QWGA 5AC6A 1LBLA 3W7PA 2WKJA 4N6EA 2DZWA 3W9ZA 3SJ3A 3I7SA 3KXQA 3NPXA 3SGUA 1YXYA 2NX1A 2Y89A 3VKJA 3E49A 4DO5A 4WXZA 4UTTC 2BTMA 3V1PA 4HPXA 4XKYA 1LDCA 2V81A 3N34A 3C2RA 3C2OA 1W5NA 4KFNA 1G4EA 2WPBA 3Q37A 1NF0A 1TV8A 2X1UA 4FEZA 5AHNA 1WBJA 1XCFA 3LTPA 4LTSA 3GAKA 2ZA1A 3PAJA 5LGXA 1OFDA 2G97A 1OYAA 2X30A 1DJNA 3O6DA 4WJEA 2QR6A 1SZEA 3KRSA 2ABBA 4YCPA 5T26A 3UWQA 5BNKA 3E96A 4FX8A 1W3IA 4CNOA 3G1SA 5CSRA 3QMTA 2JK2A 1OFEA 3R12A 5HMSA 4WY0B 1UB3A 3DENA 3EWWA 3VE7A 2O7SA 1EUAA 3LHVA 3UYCA 1K8ZA 2E6DA 4UTWC 1W5OA 3CB8A 3GB6A 1LRTA 2PRMA 3MO7A 2WNNA 3R89A 3M43A 1TPDA 3ABQA 5EBUA 1O5KA 1TB3A 5HJLA 4K39A 1PVNA 4AAJA 1TJRA 2B7OA 5D03A 4LWWA 2ZCGA 4E2BA 3T55A 3HGOA 4O16A 1I45A 1LLWA 3DHFA 2P10A 3O06A 4LUJA 3LCFA 4OBTA 1Q3NA 3UWVA 2E1DA 4UCGA 4O10A 3G1FA 1H1YA 1WA3A 1Z44A 1XFBA 1OG0A 1YADA 1HUVA 3EWBX 3QYQA 3BGGA 3W7DA 5LHEA 3TKFA 3OVRA 4S2CA 4DF2A 3T7VA 3G1AA 5CZTA 1XXXA 2VXNA 3DFSA 4A2SA 1YTDA 1ME9A 4BR1A 3P84A 3R8RA 3YPIA 3OA3A 3QMSA 2CZDA 1S5WA 5D38A 3QQ1A 3LV6A 2QCCA 4XBSA 4FNUA 1TV5A 2DZVA 2RDUA 2X1RA 3WK1A 2VFEA 1FBAA 2W79A 4J9JA 4TO8A 3TC6A 1CW2A 4ZVJA 2QKFA 3F4NA 4CQAA 3EWZA 1L6YA 3BG5A 3MHFA 1FWNA 3NO5A 4GUGA 5HUPA 1JCNA 4HNTA 4FXSA 3FOKA 5D2YA 3LCIA 3NR0A 4WOZA 3SR7A 3WJWA 4TX9A 1XC4A 3IV3A 1K03A 1A53A 1UBSA 4RX0A 5G5IA 3HIJA 4FIRA 3PB0A 3RNDA 4WY0F 2CLLA 1LYXA 1F6PA 1I8JA 4ZQNA 3W7KA 3O8AA 4GXMA 5D32A 4UR8A 4AVFA 3DH7A 3TXVA 5KITA 4JDYA 4UFLA 2YSWA 1SSGA 3PBYA 4QITA 1TPEA 2RH9A 5IM51 3LTSA 5K4ZA 4MLRA 2FPTA 3G1HA 5A5WA 1K7EA 3A5FA 3DU0A 4CCDA 1XKYA 5F4XA 5LNUA 4LS0A 1SW3A 4OWGA 1KM6A 1OX4B 3W7QA 3LHYA 1ZNNA 4MFDA 4Z08A 3NQ2A 4OV4A 4MUZA 3BG3A 1WOAA 3L5MA 3U6WA 2Z6JA 1IXPA 4NZJA 1A5AA 3IGUA 4FNRA 5E93A 3L68A 2CLMA 4MPQA 2RKXA 3G8EA 1J2WA 1FCBA 3QW4B 1ZAJA 4JS3A 1QAPA 3EKLA 1MEIA 4JX6A 3BW3A 3S1UA 2HSAA 1A5SA 4AHQA 1SFLA 7TIMA 1KA9F 3CT7A 3JR2A 3TC7A 1L2UA 1RPXA 2A2IA 4UTTA 4HN4A 3P5YA 1PV8A 3WJYA 3NZRA 3N14A 3TU9A 3BVJA 2QUVA 1VR6A 3HGSA 3IIZA 1KBIA 5D05A 4ZQMA 1D3HA 3QJAA 1FWTA 1LBMA 3Q58A 1NVMA 3PR2A 4LRTA 2DZTA 4OHQA 3M16A 5KMYA 4IMFA 3A23A 3LHUA 4ZQRA 4JX4A 2DZUA 1QPOA 1HFBA 3GZ3A 1LZOA 2G96A 4N9EA 4O0KA 2FB2A 2ZA3A 2NV2A 1TQJA 1KM3A 4QNWA 4O12A 3MI2A 4HT3A 3UNDA 1ICPA 3I7QA 4O53A 2V5LA 1TTQA 5D30A 4CQ8A 3PULA 4O1CA 2ATMA 2R8WA 2DZPA 3VFLA 5KZEA 3K30A 3EX2A 4LUIA 1H5YA 4UTWA 1JUEA 3NGJA 4FB7A 2V82A 4XKYB 1JCMP 4DEFA 2YPIA 1RVGA 4AWUA 1QMLA 1H51A 3W7JA 2ZZ1A 4NJKA 3TSDA 1ML1A 1ZENA 4IPJA 3TK7A 3FKRA 4EVZA 4NXSA 1KM1A 1SQ7A 3LBMA 1R2RA 4RJEA 3QPYA 1QDSA 5FEPA 4RZ4A 4P2VA 2GOUA 1ZHAA 3W6YA 1OHLA 3VNDA 1Q6QA 3CLMA 3S9YA 1K8XA 1H7PA 2ZRUA 3C52A 3BW2A 3G18A 2A6NA 4OE7A 4K36A 4RCXA 1T96A 3G1DA 4ZL1A 2QCGA 3P5ZA 4TU1A 1N7KA 3LCHA 1QOPA 3A5VA 4DPQA 1YDOA 1IIHA 4O1DA 2ZDRA 1XBYA 1EP1A 1QOQA 1TPUA 4I7UA 4UTUA 1F6KA 4UR7A 1KFKA 5FF3A 2QCDB 4N4PA 1G4PA 3E12A 1ALDA 5LNSA 4NQ1A 2NXIA 1KV5A 3E02A 4GUIA 2BSLA 1UUMA 2FPVA 1N55A 5E0KA 3UY8A 3DI1A 2VFGA 1O95A 2C1HA 2ZA2A 4JY9A 3S5OA 2DZSA 1SO4A 5AHFA 2PRLA 3TE9A 4YLWA 3M1ZA 2GVLA 2OCZA 4UMCA 3AJXA 1XBXA 2OT1A 3GK0A 5LNWA 4RV8A 4Y90A 1NAL1 1I2QA 4MYAA 3PS7A 1SZNA 3PY2A 1G4TA 2Z1BA 2VKZG 3L66A 3DFTA 2V2HA 4JICA 3USBA 4M6QA 2RDTA 3OEXA 2TSYA 2VENA 5FI8A 4YMZA 4HHPA 2X16A 4UUIA 2ZZ3A 4IPIA 5CPLA 2NX9A 3H55A 2PE4A 4IMCA 3N9SA 4HNNA 3PBUA 4LVDA 4RXFA 5HUOA 1QR7A 1W54A 4O54A 3S42A 1D9EA 3I6RA 3A24A 3UZ5A 4QAIA 4IJBA 3TIMA 1KW1A 3C6CA 1WOBA 4JYEA 5K9CA 2QCEA 3M41A 3WK2A 3DZ1A 2CLHA 1WQ5A 1PE1A 3WK0A 4H4IA 1X6UA 2V8ZA 2XN2A 1LOLA 4LS2A 4K37A 1YTEA 4R34A 3NYZA 3LI1A 1CX9A 4O14A 3SY5A 4W9TA 1IF2A 2CLOA 3NQFA 3ABSA 3U2OA 2RHGA 3IEBA 2LLEA 3O1NA 3G22A 4G1KA 3S6DA 5EA9A 1RQBA 1GVQA 3L0GA 4M6VA 3B05A 3VE9A 3M5ZA 4QNEA 4UTHA 4A29A 3W7GA 3GR8A 5C55A 5I3JA 1UJPA 4FNPA 2QF7A 3GXNA 1VYRA 4QQ3A 3GNDA 2EPHA 1Z41A 3MP4A 5C5YA 5EKYA 1H50A 4HSNA 1FXQA 3S8HA 3SW6A 3IVUA 4JX5A 3NL5A 1W5QA 1SO3A 3H53A 1O94A 1UCWA 3W83A 4DO4A 4YCOA 1ME8A 2FLIA 4JTKA 2V2CA 3P61A 1OFOA 4FIQA 1BTMA 1WYIA 5F2GA 2ZRXA 3CC1A 3HF3A 2WOQA 3C8FA 4XZ9A 5TQLA 1X1ZA 3TA6A 5AC7A 3L21A 3DFNA 4E0CA 4XUGA 1FUYA 3TAOA 3VI2A 5D04C 1KM0A 1T99A 4TMBA 2VFFA 3G0UA 4LVFA 3L2IA 4LOCA 1EIXA 3QFEA 5K9DA 3ZFHA 3PB2A 5I3FA 3NPWA 1H62A 3IIPA 1TTIA 2G5WA 2B7QA 3FJ6A 4GBUA 3NL6A 2FPYA 2Y6ZA 2WNQA 1EWEA 3BK0A 3TJLA 2AAMA 4GUFA 3CWNA 4PC8A 4UMBA 3E9AA 2PRHA 1FWWA 1VHNA 5HR7A 3CQ0A 3E0IA 2H6RA 4ONVA 1JCYA 2ZTKA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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