1W9BM

S. alba myrosinase in complex with carba-glucotropaeolin
Total Genus 196
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
196
sequence length
499
structure length
499
Chain Sequence
EITCQENLPFTCGNTDALNSSSFSSDFIFGVASSAYQIEGTIGRGLNIWDGFTHRYPNKSGPDHGNGDTTCDSFSYWQKDIDVLDELNATGYRFSIAWSRIIPRGKRSRGVNEKGIDYYHGLISGLIKKGITPFVTLFHWDLPQTLQDEYEGFLDPQIIDDFKDYADLCFEEFGDSVKYWLTINQLYSVPTRGYGSALDAPGRCSPTVDPSCYAGNSSTEPYIVAHHQLLAHAKVVDLYRKNYTHQGGKIGPTMITRWFLPYNDTDRHSIAATERMKEFFLGWFMGPLTNGTYPQIMIDTVGERLPSFSPEESNLVKGSYDFLGLNYYFTQYAQPSPNPVNSTNHTAMMDAGAKLTYINASGHYIGPLFEKDKADSTDNIYYYPKGIYSVMDYFKNKYYNPLIYVTENGISTPGDENRNQSMLDYTRIDYLCSHLCFLNKVIKEKDVNVKGYLAWALGDNYEFNKGFTVRFGLSYIDWNNVTDRDLKKSGQWYQSFISP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
publication title The glucosinolate-myrosinase system. New insights into enzyme-substrate interactions by use of simplified inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLYCOSIDASE
total genus 196
structure length 499
sequence length 499
ec nomenclature ec 3.2.1.147: Thioglucosidase.
pdb deposition date 2004-10-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
M PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1w9bM00
4WF7A 1KWKA 1QBBA 3GNRA 7A3HA 4AWEA 1MQQA 2CYGA 3T0BA 1E4NA 2JFEX 1IV8A 1UQYA 1VBUA 2W5FA 3DC0A 4PMRA 3SUTA 2OWCA 4AD3A 2WAGA 2J4GA 5IXEA 3BSHA 4UFIA 5KEZA 4JFVA 2ZX7A 3MUAA 1FOBA 1OSEA 3SCTA 4GQQA 2BY0A 5GNXA 5A69A 4MB1A 2OLHA 1JF6A 5I2UA 2WXDM 2VCCA 1LLOA 1IT0A 1HKKA 1KGWA 2YJQA 1QBAA 1KXTA 2WSKA 2XYLA 3IK2A 4CD7A 3N1AA 3VIOA 1UKSA 1TE1A 2GJRA 2X1IA 1GVIA 4RE2A 2RGMA 2E0PA 4GINA 2WK2A 3AHVA 2ZX6A 1XYZA 3PZVA 5DF0A 5HBFA 3WSUA 4ZE4A 1MXGA 2O9PA 4LYRA 3TTQA 3VD3A 2VQUA 3ARZA 3VVGA 3ZIZA 5A6SA 3N18A 2WCSA 4HMEA 2X05A 3AZRA 4HMCA 3RIKA 4W93A 4FLOA 2DEPA 5C8BB 5CLWA 1E70M 2D0GA 3CZLA 1UR0A 3W6LA 1BF2A 2XHYA 2E8YA 4CD4A 4D1JA 4P8UA 4AMCA 2VZOA 4S3JA 3FN9A 3VDAA 1HKIA 1DP0A 2CBJA 1J10A 2AOSA 1J01A 4W8LA 1A47A 5E0CA 3CGTA 1R7OA 3VMOA 1UWIA 2V5DA 1WPCA 3NCOA 3AJ7A 3GXIA 2D23A 2V3FA 1XH1A 5A2BA 1KXQA 1KQYA 2UY3A 4J3VA 3WH6A 1I1WA 2O9TA 4M80A 3LPGA 2E40A 1HJUA 2VZSA 4PBGA 4BQ2A 4CVWA 5D9OA 4FLRA 3ALGA 3F5LA 3W53A 4B16A 2XG9A 3CBWA 5IFTA 3FXYA 5CXPA 2YL8A 1E1FA 3AHTA 3ALFA 4QFUA 1PIFA 3L2MA 1HNYA 1JZ5A 2ZWZA 4B3KA 2XVPA 3VU2A 1BQCA 1LG2A 1GOOA 3RILA 4JFUA 1MW3A 1PJ9A 1CGYA 4Q22A 2Y2WA 1ECEA 3WF2A 1JZ2A 4EANA 3DYPA 4AD0A 3WD1A 2ZIDA 1NH6A 5BXPA 1UUQA 3UR8A 3U5YA 3GXFA 2BNJA 1B9ZA 2YA2A 4U5IA 4P8VA 4ZXLA 3BAWA 3WL0A 1GORA 1GOQA 1BSIA 4HU8A 1UD8A 2WWCA 2XTKA 6CGTA 1MW1A 1GHRA 3DYOA 1TVNA 1KGXA 1OBAA 4C7DA 2J7BA 4PTVA 4JL1A 3VIFA 1ZBVA 1TA3A 4QCEA 4GI6A 4ZXOA 1WDPA 3NDZA 1H5VA 1V3LA 4PMYA 1X1NA 3K1DA 4DM1A 3CMJA 2IUZA 3U57A 4WKHA 2DPEA 4GO8A 3AIRA 3NDYA 2DIJA 4KGLA 3UG4A 1JDCA 2OWXA 1MFVA 1J12A 3SCQA 1OIMA 3VDCA 3HMCA 1MFUA 5DT5A 3CZKA 3RM9A 1JFHA 3CLWA 1HL8A 1JNDA 1ZJBA 2WMJA 2Q8XA 4A3YA 1D2KA 1IZJA 1CTNA 2JF7A 3BC9A 1QI2A 4HZ7A 1QW9A 3BXWA 4PTWA 3RO8A 1E43A 4HZ8A 1JAKA 3EDDA 4Z2HA 3VGHA 3WBAA 1FP9A 5CSYA 4UOJA 5LYRA 4J28A 3L4VA 2X2YA 1UWSA 2F61A 4W84A 2WKLA 1E6NA 4W7UA 1DWHM 4YHEA 1MVYA 2DH3A 2NSXA 1HN1A 4PEEA 2DSUA 1HL9A 2VT0A 1LJYA 2YA0A 5LA2A 3OLDA 1MW2A 2WKGA 1C7SA 4PCSA 5D4YA 4MB5A 1E6SM 2DT2A 3B8SA 5HDRA 3W82A 7CGTA 4RE3A 1BAGA 5FL0A 1OINA 2WMKA 1J9YA 4AIOA 1BGGA 2VVSA 4JHZA 4AZCA 5A2CA 1KQZA 3IAPA 1BYDA 2W66A 4CU6A 1HX0A 4LYQA 4WK9A 4JCLA 4OJYA 2XUCA 3L2LA 1TMQA 4JKKA 3VILA 1ISYA 1VFOA 2BY2A 2QPSA 4J7RA 3WDPP 4ZEPA 5CSUA 3SUWA 4Y7EA 1RH9A 2D2OA 3NIYA 3WF3A 3G6LA 3SCPA 5CGMA 2CNCA 4MNJA 4PMQA 3PZNA 1GQIA 4LYPA 3N15A 1EO7A 2XGIA 3SCNA 1L0PA 1HKJA 1QI4A 5A6KA 4MNLA 4GXPA 1CZ1A 2G3MA 2VX4A 9CGTA 2ZWYA 1BLIA 5FCZA 3B9EA 5I79A 1CGWA 1QOXA 1WAWA 2PBOA 2VVNA 1E6RA 1UR9A 2WMFA 1UZ1A 3WH7A 1UKOA 3QGVA 1LWHA 2XWDA 3WD2A 2WMIB 1QI3A 1JFXA 5A6AA 1GQLA 4FF5A 4HOXA 4MAVA 2CIPA 1E71M 3AMDA 2CETA 3OBAA 3SCWA 3OZOA 1B2YA 5ABHA 4LXFA 3ARPA 1UR8A 1KCKA 2J74A 1XH0A 4W86A 3VNZA 4F66A 3BSGA 2VMFA 1O7AA 2WM0A 1OM0A 1UG6A 3IJ7A 2J77A 3WF1A 2ZUVA 5LA1A 2WLZA 3WBEA 1U30A 2ZUTA 1PX4A 2D0HA 3SCVA 2C7FA 5FL1A 2E9BA 4GZIA 3L4WA 1HJSA 3VGDA 3ZT6A 2VI0A 4ZENA 2CPUA 3PTQA 4XUYA 1CPUA 1RPKA 2FGZA 3AHXA 5JBEA 3ARUA 3AROA 3VD5A 1CBGA 4AYSA 2WVTA 2X09A 4TVUA 1PX3A 4PMZA 2PWFA 1H3GA 4RL3A 4MJ4A 3SUUA 1H0IA 4MDPA 3WNOA 1CECA 4IPLA 1VJSA 3BCDA 3AMGA 3MANA 3PTKA 4TTUA 2GDUA 1ESWA 5I0DA 3IAQA 4KRUA 2PB1A 2VR5A 4TUFA 4HMDA 4UOZA 4W88A 3MO4A 2VRJA 4QAWA 2VRKA 3K4AA 1YQ2A 3POCA 4WIWA 4HA1A 2XVKA 4NF7A 2YKKA 2DT0A 1DHKA 1P6WA 2WVVB 4GZEA 5CPSA 1JI2A 3RCNA 1GNXA 4V2XA 1B3ZA 1TG7A 1UR4A 2VQTA 1W3LA 5A6JA 2WLYA 1JF5A 1BVNP 2AAAA 4D6GA 2W4XA 1J0ZA 2VZVA 3TTSA 5IFPA 1J11A 4LPCA 4TX8A 1Z32X 3QR3A 4W89A 1E6ZA 1C7TA 1W9BM 4K68A 1C3FA 1C92A 2JIEA 3EDFA 1UKQA 2YBTA 2Z1SA 1R8LA 4ACYA 4J3WA 1JIBA 3K8MA 5BXTA 3AQUA 2GK1A 2F2HA 2JIWA 4EAMA 2C8NA 5CLTA 1M53A 3S2CA 1TR1A 1R7AA 2J7DA 3VM7A 4P7NA 3PZOA 3WDRA 3WNMA 2DSWA 3W0KA 4N0RA 2WC4A 3LPPA 3CH9A 3WD4A 2OSYA 4DWSD 1K9TA 2VZTA 1B3WA 4J3SA 4ZE5A 4PSRA 1FH9A 3N9KA 3T09A 4W8AA 3THCA 3TONA 1V08A 4J27A 1UWRA 2ZOXA 2QV4A 2VJXA 1BYAA 2XSBA 2D22A 1CEOA 3WNLA 2DIEA 4EE9A 2WVUA 3DHPA 2OYKA 2EEXA 3W29A 4QCFA 2O9OA 4P7QA 2VCAA 2BY1A 1W91A 5GNYA 1IZKA 1QNQA 2O92A 1GCYA 4M56A 1NP2A 4OOUA 3ECQA 1K9EA 2VOTA 2YDSA 5DT7A 1UD2A 4PMDA 2WANA 4ZFMA 3I3BA 1HXJA 1E55A 4UZUA 2ZXAA 4LX4A 1GOWA 2J78A 2YA1A 3TTYA 4XV0A 5A1AA 5EBAA 1ZL1A 3CIVA 4XZBA 4UQEA 1EH9A 4HOWA 5E9AA 5D8ZA 1ZBCA 2ZX5A 4BQ5A 1RD6A 1KWGA 3WEMA 3K8KA 4D6CA 3VOCA 2IXVA 5HPCA 1JXJA 5I23A 4M81A 3CUJA 5C71A 3BAYA 1SR0A 3AHYA 1CXLA 1QNRA 1E72M 2V3DA 4W85A 1W9PA 2W67A 4GZJA 1GONA 1UR1A 1PX8A 1DWIM 1ISWA 2XVGA 1HVQA 2FHBA 5A8MA 1UWUA 3BAKA 3M6DA 4M24A 3W38A 3AMKA 4TVCA 1TUXA 2JEPA 4GI8A 1W1YA 3AFBA 2XWEA 2GJPA 3WNKA 2OSXA 5EB8A 5A6LA 1R87A 4P7RA 2XIBA 1LWJA 1XD0A 3EBVA 4PMOA 3QHMA 2QHAA 2UY4A 3GH7A 4JIEA 1HF6A 1NQ6A 4L4PA 4CN1A 3AICA 1JAEA 2GJXB 4V28A 2X0YA 5I78A 4NRRA 5IDIA 4D6IA 4AZ7A 5EFDA 1EA9C 2PF0A 3AMCA 4PTXA 2G3IA 1GZJA 4TOQA 1JDAA 4JZ5A 1QW8A 1W3KA 1UD4A 2QF8A 1Q6FA 1MWOA 1UA3A 3F5JA 2WPGA 4UCFA 2ZICA 1V3KA 4D6JA 3PBGA 5I5RA 1CIUA 4X0NA 1XRVA 1JZ6A 4CCDA 4GIAA 1F4HA 3WQWA 4JFWA 1DTUA 1VJZA 2D20A 1WZKA 4BF7A 2ZX8A 4CCEA 2B31A 3NSNA 4CU8A 3SURA 1CXKA 1I1XA 4HA4A 3ZMRA 1V02E 4C7FA 2XFFA 2V3GA 3MMUA 3MSDA 3AS0A 1FH8A 1QVBA 3EMZA 4FLSA 3LPFA 3RM8A 2Y24A 4CU7A 4H41A 4AD2A 3OGRA 2CITA 3WQ8A 1ZBWA 4DUWA 2WCGA 4BQ3A 1VIWA 4JHOA 4MAZA 1Q6DA 5E0FA 5CQ1A 4HOZA 1HJXA 3GTNA 1ITCA 2E4TA 2FH8A 1US2A 4MB4A 2YL6A 3A4XA 3ZOAA 3CHEA 4IUGA 3AMLA 1VAHA 3OLGA 2F8QA 4NSBA 1G1YA 3FAWA 5M03A 1OCQA 2VURA 1QPKA 1NOFA 1QHZA 4L4OA 5M17A 4BA0A 4CGTA 4GQRA 1E4LA 2A3AA 3NSMA 1WCGA 3VGFA 3PZUA 4EKJA 4F9DA 5HNNA 2VCBA 3CZJA 4OKDA 3WQ5A 3KWXA 3L4XA 4M8UA 3VTRA 1XSKA 3GNOA 1GPFA 1V3MA 1VENA 3MUIA 4D72A 3BMWA 1UH4A 3BLPX 2Y8KA 5GPRA 1UKTA 1EO5A 1M03A 1UWQA 1V6XA 1BYBA 3UG3A 2CXGA 2PC8A 3RDKA 3F5KA 1ISZA 3CUHA 3J7HA 1AQHA 4UOQA 4WKAA 2UWFA 1V0KA 4HPGA 1V6YA 2D3NA 2UY5A 3OZPA 4UFKA 3DECA 1BPLB 3W25A 4KH2A 2XVNA 2J7GA 5A2AA 2V3EA 3L4YA 3POHA 2TAAA 1D3CA 4DWSB 4BCEA 2YL5A 2XSAA 4RE4A 5A8QA 3AI0A 1N82A 1WB0A 2WSPA 4PN2A 1C8QA 4DUVA 2D0FA 2GFTA 3U7VA 5A95A 1FP8A 2JF6A 1NWUA 3NYDA 3KEHA 4JKMA 3WQ6A 5LA0A 1XGZA 1XCXA 4C7GA 1EQCA 3EYPA 1G01A 2CKSA 5A6BA 2QLYA 3WH8A 2X0HA 1KFWA 3WELA 1CXHA 2ZXQA 5E6YA 3AIUA 2V5CA 3OGVA 2XPKA 3WN6A 3WQ4A 3MMWA 3WNNA 3WFZA 1EIBA 2J47A 5D9MA 4M29A 3A4WA 1EDQA 4AEEA 1TZ7A 5CJ5A 1H4PA 1E6QM 2DSVA 3W27A 4U33A 1A3HA 1XCWA 3VDBA 1HIZA 4KRTA 2UY2A 3WF4A 4F79A 1AQMA 3BMVA 5FOOA 4AZ6A 1FFQA 1CGTA 1J18A 5A6MA 4AZGA 5C70A 4B9YA 5ECUA 3RPMA 4PMXA 2CESA 3SUVA 2ZXDA 1UYQA 1K9FA 2EBNA 1Q6EA 1V3HA 3PZQA 1M7XA 1US3A 1FH7A 3T2OA 3B9DA 3EDEA 1CGVA 1CDGA 1WDSA 1VFUA 4PMNA 4D6EA 4F9JA 1GHSA 3I3DA 3UERA 4A4AA 1B0IA 4PCTA 4V27A 1V02A 2WHMA 3N11A 4AY1A 3E1F1 3VGEA 1SMDA 1U2YA 4GKLA 4B3LA 2DGAA 5HOSA 2G8ZA 1ODZA 5E6ZA 1CNVA 5DO8A 3OA5A 4U2ZA 3EDJA 1W9DM 2G3NA 3PZIA 1NWRA 3M7SA 4MNKA 2ZXBA 3KZSA 3W28A 3VD4A 3K4DA 3MMDA 4LQ1A 2PWDA 2EQDA 1E0VA 1M01A 5A8PA 4AEFA 1ZU8A 2YLLA 3RJYA 4ACZB 1CXEA 3W37A 3ARRA 3WIJA 2BFGA 1W32A 2WNWA 1GJWA 2J79A 1E15A 1UOKA 1E4MM 7TAAA 1PZ2A 2EJ1A 3L4UA 4W8BA 1GUVA 1UD5A 4Z2IA 3UCQA 3EMCA 1GOIA 1EDGA 3RM4A 2NT1A 1C90A 3CZ8A 1CENA 3PHAA 3UR7A 3ARYA 1CLXA 2BHUA 1JG9A 1GVYA 1JZ7A 2QMJA 1E6PA 1HP4A 1HJVA 2WC7A 4YN5A 3WUBA 5D9NA 4E8CA 4AIEA 1UH3A 5M5DA 1YHTA 5BRPA 4W7VA 4EK7A 4H04A 1HVXA 2WMIA 1JL8A 1XD1A 3WUEA 2NW0A 1UH2A 2J7CA 1G5AA 2PWHA 4MB3A 3FW6A 1X6LA 4PSPA 2HVMA 3SCRA 4GO9A 3VUPA 3U7BA 4UQBA 3WDIA 2XM2A 2WVSA 3TP4A 4PMVA 2DH2A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4WF7 A;  1KWK A;  1QBB A;  3GNR A;  7A3H A;  4AWE A;  1MQQ A;  2CYG A;  3T0B A;  1E4N A;  2JFE X;  1IV8 A;  1UQY A;  1VBU A;  2W5F A;  3DC0 A;  4PMR A;  3SUT A;  2OWC A;  4AD3 A;  2WAG A;  2J4G A;  5IXE A;  3BSH A;  4UFI A;  5KEZ A;  4JFV A;  2ZX7 A;  3MUA A;  1FOB A;  1OSE A;  3SCT A;  4GQQ A;  2BY0 A;  5GNX A;  5A69 A;  4MB1 A;  2OLH A;  1JF6 A;  5I2U A;  2WXD M;  2VCC A;  1LLO A;  1IT0 A;  1HKK A;  1KGW A;  2YJQ A;  1QBA A;  1KXT A;  2WSK A;  2XYL A;  3IK2 A;  4CD7 A;  3N1A A;  3VIO A;  1UKS A;  1TE1 A;  2GJR A;  2X1I A;  1GVI A;  4RE2 A;  2RGM A;  2E0P A;  4GIN A;  2WK2 A;  3AHV A;  2ZX6 A;  1XYZ A;  3PZV A;  5DF0 A;  5HBF A;  3WSU A;  4ZE4 A;  1MXG A;  2O9P A;  4LYR A;  3TTQ A;  3VD3 A;  2VQU A;  3ARZ A;  3VVG A;  3ZIZ A;  5A6S A;  3N18 A;  2WCS A;  4HME A;  2X05 A;  3AZR A;  4HMC A;  3RIK A;  4W93 A;  4FLO A;  2DEP A;  5C8B B;  5CLW A;  1E70 M;  2D0G A;  3CZL A;  1UR0 A;  3W6L A;  1BF2 A;  2XHY A;  2E8Y A;  4CD4 A;  4D1J A;  4P8U A;  4AMC A;  2VZO A;  4S3J A;  3FN9 A;  3VDA A;  1HKI A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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