2V3G | Genus

Total Genus 110

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	110
sequence length	273
structure length	273
Chain Sequence	GLKIGAWVGTQPSESAIKSFQELQGRKLDIVHQFINWSTDFSWVRPYADAVYNNGSILMITWEPWEYNTVDIKNGKADAYITRMAQDMKAYGKEIWLRPLHEANGDWYPWAIGYSSRVNTNETYIAAFRHIVDIFRANGATNVKWVFNVNCDNVGNGTSYLGHYPGDNYVDYTSIDGYNWGTTQSWGSQWQSFDQVFSRAYQALASINKPIIIAEFASAEIGGNKARWITEAYNSIRTSYNKVIAAVWFHENKETDWRINSSPEALAAYREAI

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
source organism	Clostridium thermocellum
publication title	D-Glucosylated Derivatives of Isofagomine and Noeuromycin and Their Potential as Inhibitors of Beta-Glycoside Hydrolases rcsb
molecule keywords	ENDOGLUCANASE H
total genus	110
structure length	273
sequence length	273
ec nomenclature	ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date	2007-06-18

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF02156	Glyco_hydro_26	Glycosyl hydrolase family 26

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	2v3gA00

3CHCA 2OYLA 1X6NA 1RP8A 2DT3A 4CGTA 4MAZA 3TTSA 3WF0A 2WBGA 2XM1A 3VDCA 3VO0A 2Y8KA 3VU2A 1GHRA 4CD5A 2J7EA 2EXOA 4Y7EA 2GK1B 2BFGA 1Q6EA 1V3MA 1SR0A 1BAGA 2WVSA 3WDIA 1V03A 2W91A 3A4AA 2QLYA 3FAXA 2GVYA 1Q6FA 4HMDA 4W8AA 1EO5A 1VFMA 1PX4A 2VZTA 1SMDA 4W5ZA 4LYQA 1BQCA 1QBBA 2CITA 1CECA 2Q8XA 3KEHA 1GJWA 3MU7A 1S46A 1CXEA 2ZXBA 5HXMA 1JF6A 1MW2A 4LYRA 2CCRA 1H11A 2GFTA 5AC4A 3OZPA 4FLRA 1QNPA 4UQBA 2ZWZA 1FH7A 3AHXA 1OGBA 1TCMA 3WSUA 2WC4A 3WBAA 2OWXA 1ZL1A 1E40A 3N04A 4W88A 2BHYA 2ZXAA 3WUBA 4M81A 3QHNA 3L2LA 1NP2A 3DYMA 1GQJA 1R8LA 4PTVA 2WVVB 1J18A 1W1VA 1F4AA 3A3HA 3BAJA 5M03A 2PWEA 1JAKA 3ARWA 1JNDA 1UOKA 2BHZA 3OLGA 1J12A 5DO8A 3AJ7A 4ZE5A 4DWSD 4X0NA 1CGVA 2OSWA 3EDJA 1E73M 3B9DA 4PMDA 4W93A 2WKGA 3SURA 3UG3A 2QV4A 1W91A 3K46A 5GNZA 1JFHA 3PZIA 2WSKA 4Z2IA 2VURA 1C8QA 4E2OA 3BMWA 1DEDA 4D6IA 1VBRA 1ODUA 3MMDA 2E0PA 1PX8A 1LL6A 1RPKA 3VIGA 4PTMA 4S3JA 3DHPA 2CEQA 3WNPA 1PBGA 1TG7A 1W1PA 4EK7A 2PF0A 1VF8A 1FH9A 5CGTA 2XHYA 1B9ZA 4H7VA 1ISZA 1QPKA 3DYOA 1HF6A 4DWSB 4PMNA 4QCEA 2OYKA 4BQ2A 1OBAA 3NSMA 3W37A 1E3ZA 3O9NA 3VIJA 1KBKA 3IANA 1KR1A 2EJ1A 2E3ZA 3WH5A 2WC3A 5GQBA 3WFZA 4U3AA 3WD4A 4D6GA 2DIEA 2W92A 5HDRA 4FLQA 2XVKA 3BAWA 4UR9A 5IDIA 1RH9A 2CESA 3BAKA 4MNLA 3WL0A 4YHGA 2VX4A 3CLWA 1JZ6A 1UYQA 2JIWA 3FN9A 4UOQA 1HIZA 1WP6A 4E4PA 2WMGA 2XIBA 2CBVA 4AD2A 1VFUA 1MW0A 2CETA 1CGTA 2VJXA 4PRWA 1ZB5A 4F8XA 2UY3A 4BZYA 1CXIA 1E0VA 3F5JA 4MAVA 1BTCA 4MJ4A 3WD3A 3ZJ6A 2XG9A 4D71A 4Q7NA 2OWWA 2WSPA 1IV8A 2VMFA 1Q6DA 1V6WA 2J77A 3NYDA 1E72M 4NI3A 3I3BA 4M56A 1JGIA 3N1AA 1TMQA 3AS1A 1UD5A 4KGJA 1DWFM 1V0LA 3ZM8A 1G0CA 2BVTA 2WNWA 1C8XA 4JFUA 4M80A 2WANA 4GI9A 4OJYA 2XFYA 5CSUA 1KGXA 3II1A 4HZ7A 4V2XA 2VR5A 2X0HA 3ALGA 2Y24A 4HZ6A 3RM9A 4QDMA 2WVUA 3BCFA 2WMJA 3U7BA 1CGUA 4E8DA 1GW1A 2GK1A 3GXIA 1BHGA 1KBBA 3CIVA 1FH8A 1OD8A 4WK9A 1HKMA 3A6OA 4MB1A 4DM1A 4BQ5A 4CU6A 1PZ3A 2VNCA 4IISA 1JZ3A 1I1WA 1XD0A 4XX6A 2BY3A 4PEEA 1ESWA 1QOXA 2O92A 1MQPA 1EHNA 1DP0A 1US2A 2QPUA 5I24A 3MO4A 2ZE0A 1ITCA 5BCAA 1H3GA 3PZGA 2J78A 1NWSA 1IT0A 1EXPA 4KRUA 3RM8A 1WAWA 2Y8VA 5FOOA 4KRTA 1J0KA 3WDQA 3W4RA 1QNSA 3CUHA 4P7NA 5A2BA 3VNZA 3ZJ7A 2VOTA 1OGSA 3AZTA 1F4HA 5M3WA 4QFUA 2G3JA 2VUYA 1UD6A 1UD2A 1AVAA 1DWHM 1WKYA 1WZMA 4P7QA 5E0FA 3CHFA 3VDHA 4UCFA 1GOIA 1IZJA 4LXFA 1V3HA 4ZE4A 1GZJA 4D6DA 3I3DA 1EDTA 3OZOA 3SCOA 5HPOA 4HTYA 1D2KA 2QMJA 1GHSA 1ZBKA 3ZMRA 1ZS2A 1HP5A 3WIJA 2YA2A 1VFOA 1KQZA 2J4GA 4F9DA 1VB9A 2Z1KA 1DWIM 3B9EA 4J3WA 4UTFA 4ACYA 1TFVA 1JYXA 1XCWA 3QOMA 2G41A 4AEEA 1K6AA 3GH4A 4V27A 3T0AA 2WAGA 4PTWA 1XSKA 2NSXA 3L4UA 3U57A 4RE2A 4CCDA 4TTGA 2VRJA 4DWSA 3CZJA 1XGZA 3WF3A 1HP4A 5JBDA 4FF5A 4J3TA 3ZJKA 1AQMA 4TTUA 2ZXDA 2TAAA 1UKQA 1W3LA 3SUWA 4AIUA 1UR0A 1WZKA 3MUAA 3LPPA 1MFUA 4PCSA 3AIUA 4AZ5A 2WLZA 3NDYA 3K1DA 2JEQA 1JFXA 2E40A 2J75A 4B15A 2X1IA 5FKYA 1WPCA 4RE4A 2E9MA 1CXLA 3F5LA 1W1TA 4LQ1A 5EFDA 3SEPA 1JD9A 4D6CA 1GONA 1B3VA 2DDXA 2XTKA 1ZBCA 1JAEA 1JF5A 4UQ9A 2PBGA 1XH0A 4M82A 7TAAA 3MANA 1HJWA 4IM4A 4U5KA 5D9NA 3WUGA 4DUVA 2O9PA 3ALFA 2YDSA 4PMZA 3TTOA 4UZSA 3N18A 3F5KA 2BHUA 3VIKA 3AIWA 1HXJA 2D0FA 2WMFA 2D3NA 4UQDA 3SUVA 1GQLA 3D5HA 3AXHA 4ZXOA 2A3HA 1X6LA 4AZCB 1E5JA 4GI8A 5CLTA 4LX4A 5BWFA 5GNYA 1NARA 2W67A 3EDKA 1UH2A 3MUY1 4P8WA 4BQ3A 3A4XA 4GXPA 3VPLA 2CYGA 3CZGA 4CD4A 3ZIZA 1E6PA 4LGXA 3ARZA 3APGA 4P7RA 4OBSA 3IAQA 5HNNA 3CUIA 3K8KA 3L2MA 3CUJA 3VD9A 2EPKX 4AD0A 2W63A 1H2JA 2XGIA 1LQ0A 1KXHA 4D6EA 2X0YA 2CBUA 3HN3A 2YA1A 1MQRA 1QI2A 2BY0A 2CNCA 4U31A 1OSEA 4PN2A 4AD5A 2E4TA 2IXUA 4Z2GA 3QHOA 1J0ZA 2YA0A 2X8RA 1GQIA 3EMQA 2WB5A 4BCEA 2PC8A 5E6YA 1B30A 4GQRA 1JYWA 2ZUMA 2VI0A 1UH4A 3T0BA 1DWJM 2B31A 3K4DA 1E9LA 5E09A 1LLOA 1LG2A 2PI6A 3EMZA 2VRKA 4MNKA 1CLVA 4AD1A 1B3YA 2CIPA 3VIIA 3LPOA 1DTUA 1VEPA 3CHDA 1BGAA 5A2AA 2W5FA 3VGDA 3BXWA 5I5RA 1KGUA 2XVPA 3CH9A 4UOZA 5IFPA 3KWXA 2BNJA 2VT0A 2XWDA 1GOKA 4HOWA 4EANA 3W6MA 2V38A 1UH3A 1QNRA 1W9PA 5BXPA 5DEZA 1G01A 4PCTA 1UZ4A 5ABFA 4J3UA 3AMKA 3UG5A 1EOKA 2G3NA 3W6LA 3THDA 2VVNA 1UQZA 3NJ3A 5DFAA 5I3DA 1M03A 3N12A 1AQ0A 1CTNA 3RMEA 3SCTA 4GZJA 3WELA 1V6YA 1UHVA 4WSJA 5ABGA 2DT0A 3CHEA 4CKQA 3SCVA 4Z2KA 4YPJA 1TE1A 4ACZB 3AIVA 4FLSA 3MMWA 1MYRA 1H41A 1C93A 3A4WA 4QLLA 3VIMA 1G5AA 3MKKA 4GPNA 2ZIDA 4TOQA 3RJYA 1UD4A 2AOSA 2JEPA 1I1XA 2WXDM 4GIAA 3BMVA 4XB3A 5EB8A 3VVGA 3NCOA 1BF2A 1CXFA 1W9VA 1V02A 5BRQA 3U5YA 3RCNA 1R85A 2D0HA 1CPUA 1UWIA 3U7VA 2DSWA 3VDAA 1CGYA 2J47A 5A6MA 4WJXA 3DYPA 3M6DA 2NT1A 4UFIA 3RO8A 3VIHA 3AS0A 3WF2A 4PMXA 1W3JA 4CVUA 1GNXA 1LL7A 3T2QA 1JNEA 2Y2WA 2DPEA 2XSAA 4JHZA 4H8HA 3BAYA 1PPIA 5D9OA 3T0DA 3ZSSA 2UY2A 6A3HA 1UWUA 1JDCA 3QGVA 3AS3A 4C7DA 3DC0A 6CGTA 1QW8A 3IAPA 1WZAA 5CXPA 1ISYA 4Z2JA 2FH8A 1OB0A 4PMUA 3RILA 3W27A 2Y4SA 1TVPA 1XCXA 5I23A 5F7UA 5AY7A 1OD0A 4U5IA 1KCKA 3ARXA 3ZO9A 1KCLA 1WDPA 1MXDA 4AZCA 5DMYA 4JKMA 3GNOA 2XM2A 2DSKA 1PIFA 1NM9A 1QBAA 2A3BA 2PWFA 1WDQA 4CU7A 4GZIA 4AW7A 1GUVA 1YHTA 5LA0A 2J74A 3ARQA 1ISWA 2BXYA 1E6ZA 5JIPA 1VBUA 1E4MM 4FK9A 1XSIA 1LWJA 4DWSC 4AD3A 5M5DA 3MV01 4UFJA 1WE5A 1BPLB 1W2PA 1CWYA 1QW9A 4AZ6A 2UY5A 4AYSA 2YDRA 1GOQA 5DF0A 2X2YA 1E4NA 1VEMA 2VZSA 4HPGA 1UZ1A 4JKKA 4GINA 4XUYA 2FHBA 4JAWA 3FAWA 2JF7A 2G8ZA 4D72A 4MNMA 1UWQA 3FHQA 1J9YA 4AZ7A 2WMHA 1HJXA 3AICA 1FFRA 3DHUA 1BYBA 4HMCA 1GORA 3NUKA 4P7OA 5A8MA 1R86A 2OSYA 4HU8A 5CGMA 3OGRA 2NT0A 3PBGA 1E15A 4UFHA 3WEMA 3UG4A 3AYSA 4WKFA 2DEPA 4W89A 3AMDA 1OINA 4W7UA 1E6NA 1O6IA 2J79A 4J28A 3WDHA 4AZBA 1EGZA 3WQ8A 1W9XA 3AS2A 2YLLA 4JL1A 1CENA 3WQ6A 4TVDA 3ZT7A 4AC1X 2FGZA 2PB1A 2D0GA 1OT1A 2DT2A 4OZOA 3GTNA 1R87A 2VCAA 1I75A 4CN4A 4W7WA 3WH8A 3VMNA 3WUEA 2XYLA 5FIPA 3CZ8A 3RM4A 1Q6GA 4N0RA 5E70A 1B31A 3GZAA 2D2OA 3N9KA 3RPMA 5A8NA 3PTKA 1EQPA 3W53A 3POHA 2CKSA 2O9TA 8CGTA 1JZ4A 3WMSA 1Q6CA 3BAIA 3WN6A 3VGBA 1D3CA 4ACZA 3BSGA 4E8CA 4ZEPA 3AI0A 4QP0A 1JYNA 3O6AA 5BXSA 4AZHA 4MB5A 3WDRA 2DSVA 1EQCA 1G1YA 1E4LA 5ECUA 1CXKA 3K4AA 2WWDA 1K9DA 1MW3A 1SMAA 2WM0A 3W0KA 1KGWA 1CDGA 5BXRA 2GSJA 4HZ8A 3VD3A 4X9YA 1KB3A 4RL3A 2HISA 5A94A 4S3KA 4AZGA 2VZUA 1DWAM 1E6QM 1E6RA 3M46A 3PZMA 4IPNB 4BS0A 4OUEA 3S6TA 1B90A 2CXGA 1QNQA 4PBGA 4WIWA 1V0NA 2ZXQA 4AWEA 1OCQA 1E70M 2WCGA 1M04A 2XFRA 1EHAA 1K9EA 1VJSA 5A6KA 2WHJA 3GNRA 4J3VA 1A47A 5CSYA 3SCSA 4L4PA 4OOUA 4AXNA 4IUGA 3MV11 4GI6A 3WUFA 4UFLA 2XUCA 5I77A 4GKLA 1B0IA 1HT6A 3UESA 1HKIA 4ATDA 4PMOA 4UNIA 4JFTA 4EE9A 1WO2A 2XVGA 2WBKA 4UOJA 3WF1A 3WEOA 3AIEA 3VNYA 1V6XA 4CCCA 5ABHA 3CUFA 4TX6A 1ODZA 1EH9A 4TXEA 2EO7A 1V3IA 3DECA 2E8YA 4Z2HA 1PJ9A 1V3JA 3IJ8A 1E6XM 2J7FA 2YL9A 3CUGA 2ZX6A 3AFBA 2FHCA 4P8VA 4YN5A 5I79A 5CG0A 4D1JA 2YKKA 3MUZ1 4UQCA 2UWFA 2YL6A 1CLXA 3ECQA 4OKDA 4NF7A 4EAMA 1WCGA 4PTXA 5A6BD 1MWOA 2XPKA 4YHEA 1XSJA 4JL2A 4U2ZA 5ABFB 1OWQA 4BF7A 1BFNA 5JIWA 1TR1A 1M01A 2CERA 1GVIA 3AZRA 4CCEA 1J01A 3ZT5A 2YL8A 1UR9A 4J3XA 3CMJA 3CMGA 1UWTA 1H0IA 1AQHA 1MXGA 3WNKA 4K68A 3WQ4A 2EPOA 2EBNA 3T08A 2EPMX 3WF4A 4HP5A 2W61A 5A6JA 2CBIA 1EO7A 1H09A 3SCPA 5E9AA 3UCQA 2WK2A 3NDZA 4B16A 3VIOA 1Y7VA 3OLDA 2FDMA 3ARVA 4AEFA 4U2YA 4QLKA 4B3LA 4CD8A 3GBDA 1N82A 2C7FA 1KR0A 3VD7A 5A6LA 3PZQA 4GO9A 3BGAA 1BYDA 2ZUTA 1UKTA 1AMYA 5I0DA 2VQTA 4CVWA 5D9PA 1QNOA 4ATWA 2D24A 3GBEA 3ARSA 1KXVA 5AYIA 4XZWA 1BGGA 1LG1A 5E6ZA 3CBWA 3NSXA 4R27A 3OIHA 4CN1A 1BG4A 2VCCA 4M1RA 3T2OA 3AZSA 5EFFA 3QHMA 3GYCA 2EQDA 5CPSA 1PEZA 3WMCA 1UG6A 4PMVA 1HX0A 3WENA 4URIA 3VKKA 2YL5A 1JZ7A 2WWCA 4W87A 3B9AA 1FP8A 1C90A 4GQQA 3N15A 1HJQA 1U33A 4RE3A 4JFSA 3GXMA 1E4IA 1JXKA 1HJVA 5CPQA 3OG2A 3GM8A 2WPGA 2OYMA 5IFTA 3W28A 3GNPA 1TA3B 2BV9A 1UR2A 2EPNA 3FNDA 3TA9A 4PSPA 1QVBA 3O2LA 1QHOA 3VILA 2Z1SA 3I3EA 4WSKA 1MQQA 1JI2A 3W26A 5C71A 3K8MA 4AZIA 1VJZA 3AMGA 1GPFA 8A3HA 5M17A 1GQKA 2PWDA 2WC7A 2NW0A 2ZUWA 3KL0A 1XHGA 7A3HA 3NIYA 4PMRA 2ZUVA 1UKSA 2ESCA 2EEXA 3AISA 5D4YA 4UQEA 1UR8A 3BH4A 1PIGA 3AOFA 1D7FA 2VL4A 1V3LA 1WZLA 1ISXA 1NOUA 1V3KA 1C3FA 4W85A 1ECEA 3AIBA 2E9LA 2X05A 3AMCA 2J7HA 2XJ7A 3PN8A 1TVNA 1WB0A 4ZENA 4Q22A 3IK2A 2JFEX 3PZNA 3TP4A 3SUSA 4B9ZA 2AAAA 1LWHA 5I78A 3G6LA 2VVSA 4AIOA 1TUXA 3G6MA 1B1YA 2XVNA 1FP9A 4FMVA 1UR1A 4U33A 2G3IA 4MADA 4WF7A 1J0IA 2JALA 3OLIA 1CZ1A 4DM2A 2PWHA 1B3ZA 3HU7A 1C7TA 2WLYA 3BSHA 2YIHA 1W9UA 3WH9A 3RIKA 1L0PA 2VCBA 1EIBA 1ITXA 3VGFA 4WLCA 5A8PA 1ZBVA 1ZU8A 2UY4A 3KZSA 3ARUA 3CTTA 1UA3A 1KFWA 3PZUA 4ZFMA 2IUZA 4PUEA 2WHKA 4MB3A 2FHFA 4F66A 2QMKA 2GUYA 1Q4NX 2ZUNA 4HOZA 3UR7A 3FXYA 1BSIA 5C70A 3FY1A 5JUVA 5CZKA 5CQ1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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2V3GA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations