5FCZA

Streptomyces plicatus n-acetyl-beta-hexosaminidase in complex with thio-naglucal (tnx)
Total Genus 182
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
182
sequence length
499
structure length
499
Chain Sequence
DRKAPVRPTPLDRVIPAPASVDPGGAPYRITRGTHIRVDDSREARRVGDYLADLLRPATGYRLPVTAHGHGGIRLRLAGGPYGDEGYRLDSGPAGVTITARKAAGLFHGVQTLRQLLPPAVEKDSAQPGPWLVAGGTIEDTPRYAWRSAMLDVSRHFFGVDEVKRYIDRVARYKYNKLHLHLSDDQGWRIAIDSWPRLATYGGSTEVGGGPGGYYTKAEYKEIVRYAASRHLEVVPEIDMPGHTNAALASYAELNCDGVAPPLYTGTKVGFSSLCVDKDVTYDFVDDVIGELAALTPGRYLHIGGDEAHSTPKADFVAFMKRVQPIVAKYGKTVVGWHQLAGAEPVEGALVQYWGLDRTGDAEKAEVAEAARNGTGLILSPADRTYLDMKYTKDTPLGLSWAGYVEVQRSYDWDPAGYLPGAPADAVRGVEAPLWTETLSDPDQLDYMAFPRLPGVAELGWSPASTHDWDTYKVRLAAQAPYWEAAGIDFYRSPQVPWT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces plicatus
publication title N-Acetyl glycals are tight-binding and environmentally insensitive inhibitors of hexosaminidases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords B-N-acetylhexosaminidase
total genus 182
structure length 499
sequence length 499
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-12-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A PF02838 Glyco_hydro_20b Glycosyl hydrolase family 20, domain 2
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5fczA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 5fczA01
2IXVA 2XSAA 3WQVA 3K4AA 4GZJA 2PWFA 4MNJA 3PTQA 1KFWA 1TVNA 4MAZA 1YQ2A 3N04A 3B9DA 3CZGA 5A2BA 1RP9A 5FL1A 2YL9A 1KXVA 1OT2A 1EH9A 4W89A 3NDZA 3CHDA 1VEOA 3PZQA 2JEQA 1DHKA 3K1DA 2DSUA 4WK9A 3CZKA 2PI6A 2GJPA 2VQUA 3VX1A 2JIEA 3CZLA 4ZENA 1KGXA 5FOOA 2BY3A 4U31A 1BLIA 1H11A 2J8FA 4BA0A 3EMCA 1KCKA 4CU6A 5M3WA 3WNNA 4NF7A 1B3XA 4JFWA 1ISYA 2D3NA 3WQ5A 1BPLB 8A3HA 1V08A 4AD0A 1E72M 1WZLA 4AY1A 2CNCA 3AHTA 1XH2A 1XV8A 1WZAA 4ATDA 3FHQA 1PX4A 4NRRA 1SR0A 7CGTA 4UFJA 2O9OA 4CD7A 3T09A 2YOCA 1R86A 1C93A 2ZXAA 4H7VA 1J0IA 3AHYA 4U5KA 3WIJA 4J28A 4Z2HA 4A3YA 3EYPA 4UFMA 3CUJA 1GVYA 4DWSA 3WMCA 1X1NA 4UFHA 3ZSSA 3CH9A 4PUEA 4QAWA 4YPJA 3WD0A 5DMYA 3WDPP 1ZJAA 2PWEA 4AZIA 1MQRA 2CKRA 3SUTA 1CGTA 2VZTA 3RJYA 1L0PA 3AMDA 1HXJA 3BH4A 3AXHA 1GOOA 1GHSA 2WHMA 4WSKA 1DWIM 3DHUA 4UCFA 4BQ2A 1E0XA 2ZWZA 5LYRA 1X6LA 3TTQA 1C91A 2HVMA 3SCSA 4U3CA 5D8ZA 2D1ZA 2GDVA 2OYMA 5LA2A 3SCRA 5CG0A 4HA3A 1ZB5A 1GORA 4BS0A 3WDJA 1EQPA 3CTTA 1JNEA 4Y7EA 5E9AA 5C8BB 2DSVA 2J7EA 3VD9A 5A8PA 1A3HA 1RPKA 4W5ZA 4QLJA 4GQRA 3SURA 2BHYA 3BAXA 1MW3A 4JKMA 4P7QA 3VD4A 1Q4NX 2BS9A 1VENA 1JF6A 1ITXA 3AS1A 3N13A 2DSZA 1WE5A 3BC9A 1F4AA 3K4DA 2XM1A 2BXYA 1QNRA 2J8GA 1KGUA 3MUAA 1QI5A 1WCGA 3UR7A 4QP0A 4HP5A 2CBJA 1H4PA 2WMKA 1BVZA 3W6MA 2DT1A 3ZJ6A 1I75A 1VFMA 4P7OA 3CUFA 1ESWA 5E0CA 4CCCA 4HPHA 1VEMA 3FW6A 4JFVA 1XD0A 4UFKA 2FH8A 2VNCA 2WHLA 2PBOA 2CKSA 3AIBA 2PC8A 2OYKA 3BMVA 5GQBA 3FHAA 2WM0A 3CZJA 4AYSA 3GM8A 2J79A 3IJ7A 4M8UA 2WCAA 1OD0A 1CNVA 2G8ZA 3T0BA 1FHLA 3DYMA 2VZSA 4PTWA 1HT6A 2VVSA 1UD4A 4AMCA 3PZTA 3AXXA 3S6TA 1FHDA 1E9LA 5JIPA 1LQ0A 4PMOA 1V03A 1BF2A 1LL6A 2XG9A 1W2VA 1CTNA 2YA0A 5JBFA 4WKAA 3W27A 1VAHA 1E6RA 1KBKA 3ZR6A 1JI2A 2YLLA 1JL8A 2BV9A 2XWEA 2OSXA 2GVYA 3SCUA 1C90A 4OBRA 3ALFA 1V3JA 4KRTA 3HJEA 5CPSA 3VIOA 3ZM8A 4AZCB 4DM1A 3ARWA 1OIFA 3RILA 2WMIB 1FH8A 1H3GA 4MB1A 2CPUA 1UR2A 2CHOA 5E6ZA 1HKIA 3OLEA 1MQPA 1LJYA 3LMYA 1UKSA 3AROA 5EMYA 3WQWA 4GO8A 2PWDA 1E15A 2DT0A 4JFSA 3BAWA 1QNQA 2Z1SA 5D9OA 1JZ6A 1IT0A 3GZAA 1GQKA 4JKKA 1FFQA 2V3DA 1Q6DA 2JIWA 3BAIA 4AEEA 1HIZA 3MANA 2ZICA 1UWIA 4S3KA 2WBGA 2X1IA 2V38A 4TVCA 4OJYA 2YDQA 4PCSA 4X0VA 1KQYA 4UOJA 4DUVA 4EKJA 4GZEA 3IJ8A 2B31A 4PMNA 2VRJA 1HKJA 3VNZA 3QR3A 3WD2A 3ZOAA 1M04A 4GQQA 7TAAA 3CO4A 4JCMA 4W7VA 1E6XM 4KMQA 2J62A 2CBIA 2J7CA 2W62A 3NSXA 2VRQA 2Y5EA 1NOFA 1K6AA 1K9EA 5D9PA 3K46A 2WMHA 4M82A 1J12A 2WC7A 4D1JA 4IPLA 3CBWA 1DWJM 2C8NA 3AS0A 1JAKA 2WLZA 4M1RA 1D7FA 4CCEA 2W4XA 3SUSA 2XIBA 4CUCA 3PZNA 3GXFA 2E4TA 5I3DA 2ZXDA 3A47A 4H2CA 4AISA 4M81A 3EBVA 3U5YA 4YN5A 1DWFM 4U3AA 4P7NA 3ZIZA 5BROA 4B9YA 1VJSA 3N9KA 2XHYA 2FH6A 1I1WA 1R7AA 3T0AA 2QHAA 3VVGA 1TFVA 3CUIA 2FHBA 3VINA 3UEQA 4P8WA 1W91A 2MANA 2CCRA 1TE1A 4CCDA 1HP4A 1UD8A 3L4XA 5E09A 2ZE0A 1E43A 2JE8A 1GQLA 3NCOA 1CLVA 4F79A 2J77A 3AHVA 4UQBA 3IK2A 4HOZA 4ZXOA 4NZCA 3TA9A 5EFFA 7A3HA 2VC9A 3IANA 2GK1A 4JKLA 1JDAA 5BCAA 4JL2A 3KE0A 4KGLA 1G1YA 4URIA 2XGIA 1QHZA 4TX8A 3TONA 1H0IA 1EGZA 3AOFA 2VX4A 4M29A 1E6ZA 3F5LA 3BLKA 1E4LA 1D3CA 4MTVA 1OSEA 4PUDA 3UG4A 4LYQA 6A3HA 4P8VA 4ZFMA 4F9JA 1FP9A 2WVVA 4PMDA 4EAMA 3PTMA 2XFYA 1F4HA 3SEPA 4MAVA 5IXEA 1FA2A 3VPLA 2VZVA 2PWGA 4H04A 2J7HA 1UD5A 1QW8A 1UWTA 2AAAA 1ISXA 3AS3A 2W92A 3RCNA 4NI3A 4K68A 1J01A 1GQJA 2DDXA 2ZUSA 4AZBA 3UETA 4CKQA 1US3A 4Q22A 5ABFA 3RM9A 1V0NA 5DT7A 3FAWA 4E8CA 4E8DA 1JG9A 4RE3A 3A4XA 1UD6A 1UHVA 1E4NA 5A94A 2Z1KA 2CETA 1ODZA 2JFEX 1V0MA 3AMCA 4GXPA 3RM4A 5A8OA 5A6BA 3L4ZA 5LA0A 3VIKA 3ZO9A 2EXOA 2CITA 3GXMA 2V3FA 5ABGA 5IFPA 2XPKA 3KWXA 3DC0A 4PMRA 4UQEA 1CGUA 1UH3A 3WF2A 3VGBA 2F2HA 2PBGA 4GPNA 3WFLA 1WZKA 3CHFA 3I3DA 2E40A 4C7GA 4W7WA 4X9YA 4RE2A 2DIEA 2DPEA 2GJXA 4PSRA 1D2KA 1UZ1A 2W67A 2YDRA 3OLDA 3OLIA 4GZIA 1QI3A 5M03A 2J7GA 3VDHA 1JYXA 1C8QA 5CXPA 1PBGA 1J0JA 3BGAA 3L4VA 3OIHA 4B15A 2PB1A 5JBDA 2EPOA 2EPNA 3VKKA 3MUZ1 3CZEA 4EK7A 3WDRA 2EEXA 4M80A 1JFXA 3FNDA 3WUFA 3WN6A 1H0GA 4HTYA 2VO5A 3M07A 1CGVA 3A4AA 4W85A 1EHAA 3AISA 4PMQA 3FN9A 3EDJA 1ZS2A 5A3HA 2UY4A 2XVLA 3OZPA 1NWRA 1ZBWA 1K9FA 1W3JA 3W37A 4LQ1A 3WH6A 4DUWA 1KR0A 1WDSA 3LPPA 3KL5A 3OA5A 4UZUA 5FD0A 4UFLA 1OBAA 2J75A 3N1AA 1KWGA 1B1YA 4MB3A 1UA7A 1C8YA 2XGBA 5HNNA 3WEMA 4KGJA 2X0YA 2WZHA 1E6NA 3EDEA 4FLSA 1BGAA 1SYTA 2VURA 1VFOA 5ECUA 3WDIA 3ARQA 1CXLA 4MNMA 5CLWA 3ZT5A 1AQ0A 3WEZA 2A3EA 2QMJA 1B3ZA 2G3IA 3PHAA 3VIHA 3VO0A 2WVUA 2Y4SA 1EDGA 5DT5A 2EPMX 3WNMA 5A6BD 4TVDA 3AMKA 1AMYA 1QOXA 2Y2WA 1NP0A 2YJQA 1J0HA 2YL6A 5CJ5A 5A6AA 1E5JA 1UG6A 1V6XA 3RJXA 3WH5A 1R87A 5JIWA 4LPCA 4PEEA 2J7BA 1HKMA 2WCGA 3D5HA 1PX3A 1BFNA 3L4TA 4QDMA 3T2PA 1W3KA 3ZJ7A 4H8HA 3WNOA 2DSKA 1XYFA 4JAWA 2GJRA 1KWKA 1R8LA 4N0RA 2A3CA 4R27A 3VGFA 1RH9A 4MDOA 1MXDA 3VDCA 1E6SM 1JZ5A 4PSPA 3HU7A 5A6SA 3ARZA 4MDPA 3ARUA 1CXKA 1UR9A 4Z2LA 2DIJA 1E6QM 5I5RA 2ZX9A 5JBEA 2WKLA 4B9ZA 4MJ4A 5I23A 3VM5A 4MNLA 3UESA 2BVDA 3CIVA 5E6YA 1QPKA 2XSBA 1MW1A 3SUUA 3B9EA 2GDUA 2Y8VA 3AZTA 3SCVA 1XCWA 1PX8A 3D3AA 4OKDA 3THCA 1MFUA 1Q6EA 4HMDA 1V02A 4L4PA 5AYBA 1XC6A 2VVNA 4MJ2A 1UWUA 1TA3A 2C0HA 2EBNA 3J7HA 2DGAA 2VCBA 5GNXA 4UTFA 1BHGA 2FHCA 2CBVA 5I6SA 4MB4A 3MSDA 3S2CA 2PF0A 1CLXA 1EO7A 2YKKA 1MW0A 1JFHA 1NOUA 1PZ3A 4B3KA 5HBFA 3GYCA 4HOWA 1BTCA 1SFSA 1HJXA 1HJVA 1KXQA 2CHNA 2E0PA 1BQCA 3PZVA 2X0HA 1QI0A 5I79A 2C7FA 5CGTA 4ATLA 2BHZA 3SCWA 3UG5A 1BVNP 3W28A 1ZL1A 4A4AA 4BQ5A 2ZUNA 3FY1A 4U5IA 4FK9A 3N12A 1V3LA 1V02E 1WPCA 3VIIA 4WJXA 4TOQA 5CGMA 3WQ8A 2W66A 1Q6FA 3HN3A 1W1VA 1HJUA 3GH7A 2ZUVA 3MUY1 3L2MA 5A8NA 4ACZB 4TVUA 2JALA 1AQHA 1FFRA 3MV01 3WY1A 2QPUA 4OIFA 2ZX5A 1R85A 2BY1A 3OGRA 1WDQA 4H8UA 1VF8A 3ARYA 1C7SA 2E9BA 4UQDA 1UZ4A 1ZBVA 1KB3A 1E1EA 1J10A 3WD3A 2ZXBA 2O92A 4NRSA 4DWSD 4FF5A 5DO8A 2WWCA 3TTYA 3GH4A 1E0WA 1YHTA 4DWSC 4W87A 3NDYA 2ZX7A 5A8MA 3WMBA 2XVKA 1W9DM 3I3EA 1PJ9A 1DEDA 1NQ6A 1MXGA 3U7BA 3W29A 4PMUA 4C91A 2V3EA 2WK2A 9CGTA 1JYVA 3QOKA 3OBAA 3WDHA 2X2YA 1EA9C 2WMJA 3ARXA 3VOCA 5DEZA 3FXYA 1HJWA 1QW9A 3LPFA 3HMCA 4XZBA 3W0KA 1SMAA 2CBUA 1WDPA 1HL8A 3VX0A 4CU8A 1XSJA 3WENA 1JDCA 5GNYA 5BRPA 5M17A 1GQIA 2J25A 2E8ZA 1J11A 4NSBA 2CIPA 4HPGA 1OB0A 2VX7A 5C71A 1PIFA 3F5KA 2WMFA 1Y7VA 2EJ1A 2VZUA 4PN2A 1TG7A 3SCOA 2F8QA 2GK1B 1U2YA 3MO4A 1UR4A 4W7UA 1IZKA 4KWUA 1HJQA 1HKKA 4C7DA 1H2JA 2ZIDA 3OGSA 3PBGA 1CXIA 4HMCA 4D6IA 2XUCA 4FLRA 1UD3A 1JNDA 4Z2KA 4PMXA 2BFGA 3BMWA 2WVVB 3DECA 1BYBA 1OGBA 1LF1A 1XRVA 3U7VA 1OT1A 2ZUMA 1B3WA 3TOPA 4FLOA 1B3YA 3FAXA 3T08A 6CGTA 1JZ7A 5A69A 1E3ZA 4JHOA 5I24A 2WCSA 2YA1A 3QHNA 1ZBKA 3RM8A 3W81A 5ABFB 5I0DA 3VD5A 2BNJA 1EIBA 5D4YA 4ZE5A 2BY0A 3SCNA 2JF7A 3AMLA 3KL3A 3A4WA 4QLLA 3BXWA 1OGGA 1FH9A 4WKHA 3GNRA 4J3WA 1JZ3A 5IDIA 3MKKA 2WANA 4W93A 4OOUA 3AJ7A 1H41A 1B9ZA 1ISVA 2WHJA 1CXEA 5BXTA 2BVYA 2YDSA 2EO7A 4P7LA 4UOQA 3AHXA 3B9AA 1DWHM 4V2XA 2QF8A 2VZOA 2WBKA 2ZXQA 2VX6A 3VD3A 4AZ6A 1ZU8A 4J3SA 3CZ8A 1V3MA 2OWWA 5CLTA 4CN1A 3ZSTA 3WF4A 2G4FA 2G41A 3IAQA 3BCDA 2X8RA 1H5VA 4XV0A 3GH5A 2GJXB 4UQAA 1TVPA 3VILA 4J3VA 4J3UA 3AFBA 3WH9A 4W8AA 4AZ7A 4QCFA 3G6LA 4AZ5A 1G01A 3ZT7A 4Z2JA 4CN6A 3WNKA 3PZ9A 5CZKA 2NT1A 4U33A 4CN4A 2XIIA 2NSXA 2J74A 4AZCA 4BQ4A 2D23A 2WWDA 1CPUA 1C3FA 1UQZA 1VEPA 3W38A 2QPSA 4CGTA 3VIJA 2WZIA 1W9BM 3GTNA 4AD3A 3CUGA 4PBGA 3L4YA 3VMNA 5M5DA 3WBEA 1CBGA 1M03A 4F9DA 2O9TA 2OYLA 4XZWA 2OLHA 3DYPA 3VU2A 1LLOA 2DT3A 2DSWA 4LXFA 3K8KA 4HMEA 3AIUA 4J27A 3ZQ9A 1VIWA 3G6MA 1KXTA 5JUVA 1W3LA 3WNLA 4A3HA 1EDTA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2IXV A;  2XSA A;  3WQV A;  3K4A A;  4GZJ A;  2PWF A;  4MNJ A;  3PTQ A;  1KFW A;  1TVN A;  4MAZ A;  1YQ2 A;  3N04 A;  3B9D A;  3CZG A;  5A2B A;  1RP9 A;  5FL1 A;  2YL9 A;  1KXV A;  1OT2 A;  1EH9 A;  4W89 A;  3NDZ A;  3CHD A;  1VEO A;  3PZQ A;  2JEQ A;  1DHK A;  3K1D A;  2DSU A;  4WK9 A;  3CZK A;  2PI6 A;  2GJP A;  2VQU A;  3VX1 A;  2JIE A;  3CZL A;  4ZEN A;  1KGX A;  5FOO A;  2BY3 A;  4U31 A;  1BLI A;  1H11 A;  2J8F A;  4BA0 A;  3EMC A;  1KCK A;  4CU6 A;  5M3W A;  3WNN A;  4NF7 A;  1B3X A;  4JFW A;  1ISY A;  2D3N A;  3WQ5 A;  1BPL B;  8A3H A;  1V08 A;  4AD0 A;  1E72 M;  1WZL A;  4AY1 A;  2CNC A;  3AHT A;  1XH2 A;  1XV8 A;  1WZA A;  4ATD A;  3FHQ A;  1PX4 A;  4NRR A;  1SR0 A;  7CGT A;  4UFJ A;  2O9O A;  4CD7 A;  3T09 A;  2YOC A;  1R86 A;  1C93 A;  2ZXA A;  4H7V A;  1J0I A;  3AHY A;  4U5K A;  3WIJ A;  4J28 A;  4Z2H A;  4A3Y A;  3EYP A;  4UFM A;  3CUJ A;  1GVY A;  4DWS A;  3WMC A;  1X1N A;  4UFH A;  3ZSS A;  3CH9 A;  4PUE A;  4QAW A;  4YPJ A;  3WD0 A;  5DMY A;  3WDP P;  1ZJA A;  2PWE A;  4AZI A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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