4YHGA

Native bacteroidetes-affiliated gh5 cellulase linked with a polysaccharide utilization locus
Total Genus 160
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
160
sequence length
389
structure length
389
Chain Sequence
RPMDNEAVQFGMSMGIGWNLGNQMDAHYDGCSYETGWGNKAATQQTFNGLAKAGFRSVRIPVTWMGHIGNAPTYAIERGWLDRVDELVHMAHKAGLIVIINIHHDGFGAADTPSKGSHWLDLPAAVASEERNQLIKQELTMIWLQIGKRFANDGEWLVFETLNAIQDGDWGNGNNRRDGGAQYRVLNEWNQVCVDAIRAAGGKNETRYIGVPGYVCNPDLTVENLVLPEDVVPNRLMVAVHSYDPWDYAGSAKYNEWGHTGKDVVPGVGEEAYVGMLNRLFNMYIRRGVPVYFGEFGAVRRASKADEEFRLYYFRYICKAMRDRRISALYWDNGNSKAGNDGFGVIDHATGRFIGNGEQAVRAMIDSWENNDPNYTLQSIYDSAPESSR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Bacteroidetes bacterium ac2a
publication title Structural Features of a Bacteroidetes-Affiliated Cellulase Linked with a Polysaccharide Utilization Locus.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GH5
total genus 160
structure length 389
sequence length 389
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2015-02-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4yhgA00
3UEQA 2VZVA 4D6JA 5JBDA 2AMGA 5I77A 3NSXA 3WUFA 1UR2A 3DYMA 2G3MA 1US2A 1KXTA 3AMCA 5BRPA 2YBUA 2CYGA 1J0ZA 4F9JA 4URIA 3N9KA 2YL6A 3W25A 4E4PA 4B3LA 1UUQA 3I3EA 1QI4A 4BZYA 3B9EA 3K8LA 1NQ6A 4AZ7A 3DHPA 4H2CA 4KH2A 5CLTA 1TVPA 3MMWA 2JF6A 2O9RA 2DIEA 3CUFA 1UWRA 1CYGA 4E8CA 4BF7A 1V3MA 5EMYA 4CN1A 2XHYA 4B16A 2JEQA 4D6GA 4GO9A 2XVNA 1V3JA 4OIFA 5CZKA 4A3HA 1W1YA 4TOQA 1E4LA 4GI9A 4WKHA 1J0JA 3WF4A 2JALA 3DYOA 4GQQA 1V0KA 3U7BA 3WD0A 2CESA 2WYSA 2ZUTA 4H8UA 1C8YA 4JFVA 3LPFA 2XM1A 3NIYA 3WUBA 7A3HA 1NOWA 5A6BD 3T0DA 2DSWA 2GK1A 2JE8A 3ARSA 3CIVA 1KR0A 2J4GA 1GVIA 4XB3A 3WDIA 3LMYA 4U2ZA 4MDPA 5BYWA 4J3XA 1EO5A 4FK9A 2G8ZA 1JF5A 3THDA 3VIFA 1TA3B 1B90A 2BVTA 2CBJA 1LL4A 3F5JA 2EQDA 3T09A 1TG7A 5DEZA 1W1PA 1E6XM 5M5DA 1B3ZA 3SCUA 5A8OA 5BXSA 4WK9A 1PX4A 1FH8A 3GXMA 2WVTA 4PBGA 2CCRA 3WUEA 4L4PA 1HP5A 3OGSA 4CCEA 4P7QA 3CUHA 1Q6GA 3WBEA 1RD6A 3UG5A 4AIOA 3ZT6A 3PZQA 1V3KA 2VX5A 1W9UA 2E8YA 4W7VA 3IJ8A 3BAWA 4AY1A 3PBGA 5IFPA 3PTMA 2NT0A 5A6KA 1D7FA 4BS0A 2YDRA 3MV11 1C3FA 2WC3A 2ZXBA 2GK1B 1I1WA 2J7BA 3WD3A 2XVGA 3WNPA 5D9NA 2E9BA 1FA2A 2BY0A 3EDDA 2J25A 2D20A 3OZOA 2CKSA 3FHAA 1JZ8A 1KBKA 2WXDM 3PZ9A 2VVSA 2Q8XA 3T2PA 1TVNA 2D0HA 3AZTA 3IAQA 3RM8A 1E5JA 4ATDA 3MO4A 2OSXA 5E6ZA 3CZ8A 4D6HA 2ZUNA 3IAPA 3T0AA 3AIBA 3BGAA 2GDVA 2D3LA 2E0PA 4FF5A 4OBRA 1E6RA 1CNVA 4MAVA 3WEOA 3L4XA 3GXDA 4M8UA 2RGMA 4MB4A 4J3VA 4N0RA 4H04A 1E6PA 3WELA 4CCCA 3A6OA 2J7GA 4GI8A 4QLKA 3SUVA 4NI3A 2XIBA 1Q6EA 4GZIA 4AIEA 2ZX8A 2ZWZA 1UD3A 2J7EA 5D4YA 1ISZA 3WH6A 1QI5A 2G4FA 2XFFA 2WLYA 1KGWA 1QI0A 1CZ1A 3WF1A 1XYZA 5A94A 3M6DA 1CENA 1BF2A 3DYPA 3CO4A 1MQPA 1CGTA 1AQHA 4XUYA 5HNNA 2XVPA 2WWCA 4JFSA 3WF0A 2WC7A 4DUVA 1B3WA 3AROA 2XUCA 1KCLA 1GJWA 1LG2A 2ZOXA 3N12A 4W8AA 1FFRA 5IXEA 3W82A 3KL5A 1BYAA 2JEPA 2BVDA 3PZMA 3RM9A 1H5VA 1KFWA 1MW2A 2WSPA 3ZT5A 1MQQA 1ISVA 1KXQA 2XVKA 3RIKA 4J3SA 2W4XA 2PBOA 3MUZ1 3PZVA 4P8VA 1UOKA 2ZUSA 3UG3A 1JZ5A 2VTFA 2GVYA 1QNSA 3L4YA 2JIWA 3DHUA 2UY5A 1FH7A 4UTFA 3NSMA 5BXRA 3LPPA 3WFZA 2UY3A 4BQ2A 4UOJA 1E43A 4TX6A 4EAMA 1CTNA 4AWEA 2CXGA 5FOOA 1HL9A 1XRVA 3K4AA 1QI3A 2A3EA 1WZAA 2FDMA 3I3BA 1VIWA 4GXPA 4J3UA 3QOMA 2XWEA 2E3ZA 2OWCA 2VNCA 3VD3A 1H11A 4YPJA 4DWSD 1W1VA 4WKFA 2C7FA 2VRQA 4WKAA 5E0CA 2XM2A 4CD4A 3MUIA 5HBFA 3AHVA 4ACZB 1BSIA 1H09A 2VCCA 1QW9A 1AMYA 3AIVA 2EPMX 3ARRA 1VBRA 4RE4A 3W4RA 4Q22A 3F4VA 3VGBA 3J7HA 3UESA 1UD4A 5F7UA 5E09A 4MB5A 3SCTA 3VMNA 4UQAA 2NSXA 3OBAA 3FAWA 4H8HA 3AOFA 5DT5A 3VD7A 2ZUWA 1K9DA 6TAAA 1ECEA 1R87A 1JDAA 2XTKA 3CMGA 3AYRA 3WDJA 3MU7A 1JL8A 2WBKA 1LWHA 3PTKA 1HJWA 3WN6A 3WEZA 4HOZA 1KB3A 1TCMA 4N42A 2WAGA 3VD5A 3W53A 4V2XA 2Y4SA 4MADA 3DECA 3VKKA 5JUVA 4V27A 5I0DA 4JKLA 1BHGA 2E9MA 4ATLA 1CXLA 1W9XA 4PUDA 5D8ZA 1OD0A 4GKLA 1WDRA 2Y5EA 1SR0A 3UR7A 3EDFA 4MPKA 1PAMA 5GPRA 3WL0A 4XV0A 5CG0A 2W92A 1IT0A 2WHMA 2V3FA 5I3DA 1AQMA 2ZXAA 3G6MA 4W88A 1J11A 1CXIA 1EH9A 1GOKA 4WSJA 4HOXA 3GNPA 2XG9A 2J8GA 5I2UA 1HN1A 2QV4A 1CPUA 1ZL1A 3UERA 3OLDA 4J7RA 1LLOA 1TZ7A 3L4TA 2FHCA 1JGIA 4D6EA 3L4UA 3AZRA 2BHYA 1ISXA 4UQEA 3KEHA 2WCGA 1V6XA 1HT6A 1WZKA 4HPGA 1EOKA 2PWEA 2YIHA 1FHDA 1VEMA 4LX4A 3ZOAA 1MW1A 1HP4A 2CHNA 2EJ1A 1V03A 2YKKA 3ZMRA 3BAIA 2VZOA 2VX7A 5GNZA 4W87A 3W26A 3L4ZA 4U3AA 2CBUA 3U7VA 2BVYA 4PMXA 3AMLA 5I78A 1HNYA 3TTOA 1WO2A 3KL0A 4TX8A 1ZBWA 4X0NA 3VTRA 1PX8A 3KWXA 2E4TA 3B8SA 3W0KA 3VDAA 1MFVA 3CUGA 1B3VA 5A1AA 1XD0A 1JI2A 3TTSA 4ZXLA 4W84A 5I24A 3FN9A 5A8MA 1E5NA 4UR9A 2WZEA 3VUPA 3GZAA 2BNJA 1WCGA 4AD2A 2XJ7A 4UOQA 4BCEA 1B3XA 1VFMA 3AIEA 2G3IA 4QP0A 4PMQA 2BHUA 4WIWA 1E1FA 2J62A 4UFLA 3BMWA 1VFOA 3AJ7A 2F8QA 4PYSA 3VMPA 4JKKA 1Q6CA 2PWDA 3VPLA 4PTWA 4F79A 1UH3A 5CQ1A 2WZHA 3WIJA 4GINA 4PTXA 5C8BB 4HA4A 1WPCA 2WZIA 2CITA 1DWAM 4GIAA 1CGWA 1R86A 4Y7EA 3G6LA 4PTVA 3WH8A 4BQ4A 4M29A 3MV01 2V3DA 3RILA 3BMVA 1HJUA 1WZMA 1K9FA 1VFFA 3W27A 5CSYA 1BYCA 1CEOA 4IPNB 4HZ6A 4XX6A 1HKMA 3II1A 3K46A 1VEOA 4QAWA 5GNYA 1E4IA 2DH3A 2FHBA 3ZIZA 3ZSTA 1SYTA 1ZU8A 3VNZA 5ABEA 1QNRA 3O6AA 1M7XA 4Z2IA 5E0FA 1MYRA 4UFKA 2VURA 4IISA 3ZJ6A 1ZBKA 5EFFA 3PZNA 1Y7VA 4CU6A 2O9TA 4B3KA 1GVYA 1V6WA 4P8XA 3VIGA 3VILA 5A6JA 3WMBA 2ZX6A 1PIFA 3FHQA 1JNDA 2YLLA 1X1NA 1UR8A 4EANA 1H4PA 4AZHA 4UFJA 3EMZA 3WENA 1GJUA 4B9YA 1WDPA 1XSJA 2GUYA 3BXWA 4AISA 2JFEX 1M53A 3POCA 1R8LA 4MB1A 3BAYA 5A6SA 4P8WA 5CGTA 4X0VA 1UR4A 3ECQA 5I23A 2J75A 2X09A 3K8MA 2QF8A 1PZ3A 4MDOA 4OZOA 3QGVA 3QOKA 1ZS2A 4PMUA 1C90A 4FMVA 1D3CA 1OSEA 4YHEA 4U33A 1Q4NX 4MNKA 2IXVA 3AS1A 4J28A 4GQRA 1VJSA 4NRRA 2W5FA 1E6ZA 1IZJA 2YLAA 3WQ4A 1G9HA 4A4AA 2ZUMA 3RJYA 4W7WA 1LL6A 3WDQA 1OT1A 4LYPA 1GOQA 1LJYA 3AXHA 3SIMA 1G0CA 1NWSA 2HVMA 1LF1A 2WVUA 5A6AA 3NYDA 3N15A 2AOSA 5KEZA 4Q7NA 3GNRA 1FH9A 1E70M 3UG4A 1KQZA 3SCQA 1WAWA 1R85A 3WL1A 3WSUA 3ARUA 2GJXA 3WMCA 4DM1A 3VGHA 1XH2A 3CZEA 4CN6A 4UFMA 4TVDA 1EGZA 1XH1A 3ZQ9A 1OINA 5A6MA 3SUSA 1EDTA 2DQXA 4CVWA 4W5ZA 4DWSC 2DPEA 5AYBA 3WH9A 1UKTA 1ODZA 3WDRA 1WZLA 4OJYA 3SEPA 5DFAA 1A47A 1UKSA 3TTQA 2BV9A 1VRXA 2WSKA 2DT1A 3B9DA 3N18A 4D72A 3F5LA 4P7RA 8A3HA 5FL0A 1MFUA 2WHKA 3W24A 4AEEA 5E6YA 4D71A 2V5DA 1H49A 3OZPA 4AIUA 4B9ZA 1JG9A 3TONA 2DH2A 1H0IA 1GQJA 2ZWYA 5IHSA 3ARWA 3BSGA 1XC6A 3LPGA 1JF6A 2D24A 4MNJA 1BVNP 5AYIA 4R5EA 5D8WA 1E56A 1Q6FA 1TFVA 2DSZA 3E1F1 1TR1A 2BS9A 2WB5A 2GJPA 5BRQA 2GJXB 3AHYA 5IDIA 1FP8A 4TUFA 1EIBA 4HZ7A 3AHZA 1YHTA 3MKKA 2FGZA 4JL1A 3RM4A 1CGXA 3WD1A 7CGTA 5AY7A 1GOWA 1WP6A 3WEMA 2VX6A 3QHMA 2WMIA 3WF3A 3VIJA 4DUXA 2CPUA 3I3DA 1W9PA 2VVNA 4TTGA 4P7OA 1WDQA 1JZ4A 1HJXA 4GZJA 3AS2A 1QHZA 2PWGA 3SCPA 5HPOA 2V38A 3QR3A 1E71M 1ZBCA 2D0GA 2IUZA 3CZKA 5D9MA 3VIHA 2QPSA 1HJQA 2ZXQA 1ITXA 1HXJA 3VMOA 2OYKA 1BLIA 3WDPP 1QNQA 1HIZA 4LGXA 2FH8A 3NDYA 4EK7A 3BAJA 3W81A 3WQWA 3BC9A 1PPIA 3VDHA 4HMEA 1E1EA 4HMCA 3VIKA 3KE0A 5LYRA 3AYSA 2VQUA 1OGBA 4P7NA 4JAWA 4GI6A 1WKYA 3VD9A 3IK2A 3VD4A 2WVVA 2WMIB 5GQBA 1UZ4A 2YA1A 2CERA 1TUXA 1W9VA 1JAEA 3AIQA 1E0VA 2E9LA 2VCBA 2WMGA 5A2BA 2J47A 5CGMA 1GQLA 4FLQA 5EBAA 4DM2A 3WQ8A 3SCWA 1UWQA 1UWIA 4PCTA 4H7VA 1OIFA 4Z2GA 5AC5A 1EDQA 3W28A 5A8NA 3S6TA 1C8XA 1VJZA 3VIPA 4RL3A 1E40A 1B1YA 1FHLA 1UZ1A 3GM8A 4A3YA 1KWKA 2WANA 2CEQA 2V5CA 4PTMA 5I6SA 3APGA 3AHTA 1BVZA 3NSNA 4AEFA 1ISYA 4HU0A 3AMKA 4NF7A 3EDKA 1P6WA 1JFHA 2J7HA 4U5IA 1UR0A 3N11A 4D1JA 3BCDA 4W5UA 1UR9A 1W2VA 2Y24A 3WNNA 4QFUA 3GBEA 1UHVA 4AZGA 2AAAA 3WQVA 3EMQA 1KXVA 1QBAA 2B31A 2XPKA 1J01A 1E73M 4NZCA 1KXHA 2VT0A 1MXDA 1D2KA 1VFUA 4JZ5A 3L4VA 1B0IA 1GHRA 3AICA 3A4WA 2G41A 3WDHA 2WVSA 5CPSA 3VIIA 1XYFA 3OIHA 1W32A 1E15A 4UNIA 1NWUA 2W61A 3GXIA 2DSVA 2VUYA 4AC1X 4C7DA 2YA2A 2VX4A 4C7GA 4HMDA 4GPNA 3ARVA 1UKOA 3AXXA 1A3HA 3T08A 5ABFA 1M01A 2WHLA 3ALFA 4LXFA 3ARXA 3HU7A 2BXYA 4MB3A 5CPQA 5M17A 1W3LA 1XGZA 3IANA 2PB1A 3GYCA 3NCOA 1JI1A 1H41A 2Z1KA 3WNMA 4PMVA 3F5KA 3GDBA 3AQUA 1EDGA 2J77A 2UWFA 3PTQA 5D9PA 2WWDA 1UA3A 1GQIA 1J0HA 2O9OA 4Z2LA 5M03A 5LA0A 2BFGA 3VO0A 2D2OA 1KGXA 3EYPA 3B9AA 1JXJA 3UR8A 3UCQA 2X2YA 1AVAA 4DWSA 3BH4A 5DO8A 1B3YA 1B30A 4MAZA 1CXHA 5CXPA 3GNOA 1QHPA 2J78A 1BG9A 3CZLA 1ITCA 4ACYA 2EPOA 1V3IA 3A3HA 1V0NA 4M56A 4KWUA 4AZBA 1XHGA 4OOUA 5ABFB 1UH4A 3THCA 4AZ6A 4D6DA 3LPOA 1PZ2A 4TXEA 1J10A 5TD4A 2WHJA 3VU2A 5EFDA 2QHAA 4UQ9A 2EPNA 1I75A 2Y8KA 3A4AA 2X05A 1CDGA 2J8FA 1VBUA 2J7FA 4PMZA 3ARYA 2UY4A 1NWTA 2OSYA 2ZX7A 2BY1A 5E70A 1DEDA 3SURA 1C7TA 3OA5A 3WFLA 4CCDA 4JFWA 4FLRA 3GH5A 3VVGA 3T2QA 1HKKA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3UEQ A;  2VZV A;  4D6J A;  5JBD A;  2AMG A;  5I77 A;  3NSX A;  3WUF A;  1UR2 A;  3DYM A;  2G3M A;  1US2 A;  1KXT A;  3AMC A;  5BRP A;  2YBU A;  2CYG A;  1J0Z A;  4F9J A;  4URI A;  3N9K A;  2YL6 A;  3W25 A;  4E4P A;  4B3L A;  1UUQ A;  3I3E A;  1QI4 A;  4BZY A;  3B9E A;  3K8L A;  1NQ6 A;  4AZ7 A;  3DHP A;  4H2C A;  4KH2 A;  5CLT A;  1TVP A;  3MMW A;  2JF6 A;  2O9R A;  2DIE A;  3CUF A;  1UWR A;  1CYG A;  4E8C A;  4BF7 A;  1V3M A;  5EMY A;  4CN1 A;  2XHY A;  4B16 A;  2JEQ A;  4D6G A;  4GO9 A;  2XVN A;  1V3J A;  4OIF A;  5CZK A;  4A3H A;  1W1Y A;  4TOQ A;  1E4L A;  4GI9 A;  4WKH A;  1J0J A;  3WF4 A;  2JAL A;  3DYO A;  4GQQ A;  1V0K A;  3U7B A;  3WD0 A;  2CES A;  2WYS A;  2ZUT A;  4H8U A;  1C8Y A;  4JFV A;  3LPF A;  2XM1 A;  3NIY A;  3WUB A;  7A3H A;  1NOW A;  5A6B D;  3T0D A;  2DSW A;  2GK1 A;  2JE8 A;  3ARS A;  3CIV A;  1KR0 A;  2J4G A;  1GVI A;  4XB3 A;  3WDI A;  3LMY A;  4U2Z A;  4MDP A;  5BYW A;  4J3X A;  1EO5 A;  4FK9 A;  2G8Z A;  1JF5 A;  3THD A;  3VIF A;  1TA3 B;  1B90 A;  2BVT A;  2CBJ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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