3ZIZA

Crystal structure of podospora anserina gh5 beta-(1,4)-mannanase
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
345
structure length
345
Chain Sequence
SAKVSGTRFVIDGKTGYFAGTNSYWIGFLTNNRDVDTTLDHIASSGLKILRVWGFNDVNNQPSGNTVWFQRLASSGSQINTGPNGLQRLDYLVRSAETRGIKLIIALVNYWDDFGGMKAYVNAFGGTKESWYTNARAQEQYKRYIQAVVSRYVNSPAIFAWELANEPRCKGCNTNVIFNWATQISDYIRSLDKDHLITLGDEGFGLPGQTTYPYQYGEGTDFVKNLQIKNLDFGTFHMYPGHWGVPTSFGPGWIKDHAAACRAAGKPCLLEEYGYESDRCNVQKGWQQASRELSRDGMSGDLFWQWGDQLSTGQTHNDGFTIYYGSSLATCLVTDHVRAINALPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural and Biochemical Analyses of Glycoside Hydrolase Families 5 and 26 Beta-(1,4)-Mannanases from Podospora Anserina Reveal Differences Upon Manno-Oligosaccharides Catalysis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GH5 ENDO-BETA-1,4-MANNANASE
molecule tags Hydrolase
source organism Podospora anserina
total genus 140
structure length 345
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.2.1.78: Mannan endo-1,4-beta-mannosidase.
pdb deposition date 2013-01-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3zizA00
1TE1A 4WKAA 3T08A 3T2PA 2ZUSA 3AMDA 1JFHA 4AYSA 3WIJA 1LLOA 1GCYA 3VDHA 4D6JA 3WNNA 2E3ZA 1J0YA 2WBGA 1ISZA 1VJSA 1WPCA 4JAWA 4PCSA 3CHCA 1IZJA 1HXJA 3WD4A 2WK2A 2VT0A 1B1YA 3EDEA 3VIIA 1KWGA 2GJRA 3CH9A 3W25A 3WEZA 5BXSA 2XIIA 1GVIA 2IXVA 1JL8A 2GUYA 2YOCA 3UESA 1VB9A 2J7BA 4R5EA 1V3JA 1H49A 3M7SA 1WCGA 3CMJA 2J7DA 3LPPA 3VDBA 3WNMA 4UFMA 5CXPA 5FKYA 4BCEA 2XJ7A 3DHPA 2D0HA 2W67A 5FCZA 4M82A 4UFHA 1CGVA 4HZ6A 4GQRA 1QPKA 5DFAA 4GZEA 4C7DA 4PMVA 1C8XA 3AFBA 1R7OA 2EPKX 3KWXA 1HL9A 2BY2A 5M5DA 4AZ5A 1CENA 3WH8A 1G9HA 2OWWA 4Z2LA 1BHGA 4WSKA 5TD4A 4JKLA 3AQUA 2VR5A 5A2AA 3TONA 1ZBKA 4HA1A 3CZGA 1E73M 3EBVA 3WMSA 2VZUA 2BY0A 4Z2GA 2CITA 1E55A 4PN2A 4MDPA 3WEMA 5CZKA 1CXEA 3DECA 1O7AA 3WH6A 1VIWA 4GZIA 1UR8A 3OGVA 5LA0A 4PTMA 3K1DA 2YLAA 1QI3A 4MNJA 5AYIA 1BYCA 1V02E 3CZKA 3GBEA 1W3HA 3U57A 2CXGA 2XM2A 1KXHA 4UQEA 3T0BA 1EH9A 2DT2A 3BH4A 4W7UA 3L2LA 4D6CA 4UOQA 3AHTA 3O2LA 3SCNA 3ARQA 1G1YA 1LJYA 1UHVA 4HOXA 1JF5A 4DUVA 2J7EA 4GQQA 2Z1SA 1NWUA 3EDDA 5CJ5A 3GNOA 1E9LA 4W87A 3THCA 5EFFA 4EK7A 4BA0A 1GUVA 1D3CA 4E8CA 4UTFA 2FH8A 3BSHA 3L4UA 1UKTA 4U5KA 1OWQA 5I23A 4UZUA 1H3GA 3BAKA 1MFVA 2YIHA 3SCSA 1HN1A 4WSJA 2GJXB 2EPOA 2CERA 1XYFA 4DWSD 1E1FA 5CSYA 3GXIA 4AC1X 1GQJA 4N42A 1PX3A 1B90A 1RP9A 1QI5A 3RJYA 2VURA 4B9YA 2DQXA 3B9AA 2WBKA 4MDOA 2WHKA 4PMZA 3CIVA 1GONA 4D6DA 3AMLA 1JIBA 1MW3A 4W5ZA 1EO5A 3OIHA 2DT0A 3CMGA 3AJ7A 5E0CA 3WEOA 4NZCA 2PF0A 1FH9A 2GJXA 2F61A 3PZUA 4W8BA 2J7GA 2WM0A 4H2CA 3B9DA 2YL8A 2OYMA 1Q6EA 1UR0A 4JFSA 5DT7A 2VC9A 5E09A 1I1XA 4FMVA 2A3EA 1MYRA 1KCLA 2DSZA 1B3VA 1TMQA 3K46A 2O9RA 3VD4A 2VQUA 1JI2A 3WD1A 5CPTA 1ZBCA 1GJWA 1Y7VA 3ARPA 1YHTA 2VZSA 1XCXA 4C7FA 2VRKA 4JIEA 2QLYA 3BAWA 1W1PA 1UD5A 2BHZA 1GORA 4CU6A 5ABHA 3UERA 2DSWA 5FIPA 5DT5A 1V3HA 1GOQA 2DDXA 3POHA 3WNLA 4JFTA 4TVDA 3WSUA 3KEHA 1XD0A 2XIBA 4OIFA 3PZOA 4J3TA 2D20A 1UH4A 7CGTA 3AOFA 2W4XA 2OYLA 1DWGM 3ZT5A 4J3SA 1TVNA 3AXXA 1UR4A 1V02A 4LX4A 1HIZA 3HU7A 2DSVA 3CUHA 3VDCA 3I3DA 1UKPA 1DHKA 5CPQA 3K4AA 3W6MA 2ZX7A 2WVSA 2WVVB 5A2CA 1N82A 2GDUA 3RM4A 3MMUA 5I2UA 3LPGA 5HDRA 2WHMA 2WVTA 1OCQA 4E8DA 2G41A 4P7OA 4P8UA 1E70M 4W8LA 4NRSA 2BFGA 1NM9A 2VZOA 4HZ7A 5GPRA 1PBGA 1UZ4A 1NWRA 3VGEA 3GNPA 1E0VA 3OZOA 4U3CA 2PWGA 3N11A 1JDAA 1HT6A 2YBTA 2WVVA 3W26A 3NJ3A 2FH6A 4PMQA 1OGGA 3AZRA 1NOFA 3AISA 5FOOA 1FP9A 4MB5A 3QHNA 2YA1A 3WUFA 3UR8A 3PZIA 3RILA 3GNRA 4KH2A 2VNCA 4JKKA 4Z2IA 1ZBVA 4Z2KA 4KRTA 2ZXBA 3K4DA 1VBUA 4CN6A 2CESA 6CGTA 4PSRA 3WD0A 3WL0A 4QCEA 1VFFA 2G8ZA 2DEPA 2D3NA 4ZE4A 2AAAA 1US2A 1GZJA 5E6YA 4M8UA 3SEPA 1D2KA 2PWEA 1CGYA 3WDRA 2VRJA 1G5AA 3S2CA 3VOCA 4H41A 3GH4A 4XZWA 3W81A 1FA2A 5BRQA 2BVDA 1FH8A 3WD3A 4ZE5A 3L4TA 2D0GA 1UYQA 1NOWA 5A8MA 1MXGA 3M46A 1QOXA 3TA9A 3WH7A 2RGMA 3WF2A 1JDCA 4MNKA 2WWCA 1J0ZA 1UWQA 1OT2A 4AZ6A 3WUGA 3GH5A 3I3BA 3VPLA 1DWJM 4UFJA 1EDQA 5IHRA 1E6PA 2CPUA 1HKIA 4MAVA 4Y7EA 3NYDA 2GDVA 5CGTA 3W4RA 4LYRA 1PJ9A 3PZMA 2IUZA 3NIYA 3UCQA 4HPHA 3AS0A 1CBGA 4JHZA 5EFDA 4MNLA 3KL5A 1OT1A 3CHDA 2DPEA 2WMJA 5D4YA 1H4PA 2WHLA 2UY5A 4UQDA 4V28A 1CDGA 1ITCA 4XZBA 2DSKA 2FHCA 1VAHA 1ZJBA 1W9BM 2NW0A 1X6LA 2WCGA 3N12A 2BNJA 2CHNA 1XRVA 1OIMA 3ZT6A 4D6EA 1HJQA 2A3BA 3WBAA 3VGHA 4B3KA 2IXUA 4AXNA 4W8AA 4CD7A 2J75A 1KXTA 1P6WA 3WDQA 3JUGA 1CIUA 4DWSB 2JEQA 5D9NA 2D24A 1JI1A 3LPOA 3SCUA 4UFIA 1H2JA 1W2VA 4ZXOA 1H41A 2BS9A 3CUIA 4QLJA 4LGXA 3FXYA 4P7RA 2VCCA 2DH3A 4TUFA 4QDMA 3VINA 1EGZA 3LPFA 4KRUA 2Y8VA 3K8LA 5JUVA 1ODUA 5E9AA 1UWTA 5BYWA 2J25A 3WELA 3ARZA 4P7LA 4OJYA 3OB8A 3VDAA 1G01A 1V6UA 2XFYA 3VMNA 1GOMA 4F66A 1E5JA 1NOUA 3O6AA 3AHZA 4DWSA 1SFSA 1J9YA 3ZQ9A 1JDDA 2UY3A 2GSJA 1XC6A 4AY1A 3W82A 2OSWA 3VIMA 4JKMA 2G3MA 1H09A 3AIWA 2WW5A 3IJ9A 4UQ9A 3N13A 4PMRA 1E3ZA 1WDSA 3CUJA 2VTFA 4AISA 3W27A 2YLLA 1BF2A 3ARWA 3A4AA 1JD7A 4JL1A 3PTKA 3L4YA 1V6VA 4OOUA 4TXEA 1HJWA 1UWIA 5AC4A 1GHSA 3SUUA 3FHAA 4B3LA 4FLSA 3FHQA 4FLQA 3IAQA 3NSXA 1EXPA 4H8UA 1J0KA 4PMNA 1PAMA 2O9OA 1CLVA 1JZ8A 2BVYA 1K9EA 1HP5A 1TG7A 1X1NA 3EDJA 1V3KA 2J47A 3ALFA 4NF7A 2ZUMA 2WC4A 1EQPA 4F8XA 1CPUA 3WF3A 2UY2A 5EMYA 1EDTA 3ZSTA 3WDPP 5JBDA 1CXIA 3BAIA 2WMGA 5HBFA 1E0XA 3WQ5A 1IT0A 1R7AA 4UQBA 4QAWA 1B30A 3BLKA 3ARRA 3L4VA 2WSPA 2XG9A 1WZAA 3T0AA 3EYPA 5IXEA 2VQTA 4HPGA 5A6KA 2C0HA 2XVPA 1XSKA 2J7HA 3PN8A 1W9DM 2UWFA 1ITXA 2VR4A 3OA5A 5D8ZA 2J7FA 1CZ1A 4UQAA 3CZEA 2JEPA 2YBUA 4BF7A 2XWDA 1VEPA 3D5HA 1JFXA 4PSPA 1XH0A 3VIGA 4MJ4A 2FGLA 1LWJA 5JBFA 1LWHA 4UNIA 3RMEA 3CPUA 1BYAA 4LPCA 1PZ3A 4X0VA 2YL6A 3VU2A 3U7VA 2GK1B 2WZIA 5AYBA 2ZX5A 4M56A 4QLKA 4TX6A 1M53A 2WZEA 3CZLA 2BY3A 3PZTA 1UUQA 4U2YA 2YDSA 3OLEA 1CWYA 1V0KA 2X09A 9CGTA 3AHYA 1E6XM 3VIOA 4WKHA 2J79A 1MWOA 1W1YA 4P8WA 2BHUA 3OLDA 1L8NA 4F9JA 1QW9A 3VD3A 2JF7A 3BLPX 3ZO9A 4D71A 5F7UA 1VEOA 4WKFA 2QMKA 2GK1A 1I75A 3PZ9A 4UOJA 3WENA 1E0WA 3N9KA 4R27A 2GVYA 1J11A 1WZLA 1DWIM 3O9NA 1JYXA 1FOBA 1ZL1A 2CEQA 4OZOA 2CBJA 3AIQA 1G94A 2W5FA 4Q22A 5BXTA 1QBBA 1TCMA 1V03A 4AD3A 1SMAA 1JXJA 4WF7A 3AZTA 1C8YA 2E9MA 4CVUA 2DSUA 7A3HA 4TVUA 2XHYA 3PTMA 1AQ0A 3QGVA 2ZOXA 1F4HA 3OGRA 5A8PA 3VIHA 4HA4A 3T2QA 2XVNA 2PWHA 1B31A 1KB3A 3SURA 3WFLA 3GH7A 3GXFA 1PIGA 4CUCA 1NP0A 1KQZA 2XFFA 4AIEA 4AD4A 4XB3A 3T09A 2VUYA 1QNOA 1LL6A 4W88A 2WZHA 1MQPA 3L4XA 5KEZA 2QMJA 2FGZA 3CLWA 1K9TA 2WKGA 2AOSA 2CBIA 4W84A 5HPOA 2BV9A 2GJPA 3IJ8A 1UG6A 2WXDM 1WE5A 4URIA 3UETA 4TTUA 3WMBA 3VKKA 3BMVA 4HOWA 4TX8A 2EQDA 2JFEX 4UOZA 1KFWA 4TOQA 2ZUWA 3AICA 3IAPA 3SCPA 3SCQA 5GQBA 4AZ7A 2VVNA 5GNYA 1WDRA 2WANA 2QPUA 4W7WA 1U2YA 1HJSA 1PX4A 5JIWA 3A4XA 1QHOA 4HMEA 2X1IA 3VNYA 3BAXA 3QHMA 1V0LA 2WLYA 2EEXA 2OWXA 4HP5A 5AC5A 4AMCA 2VX6A 1H1NA 1CXLA 5CPSA 5JBEA 3TTSA 2X0HA 1HVQA 2D23A 3L4WA 4ACYA 4AW7A 1V6WA 3WDHA 1W2PA 1GQKA 5IFPA 1CGWA 1JYWA 1AQMA 3MMDA 1W9VA 5EB8A 4MTVA 3ZOAA 4AD1A 2CKRA 2QV4A 1CXFA 4EE9A 5A8NA 4PTWA 5IHSA 4LQ1A 3WNPA 1QVBA 2ZX6A 4BS0A 1E4NA 4CD8A 5A6MA 4B16A 1W9XA 5I6SA 3CBWA 1MQQA 1HVXA 4NI3A 1E40A 4AEFA 4S3JA 4FK9A 1BG9A 1WO2A 4JCMA 2EJ1A 4Z2JA 8A3HA 2Y4SA 2V38A 3LMYA 2G4FA 3WUBA 4W93A 3CHEA 1E56A 1KGUA 1ZU8A 1OINA 2EPNA 5FD0A 3F5JA 5CSUA 1B2YA 4PTXA 1V6YA 2QF8A 2J8FA 1R87A 1RD6A 1C90A 5E70A 1B3XA 2EPMX 2YL9A 5IFTA 3OLIA 5A94A 4ZXLA 3DHUA 2WSKA 1J0HA 3SUVA 1E71M 1JZ6A 1UR2A 1BFNA 2CIPA 3ZR5A 1B3WA 5HPCA 2VL4A 2W92A 4Q7NA 4NSBA 3VD7A 2E8YA 1GOWA 1E5NA 4PBGA 2ZIDA 3WF0A 4H7VA 2XVLA 1A47A 3N15A 4GI9A 3AHXA 1DWHM 2OSXA 3AI0A 4QFUA 1W1TA 5A6LA 3HN3A 1OD0A 3MKKA 3VO0A 1E6QM 3VX0A 1MVYA 1UD8A 1V0NA 2X05A 4U2ZA 1XH1A 1LG1A 3BAYA 1HX0A 2Y2WA 1E72M 1R86A 1XYZA 1B0IA 2WCSA 3FN9A 1GNXA 1F4AA 1XSIA 1H0IA 3W6LA 1FP8A 3VILA 3IANA 1LQ0A 4YHEA 2CYGA 2WB5A 1VENA 2VCBA 4P8XA 4PMOA 1ZBWA 4D6GA 3A47A 3MSGA 4PEEA 2J78A 1US3A 1EIBA 3MV11 4RE3A 5BWFA 1C3FA 1UD2A 1NWSA 1NWTA 4MB1A 5ABGA 2V3EA 4LYPA 1HF6A 4JFUA 3EMCA 1LF1A 4AZIA 1XH2A 3G6LA 2JE8A 1J01A 3B8SA 3AXHA 3VD5A 2HVMA 1EOKA 4PMDA 3SUTA 3UG3A 4CCCA 2ZICA 4ZFMA 4OBRA 1QHZA 5E6ZA 3ZJKA 4D1IA 2VZTA 3RM8A 1JNDA 2G3IA 1QNRA 2DIJA 3N1AA 3UR7A 3U5UA 4OKDA 3NDZA 3U7BA 1DWAM 3MANA 4J3VA 2VVSA 4OOZA 3RCNA 1WAWA 1JYNA 3WDIA 2WYSA 3AIEA 7TAAA 2BY1A 3GXDA 4AZGA 4ZEPA 4H8VA 3ZR6A 3G6MA 4ML4A 3WF4A 3VGGA 4M81A 1LL7A 4JHOA 1VBRA 1W9UA 2YKKA 3ARUA 4W7VA 3SUWA 1O6IA 3UG4A 4H04A 5I5RA 2ZUTA 5CGMA 4PRWA 4ATDA 4A3HA 4BQ2A 1UD3A 3AYSA 3WQ6A 3AZSA 1ZJAA 2E0PA 2E9LA 3GYCA 5M3WA 1RPKA 3MS8A 5D9MA 5HXMA 4FLRA 3ARTA 3OLGA 4PUEA 1SYTA 1BSIA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1TE1 A;  4WKA A;  3T08 A;  3T2P A;  2ZUS A;  3AMD A;  1JFH A;  4AYS A;  3WIJ A;  1LLO A;  1GCY A;  3VDH A;  4D6J A;  3WNN A;  2E3Z A;  1J0Y A;  2WBG A;  1ISZ A;  1VJS A;  1WPC A;  4JAW A;  4PCS A;  3CHC A;  1IZJ A;  1HXJ A;  3WD4 A;  2WK2 A;  2VT0 A;  1B1Y A;  3EDE A;  3VII A;  1KWG A;  2GJR A;  3CH9 A;  3W25 A;  3WEZ A;  5BXS A;  2XII A;  1GVI A;  2IXV A;  1JL8 A;  2GUY A;  2YOC A;  3UES A;  1VB9 A;  2J7B A;  4R5E A;  1V3J A;  1H49 A;  3M7S A;  1WCG A;  3CMJ A;  2J7D A;  3LPP A;  3VDB A;  3WNM A;  4UFM A;  5CXP A;  5FKY A;  4BCE A;  2XJ7 A;  3DHP A;  2D0H A;  2W67 A;  5FCZ A;  4M82 A;  4UFH A;  1CGV A;  4HZ6 A;  4GQR A;  1QPK A;  5DFA A;  4GZE A;  4C7D A;  4PMV A;  1C8X A;  3AFB A;  1R7O A;  2EPK X;  3KWX A;  1HL9 A;  2BY2 A;  5M5D A;  4AZ5 A;  1CEN A;  3WH8 A;  1G9H A;  2OWW A;  4Z2L A;  1BHG A;  4WSK A;  5TD4 A;  4JKL A;  3AQU A;  2VR5 A;  5A2A A;  3TON A;  1ZBK A;  4HA1 A;  3CZG A;  1E73 M;  3EBV A;  3WMS A;  2VZU A;  2BY0 A;  4Z2G A;  2CIT A;  1E55 A;  4PN2 A;  4MDP A;  3WEM A;  5CZK A;  1CXE A;  3DEC A;  1O7A A;  3WH6 A;  1VIW A;  4GZI A;  1UR8 A;  3OGV A;  5LA0 A;  4PTM A;  3K1D A;  2YLA A;  1QI3 A;  4MNJ A;  5AYI A;  1BYC A;  1V02 E;  3CZK A;  3GBE A;  1W3H A;  3U57 A;  2CXG A;  2XM2 A;  1KXH A;  4UQE A;  3T0B A;  1EH9 A;  2DT2 A;  3BH4 A;  4W7U A;  3L2L A;  4D6C A;  4UOQ A;  3AHT A;  3O2L A;  3SCN A;  3ARQ A;  1G1Y A;  1LJY A;  1UHV A;  4HOX A;  1JF5 A;  4DUV A;  2J7E A;  4GQQ A;  2Z1S A;  1NWU A;  3EDD A;  5CJ5 A;  3GNO A;  1E9L A;  4W87 A;  3THC A;  5EFF A;  4EK7 A;  4BA0 A;  1GUV A;  1D3C A;  4E8C A;  4UTF A;  2FH8 A;  3BSH A;  3L4U A;  1UKT A;  4U5K A;  1OWQ A;  5I23 A;  4UZU A;  1H3G A;  3BAK A;  1MFV A;  2YIH A;  3SCS A;  1HN1 A;  4WSJ A;  2GJX B;  2EPO A;  2CER A;  1XYF A;  4DWS D;  1E1F A;  5CSY A;  3GXI A;  4AC1 X;  1GQJ A;  4N42 A;  1PX3 A;  1B90 A;  1RP9 A;  1QI5 A;  3RJY A;  2VUR A;  4B9Y A;  2DQX A;  3B9A A;  2WBK A;  4MDO A;  2WHK A;  4PMZ A;  3CIV A;  1GON A;  4D6D A;  3AML A;  1JIB A;  1MW3 A;  4W5Z A;  1EO5 A;  3OIH A;  2DT0 A;  3CMG A;  3AJ7 A;  5E0C A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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