1KQZA

Hevamine mutant d125a/e127a/y183f in complex with tetra-nag
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
273
structure length
273
Chain Sequence
GGIAIYWGQNGNEGTLTQTCSTRKYSYVNIAFLNKFGNGQTPQINLAGHCNPAAGGCTIVSNGIRSCQIQGIKVMLSLGGGIGSYTLASQADAKNVADYLWNNFLGGKSSSRPLGDAVLDGIDFAIAHGSTLYWDDLARYLSAYSKQGKKVYLTAAPQCPFPDRYLGTALNTGLFDYVWVQFFNNPPCQYSSGNINNIINSWNRWTTSINAGKIFLGLPAAPEAAGSGYVPPDVLISRILPEIKKSPKYGGVMLWSKFYDDKNGYSSSILDSV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Hevea brasiliensis
publication title Expression and Characterization of Active Site Mutants of Hevamine, a Chitinase from the Rubber Tree Hevea brasiliensis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Hevamine A
total genus 98
structure length 273
sequence length 273
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2002-01-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1kqzA00
1JD9A 3BLPX 3SCNA 1HJVA 1NP0A 4M8UA 1OIMA 1K9TA 4D6FA 1HJSA 1WZMA 2ZUNA 2J8FA 1E0WA 3ZJ6A 5M3WA 2GDVA 2DSKA 3WIJA 3NUKA 1MW1A 3OG2A 5HXMA 3I3EA 2GJRA 2VUYA 3B9AA 3SCPA 4UCFA 4CN4A 3KZSA 2VCCA 4CD5A 1XYFA 1PEZA 2EPOA 5C8BB 2W63A 4AY1A 4LXFA 2D0GA 2XVKA 3ARPA 4OBSA 4QLLA 2WB5A 4Q7NA 3VD5A 3N15A 1ISZA 3KE0A 2VTFA 3N9KA 2VRKA 1L8NA 2ZX5A 5IFPA 1VJSA 3EBVA 1VFFA 3K8KA 4H41A 3ZMRA 1KXQA 1UR9A 4V28A 3VNYA 1G01A 2WW5A 4ZE5A 4J27A 2XGIA 1UH2A 2YL5A 2ZUTA 3VGHA 4J7RA 1SFSA 2CITA 1YQ2A 2DT0A 1CECA 2PBOA 3RM8A 2WWCA 2WVSA 1VAHA 4YN5A 1UD2A 4AW7A 1WKYA 2WSKA 5HPCA 3ZO9A 3LPPA 1WO2A 2D22A 1HJWA 3AS2A 3LMYA 1HJQA 4PCTA 4HA1A 1K6AA 5FCZA 2CESA 3BAJA 5HDRA 1UWSA 1V3LA 5I79A 2XG9A 4H8HA 1H4PA 2XVPA 3ARXA 5KEZA 2HVMA 2OYMA 1V02A 2WC3A 1TVNA 1FH7A 5EFFA 4P7LA 1C90A 2QPSA 5CGMA 1W3HA 4W7UA 2E40A 4AZCB 1B3YA 4AISA 3W6MA 2XIBA 3D5HA 3OGRA 7A3HA 1N82A 1TMQA 5JBDA 3BC9A 4MB3A 3SUWA 3ARWA 1DEDA 1FA2A 4EANA 3TP4A 2VO5A 3ZJ7A 1ITCA 5BXRA 2W67A 1L0PA 1C7TA 1TCMA 4IUGA 4PMRA 1WAWA 4J3TA 2G3MA 4HTYA 1M01A 2VRQA 5ECUA 3T2QA 1X1NA 3SCSA 1J18A 5A6AA 5LA1A 4WIWA 2ZIDA 2BXZA 1M53A 5EMYA 5CSYA 1LL4A 2VURA 3DYPA 1BGAA 4LPCA 1B31A 4UQBA 3W53A 3WH8A 3RM4A 3RJYA 3VOCA 4YHEA 1CGVA 3WNPA 3L4UA 3GTNA 2VI0A 1GOKA 3K4DA 2EQDA 5CSUA 2CHNA 3ZM8A 4D72A 3M7SA 3A47A 3M07A 1NOWA 1XSKA 3MUY1 2DH3A 4W88A 2D20A 1Q6CA 3VTRA 4PMUA 1KGXA 3TA9A 1QOXA 1W1YA 2JIWA 5I24A 3WQVA 1VEOA 5LA0A 4GINA 4CN6A 5JBEA 3KL3A 1WB0A 3UG4A 1QI2A 4CD4A 2G3JA 1JI2A 2EEXA 2ZUSA 4H8VA 4WLCA 1NARA 4PSRA 1MWOA 4H7VA 1UR4A 3BMWA 1V3MA 1GOOA 4AIUA 3BSHA 3SCUA 3QOKA 1E4LA 1Q6EA 3W37A 1U2YA 3DYOA 2D3LA 4ATDA 4X0NA 2B31A 4JHZA 4MTVA 5A6JA 4F9DA 1HKIA 1I1WA 3ZJ8A 3CUIA 2ESCA 4UZUA 4D1IA 1V0MA 1JZ4A 4MB4A 3VX0A 3WNLA 3QR3A 1IV8A 5F7UA 2WMIB 3W0KA 4CCCA 3AROA 4CGTA 2WAGA 4PMQA 1JYNA 4S3JA 1JG9A 2F61A 3VINA 1UWRA 3SCTA 1PX4A 2Z1KA 4BQ4A 4QLJA 3SCQA 3DYMA 1UD3A 2RGLA 3AOFA 4KWUA 2W92A 1HJUA 3FW6A 1MFVA 1JDCA 2GDUA 1BHGA 3ECQA 4D6DA 4TOQA 4EKJA 2G41A 2W66A 2W4XA 1IZKA 1LWJA 3IJ9A 1QBBA 3WD3A 2YL6A 1MQQA 3WDHA 7CGTA 3ZT5A 3OB8A 2Y4SA 4D6GA 1M03A 2ZX8A 3WMSA 1C93A 1ISWA 2EPLX 1MYRA 4MNKA 1HL8A 5FL0A 1BYAA 2WMJA 3CUFA 1V0NA 2ZWZA 4UZSA 4AWEA 3HN3A 1ZBWA 3W25A 1OWQA 3BXWA 4U3AA 1I75A 3EMZA 2PC8A 4CU7A 5DEZA 3NYDA 4D6EA 4AEEA 2YLAA 4F9JA 1GONA 1OT2A 3AIUA 3CPUA 2W91A 1GHRA 1BYBA 1VFMA 4KMQA 4AZGA 2BHZA 4IPLA 3TONA 2WANA 3MU7A 2ZXAA 3VVGA 5CPQA 5A1AA 4PTXA 2DH2A 5ABGA 3LPGA 1FHDA 3A4WA 2Y8KA 4TVUA 5I5RA 1X6LA 4P7OA 1JAKA 2PB1A 1H3GA 4W7VA 3UCQA 4M82A 4B3KA 4BQ3A 4PUEA 4CUCA 4TVDA 2FHFA 4J3VA 3B8SA 5JIPA 5FKYA 1DTUA 2WMHA 4E8DA 3L4XA 1XD1A 4LYPA 3WUEA 3K8LA 1UH4A 4E4PA 3GXMA 3GH5A 1E5JA 3BMVA 3SUUA 2WC4A 4URIA 2UY5A 2D24A 1ODZA 3ARTA 2JALA 3BAYA 2QPUA 5DO8A 3VGBA 1B3VA 2VZUA 3EDJA 3ARZA 3QHNA 3AHXA 1KXHA 3HU7A 3FXYA 1G1YA 2JIEA 3AISA 4HP5A 3K8MA 4QFUA 1QI5A 4HA4A 3AXHA 2IXUA 4ACZA 5IHSA 4Z2IA 3VD7A 3RIKA 2ZXBA 4AXNA 4B9YA 3VDBA 4LX4A 3UR8A 3PZOA 3OA5A 1JF5A 4OJYA 2WVTA 2E9MA 1UZ1A 3S6TA 1UD6A 3GM8A 3VDAA 1HL9A 3WQ6A 1W3KA 3EDKA 4UTFA 4AD1A 1EGZA 3VGGA 2D3NA 2D0FA 4L4OA 2YL9A 3GXDA 3DECA 1JI1A 3VILA 1XH0A 5BYWA 4D6CA 2DT2A 4NSBA 1D3CA 3ALFA 3WEOA 1C8YA 3TTQA 1WP6A 2Z1SA 1DP0A 5D9NA 2VX5A 4FLOA 1NOFA 4DWSA 1LLOA 4HU0A 2YA0A 3CZEA 4LQ1A 2XM2A 3M46A 5HPOA 1W9VA 2X1IA 3VGFA 1W91A 2MANA 2PBGA 1W2VA 4UQEA 2AOSA 4GI8A 1UWIA 2BY2A 3AICA 1NWRA 2XVNA 1QPKA 3G6MA 4U31A 1J9YA 2VCAA 3BCFA 2O9PA 1UWQA 1JFXA 1AMYA 1CGYA 1V6XA 2BVTA 4L4PA 1E0VA 1E6ZA 1E6SM 1ISXA 5E9AA 4MNLA 5CPSA 3GYCA 3MSDA 1DHKA 3ARSA 2XFYA 2WMIA 2J4GA 5IXEA 4GQRA 4H2CA 2UWFA 4ZXOA 3PTKA 3WF0A 2V38A 5C70A 4M56A 1XV8A 1W9BM 1R87A 4DUXA 3AIVA 1BVZA 5M17A 4AZIA 1CIUA 5CQ1A 3IJ7A 8A3HA 1Z32X 4ZXLA 1W9PA 4YHGA 4P8VA 1H11A 3FNDA 1UUQA 4W93A 2J7HA 3CZ8A 2VQUA 2V3FA 1PPIA 1E5NA 1NM9A 4TTUA 1UYQA 2F8QA 1EDTA 4FMVA 1NWUA 3SURA 3W28A 1E1FA 4U2ZA 1DWHM 1EA9C 4MNJA 4PSPA 1BGGA 1WZKA 2FGLA 3WY1A 2GJPA 4W8LA 1WDQA 4OOUA 4PTMA 1YHTA 1SMDA 3G6LA 5CLTA 2VOTA 3VIMA 3GZAA 2J7DA 1Q6FA 5A69A 1DWFM 1OM0A 2ZOXA 1HJXA 1X6NA 2WZIA 4W8BA 3IAPA 1V3JA 3BAXA 2ZUUA 2E8ZA 1JDAA 3RILA 4J3XA 4Q22A 1EDGA 4JKLA 1AQMA 4U5KA 2EPNA 1KB3A 3AS0A 7TAAA 5IFTA 4J3UA 3MUIA 3TTOA 1JIBA 1C8XA 5BRPA 2VZVA 1UWTA 2JEPA 1CXLA 2PF0A 4MAVA 5GNZA 1OGSA 2VJXA 3RJXA 4C7DA 4AD3A 5CXPA 1B0IA 2VVNA 4GZIA 1KCLA 1JL8A 1UR0A 3VDCA 3VD4A 4D6IA 2YA1A 4HMDA 1SYTA 4N42A 5HBFA 1LL7A 1QNPA 1UKQA 2QF8A 2CPUA 3LPOA 1B1YA 4GI6A 3SUVA 1UD5A 2EPMX 1MVYA 1XH1A 3CZLA 3PZTA 5EFDA 5AC5A 3AMLA 1CGUA 3QHMA 4FK9A 1W9DM 3NSNA 3GXIA 1E3ZA 3ARUA 5A95A 3EDFA 5FL1A 2BVYA 1XHGA 4RE3A 1K9EA 3GDBA 4MB1A 4J3WA 1V08A 3VIFA 5TD4A 4MJ4A 2YL8A 1XCWA 1GW1A 4M24A 1JZ6A 1CGTA 2J8GA 1TA3A 4UFMA 2PI6A 1V6UA 1M04A 2QLYA 1CNVA 3II1A 1G5AA 3AHTA 5E70A 1GQKA 2NT0A 2QV4A 4OBRA 1CXIA 1W1VA 1HKKA 3AXIA 1MW2A 3MO4A 1FOBA 4KH2A 4ML4A 3WNMA 4C7FA 2WCGA 3APGA 1E6XM 3SIMA 4GZEA 1E15A 1CPUA 3KL0A 5DF0A 1BAGA 1JF6A 1KCKA 2VT0A 3THDA 1E4MM 4R5EA 4OUEA 1PX3A 1E70M 1VFUA 1Q6DA 3J7HA 3HMCA 1QI4A 2V3GA 1BSIA 1RPKA 1WDSA 4Z2KA 5GNXA 2HISA 3AIBA 3HJEA 3CZGA 1WNOA 3AYSA 1KR0A 3RMEA 3CUGA 4KGLA 2CEQA 1FH9A 1ODUA 4PMVA 2YOCA 3N11A 2JFEX 1LWHA 2GJXA 4UQDA 3ZQ9A 1WCGA 4ATLA 1B3WA 1UKSA 4ACZB 3PZNA 2ZXDA 3WF1A 1LL6A 3VNZA 5D9PA 2CCRA 1UZ4A 4PMZA 1LG2A 2EO7A 3WD1A 3WF2A 3O6AA 2Y5EA 5HOSA 4MB5A 4WKFA 1E6NA 2A3EA 4BF7A 3I3BA 1CTNA 3MV01 3U7VA 1EHNA 3MMDA 3KEHA 4GZJA 4RE4A 3CBWA 4WF7A 5CG0A 4PMDA 3ZR5A 4XZWA 1M7XA 2XFFA 2GUYA 1OINA 2WLYA 1JD7A 1GCYA 1EO5A 3WELA 4UFLA 2YDQA 3UR7A 3CMJA 1PJ9A 5E09A 2ZUVA 1D7FA 3RDKA 4DWSB 1CXFA 3U57A 2DEPA 3VKKA 2VQTA 1JZ3A 1W3LA 3WNNA 4HPHA 3GNOA 3W81A 5JBFA 5A2BA 2DSWA 1C3FA 3MMWA 1OBAA 4M1RA 4UFHA 1HP4A 3SCOA 2WVUA 2E9BA 3O2LA 3PN8A 2VZSA 1GQLA 3EDEA 4OKDA 3WDIA 2WXDM 1HXJA 1UD4A 1VBRA 3EYPA 4CU6A 1V02E 4AIEA 1QW8A 1JFHA 3W6LA 2PWFA 4F66A 4OOZA 3AZRA 1GVYA 4QLKA 2G8ZA 1PX8A 2YKKA 1J10A 2YLLA 2WHMA 4F79A 1W2PA 1HKMA 2J47A 4H04A 4HPGA 1OGBA 1UKOA 4KGJA 1A3HA 1J0YA 3AHZA 3VD9A 3WSUA 3MSGA 3T09A 1OCQA 2D23A 5JUVA 4GIAA 1ZJAA 3ZT6A 4TX8A 4CVUA 2WWDA 2WNWA 2X09A 4HZ6A 1TG7A 1W3JA 3WL1A 1OSEA 5FIPA 5A6KA 5C71A 2WYSA 1KBBA 2WCSA 1MW3A 3FY1A 1J12A 3WUGA 1J0HA 1BTCA 2WHLA 4M81A 1DWAM 1E1EA 2ZX7A 2CBIA 3CO4A 3F4VA 4GO9A 4UNIA 4JCLA 5AYBA 4JFTA 5JIWA 4W84A 2E0PA 2C0HA 2V5DA 1CXHA 2VX4A 3L4YA 1PAMA 2BXYA 4TTGA 3VGEA 3VUPA 1GQJA 4ZEPA 1GUVA 3WN6A 2XIIA 3BCDA 1WPCA 4JL1A 2DPEA 2PWDA 1H1NA 2X0YA 2CBJA 3ZSTA 4UOQA 1F4AA 1PIFA 2EPKX 5EBAA 1GJWA 3EMQA 1RP8A 5I2UA 4W5ZA 2E9LA 4AZBA 4QAWA 2J7FA 5E6ZA 3W29A 2ZICA 1QNQA 3CZKA 3F5JA 4W87A 3OLDA 5ABHA 1RD6A 3AFBA 3ALGA 3L2MA 2C8NA 2OSWA 2RGMA 2YBUA 2GFTA 1VEPA 1J0IA 3CUHA 1FP9A 2V5CA 2WHJA 1QHOA 3WEZA 2VZTA 2XSAA 5DFAA 4WSJA 2GSJA 4DUVA 1OGGA 1XCXA 3AIEA 3BSGA 3WMBA 4N0RA 1EQPA 4BQ2A 1UA3A 4HZ7A 5A8NA 3WDPP 1V3IA 4B9ZA 5D8WA 1JNEA 4GPNA 3VIGA 4Z2JA 2XTKA 5BROA 1QW9A 2VR4A 4ZE4A 4AZ5A 4P8UA 1XD0A 3OBAA 1BLIA 1CLXA 3W4RA 3VMOA 3BH4A 2C7FA 2VR5A 1EH9A 4WK9A 1XYZA 2XJ7A 1LQ0A 1Y7VA 1MFUA 3DHUA 4JL2A 3NSXA 4XV0A 3ZSSA 1U30A 4AD4A 1H09A 2PWGA 3UEQA 4PBGA 2BY1A 1E0XA 1BQCA 1H2JA 3UG3A 1J11A 3E1F1 2J7BA 4MPKA 6A3HA 5BXSA 1UR2A 3CHFA 1HX0A 3UETA 1OD0A 1UD8A 1HF6A 1VBUA 1TA3B 4JFVA 1JGIA 3POHA 3RM9A 2BHUA 1VRXA 1IZJA 2V3EA 4U5IA 1VENA 4W5UA 4EE9A 2BVDA 3SUTA 3CHDA 1UA7A 2DGAA 2J74A 3ZT7A 1UR1A 2WHKA 3AMKA 5A6BA 4W86A 3TOPA 4DUWA 3VIKA 4A4AA 2UY3A 1TVPA 3WH5A 3CTTA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1JD9 A;  3BLP X;  3SCN A;  1HJV A;  1NP0 A;  4M8U A;  1OIM A;  1K9T A;  4D6F A;  1HJS A;  1WZM A;  2ZUN A;  2J8F A;  1E0W A;  3ZJ6 A;  5M3W A;  2GDV A;  2DSK A;  3WIJ A;  3NUK A;  1MW1 A;  3OG2 A;  5HXM A;  3I3E A;  2GJR A;  2VUY A;  3B9A A;  3SCP A;  4UCF A;  4CN4 A;  3KZS A;  2VCC A;  4CD5 A;  1XYF A;  1PEZ A;  2EPO A;  5C8B B;  2W63 A;  4AY1 A;  4LXF A;  2D0G A;  2XVK A;  3ARP A;  4OBS A;  4QLL A;  2WB5 A;  4Q7N A;  3VD5 A;  3N15 A;  1ISZ A;  3KE0 A;  2VTF A;  3N9K A;  2VRK A;  1L8N A;  2ZX5 A;  5IFP A;  1VJS A;  3EBV A;  1VFF A;  3K8K A;  4H41 A;  3ZMR A;  1KXQ A;  1UR9 A;  4V28 A;  3VNY A;  1G01 A;  2WW5 A;  4ZE5 A;  4J27 A;  2XGI A;  1UH2 A;  2YL5 A;  2ZUT A;  3VGH A;  4J7R A;  1SFS A;  2CIT A;  1YQ2 A;  2DT0 A;  1CEC A;  2PBO A;  3RM8 A;  2WWC A;  2WVS A;  1VAH A;  4YN5 A;  1UD2 A;  4AW7 A;  1WKY A;  2WSK A;  5HPC A;  3ZO9 A;  3LPP A;  1WO2 A;  2D22 A;  1HJW A;  3AS2 A;  3LMY A;  1HJQ A;  4PCT A;  4HA1 A;  1K6A A;  5FCZ A;  2CES A;  3BAJ A;  5HDR A;  1UWS A;  1V3L A;  5I79 A;  2XG9 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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