2QHAA

From structure to function: insights into the catalytic substrate specificity and thermostability displayed by bacillus subtilis mannanase bcman
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
336
structure length
336
Chain Sequence
HTVSPVNPNAQQTTKTVMNWLAHLPNRTENRVLSGAFGGYSHDTFSMAEADRIRSATGQSPAIYGCDYARGWLETANIEDSIDVSCNSDLMSYWKNGGIPQISLHLANPAFQSGHFKTPITNDQYKKILDSSTAEGKRLNAMLSKIADGLQELENQGVPVLFRPLHEMNGEWFWWGLTSYNQKDNERISLYKQLYKKIYHYMTDTRGLDHLIWVYSPDANRDFKTDFYPGASYVDIVGLDAYFQDAYSINGYDQLTALNKPFAFTEVGPQTANGSFDYSLFINAIKQRYPKTIYFLAWNDEWSPAVNKGASALYHDSWTLNKGEIWNGDSLTPIVE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus subtilis
publication title From Structure to Function: Insights into the Catalytic Substrate Specificity and Thermostability Displayed by Bacillus subtilis Mannanase BCman
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-1,4-mannanase
total genus 128
structure length 336
sequence length 336
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.78: Mannan endo-1,4-beta-mannosidase.
pdb deposition date 2007-07-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02156 Glyco_hydro_26 Glycosyl hydrolase family 26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2qhaA00
1BYDA 2PC8A 1GQLA 1XCXA 4P7OA 2WYSA 3ARSA 5GNXA 2VQUA 1CIUA 3AJ7A 4D6GA 2E0PA 5M5DA 3AISA 3AOFA 3BC9A 3MS8A 4UZUA 3VGDA 1DHKA 3U5YA 1AVAA 3PZIA 1XC6A 2ZXAA 3VIPA 4OUEA 2Y5EA 4DM2A 1E6ZA 2XIBA 3SUTA 3AZSA 1AMYA 2D22A 5FD0A 3T0BA 1KQYA 1JFHA 1V3MA 1J12A 3VPLA 1D3CA 3RM8A 2VZUA 5BXPA 2W67A 3VUPA 3N04A 4TVCA 2UY3A 2WPGA 1FHLA 3WIJA 1CGTA 1UWUA 2YLAA 4GQQA 2VX4A 3VGGA 5A3HA 1V02E 1ESWA 1TVNA 2G4FA 4MB3A 1W9UA 4TVDA 2CCRA 2BHYA 3FHAA 1GOWA 4B3KA 4IISA 1K9EA 2VL4A 1QHOA 3NCOA 3WN6A 1G1YA 1VJSA 3LPPA 1ISWA 3WNPA 4MTVA 2OYMA 1XYFA 1B9ZA 1WZMA 3MMWA 1HKIA 1WZAA 4BA0A 2YL8A 2D1ZA 1BYCA 2XFRA 4FLRA 4UQ9A 2VOTA 1C3FA 3SCVA 3AQUA 4DWSB 1GNXA 3KE0A 3A3HA 1ZJAA 2J78A 5I77A 2FGZA 3DYOA 4Q22A 2OWXA 2CBJA 2WMKA 1GORA 1UWQA 4JHZA 5BWFA 3EDDA 4V27A 1CLVA 1QBBA 2VUYA 4PN2A 1N82A 1Q6DA 5BRPA 1E4NA 3WNMA 1PX4A 1UZ4A 3AZRA 2WM0A 3WY1A 3K8LA 3I3BA 5A1AA 3MSDA 4MNJA 5M3WA 1LWHA 2CETA 4Z2IA 1VBRA 1WAWA 4FF5A 1OWQA 4CCEA 1SR0A 4NRSA 5DEZA 1GOQA 2WNWA 2ZXQA 3WELA 5FL1A 1ZBCA 3ECQA 1WDSA 5A6LA 5KEZA 1J0KA 1HN1A 3ZJ6A 3VIMA 2BHZA 5A2BA 3VIFA 5IFTA 1C93A 2EQDA 1CTNA 3ARZA 3MO4A 2V38A 1O7AA 2ZXDA 3S6TA 3AMCA 2ZX8A 3O6AA 1HJUA 2RGMA 4FK9A 3WUEA 4AZ7A 4LPCA 2VRQA 2VR4A 4MNMA 3GBEA 3AFBA 3GM8A 1E4LA 3SUUA 3EDFA 2J8GA 3WSUA 4FLSA 1GPFA 4D6IA 1V6WA 5HBFA 1E71M 2XWEA 4A4AA 1V6XA 3RCNA 2PWGA 4U33A 4W7WA 4PMXA 1RD6A 4UFHA 1FOBA 4U5IA 4QLLA 3OGVA 2X05A 5A95A 1MQRA 1JL8A 4C7FA 3VD4A 1V3LA 3GBDA 3WF3A 5D9OA 1W1PA 2EEXA 4ZEPA 4CU8A 2QMJA 3N11A 1MYRA 3ZJ8A 3AMLA 3N15A 1ITCA 2E8ZA 3BAYA 3ARXA 3AHZA 3W81A 4PBGA 5A6SA 3WDIA 1E73M 1W1YA 4AZBA 5D8WA 1MW1A 2E3ZA 1OB0A 2BFGA 4AXNA 2W92A 2WWDA 4HU8A 2B31A 1GJWA 5GPRA 4YN5A 5JBEA 3CLWA 1VBUA 4P7LA 1E6QM 1XH0A 1EOMA 1VIWA 5D8ZA 1V6VA 7A3HA 4IUGA 4W8AA 3GYCA 1OSEA 4L4OA 4JFSA 1TZ7A 2D0FA 4AZCB 1IZKA 2EPNA 3VIIA 2XVLA 4H04A 1B3YA 3RJXA 1QHPA 1LG1A 2G3IA 3VX0A 4YHEA 4BS0A 1OGGA 5TD4A 3BAWA 3O2LA 1Q4NX 4J3WA 1OT1A 2VRJA 4DUWA 3PTQA 1BYBA 3IK2A 4D6EA 4RE4A 4GI6A 3QHOA 4Z2HA 1HF6A 2DIEA 4HOWA 1J11A 3J7HA 4TUFA 5DO8A 3BMVA 3VU2A 3BAIA 3QHNA 1A47A 2YL5A 3QHMA 1WE5A 3GXMA 4UZSA 3MMUA 2YDRA 3CHFA 4HA3A 5E09A 2C8NA 3A47A 3GXFA 2BY1A 1JF6A 3TTOA 1XRVA 4PMUA 1QVBA 3RMEA 1HX0A 5LA0A 1Y7VA 1EGZA 3MV01 2E9BA 2CYGA 3WNLA 2YJQA 2WMHA 1JNDA 1PZ2A 5LYRA 5HXMA 2D0HA 2JFEX 4CD4A 2VX7A 2WVVA 4OBRA 4UOJA 3EMQA 1MW3A 2ZWZA 2ZUMA 1NH6A 4B15A 2O9TA 1KXQA 3TONA 4X0NA 1HT6A 3WDHA 1NOFA 1K9FA 2FHFA 4KMQA 3F5KA 3UG5A 4UOZA 2VNCA 1CGUA 5I3DA 1TCMA 4RE2A 3BMWA 1XD0A 5FOOA 3BLPX 2JIEA 3W53A 4ZFMA 2XTKA 3WDJA 4AIEA 4JFUA 4KWUA 4XUYA 2AOSA 1VAHA 1TUXA 4JCMA 1HJXA 4UFIA 1ZU8A 1FA2A 5E6ZA 1LWJA 3UG3A 4Z2KA 4PMVA 1JNEA 1H0IA 4J7RA 1E9LA 2D3NA 1E6PA 4E8DA 1UD2A 3GTNA 2AMGA 1L8NA 3ZT6A 4AIOA 2V5CA 1DEDA 2JF7A 2JF6A 2CHOA 3VGBA 3ZSSA 3THDA 2UY4A 2DT2A 4YPJA 4GO9A 2PBGA 1GONA 5BYWA 2DSZA 3VO0A 1CZ1A 5CGTA 1GOMA 1BQCA 3VMPA 5ABHA 4Q7NA 3CZJA 1M04A 2RGLA 2VQTA 1NOWA 2J8FA 5CPTA 3BXWA 1JZ2A 1QPKA 1U2YA 3T2QA 1B3XA 1EHNA 1UYQA 5DFAA 2OWWA 4BZYA 1PBGA 1JD7A 1RP8A 1VENA 1I75A 2GK1A 3GXDA 2EBNA 1HKJA 4JFTA 5ECUA 3WH7A 4WJXA 3W37A 4TX8A 1J01A 1NOUA 2WANA 1W9VA 2E40A 2YL9A 3N18A 1E15A 2WVSA 4D1IA 1B31A 1W32A 1ECEA 1E1EA 2YIHA 2QV4A 3CUHA 1JXKA 1B3WA 1AQMA 3U5UA 3PBGA 1FH9A 5AC5A 3VINA 3RM9A 1U33A 1S46A 2NSXA 1W3JA 2WMJA 3WQ8A 1JZ4A 2YLLA 4GZIA 3PZOA 1LL6A 1KXHA 1CDGA 3RM4A 3WNKA 5CSUA 1VFMA 1XH1A 3WH6A 1C7TA 3ZT5A 4AZIA 1UD8A 1KR1A 4ZE5A 1NQ6A 3ZR6A 4JL1A 1JGIA 2XGBA 3W25A 2O9OA 4ZXLA 3RDKA 1H09A 3SCTA 1MFVA 3TA9A 5CXPA 2W62A 4GZEA 1GQIA 4D6CA 2J79A 5E9AA 2ZUNA 2PWDA 1V3JA 4UFLA 1GZJA 1V08A 1E55A 3PZNA 1NM9A 3FHQA 4W84A 1CXIA 3CH9A 3PZUA 2VZVA 3WENA 4UQAA 3AMDA 1NWTA 1ZL1A 4HZ7A 3CGTA 3WF2A 2Z1SA 2EPLX 1E6RA 1CXKA 1H4PA 4JFVA 1GOIA 4WSKA 1ZS2A 3UETA 4CUCA 2HISA 1AQ0A 1KR0A 3AMKA 1UH3A 4Z2LA 4BQ3A 4URIA 5EB8A 1TA3A 5AYBA 5BRQA 2OYLA 5CQ1A 3T2OA 2X0YA 4W8LA 1LJYA 1HJWA 3NDZA 3IANA 3WQ6A 1E4IA 2D3LA 2CESA 1WNOA 3AS1A 4HMDA 1GJUA 4DUXA 5EFFA 3LPOA 2DQXA 3K8KA 3CBWA 4TX6A 4WIWA 1UOKA 1PX8A 2YBUA 4E2OA 3B9EA 2VCAA 3ALFA 2AAAA 2W63A 3AYRA 1HP5A 3BCFA 1BFNA 3WMSA 2GJXA 1UKSA 3L4XA 3AZTA 4NZCA 1V3KA 2O9RA 3ALGA 1V0MA 1J0IA 2W91A 2OSWA 1A3HA 3RJYA 1K9TA 5HNNA 1SMAA 1PIGA 2D2OA 4J28A 1DWIM 2EJ1A 1JZ8A 1FH8A 4JAWA 2WWCA 5I5RA 1BSIA 2OSYA 4D72A 3AS2A 4F9JA 2WC7A 2DT3A 2G8ZA 4P8VA 4AD0A 4DWSD 1R87A 1EA9C 3N17A 4KRUA 4QAWA 3MSGA 1KQZA 3F5JA 1J0JA 4D6FA 3SEPA 1QI4A 4GI9A 3WQVA 1OINA 2XM2A 4JCLA 3T0DA 4GZJA 2C7FA 2QPSA 3CUIA 4R5EA 4WF7A 1OBAA 1XSKA 1V6UA 2V3FA 4M1RA 1JDCA 1Q6CA 2W61A 4W93A 5ABEA 4H7VA 1C8XA 2WBKA 1GW1A 3T0AA 1J18A 1UR0A 2YOCA 1JXJA 2CBVA 1GCYA 5IFPA 3SIMA 1CECA 4UR9A 3FNDA 4J3SA 5A8OA 4LGXA 4HMEA 1UH4A 3AIUA 3WL0A 1RH9A 2JEQA 3UG4A 1Q6FA 3VDHA 1UKOA 4C7DA 2GSJA 2QHAA 4MAZA 4MPKA 3ZJKA 3CHDA 1RPKA 4V28A 1E0VA 4PMRA 1WKYA 3SCPA 3T08A 3KWXA 2O9PA 2NT0A 4QLKA 2GJRA 3II1A 1H1NA 2VI0A 4EE9A 1HP4A 1ODUA 3CZ8A 3L4VA 2EPMX 1XYZA 4E4PA 4WLCA 3SCNA 1BVZA 1E3ZA 3AS0A 1GVYA 3FN9A 4U31A 1UHVA 1XD1A 3FXYA 4CCDA 2BY3A 3ZSTA 4RE3A 3M6DA 3ZO9A 1ISXA 2VRKA 2PWEA 4EANA 1BAGA 1CXHA 1H41A 2TAAA 4U3AA 4W7UA 2EXOA 4UTFA 2IXVA 2ZIDA 1ISZA 4WSJA 4D6DA 3SCWA 1JYWA 2QLYA 4W7VA 2XVKA 2F8QA 1K6AA 5CJ5A 4D6JA 3NSNA 1PAMA 1WDQA 2VMFA 3VMNA 3WD4A 4HTYA 1VF8A 2FH8A 2WHMA 1JAKA 4PUDA 5AYIA 1F4AA 4BF7A 3GXIA 3AICA 4PTXA 4AY1A 2WXDM 3ZJ7A 2WMGA 4MAVA 4AISA 2NW0A 1VRXA 1LLOA 2DH2A 4HP5A 3BAXA 1JF5A 3ARTA 1WO2A 3ARUA 1TFVA 4ACZB 3K1DA 2WMIB 3RO8A 2XSAA 4YHGA 1GVIA 5BXSA 3CPUA 4Z2JA 1HXJA 4AZ6A 4W8BA 2A3HA 2FGLA 5IDIA 3K4DA 2J75A 5HDRA 3ZOAA 3FAWA 2WC3A 3BAJA 3HN3A 1DWGM 4PMOA 4IPNB 2E4TA 5AC4A 3UCQA 1UKPA 1D7FA 1US3A 3ZQ9A 2E9MA 2J7FA 1E70M 2C0HA 3W26A 3CZEA 3VD5A 4A3HA 2X1IA 3VDCA 2GFTA 1V3HA 1ZBWA 2J74A 2PI6A 2QF8A 5BXTA 3GZAA 1JZ7A 1E72M 1EQCA 5E0FA 1KGXA 3QGVA 5FKYA 1C8QA 4AEEA 1XHGA 4P7NA 3VDAA 1BTCA 1B0IA 3S2CA 5JIPA 2CKRA 4JKKA 4PTWA 4F9DA 1SYTA 3WDQA 1WDPA 2BV9A 2PBOA 4D1JA 5CLWA 4L4PA 4U2ZA 2WHJA 3VTRA 5CLTA 2PWHA 1G0CA 5ABFB 4TTGA 4MDOA 3W4RA 1QNOA 4PCTA 5DT5A 4KRTA 1KWGA 2WLYA 1BVNP 3OB8A 2WHLA 3L4TA 2OLHA 3EDJA 2D0GA 1KCKA 1KGWA 3I3EA 2ZUVA 1BG9A 3SCUA 2V3DA 2FH6A 4J3TA 1E0WA 1OM0A 2G41A 3L2LA 1UR4A 1X1NA 3PZ9A 2D23A 3BGAA 4BQ2A 3VIGA 5BROA 4HPGA 1UWSA 4HU0A 3U57A 3AS3A 3W24A 4MB5A 1UG6A 2ZWYA 3POHA 4XV0A 3AIWA 1VFOA 1M01A 2VR5A 3L4WA 1MWOA 3G6MA 3VD7A 4B3LA 3WUGA 1WP6A 3AYSA 3AIQA 3SCQA 2A3CA 3GH7A 2WC4A 1TA3B 4DWSA 3VNYA 4CN4A 3M7SA 3CMGA 2WLZA 5IHRA 1OD0A 1HL8A 1NWUA 1QNQA 4U5KA 2FHBA 1UD4A 1XGZA 4B9YA 4OKDA 4JFWA 3W38A 4QCEA 2J25A 1CGVA 5GNZA 3TOPA 2W4XA 2YKKA 3G6LA 4HA4A 4QDMA 4AWEA 5IHSA 5LA1A 3QR3A 1UWTA 4TVUA 3WNNA 1CXEA 2WMFA 5CG0A 1UD6A 2DEPA 1V6YA 1CWYA 1H11A 4GKLA 4PSPA 3B9DA 1UUQA 1TR1A 2VO5A 3WBEA 1J0ZA 2Y24A 1VEMA 5E70A 2IUZA 1W3HA 3WF1A 4PEEA 1ITXA 5IXEA 5A6KA 1KBBA 4AW7A 4B9ZA 2DH3A 6A3HA 2EPOA 5A6AA 3W6MA 3PZTA 4PSRA 2WW5A 4ZENA 4DWSC 1TVPA 4TTUA 4OIFA 4UFJA 4M8UA 3PZGA 2CHNA 1GHSA 1EDTA 1EHAA 1I1XA 3N9KA 4HZ8A 5C70A 3D3AA 3WH8A 4QCFA 2VVSA 1VFUA 4P7QA 4W89A 8CGTA 1F4HA 3PTMA 3HU7A 5I0DA 3B9AA 3OZPA 3L4YA 3WEOA 3DC0A 4W5ZA 4A3YA 4CVWA 1JDAA 2YDSA 4LX4A 5A8QA 2DPEA 3OLIA 3N1AA 4GIAA 1V0LA 2BVDA 4JZ5A 5D4YA 2DSWA 3AIVA 3FAXA 2J77A 1B2YA 4W5UA 1LL7A 4ACYA 2ZE0A 1GQJA 1UR8A 4FLOA 1IV8A 4UQBA 3WKZA 2BS9A 5HPCA 1J10A 1W3KA 3RIKA 3CUFA 3KL5A 5ABGA 4PYSA 3A4AA 2PB1A 4BCEA 2VZSA 2J7HA 3CIVA 1XV8A 2V5DA 5DMYA 3W28A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1BYD A;  2PC8 A;  1GQL A;  1XCX A;  4P7O A;  2WYS A;  3ARS A;  5GNX A;  2VQU A;  1CIU A;  3AJ7 A;  4D6G A;  2E0P A;  5M5D A;  3AIS A;  3AOF A;  3BC9 A;  3MS8 A;  4UZU A;  3VGD A;  1DHK A;  3U5Y A;  1AVA A;  3PZI A;  1XC6 A;  2ZXA A;  3VIP A;  4OUE A;  2Y5E A;  4DM2 A;  1E6Z A;  2XIB A;  3SUT A;  3AZS A;  1AMY A;  2D22 A;  5FD0 A;  3T0B A;  1KQY A;  1JFH A;  1V3M A;  1J12 A;  3VPL A;  1D3C A;  3RM8 A;  2VZU A;  5BXP A;  2W67 A;  3VUP A;  3N04 A;  4TVC A;  2UY3 A;  2WPG A;  1FHL A;  3WIJ A;  1CGT A;  1UWU A;  2YLA A;  4GQQ A;  2VX4 A;  3VGG A;  5A3H A;  1V02 E;  1ESW A;  1TVN A;  2G4F A;  4MB3 A;  1W9U A;  4TVD A;  2CCR A;  2BHY A;  3FHA A;  1GOW A;  4B3K A;  4IIS A;  1K9E A;  2VL4 A;  1QHO A;  3NCO A;  3WN6 A;  1G1Y A;  1VJS A;  3LPP A;  1ISW A;  3WNP A;  4MTV A;  2OYM A;  1XYF A;  1B9Z A;  1WZM A;  3MMW A;  1HKI A;  1WZA A;  4BA0 A;  2YL8 A;  2D1Z A;  1BYC A;  2XFR A;  4FLR A;  4UQ9 A;  2VOT A;  1C3F A;  3SCV A;  3AQU A;  4DWS B;  1GNX A;  3KE0 A;  3A3H A;  1ZJA A;  2J78 A;  5I77 A;  2FGZ A;  3DYO A;  4Q22 A;  2OWX A;  2CBJ A;  2WMK A;  1GOR A;  1UWQ A;  4JHZ A;  5BWF A;  3EDD A;  4V27 A;  1CLV A;  1QBB A;  2VUY A;  4PN2 A;  1N82 A;  1Q6D A;  5BRP A;  1E4N A;  3WNM A;  1PX4 A;  1UZ4 A;  3AZR A;  2WM0 A;  3WY1 A;  3K8L A;  3I3B A;  5A1A A;  3MSD A;  4MNJ A;  5M3W A;  1LWH A;  2CET A;  4Z2I A;  1VBR A;  1WAW A;  4FF5 A;  1OWQ A;  4CCE A;  1SR0 A;  4NRS A;  5DEZ A;  1GOQ A;  2WNW A;  2ZXQ A;  3WEL A;  5FL1 A;  1ZBC A;  3ECQ A;  1WDS A;  5A6L A;  5KEZ A;  1J0K A;  1HN1 A;  3ZJ6 A;  3VIM A;  2BHZ A;  5A2B A;  3VIF A;  5IFT A;  1C93 A;  2EQD A;  1CTN A;  3ARZ A;  3MO4 A;  2V38 A;  1O7A A;  2ZXD A;  3S6T A;  3AMC A;  2ZX8 A;  3O6A A;  1HJU A;  2RGM A;  4FK9 A;  3WUE A;  4AZ7 A;  4LPC A;  2VRQ A;  2VR4 A;  4MNM A;  3GBE A;  3AFB A;  3GM8 A;  1E4L A;  3SUU A;  3EDF A;  2J8G A;  3WSU A;  4FLS A;  1GPF A;  4D6I A;  1V6W A;  5HBF A;  1E71 M;  2XWE A;  4A4A A;  1V6X A;  3RCN A;  2PWG A;  4U33 A;  4W7W A;  4PMX A;  1RD6 A;  4UFH A;  1FOB A;  4U5I A;  4QLL A;  3OGV A;  2X05 A;  5A95 A;  1MQR A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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