3TSB | Genus

Total Genus 148

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	148
sequence length	490
structure length	490
Chain Sequence	QSNAMWESKFVKEGLTFDDVLLVPAKSDVLPREVSVKTVLSESLQLNIPLISAGMDTVTEADMAIAMARQGGLGIIHKNMSIEQQAEQVDKVKRSESGVISDPFFLTPEHQVYDAEHLMGKYRISGVPVVNNLDERKLVGIITNRDMRFIQDYSIKISDVMTKEQLITAPVGTTLSEAEKILQKYKIEKLPLVDNNGVLQGLITIKDIEKVIEFPNSAKDKQGRLLVGAAVGVTADAMTRIDALVKASVDAIVLDTAHGHSQGVIDKVKEVRAKYPSLNIIAGNVATAEATKALIEAGANVVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQLTAVYDCATEARKHGIPVIADGGIKYSGDMVKALAAGAHVVMLGSMFAGVAESPGETEIYQGRQFKVYRGMGSVGAMEKGSKDRYFQEGNKKLVPEGIEGRVPYKGPLADTVHQLVGGLRAGMGYCGAQDLEFLRENAQFIRMSGAGLLESHPHHVQITKEAPNYS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Bacillus anthracis
publication title	Bacillus anthracis inosine 5'-monophosphate dehydrogenase in action: the first bacterial series of structures of phosphate ion-, substrate-, and product-bound complexes. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase
total genus	148
structure length	490
sequence length	490
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date	2011-09-12

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00478	IMPDH	IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
A	PF00571	CBS	CBS domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3tsbA00

3P7YA 3W7HA 4Z08A 1K8XA 4M6QA 3GNDA 3G22A 4NX0A 2YCEA 1O60A 2J6XA 3M0ZA 3C4UA 4YLWA 1TPUA 5AFDA 3BV4A 4S1FA 2CLLA 1ZFJA 3INPA 1ML1A 2ZRXA 3NL6A 3UWZA 4K8EA 4X3ZA 1ONRA 4X9SA 3GDMA 4C1KA 2X1SA 1EP1A 3LCLA 5K4ZA 1LP6A 2X1UA 3QRHA 2B7PA 5E0KA 3PM6A 1N55A 1XBVA 5D37A 1W54A 1G69A 4XZ9A 6TIMA 3IIPA 2TMDA 2H3BA 5KZEA 1PE1A 4N9BA 2WNNA 4CNOA 2DJLA 4XTDA 4ZL1A 3TXVA 2QCMA 3ELFA 1M6JA 1VC4A 1SZFA 3LTSA 3QW3A 3TAKA 4JNMA 4ADTA 2YGYA 1O5KA 3EEGA 1ALDA 1L9WA 2QEZA 4CNPA 3GLCA 3N34A 4UTMA 5F4XA 2JBMA 1A5SA 2ABAA 4H3DA 4NT0A 1M7PA 3LCHA 2V2CA 4JTEA 3R13A 5HR7A 3CHVA 1FQ0A 4IGHA 2VEIA 1W56A 2QCHA 4TR9A 3ABSA 3TMLA 4K36A 1NVMA 4LRSA 5HWJA 3BLFA 1JQXA 3NQ8A 1MZHA 1PIIA 4O1AA 4BI6A 2C14A 4O1BA 2NUYA 2GVGA 5IBXC 4MY9A 1SW7A 2R14A 2WPBA 4KKXA 2H8ZA 1D9EA 1F76A 1YXCA 4NJGA 4GUIA 1A50A 3W74A 1P5BA 1SU5A 3S1XA 3USBA 3W1UA 2ZBTA 3OIXA 1F6PA 3W7CA 3QPZA 1GEQA 3HO8A 1TCDA 1Y0EA 2Q8ZA 1QO5A 3U2OA 4MVAA 1WX0A 3HQ1A 3QW4B 5KMYA 5G4WA 3NQ7A 4PODA 2D73A 4WOZA 5GVJA 3F1QA 4MLRA 1KM5A 3GAKA 4MY1A 2JKPA 1H1YA 5HINA 3MP3A 2E6FA 1JUKA 2QAPA 3LXBA 3FOKA 3KOFA 1W37A 1FWNA 3TNOA 3IIVA 4BWLC 8TIMA 1TPB1 4RX0A 3NQFA 4U4MA 1EIXA 1RQEA 5AHNA 3TW6A 3NM1A 1R47A 3B0PA 3W2MA 4ZMGA 2Y63A 1MEHA 1JCMP 2TPSA 4NZFA 3W2KA 4Z1AA 3NQVA 1AMKA 3A5FA 4IMEA 4NX5A 3PB2A 4ZQNA 3O6DA 3OVPA 5FF3A 2QJIA 1ME7A 1F2JA 2E5CA 1N7KA 1IXPA 3VCRA 5EL1A 2X16A 4N02A 3W7JA 4XBSA 1VR6A 4AEOA 1Q6LA 4ICNA 3IGSA 3C56A 2ISSA 5DBTA 3PBWA 4BI7A 2JK2A 1M7OA 1XBZA 3CU2A 3ZFHA 4DXVA 1R30A 4RZ4A 1SZEA 1ICSA 1KM6A 3FYPA 1O94A 3M1ZA 2VFEA 1S5WA 3EWBX 3EXTA 4UTJA 3M9YA 2C0AA 1I2QA 3VE7A 4N4PA 3M43A 3R12A 4MYAA 3B0UX 4IMGA 1OFEA 1F5ZA 4JYEA 1HFBA 3FS2A 5K9DA 2HMCA 5F4SA 4TMCA 3C0JA 4O11A 3W71A 1DHPA 2FPVA 2PRLA 3DKLA 2PCQA 4Q32A 3O07A 3W6YA 5G1TA 4S2CA 4CNNA 4QSHA 4TO8A 4O18A 4MKNA 3DFSA 2ATSA 4M7SA 2ZTJA 3HGRA 4RXFA 1FWTA 4O1DA 4LVBA 3E9AA 4R53A 3P62A 2E6DA 5I3FA 4BR1A 4RZ6A 4MJMA 3LTYA 1FX6A 4NJJA 4HNVA 3ATZA 1E51A 2NX9A 3P74A 4UFKA 1QMLA 1YXYA 4K8HA 3QMTA 2WV8A 1TV7A 1VCGA 1I4NA 3GYEA 3TX9A 2CLEA 5D04C 5EKYA 3NL5A 3BVJA 3MHGA 4LUIA 4ORMA 2V0TA 4YXGA 1AW2A 1OK4A 2RHGA 4IXHA 4EOUA 5DCDA 3TUUA 1KFEA 4WOQA 3LGEA 3UWUA 1XUUA 5DELA 2VELA 4M19A 3CC1A 4JTTA 3B05A 3L5AA 3MBDA 5AYZA 4FNQA 1SO4A 2A1YA 1TIMA 3TSMA 5AC6A 1DL3A 1FY6A 3NPWA 4TX9A 3BGJA 3W7OA 5DCEA 1T96A 5CGQA 3S0CA 2V30A 2CLOA 4MFEA 2Y7EA 1VRDA 2NXHA 1QPNA 2O7QA 3KRZA 4ZQRA 2C1HA 3G1XA 3MO7A 5D05A 1EB3A 3UPBA 1TJRA 3EWWA 3W7MA 4IXXA 1GG1A 4JXCA 3W83A 4PC8A 3IVUA 1SZGA 1RZMA 4JDYA 1JCJA 1XDMA 5G5IA 1X1OA 1WQ5A 2OZ0A 1YTEA 2C18A 4GBUA 2VEMA 3LI0A 2J27A 3SY5A 4O0ZA 4ADUA 3NVTA 3G1AA 5EPDA 2RDTA 1VCFA 4RR4A 3GKAA 3M5XA 1PCKA 4DPQA 4UIOA 3TJXA 5FF0A 2JGYA 1KW1A 3SW6A 3FEMA 4FNSA 4QQ3A 4UXDA 5K9CA 1LLWA 1D3GA 4I7VA 4LV9A 2Z1BA 3WK1A 4JGDA 4G1KA 1OFAA 2FDSA 3H53A 4O10A 3STEA 3T40A 3UWYA 3UQNA 3RLVA 1GQNA 2ZRWA 2OT0A 2A85A 1UB3A 5K2ZA 1YTDA 2V5LA 1C9DA 3Q58A 2E6YA 1KM3A 3VFLA 2AGKA 3QM3A 3U6WA 3W2LA 3CQ0A 1W3IA 5F1VA 4M5PA 3ZWSA 3KFTA 4O12A 3OBKA 4RV8A 1VCVA 3BW4A 1NSJA 5L6UA 1OX4B 2O7SA 3PBVA 2Q3OA 3W9ZA 1B57A 4HSOA 1FWWA 2ZQ0A 1EWEA 2JKEA 2ZRVA 4JTKA 4KFPA 1H50A 1DQXA 5EY5A 2A7PA 5HWMA 3IIXA 3TQKA 1S5TA 3NR0A 2VEPA 5D03A 5CKSA 5AB3A 5LSMA 1H60A 3CWNA 3HB9A 4FNRA 4HKPA 5C2XA 3W7QA 5D2WA 1RVGA 3LXCA 5U4NA 5C5YA 2H6RA 1W1ZA 3LERA 3UD6A 3OVQA 4EF8A 3I7SA 1IXOA 1S3HA 3OHIA 3W1LA 3L9CA 2EHHA 3PS7A 3STGA 2B7NA 2WSYA 3TE9A 2QDHA 3L0KA 2C13A 3E96A 1U83A 1A5BA 1OF8A 3L5MA 3QMSA 2Z2UA 1A5CA 1Q6QA 4FX6M 2ZRZA 1O95A 4UR7A 2VEKA 4JY8A 4AF0B 4JY9A 1GWJA 1QOPA 1ZY9A 3UYCA 3NG3A 1Q3NA 3T78A 1LOLA 1VYSX 3W86A 2XN0A 2CLMA 4ZQMA 1IIGA 1TRIA 1MEWA 3LHVA 3TU9A 1T8XA 1LRTA 3P82A 2QR6A 1H7PA 5K7JA 4HPJA 3W23A 1ME8A 4LTSA 3GDLA 1JR1A 1J2WA 2WO5A 1VYRA 4JTHA 1L6SA 1N8FA 2IQTA 3NEVA 5A5WA 1Z41A 5I3IA 2G95A 5I3HA 1THFD 1W0MA 4MZ8A 2PURA 4XKYB 4DF1A 3NQ2A 4IUOA 5BW6A 4W9TA 3DI1A 3R8RA 3UNDA 3A21A 2LLEA 5CPNA 1RQHA 3QFEA 1B9BA 5E1QA 2YXGA 1OHLA 3G0SA 4QIUA 1JCLA 3ANYA 1WBHA 4DQWA 1KFKA 4FX8A 3LDVA 1SUXA 1FCBA 1WV2A 3BG3A 2FB2A 3W7NA 2F7FA 4O54A 3LLDA 1F73A 4PFMA 5DY2A 1KTCA 1WA3A 4N4QA 4BF9A 3DU0A 2HTMA 1OVDA 4YCPA 2B4GA 5TIMA 3W1TA 1RR2A 2GJNA 2P0OA 4DO5A 2Y7FA 5BNKA 5LNWA 4IJBA 3HGSA 3W7KA 3Q37A 3JR2A 4LNYA 4PCFA 3UXDA 3N3MA 1V7YA 4IWWA 2Y85A 4O50A 1PHWA 3HIJA 1DJQA 4MIMA 3N73A 1FXQA 1VQTA 3V75A 3IIOA 5K9XA 4GC4A 3M6YA 4IMDA 2X30A 2GPTA 3BLIA 2GOUA 3UZJA 2VFGA 2P10A 3M47A 4PA8A 1W3NA 4FIQA 5FEWA 2AAMA 4UTWA 1LBFA 1FCVA 4N6EA 2BSLA 4E38A 3PAJA 4Q33A 4KFNA 3PY2A 3C6CA 4CCCA 1O5XA 4AWSA 1PVNA 4O14A 2DZTA 3TXZA 3EKZA 3TCEA 3FLUA 2C3ZA 3HOJA 1HO4A 2GVLA 4FNUA 2TRSA 5D2YA 4FEZA 2E09A 4HNNA 3HPZA 3M16A 3MWAA 1H7XA 3NQMA 3ABQA 3NO5A 2ALDA 2CLFA 4FHAA 5T26A 3SI9A 4XUGA 4NJIA 3VI2A 3Q94A 1P4CA 3DHFA 1YADA 5I3GA 2ZFAA 4MUZA 4RLIA 1KM2A 1UUOA 4Z1CA 3LTPA 2ZZ3A 3IGUA 1KFJA 1W31A 3W1PA 3BG9A 3TH6A 1OX4A 2ZZ1A 3P60A 1TQJA 3NQGA 3GK0A 5LNVA 3N2XA 4IX0A 4NXKA 1LBLA 2E5BA 3I65A 4RZ5A 2DORA 2GVJA 5DCBA 1ZCOA 4RK8A 1ZALA 3THAA 1T0OA 1VGAA 1XKYA 5DN1A 4TU1A 3MW7A 4QJ1A 3P61A 3GNNA 5CG7A 3E02A 1HO1A 4WUIA 1PL9A 3M5YA 1NFBA 4X2RA 5EA9A 2I9EA 3TDFA 3DZ1A 1UASA 4O19A 3FIGA 1QPOA 5AC7A 1OYAA 2DZWA 3QH2A 3AJXA 3PR2A 3LHTA 4DEFA 3CIWA 3LX9A 3HG2A 1BEUA 4QAIA 3MYPA 4O0KA 3W1QA 2V2HA 4O52A 3QZEA 3DGRA 3B4UA 3KHJA 1IXQA 1RPXA 2YZRA 1BWLA 3IRDA 2F84A 4JX6A 3L67A 4H6KA 1QOQA 3SZ8A 4U28A 4LY8A 1R2RA 4WJEA 3MI6A 3PB0A 4Y8FA 4OV4A 1TTIA 2QJHA 3LI1A 1AG1O 4MY8A 2A7RA 1VPXA 4GUFA 3DAQA 5HMSA 3S1UA 3E0IA 1TMHA 3G8RA 3TQ0A 5HULA 1Q6OA 1L6YA 4XBKA 2G97A 1Z42A 1C29A 4FX7A 3W1NA 3W87A 5CPLA 2ISVA 3CWOX 3EWYA 3QJAA 4NNCA 1T99A 1SR9A 3I68A 4AHPA 1AK5A 2FFCA 4L4LA 4OV9A 3L0GA 4OHQA 1ME9A 3TKFA 2W79A 2NV1A 4FIRA 3HGOA 3K30A 5HQEA 2E68A 2WKJA 4O15A 1LM1A 3WK0A 2CFFA 3HG5A 2E5DA 4E2DA 4OWGA 3N14A 4CQ8A 1TPDA 3QEZA 3LV6A 5FF2A 3M41A 2GUUA 5HWNA 3S1VA 2A4AA 3LHYA 1EUAA 2QCDB 3LCGA 4L4MA 2R94A 1TPEA 3LXAA 4UTLA 1SZNA 2A2IA 3LOTA 3OVRA 3TC6A 1X7FA 3CB8A 1SSGA 1VHNA 1X1ZA 2QAFA 2VENA 4RJEA 1EA0A 1FDZA 2Y89A 1B4EA 1K7FA 2Y62A 3IVSA 4X22A 4YL2A 1KBIA 1VS1A 5L9FA 1LDCA 1TPFA 3BG5A 3CTLA 3SGUA 1TRDA 4JD4A 1OX6A 3NQCA 4AB4A 2NXGA 1W5OA 1KA9F 4AWUA 3NYZA 3T7VA 4Y6GA 3GR7A 2C6QA 3W3OA 3QSRA 1UCWA 1XBYA 5DLCA 3TK7A 2EKCA 5CSSA 2Y6ZA 2NUWA 5AHIA 3LRKA 4UFJA 4GUJA 5LNSA 3OEXA 1PCWA 4LC8A 1OFRA 2YYUA 4UTWC 1K3UA 3NQEA 1H5YA 1SO5A 3G0UA 5HR6A 5HNRA 3IEBA 1SO3A 1ZAIA 5FEXA 4EF9A 3WJSA 3LB0A 2NUXA 3PVFA 3W84A 3P81A 3HGJA 1SO6A 2QUVA 3NZRA 3PBUA 1G4TA 1ZNNA 3L5LA 2V9DA 4TMBA 3CLMA 1I2OA 1GT8A 4Q4KA 4JTFA 3LCWA 2RDWA 3BO9A 2W6RA 1L6WA 2WSQA 5FI8A 2EPHA 3W7PA 4Z1DA 4IOTA 4M6PA 3STFA 1F7BA 3S9YA 4DBDA 2A5HA 5HUPA 1VLWA 2YW3A 1DVJA 4A22A 1L2UA 3DFQA 3LV5A 3LHZA 3DBPA 4K37A 3TC7A 1OABA 3MI2A 1FXPA 3LCXA 2H3DA 5F4WA 4JTUA 1PHQA 2I14A 4OQVA 5DXYA 5I3KA 3W76A 1A53A 4UTIA 3MYOA 4DELA 4OBTA 1TB3A 1XI3A 3W1XA 1GVFA 1Z48A 3IIZA 4MYXA 4K39A 1TPC1 3KXQA 1MSSA 3R5EA 2EAWA 4UNLA 4UMAA 4HNUA 4A3UA 2EGZA 3DFNA 4N2YA 3I7RA 4PL2A 1X8FA 4ONVA 5AHLA 4QM1A 3TAOA 1I2PA 4J9JA 2BXVA 1VH7A 2RKXA 2XFWA 4O8RA 2OCZA 3H55A 1OJXA 5F2GA 2B7OA 4JS3A 5EBUA 7TIMA 3M5ZA 1K02A 2E6AA 4OU1A 3PSVA 1ICQA 3N2MA 5A8GA 2YX0A 4YWIA 1KV8A 3RNDA 1YDOA 4HIBA 4GE8A 4OE7A 3WJZA 1DKWA 2BLEA 3EX6A 5D2XA 3T44A 5AOUA 3LCIA 1W5PA 2ZZ2A 4LVFA 3S42A 1G67A 2C19A 3S5OA 5DXXA 2AQWA 4IMCA 3WJXA 3CM4A 1GYNA 1LRNA 1W3TA 4POCA 4AVFA 4FXRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3TSBA

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