4IISA

Crystal structure of a glycosylated beta-1,3-glucanase (hev b 2), an allergen from hevea brasiliensis (space group p41)
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
316
structure length
316
Chain Sequence
EVGVCYGMQGNNLPPVSEVIALYKKSNITRMRIYDPNQAVLEALRGSNIELILGVPNSDLQSLTNPSNAKSWVQKNVRGFWSSVRFRYIAVGNEISPVNRGTAWLAQFVLPAMRNIHDAIRSAGLQDQIKVSTAIDLTLVGNSYPPSAGAFRDDVRSYLNPIIRFLSSIRSPLLANIYPYFTYAGNPRDISLPYALFTSPSVVVWDGQRGYKNLFDATLDALYSALERASGGSLEVVVSESGWPSAGAFAATFDNGRTYLSNLIQHVKRGTPKRPKRAIETYLFAMFDENKKQPEVEKHFGLFFPNKWQKYNLNFS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
publication title Structural analysis of the endogenous glycoallergen Hev b 2 (endo-beta-1,3-glucanase) from Hevea brasiliensis and its recognition by human basophils.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-1,3-glucanase form 'RRII Gln 2'
total genus 103
structure length 316
sequence length 316
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.39: Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase.
pdb deposition date 2012-12-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00332 Glyco_hydro_17 Glycosyl hydrolases family 17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4iisA00
5FCZA 3CBWA 4TXEA 3RJYA 3CUGA 2ZXQA 4U31A 3SCQA 4DUVA 5EFDA 3TA9A 2VO5A 3VNZA 2ZUSA 4H8UA 5I24A 3L4TA 1HJVA 4AD4A 1JZ2A 2WB5A 1QI5A 1XCXA 3LPGA 1QW8A 1W91A 4AEFA 4MPKA 2GUYA 3MUZ1 5GPRA 1E71M 4CCCA 3G6LA 3K8KA 5I0DA 4X0VA 4PTXA 5CXPA 1Q6CA 2VURA 3CZKA 4CCEA 5I2UA 1E9LA 3LPPA 4TVCA 4DM2A 5BCAA 3FHAA 3GH4A 4IISA 2OWWA 3SURA 4ZEPA 5M03A 1C8XA 1TA3A 1UWRA 4KWUA 4MB3A 2E9MA 4F79A 4YPJA 1KB3A 4J3XA 2FHFA 3M46A 1B31A 1V6WA 4PMZA 3WF0A 1UWSA 1EHAA 4HMDA 4MDPA 3EDDA 3MS8A 1ZJBA 1ISVA 3I3BA 1JL8A 5BXPA 4HZ7A 1C8YA 3CMGA 2GJRA 1WE5A 1GW1A 1GHSA 3T0AA 5HPOA 1EQPA 3OG2A 5AYIA 4MB4A 4J27A 1NP0A 3ZR6A 4HOWA 1UH3A 3VDCA 1V6XA 3VKKA 1B2YA 2PWEA 1E73M 1JF5A 1EDTA 4P7OA 3RIKA 2YDQA 3K8LA 1GJWA 4GKLA 5CPSA 1GORA 3N18A 3WH8A 1EO7A 5A3HA 2XYLA 2YBUA 2AAAA 1W1TA 5CPTA 2WWDA 4PBGA 3EYPA 1RP9A 2X0YA 4F66A 2XIBA 4BQ3A 1W3KA 1TVNA 2PC8A 1W3LA 2VTFA 3GNRA 1QBBA 3PTKA 2DSZA 1GCYA 1BYAA 2O9RA 1CXHA 1JNDA 3WF1A 4AIOA 4LYRA 3WH5A 4AISA 1LG1A 3VGFA 2BNJA 2E9LA 2FGZA 2BVDA 2DH3A 1R8LA 3N1AA 4GQRA 2CXGA 2XUCA 2PB1A 1J0JA 1UZ4A 2J4GA 1F4AA 1FH9A 4MTVA 1E6RA 1QNPA 3OA5A 3AZRA 3AXHA 1W2PA 3NYDA 3EDEA 1JYVA 4D6FA 1V3LA 2CITA 3OIHA 4D72A 3WBAA 1XH2A 5F7UA 2WHLA 3MANA 5BYWA 1JZ5A 5C71A 4F9JA 3SCPA 4AMCA 1WZKA 3POHA 3TP4A 1JFXA 1QNRA 4CUCA 1ISZA 1BTCA 5LA2A 2J7HA 1BYCA 1V3KA 4Q7NA 4HA1A 2GSJA 5I77A 4CKQA 2J25A 3AS3A 3WMSA 1NWUA 1VFFA 4GQQA 2WBGA 5A8OA 4CVWA 2GFTA 2GK1B 4M1RA 2WBKA 2ZXAA 2B31A 3T08A 3WDRA 3OGRA 3WKZA 1XYFA 1IT0A 3WEMA 4JHZA 5A2AA 3OGSA 3U57A 3AIQA 1AQHA 2ZX7A 4D6GA 1ISWA 2WXDM 3CZLA 3ZOAA 3ARZA 3ZMRA 3DYMA 4PMQA 1K9FA 2DSVA 1JGIA 6CGTA 3VGHA 1WCGA 5BXRA 5DMYA 4UQEA 1KXVA 1OT1A 1HN1A 5CPQA 3KEHA 2G4FA 1RH9A 3W28A 4MNMA 3WMBA 2VOTA 1J0KA 3WH7A 2ZX8A 4IUGA 8A3HA 3CUHA 1E3XA 3SUUA 4UTFA 1DP0A 2G3IA 3RILA 1EDQA 2QLYA 1W9BM 2VC9A 4LX4A 3GNOA 4UFIA 1SYTA 3K1DA 1NP2A 3VIMA 4D6HA 4HU0A 3J7HA 2O9TA 4OJYA 3W29A 2XVLA 3GXIA 1N82A 3WEZA 4BCEA 2GDUA 2VZUA 2OLHA 1EOKA 1CLVA 1D2KA 1E4MM 4P7NA 2J7DA 1XSIA 2ZWZA 5HDRA 2XSBA 1UR9A 3SCTA 3AXIA 4TTGA 2WMKA 1CGYA 1UZ1A 3ZM8A 1DWIM 1PZ2A 5TD4A 1CXEA 3FXYA 2WAGA 2UY5A 1H0GA 1FA2A 4PSRA 1JYNA 3D5HA 1PPIA 3WF3A 4QAWA 3AICA 2AMGA 4M80A 3UG4A 3CZ8A 1I1WA 4X0NA 5HBFA 2PF0A 4ACYA 3FN9A 1CENA 2W4XA 4AEEA 3AYSA 2W63A 2BS9A 1TG7A 2Y24A 1MXGA 1PBGA 3A4WA 3HU7A 4ACZB 1XCWA 2BY3A 3W38A 2WZHA 3SUTA 1W1YA 1HL9A 4KGLA 2YBTA 1KWKA 4NF7A 3L4ZA 5A6KA 2WVTA 1HKJA 3KL5A 3IANA 1J10A 2X0HA 2VRKA 1G01A 3N17A 5E6ZA 5EMYA 4PMVA 1PX3A 4A4AA 1ZL1A 4WJXA 3ZJKA 2BXYA 1Z32X 1C3FA 4W7WA 1HJUA 2XVGA 3WD4A 1MXDA 3WNOA 1QHOA 4XB3A 1CGTA 4E4PA 1OGBA 1K9TA 1OB0A 4OBSA 2E40A 5I23A 1B3XA 1NOFA 4RE3A 2O9OA 1JZ7A 3VD7A 2XM1A 1B3VA 1SMDA 2CERA 1G1YA 3VDBA 3HN3A 5ABFA 2DEPA 2YJQA 3WFZA 4B3KA 1FHDA 2GJXA 2ZX5A 4LXFA 1ECEA 1E70M 1VRXA 1VIWA 1E6NA 3EDFA 3ZT6A 4ATLA 1D3CA 3QHNA 1VBUA 1V6YA 3IAQA 1U30A 1LL4A 3CIVA 2D3NA 4FLSA 2A3EA 1UWQA 3K46A 1JAKA 1HJXA 4R27A 3VIKA 4UZUA 3QOKA 4A3HA 4H04A 1V6UA 3SCOA 1JXKA 1V0LA 1E6SM 4E8CA 4CVUA 4RL3A 5GNXA 1V0MA 3PZIA 4U33A 2UY3A 1KR0A 1R85A 1PJ9A 3CPUA 1ZBVA 2WCSA 1MW3A 3A47A 4P8UA 1FHLA 4M82A 3ARYA 1HJQA 3DHUA 4HOXA 1C90A 2VVSA 2X2YA 4ZXLA 4J3UA 4PUEA 5BROA 5KEZA 4UCFA 1VJSA 1FP8A 3FW6A 4V28A 5FKYA 4AZ6A 2WANA 3W0KA 3ARVA 1UWIA 2JFEX 3ZSTA 5I6SA 2V5DA 4ZFMA 1EOMA 3U7VA 3VNYA 1ODUA 1UUQA 1S46A 3PZUA 1OSEA 1E40A 2J75A 1UQYA 3ZJ8A 4M56A 3AQUA 2RGLA 4AD5A 2WVVB 1WO2A 3ALFA 3WD3A 3AIRA 2WHJA 2G3NA 1UA3A 4NI3A 3EDKA 3FY1A 2EXOA 4PSPA 1CDGA 4U3AA 5FL0A 4LYPA 3MKKA 1HX0A 1GQIA 3KL3A 1TVPA 2DSWA 3AIUA 1HKMA 1UKQA 5ABGA 2Z1SA 3PZMA 2CPUA 1E6XM 4P8WA 3AHTA 3CHEA 1AMYA 2CIPA 2XWDA 4AD1A 3ARTA 4AC1X 2GVYA 5A6SA 1PIGA 4CU7A 3B8SA 5D9MA 1HP5A 3CTTA 1KGUA 4AD0A 1BF2A 4AZ7A 1CLXA 1WZMA 2BY2A 2EPLX 2CBJA 3BSHA 1VEMA 1WB0A 4UOQA 4H2CA 1XRVA 2W66A 4UOZA 1JAEA 3GYCA 4U5KA 4UFMA 3NJ3A 2D23A 3VGGA 1QNOA 1SR0A 4U5IA 1JYXA 3EMZA 3W25A 4JKMA 3L4XA 1GOWA 3K4AA 1VENA 3AYRA 5HNNA 4W89A 3E1F1 1E0VA 2UY4A 4KMQA 2WLYA 1TFVA 1V3IA 4YHGA 4Z2LA 3S2CA 1UD6A 4PTMA 3W82A 5A8PA 1EQCA 1QI0A 4S3KA 3GDBA 2IXUA 3BGAA 2WMIB 2WWCA 2BHUA 4NZCA 3OLEA 3DECA 3ECQA 3PZGA 4M24A 5JBDA 1G0CA 3DHPA 3F5LA 2QMJA 1UD2A 5D8ZA 1GJUA 3WBEA 3VD3A 4AZCA 5I79A 7A3HA 5A6MA 2XSAA 2DT2A 3NCOA 4ZE4A 2XGIA 4C7GA 1V6VA 4WK9A 3WQ8A 4C7FA 1JI2A 3WDHA 4UQBA 1WZLA 1FH7A 3I3EA 3WMCA 1E6QM 3TONA 3K8MA 1NOUA 4OIFA 4NRSA 3QR3A 4QLJA 3MUIA 4IM4A 2W92A 3AS2A 1GVIA 1KQYA 4W5ZA 2XHYA 3IJ9A 1QW9A 3VGEA 3WDJA 1US2A 4PTVA 2E0PA 3AI0A 1B3YA 2YDRA 6A3HA 2ZXDA 2ZUUA 1TE1A 1E4LA 2FH6A 1JDCA 3CH9A 4JFSA 4OUEA 1GOOA 1C7SA 1VF8A 3GH7A 3A4XA 3VIGA 2JIEA 3MV01 5FL1A 3L4YA 3NSNA 4TX6A 5D9OA 3MMUA 1W9XA 4EK7A 4AD2A 2D22A 3A6OA 3NSXA 4CD6A 4JIEA 4N42A 2YDSA 1E6ZA 1LL6A 1V3HA 2XIIA 3VGBA 3ZR5A 3MUY1 4AZBA 3EMQA 4WKAA 3AZTA 3CMJA 5DEZA 3W6LA 2VX4A 5D9NA 5C70A 1Q6GA 1HVQA 3CHCA 1WDPA 3BSGA 1R87A 3TTOA 3SCSA 3ZIZA 1UR2A 1PX8A 5E6YA 3PZNA 3THCA 3TTQA 5DO8A 2VJXA 1VEPA 2VR4A 2ZX9A 3OLDA 5CG0A 1Q6FA 3OZOA 4CD8A 4FLQA 1CGWA 1XV8A 4PN2A 6TAAA 3PZ9A 4DWSA 2VNCA 2D24A 4TVDA 1E3ZA 2OSWA 4H41A 3BMVA 2OYMA 3WNLA 2VZOA 4D6DA 4S3JA 8CGTA 3GBEA 2WSPA 1GPFA 1W2VA 1G9HA 4WSKA 3W53A 2ZX6A 3GTNA 4GI8A 1LLOA 2HVMA 1JD7A 3AMDA 2Y8KA 3SEPA 2VVNA 4LQ1A 2J47A 3BLPX 3UERA 1H5VA 2ZXBA 3W6MA 1E43A 1GONA 1OGGA 1LWJA 1XSKA 1V02A 4PCSA 2DGAA 1MVYA 1JD9A 2CESA 2WSKA 3VUPA 2YA2A 4J3TA 4JAWA 5ABEA 1KR1A 1WKYA 1VFMA 4PMXA 3TTYA 2BXZA 3KL0A 1E56A 3MMDA 3W37A 1CEOA 4J28A 1J18A 1TR1A 1GOIA 1KCLA 1EHNA 3RMEA 1QI2A 1D7FA 2VRQA 1CXLA 2ZE0A 2QPSA 4X9YA 1U2YA 4GZEA 2X8RA 3TOPA 4CD7A 4L4OA 3OZPA 1QI3A 4JFUA 1OWQA 1HJSA 4BZYA 2XFYA 1NWRA 3N12A 2WHMA 1UR1A 5C8BB 1CNVA 2DT0A 2WZEA 1E1EA 4Y7EA 1ITCA 2G3JA 2CKSA 3ALGA 4D6EA 1E55A 2BV9A 4P8XA 4CN4A 1OBAA 2VRJA 2O9PA 4KGJA 3NDZA 1L0PA 5ABHA 2CBIA 4UFLA 3VOCA 4B9ZA 3TTSA 1UR4A 2E3ZA 3PZVA 4HTYA 4B15A 5JBEA 3VIPA 4P8VA 1SFSA 4CU6A 2JALA 2YL8A 3K4DA 1XD1A 2XFRA 3L4WA 4B3LA 1BSIA 3BAJA 1IZKA 5BWFA 3AIWA 2VCCA 5ECUA 4F8XA 2JF7A 4OOZA 2VMFA 4W7UA 3CUJA 4GZIA 1SMAA 5A95A 1O7AA 1ESWA 1CIUA 3WELA 3BXWA 4CCDA 1HXJA 5EB8A 4GXPA 3UEQA 1WNOA 4AYSA 4HMCA 2ZUVA 5IXEA 1QBAA 4BQ2A 2RGMA 1BGGA 3KWXA 3PTMA 1C93A 4ATDA 3VX0A 4OZOA 1GVYA 1GZJA 2J78A 1M03A 5I5RA 3VIFA 4JL2A 4Z2GA 1NWSA 1NWTA 5IHRA 2E9BA 2WMJA 2Y5EA 1H11A 1YQ2A 3T0DA 2EPKX 1KXQA 1P6WA 3CZEA 3THDA 2UWFA 1JF6A 5GNZA 1B90A 1KCKA 3AS1A 3WD0A 4XV0A 2GK1A 3T0BA 1OIFA 5CZKA 3L2LA 1A47A 2WCGA 2J8FA 3VINA 4QCFA 2DSKA 3GBDA 1KXTA 4UR9A 1UKTA 2W91A 1VB9A 1OD0A 1DWAM 3IJ8A 4WKHA 3F4VA 3WL1A 4FMVA 4UQDA 3VTRA 5I3DA 4H7VA 2WHKA 5AC5A 1MWOA 4OOUA 5M3WA 1UR0A 4HP5A 3L4UA 2CETA 3WDPP 3AHYA 3ARXA 3N13A 1V0NA 3GNPA 2XWEA 2YA1A 4N0RA 4W85A 2D0FA 1UD3A 7TAAA 1J11A 3WENA 1CWYA 4UNIA 1PX4A 1OGSA 4L4PA 3PBGA 3ZT5A 4K68A 1EXPA 2BHZA 2WC3A 3AMLA 4NRRA 3AIEA 1PAMA 4QLLA 4UFJA 5CSYA 4B16A 1I1XA 3JUGA 5A69A 5BXSA 2QF8A 4HA3A 3KE0A 3W81A 2WK2A 1J0IA 3N04A 3WY1A 2ZIDA 5A8NA 5IFTA 2EBNA 4BA0A 3VM5A 2C0HA 1UOKA 5A8MA 3RM4A 1MW2A 1DWHM 2JIWA 3GH5A 3T2QA 4F9DA 3PN8A 1QHZA 4J3WA 4D6IA 4DWSC 1B30A 4MAZA 1QI4A 2VX6A 1XGZA 3DYPA 3B9DA 4WSJA 4MNLA 4DWSD 1BG9A 1AQ0A 2W67A 2EJ1A 1BVNP 4LPCA 3N9KA 1JZ4A 1BFNA 1ZU8A 4W8LA 1BQCA 2G41A 1DHKA 4IPNB 1H3GA 2WMGA 1KXHA 1BYBA 3CHDA 2C8NA 3SUVA 4ACZA 1LQ0A 3UG5A 4KRTA 1VBRA 2CEQA 1UKSA 5A94A 3MV11 1M01A 2VZSA 1MFUA 3ARPA 2JEPA 4J3VA 1CXFA 3M6DA 3UETA 1CXIA 3VPLA 2XJ7A 1BVZA 4HPGA 1E1FA 3FHQA 4PYSA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5FCZ A;  3CBW A;  4TXE A;  3RJY A;  3CUG A;  2ZXQ A;  4U31 A;  3SCQ A;  4DUV A;  5EFD A;  3TA9 A;  2VO5 A;  3VNZ A;  2ZUS A;  4H8U A;  5I24 A;  3L4T A;  1HJV A;  4AD4 A;  1JZ2 A;  2WB5 A;  1QI5 A;  1XCX A;  3LPG A;  1QW8 A;  1W91 A;  4AEF A;  4MPK A;  2GUY A;  3MUZ 1;  5GPR A;  1E71 M;  4CCC A;  3G6L A;  3K8K A;  5I0D A;  4X0V A;  4PTX A;  5CXP A;  1Q6C A;  2VUR A;  3CZK A;  4CCE A;  5I2U A;  1E9L A;  3LPP A;  4TVC A;  4DM2 A;  5BCA A;  3FHA A;  3GH4 A;  4IIS A;  2OWW A;  3SUR A;  4ZEP A;  5M03 A;  1C8X A;  1TA3 A;  1UWR A;  4KWU A;  4MB3 A;  2E9M A;  4F79 A;  4YPJ A;  1KB3 A;  4J3X A;  2FHF A;  3M46 A;  1B31 A;  1V6W A;  4PMZ A;  3WF0 A;  1UWS A;  1EHA A;  4HMD A;  4MDP A;  3EDD A;  3MS8 A;  1ZJB A;  1ISV A;  3I3B A;  1JL8 A;  5BXP A;  4HZ7 A;  1C8Y A;  3CMG A;  2GJR A;  1WE5 A;  1GW1 A;  1GHS A;  3T0A A;  5HPO A;  1EQP A;  3OG2 A;  5AYI A;  4MB4 A;  4J27 A;  1NP0 A;  3ZR6 A;  4HOW A;  1UH3 A;  3VDC A;  1V6X A;  3VKK A;  1B2Y A;  2PWE A;  1E73 M;  1JF5 A;  1EDT A;  4P7O A;  3RIK A;  2YDQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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