4B15 | Genus

Total Genus 94

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	94
sequence length	266
structure length	265
Chain Sequence	GGNIVVYWGQGGSDNSEGSLKEACKSGHYNMIVLEELITYDNGRDPDLNLGAHCVNCTSLQQEIKYCQLKLIKILLQIGQVTPTKEDTKDTTKDLSQYLDSNFFSGKSGPLGEVYLDGIDIASVPEGLNLKFDELVQALNDSATSRRIYLSASPNCVYPDYYLDKAIQTQKLDFLFVQFFYALPCIYTQGLPEDLFQAMKTWTSNVPESIFMALPATPDLNGYIPPRVLNKEILPAVTQASNFAGVMIFDRYFDRFRKYSSKIKR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
publication title	Structural Investigation of a Novel N-Acetyl Glucosamine Binding Chi-Lectin which Reveals Evolutionary Relationship with Class III Chitinases. pubmed doi rcsb
molecule keywords	CHITINASE LIKE LECTIN
total genus	94
structure length	265
sequence length	266
ec nomenclature
pdb deposition date	2012-07-06

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00704	Glyco_hydro_18	Glycosyl hydrolases family 18

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	4b15A00

2WBKA 1BPLB 2CERA 4H8UA 1HP5A 1V0NA 5ABEA 3I3DA 5GNZA 1LG2A 3G6LA 3WD2A 3OLEA 3F4VA 1J01A 1U2YA 3U57A 2VCAA 2J25A 4TVUA 1UWIA 1GQJA 3FW6A 3VNZA 3ZOAA 4HU8A 3GH7A 2UWFA 4TVDA 2XGIA 2CBUA 4CN1A 3I3EA 3BXWA 5BCAA 1UKOA 2HISA 4DWSC 3MV11 4FLSA 3ZJ6A 1H49A 2J7FA 4JZ5A 4H8HA 1GOMA 4JCLA 3FNDA 3VMNA 3MV01 2G3NA 4N0RA 1CXEA 2ZOXA 3S2CA 3WDRA 2DH3A 3ALGA 4A3YA 1XH2A 4W86A 3OGRA 1TVPA 1GOOA 3IAQA 2J7DA 5EB8A 2O9PA 1KQYA 5M5DA 3D3AA 4GZJA 4V2XA 4P7RA 2GSJA 4IPNB 1NOFA 3DYOA 1OM0A 2J8GA 4ATLA 3CZKA 3ZQ9A 1MW3A 6CGTA 2BY1A 1XH0A 3DHPA 1CGWA 2DSWA 2EPMX 3AHTA 1CXFA 1UWTA 3PZVA 1JDDA 1W9UA 4W89A 3FN9A 1BFNA 3W82A 2J78A 2G3IA 9CGTA 3VD3A 1JAKA 3WQWA 2Y24A 3PZMA 3TTYA 5GNXA 3W28A 2BY2A 5HPOA 2VZVA 1CGUA 4OJYA 2ZXBA 2E9BA 3U5YA 1TCMA 5E6ZA 2O9RA 3AIUA 1JYNA 5A1AA 2W61A 2CESA 3VDAA 3II1A 4OOZA 5BROA 1UQYA 1R8LA 3ZSSA 2XVPA 2DSZA 2ZUVA 3AMGA 4UFMA 1E5JA 1X6NA 1HP4A 3F5KA 1UWUA 3ARSA 1ZU8A 3A47A 4EKJA 2EJ1A 1CXLA 1GJWA 1Q6FA 1JL8A 1HJQA 1BVZA 3NIYA 2EXOA 2VQTA 2WCSA 4DWSA 1UH4A 3KL0A 3HU7A 1E4LA 3BCFA 2YLAA 4W8AA 1MW0A 4JFSA 2XGBA 1BTCA 3M07A 1MVYA 4CUCA 4B9YA 4AZ5A 4L4PA 1HT6A 4LYQA 2AOSA 4HMCA 4KWUA 2A3BA 3QGVA 3KWXA 2VVNA 4CVWA 2QHAA 2ZUSA 1O7AA 4URIA 2YDQA 3VNYA 4LYRA 4P8WA 1NWUA 3PBGA 5AC5A 1KBKA 4U3AA 4DUVA 5BXRA 1WPCA 1KBBA 2YA0A 3AIRA 2GJXB 3AZSA 2WSKA 1W3LA 2JEPA 1HKMA 1KXQA 3SUSA 2WBGA 3ZT6A 4AZBA 2FH6A 2QMJA 4UFLA 2E8YA 1P6WA 2IXVA 4L4OA 4Z2KA 3ZJKA 1E0XA 4J3VA 1D2KA 1OT1A 4J28A 5I79A 4QCFA 2YBUA 4UFJA 4CCEA 5A8NA 2ZUMA 3VKKA 4J7RA 3L4XA 4MJ4A 3SURA 3ZSTA 2WCGA 5BRQA 2DSUA 1HX0A 1ZJAA 4AISA 1KR0A 2FHBA 4KH2A 2GK1B 1LWJA 4TOQA 5EBAA 1EHAA 1TUXA 4NSBA 2WHLA 3W81A 3GH5A 4BF7A 4Z2GA 2ZUUA 3N15A 4Y7EA 1K9EA 2ZX8A 1LF1A 1QNOA 2WC4A 4LXFA 1FOBA 2YDSA 3U7VA 3DECA 1JD7A 3W0KA 3CHDA 3AMCA 1HL8A 1O6IA 1SR0A 2WMHA 1ISVA 2JF7A 3WDQA 3GDBA 1FHLA 1WB0A 1ZJBA 3SCUA 1VFMA 3WQ8A 4ZE4A 4RL3A 3WQ5A 1J0IA 3IJ9A 3RM8A 4H7VA 3VDBA 4H8VA 3O9NA 4MAVA 5I24A 4PMZA 3F5LA 2PWDA 4AZ7A 5C70A 2J62A 1JI2A 1UWQA 3EDKA 2XVGA 4WKFA 3S6TA 3VGFA 4CD6A 3WH8A 4JHOA 3VGGA 1XSKA 5FL1A 2QLYA 2CKSA 5M03A 2WHMA 4E8CA 1HXJA 4GKLA 2D22A 3MUZ1 1KCLA 2BHUA 5A2AA 1E1FA 1DWGM 1UH3A 3QHNA 4UTFA 3CUIA 2XIBA 3GXIA 4GPNA 4V28A 1JYVA 5LA0A 3SUUA 4PBGA 3ARVA 1VFFA 2VL4A 4W85A 1E4MM 4JFUA 2XM1A 1NARA 3BMWA 5ABGA 4D6FA 2E9LA 1H1NA 5IDIA 2BY3A 2J75A 4R5EA 3T2PA 2WZEA 3VTRA 3HN3A 5HXMA 1W3KA 1V03A 3KL3A 1NP0A 5DF0A 3WUFA 1RH9A 3PZTA 1CIUA 3N12A 2WKGA 1WCGA 3MKKA 2Y8VA 4X0NA 2ZXQA 3AI0A 1HJSA 4AIEA 4UZUA 4F9JA 3BAIA 1NWSA 2BV9A 1S46A 2V5DA 3IANA 5I23A 2DT2A 3WY1A 4U5IA 2F8QA 3AS1A 2D3LA 5BRPA 1HNYA 1MFVA 3LPPA 3L4WA 3WUBA 1AVAA 1M7XA 4MTVA 2E9MA 4OBRA 5ECUA 2XJ7A 2ZUNA 1JNDA 2VNCA 2NSXA 1CXHA 1KXHA 4QAWA 3OBAA 3WDHA 3WDPP 4JCMA 3OGVA 2WLYA 1QI4A 3T2QA 1KR1A 5A8OA 1US2A 2WMFA 3ARWA 1E5NA 4CD7A 1BQCA 2WMIB 1PPIA 4UQAA 2YKKA 3CZ8A 1B3VA 3UESA 1J0YA 1LL7A 1UD8A 4AYSA 3I3BA 2VR4A 4HZ6A 4HZ8A 5EFDA 1I75A 2BFGA 4YHGA 2Y8KA 5FL0A 4QLKA 2W62A 2ZXAA 1WE5A 2J4GA 4KGJA 1RP9A 2IXUA 4IPLA 4D1IA 5A6BA 2VZOA 1KGWA 4H04A 3NCOA 3FHQA 5CLTA 1H4PA 4PSPA 1UHVA 1W9XA 1TR1A 4P8VA 1W1PA 5E70A 2GDUA 3GBEA 1WZLA 3AMDA 5EMYA 2J77A 5JBFA 3MSGA 2WPGA 1CBGA 2XHYA 3PTQA 4B16A 3WNMA 4U31A 3L2MA 1DHKA 3AIWA 5AY7A 1L8NA 3WIJA 2YL6A 1LWHA 1OGSA 4MJ2A 4WK9A 1UD3A 1IZKA 5E09A 3WEOA 3WD1A 1JXKA 1B3WA 4YPJA 4QP0A 1E9LA 3WQ4A 4H41A 1HVXA 1JF6A 2WMJA 1XC6A 3TTQA 4M56A 2YBTA 3W27A 2PB1A 4FLRA 5HBFA 2BS9A 3L2LA 4K68A 2G41A 2VMFA 2WXDM 1CXIA 2PBOA 1XYFA 3K8MA 5JBDA 4WKHA 2VOTA 3WBAA 3VIFA 1DWAM 1E6SM 2J47A 1BVNP 1V0KA 3AIQA 4JL1A 4AW7A 3GTNA 4D72A 1OSEA 4ZE5A 1CLXA 1M04A 1HKKA 1H11A 4ML4A 5A6JA 3ZMRA 5DT7A 4ATDA 4AIUA 1H3GA 2XUCA 2DDXA 1NQ6A 3NDZA 3VX0A 4MDPA 2D3NA 1G94A 3HJEA 2XWDA 3FAWA 1ZL1A 1WKYA 1VIWA 1BGGA 4D6EA 1K9TA 1L0PA 5AC4A 2ZWYA 2OLHA 4D71A 2JE8A 5HPCA 1V6XA 1X6LA 2GK1A 4AD4A 1RP8A 3K4AA 3OIHA 1XGZA 3UETA 3BMVA 1NOWA 1KB3A 4C7FA 2XWEA 3AJ7A 1UQZA 1XCXA 3UR7A 2NW0A 3GM8A 1TA3B 3RPMA 4KRUA 1B3YA 3WD0A 1ZBKA 4WLCA 5A6AA 1NWRA 4PUDA 3K1DA 2C7FA 5FD0A 3DHUA 3AOFA 2BVDA 1BG9A 4M8UA 1PEZA 1K9FA 1IT0A 1NWTA 1N82A 5HDRA 5FOOA 1SYTA 1W1VA 3WQVA 4A4AA 4AEFA 4IUGA 1KGUA 3GZAA 2CBIA 2RGMA 2OSYA 4OOUA 4UQEA 5CSYA 2O9OA 1QI0A 2WMGA 3VVGA 1MFUA 5HOSA 4MAZA 1M03A 1QW9A 2YOCA 1W9DM 4JHZA 1YQ2A 4LPCA 1UD2A 3CIVA 2EPNA 1JZ8A 4HA1A 4B3KA 3BSGA 5I77A 3D5HA 5CG0A 2CCRA 2XFFA 2BY0A 1FA2A 4GO8A 2O9TA 3ALFA 3AZRA 2G3MA 1QOXA 1UR8A 1X1NA 3O2LA 3UERA 4YN5A 1F4AA 4M81A 2MANA 1JDAA 5E6YA 2VO5A 1JZ3A 5DFAA 2FGZA 3VIOA 4ACZB 4Z2IA 1W3HA 2WAGA 3IJ8A 1UUQA 2WM0A 2OSWA 4U33A 4D6GA 4FK9A 3WH5A 1SFSA 3VGBA 1QBAA 1EDQA 2BVYA 3VM5A 2ZWZA 1FHDA 2E8ZA 2WK2A 5DT5A 1QHPA 3N04A 1CGXA 1E40A 4HTYA 3CHFA 3UG5A 2AMGA 2PI6A 1M01A 2ZX9A 1W9PA 1CDGA 3ZO9A 3NSMA 2CKRA 5CPQA 1JZ7A 1R87A 2ZX7A 4P8UA 5A8QA 1NM9A 1E1EA 3W37A 3OZPA 5E9AA 1ZBVA 1ISWA 1GQKA 3AHYA 5HNNA 4LQ1A 3QOKA 5IFTA 2VRQA 4FMVA 2WVVB 4Q7NA 2D20A 1V02A 5DO8A 1C3FA 5D9NA 3N11A 3WNNA 1NOUA 1OGGA 1V6YA 3W4RA 3LPOA 3QOMA 3VDHA 3WDJA 1UKQA 5FCZA 1LJYA 3MO4A 2D0GA 3ZIZA 2G8ZA 4UZSA 5CGTA 1TVNA 3OG2A 2D2OA 3AHVA 1UZ4A 5FIPA 1CGYA 3N13A 3CMJA 5I0DA 5JBEA 4GZEA 3WUGA 1JZ2A 5JIPA 3MMWA 5DEZA 4HMDA 1M53A 2WKLA 3ECQA 1UD5A 1JD9A 3WSUA 4WKAA 2J7CA 4CD4A 4ZFMA 4QDMA 1OD0A 7TAAA 2DT1A 4QCEA 1MQQA 4EANA 1Q4NX 2DQXA 2YL9A 4AMCA 4M80A 1B31A 1C92A 3CBWA 2VRKA 1VBUA 4YHEA 3W25A 4HOWA 1B2YA 3TOPA 1WDRA 5BYWA 1GUVA 2W67A 5A2BA 4OKDA 2UY2A 3NSXA 2VRJA 4BQ4A 2YDRA 3VDCA 3WMCA 3B8SA 2Q8XA 1MQRA 2DPEA 3GXDA 4PTWA 2XM2A 2VX6A 4PUEA 1ISXA 1DWHM 2XFRA 3W38A 3RJXA 4U2ZA 5GPRA 4HA4A 1ITXA 3EMCA 4RE4A 3CH9A 1BYDA 3AIBA 3NSNA 2YIHA 1V3IA 4AZCB 5IXEA 1WAWA 1XYZA 1Y7VA 1WZMA 4PCTA 4AD1A 2FHFA 3QR3A 2EBNA 1E43A 2Y2WA 4NI3A 3BH4A 3EDJA 3ZR6A 2WC3A 5I6SA 2VVSA 4W7VA 2DEPA 1WDPA 4XV0A 5I2UA 1SMAA 1WZKA 4UOQA 3FY1A 1KXTA 1R7OA 4WSJA 3CUGA 2BVTA 2XIIA 2XPKA 1RPKA 5EFFA 4V27A 3WN6A 2WWDA 1VEOA 2GJRA 1DWIM 1OB0A 4PMXA 4DWSD 2WW5A 1CYGA 2J7HA 4ZEPA 1HF6A 4AY1A 3OLIA 3WUEA 5JUVA 2V3FA 2NT1A 2J79A 1GONA 1UZ1A 2DIEA 5A8MA 1W9VA 2A3HA 1V08A 4HA3A 1J0HA 1CEOA 4UOZA 3LPGA 3RILA 4GINA 1EDTA 2VZTA 3DYMA 2BXZA 2JEQA 2XTKA 1KFWA 2A3AA 2OWWA 1E15A 1W3JA 4P7QA 4XZBA 1J10A 1G9HA 1ECEA 2ZXDA 4S3JA 5A8PA 3CHEA 1G1YA 2QPUA 3KL5A 2CXGA 3AYRA 1BYBA 3AQUA 3PZGA 4GO9A 1E6PA 1JFHA 5GQBA 3OLGA 2J7EA 1VEMA 5JIWA 2J74A 3THDA 1TZ7A 3WD4A 3WEMA 2DSKA 1CWYA 2FHCA 1W1YA 4DM2A 4TVCA 4MNKA 3EDFA 1BF2A 3O6AA 1GJUA 3VIJA 4CGTA 1MW2A 1GZJA 2ZIDA 4BCEA 2CPUA 5A6LA 3VX1A 4PRWA 1GQIA 1HIZA 1HKJA 3MU7A 1HJWA 1OT2A 4UFKA 1G0CA 2VI0A 3ARTA 3WENA 4M82A 2J7GA 5A69A 2JFEX 1UWSA 4FLQA 3T08A 1EQCA 3LMYA 3UR8A 2XSBA 1OIMA 1QNRA 4XX6A 3AIVA 2X05A 1R86A 2GUYA 2QPSA 1WZAA 4W7UA 1VENA 3RDKA 3VIIA 2WYSA 4ZENA 1XH1A 1BYAA 3AS0A 4XB3A 3AICA 1HVQA 1VJSA 3ARQA 2C0HA 1OIFA 4WSKA 4WIWA 3WF3A 1GW1A 2ZE0A 1AMYA 1Q6GA 1BLIA 3L4TA 3EMQA 3DYPA 1KCKA 2A3CA 4UQDA 2WVSA 1UA7A 5GNYA 1C7SA 2F2HA 4FF5A 3MSDA 3AHXA 1V3LA 1V0MA 1NH6A 1BSIA 4CD5A 4UFIA 5D8WA 3PHAA 4A3HA 4AD3A 1D7FA 1J9YA 4TXEA 5LA1A 1E3XA 2WHKA 4FLOA 3DC0A 3PZIA 3ARXA 3WH6A 3M46A 1GQLA 2G3JA 3MANA 1JXJA 1V0LA 2GDVA 1MXGA 2WC7A 1AQHA 5ABFB 1JF5A 3VOCA 5A2CA 4CU8A 1ZBWA 2XSAA 3SCNA 3BGAA 2DIJA 4Q22A 4ATWA 4GXPA 3BAKA 5A6SA 1SMDA 2UY5A 3T2OA 3VGHA 4DWSB 1JFXA 4W8LA 1XV8A 2PF0A 3EYPA 3SCWA 2EPKX 3CUFA 4AD2A 1JI1A 1E0VA 4D6DA 1PJ9A 1WP6A 3EDDA 3JUGA 1HJXA 5D9OA 1VAHA 1LG1A 1QPKA 3RIKA 2WANA 1H0IA 4B15A 1D3CA 4C7DA 1OWQA 1H0GA 3N1AA 3AXXA 3KZSA 1I1WA 8A3HA 2YA2A 4TUFA 3QHMA 2PBGA 2XVNA 2B31A 1MXDA 3MS8A 2PC8A 2QV4A 5E0CA 1HKIA 4U5KA 3SIMA 4AZ6A 4AWEA 5C71A 1GHRA 3CUJA 4IISA 4J3XA 2CEQA 1DWJM 2OYMA 1QNSA 1GORA 1CPUA 4GI8A 2VZSA 1EOMA 3KEHA 1XSIA 2X0YA 3MUAA 3VU2A 3BC9A 3CZJA 3GXFA 3VUPA 4QFUA 4MADA 4TX6A 5IHSA 2GJXA 3RJYA 1PBGA 1BG4A 3VGEA 1E55A 2PWGA 4CVUA 1DP0A 3WFLA 2D24A 4BA0A 3WKZA 1UR9A 1OD8A 1WDSA 4F8XA 2GJPA 2E4TA 3CGTA 1JIBA 4UR9A 1K9DA 2YL5A 3VO0A 4PCSA 3AISA 1RD6A 1GOQA 4OZOA 4WJXA 1CTNA 1UKTA 1J18A 2FH8A 6TAAA 1QW8A 1KGXA 1PX4A 1VB9A 2Z1KA 1EA9C 4JL2A 3T09A 1B90A 4UOJA 1J0ZA 2JIEA 3WNOA 5C8BB 4JFWA 4PMOA 1CGTA 3L4VA 1C90A 4AC1X 5D4YA 2W66A 3FXYA 4J27A 3EDEA 3PZ9A 4P8XA 3AMKA 5A6BD 2ZICA 2GVYA 3TONA 1E3ZA 3BAXA 1CXKA 1CECA 3G6MA 4UQ9A 4PMDA 2FDMA 5I3DA 3ZM8A 1KWKA 5CPTA 2QMKA 2W92A 2E3ZA 2NT0A 5CQ1A 1PAMA 3N9KA 2YJQA 1CNVA 3IJ7A 4H2CA 1W32A 3VMOA 2RGLA 3WMBA 3WF4A 1EOKA 3UEQA 1BYCA 1UKPA 4UCFA 1LQ0A 3NDYA 1ZB5A 1BAGA 3APGA 2VX4A 1OGBA 3MMDA 2Y4SA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4D6J A;  2Z1S A;  3CZG A;  3VIM A;  1VJZ A;  2D23 A;  4GZI A;  2OSX A;  2XYL A;  4PMY A;  4N42 A;  4P7N A;  3J7H A;  1J11 A;  2AAA A;  4JFT A;  3VMP A;  1G5A A;  3GH4 A;  2VJX A;  5DMY A;  4W88 A;  3MUY 1;  2X1I A;  5D9P A;  1QI5 A;  1V3K A;  3PZQ A;  4MB1 A;  2EPL X;  1UR4 A;  2V38 A;  3UG4 A;  5D9M A;  1NP2 A;  4GI9 A;  2G4F A;  4TTU A;  3CUH A;  1BHG A;  2WZH A;  5IFP A;  4XZW A;  4HOZ A;  1IV8 A;  3MUI A;  1QNQ A;  4MB4 A;  4PMN A;  3THC A;  3W6M A;  2JF6 A;  1V02 E;  4OUE A;  1EXP A;  1GVY A;  3AZT A;  5D8Z A;  5I5R A;  3PZN A;  1OIN A;  1EHN A;  4CCD A;  1GPF A;  2CNC A;  4W87 A;  1XSJ A;  3K8K A;  3AYS A;  1E56 A;  1VRX A;  1C93 A;  1V3M A;  2ESC A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3TSD A;  1BPL B;  3UW6 A;  2ZC1 A;  1PV8 A;  1JPM A;  3C2E A;  4H8U A;  4FP1 A;  2GGG A;  1LG2 A;  3WD2 A;  3F4V A;  3U57 A;  1WXZ A;  1SUX A;  3ZOA A;  4HU8 A;  3GH7 A;  4BFA A;  4I3G A;  2ABA A;  1PDY A;  2CBU A;  3CLM A;  1KFE A;  3ABR A;  1UKO A;  2HIS A;  2H3B A;  4QIU A;  1UJP A;  3TR2 A;  4FX7 A;  1H49 A;  3PC0 A;  3DFN A;  4PCP A;  4JCL A;  3VKB A;  2G3N A;  4F2B A;  4S3B A;  3UYI A;  1CXE A;  2ZOX A;  3S2C A;  3ALG A;  4PRR A;  5A5W A;  1XH2 A;  4MKS A;  3IAQ A;  5EB8 A;  4HVX A;  2B0M A;  1E1C A;  3BQ5 A;  3LQG A;  5D02 A;  1G67 A;  2G0W A;  1X98 A;  1NOF A;  3DZ1 A;  3R2G A;  4ATL A;  4GKT A;  3DBN A;  4ERG A;  4GJ1 A;  4GC4 A;  3DES A;  6CGT A;  2BY1 A;  2DSW A;  3PZV A;  1QW7 A;  1A4L A;  1JDD A;  4L6O A;  1OYA A;  1KD0 A;  2R14 A;  5TNV A;  3JR2 A;  3FA5 A;  4KIR A;  3KDO A;  2GQ9 A;  3PZM A;  3W1A A;  3W28 A;  4GIE A;  1DID A;  5AC6 A;  1ZSX A;  3C0Q A;  3PG9 A;  5HPO A;  3LRM A;  1CGU A;  4OJY A;  3UNT A;  2FTP A;  5ABT A;  3HMJ G;  4ERA A;  3LCL A;  2O9R A;  4JNZ A;  4O28 A; 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4B15A

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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