4XZW | Genus

Total Genus 127

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	127
sequence length	305
structure length	305
Chain Sequence	KTPVAKNGQLQVVGTALLNRDGKPFQLRGISTHGLQWFGQFANKDAFQTLRDDWKANVVRLAMYTDPNANGYIAQPEWLKAKVKEGVEAAKELGMYVIIDWHILNDNDPNLYKEQAKRFFAEMAREYGNTPNVIYEIANEPNGDVTWEEKIRPYADEVIRTIRSIDRDNLIIVGTGTWSQDVDDVASDPLPYKNIMYALHFYAGTHGQFLRDKANYALSKGTPIFVTEWGTSDASGDGGVFLDQSREWLKYLDSKTISWVNWSLCDKNEASAALRPGADPHGGWGDDHLSDSGRFIKAKLIEALE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
source organism	Uncultured bacterium
publication title	Endo-glucanase chimera C10 rcsb
molecule keywords	endo-glucanase chimera C10
total genus	127
structure length	305
sequence length	305
ec nomenclature	ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date	2015-02-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	4xzwA00

4QLKA 1KFWA 3VVGA 2W5FA 2WMJA 1LQ0A 1J0IA 5D9NA 3K4DA 4TVDA 3AS1A 1US3A 4KGLA 3WENA 3NUKA 1D3CA 1DTUA 1V02A 5ECUA 2JALA 1E73M 3CZJA 1JFHA 5CGTA 3AIWA 5CQ1A 3HU7A 3DYOA 2A3BA 1B3YA 2XFRA 5FD0A 4OBRA 3B8SA 2WSPA 3OLEA 4TVUA 1US2A 3J7HA 2D24A 1VFOA 4ZFMA 1TA3A 3DHUA 1XYZA 4Z2KA 4AD3A 1GHRA 3ZT6A 2WLZA 3POHA 2B31A 1XD0A 3RM4A 3A3HA 1JDCA 2BXYA 4TTUA 2PC8A 3PZTA 4QCEA 3GM8A 3OLIA 1UG6A 2UY5A 2ZUSA 4D6JA 3CMJA 4JKLA 3WD1A 2DPEA 1EGZA 2IXVA 3VX1A 1PZ3A 4M1RA 4DWSA 1QI5A 3UESA 3SUTA 2WHJA 3WQVA 4FLSA 3GXMA 3WELA 2BHUA 2ZE0A 1Q6CA 1UZ1A 2NSXA 3PBGA 2AOSA 1NH6A 4PRWA 1V3MA 3RIKA 4P8VA 1CGVA 4PN2A 1FOBA 5CGMA 4IISA 3RMEA 2WLYA 4AY1A 1SMAA 3WH8A 4R5EA 3ZSSA 1PPIA 2V3FA 4D72A 3TTQA 4YPJA 1DWJM 1WZAA 4N42A 4GXPA 3A4AA 3DECA 2WBGA 3AS2A 3L4ZA 4AD0A 1B30A 2DH2A 4MNLA 1K9EA 4Z2IA 3EDFA 4TTGA 1E4LA 3BSGA 4CD4A 2VL4A 2O9OA 3CZGA 4ZXLA 1KB3A 1MQRA 2WBKA 3N18A 1KWGA 2XTKA 1UR2A 1B1YA 4CN1A 5I0DA 1RD6A 4Q22A 4PUDA 1VAHA 1GUVA 2CKRA 2VI0A 3OZPA 5HPCA 4UQEA 1V0LA 1DWIM 1F4AA 4ATLA 1AQMA 5GNYA 3WNOA 1OT2A 4FLOA 1MQQA 1BHGA 2CKSA 3WNMA 5I6SA 5I3DA 4OBSA 5JBFA 2E8YA 4TXEA 2D3NA 3ARTA 5I24A 3MU7A 4IUGA 4P7LA 3WD3A 4HA3A 2EPLX 4LYRA 3GXDA 2CERA 4UQBA 4HPGA 4PCSA 3QGVA 1VBUA 4CUCA 1WAWA 4KH2A 4MNMA 4UFIA 4F9DA 3GNOA 3T09A 1GZJA 3T0DA 1G9HA 4UCFA 3PZVA 3FHAA 2VR4A 3W25A 3WD2A 3OIHA 3W53A 4AEEA 4CGTA 1VJSA 1BYBA 2CNCA 4EANA 1QW9A 2E3ZA 1LL7A 2J8GA 3SUVA 2XIBA 1F4HA 3RJYA 1JNEA 3MSGA 3MMUA 1YQ2A 3EDEA 1J11A 3AHTA 3TTSA 1KGXA 4ZXOA 3VGEA 1AMYA 2CBJA 1JZ2A 1MW1A 2WCGA 2VOTA 4A4AA 2PB1A 1E0WA 3CUIA 4AIUA 2X0HA 1W9BM 3TOPA 3SIMA 4CCCA 3EMZA 1V6VA 1BAGA 1XHGA 2J25A 5C71A 2BHYA 2WANA 3BMWA 4M80A 4U5IA 4UFHA 2ZIDA 1KXQA 3VO0A 4OOUA 1UWTA 3AMGA 4W7UA 3AHVA 2ZICA 3VMNA 3VU2A 4AD4A 3VIFA 1SYTA 1V3HA 1UD3A 2XFFA 4AZ5A 4DUVA 1QOXA 1WZMA 4JCMA 1G01A 1VJZA 1MVYA 1GOWA 1ODZA 3B9EA 1EIBA 3AIRA 2G3MA 3SURA 3WEZA 3VMOA 4HTYA 4Q7NA 4L4OA 2E9BA 5E09A 3AMLA 4JHZA 4OKDA 5A6BD 5LA2A 3CBWA 4AZHA 1V6XA 1JYWA 1G1YA 2J4GA 3TTYA 3M6DA 1HNYA 1WO2A 3PN8A 4MDOA 3SCQA 5A2BA 3AIUA 3PZNA 4P8WA 1UH4A 2D0FA 1GCYA 3AZSA 3MUY1 1QBBA 1MW0A 4PMXA 1BVZA 4XV0A 1JI1A 3EMCA 3PZQA 3A47A 2BY3A 1I1XA 4MB3A 2UWFA 2FHFA 3AIEA 2AMGA 1V6WA 1FA2A 2PF0A 2FGLA 2VURA 1R7AA 4AXNA 3CUJA 1K9FA 1NARA 3W26A 3BAIA 5M03A 1HJSA 2BVYA 3LPPA 4GZJA 4W7WA 3FN9A 2W63A 1ZJBA 5EFDA 1CGXA 3WIJA 1WNOA 5E0FA 2CETA 4W5UA 4MB4A 6TAAA 3W38A 4J3SA 1B0IA 4J3VA 2VTFA 2CITA 2XPKA 5FIPA 4JFUA 1U30A 1C93A 4IPLA 4XX6A 2WHLA 4GI6A 3AJ7A 3N04A 5CZKA 2YL6A 3SCPA 1QBAA 3MKKA 1IT0A 3VNYA 4F9JA 2YBTA 4UZUA 1GOOA 1HKIA 1LL4A 1Q6EA 4JFWA 3AMKA 5CSUA 4TUFA 2CYGA 3ZR5A 1FH8A 5CLTA 1JG9A 2WK2A 3OZOA 1GW1A 2DDXA 1UHVA 3CH9A 2CXGA 4GIAA 1UQZA 3LPOA 4D71A 1GOKA 1CENA 1VF8A 1BTCA 1PX3A 1PIFA 1JAKA 1V6UA 2DT0A 2G41A 3I3EA 3WMSA 2WKGA 1H3GA 3MMDA 1JF5A 3BCFA 2J7CA 7A3HA 4KRUA 5CXPA 2D3LA 3QHMA 4ZE5A 1HJXA 1W9DM 1J18A 5BCAA 1DWHM 3W0KA 1CPUA 3GH5A 5A8QA 4PMZA 1G5AA 1VFFA 3AS0A 4GKLA 5A6KA 5I23A 4D6GA 3BLPX 3N13A 1UD2A 1KXVA 3PTKA 4MDPA 3ZO9A 4OZOA 4QFUA 2G4FA 1L8NA 1V6YA 1UD5A 2VX7A 4W86A 2V38A 1R7OA 1V3JA 2V3GA 3WBEA 1W32A 4JFSA 4LGXA 3G6MA 4W5ZA 5A94A 2WVVA 4H41A 2GDVA 2YBUA 2YDRA 3SCNA 5A6JA 2EXOA 3HN3A 3UR8A 4WSJA 2D0GA 1C3FA 1UKQA 5I5RA 5IXEA 5ABHA 4LYQA 4FK9A 4A3HA 3VIMA 3WH9A 3T08A 1CXKA 1H5VA 4Z2JA 3BAJA 3WUEA 1M53A 2JF7A 4JKKA 4TVCA 1KR0A 1ZBWA 4GI8A 3GH7A 2WAGA 3N11A 3L4VA 2CHNA 4M82A 3L4TA 4P8UA 4HU0A 1OCQA 3GNRA 4Z2GA 1E6PA 1HVQA 3A6OA 3BAKA 1XGZA 3POCA 2O92A 4UR9A 3N15A 1OGBA 4D6IA 2XG9A 4UFLA 1Q6DA 1UH3A 5F7UA 2DT3A 3ZT5A 2RGLA 4RL3A 4GPNA 4W87A 1PZ2A 2VX5A 2ZX9A 1E70M 2QPSA 3GYCA 1O6IA 2CEQA 5FKYA 2GJXA 3VGGA 1C7SA 2ZX7A 1UWUA 4P7RA 5JUVA 2BHZA 1V3IA 3CZ8A 4U5KA 2BFGA 1GOMA 3I3BA 8A3HA 4FF5A 3ZM8A 3FAWA 1V0NA 3VGBA 1V0MA 4EAMA 3RPMA 3K1DA 1XH1A 2G3NA 1QI3A 1HL8A 2CCRA 2VC9A 4B9ZA 8CGTA 4ACYA 4ZEPA 2CBUA 1ISVA 3RM8A 4OJYA 3UR7A 3AXHA 4KWUA 5IFTA 3F5KA 2D20A 3WSUA 3AOFA 4BCEA 3IJ7A 3EYPA 2OWCA 4PSRA 1M04A 1MW2A 2X8RA 4D6FA 3U5YA 3PTQA 7TAAA 4CU6A 4EE9A 1EOKA 4AZCB 1MFUA 4BQ5A 2Y2WA 3F5JA 4WSKA 2VCBA 5BWFA 1JDDA 1V03A 2WMGA 1ODUA 3GH4A 1M01A 5CPSA 4AIOA 2V5CA 2EO7A 3AFBA 3VD4A 1XD1A 1OM0A 2EQDA 1XH2A 2YIHA 2WMHA 4PBGA 1NWTA 3S2CA 5KEZA 2WC3A 1EDTA 1E6ZA 1W9XA 5I78A 2V5DA 1ZS2A 1XCWA 2XHYA 5HPOA 2ESCA 1BG9A 1E55A 1D2KA 1J0HA 1E15A 1PBGA 5FL1A 2DGAA 4DUWA 2DSKA 3O2LA 3BSHA 4D1JA 2OYMA 1E1FA 1UR9A 2OWWA 1JD7A 3O9NA 3PHAA 3ARYA 3THDA 1FH9A 2PWDA 1BFNA 1UKOA 4M81A 3U57A 4KRTA 3ARPA 4E2OA 1GPFA 1H11A 2XVPA 2W92A 3AHXA 3CZEA 5JIPA 2VZOA 1UR4A 3CLWA 3W24A 3WF0A 1KBKA 1H0GA 3D3AA 1FP9A 1BG4A 3PTMA 1QW8A 1WZLA 1NP0A 1IV8A 1C8QA 4PMVA 3WH5A 3FNDA 5A8MA 2DSZA 2X1IA 4JIEA 1CLXA 1ZBKA 2GJRA 1EDGA 1OB0A 1ZBVA 1CTNA 4AYSA 3AQUA 2DT1A 3W81A 4CN4A 4J7RA 3SEPA 2WCSA 5CPQA 3WDQA 5AC4A 4CVUA 5A69A 2BY1A 1SMDA 2C7FA 4QDMA 1WKYA 3AMDA 1H4PA 4HA4A 4MADA 3RCNA 3WY1A 4WKFA 4UQ9A 1QHZA 2GK1A 3L4XA 4H8UA 3VDAA 1WP6A 2D1ZA 3NYDA 5E9AA 3WUFA 1CXEA 1H0IA 2ZXAA 1WDSA 2VQUA 4Y7EA 4XUYA 2JF6A 3GDBA 1Q4NX 4CCEA 2WZHA 3UEQA 1HT6A 3NCOA 2G3IA 5IHRA 1R85A 1MXDA 3T0BA 3UETA 4BZYA 3VDBA 3TA9A 3G6LA 5FL0A 1CXFA 4BQ2A 3VGDA 3ARWA 1G0CA 1MW3A 1TVNA 2XYLA 2XFYA 3QOMA 4GZEA 4HU8A 1EO7A 4YHGA 3DHPA 2J62A 4X0NA 5I79A 1E3XA 4AZ7A 1GQLA 1B2YA 1W9UA 1GJWA 4V27A 3CIVA 5HDRA 1M7XA 3AIQA 2DSVA 4YN5A 4DWSD 1NWSA 3AHZA 2XIIA 1JYVA 3PZOA 2JE8A 1CEOA 4PSPA 5DFAA 1CDGA 3U7VA 3O6AA 1HJVA 4M24A 1E0XA 3GTNA 5CPTA 1OSEA 3MUZ1 5JIWA 3IAQA 3SUWA 3JUGA 2J7HA 5E70A 2O9PA 5AYIA 4F66A 9CGTA 2YKKA 2J47A 2VR5A 3WNKA 3VUPA 4B15A 1BPLB 4ACZB 4UNIA 5A2AA 2PI6A 1Z32X 1PEZA 1H09A 1TCMA 4UQAA 4AC1X 4KMQA 3VIKA 2Z1KA 1E6XM 1HKMA 3SCVA 3WQ8A 2Y8VA 2BS9A 3W6LA 1Y7VA 5E6YA 1EDQA 4HOXA 2WCAA 2WMKA 4GO9A 4S3KA 1ISXA 2WB5A 2HISA 3N12A 4H8HA 3L4UA 3ZJ6A 4CD6A 1ZL1A 2XVKA 3SUUA 1QHPA 1WCGA 3F4VA 1KWKA 2QLYA 1XC6A 4BS0A 4HPHA 2J75A 2J74A 5EFFA 3VOCA 4AZIA 3N17A 3SCTA 1MXGA 5ABFB 4CD7A 4B3KA 1NQ6A 1W2VA 2WSKA 2XSBA 1W3JA 1OBAA 2XSAA 3WDRA 1NWRA 4BQ3A 5D9MA 4W8AA 1FHLA 5A6MA 1LWHA 4WK9A 4EK7A 4LQ1A 4D6HA 1E5NA 1Q6FA 2D23A 4NI3A 3DC0A 1J10A 3OGVA 3W4RA 1UQYA 4H2CA 2EPOA 1NOFA 3AMCA 5A8OA 3OG2A 3PZ9A 1CIUA 1H49A 2EBNA 4ATWA 3AISA 1UKPA 3UCQA 1L0PA 4PTVA 1W3KA 4JZ5A 2UY4A 2PWHA 2VMFA 3FXYA 2WHKA 3FAXA 3RM9A 4W8BA 2X05A 3IJ9A 3A4WA 3PZUA 2D22A 3DYPA 1EHNA 2V3DA 4F8XA 2WW5A 2EEXA 4U31A 4WF7A 5A6SA 4MJ4A 1LL6A 4ZENA 1E6SM 5D9PA 3OA5A 3WD0A 3EDJA 1UWSA 1W3HA 2GVYA 2YL8A 3CHEA 2CBIA 1V0KA 1OT1A 3ZT7A 4LX4A 1JAEA 5AY7A 4HMCA 4AISA 3ECQA 3OB8A 3VMPA 3ARVA 4JKMA 3WMBA 2YL5A 3ARZA 1GHSA 3VIPA 4W93A 2FHCA 4PMYA 5LYRA 1QPKA 2F2HA 2D2OA 3K8LA 1V08A 2DEPA 1B3VA 3OGRA 3A4XA 1KCKA 1CZ1A 1G94A 1TA3B 3VIGA 1BF2A 1EOMA 3WKZA 4EKJA 1TFVA 3WQ5A 3L2LA 2ZUNA 1WDPA 3AZRA 3W6MA 3LMYA 5TD4A 2J7GA 4E8CA 4LYPA 5BRQA 2OYLA 2ZWYA 1I1WA 1J0KA 1R86A 1EA9C 2ZX8A 4U3CA 1GQJA 1JZ7A 1PJ9A 4DWSB 3PZGA 1U33A 3RO8A 5AC5A 2ZUTA 3UG4A 1LJYA 4OUEA 1DHKA 2HVMA 1BGGA 2BVDA 2D0HA 2E8ZA 2XM2A 1AVAA 3CHFA 3WEMA 1XRVA 1WE5A 1ECEA 1GVIA 5JBEA 2WVUA 1QNPA 5JBDA 3MSDA 1HN1A 1UWRA 1E4NA 3CZLA 1QNSA 4DM2A 1B3WA 1OWQA 3FW6A 1KXTA 1V3KA 1W9VA 1JF6A 3CO4A 4ATDA 3ARRA 4MNKA 2YLLA 1C8XA 2A3EA 3KL5A 3DYMA 1JD9A 4B16A 4DWSC 3VDHA 1TVPA 3U7BA 1VENA 2YA0A 3F5LA 2GFTA 1JFXA 2XM1A 3WF1A 1Q6GA 2NW0A 3EBVA 4MPKA 3AHYA 3CGTA 2EPNA 2J7DA 2E4TA 1WZKA 3BCDA 1HL9A 4IM4A 1ZBCA 3AS3A 4UFMA 1H2JA 1J0ZA 3EDDA 4AWEA 1MWOA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 5BRO A;  2CIP A;  4MNJ A;  4U33 A;  2OSW A;  4BQ4 A;  1TZ7 A;  2XVG A;  1LF1 A;  2ZXD A;  3WDI A;  3GBD A;  4P7N A;  2VRQ A;  3AYR A;  1VFU A;  1HKJ A;  2PWE A;  1W2P A;  1C7T A;  2VZS A;  3TP4 A;  1CXL A;  1HJQ A;  3UG5 A;  1QI2 A;  1FP8 A;  3BH4 A;  2WC4 A;  3SCU A;  1UOK A;  3ZST A;  5FOO A;  3KL0 A;  2WM0 A;  5BRP A;  2J7E A;  3VD5 A;  2J77 A;  1S46 A;  1FH7 A;  4ACZ A;  3LPF A;  2XUC A;  2EPK X;  4HOZ A;  1HP5 A;  4AD1 A;  1RP9 A;  1UD6 A;  2C0H A;  2PBG A;  2ZX6 A;  4RE2 A;  1HF6 A;  2CPU A;  2DSU A;  4AZG A;  1EQC A;  1TMQ A;  2VZV A;  4GQR A;  1GOI A;  3HMC A;  4CKQ A;  1JZ4 A;  2YDS A;  2GSJ A;  4C7D A;  4PMQ A;  1R8L A;  1EQP A;  4WIW A;  4UQD A;  4V28 A;  1U2Y A;  1OGS A;  3AYS A;  3MV1 1;  2JIW A;  3M7S A;  3WF3 A;  3WEO A;  1C90 A;  2G3J A;  1HXJ A;  3WFL A;  4D1I A;  5EBA A;  4C7G A;  3BAX A;  3VIJ A;  4D6D A;  1ISW A;  3ZJK A;  5A1A A;  3WMC A;  1GOQ A;  1NP2 A;  1UKT A;  1GVY A;  3GXF A;  1VEO A;  2VX4 A;  2WPG A;  1BYD A;  3ARU A;  1BYC A;  2GUY A;  2VZU A;  3VTR A;  2WKL A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1O1H A;  1SSD A;  2H90 A;  4DJE C;  4R5E A;  4O10 A;  1DID A;  3KFT A;  1WZA A;  3S5N A;  3MYP A;  3A4A A;  4GXW A;  5FJI A;  4MZ8 A;  4HSH A;  2R1N A;  2ZA2 A;  1R38 A;  2D2J A;  3H4W A;  4Z2I A;  1J4E A;  4Z1Y A;  4TTG A;  4GUI A;  3BSG A;  3WLO A;  3PG8 A;  3IRS A;  4R7W A;  3FA3 A;  2Z1X A;  4O8A A;  1AK5 A;  3R12 A;  1Q66 A;  1KB3 A;  2WBK A;  4LVD A;  3N2T A;  2XTK A;  4IID A;  5I0D A;  4ZQN A;  1A0C A;  3N4F A;  4UTL A;  1QPO A;  2CKR A;  4ZOC A;  4PA8 A;  3UWZ A;  1F4A A;  4ATL A;  1AQM A;  3DER A;  4LF1 A;  5CBI A;  1Q8A A;  5I6S A;  1RJR A;  4LVF A;  5JBF A;  1ZAJ A;  4G7E B;  2RKX A;  3MU7 A;  1TPF A;  4P7L A;  3NVD A;  4NP7 A;  2AQV A;  1EX1 A;  4HA3 A;  1Q4W A;  3GXD A;  1R0M A;  2ODO A;  4UQB A;  1IGW A;  4CUC A;  4KH2 A;  5HR6 A;  3GNO A;  1UUM A;  4PZV A;  1DQW A;  3T0D A;  3XIS A;  4DZH A;  3L9C A;  3TW9 A;  2UZ9 A;  3LRL A;  3WD2 A;  2Z1W A;  3HF3 A;  3XIM A;  2BOF X;  4CGT A;  1BYB A;  4WRH A;  3GR7 A;  1IYX A;  1QW9 A;  4BR1 A;  1W5Q A;  3EPN A;  2W79 A;  4IPP A;  5IBX A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4XZWA

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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