1TPWA

Triosephosphate isomerase drinks water to keep healthy
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
245
structure length
245
Chain Sequence
RKFFVGGNWKMNGDKKSLGELIHTLNGAKLSADTEVVCGAPSIYLDFARQKLDAKIGVAAQNCYKVPKGAFTGEISPAMIKDIGAAWVILGHPERRHVFGESDELIGQKVAHALAEGLGVIACIGEKLDEREAGITEKVVFEQTKAIADNVKDWSKVVLAYEPVWAIGTGKTATPQQAQEVHEKLRGWLKTHVSDAVAQSTRIIYGGSVTGGNCKELASQHDVDGFLVGGASLKPEFVDIINAKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase(intramolecular oxidoreductase)
source organism Gallus gallus
publication title The role of water in the catalytic efficiency of triosephosphate isomerase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE
total genus 89
structure length 245
sequence length 245
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.3.3: Methylglyoxal synthase.
pdb deposition date 1994-11-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1tpwA00
3VE7A 2VKZG 1TB3A 2HSAA 3BW2A 2X1SA 2TSYA 1OYCA 3WK1A 3OHIA 1EIXA 4NJJA 3EX3A 1H7OA 3EXTA 3PAJA 1YPFA 3R13A 4MY1A 1BTMA 4Y90A 1I8JA 4GUIA 4H4IA 4IMDA 3TMQA 4NT0A 2WNNA 1H7XA 3PUDA 3CT7A 1IXOA 1KFLA 2YCEA 3U2OA 1TRIA 1O5XA 1D3HA 3P84A 3GDLA 2NUWA 1SQ7A 1XFBA 3EKZA 5J5DA 2E5DA 3W75A 5FEWA 1SZGA 1VS1A 3E02A 2GVJA 4C1LA 1ME9A 4UTKA 3NPXA 3R2GA 1VZWA 1FCQA 2CWNA 5BMWA 1HFBA 1TTJA 4IGHA 3QFEA 4K7VA 1F2JA 1IXNA 5A5WA 3TJLA 5D05A 4K6AA 2A6NA 2HS8A 3C3NA 2D73A 3SGUA 3TW7A 4LUJA 1YDOA 4O54A 4IMFA 1TQJA 2RDTA 1H50A 1CI1A 1P5BA 4PEKA 5CZJA 1IXQA 2Q8LA 2LLEA 3KOFA 3P61A 1TMHA 4GRSA 4EVZA 3NQ2A 1GVOA 2C16A 5CG7A 1J4EA 1PS9A 3IGSA 3G0XA 3USBA 4RZ4A 5CZTA 3P60A 1XXXA 3N9SA 1VCGA 3HJZA 1VLIA 1RV8A 2FTPA 2ZRYA 3EWBX 2E6DA 4PC8A 1G7VA 3NNTA 4N9DA 1NF7A 3A9IA 1QFEA 3S1VA 3VFLA 3W23A 4JTIA 5G4WA 4LVGA 5LKYA 4A2SA 1EX5A 1GT8A 3O6DA 1G6CA 2QCGA 4IMGA 1H5YA 4D2JA 3QW4B 2V8ZA 4NQ1A 3WJYA 4P61A 1JULA 1Z41A 2PE4A 3GR8A 2NX3A 2ZZ3A 2GVLA 5EL1A 4QAIA 4R7JA 1KBJA 3C61A 1QOPA 1ME8A 4IOTA 3GDKA 1I2QA 2AQWA 4ZQMA 4X9SA 1TJRA 1W5OA 3HPXA 4PA8A 3EWXA 4ADSA 3HG5A 3M6YA 4O12A 3TR2A 4UTLA 4OQVA 2BLEA 3STEA 2QJIA 3B06A 5AC6A 4JX6A 1TPVA 1LTDA 3ATZA 1DJQA 2WKJA 2NWSA 3W7IA 4FNPA 4E2BA 1GYNA 2DP3A 2W6RA 3O07A 2Y7GA 2ZDRA 1OF8A 5J5RA 4JYDA 2O7SA 4ZVJA 1W1ZA 1Z44A 1LCOA 1VGAA 3LI1A 3BARA 3TCEA 3O05A 4Q4KA 5KTLA 3SZ8A 1LP6A 1SZFA 4DPPA 3EWZA 3L0KA 3VE9A 4TR9A 3DFSA 1VLWA 4OT7A 3TFCA 3W7RA 1TTPA 1K02A 1YPIA 1C8VA 1XDMA 1QWGA 4OV9A 2DZVA 3HBLA 1C9DA 1P0KA 1IGSA 4HIBA 4JY9A 1LLWA 1DV7A 4N9EA 3S42A 4Y9AA 3GR7A 1H7WA 1OABA 1KM3A 3ABRA 3LGEA 4HNUA 3T55A 2GJLA 1ZAIA 1YDVA 5D2XA 3CEPA 5D03A 3O16A 1LROA 1F05A 4DF1A 3LTYA 1XBZA 4O17A 2VELA 3HGJA 2E5CA 2Z0IA 1YDNA 4MLRA 4O1DA 4XKYA 2X2GA 3I65A 1R47A 4ORIA 4LOCA 4QJ1A 5D2VA 1H1YA 1P1XA 2X1TA 1YTKA 1I45A 1KM5A 1EP3A 4KWVA 4PCFA 4AWUA 2KZHA 2FDSA 3W7CA 3AJXA 3SSJA 3L68A 1Z42A 2JKPA 3WK0A 4NJIA 4IPIA 1SFLA 4UMCA 1OHLA 2QJHA 2V81A 3PR2A 1JQXA 4BI5A 1OFQA 1MXSA 4O28A 1FQ0A 2ZZ1A 4XTIA 2WSQA 3EWYA 4NNBA 1ICSA 2V0TA 5DBUA 4JTHA 2ZZ7A 3LCFA 1TPB1 4AAJA 3W2JA 3HPSA 4WJEA 5EYWA 5CSRA 2VXNA 5K9XA 1K7XA 4HPJA 3FYOA 2WOQA 4RLIA 3GXTA 4R34A 1VYSX 5SWUA 3NPUA 1EPXA 2RH9A 2F7FA 3NPVA 1GYLA 5KZEA 1XBXA 4K38A 1JCNA 1LM1A 3PVFA 2NLIA 3P82A 3AO0A 2YSWA 3CM4A 3W7PA 3FKRA 4ZMGA 3NQCA 3M5XA 4HNVA 4M7SA 5T26A 4O15A 1SSDA 4PH6A 3W1AA 2XN0A 2WPBA 2A6LA 3M47A 4TMBA 2YFOA 4GFSA 2J9ZA 2CLKA 1PCWA 4FIRA 1FXPA 4ADTA 1M6JA 5AYXA 3W7DA 5CPOA 2CLLA 3G1XA 5AFDA 1FY6A 1Q45A 2BXVA 1LBLA 2V5BA 4MZ8A 4FB7A 4FHAA 4RKAA 4N4PA 1W3NA 3ABQA 4UFIA 3BV4A 3G1HA 5D38A 1YLVA 2JBMA 4I7WA 1H61A 5D2YA 3G0UA 4ORMA 5EBUA 3G1SA 3W3OA 3G1VA 4YXGA 3SIZA 4LUIA 3S5OA 1Q6LA 2H8ZA 3UZJA 1GZGA 1PL9A 4RZ6A 3LB0A 1W5NA 5EPDA 1DBTA 3PWAA 4QM1A 3GDTA 4O1AA 3DHFA 1LRTA 3MWAA 2QCFA 3F03K 4OV4A 4CLMA 4M5PA 1FCBA 4I7VA 4QIUA 4CCCA 3S5ZA 4Z0SA 1NAL1 4O14A 1PE1A 4N2YA 3MI3A 1L2UA 5HR6A 3W76A 1FDJA 5K9DA 2G97A 4E2DA 4KFNA 4NVTA 2ZCGA 1WV2A 2R94A 4XQ6A 1AL7A 1UJPA 4YWIA 2TRSA 4JTSA 4RR4A 2E6YA 3G1DA 4HKPA 1RZMA 1ICQA 1OFDA 4JDYA 4M7TA 4GUHA 2HTMA 5BOOA 5K2ZA 2BSLA 1RD5A 1GVQA 3P80A 3HB9A 5AYZA 5E1QA 3L9CA 1TRDA 1XI3A 1TTQA 3B03A 3GXNA 2Q8ZA 3QPYA 1KM6A 2BWGA 2A21A 3PBYA 1R2RA 4LS1A 3ELFA 4NU7A 2GJNA 4RX0A 4XTDA 3RK8A 3S1XA 3QJAA 3HGSA 3DI0A 3O1NA 3WK3A 4NXKA 3TXVA 2VFGA 2J27A 3FFSA 1ML1A 3MHGA 2CZEA 4UTMA 2V82A 3MJYA 1R46A 3DZ1A 3OVQA 3W1LA 2NV2A 5HUOA 3P8IA 3UPBA 3W7KA 1SW3A 1VRDA 3W71A 1A5CA 3CIWA 3NQVA 5LZLA 1PVNA 4FX7A 4GUGA 3THAA 4R33A 1NEYA 3CHVA 3L2IA 4H3DA 2V9DA 2G5WA 3IGXA 2QCCA 5F1UA 5LHEA 3NA8A 4CNPA 3TW6A 2Y88A 2WV8A 2QUVA 2DZPA 4ONVA 2QCDB 2NV1A 1LOQA 2RDWA 2V5LA 1DKWA 5E93A 4AHPA 1AL8A 1UB3A 5AHIA 2ATMA 2ZRZA 3LI0A 4R53A 2Y7DA 4N9CA 1TV8A 5FI8A 5K3VA 1R2SA 3MW7A 2YDAA 3KVJA 1G7UA 1JCYA 1SO6A 4O1CA 4MJZA 4XZ9A 3T78A 3U6WA 5C55A 3LCWA 3NQEA 3B04A 3NEVA 3LCHA 3TROA 1B4EA 3EKLA 2YPIA 4POCA 1QMLA 3B0UX 2C19A 5CPMA 3W1NA 4UUIA 4LY8A 4MKNA 1FDZA 4CNOA 2WJZA 3N2XA 4PL2A 5U4NA 3G3MA 1LOSA 2ZA2A 4UR7A 1XDLA 3TSBA 2A7PA 3HO8A 4HNTA 3H53A 3TH6A 3VKJA 3TQVA 3LCGA 1A5BA 2CFFA 4UFLA 3GVGA 1TPC1 3DI1A 4OE7A 1LDCA 3LOTA 3TX9A 3LRMA 1A53A 4UC5A 4IMCA 1L6WA 1H7RA 2CZFA 2CLIA 1TPWA 1EA0A 1AW5A 3C2OA 2YW4A 3L21A 4Z1AA 6ALDA 1T99A 1S3HA 3SFKA 5C6MA 3L0GA 2Y6ZA 3QQ1A 3ATYA 3LBMA 1QAPA 1FWNA 3G1YA 2X30A 3EXRA 1QR7A 4JEQA 3QMSA 1VCFA 5DY2A 5G1TA 5AHMA 2B7OA 1CX9A 4S1FA 1AW2A 4NJGA 1LOLA 2NZLA 5DXXA 1H7NA 1LLZA 3MMTA 5BNKA 1W0MA 1I2OA 3L66A 4K7YA 3W84A 2ALDA 2J6XA 1JVNA 1KTCA 3PG9A 3B8DA 4NNAA 2J24A 4FNUA 3ZWSA 3DKJA 4GE8A 1HUVA 4LV9A 2V2CA 4UIOA 3O06A 2W0UA 1T8XA 4H6KA 4QISA 3UYCA 4DXVA 3BGGA 2C6QA 4AVFA 4Z08A 3GXPA 3HF3A 5DBTA 2AGKA 4GC4A 2VFHA 1HO4A 5AYYA 2WQPA 2YW3A 4JGDA 3QH2A 5F1VA 2DZSA 1VQTA 5KINA 3UQNA 1G4EA 4QNWA 5EY5A 1TYGA 1Z48A 4JX5A 1TPDA 4ZQPA 2I14A 2FJKA 2B7PA 3LTPA 2NX1A 2H6RA 4Z1DA 3Q37A 5FF4A 2JKEA 4S2BA 3GZ3A 4DELA 3BPWA 3NOEA 4AF0B 1JUKA 1OX4A 1WOAA 1O4UA 4WY0A 4ZL1A 1OK4A 3MYPA 3C6CA 1G4SA 5K4ZA 2JK2A 1W8SA 3NXFA 3F4WA 1SR9A 4O0ZA 4FEZA 3WJXA 1WDWA 1Q6QA 3OEXA 3M1ZA 3THQA 1AW1A 3W7GA 4UTHA 2E5BA 2J9YA 4O11A 2VFFA 4FIQA 3INPA 3CIXA 1VR6A 5EMUA 1JR1A 3RFAA 3N73A 1SZEA 1XCFA 3CTLA 1TTIA 1ME7A 4XUGA 1V5XA 1K7FA 1JCLA 4AWSA 5LGXA 1A5AA 4MY9A 4WX2A 3ZS4A 1I2PA 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2E6FA 3QF0A 1G4PA 3L67A 2QCEA 3CU2A 3M5VA 1XL9A 2CLOA 4EOUA 1CW2A 3G3DA 1I2RA 3CLMA 2GUUA 2A4AA 1JCJA 1VPXA 1LORA 4OGZA 4O53A 2ATSA 2C1HA 4MIMA 4UTTC 3W72A 5HJLA 2VEIA 1F7BA 3QYQA 2FLIA 3M0ZA 1SUXA 1X1ZA 2G96A 2GQ9A 3O15A 4BK9A 3MHFA 4DPQA 1UASA 1WAUA 2DZXA 3FYPA 4BR1A 2FQIA 1EWDA 2Y62A 4LVFA 1PHWA 3W7LA 3CQ0A 2ZQ0A 3R5EA 2QCHA 4WXYA 1OFOA 4U28A 3EWUA 3NM1A 4ALDA 5FF3A 1Q3NA 5HWNA 4UNLA 1TPUA 3S0CA 3NPWA 2QUUA 4FXRA 4JR5A 3ABOA 4NUWA 2NXIA 1O5KA 3IIZA 5HQEA 3FJ6A 5ABTA 3U8GA 3HG4A 2ZZ5A 3M44A 5HR7A 4XBSA 5D33A 1SZNA 3TA6A 1DJNA 3F4NA 3WJWA 5IBXC 1TQXA 3TC6A 3LHTA 2E6AA 3ANYA 5DLCA 2TMDA 4MOZA 3MBDA 3TJXA 3NQ7A 5L9FA 2R8WA 4O13A 1KW1A 4AHOA 3QSTA 4DF0A 4BI7A 4DBDA 2QCMA 3HGRA 4E38A 2DJXA 3GK0A 2ZZ6A 4RJEA 2BTMA 2FB2A 5CZ0A 4WOZA 3IIVA 1EUNA 3QMRA 3TSMA 3O63A 4TMCA 1K8ZA 2UV8G 1FCUA 3C2FA 3ZFHA 4MVAA 2Y7EA 1JRCA 4JYEA 3RNDA 3QQ0A 2WNQA 3KRSA 5HNRA 5AHLA 1JCMP 3W7EA 2I1OA 1EUAA 1LZOA 1EB3A 3T40A 2GVGA 3W2MA 4DO5A 4HT3A 4FNQA 1XM3A 2QF7A 2ZZ2A 3MYOA 2Q3RA 4O52A 5D30A 2TPSA 4Y8FA 5LGZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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