1WXJA

Crystal structure of tryptophan synthase a-subunit with indole-3-propanol phosphate from thermus thermophilus hb8
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
257
structure length
239
Chain Sequence
MTTLEAFAKARSEGRAALIPYLTAGFPSREGFLQAVEEVLPYADLLEIGLPYSGPVIQRASELALRKGMSVQGALELVREVRALTEKPLFLMTYLNPVLAWGPERFFGLFKQAGATGVILPDLPPDEDPGLVRLAQEIGLETVFLLAPTSTDARIATVVRHATGFVYAVSEVKDLVRRIKARTALPVAVGFGVSGKATAAQAAVADGVVVGSALVRALEEGRSLAPLLQEIRQGLQRLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Thermus thermophilus
publication title Crystal Structure Of Tryptophan Synthase A-Subunit with Indole-3-propanol phosphate From Thermus Thermophilus Hb8
rcsb
molecule keywords tryptophan synthase alpha chain
total genus 91
structure length 239
sequence length 257
ec nomenclature ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date 2005-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00290 Trp_syntA Tryptophan synthase alpha chain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1wxjA00
2D73A 1SR9A 4A2SA 1IIGA 5I3IA 4Z0JA 3GDLA 1IGSA 1YDOA 4O50A 3DFPA 3UWVA 3OVRA 1G4EA 3DU0A 2ZFAA 4DQWA 3THAA 4HPXA 4ORIA 3U8GA 1YTEA 5LNVA 1AL7A 5EA9A 1ME8A 4P61A 3VKJA 1H7PA 1LOQA 1T0OA 3QFEA 1BWLA 1Y0EA 3KVLA 3P67A 1XI3A 4QAIA 3FKRA 4WJEA 1GTEA 2J9ZA 1TV5A 2YX0A 1DHPA 3TV8A 3PUOA 1L6YA 3QMRA 1FWNA 1OYBA 4AF0B 3IVSA 3A5FA 1QAPA 3W7EA 2B7QA 4HSOA 2CZ5A 5GVJA 5D33A 5HNRA 1G6CA 2ZDRA 4YMZA 3DENA 1PHQA 2WSQA 3MO7A 5G2WA 3W7CA 3UZ5A 2FLIA 1GVFA 1KA9F 3LHUA 1EB3A 3NPUA 4XQ6A 1W5NA 5D37A 1VYSX 2QF7A 3W2JA 1TPH1 4C1KA 1PVNA 4E0CA 1TPB1 1QCWA 1FUYA 1SO5A 3PB2A 3I6RA 4GUJA 2J6XA 3W85A 2ZZ7A 2QUUA 4LRSA 3W2LA 1SQ7A 3FJ6A 3G1DA 3M5VA 3C2OA 1V7YA 5H2ZA 1C29A 1SZNA 3W1TA 3W73A 3LLFA 2I9EA 2PE4A 2ZCGA 2YXGA 2CLMA 5DY2A 4M7SA 5KITA 2C13A 5HINA 1VLWA 4JX5A 1I2RA 3S42A 3W1PA 1PE1A 1OFDA 4RJEA 3IIZA 3FS2A 2YYTA 2GUUA 1KW1A 4LUIA 3NOEA 2VEMA 5I3GA 3BARA 1YLVA 1GVOA 3W86A 4P2VA 4O28A 3M5YA 3S5ZA 1GEQA 1I2QA 3PBYA 3T4CA 4NQ1A 2TMDA 3R8RA 2RDTA 3I65A 4HKPA 4JTSA 2ZRVA 1SO4A 3KRSA 3B0UX 5G2HA 4FEZA 1NSJA 2CLFA 3QMSA 5CKSA 4LOCA 2VFHA 3BG3A 2PRMA 3TFCA 2BSLA 1WDWA 6ALDA 1CX9A 3GNNA 1KTCA 3GR7A 1HFBA 3C52A 4UFIA 3W9ZA 3W72A 1GOXA 2ATMA 5F2MA 4ORMA 2E1DA 1Q45A 3ABSA 3F4WA 4LVBA 3W1MA 2ZRUA 4LRTA 3QSTA 4DBDA 5I3HA 3EWZA 3PB0A 2QAPA 2BX7A 3FYPA 1PL9A 5C5YA 1LBMA 1OF6A 1XBXA 3PUEA 2C19A 3W7KA 2E5DA 3TQ0A 2P1FA 3M9YA 4ADUA 2B7PA 4I9AA 4UTUA 3TK7A 4N6EA 4RZ4A 4BWLC 3UQNA 4A3UA 5FF2A 3FOKA 3IGXA 2FDSA 1KM4A 2O7SA 4CQ8A 2V5BA 2XN0A 3U6WA 1DORA 5BMWA 3UNDA 3M43A 3ABRA 5IBXC 3R89A 3GKFA 3WJSA 4KFNA 1Q6LA 1IIHA 2NV2A 5DCBA 1W5OA 1VCGA 1YXYA 1P0NA 3CEPA 4BI5A 5K9CA 3IIPA 4WY0A 3SIZA 2HTMA 3GDMA 5DBTA 1QFEA 4WUIA 4WZHA 3N19B 4GWEA 4FF7A 3ZWSA 3O16A 1KV5A 2FPVA 2I14A 3O6CA 3S9YA 4AHPA 5DELA 2V2DA 1GWJA 1EEPA 5CSRA 3NQGA 2I1OA 3EWWA 3W1LA 2NV1A 1WOAA 3CWOX 5LNUA 3BG9A 3NQFA 2G97A 2JGYA 3PG9A 1OF8A 4TMCA 2FB2A 3G1FA 5BRBA 3EB2A 3CEUA 3B04A 1L6SA 2QCDA 3UZJA 2X16A 1RQBA 5FF3A 3P5YA 3N9SA 1DBTA 1OJXA 3STFA 3G3MA 2X1SA 4JTJA 4PA8A 4M6PA 3FLUA 4L4MA 3E12A 4A29A 4HNTA 2ISSA 4JTGA 5K9XA 4JIPA 1QO5A 5K4XA 4S2BA 4EF8A 5J5DA 3TROA 1FX6A 2JKPA 1YXDA 3O63A 1W0MA 1YTDA 1AW1A 1UB3A 3LM7A 1LM1A 1XDLA 2YW4A 3W74A 2NXGA 4GFSA 1LRTA 3WK1A 1TPUA 4LNYA 3NL5A 4UFJA 4N9EA 5IBXA 3OG3A 5FI8A 4AWTA 1J5TA 1SZGA 5AHNA 3W1UA 3N9RA 1OX4B 4YCPA 1QPNA 3L68A 1S5VA 1KM1A 5F1UA 3M47A 3M41A 1NF0A 3QEZA 4XBSA 4MJMA 2PCQA 2RKXA 3N14A 1VH7A 5C55A 4JTTA 3L5AA 1Z41A 5CPNA 3BGGA 2CWNA 2X1RA 2P0OA 4UTMA 5K7JA 2ZRWA 3TMLA 2YZRA 3GK0A 3TA6A 5AC7A 2QEZA 4HNVA 3G8RA 1IXOA 3IIVA 1XFBA 4POCA 4WD0A 3CB8A 4NNCA 1F05A 4TX9A 1TTIA 4O17A 1MEWA 4MZ8A 4NXSA 3W7OA 5G4WA 3TIMA 1H62A 4O8RA 1ICPA 3H54A 1KFEA 2ATSA 1JJKA 4FIQA 3HGJA 2WOQA 2RHGA 2VFIA 1OFAA 1OFRA 3LX9A 3KAOA 4M19A 4CCEA 3TJXA 5BOOA 4M7TA 2FB3A 2VENA 5FEXA 3NQEA 1VR6A 5D2TA 4O0KA 3OVPA 4X9SA 1DQXA 2DZWA 3P60A 1EWDA 1SW0A 3GKAA 5CSSA 3TSBA 1H63A 3GDTA 1QO2A 2VFDA 2ZRZA 2Y63A 1M6JA 2C18A 3O06A 3LLDA 3O6YX 2WV8A 4ZQOA 3DHFA 2QJHA 3IGSA 4K6AA 4O4VA 5TIMA 2NX9A 5BMXA 2JKAA 4NNAA 3TQKA 5DBUA 4ZMGA 3LRLA 1FCVA 3PWAA 3M5XA 1R2RA 3F03K 4JD4A 3W70A 5HWJA 1R30A 3NGJA 4KWVA 2EGZA 3TNOA 2QKFA 3S6DA 1GVRA 4FXSA 2Y7FA 2Z2UA 1VCFA 2WNZA 3VE7A 1DJQA 3YPIA 2R91A 3MW7A 1U83A 1GVSA 1FCBA 2A21A 2DZVA 1W54A 4IMEA 3GX9A 3MP3A 4LC8A 5AFDA 2YPIA 3W1XA 4NU7A 3CLMA 4LW7A 1JVNA 3JR2A 4B5NA 3EEGA 5K9DA 4I7WA 2V0TA 3BG5A 4IJBA 5AB3A 2IQTA 3GAYA 4JX6A 5C6MA 1SUXA 5AHEA 3ATYA 4MLJA 2ISVA 2WNQA 3V1PA 1GYLA 1XBYA 1JUKA 2Y7DA 1JQVA 3EX1A 4ONVA 4GBUA 2A0NA 4ALDA 3R12A 1PHWA 3LV6A 3LGEA 1TPFA 4DF0A 3HQ1A 2QR6A 5ABTA 2Y88A 1WBHA 5CZTA 5G2IA 2V9DA 3M44A 1LBFA 1ZNNA 4IMDA 3OEXA 3N34A 1DKWA 2FIQA 3OBKA 3F4NA 1LTDA 1KM6A 4GJ1A 1FXPA 5CPLA 2NUXA 1KTNA 4O14A 2VC6A 5HQEA 1G7VA 3T44A 4FHAA 2VEKA 1FBAA 1RQEA 3GVGA 4IX2A 2A5HA 5C54A 3G1XA 4JS3A 3BK0A 1XDMA 3V75A 4U4MA 4AWUA 3E0IA 5FESA 3SGZA 4NJKA 5SWUA 1JCXA 1LROA 2J9YA 1VLIA 3BV4A 3DFTA 4LS2A 3IVTA 3NNTA 2JGQA 3DH7A 3GNDA 5FF7A 1DOSA 4RKAA 3UY7A 5DCDA 1ZY9A 1F6PA 3TE9A 4ZQMA 4BI6A 1LOSA 3W1AA 1WBJA 4K7VA 3UY8A 1I2NA 3LI0A 4GUHA 3NL2A 4X2RA 3W76A 3W84A 3NQ8A 4A21A 3EX3A 4BF9A 3CQ0A 3JRKA 5F2LA 2QDGA 4JY9A 3UXAA 1FCUA 4IXXA 3CPRA 4DPPA 1AW2A 3P61A 1CW2A 3C3NA 2WPBA 3RLUA 4O1AA 1QPRA 1W3IA 1H60A 1I8JA 3IVUA 3AO0A 3HPXA 3MP4A 4O19A 5KZEA 4PCFA 2GPTA 4BFAA 2Y85A 4RLIA 3PUDA 3TDFA 1PS9A 3NQAA 1VC4A 1RR2A 3R2GA 1Z48A 3IIOA 3S5OA 3KOFA 3MYPA 2W79A 1HL2A 5FEZA 4KWWA 4M5PA 2J9XA 4GXMA 2Y7EA 1KFLA 3O07A 1ML1A 3QW4B 2YCEA 1TYGA 2Q3RA 2Y62A 3EKLA 4PC8A 1FQ0A 1KLYA 4KKXA 4O10A 5A5WA 1KM0A 1W5PA 2UV8G 3TAOA 3KRUA 4XKYA 5U4NA 3GZ3A 4RX0A 1LYXA 4WY0F 2DZUA 1D3GA 1TB3A 4H6KA 3TCEA 1G4PA 4JEQA 5MHBA 3WJYA 1BKSA 3DGRA 1OG0A 1T99A 3DKJA 2B4GA 3QZEA 5I3FA 4O18A 1G69A 2A6LA 3PULA 5D09A 2AGKA 5AYYA 1VJIA 1XKYA 2ZBTA 4N9DA 3ZR4A 1H7RA 4AB4A 5HWMA 3TC6A 4IMCA 4LVDA 1VS1A 2DJLA 3KRZA 4UFHA 1B4EA 2GJNA 2E6AA 1TREA 4O0ZA 1YXCA 3W1NA 2Q8LA 5EMUA 2QUVA 3EWYA 1OK6A 3L5MA 1TIMA 1BTMA 3W87A 1MZHA 4Z08A 2H3DA 4DBEA 3QQ1A 2RDWA 3P80A 2ZYFA 3LRKA 2X1TA 1TPDA 1LCOA 4OU1A 1WOBA 2XFWA 3TMQA 3VFLA 3IRDA 2ZTKA 4WOQA 1XBZA 3NPVA 3INPA 4K36A 3MI6A 3WJXA 2E09A 3O05A 3TSMA 4D2JA 2OCZA 4O4WA 1A5BA 4PL2A 2NUYA 3DI0A 3NQVA 1LLWA 2YYUA 3NA8A 2OZ0A 1KV8A 5AOUA 3VE9A 1TPVA 3FJLA 4LVAA 3HPSA 1I2OA 3G1HA 1W5MA 4WQ6A 1JCNA 2Y7GA 3PY2A 3G1YA 5LKYA 3W2KA 1EX5A 7TIMA 2RH9A 2BXVA 4TIMA 3C2VA 3A24A 3WK2A 3T7VA 5FF4A 3S1VA 3DFQA 3MUXA 4XWUA 5F2GA 2C1HA 5HJLA 4CNOA 3DKLA 2V2HA 1Z44A 3NXFA 3EWUA 2JBMA 2CLOA 4LT9A 1NAL1 4YCOA 1LOLA 3BLEA 3S8HA 4O57A 3GIYA 4O1BA 1X8FA 3RFAA 2TSYA 3UWZA 2C16A 2E68A 1XCFA 1DL3A 4R33A 3PAJA 4JTUA 4O54A 4BI7A 2ZZ1A 4PH6A 3LHWA 3NQDA 4UCGA 1S5TA 1I2PA 1YADA 1TCDA 3PBUA 3UXDA 4TMBA 4O53A 3S5YA 1QPOA 4UFKA 1PCWA 1W31A 4Y90A 3RNDA 2QCCA 4MJZA 4N4PA 3QPYA 4MUZA 1WA3A 5F4WA 3UWYA 4UNKA 3RLVA 1TTQA 4DF1A 1O60A 4XBKA 1KFBA 4X3ZA 1K3UA 3UYCA 5K4ZA 3TW6A 1K7XA 2NZLA 5I3JA 1JR1A 1H51A 5HMSA 3RK8A 4L4LA 3P82A 3QSRA 3W2MA 3E96A 1F6KA 1DVJA 4N9CA 3OHIA 1W3TA 1OK4A 3LCFA 1H1ZA 5EPDA 3LCWA 5CZSA 1JUBA 1MXSA 2F84A 2WJZA 3QC3A 2EF9A 4QNWA 3W23A 3LI1A 3H55A 1TTJA 4WXZA 3W71A 2CLEA 1EPXA 2WNNA 3BW3A 1F76A 4JYDA 3LB0A 1X7FA 2YW3A 5AC6A 2F7FA 1AL8A 1H1YA 4KFOA 3QRHA 5D30A 1QR7A 3O6DA 3OA3A 3THQA 2DP3A 5IM51 3W88A 1MEHA 3EXSA 3LBCA 3P81A 4AHQA 4AEOA 5HWNA 1FCQA 2C15A 5D2YA 3STCA 5DN1A 1QWGA 2PURA 4I7UA 4A22A 4W9TA 1TMHA 1OYAA 4LC6A 3ELFA 1FDYA 2BZNA 1GVQA 2V30A 2Y89A 3RMJA 1EP1A 1JRBA 1R2SA 3G0XA 1EIXA 3MP5A 2X1UA 3MWAA 1JCJA 2V5LA 2E5BA 3TFXA 3IV3A 3M1ZA 1RV8A 1XBVA 4RZ5A 4NJIA 2NUWA 3IIXA 3VNDA 3BGJA 5LNRA 1GJPA 3NQ7A 4QIUA 5CPMA 2Q3OA 3G1AA 3PS7A 5D2XA 1KFJA 1K8XA 4IQLA 3O15A 4MIMA 4UMCA 3TH6A 2QCLA 3CIWA 2ZA3A 2CLIA 2Q8ZA 4DF2A 1J4EA 4BWLA 4NXKA 3Q2DA 3OVQA 1H61A 2QDHA 5K2ZA 5A8GA 3GXNA 3TKFA 3EX2A 2G5WA 4CNPA 4ZZ9A 3TU9A 4DXVA 2NXIA 3W7DA 2V81A 4UNLA 4BR1A 3D0CA 3TW7A 4QITA 4XTIA 3MJYA 3RU6A 3CC1A 3F1QA 1M7PA 2VFGA 4Q33A 1KBIA 5EL1A 1B4KA 4RK8A 4O52A 1QOPA 4CCCA 3PR2A 2A7NA 4TO8A 4EF9A 4GUGA 2A2IA 3UWQA 3K30A 2NX3A 4QM1A 5HUPA 3QH2A 2DU2A 3C4UA 1W5QA 1VQTA 1R2TA 2RFGA 2ZRYA 4RZ6A 2FFCA 1XXXA 5H91A 2ALDA 3QPZA 4JTKA 4O1DA 5CZ0A 4M6VA 2DZTA 1F5ZA 3HF3A 3MI2A 4FB7A 3LDVA 2WO5A 1B57A 4PFMA 4JDBA 1JRCA 2E6FA 2Z0IA 2QCGA 3ANYA 5DXXA 3HG4A 4IX0A 3SSJA 2OX1A 1EP2A 1BWKA 2DJXA 2CLHA 3S1WA 1FWTA 3C2RA 4JTEA 4OWGA 4C1LA 1FWRA 3LXAA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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