1NP0 | Genus

Total Genus 7

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	7
sequence length	53
structure length	53
Chain Sequence	ALWPLPLSVKMTPNLLHLAPENFYISHSPNSTAGPSCTLLEEAFRRYHGYIFG

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Hydrolase
molecule keywords	Beta-hexosaminidase subunit beta
publication title	Crystal structure of Human beta-hexosaminidase B: Understanding the molecular basis of Sandhoff and Tay-Sachs disease pubmed doi rcsb
total genus	7
structure length	53
sequence length	53
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date	2003-01-16

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	1np0A02
3.30.379.10	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	Chitobiase; domain 2	Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like	1np0A01

4E8CA 4AIEA 1GOKA 2CITA 4JL1A 4PTXA 1MW3A 3MUZ1 4OJYA 1UWUA 4RL3A 3VD9A 4ZFMA 1TE1A 4RE3A 3ARRA 1CWYA 1A3HA 1NH6A 2ZXDA 1H1NA 1HL8A 1OM0A 3AQUA 3MV01 3WFLA 1QHOA 1CXLA 1BGGA 2WK2A 5LYRA 4LYQA 3ZR5A 5C8BB 3CMGA 1E6PA 4HZ7A 3VD4A 1GHSA 3EMZA 1P6WA 1CXFA 1US3A 3VUPA 2EPMX 1QPKA 4PN2A 2VZUA 3WF4A 5C71A 2DIJA 4YHGA 3BGAA 1A47A 4EANA 2J47A 1PX4A 4IM4A 3A6OA 4AD3A 1C7TA 1V02E 3CZLA 5IHSA 3CIVA 3UCQA 1TG7A 3LPFA 4BF7A 4HPHA 4S3JA 2JF7A 1W91A 1TZ7A 4AXNA 1W1TA 3VKKA 1TMQA 3OA5A 1QW8A 1E5NA 1GQLA 4OBRA 4C7FA 4JKKA 3TTOA 5A6JA 1EQPA 1PX8A 4PMUA 3RO8A 1B3YA 2GSJA 2XG9A 2VZVA 5AY7A 9CGTA 1QNQA 3KWXA 2J79A 4D6GA 2EPKX 3BCFA 4MAZA 1F4AA 3L2MA 1KWGA 1XGZA 1LG2A 4MAVA 5E6ZA 2PWEA 3VPLA 2GK1A 3UR7A 3IANA 1QI0A 2YL9A 2BVTA 4MNLA 4TTUA 3FAWA 3EBVA 4DM2A 1KCKA 2JIWA 1LL4A 4GI9A 2UY5A 1C7SA 1QI4A 3OLGA 1H49A 4FF5A 5ECUA 2BFGA 1UWSA 1NWUA 1C92A 1EO7A 2A3BA 3QR3A 4AW7A 2EQDA 3W0KA 2ZX7A 1QNPA 4WLCA 4AC1X 2BY1A 3WBEA 1OB0A 4C7GA 3CLWA 4MB5A 3L4VA 2WMHA 2XFRA 5E09A 4W8LA 5EFDA 3EDKA 3ZT5A 3AS1A 4AZBA 4TUFA 1HJSA 1WDQA 3KE0A 1XD1A 3RMEA 3MKKA 2VX6A 1Q6GA 2E9MA 3BMWA 2BVDA 1WB0A 4AZCB 4Z2IA 3WD0A 4JFTA 3EDEA 1UA7A 4HA3A 1ISVA 4JFVA 2YL8A 3W26A 4DUVA 4CD7A 4UFLA 1GJUA 2EJ1A 5M5DA 5A8QA 1OINA 2DSWA 1E70M 3NCOA 2A3HA 3NJ3A 3FNDA 4PMRA 4AZGA 2XUCA 3AHZA 3VM5A 5IFTA 4UZSA 3PN8A 1PIFA 1E6QM 3TP4A 1GQKA 1XV8A 4HMCA 5LA0A 5LA2A 2OWWA 4C7DA 2O9TA 2EPLX 3J7HA 3PTKA 3L4UA 3SUSA 1RPKA 1VFUA 4HA1A 2WMFA 1JZ8A 5E6YA 4ZXOA 1JXKA 4GPNA 2W91A 3WN6A 2PC8A 1HN1A 2WC7A 1AQMA 2YBTA 1Q4NX 4EAMA 1JDCA 3RJYA 4L4PA 4RE2A 5HPCA 1XH1A 3K8KA 4PMNA 3WL1A 5A2BA 3A4AA 4C91A 2ZUMA 4AZIA 3UETA 2ZX9A 5A6LA 4AD0A 2QF8A 2WAGA 5BCAA 5I6SA 4AD2A 2ESCA 3VIHA 5A3HA 4BCEA 2DT0A 2F2HA 3FW6A 1V0KA 4IPNB 3UG5A 1UG6A 2J7CA 2WVSA 3AFBA 3OZOA 3ZOAA 3FY1A 4BQ3A 1WCGA 3SCOA 2WZIA 1HP5A 3RM8A 2X0HA 3POHA 4JCLA 2FDMA 3GXIA 4M1RA 1VEOA 2D1ZA 3ARSA 5CGMA 1H0GA 1V6WA 5AC5A 4XZWA 2G8ZA 3PTMA 1VEMA 3SCRA 4QLKA 1DWHM 1CBGA 4UNIA 2ZIDA 4P7NA 1M7XA 5E0CA 1RP8A 4D6FA 1J0HA 4IUGA 1UD4A 4J7RA 2ZX6A 1WDPA 1HJUA 3CMJA 1QOXA 2XM1A 3VGBA 4W86A 1JXJA 2XVLA 5A8NA 1B3VA 1U2YA 1K9TA 1VF8A 2WWDA 3FN9A 3WMCA 2WM0A 2X2YA 4U3CA 4P8WA 1OCQA 1KCLA 1E40A 3VDBA 3U7VA 5FD0A 1UH4A 3AIEA 3ZJ8A 4E4PA 2OSXA 2VMFA 3NSXA 4ACZA 4TTGA 2O9PA 2WZHA 3VOCA 2QLYA 2WW5A 4MPKA 1M53A 4HA4A 4HP5A 3D3AA 3ALGA 4FLOA 2E8YA 1GONA 2CERA 5A94A 5I2UA 3BMVA 4PCTA 1MW2A 1GQIA 1GOMA 1TCMA 1GVIA 1MXGA 2XIBA 3GH5A 4GQRA 1FH7A 4B15A 4PMXA 4MTVA 2FGZA 2JIEA 1NWTA 4GI6A 1FHLA 2VZSA 4PUEA 3WD1A 2Y2WA 2D22A 3SURA 1HT6A 3WQWA 1MQRA 3T2OA 1QBAA 1V08A 4AZHA 5DFAA 1AVAA 1C8QA 1E6SM 4CVUA 1E3ZA 2PWGA 4ZE4A 3HU7A 3PZUA 2OWXA 3W53A 1J10A 3OLDA 1J0ZA 2WLYA 2VR5A 3L2LA 4FLSA 4GZJA 5BXTA 1KGWA 1ZBVA 3ECQA 1EGZA 4CD6A 1BLIA 2WSKA 3BSGA 4A3YA 4Q7NA 2FHFA 4WKFA 3AXIA 1UR1A 5IFPA 1JZ2A 3RM4A 4UOZA 1E4IA 4PYSA 1CXEA 1OGGA 5EB8A 2CBUA 1VEPA 4H8VA 2DSVA 4UR9A 4AZ7A 2Y4SA 4YPJA 1NARA 1DWJM 3VIKA 1KR1A 2WCGA 1ISXA 1DWAM 2ZUWA 1CLXA 2UY2A 1ISWA 5E0FA 1N82A 1VBUA 2X8RA 2VX7A 1QNSA 2WC3A 3N9KA 1ITXA 1BTCA 3SCTA 3RIKA 3M6DA 4W85A 1OWQA 3THCA 1GVYA 4L4OA 3GNOA 4D6IA 5BWFA 3WH7A 1DWFM 4PSRA 1V0MA 1W1VA 3W81A 4S3KA 3IAQA 2CBVA 3AYSA 1PBGA 1TVPA 3WDRA 3WDPP 1UD5A 1MQQA 1EDGA 4CCEA 3AHTA 2WVVA 1LJYA 3CGTA 1CEOA 2FHCA 4N42A 2YIHA 5I23A 2WCAA 3VO0A 1E43A 4D6EA 1OGBA 3RJXA 2WWCA 3WENA 1HXJA 2X09A 3EMQA 3G6LA 4EE9A 3CH9A 5CSYA 2ZUNA 4DWSB 1NM9A 4W7VA 4M56A 1DHKA 3DYOA 3KEHA 2XWEA 2VZTA 5LA1A 4BQ2A 1AQHA 4CD5A 1VFOA 2Z1KA 3NYDA 3T09A 1NQ6A 4P7RA 1VFMA 5D8ZA 5AYBA 1V3HA 1TUXA 2XVKA 3AISA 3EDJA 5M17A 1V0NA 1D2KA 2WHLA 2J7GA 3AICA 1Q6FA 3AIQA 1V0LA 3IJ9A 1J0IA 2CCRA 4QDMA 3WQ8A 1QHZA 2VRQA 3WH5A 1UOKA 3ZJ6A 3AIWA 3IK2A 1B9ZA 4D6CA 1XSIA 1BVZA 1V6VA 4ACYA 5KEZA 3GXMA 2WVTA 3CBWA 3AIVA 6TAAA 2W5FA 3I3BA 3QGVA 4J3SA 3WSUA 1LWJA 1PPIA 2GDUA 1EOKA 5D9OA 1PZ2A 3T0AA 3EDFA 2WCSA 3WFZA 1ZS2A 4F9DA 2DH2A 3GBDA 1UUQA 5A1AA 2FH6A 1JF5A 2C8NA 4TXEA 4J3VA 2CBJA 2BXYA 3ARZA 4JFUA 1FOBA 2XYLA 1BF2A 2BXZA 2CHOA 3A4XA 1U30A 2VNCA 2XVPA 4IPLA 4PMDA 5JIPA 4MB4A 5A6AA 2EPOA 1OGSA 5M3WA 1ODUA 3MMWA 3VM7A 2QHAA 4GIAA 1RP9A 3CHCA 2WMKA 3ARWA 4JIEA 2QMKA 4OBSA 1WKYA 2JE8A 5BRQA 2CESA 3M7SA 4RE4A 1E6NA 5E9AA 5JBDA 1X6NA 3SCQA 2W63A 3VMPA 4H04A 1BPLB 4F79A 2V3DA 2VX5A 2YA1A 1KWKA 4H8HA 4JHOA 1WZMA 2UY4A 4GXPA 1X6LA 3AI0A 1EDQA 2NT1A 2WHJA 3PZMA 2XTKA 1B3ZA 1HKMA 2J75A 4OZOA 4AEFA 1FP9A 2YL5A 4BQ4A 2YA0A 3WF3A 3WDIA 2EEXA 4AEEA 3B9EA 1SYTA 1XYFA 1CIUA 3MO4A 1E0XA 5BRPA 4W87A 1GCYA 3WY1A 2DQXA 5TD4A 3T0BA 3WD3A 3TTSA 1I1XA 2D2OA 4QLLA 5EFFA 4OKDA 1WZKA 1K9EA 2BHZA 4P8XA 2EBNA 5A6BD 2ZWZA 1HVQA 2VT0A 3T08A 2BNJA 4NF7A 1G9HA 3MV11 3OGVA 1ZBCA 3WF0A 1B31A 3MMUA 4AYSA 2V3GA 5D9MA 1CGYA 2D0GA 4QFUA 1KXQA 1CDGA 1MWOA 3M46A 1XCXA 1H41A 3W6MA 1US2A 1BHGA 3TA9A 3FHQA 4JZ5A 1BGAA 4WKHA 3T2QA 4HOZA 3CZGA 2J25A 3WNNA 4JHZA 2FGLA 1UR0A 3KZSA 3II1A 3N04A 2CIPA 4F8XA 3PBGA 3SCVA 2XIIA 2CHNA 3FXYA 5D4YA 1PX3A 3CZ8A 2XPKA 1GOOA 2X05A 1SFSA 3CHFA 1V03A 3N11A 1B0IA 2WKGA 3VNYA 1JYXA 2HVMA 4HU0A 1SMDA 5JBEA 5BROA 2F8QA 1GW1A 3ZJ7A 1RD6A 2VTFA 4E8DA 3ARYA 4NRRA 5A2AA 1J0YA 5CPTA 4DWSD 3VDAA 3AS3A 2GK1B 4JKMA 4HPGA 5DO8A 2CBIA 4M80A 3VGHA 1K6AA 3SCNA 1DEDA 2OWCA 1WZLA 1ZL1A 5EMYA 1J0KA 5CLWA 1VIWA 2ZUSA 1GPFA 1Q6DA 3AZRA 3OGRA 4PBGA 2DPEA 1QVBA 4HZ8A 3NSMA 1BYDA 2YDQA 5GNXA 1J11A 3AXXA 2YDSA 4UCFA 3HMCA 4CUCA 2O9RA 1BYAA 3GXDA 4Y7EA 2PBOA 4M24A 5A2CA 3A3HA 4BQ5A 1E0WA 4KRUA 3RM9A 5D8WA 4FMVA 3CUJA 3OB8A 4H8UA 4QCFA 1QNOA 3W29A 2WMIA 3VIFA 2E40A 4E2OA 4WF7A 1FH8A 2VQTA 3AMDA 3AOFA 3GTNA 4MJ2A 4NRSA 4ZENA 4W8AA 2W61A 4N0RA 2V5CA 4PMVA 5AYIA 1UD8A 2XSAA 1UWIA 1UKTA 1GZJA 4LQ1A 2CKRA 5CPQA 3WD4A 1JNDA 3SEPA 4W84A 3CO4A 4W5UA 2E9LA 4ATLA 4PMZA 4FLRA 3N13A 1JFHA 2AAAA 1D3CA 5BXSA 4OOUA 3WELA 3MSDA 1XH2A 1Q6CA 1UD2A 5IXEA 4CKQA 1BVNP 4D71A 2Y8KA 1UA3A 5I24A 3VX1A 1FFRA 1UKSA 1HJVA 1OIMA 5A95A 4ATDA 1UHVA 2W4XA 3JUGA 3ZT6A 5D9PA 4BS0A 3W25A 5I79A 2G41A 1HF6A 1KXVA 1B30A 1EH9A 1EXPA 3MUIA 1JIBA 2G4FA 5GNZA 1PAMA 1GOIA 2CPUA 3AJ7A 6CGTA 3K8LA 2BY0A 4KMQA 1FA2A 1OBAA 2RGMA 1GNXA 3TTQA 1W9UA 4M82A 5FKYA 2OYKA 4D6DA 3WEOA 2BHYA 3WBAA 4MNJA 4D72A 1FH9A 1E6ZA 1KR0A 2DIEA 3L4ZA 4UOQA 4PEEA 1XSKA 4UOJA 3MS8A 2D3NA 3MANA 2VQUA 2JEQA 2XGIA 2ZE0A 2J7DA 1W3KA 5BXPA 4GQQA 1KXHA 3A47A 4P8UA 1VENA 2WVUA 3B9AA 3EMCA 2EPNA 4W5ZA 1JL8A 3OBAA 1HKIA 2J4GA 3DYPA 3CZJA 4ML4A 2G3JA 1UYQA 2J74A 2NSXA 5KZ6A 2AMGA 3CUFA 1GORA 3CUIA 1R85A 1E6XM 3WQ5A 5HDRA 4ACZB 5ABEA 1WO2A 5ABGA 1QBBA 3WMBA 3K4AA 1NP2A 2VC9A 3CHEA 4QAWA 3ARVA 3WH6A 3VMOA 1V6YA 3PZ9A 7CGTA 1O7AA 2W67A 4X9YA 1B2YA 4D1IA 3AHVA 3ZMRA 3MU7A 1CPUA 2XHYA 4J3XA 3FHAA 4WIWA 3APGA 4NSBA 4X0NA 4U2ZA 2O9OA 4UQ9A 5I0DA 3K8MA 1RH9A 3LPGA 5A8MA 2PWFA 2XWDA 1OT1A 3GH7A 1E6RA 2C0HA 3W24A 1VAHA 1E0VA 1R7AA 4XUYA 5HPOA 3WNMA 3AZSA 2PWDA 2XFFA 4YHEA 3WL0A 4DUXA 1JYNA 1K9DA 1HL9A 3CZKA 2WHMA 1J18A 3CHDA 2J8FA 4B3LA 1DTUA 2VL4A 4TOQA 2ZX5A 4LX4A 2E0PA 1VJZA 2VURA 4Z2JA 4NI3A 1V6UA 4V28A 1ZJAA 3SUUA 1CGWA 4XZBA 2D20A 2J8GA 2FHBA 4B9ZA 4D6JA 3ARQA 3CPUA 4UQCA 2JALA 3NDYA 3NSNA 1U33A 5CQ1A 3VDCA 3RPMA 3MSGA 3WEMA 4A3HA 5ABFA 3VX0A 5ABHA 4AMCA 3ZSSA 4Q22A 2BY2A 1JNEA 2VOTA 2XFYA 3VNZA 2WNWA 3AIBA 3L4TA 3PZIA 5I3DA 3SUTA 2GJXA 1KQZA 1WDRA 3U5UA 3IAPA 3ZJKA 3OLEA 2PI6A 3BLPX 1ISYA 4B3KA 1IT0A 1KXTA 3BAKA 4Z2KA 1G94A 1ZJBA 5IHRA 5FCZA 5DT7A 1K9FA 2X1IA 1CXHA 2WSPA 1E71M 4AIOA 2DDXA 4CD4A 3W6LA 4W8BA 1OIFA 2XGBA 3IJ7A 4BZYA 3VGEA 1KBBA 1W9BM 4F66A 1XYZA 1B90A 1KGUA 5CLTA 1HJWA 1XH0A 2WVVB 3VILA 2AOSA 4H2CA 1JDDA 2BY3A 1H2JA 1M04A 3F4VA 4OOZA 2XVGA 1J0JA 3GDBA 1C90A 4JKLA 8CGTA 1TR1A 4GZIA 1WPCA 3GM8A 1XD0A 5CG0A 3UG4A 4TVUA 4KWUA 3VD3A 5I5RA 3AIUA 2J7EA 2D3LA 2J77A 1FFQA 3GNRA 3RDKA 5I77A 4GINA 1XC6A 3WQ4A 1H11A 1YHTA 1ESWA 1TVNA 3W38A 5DF0A 2WPGA 4J28A 1FHDA 1SR0A 1WP6A 4JAWA 1JFXA 1CGUA 3WKZA 4CGTA 4U2YA 1QW9A 3VIJA 1CYGA 3NUKA 3AHYA 4AD5A 3WDJA 4AISA 1SMAA 1BG4A 1R87A 1LQ0A 3WDQA 1CECA 1V3JA 4GZEA 1TA3A 3QOMA 3FAXA 1C8YA 4M29A 2BHUA 4MDPA 1B1YA 4WKAA 1UR8A 2BS9A 4JFWA 5HNNA 1E9LA 4JCMA 1HJXA 4UQEA 4UFJA 3DHUA 1GOQA 4LYRA 3OGSA 4GKLA 2ZXBA 1CGXA 1NWRA 1ZBWA 1AQ0A 2OSYA 1I1WA 2J7HA 3BH4A 1W1PA 2DT2A 2WHKA 4AY1A 5BXRA 1KFWA 2GVYA 2BV9A 4WJXA 1W32A 2WBKA 3BSHA 3F5KA 1IZKA 3VD7A 1W9XA 1LL6A 4MDOA 3U5YA 4Z2GA 1D7FA 3L4WA 3CUGA 3K4DA 1MW1A 1JZ6A 3BLKA 2A3EA 4KGJA 4CCDA 4LGXA 4CU8A 4C90A 1EIBA 1OD8A 2Z1SA 3U7BA 3WH8A 1L0PA 3W37A 5FIPA 2GJPA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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