2XVPA

Chia1 from aspergillus fumigatus, apostructure
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
310
structure length
310
Chain Sequence
FSNLAIYWGQGPNQLRLSHFCQETSLDIINIGFINYFPDMSPGHWPGSNFGNQCDGSVYVTNDGVVTKLLSGCHQIMEDIPICQAAGKKVLLSIGGAYPPDQSILSEDSAVAFATFLWGAFGPVAEGWEGPRPFGDVVVDGFDFDIEHNGGFGYATMVNTFRQYFNQVPERKFYLSAAPQCIIPDAQLSDAIFNAAFDFIWIQYYNTAACSAKSFIDTSLGTFNFDAWVTVLKASASKDAKLYVGLPASETAANQGYYLTPDEVESLVSTYMDRYPDTFGGIMLWEATASENNQIDGAPYADHMKDILLH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Aspergillus fumigatus
publication title Natural Product-Guided Discovery of a Fungal Chitinase Inhibitor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CLASS III CHITINASE CHIA1
total genus 99
structure length 310
sequence length 310
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2010-10-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 2xvpA00
1CLXA 3II1A 1GQLA 4DWSD 4E8DA 1VBRA 2CESA 3RCNA 4W88A 5BRPA 2J75A 4D6IA 3EDDA 3KL5A 1ZJBA 3OLEA 3WD0A 1JZ3A 2OWXA 2NSXA 4BQ3A 4AMCA 4D6EA 3U7BA 2XWDA 1KXHA 1W2VA 3OLGA 3LPOA 5EFFA 3CUIA 3CUHA 3TONA 4DUWA 1C91A 4DWSA 2J74A 1WZAA 3SIMA 1E56A 4KMQA 1JDCA 4W84A 3VGHA 5IFPA 2D24A 2UY4A 3AIVA 1VFMA 2GDUA 2VURA 3VX1A 1MFVA 3LPGA 4X0VA 4CD5A 2WSPA 3F4VA 4UQCA 1FOBA 2EPKX 1NQ6A 1N82A 1NP2A 3KEHA 3OG2A 2VRJA 3VIFA 5FL0A 1DTUA 2G3IA 2V3EA 1W3KA 1KGXA 2XWEA 1E72M 4B16A 2WCSA 2GVYA 2WB5A 1QNPA 5BXSA 1D7FA 1W9DM 1ZU8A 2E0PA 4MNJA 4CN4A 3KE0A 4OBSA 2VVSA 1E4IA 3A6OA 3NIYA 3IANA 2CEQA 1F4AA 3F5LA 1W3LA 2J4GA 3W81A 4OBRA 1HF6A 3HMCA 1I1XA 4E4PA 1JI2A 4D6GA 3AIBA 3T2PA 1FH9A 3CZEA 1B3WA 3MUIA 4D72A 4F9DA 1O6IA 3GH4A 3GNPA 5A94A 4D1IA 3W82A 1BFNA 2WC3A 4GKLA 3VOCA 2Z1KA 1LL7A 1QNOA 4JCMA 1E5JA 1SYTA 2VMFA 1CXKA 2CETA 2WWCA 1QNQA 3SUSA 3L4UA 1I1WA 1V0LA 3POHA 5D8ZA 3WDIA 3OZPA 1CXEA 3MO4A 2WMFA 4AYSA 1SFSA 3U7VA 1L0PA 3QOMA 3M7SA 3DYOA 2WHKA 4RE4A 1UKSA 1C7TA 2DSWA 2IXVA 4PTMA 3AFBA 1WZKA 3VIPA 3N9KA 4PMXA 1HN1A 1JYNA 1ITCA 1V02A 4H04A 1MXGA 3AIWA 1JG9A 4PMOA 4EK7A 1BLIA 1Z32X 5A8NA 4LXFA 4F8XA 4MAZA 4J3SA 3VILA 2ZXAA 2WC4A 4HA1A 1CIUA 2DSUA 2BVYA 3SEPA 3VIGA 3AIEA 2AOSA 4W8LA 1WCGA 3EBVA 3SCTA 4ML4A 4D6JA 3WNOA 1X6NA 3BCFA 1V6XA 1NARA 4FLSA 2FHFA 1UWQA 1V6VA 4LYPA 4P7QA 3WDJA 4JHOA 1UH3A 2D23A 4LPCA 1OM0A 2C0HA 4TX8A 3W6MA 5GPRA 1MFUA 3ARVA 1V0KA 4EAMA 1M53A 2VNCA 4YPJA 2W67A 3CZGA 1V6YA 3T0BA 4TVCA 8A3HA 3VIOA 1C8XA 1CBGA 1XHGA 2HISA 4PTVA 5LA0A 3SCNA 2VCCA 4P8XA 1E6SM 3WF3A 2VQUA 4H7VA 2VX5A 1MQRA 4ZFMA 1JZ4A 4F79A 3ARRA 1DHKA 5FCZA 2CHOA 2BY1A 3MSDA 3VNYA 1CGTA 4QCFA 4CU6A 3HN3A 5A6LA 2OSXA 1S46A 3K8LA 1GJWA 4H8UA 2UWFA 2D1ZA 1E5NA 3M46A 2C8NA 4PUEA 2J47A 1IT0A 3VD4A 3K1DA 3BGAA 1E3ZA 2YBTA 5AYBA 2E9BA 1VEMA 2J8GA 5AC5A 1LLOA 2CCRA 4AIOA 1HJVA 3G6MA 1UA3A 3GXFA 3AMLA 2ESCA 4DUVA 3KWXA 3MUY1 3W53A 2D2OA 2WHJA 3WEZA 1OGGA 4PMYA 3ARQA 1QHZA 3VTRA 1EDGA 4UOQA 3AZTA 2FHBA 1G94A 3OB8A 3WUGA 1OCQA 5IHRA 4GIAA 3AROA 4FLRA 2VR5A 4UFJA 1JAKA 2WC7A 5CZKA 4ZXOA 2XG9A 3CUFA 1KXTA 2O9OA 3AS3A 3B8SA 1UQYA 5I0DA 4UFMA 4WK9A 3HJEA 3EMZA 1DWFM 3ALFA 5ABFA 1H41A 1C93A 5HBFA 3RMEA 5CGTA 1Q6EA 3PZMA 3DHUA 1W9VA 4D71A 4J3VA 3BCDA 2WMKA 1BQCA 1V0NA 1H3GA 3SCOA 3MMDA 4M82A 3W4RA 1V3LA 4KRTA 3EDKA 1QPKA 1JDAA 2NT1A 3AHZA 4AZBA 1JAEA 1M03A 4AY1A 1NM9A 1XRVA 2GJXA 2A3BA 3WF4A 4URIA 2YL6A 4U5IA 1HNYA 1TMQA 4WKAA 5A6KA 3U5YA 1PIGA 3W0KA 4HPHA 3QR3A 4WKHA 4Q22A 5CPSA 2CKSA 3WQ6A 2W66A 3IJ8A 4DWSB 5I6SA 4UQEA 1KXVA 2ZX9A 2VCBA 2VX6A 1CLVA 1WKYA 3WDHA 1QVBA 8CGTA 4U5KA 2EEXA 3KZSA 3PTMA 5HNNA 2WCGA 2E8ZA 1JFHA 2ZUTA 1KGWA 1RP9A 3WMSA 3AI0A 1U33A 4L4PA 1UD5A 2PF0A 5BYWA 5A2CA 1E6RA 3UR7A 3BAYA 2V5CA 1PZ3A 4HOWA 3SCQA 5FL1A 5JBFA 2W91A 3UG3A 1UR2A 2BY3A 1TCMA 2J8FA 3RM4A 1G01A 2F61A 2YDRA 1VEOA 1UD6A 4H8VA 4TOQA 2BFGA 4QCEA 1H0IA 3LPFA 2RGLA 2QLYA 3PZUA 4MTVA 3DECA 3EMCA 2D20A 1K9DA 1PIFA 4HP5A 3S2CA 5LA2A 5A69A 4NRSA 4MJ2A 3OGVA 1W2PA 4XB3A 3SCWA 2X8RA 2J78A 1B3VA 4QFUA 2XGBA 4P7OA 3TTQA 4U31A 1UA7A 4U2YA 4CD7A 4L4OA 5I2UA 4F66A 1GQKA 2WZHA 1A47A 3NCOA 2EPLX 3BC9A 3TTSA 4CD4A 1SMAA 5KEZA 1PX3A 4V27A 1UWSA 1ESWA 2PWHA 2D3NA 3WH7A 4BA0A 3G6LA 1WPCA 3VGEA 3WNMA 3WH6A 5M3WA 1QW8A 4UQAA 2ZXBA 1GHRA 1MXDA 3MMWA 3WH9A 1UD8A 3GNOA 1B3ZA 4UNIA 4WSJA 2PB1A 3BLPX 3WDQA 1KR1A 1TA3B 5C70A 2WMGA 5ECUA 3ZR6A 4QLJA 3AXIA 1JGIA 2B31A 3VIJA 1ZJAA 3AIQA 3FXYA 4J7RA 5BWFA 1CENA 5CSUA 1R85A 4NZCA 2QMJA 2YBUA 2VC9A 1V3MA 2EJ1A 1MW3A 3A4AA 3NDZA 1HXJA 2OYMA 1YHTA 5JIWA 3PZTA 1VRXA 2XSAA 3IAPA 2ZICA 1J01A 3PZ9A 1UR0A 1XH1A 4UZUA 3CHDA 2JF6A 1CXHA 5EMYA 2X1IA 4B3KA 4OOZA 3CHEA 2YDQA 3FHAA 4IUGA 4CVWA 5HOSA 5D9MA 3AZSA 2A3HA 5DT5A 3RM8A 3UG4A 4H8HA 4P8VA 4BZYA 4ACYA 3I3BA 3ZR5A 3WF0A 1W91A 4A3YA 3VD3A 3QHNA 4W86A 3WUBA 2JIWA 3T2OA 2PWDA 2YJQA 4N0RA 3T2QA 1M01A 1NWUA 4Q7NA 1LF1A 5AYIA 4AXNA 1ODZA 3W29A 4LYRA 4CU8A 1FHDA 3WKZA 5FOOA 2V3DA 2CXGA 1XGZA 4H41A 4IISA 4JIEA 2IUZA 5D9OA 4AEEA 3NJ3A 1V3HA 4JL1A 1E4LA 2BVTA 3AMDA 4X0NA 1V3IA 3I3DA 1W3HA 1JF5A 2CITA 4KH2A 3L2LA 1Q6FA 1AQMA 4UR9A 1E6QM 4GZIA 4KRUA 4M29A 2VVNA 4AZ6A 1J9YA 1EGZA 3AHXA 3GBEA 1FH7A 2OSYA 3WH5A 1NP0A 1VBUA 1XCWA 4UFIA 1GW1A 1WP6A 5M03A 2FDMA 1HJWA 3RO8A 3A3HA 3ZJ8A 1OGSA 3BAIA 1HX0A 4J28A 3BAWA 2GUYA 4ATLA 1C3FA 5D8WA 4JHZA 1KWGA 1HKMA 1PAMA 2V3FA 1BGAA 2DIJA 1KWKA 2X09A 2DT1A 2XTKA 3AICA 2J7CA 1J12A 4W8AA 3VM7A 2WZIA 3ZO9A 4E2OA 4KWUA 2WBGA 4CD6A 5DFAA 5C71A 1GJUA 4AD3A 3TA9A 1X1NA 2RGMA 2E40A 3AMKA 4P7RA 1GOKA 1LG1A 1AMYA 1OD8A 4AZHA 1B3YA 2VRKA 5LA1A 3CHCA 5A6BA 3WEOA 2QV4A 1XH0A 1Q6CA 5GNZA 2Y2WA 3OGSA 4D6FA 5E70A 5CLTA 1UKOA 2YL9A 4PYSA 3W6LA 2DT2A 4TXEA 1KB3A 2D0HA 3AMCA 4AD1A 2XM2A 4W85A 6TAAA 1BVNP 4ZEPA 5CLWA 3GXDA 4MDPA 3DYMA 4AD0A 2ZUVA 3GNRA 4B9ZA 3AXXA 4PMQA 3VIMA 3VVGA 2DIEA 2XGIA 1ISYA 4RL3A 2YLLA 1B90A 4TUFA 1RH9A 1UR8A 1BPLB 4PMUA 4WSKA 1G9HA 1GCYA 3CMGA 2WVVB 1UR4A 1QI2A 1E4NA 1O7AA 2G8ZA 3AS0A 2YOCA 1GQJA 1HL9A 5A3HA 1C8YA 1W1TA 2FH6A 3NSMA 1WZLA 4D6HA 3PBGA 4W5UA 2WMHA 1LQ0A 4HZ7A 1WAWA 4AEFA 5A8QA 3NUKA 1JD9A 9CGTA 5GQBA 1Q6DA 2Y8VA 4HTYA 3AHVA 2VT0A 5FKYA 1OIMA 5E9AA 4UOZA 1JNEA 3OLIA 1ZBVA 1JXKA 5CPQA 2Z1SA 3GXIA 3E1F1 2BNJA 4GQQA 4A4AA 1VJSA 4UFLA 2G3NA 3N12A 4AIEA 1H49A 1ZL1A 2PBGA 3SUUA 2VQTA 3ARWA 5M5DA 1OSEA 3SCUA 2WKLA 2YIHA 2E8YA 1E55A 1MQPA 1E43A 2VX7A 1E3XA 1FP8A 2J25A 3PTQA 3WDPP 1UHVA 3MV01 3WMBA 4CKQA 4WIWA 4P7LA 1E1EA 3PZQA 3CTTA 1RPKA 3CH9A 1W9BM 5A6SA 3IJ7A 3SCPA 1QHOA 1QI4A 5CGMA 1KBBA 3W26A 2GJPA 3AS1A 1UH2A 3WD3A 1DWIM 4U3AA 1PBGA 3EDEA 3B9EA 2CYGA 3CO4A 1GPFA 5CQ1A 1BTCA 3OLDA 4AC1X 2VZTA 4C7FA 3D5HA 3EYPA 1JZ8A 2AMGA 3F5KA 3HU7A 3W25A 2WANA 1V6UA 1CXLA 4HZ6A 3THCA 4CGTA 2BXYA 4M8UA 4GZJA 1FFRA 1UKTA 3VNZA 1HVXA 1XD1A 3AISA 1K9FA 3TTOA 1E1FA 1J0KA 4PMRA 1DWHM 3WSUA 2WM0A 2J7BA 2DSVA 1G0CA 2WCAA 2QHAA 4QP0A 4HU0A 5HDRA 1JXJA 7CGTA 4WJXA 1LJYA 1GOWA 1HL8A 4JAWA 2DGAA 2A3CA 1FA2A 3NDYA 1QBAA 1E0WA 5BCAA 3WFLA 3ZMRA 2WLZA 1QHPA 4BQ4A 3KL0A 1Q4NX 1U30A 3AS2A 2E9MA 5I3DA 1HP4A 2QMKA 3JUGA 3VU2A 6CGTA 1H5VA 2OLHA 2MANA 1CGWA 3T0AA 3ALGA 3VDCA 2CBIA 4OZOA 3W28A 1E6ZA 3IAQA 4HMEA 2XIIA 1WDSA 1TVNA 3VINA 5E0CA 1MQQA 3N1AA 3GXMA 1WZMA 2ZE0A 1JF6A 1E4MM 1WDPA 3T08A 1FH8A 4GZEA 1KFWA 2JE8A 2BY0A 3AHTA 2XVNA 1LWHA 1US2A 3POCA 1AQ0A 3O2LA 4J3WA 3SCSA 1HKJA 1QOXA 5BROA 3ZQ9A 4UQBA 3AIUA 1TUXA 5E0FA 2BXZA 3UESA 1CXFA 3BH4A 3FW6A 4UZSA 5I77A 3UCQA 5GNYA 1QI3A 4M81A 3PZOA 3L4YA 3W27A 4PSPA 2VZUA 4ZE5A 3GYCA 1D3CA 7TAAA 3ARXA 1DEDA 5HPOA 3GTNA 1SMDA 2J7HA 3PN8A 4U33A 1JZ6A 3WNKA 4HZ8A 3WQ8A 4BCEA 5GNXA 2OSWA 3B9AA 2W92A 1W1YA 1MW0A 1UD4A 2YDSA 1EXPA 2JEPA 4GI9A 5A2BA 1BHGA 1CGVA 3TP4A 3BSGA 4W89A 4ZENA 4M1RA 5BXPA 2W63A 4JFSA 4UOJA 4P8WA 1Q6GA 4MJ4A 4D6DA 3DC0A 4PBGA 5TD4A 1W9PA 3WQVA 2CIPA 2VCAA 1PPIA 1J10A 4PTWA 2V5DA 3CHFA 3VD9A 2GSJA 2BVDA 1BVZA 1BAGA 5M17A 4NF7A 1MW1A 1GOMA 2WLYA 4CN1A 5EBAA 2Y8KA 1WNOA 5E09A 1H0GA 4PEEA 1HT6A 3ARTA 2CHNA 4MAVA 4GI8A 2E9LA 1J0HA 4GINA 4AZGA 3FNDA 4W7WA 4M24A 1LWJA 1VIWA 2XHYA 3THDA 1OWQA 4UCFA 3NSXA 3A4XA 1C90A 3L4TA 3SUWA 1GZJA 1NOUA 4OOUA 1GONA 3VDBA 4JKLA 5A6AA 2WHMA 2ZOXA 3FAWA 4AW7A 5D9PA 1EHAA 1GQIA 4EE9A 5C8BB 3ARUA 4DWSC 2XVLA 1CTNA 1QBBA 1ISZA 4PMNA 3UR8A 3AIRA 5DF0A 1VJZA 2O92A 4AZCA 3U5UA 3ARPA 4ATDA 2C7FA 3RDKA 1UQZA 1NOWA 4J3UA 1UWIA 3I3EA 3CPUA 5DO8A 2W5FA 1HJQA 3CBWA 1E40A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1CLX A;  3II1 A;  1GQL A;  4DWS D;  4E8D A;  1VBR A;  2CES A;  3RCN A;  4W88 A;  5BRP A;  2J75 A;  4D6I A;  3EDD A;  3KL5 A;  1ZJB A;  3OLE A;  3WD0 A;  1JZ3 A;  2OWX A;  2NSX A;  4BQ3 A;  4AMC A;  4D6E A;  3U7B A;  2XWD A;  1KXH A;  1W2V A;  3OLG A;  3LPO A;  5EFF A;  3CUI A;  3CUH A;  3TON A;  4DUW A;  1C91 A;  4DWS A;  2J74 A;  1WZA A;  3SIM A;  1E56 A;  4KMQ A;  1JDC A;  4W84 A;  3VGH A;  5IFP A;  2D24 A;  2UY4 A;  3AIV A;  1VFM A;  2GDU A;  2VUR A;  3VX1 A;  1MFV A;  3LPG A;  4X0V A;  4CD5 A;  2WSP A;  3F4V A;  4UQC A;  1FOB A;  2EPK X;  1NQ6 A;  1N82 A;  1NP2 A;  3KEH A;  3OG2 A;  2VRJ A;  3VIF A;  5FL0 A;  1DTU A;  2G3I A;  2V3E A;  1W3K A;  1KGX A;  2XWE A;  1E72 M;  4B16 A;  2WCS A;  2GVY A;  2WB5 A;  1QNP A;  5BXS A;  1D7F A;  1W9D M;  1ZU8 A;  2E0P A;  4MNJ A;  4CN4 A;  3KE0 A;  4OBS A;  2VVS A;  1E4I A;  3A6O A;  3NIY A;  3IAN A;  2CEQ A;  1F4A A;  3F5L A;  1W3L A;  2J4G A;  3W81 A;  4OBR A;  1HF6 A;  3HMC A;  1I1X A;  4E4P A;  1JI2 A;  4D6G A;  3AIB A;  3T2P A;  1FH9 A;  3CZE A;  1B3W A;  3MUI A;  4D72 A;  4F9D A;  1O6I A;  3GH4 A;  3GNP A;  5A94 A;  4D1I A;  3W82 A;  1BFN A;  2WC3 A;  4GKL A;  3VOC A;  2Z1K A;  1LL7 A;  1QNO A;  4JCM A;  1E5J A;  1SYT A;  2VMF A;  1CXK A;  2CET A;  2WWC A;  1QNQ A;  3SUS A;  3L4U A;  1I1W A;  1V0L A;  3POH A;  5D8Z A;  3WDI A;  3OZP A;  1CXE A;  3MO4 A;  2WMF A;  4AYS A;  1SFS A;  3U7V A;  1L0P A;  3QOM A;  3M7S A;  3DYO A;  2WHK A;  4RE4 A;  1UKS A;  1C7T A;  2DSW A;  2IXV A;  4PTM A;  3AFB A;  1WZK A;  3VIP A;  3N9K A;  4PMX A;  1HN1 A;  1JYN A;  1ITC A;  1V02 A;  4H04 A;  1MXG A;  3AIW A;  1JG9 A;  4PMO A;  4EK7 A;  1BLI A;  1Z32 X;  5A8N A;  4LXF A;  4F8X A;  4MAZ A;  4J3S A;  3VIL A;  2ZXA A;  2WC4 A;  4HA1 A;  1CIU A;  2DSU A;  2BVY A;  3SEP A;  3VIG A;  3AIE A;  2AOS A;  4W8L A;  1WCG A;  3EBV A;  3SCT A;  4ML4 A;  4D6J A;  3WNO A;  1X6N A;  3BCF A;  1V6X A;  1NAR A;  4FLS A;  2FHF A;  1UWQ A;  1V6V A;  4LYP A;  4P7Q A;  3WDJ A;  4JHO A;  1UH3 A;  2D23 A;  4LPC A;  1OM0 A;  2C0H A;  4TX8 A;  3W6M A;  5GPR A;  1MFU A;  3ARV A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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