4A3H | Genus

Total Genus 122

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	122
sequence length	300
structure length	300
Chain Sequence	SVVEEHGQLSISNGELVNERGEQVQLKGMSSHGLQWYGQFVNYESMKWLRDDWGINVFRAAMYTSSGGYIDDPSVKEKVKEAVEAAIDLDIYVIIDWHILSDNDPNIYKEEAKDFFDEMSELYGDYPNVIYEIANEPNGSDVTWGNQIKPYAEEVIPIIRNNDPNNIIIVGTGTWSQDVHHAADNQLADPNVMYAFHFYAGTHGQNLRDQVDYALDQGAAIFVSEWGTSAATGDGGVFLDEAQVWIDFMDERNLSWANWSLTHKDESSAALMPGANPTGGWTEAELSPSGTFVREKIRES

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
source organism	Bacillus agaradhaerens
publication title	Snapshots along an enzymatic reaction coordinate: analysis of a retaining beta-glycoside hydrolase. pubmed doi rcsb
molecule keywords	PROTEIN (ENDOGLUCANASE)
total genus	122
structure length	300
sequence length	300
ec nomenclature	ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date	1998-07-22

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	4a3hA00

5D9OA 9CGTA 1JG9A 5CJ5A 2WMKA 3GXDA 1C8XA 1ISXA 2FHBA 1JNDA 1M53A 3TA9A 3W4RA 7CGTA 1PZ3A 1QNSA 1XSKA 1QI5A 1LL7A 1GVIA 3ALFA 1CXIA 2EPNA 4U5KA 1G01A 1BHGA 5A69A 5HDRA 3ZT7A 2D3NA 1MQPA 2DSKA 2Z1SA 5D9MA 3VTRA 1J10A 3ARWA 1BAGA 3RMEA 4E2OA 1QOXA 3WNOA 1JZ5A 3AXHA 2J7GA 1UWSA 1DHKA 3RJXA 2J7HA 2WC4A 2AOSA 4BA0A 2NSXA 5BRPA 2JF7A 4D6DA 4CU8A 1WKYA 4MNJA 3S2CA 3ZJ7A 3TOPA 1GQIA 1W9PA 3NJ3A 4ACZA 1EA9C 1V6WA 3OBAA 3MUY1 2J7FA 3WDQA 4EAMA 1NWRA 1CGTA 1G1YA 1QI2A 2Y24A 2J7CA 4TTGA 2YL5A 4HMDA 1Z32X 4KRUA 4DWSD 1EQCA 2ZX8A 2FH8A 3UEQA 3SCQA 2OWWA 2VR4A 4IM4A 3N1AA 2VZOA 1H1NA 4BQ3A 8A3HA 4U3AA 1JFHA 1ISWA 4AW7A 5CGMA 4IUGA 2A3AA 2EO7A 2DPEA 4FMVA 3SUWA 3TP4A 4P8XA 2IXUA 3VGBA 4TTUA 1V0KA 1KXHA 1EOKA 3GXMA 3AZSA 3DHUA 4GPNA 4M82A 4NZCA 2VQTA 1W9BM 1R86A 1KQYA 1TA3B 2WCGA 1DEDA 4AD2A 2PI6A 2Y2WA 3PHAA 5BXTA 1JZ4A 1CXFA 1YHTA 1GONA 2CIPA 3VGEA 1MXDA 1UKOA 2V3GA 2E9LA 1XYFA 3UESA 1VFMA 3ZJ6A 3TTSA 3W38A 1B30A 5A6BD 1D7FA 3WF0A 1UWIA 3K8LA 1E0XA 6TAAA 3AYSA 1NM9A 1MW3A 1UD8A 2GDVA 4D6EA 2WBKA 3A4WA 2AAAA 3WUEA 2G3JA 3W6LA 4PTXA 1QNOA 1JXJA 4P7QA 1E0WA 1BTCA 5AC4A 3A4XA 3BH4A 2QPSA 2O9RA 1LLOA 1OT2A 4KGJA 3RM4A 3BCDA 5IDIA 1UHVA 1XSJA 3BCFA 1UQYA 3BSHA 1B2YA 4HZ7A 1UWTA 1HX0A 1CXLA 2V3EA 1KQZA 1UR9A 1ZBCA 1KWKA 3BMVA 3L4UA 5A8QA 3WUGA 3UETA 1PIGA 3L4TA 1XHGA 4MB1A 3BSGA 3WENA 2XGBA 3GNRA 4DWSC 5CG0A 1HVXA 1J01A 1DWGM 4YHEA 1HP4A 4HP5A 1BVZA 1H11A 1WDRA 5TD4A 2WC7A 3WQ4A 4GQRA 4P8WA 2XVKA 1H3GA 1KXQA 2VL4A 2G3IA 3MMWA 3S6TA 3VIJA 1E1EA 1UUQA 3OLIA 4HTYA 2CHOA 3AISA 3AJ7A 3AIVA 1E0VA 1TVPA 3CZGA 3HU7A 4H2CA 2OYKA 3AIUA 2CCRA 2XWEA 4CCCA 1A3HA 4F66A 5CGTA 5IHRA 3GNPA 2UWFA 4J3TA 1JL8A 1L0PA 2PB1A 1IZKA 2GDUA 3W28A 4HA1A 3ARXA 2FHCA 4N42A 1SFSA 2VZSA 3U7BA 1EQPA 2WAGA 1PIFA 4ZE4A 5A6JA 2BNJA 1E3ZA 2VVNA 4JKKA 3SUUA 1PJ9A 4GI9A 1ZJAA 3VINA 4B3LA 1HNYA 2YA2A 4RE3A 5A6KA 2ZUVA 5GPRA 4CD5A 4AWEA 4N0RA 4Z2JA 2DIEA 1EO5A 3GXIA 1DWJM 5DT7A 2EPKX 3KL5A 1HJVA 1V3KA 3W81A 4HU0A 3A3HA 4HZ6A 4A4AA 1A47A 2GJXA 3M6DA 4MPKA 3SEPA 1PAMA 2CNCA 3WEZA 3MU7A 1ODUA 4UZUA 2VQUA 1RH9A 1GOKA 3VX0A 4HPGA 3NDYA 4OBSA 4JKMA 1GUVA 1OGSA 1U33A 2G3MA 2QLYA 4J28A 1TVNA 1VAHA 1V6XA 2DDXA 1CECA 4U33A 2VURA 1HIZA 3UG5A 4IPLA 1LF1A 2J7EA 3FAWA 1KGXA 1OB0A 1E70M 4PBGA 4MNMA 4PMVA 4PTMA 4UQBA 1H0GA 3CMGA 4UQAA 1MXGA 5DT5A 5BXRA 4HMCA 2VJXA 3WQ5A 2X0HA 1K9TA 1BYDA 4AEEA 4UOQA 4X9YA 2EBNA 3AIEA 1KGUA 3MV01 2CBIA 1ZBWA 4WLCA 2V3DA 1MQQA 3WFZA 1LWHA 2WXDM 2CBVA 1GJWA 3WUBA 3ARUA 3UR7A 1N82A 1BGGA 4C7DA 3GBDA 4U3CA 4XV0A 1I75A 2ZUMA 1C7TA 2TAAA 3O2LA 1OINA 4ATWA 3VIHA 2C7FA 4E8CA 1V3JA 1LL4A 4JFWA 1ZBKA 3UG4A 4LYPA 3WEOA 2DT0A 6CGTA 2WM0A 5ABFA 3UERA 4W5UA 1E6PA 1W3KA 4OBRA 1ISYA 3AROA 3ZM8A 4AISA 3WQWA 2WMHA 1V6VA 2E9MA 3QGVA 3W53A 1UD2A 2XM1A 3VD7A 5GQBA 2DT2A 3B9EA 1BF2A 1WB0A 1FP8A 1TR1A 5A2AA 7TAAA 4D6CA 3FHAA 1CWYA 2XSAA 1CIUA 1KXVA 4EE9A 2E8ZA 1KCLA 2JF6A 4MJ4A 3AIBA 3PTMA 2DH3A 3MUAA 2W66A 4UR9A 3VIMA 2D2OA 5D9NA 1Q4NX 2MANA 4M1RA 1JAEA 1OIMA 3PZTA 1UOKA 5GNZA 1DWFM 1JGIA 4LYRA 1FH7A 3CO4A 1GQLA 3NSMA 4D72A 3CTTA 4S3KA 1B3ZA 2O9OA 4M56A 4C7GA 3QHMA 1V3IA 2YL9A 4TX8A 3EMQA 3DYPA 5FKYA 2CKRA 1E72M 4PMOA 4AD3A 2WLYA 2YA1A 3ARRA 4P7OA 3ZMRA 4AIUA 5IFTA 1V3MA 2IXVA 4MTVA 2UY5A 4V2XA 1BYCA 5DF0A 3WDPP 4RE4A 4HOWA 4KWUA 3A6OA 1KXTA 1V0MA 3CUHA 5C71A 3W24A 4PMYA 4B3KA 4AZCB 2ZWYA 2Q8XA 3AMGA 3I3BA 3WH6A 1GHRA 3ZT6A 2E0PA 2BVDA 2DSWA 3RIKA 3AXXA 1SMDA 1B3XA 2JIEA 1UH4A 2QMKA 5A94A 2VCBA 3RDKA 1BPLB 2DT3A 2UY4A 5JUVA 2ZXDA 4EANA 2WMGA 4AXNA 4EK7A 3AZTA 4LX4A 5LA2A 3GNOA 4QLLA 2WWDA 4P8VA 4F9DA 1BG4A 2BY0A 3CPUA 3ZSTA 3PZQA 4UFLA 4ML4A 3LPFA 2F2HA 3WNNA 1VRXA 3UCQA 1LWJA 4BCEA 4BF7A 2FHFA 4TX6A 1TE1A 1EHNA 4W85A 3WNPA 3ZJKA 2XJ7A 1H41A 1DWHM 3F5LA 3EDDA 4UNIA 1J0KA 4CVWA 2J79A 1Q6FA 1PEZA 2J7BA 1PX8A 5CQ1A 2EPOA 1O7AA 2C8NA 1NQ6A 2ESCA 3CUFA 2XSBA 1MWOA 4AZHA 2VI0A 4QFUA 3W29A 3L4ZA 2UY2A 1DTUA 4QLKA 2BVYA 4U2ZA 4NF7A 1UA3A 3MO4A 4KH2A 4AZIA 3OG2A 2VOTA 2ZXAA 2D24A 4MDPA 4DUVA 1HXJA 1WP6A 1O6IA 4P7NA 1RD6A 4U31A 3WD4A 5A1AA 1J0HA 5CLTA 1AQMA 4GZEA 5DEZA 3QOMA 1GPFA 1GVYA 3SCUA 4AIOA 1WZKA 1HJQA 3EMCA 2YDSA 2D0GA 1JZ3A 1H09A 1M7XA 1FH8A 1EDQA 3AIQA 4CD7A 4PMUA 2YIHA 2JFEX 4Q7NA 1MW0A 1HKIA 1UWUA 3ZO9A 5HPCA 4HPHA 1AMYA 3MV11 1NOUA 2CBJA 3VM5A 3ARSA 4BQ5A 1UZ4A 1OGGA 1UH2A 4UFJA 3ZSSA 4WKAA 2IUZA 1MVYA 2NT1A 3FNDA 4QLJA 2XHYA 3FN9A 2XWDA 3DYOA 3PZVA 1GOOA 1TMQA 4UFIA 5A6AA 3ARQA 1V6UA 1CGUA 2GJRA 2XM2A 3PZIA 3ARPA 4P7RA 3LMYA 3VUPA 1UD5A 2C0HA 4GQQA 3PZOA 3UG3A 3DC0A 4W87A 3GH4A 5D8ZA 2WVVA 1AVAA 1E4NA 5FL0A 2CXGA 1H49A 4HA3A 4M8UA 2ZWZA 4PSRA 1E40A 2D23A 2W62A 2WMJA 4JZ5A 2PC8A 1LL6A 4LQ1A 4F9JA 5E09A 1JYWA 4JFTA 1CNVA 3TTQA 4JCLA 1RPKA 2B31A 4W8BA 5CPSA 1H4PA 1VEMA 4PMZA 2EPLX 2G4FA 4WF7A 2QF8A 3MKKA 3ZJ8A 2WSPA 1HT6A 4Z2IA 4B15A 1VJSA 5CZKA 2EPMX 2VRQA 3NUKA 4TVUA 4D1JA 2YOCA 3RPMA 3VD5A 4CN4A 3CUJA 1B31A 4KGLA 2YA0A 1XRVA 1EH9A 3VILA 5CSYA 1WDQA 3WF4A 1CGWA 1FP9A 4W8LA 1JF5A 4XZBA 4YPJA 1WCGA 3OGSA 4OKDA 3VNYA 2Y5EA 5BCAA 3WN6A 2WW5A 1V6YA 4QP0A 1G0CA 1QVBA 4QCFA 1W32A 4PUEA 2ZX7A 4A3HA 1B0IA 3GYCA 4AC1X 1OGBA 4UQEA 3TTYA 2QHAA 4CUCA 1J18A 2J77A 1NOWA 3QR3A 1GQKA 1EHAA 3PBGA 3AS2A 4PTWA 3WUFA 3IJ7A 4RE2A 2WZEA 3GXFA 2ZUNA 4D6JA 3CZKA 5BROA 3VPLA 4YN5A 1BG9A 1V3LA 1UR2A 2Y8VA 2E40A 2PWFA 3LPGA 4ZENA 3GZAA 4ACZB 2YJQA 2WVUA 2DSVA 2Y4SA 3A4AA 2WBGA 4DUWA 4PMRA 1B3WA 2XPKA 1TFVA 2EJ1A 2X1IA 1XH1A 5ABHA 2WPGA 5EFFA 3VOCA 2OSWA 1UKTA 5CLWA 2OYMA 4HZ8A 3VM7A 4MNLA 4XZWA 3VIOA 2A3BA 1HN1A 4C7FA 3BAJA 4DUXA 3BLPX 1GZJA 1J11A 4QAWA 1HKMA 1UKQA 4X0VA 3W25A 5EFDA 2ZOXA 4PCSA 2XIIA 3DYMA 1GHSA 2CKSA 2GFTA 2WC3A 5M3WA 3EDJA 5EBAA 4CKQA 4Z2LA 3AS0A 3BC9A 1KWGA 1W3HA 2VUYA 3VGGA 3W6MA 4ATDA 4QDMA 1QW9A 4AD5A 1XSIA 4ZEPA 3LPOA 4GIAA 2EEXA 1W1PA 1BQCA 3ZR6A 2X05A 3G6MA 2J8FA 4HA4A 2W67A 4W7UA 1HVQA 1XH2A 4NRSA 3CUGA 3RCNA 4UFMA 4J3VA 2BXYA 3GDBA 5D9PA 1WO2A 1B3VA 5E0FA 3WH8A 1HKKA 1E9LA 1GOQA 1CEOA 1US2A 4DM1A 5FIPA 3CHCA 2VT0A 1UR8A 1HJXA 4AMCA 4W84A 3ECQA 1VFUA 4JAWA 2RGLA 3BAWA 3AS3A 4AD0A 1CBGA 1AQ0A 3VIFA 1B3YA 2NT0A 3T09A 1QHZA 3W26A 1OD8A 3OZPA 1U2YA 2UY3A 2OYLA 5A95A 2XVGA 1D2KA 1W2PA 5DFAA 3IJ9A 1KBBA 1JF6A 2YDQA 1XH0A 3WL1A 3WMCA 5DMYA 4JFUA 3AMKA 3B8SA 3F4VA 4M80A 3RM8A 3AMCA 3VGFA 1KBKA 1W9DM 3VVGA 2O9PA 4CCDA 2VX6A 1WZMA 2Y8KA 2PBOA 4H04A 2V5DA 4OJYA 2WKLA 3OA5A 4P8UA 1DP0A 1QNQA 4H8HA 1LG1A 4CD4A 1CPUA 3RILA 2G3NA 3I3EA 3A47A 3POCA 1R85A 1W1VA 2A3HA 1FFQA 5LYRA 2NW0A 4PUDA 4TVDA 1HL8A 4GINA 2X2YA 3AIWA 1ITCA 4B9ZA 7A3HA 1UH3A 1UD6A 4FLSA 5AYIA 1OWQA 3IAQA 1ZB5A 2VO5A 4PMXA 2J4GA 2VZTA 4H41A 4W89A 3VDCA 2YDRA 2YL8A 3AMLA 3T0AA 4GKLA 1M03A 1ITXA 4H7VA 3QHOA 1E1FA 4E8DA 2CESA 5D4YA 4GXPA 2J25A 1S46A 4PYSA 1MFUA 1JYVA 1QI3A 3HMCA 1SMAA 2GK1B 4OOZA 3MSGA 1ISVA 3NSNA 4M24A 4MADA 2ZXBA 3AHYA 3BAIA 4R5EA 2ZIDA 3PN8A 2J74A 5F7UA 3SIMA 1X6LA 4OZOA 1W9XA 5AC5A 1M04A 3N18A 3T08A 2XYLA 5ECUA 1F4AA 1GOWA 3GH5A 2G8ZA 3T2QA 1E5NA 4PMDA 1VFOA 2W61A 3PZ9A 1HJWA 3U5UA 4AZBA 4AY1A 4MB3A 3EDKA 1E6SM 3WBAA 3DHPA 4ZXLA 3WSUA 1F4HA 1I1XA 3U57A 1KR1A 4UQ9A 1UA7A 1SYTA 2OWXA 1W9VA 1PPIA 3D3AA 1OIFA 4RL3A 1G94A 5DO8A 3WH7A 4AEFA 4MAZA 1JD7A 2BS9A 3RJYA 3PTQA 4UQCA 5HXMA 1DWAM 2ZX5A 4QCEA 3WF3A 4BS0A 1GOIA 3WL0A 3CHDA 2CHNA 3OZOA 1UKSA 4DWSA 1QI4A 3CUIA 3BMWA 5JIPA 2BXZA 1EOMA 5I2UA 3B9DA 1C8QA 3GM8A 4PMNA 4DM2A 1JFXA 1VEPA 1CLVA 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1E56A 3QOKA 3AXIA 4W88A 1JZ6A 4UTFA 3SCVA 3BXWA 4M29A 3VX1A 1J0JA 4UCFA 3UR8A 1XCXA 1HL9A 1K9EA 1NH6A 3T0DA 4BZYA 5IXEA 2VVSA 3T2PA 3WBEA 2VTFA 5FL1A 1WPCA 1HKJA 1VB9A 4UQDA 2WNWA 3W37A 3EMZA 1V03A 2CPUA 4XB3A 1UD3A 3CZEA 1ISZA 1UKPA 1KR0A 2XGIA 4D6GA 1JXKA 3J7HA 3N12A 2W92A 1E4MM 3MSDA 4CU6A 2GSJA 2VZUA 1KCKA 2EXOA 2WMIB 2WHKA 4V28A 1EO7A 1OT1A 1JZ7A 1W9UA 3D5HA 2VX7A 2YL6A 1E3XA 5HBFA 1JAKA 1Q6EA 4J3SA 3N13A 3FY1A 3FW6A 1EDTA 2FH6A 2VMFA 3NCOA 4GI8A 1BFNA 4CGTA 3K8MA 4HOZA 1AQHA 1CXKA 4FK9A 4IPNB 2WB5A 4OUEA 5C70A 2XFRA 5I6SA 2ZXQA 2BHYA 3MUZ1 4J7RA 1HF6A 5ABEA 1GCYA 4H8UA 1WDPA 1GJUA 2O92A 2QV4A 3WD0A 1CZ1A 1U30A 1JD9A 4MB5A 4PRWA 3OLGA 1SR0A 5AYBA 2D0HA 3IK2A 5A8OA 1I1WA 3KL3A 2VCAA 4UFHA 1E43A 1OBAA 3PTKA 4JFSA 1KB3A 4MNKA 1RP8A 1CGXA 2ZE0A 3SCPA 3ARYA 4PTVA 4TXEA 2J75A 1BGAA 1QBBA 1W3JA 3II1A 1E73M 4FLQA 1OSEA 1W1TA 1W1YA 2WANA 3BGAA 1E71M 3CBWA 1C90A 3PZUA 3WKZA 3WY1A 4WJXA 3WDIA 1BLIA 1JI2A 1BYBA 5E6ZA 1E6RA 1W2VA 1VIWA 3SCOA 1B1YA 3K8KA 2FGZA 2WVVB 5E9AA 2VRKA 2BY2A 3MANA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3GH7 A;  1E6N A;  4JHZ A;  1K9D A;  2DEP A;  2JIW A;  3CGT A;  1WNO A;  2BV9 A;  3WDJ A;  3N04 A;  3WF1 A;  4NI3 A;  1ECE A;  4IIS A;  4W5Z A;  1PZ2 A;  4GZI A;  4U5I A;  2XFF A;  1TG7 A;  3RO8 A;  2D0F A;  2GVY A;  3AIC A;  4UOJ A;  1VEO A;  2W91 A;  1J12 A;  1V3H A;  1QPK A;  3AHV A;  4CD8 A;  2W5F A;  2CBU A;  1R87 A;  3VGD A;  1UZ1 A;  1JDA A;  3AQU A;  3SCW A;  1Y7V A;  3CH9 A;  3EDE A;  3WNL A;  4PN2 A;  2BFG A;  4AD1 A;  2A3C A;  4CU7 A;  1C93 A;  3VNZ A;  1L8N A;  2WMI A;  5FOO A;  1E55 A;  1QHP A;  1UWR A;  3F5J A;  3RM9 A;  4AYS A;  4UOZ A;  3OGV A;  2VCC A;  2DIJ A;  1NWS A;  3CIV A;  5A8N A;  3SCT A;  5HOS A;  4PCT A;  4DWS B;  1C7S A;  3KZS A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4A3HA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations