3FA5A

Crystal structure of a duf849 family protein (pden_3495) from paracoccus denitrificans pd1222 at 1.90 a resolution
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
276
structure length
276
Chain Sequence
GKPCIICVAITGSLPTKENNPAVPITLAEQVESTHEAFEAGASIAHCHVRDDEGRPTSDPDRFAALKEGLERHCPGMIVQLSTGGRSGAGQARGAMLPLCPDMASLSVGSNNFPTRVYENPPDLVDWLAAEMLKYDIKPEIEAFDLSHILQAKRMAGDGRLAGTPYVQFVMGVRNAMPADRDVFDYYIHTVRRLFGEDAPWCAAGIGPSQIVLNEWAISSGGHARTGLEDNVRLDRDRLAPSNAALVGRAVELCEKYERPVATWRQARQILGLRMV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of protein of unknown function (DUF849) (YP_917261.1) from PARACOCCUS DENITRIFICANS PD1222 at 1.90 A resolution
rcsb
molecule tags Metal binding protein
source organism Paracoccus denitrificans pd1222
molecule keywords protein of unknown function (DUF849)
total genus 95
structure length 276
sequence length 276
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-11-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05853 BKACE beta-keto acid cleavage enzyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3fa5A00
3S1WA 5DXYA 4UMAA 4Y8FA 3TW7A 5AC7A 4HPJA 4O0ZA 1GVQA 2WNQA 5G1TA 2I1OA 1IGSA 3NQ7A 4FXRA 4AF0A 4FNUA 4KWVA 3TDFA 4N4QA 3M47A 3W7KA 3GVGA 1PE1A 1YTKA 1KFBA 3FS2A 1W37A 4YLWA 4ZL1A 4UFMA 5LNRA 3N19B 1G69A 3B0PA 3G0XA 3KFTA 4MFDA 2BZNA 5CPMA 4BWLA 1H7OA 2QCCA 1QAPA 2V81A 5D37A 2Y62A 3UWUA 1EP1A 2DZWA 4MYXA 3CQ0A 1LLWA 2C13A 3TAOA 3KVMA 3L5AA 5K3VA 3NL5A 4P61A 1ALDA 3EWWA 1O60A 2R14A 5D03A 2YDAA 1G4SA 2FFCA 3WJXA 3UY8A 1R46A 1W5OA 4LNYA 1W3IA 2ALDA 2JBMA 3R2GA 1TSIA 4IWWA 1UBSA 1D9EA 2TYSA 2FTPA 4NZFA 1XM3A 3RLUA 1JCJA 3THAA 3ANYA 1M7PA 3TR2A 1H62A 2ISVA 4FX6M 1LCOA 3W2LA 1TV7A 3GXNA 3LDVA 3W1QA 3DI0A 5TIMA 4LVBA 2WO5A 4WOZA 3NQ2A 3W88A 4DQWA 3M16A 4G1KA 3KRZA 1LRNA 1GEQA 2PCQA 5D2WA 3NNTA 1NSJA 2C6QA 1WOBA 2YW4A 1KFJA 2ZZ7A 5HUOA 2WOQA 1JCLA 3ELFA 3W7RA 3HG3A 4K39A 5D30A 4UTHA 4JTHA 1TO3A 3M43A 5DY3A 1XKYA 4PH6A 1JQVA 1N7KA 1O5KA 4LV4A 3S42A 1SFJA 3Q58A 4KFNA 1H61A 1G4EA 2XN0A 2GVGA 4K38A 2C1HA 5FEWA 1JCNA 3G1VA 3UWZA 2X1SA 4WY0F 2E6YA 4HPXA 3WJWA 4BI7A 4ML9A 2C19A 2YYTA 4OU1A 2OCZA 2E6AA 1VCFA 1P1XA 1Q6LA 3W75A 1DV7A 1YDNA 3W1XA 3LOTA 4IX2A 3FLUA 1F5ZA 3M7WA 4GXMA 1OFEA 5BMWA 2QCMA 1H60A 3HF3A 5CZJA 4HT3A 3EX6A 4GUGA 1HUVA 5LHFA 1DQWA 1TPWA 2VFFA 1GT8A 5KTLA 2CLLA 3JR2A 5DELA 3NO5A 4XKYA 1GZGA 3GDTA 3O16A 3IGUA 3PG9A 5TQLA 4LC6A 3QW3A 4NXKA 4A2RA 2TSYA 2CW6A 1TIMA 2PC4A 4OV4A 5HMSA 3FA5A 2H3DA 4PA8A 2C16A 4RKAA 4GRSA 3BW3A 2HMCA 1R47A 1AK5A 5AHEA 4CNOA 3ZWTA 2F84A 3CWNA 5HQEA 4UTMA 2QCEA 1QCWA 4EIVA 4JTGA 3A21A 3DFQA 2X1TA 1K8YA 3LX9A 3GDMA 2CLIA 1KFKA 2EKCA 2C14A 2VFIA 4O14A 3NZRA 2WNNA 3NQAA 1GVOA 4UR7A 3LERA 1KM4A 3S1VA 2YPIA 1OK4A 1SZGA 5D09A 5CPNA 3LCIA 5LNWA 2FPYA 4O18A 1XBVA 3LM7A 3QMTA 3W1TA 1TYGA 4MLJA 1TRIA 4FNPA 5FEZA 3LCHA 2Y61A 3UPWA 1T99A 4UTTA 3TQKA 2V30A 1O95A 2YFNA 3E0IA 4K8EA 4M5PA 1VS1A 2E6DA 3PUEA 4UFKA 3DFOA 4O57A 3L65A 3WJZA 2Z6IA 3T4CA 2ZYFA 1QPNA 3MMTA 3A22A 3GYEA 1VCVA 2J9ZA 1C29A 3WJSA 3OEXA 4JXCA 1Q45A 4Z0SA 4FO4A 4Y9AA 4WQ6A 3BVJA 1W3TA 3VI2A 1FWTA 3INPA 5G2WA 4AHOA 4TR9A 3P82A 4NJKA 3UQNA 1THFD 3O6DA 4ADUA 5EA9A 4JY8A 3KRSA 3W83A 1LRQA 3O6YX 1F74A 3HG5A 4UTUA 1HO4A 2QDHA 4TX9A 1MEHA 3BLFA 2A0NA 5FF0A 1ZY9A 4JYEA 2OT0A 3UNDA 4MPQA 3CB8A 5K4XA 1WBJA 3MI2A 5CGQA 3IIZA 4L4MA 3GXTA 1FXQA 4TO8A 3L2IA 2WJZA 3QF0A 3V1PA 3SZ8A 1LDCA 1S5VA 4C1LA 3G1YA 1H7PA 2Y7DA 3RU6A 2VOMA 2FPTA 1DKWA 4K7YA 2CLMA 1C8VA 2ISWA 3W73A 3TA6A 2YSWA 4NU7A 2G97A 3QZEA 2P1FA 4O19A 1MO0A 3Q37A 1UUMA 2ISSA 3BW2A 2ZRXA 1I4NA 2PRLA 3A5VA 1TPC1 2ZDRA 2QCLA 4LT9A 3W1PA 5IBXC 3T55A 1OVDA 4NXSA 4PEKA 4TMCA 4JTTA 3DFSA 3LHYA 1W5MA 3BLEA 2Y6ZA 3RMJA 4LUJA 4O16A 2G5WA 4M6VA 5I3KA 2DJXA 4DEFA 3UXDA 4O28A 3NQGA 3TMLA 1OYBA 1TPDA 3SJ3A 3S0CA 2VFGA 4LY8A 1G67A 3FKKA 3T44A 5EMUA 3HGSA 3G1AA 4YCPA 5KZMA 3HG4A 4ONVA 4M6PA 2QKFA 1IXQA 4OHQA 1JVNA 1P0NA 3CEUA 2TPSA 3W87A 1OABA 7TIMA 2QEZA 3W7DA 4GBUA 4HKPA 4EVZA 4C1KA 5AC6A 2WNZA 1D3HA 3CPRA 1JQXA 2V2DA 1WX0A 2E5BA 3W9ZA 3L5LA 4ZQCA 1W0MA 4IUOA 3EEGA 5G4EA 3TROA 4AEOA 3HPXA 4CNNA 2A5HA 3DFTA 3LBMA 3LCGA 3LXAA 5HULA 2Y89A 4GJ1A 1TQJA 3UWWA 4N9EA 5KITA 2V9DA 3G0UA 3BW4A 5F2LA 1LOSA 5D2VA 1TTJA 2RDTA 1ML1A 2ZZ4A 4WX2A 2E5CA 3QC3A 1X1ZA 3LI0A 4FIRA 1EX5A 2J27A 1J2WA 5U4NA 4S2BA 1OX6A 3ABSA 1QR7A 1SZNA 3PUDA 4XTIA 3M5VA 1F7BA 4O50A 2VEMA 2BXVA 4N9BA 3UZ5A 3W2KA 4JX6A 4MZ8A 5D38A 4JD4A 1KA9F 1KM5A 4N02A 3U6WA 4LVGA 3W85A 3WJYA 3S1XA 4A21A 3N3MA 4O11A 4QAIA 1O94A 3G1DA 5C54A 2NX9A 5BMXA 1KV5A 2A6LA 2WSRA 1GJPA 4K8HA 4UTIA 5I3HA 5LGXA 1QDSA 1TMHA 1BWLA 4MJZA 2E09A 1GVSA 2ATMA 3UWVA 1X7FA 3PR2A 4LV9A 3NQDA 1QOPA 4Z08A 1KM2A 4N6EA 3W7OA 3GB6A 1KM1A 1G4PA 3B04A 1V5XA 4MKNA 3UWYA 3M5XA 3GNNA 4GUJA 4FNQA 5DCBA 3NQMA 1WAUA 3N2MA 3I7QA 3P60A 3PULA 4UUIA 5D2YA 1QPRA 5F2MA 1KFLA 2B7NA 4N6FA 5CKSA 1FCUA 2CLKA 3W7LA 1LBFA 4GUFA 4IPIA 4RXGA 5G2HA 1OF8A 4ADTA 1YDVA 4ZQOA 6TIMA 2W0UA 3SGZA 3MHFA 1JUEA 3B4UA 4O4WA 1TREA 2R91A 3PB2A 1M6JA 4XBKA 3DAQA 3MHUA 4JYFA 4A22A 1NAL1 3QSTA 4O17A 2ZFAA 2E5DA 3T7VA 5CSRA 1UCWA 1KTNA 4O15A 3LCWA 2IQTA 1K8ZA 1OFAA 5D33A 4Y90A 3LHUA 4IMGA 2Z0IA 2J24A 2FB2A 4HNUA 3LRLA 3N73A 3TFCA 1KTBA 3TC6A 3PG8A 4PL1A 3KX6A 1RPXA 5AHIA 1ONRA 2E1DA 1TJPA 3AO0A 3P62A 2CLFA 2GUUA 3NPUA 1L6YA 8TIMA 1EUAA 4QNEA 4Z1AA 3EWBX 2DZTA 1VYPX 2WSQA 5FESA 3TSBA 3W7MA 1LYXA 1XBYA 4IMDA 4MYAA 1SO3A 1I2RA 3LLDA 4RXFA 4GE8A 1FWRA 3FIGA 3WK2A 2I9EA 3G3MA 1MEIA 3D0CA 4KWWA 2G95A 4I7UA 3NL6A 1OYCA 1HG3A 1K7XA 2GJLA 1FWWA 1KLZA 2X1UA 3PBVA 2A2IA 1SO6A 3KXQA 1LBMA 1MSSA 2DP3A 2ABAA 3OG3A 5F2IA 2NX1A 5LNUA 2NV2A 2ZZ2A 4OV9A 4NX0A 4JGDA 5KZEA 4MY8A 2B4GA 3P61A 1LZOA 4JNMA 3NGJA 3LGEA 5BRBA 3HGRA 1K3UA 1F05A 1S3HA 3LTSA 4NNAA 4JICA 4M19A 3CIWA 1GPWA 1AG1O 4X3ZA 3EKLA 3IEBA 4GWEA 1EA0A 3W1LA 3MJYA 1CI1A 1OG0A 1SZFA 4O1BA 3NPWA 1W54A 3M6YA 3RNDA 4IX0A 4WY0B 3DXIA 3HJZA 3EWZA 3KOFA 3DKJA 1XBZA 1Q3NA 1JUKA 3EB2A 4CQAA 2EHHA 2RDWA 3LV6A 3GR7A 3QH2A 1WXJA 3IIPA 1HL2A 3LHVA 4AMAA 3HBLA 1DJNA 1YXCA 5L6UA 3A5FA 5CG7A 4IOTA 5H91A 4JYDA 4OBTA 1LRTA 4AHQA 4MY9A 3FJ6A 3W1NA 2O7QA 2B7OA 1TRDA 3W1RA 3BG9A 2YYUA 4PTNA 2VC6A 2A7PA 3GDKA 1SPQA 1TJRA 1R2SA 5IM51 4JTLA 3HPSA 1LLZA 2HSAA 3STGA 3H53A 1GYLA 2UV8G 3GR8A 3DHFA 5CPLA 3CM4A 3EX1A 3G1HA 1W5QA 2Z2UA 2V2HA 3EXTA 1XL9A 4JIPA 2JGYA 2OMAA 5E93A 3UD6A 2Z6JA 1FXPA 1W3NA 5K9DA 1T8XA 3QQ1A 3IRDA 4O4VA 3C4UA 4UTTC 1GVFA 4I7VA 3LXCA 3TSDA 1H1YA 1OX5A 4UFLA 3EWXA 3GIYA 4WJEA 2CWNA 1EWDA 3PM6A 2NX3A 1QPOA 1EEPA 4DO4A 4DPPA 3FKRA 4Z1CA 4LWWA 4EF8A 1H7XA 1W8SA 2CZEA 3L9CA 5LKYA 3LLFA 2GQAA 2YGYA 1CX9A 3TXZA 4MZYA 3NPXA 3G1FA 1OX4B 1FQ0A 2BLEA 2FDSA 1ZNNA 1TV5A 3W2UA 4OGZA 3MHGA 3C61A 4LVDA 2HS8A 3W1AA 3W70A 4XQ6A 1IXPA 4KFOA 2QCDB 1NFBA 4JEQA 1FCQA 3W7IA 1VLIA 5DBUA 3LCLA 4LVAA 3UYCA 2H8ZA 3GKFA 2DZUA 3NM3A 2TMDA 3LTPA 4Z1DA 2CZ5A 5KSWA 2GVLA 3DZ1A 3HMJG 3EXRA 2V82A 2DZVA 5EPDA 5DN1A 1OK6A 1EB3A 1VCGA 1VYSX 3UWQA 3TU9A 1FX6A 1QNVA 3L5MA 3FEMA 1H50A 5E0KA 3G1XA 1BWKA 4NZJA 3FYPA 1A53A 2QJGA 1NF0A 5CZ0A 2ZTKA 3SW6A 5EKYA 3QYQA 1NF7A 3P80A 3C3NA 1VJIA 1K7FA 1VHNA 3RF9A 3JS3A 1N55A 3W84A 1F6KA 3IGXA 5DXXA 5AHNA 1U83A 2I14A 3OIXA 3M41A 3QW4B 5DCDA 3A23A 1KM3A 2CLEA 4WOQA 3TJXA 1WV2A 3OBKA 3TC7A 2VXNA 2YFOA 3M5ZA 2YX0A 2XN1A 1T0OA 1ZAIA 2EAWA 5F4SA 5L9FA 3P67A 3LRMA 3CU2A 1R2TA 3KHJA 1JCXA 4ICNA 4O1DA 3G18A 3KVJA 1XI3A 3A9IA 3G3DA 2KZHA 2Q3OA 1I2QA 1RZMA 3L67A 4WZHA 1W5NA 1SR9A 3B03A 3LI1A 3QMSA 1YTDA 5LNSA 1A50A 3S5YA 4ZMGA 4CCDA 1MXSA 3TKFA 1LBLA 1NEYA 4AAJA 4X22A 3W7QA 3W76A 3TUUA 1ADOA 1I2PA 5LHEA 1TTIA 1FCVA 4AWUA 3TAKA 3MUXA 3WFAA 1VYRA 2NUYA 2A1YA 3VNDA 5CZSA 1OJXA 3Q2DA 1JCYA 4Q33A 4YL2A 2BWGA 3R12A 4TIMA 3SI9A 1W5PA 4DF1A 1ICPA 4X9SA 5HJLA 1DVJA 1XC4A 1EIXA 2YZRA 1SO4A 4MIMA 2Q8ZA 2ZA1A 2YW3A 1FDZA 3VE7A 4NNCA 4QJ1A 4UNKA 5D2TA 3EWYA 3O63A 3LHZA 3NQEA 5FF2A 4ORIA 2AQWA 2GVJA 4XZ9A 1EP3A 4QITA 1DOSA 1JR1A 3F4NA 5BNKA 4WUIA 1FCBA 3TSMA 3VFLA 3NPVA 1QOQA 5AYZA 4IMEA 1KFCA 2ZRZA 1KBIA 5CZTA 1IXOA 2XN2A 4J9JA 3O1NA 3EKZA 2HS6A 4QSHA 1IF2A 3BG5A 1RQBA 4H4IA 2CU0A 3I7SA 3QEZA 3ZWSA 2Y70A 5A8GA 4JR5A 3TQVA 1GQNA 3PBUA 3P81A 2QR6A 1XCFA 4U28A 5F4XA 3PBYA 1UJPA 4O8RA 3WK3A 4ZZ9A 2GQ9A 4CQ9A 3V75A 2CZDA 1ZAJA 2ATSA 2ZBTA 4K7VA 2J88A 1ICQA 2EPHA 3TQ0A 1GTEA 4O53A 3HGJA 2WKJA 1S5WA 1TB3A 3E96A 1A5BA 4JTKA 5U7SA 4U4MA 1EUNA 3IGSA 5C55A 2NUWA 4B5NA 4DO5A 4LW7A 3OVRA 3LBCA 1A5CA 5K9CA 4JTSA 4H3DA 3W74A 2Y7FA 2FPVA 4IJBA 4NT0A 3NQCA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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