5JBEA

4,6-alpha-glucanotransferase gtfb from lactobacillus reuteri 121 complexed with an isomalto-maltopentasaccharide
Total Genus 309
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
309
sequence length
854
structure length
854
Chain Sequence
MGPGTWENMAFAQDSSAINNIDGYLSYTDWYRPYGTSQDGKTWYKTTAMDWRPLLMYIWPSKDVQAQFIKYFVNNGYENANYGLTKDTVANINKDTNTTVLANMAQNLRYVIEQSIAANKGTSKLANDINSFAATVPELSASSELSLQSMPNYRPDKSGTIDSDQVIFVNNNSKDPRKGNTSYADSNYRLMNRTINNQAGNNNSDNSPELLVGNDIDNSNPVVQAENLNWEYFLLNYGKLMGYNPDGNFDGFRVDAADNIDADVLDQMGQLMNDMYHTKGNPQNANDHLSYNEGYHSGAAQMLNEKGNPQLYMDSGEFYTLENVLGRANNRDNIGNLITNSIVNRQNDTTENEATPNWSFVTNHDQRKNLINRLIIKDHSNIPDIMGSAYKVEYANQAWQEFYADQEKTNKQYAQYNVPAQYAILLSNKDTVPQVYYGDLYNETAQYMQEKSIYYDAITTLMRARKQFVSGGQTMTKLNNNLLASVRYGKGVVDANSNGTDKLSRTSGMAVLVGNDSNMAQQSVAINMGRAHANQQYRNLIDTTENGLTYDADNSENPAILTTDSNGILKVTVKGYSNPYVSGYLGVWVPVISGDQDVTTNASDVVANKEKTFESNAALDSHMIYEDFSLFQPEPTSVENHAYNVIAKNASLFSDLGITDFWMAPAYTPFGRSRYNEGYSMTDRYNLGTTANPTKYGSGEELANTIAALHKAGLKVQEDIVMNQMIGFSGQEAVTVTRTNNRGMQIHVNGQTYANQIYFAYTTGGGNGQETYGGKYLAELQKNYPDLFTTKAISTGVAPDPTVRINKWSAKYQNGTSLQNIGIGLAVKLANGDYAYLNSGDNKAFNTLLPTAIS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of 4,6-alpha-Glucanotransferase Supports Diet-Driven Evolution of GH70 Enzymes from alpha-Amylases in Oral Bacteria.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Inactive glucansucrase
molecule tags Transferase
source organism Lactobacillus reuteri
total genus 309
structure length 854
sequence length 854
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.1.5: Dextransucrase.
pdb deposition date 2016-04-13
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5jbeA02
3.20.20.470 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glucansucrase 5jbeA03
2DSUA 1C7SA 4TVUA 1R7OA 5HXMA 4D6DA 3O2LA 3VIKA 3VNZA 1MQQA 3OLDA 2CBUA 4BA0A 2J8FA 3HN3A 3SCOA 1QW9A 1VEOA 2G4FA 2CITA 2VMFA 3W6LA 3RIKA 2ZOXA 5BWFA 3L4UA 2QF8A 2D0HA 3WN6A 1HT6A 1JZ4A 4D6HA 1QNRA 4D6FA 2WMJA 5A6BD 3AZRA 5AYBA 1I1XA 1PIGA 2VZVA 5A6SA 4OZOA 3F5KA 5BRPA 1UD6A 2E9LA 3U7BA 1FOBA 1J12A 1J9YA 5AC5A 1D7FA 2ZXQA 3WD4A 2DT2A 2PF0A 8A3HA 5HNNA 3VIOA 1H49A 1HVXA 2ZXBA 2BHZA 1V6VA 2VI0A 3NCOA 1WNOA 1G01A 3BGAA 2CXGA 1B3YA 1GOKA 1HL9A 4B3KA 2ZUUA 4E8CA 5A6LA 2ZX6A 1DEDA 3LPGA 2XVKA 4BQ4A 1DWFM 3VTRA 2W67A 1W91A 4DM1A 3ARPA 4RE3A 1WZKA 4J3VA 4B15A 4U3AA 3PZUA 4MB1A 1TG7A 3K8MA 2VR4A 3CLWA 3VIIA 3N9KA 1C93A 4AZHA 2J47A 3GBEA 2J25A 1OGSA 1XCWA 1FH7A 1B3VA 3SIMA 3G6MA 1DWJM 5C8BB 4MB3A 3L2MA 1JD9A 3PZIA 4HZ6A 2XGBA 1K9FA 4QLLA 1PPIA 3BH4A 1J0YA 4F8XA 1R86A 4JKLA 3WMSA 3WH7A 5D9OA 3WDHA 1WPCA 3UCQA 1CLVA 1MFVA 1GOQA 2WVUA 4BZYA 5A2AA 3K1DA 4JCMA 4N0RA 1W3KA 3M7SA 3N13A 4PSPA 3TA9A 2X8RA 5E0CA 5DMYA 4H8HA 4B9YA 2W4XA 1Z32X 5AYIA 1CLXA 1FP8A 2GSJA 3K8KA 5ABHA 3VD9A 3GZAA 2Y5EA 5A8QA 1V6YA 1E4IA 3W4RA 4PMZA 3AIEA 3SUUA 3G6LA 3B9DA 4X0VA 1BGAA 3WQ6A 1HKKA 4QAWA 4M24A 1SR0A 2FHCA 2OWCA 2PC8A 1H3GA 1CXLA 3RM9A 3AIQA 2ZE0A 2VVSA 4ZFMA 1OBAA 2IXUA 3CHCA 2X09A 3SCUA 1UWQA 2D23A 3PZMA 4ML4A 3EBVA 1GW1A 4FLSA 4HU0A 3L2LA 3POCA 2FH8A 2E3ZA 3GYCA 5CPTA 3CUHA 2G3IA 4AZCA 3FAXA 4BQ3A 2XFRA 3OG2A 1CXHA 1TA3A 2E4TA 2J7BA 2V5DA 4W8LA 1S46A 4AYGA 2W63A 1F4AA 1LLOA 3AIVA 3AS3A 4TTUA 2XJ7A 1XH1A 4W7UA 1TCMA 1X6LA 1Q6EA 4D6GA 1UZ4A 4OOZA 1CZ1A 4GZEA 3AS1A 4UOQA 1WDPA 4C7DA 4D6CA 1AMYA 2ZUWA 3BAIA 3D3AA 3ZR5A 4TUFA 3S6TA 2PB1A 2EJ1A 2VZTA 4ACZA 5EB8A 5M17A 2RGMA 1BVNP 3CUGA 5C71A 3ARUA 2Y8KA 1OT1A 3VGFA 2WCGA 3IANA 2CNCA 3BAJA 1G1YA 5CPSA 4AEEA 6A3HA 4GZIA 3OLEA 4ZENA 5CXPA 2AOSA 3APGA 1EDTA 1BLIA 2YA1A 3I3BA 3NJ3A 3AHXA 4HZ8A 3CGTA 5BRQA 3JUGA 3VGDA 2JIEA 2QMKA 3K4DA 3WD3A 4GO9A 3SUTA 3RM8A 3WNNA 4KGLA 1BAGA 3UG3A 5AC4A 2YL5A 4DWSD 4F79A 3VX1A 3L4ZA 1MW1A 1SMAA 1ZS2A 1BHGA 4U2ZA 1XCXA 4QP0A 3LPPA 1V0NA 4N42A 3RO8A 4AC1X 1OSEA 7A3HA 2WC3A 2OLHA 3EDKA 2A3HA 1B90A 3CBWA 1BYBA 1C8YA 1EXPA 1XGZA 1LL6A 1UWTA 4OUEA 2O9RA 2J4GA 1LQ0A 1E73M 1ODUA 3CZGA 4JL1A 3RJXA 4K68A 4HP5A 4LPCA 1NWRA 2VJXA 3VIPA 5FD0A 3OA5A 2WZEA 1GVIA 4AW7A 1JDCA 3SCNA 1KBBA 4UFIA 1MW3A 1VFOA 3RCNA 2IXVA 2D0FA 3MV01 1H0GA 1RPKA 2EXOA 5JIPA 4GZJA 3AHYA 4H8VA 4JFSA 4ZXLA 1OIFA 2J77A 2VTFA 1JYWA 3VIJA 1EOKA 4XZBA 3PTQA 1TVNA 1E6PA 3HJEA 4PUDA 1PX3A 3DECA 2ZXAA 2GK1A 1LF1A 2QHAA 5BCAA 3SCTA 1E3ZA 2CYGA 3CZLA 1D2KA 1FFRA 3WSUA 4GXPA 4CCDA 1ISZA 2VNCA 3GXIA 4CUCA 1QHOA 4OOUA 4W88A 4ZXOA 1W9VA 2AMGA 2JALA 3TTSA 5LA0A 4P7QA 1XH0A 3WH8A 2G3MA 3VILA 5D9MA 1JZ2A 2DH3A 1PX4A 1UR0A 4TX8A 3KLKA 4WKFA 4CD8A 1NWTA 3WDIA 3TP4A 4F66A 1UD4A 1GVYA 2VZUA 3QGVA 1ECEA 3WNKA 1GJUA 2J8GA 1BQCA 1FA2A 5FIPA 1HJXA 1EO5A 3GDBA 4WIWA 3GBDA 5CGMA 1OB0A 2E8ZA 5HPCA 1PEZA 2WBGA 1H2JA 3FHQA 2V38A 1QI2A 2B31A 2A3BA 6CGTA 1J0KA 2PBGA 1FP9A 1NH6A 1YQ2A 3AIBA 3WNMA 1E6QM 1GOOA 1ZU8A 3ZOAA 1J0ZA 4AZGA 2DQXA 1C7TA 5BXSA 3CPUA 3AXXA 3N11A 3N04A 3S2CA 1PX8A 4JFVA 4W7WA 2EO7A 4UQ9A 4CCEA 1JI1A 1QI5A 4MPKA 3QHMA 1HN1A 2WANA 2XG9A 5GPRA 2Y8VA 5A2CA 2O9TA 1TUXA 1BTCA 4RL3A 3WH9A 1E0VA 1MYRA 2PBOA 3II1A 3TTYA 4J3TA 1EOMA 5KEZA 2CHNA 4OKDA 2CKSA 2OYMA 4QLJA 2VOTA 3CTTA 1DWGM 4PUEA 3ARZA 3WDPP 3SUWA 1ZBVA 3QHNA 3SUSA 3WEOA 1V08A 3EDFA 1QW8A 3NUKA 2FHFA 3CMGA 4HA4A 2VT0A 1AQ0A 2F8QA 4D6IA 2D3LA 3T09A 3EDEA 2WVVB 1XV8A 4QCFA 1JAEA 1DTUA 3SCQA 4DUVA 1PJ9A 3OGSA 5C70A 3AS2A 2V3DA 2VVNA 4GINA 1ITXA 4ZEPA 2CESA 1E9LA 3AYRA 1GONA 3WDQA 3PZQA 4H04A 2BXZA 3MO4A 2YJQA 1WP6A 5CZKA 1KGXA 3ZO9A 4J27A 5D8WA 3DYPA 3UERA 2VQUA 2NT0A 4TVCA 3VNYA 1UKPA 1UR9A 2WMKA 3RILA 1WB0A 2EPLX 4FK9A 4GI8A 4AEFA 3UETA 3WQWA 3SURA 1EHNA 1OCQA 3L4TA 1WZAA 3D5HA 3AIUA 3OGVA 1TFVA 3IK2A 3WQVA 4U5IA 1J18A 2J7GA 4KH2A 1UUQA 1RH9A 3KL3A 4Z2GA 1EA9C 1XC6A 4CKQA 2XWEA 3MS8A 1E5JA 3AMDA 1VFFA 4JHZA 5M5DA 3HZ3A 3K46A 4CU6A 2MANA 4AZBA 1WKYA 4JHOA 3AZTA 3VDAA 2V3GA 1C90A 3AHVA 2XHYA 3GNOA 4PYSA 2OSXA 3QOMA 1MWOA 4PMNA 4PRWA 4MNKA 2YBTA 1Y7VA 5I0DA 1V3HA 1HJQA 3EDJA 3WNPA 1GOWA 3WH6A 2BY2A 2G41A 3IAQA 2GJXB 4LQ1A 4A3YA 1QVBA 1PIFA 1U30A 4CN1A 1W1TA 4P8XA 2VR5A 3GTNA 4M80A 2E8YA 4MB5A 2WNWA 3CUFA 3ARXA 4OBRA 3T0BA 3QHOA 1Q6CA 1UWRA 4CVWA 3A3HA 3PTKA 4HA1A 1W1VA 1FH9A 1E56A 2XSAA 4NI3A 2DDXA 2JFEX 4L4OA 2BHUA 5LA1A 3O6AA 5IFTA 3K8LA 1ISYA 2JEQA 5IFPA 1DWIM 2BXYA 5I3DA 1VENA 1H1NA 1WCGA 3CHEA 1B1YA 2AAAA 3IJ9A 6TAAA 1QI3A 4FF5A 4CD6A 2DT0A 4B9ZA 4MNLA 3WENA 2CPUA 1DWHM 3FY1A 2XUCA 1UZ1A 1ZBWA 1UQZA 3UG4A 1Q4NX 4Y7EA 3DYOA 5GNZA 2X2YA 1GUVA 3EMQA 2UY5A 1HJWA 3VKKA 1C8XA 2YOCA 2NSXA 1GORA 2ESCA 4ZE5A 4XZWA 1VJSA 1VAHA 3WD0A 2WC4A 5KZ6A 3TTQA 1VB9A 2DPEA 3ZM8A 3F4VA 3AXIA 2VZSA 2W66A 4UFHA 2DSVA 3BLKA 4QDMA 2J75A 3W38A 4LYQA 2J7FA 4AD3A 3U57A 1ZJBA 1JNDA 2WSKA 1M03A 2YA2A 1UKOA 2PWDA 1L8NA 4GO8A 1BGGA 2WHLA 3OIHA 2V3FA 4H8UA 1H0IA 1CTNA 3WBEA 1B2YA 1KBKA 4W86A 5FKYA 3ZSTA 4NSBA 1NWSA 4U5KA 1ISWA 1LG2A 1ZBKA 1B3ZA 2WHJA 3W53A 4FMVA 2CHOA 3RM4A 3T08A 4UCFA 3N15A 1JYNA 1MQPA 5D4YA 2YBUA 2DSZA 4KRTA 1UA7A 2F61A 5IXEA 1D3CA 4MAVA 1EGZA 2ZX7A 4ATDA 3LMYA 3L4XA 3BAYA 5IHSA 5A6AA 1N82A 4CD4A 1V02A 1FFQA 2IUZA 3WQ8A 4HOXA 2WVVA 1JZ3A 3ARVA 1GQIA 2EPMX 3VIGA 3FNDA 4ACYA 1NOWA 4AIOA 4DM2A 3W82A 1UKTA 2WLYA 1XHGA 4W5ZA 3ZJ7A 2DIEA 3MUIA 1E1FA 3SCSA 2VX6A 4R5EA 5CSUA 1UD8A 1JYVA 4PMDA 3M46A 2BY0A 2VX4A 1OWQA 2J7CA 1NP2A 3IJ7A 2O9PA 2WKLA 5A8MA 3UR7A 1JFHA 4NF7A 2WWDA 1V0MA 1NWUA 4D1IA 1W9BM 4EAMA 3A4AA 3UR8A 2ZUMA 1B3WA 1GQJA 1M7XA 3ALFA 1LWHA 1UKSA 1HL8A 4A4AA 2DSWA 4V28A 1V3MA 5A95A 1E70M 1QNOA 2WCAA 3WUEA 1KGUA 3ZT5A 3VOCA 1V02E 1OD0A 3GXFA 4AMCA 3A4XA 3NSMA 4WSJA 1M04A 1AQHA 1XYFA 1XYZA 1KCKA 2Y2WA 4MTVA 2XVLA 5HOSA 3MMWA 2WKGA 1QNSA 3VIHA 3WFZA 5A69A 1JD7A 1WZLA 4HA3A 4P7NA 2D0GA 3T0AA 5A6MA 2WCSA 1US3A 3VINA 4EKJA 3FW6A 1WDQA 3SUVA 4QCEA 3RJYA 4D6EA 3CUIA 4NZCA 1JAKA 1CBGA 3VDCA 2CKRA 3VD4A 4W8AA 2CBVA 3ARWA 3WF0A 1UD5A 4WKHA 3I3DA 3L4YA 4AIEA 2QV4A 4M56A 4AZ6A 1JZ8A 4Z2HA 3AQUA 3NYDA 1J11A 4UFJA 1E6NA 2W91A 4P7LA 3UEQA 3WUBA 3AYSA 3GXMA 3PN8A 2W61A 5CLTA 3BAWA 2ZX9A 1UYQA 4HOZA 2RGLA 2UY3A 2BVDA 2QPSA 1JDAA 2EPNA 3W0KA 4M82A 3W26A 2VRJA 1MVYA 4WJXA 2YL6A 4AD1A 4HOWA 1YHTA 1QHPA 4EANA 3F5JA 4HPHA 1HIZA 1VJZA 1BYAA 3N12A 4AWEA 1Q6FA 4J7RA 9CGTA 4BQ2A 5E70A 2DIJA 2XVNA 1MFUA 4BF7A 2A3CA 1H09A 3WDJA 5CGTA 1NOUA 1JDDA 1HKMA 5HDRA 1IV8A 1KWGA 3VO0A 2WBKA 4A3HA 1R7AA 5A2BA 3PZOA 3BC9A 1J0HA 2D3NA 1BFNA 2BNJA 1VEMA 4AZ5A 1C92A 2HISA 3AMKA 3WH5A 1KR1A 1C8QA 2DT3A 4Z2IA 2XFYA 3WQ4A 2WPGA 5A94A 1EQCA 2A3AA 2FDMA 3BCDA 4AISA 5HPOA 5ABFB 1W9PA 3U7VA 1XD0A 2WMIB 4MJ2A 2J7EA 3VMOA 1BPLB 2D20A 2YDQA 4BS0A 1E43A 3E1F1 4MB4A 3I3EA 4RE4A 2WZHA 5GNYA 1F4HA 1HF6A 4GI9A 4L4PA 1X1NA 1CXKA 4FLOA 4CU8A 4WLCA 1E5NA 3OB8A 3RDKA 5AY7A 5IHRA 2OYLA 5I6SA 1DHKA 3KLLA 3PHAA 3CO4A 2X05A 1MW0A 1A47A 1E1EA 2F2HA 3AFBA 4X9YA 5I79A 2YLLA 3ALGA 2V5CA 4E8DA 3WDRA 4C7GA 1V3IA 2VQTA 3L4VA 2E9BA 3CZ8A 1TR1A 3AROA 5I5RA 4UQBA 4RE2A 3LPFA 2Z1KA 3ZJ6A 1QBAA 2DT1A 3GH5A 1W2PA 3WL0A 4KRUA 1HX0A 4TOQA 1UR1A 3EDDA 2XTKA 2JEPA 3VIMA 1G9HA 1KXVA 5DO8A 1IZJA 4W84A 1WO2A 5E6YA 3QOKA 2WYSA 1LL7A 4UFLA 4JL2A 2CIPA 2FGZA 1GOMA 4LYPA 4AD5A 5JBDA 1ZL1A 3VU2A 1KXQA 2WW5A 1B31A 5I2UA 3A4WA 2C8NA 1HNYA 1BYCA 4CN4A 1JGIA 4ATLA 3ECQA 5DF0A 1ISVA 7CGTA 2UY4A 1KFWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2DSU A;  1C7S A;  4TVU A;  1R7O A;  5HXM A;  4D6D A;  3O2L A;  3VIK A;  3VNZ A;  1MQQ A;  3OLD A;  2CBU A;  4BA0 A;  2J8F A;  3HN3 A;  3SCO A;  1QW9 A;  1VEO A;  2G4F A;  2CIT A;  2VMF A;  3W6L A;  3RIK A;  2ZOX A;  5BWF A;  3L4U A;  2QF8 A;  2D0H A;  3WN6 A;  1HT6 A;  1JZ4 A;  4D6H A;  1QNR A;  4D6F A;  2WMJ A;  5A6B D;  3AZR A;  5AYB A;  1I1X A;  1PIG A;  2VZV A;  5A6S A;  4OZO A;  3F5K A;  5BRP A;  1UD6 A;  2E9L A;  3U7B A;  1FOB A;  1J12 A;  1J9Y A;  5AC5 A;  1D7F A;  2ZXQ A;  3WD4 A;  2DT2 A;  2PF0 A;  8A3H A;  5HNN A;  3VIO A;  1H49 A;  1HVX A;  2ZXB A;  2BHZ A;  1V6V A;  2VI0 A;  3NCO A;  1WNO A;  1G01 A;  3BGA A;  2CXG A;  1B3Y A;  1GOK A;  1HL9 A;  4B3K A;  2ZUU A;  4E8C A;  5A6L A;  2ZX6 A;  1DED A;  3LPG A;  2XVK A;  4BQ4 A;  1DWF M;  3VTR A;  2W67 A;  1W91 A;  4DM1 A;  3ARP A;  4RE3 A;  1WZK A;  4J3V A;  4B15 A;  4U3A A;  3PZU A;  4MB1 A;  1TG7 A;  3K8M A;  2VR4 A;  3CLW A;  3VII A;  3N9K A;  1C93 A;  4AZH A;  2J47 A;  3GBE A;  2J25 A;  1OGS A;  1XCW A;  1FH7 A;  1B3V A;  3SIM A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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