3MJY | Genus

Total Genus 107

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	107
sequence length	314
structure length	306
Chain Sequence	GSMSLQVNLLNNTFANPFMNAAGVMCTTTEELVAMTESASGSLVSKSCTPALREGNPTPRYQALPLGSINSMGLPNNGFDFYLAYAAEQHDYGKKPLFLSMSGLSMRENVEMCKRLAAVATEKGVILELNLSQVAYDFDAMRQCLTAVSEVYPHSFGVKMPPYFDFAHFDAAAEILNEFPKVQFITCINSIGNGLVIDAETESVVIKPKQGFGGLGGRYVLPTALANINAFYRRCPGKLIFGCGGVYTGEDAFLHVLAGASMVQVGTALQEEGPSIFERLTSELLGVMAKKRYQTLDEFRGKVRTL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Leishmania major
publication title	Novel insights for dihydroorotate dehydrogenase class 1A inhibitors discovery. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase
total genus	107
structure length	306
sequence length	314
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.3.1: Transferred entry: 1.3.98.1.
pdb deposition date	2010-04-13

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	3mjyA02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3mjyA01

2ZQ0A 4XWUA 1VC4A 4DF0A 3LCHA 2VC6A 3PUOA 4LS0A 4IMGA 1H51A 2BX7A 3KRZA 4ZQNA 3H55A 3F1QA 3W7MA 3FFSA 3SW6A 5HUOA 2I1OA 3MP3A 2CFFA 4XQ6A 3CEUA 1JCYA 1L2UA 1WXJA 3LXCA 3QFEA 1XCFA 2FB2A 3HMJG 1IXOA 4JXCA 5G1TA 2DZUA 3BW3A 3B04A 3CB8A 4DO6A 3IIPA 4OBTA 1JULA 1W3TA 3FIGA 3C52A 3FS2A 3O06A 2NXIA 4O1BA 3W2LA 5G5IA 1OYBA 3VCRA 3NNTA 2WSRA 3K30A 3TC7A 3QC3A 5DCBA 4UTJA 4K37A 4Z1AA 3GXTA 4NQ1A 1XBXA 1H7WA 2QCDB 4OHQA 4ZL1A 3TE9A 3STEA 1LM1A 4RV8A 4MKNA 4RZ5A 1JCXA 4BR1A 3W7RA 1VYPX 1TSIA 2A7PA 4AB4A 5A5WA 1I4NA 5LNUA 3C2OA 3IIZA 3INPA 4A29A 4PFMA 1RQHA 2QCGA 1IIHA 1Z44A 5CPMA 2TSYA 4O4WA 1FXQA 4LW7A 5AB3A 5HR7A 4AF0A 3PF3A 4Z1BA 4N9EA 4O52A 3U2OA 3N2MA 4HPXA 3LB0A 1YPFA 2CZ5A 3ELFA 1LRNA 4O54A 1U83A 1D3GA 1JR1A 3TQVA 3KOFA 3PG8A 1FWNA 5D2WA 1PVNA 2V0TA 4NNCA 1O94A 4N9BA 3Q37A 3R2GA 1KFBA 3W6YA 1NF0A 3NL2A 1HFBA 3HBLA 3NA8A 5DN1A 2RDTA 2JKEA 2NUXA 2JGYA 4XTIA 5G2HA 3MYPA 2A7RA 3NQDA 5F1VA 2YYUA 2V8ZA 3WJYA 2CWNA 2Y62A 2A1YA 4O1DA 2VEIA 4XKYB 3C8FA 3TIMA 2WOQA 2GQAA 3RF9A 4K8HA 4AHQA 3IGXA 4HPJA 1TV7A 1QPRA 3O1NA 3W22A 3WJSA 5LHFA 4NXSA 5U7SA 1IXQA 1TIMA 3T40A 5SWUA 1NVMA 5D02A 4LV4A 2E09A 4Q4KA 3S5OA 2C1HA 4N6EA 2QAPA 2NUYA 2YCEA 3ATYA 3KVLA 3TCEA 2W6RA 2PRHA 1ZENA 3CWOX 1TPVA 3P8IA 1WBJA 1LBMA 3DZ1A 1PHQA 4QSHA 5HWJA 4O11A 4DO4A 1K7XA 5DCEA 3W76A 3TK7A 1T0OA 4UNKA 2ZA3A 5KTLA 4FX8A 1ME7A 3NEVA 4FEZA 2I9EA 1PV8A 5FF0A 3BG9A 5DBUA 3ATZA 4OWGA 3C3NA 3LHUA 1V7YA 2PURA 4POCA 4RXGA 1EB3A 3PBVA 1EUAA 3TAKA 3FOKA 1LORA 1LZOA 5K9DA 4MPQA 1O60A 1W0MA 1ZY9A 4LUIA 4WOQA 3ZFHA 2H3BA 5AHMA 4LC8A 1KTBA 1B57A 3CC1A 3W71A 1E51A 3GR7A 4DPQA 4JIPA 5IM51 3IIVA 4WY0B 1C29A 3C61A 3R13A 3W1UA 1QWGA 1LTDA 3HG3A 1AL8A 1O5XA 4K7YA 4QIUA 5D04C 5AHLA 2P0OA 1LBFA 2IQTA 4EVZA 2C15A 2H8XA 3HIJA 3W74A 3UQNA 2HTMA 1DQXA 3IIOA 2GPTA 2GVJA 3SGUA 2ABBA 5LHEA 4M6PA 3C2VA 5AYXA 4UTIA 3TDFA 3W72A 2NX3A 3W1XA 1N8FA 3SY5A 4RK8A 4GUFA 3ZR4A 1OFOA 3WJWA 2QDGA 3EXTA 3R5EA 4FNQA 1PHWA 3TX9A 3LI0A 2ZZ5A 4JTGA 1CW2A 3LLFA 4NT0A 4OV9A 3UY7A 3QSTA 2OX1A 3P60A 3O6CA 3MBFA 1GVFA 2JGQA 3L0NA 1ONRA 4EWND 1LBLA 1EEPA 1VGAA 3W7CA 5TBOA 3THQA 3W07A 3UXAA 2V2CA 2CZFA 4A3UA 5C55A 4IMEA 4UFIA 5AC7A 3G0SA 1LRQA 5I3IA 4JYDA 1H1YA 4AAJA 4EF9A 2NXHA 7TIMA 1NFBA 2QUUA 5KMYA 3WJZA 2J6XA 3R89A 1V5XA 3PY2A 5G2IA 3M16A 4MUZA 3PSWA 3ZWSA 4GE8A 3ABQA 4R7JA 5F4XA 1OFEA 2C13A 1J4EA 1OX4A 4JX4A 4UFMA 3N9SA 4UMBA 4BK9A 3C6CA 1CX9A 2Q3RA 3C2FA 4JNMA 3P5ZA 4NNAA 3T4CA 1U5JA 2FJKA 1VR6A 4QISA 2BWGA 1LROA 1Z48A 3DFSA 4JGDA 5C5YA 2YR1A 4DBEA 1IXNA 2HS6A 3NL5A 3GKFA 3U6WA 1JUBA 3FJLA 3NYZA 1L9WA 1MEWA 1KTCA 1M7PA 3WK3A 3HGOA 2GJLA 1R46A 4MIMA 1D3HA 5AOUA 4MYAA 2OJPA 3HG5A 1G7UA 1VZWA 5K9CA 2I14A 3W7IA 3LXBA 3L68A 5FI8A 3QPYA 1K3UA 3TQKA 4LVDA 3MWAA 1FBAA 4LUJA 5D30A 5I3JA 1XUUA 3NPUA 4KWWA 3QMRA 3B8DA 4QAIA 1P0NA 3NZRA 2F84A 3W23A 2JK2A 3PSVA 4KFOA 1I2RA 2ZRWA 3NPVA 3RNDA 1W37A 4NX0A 2WNZA 1P5BA 2V9DA 1MEIA 2XN0A 1G4SA 1ALDA 4HKPA 2V2DA 3KVKA 2Y7FA 1FY6A 2A2IA 1Q6QA 3W73A 1M7OA 2A7NA 4K8EA 2VFGA 3RU6A 2V2HA 2E6YA 1GQNA 3NVTA 1AW5A 5K4ZA 6ALDA 5D32A 3GX9A 3N2XA 3UZ5A 3M1ZA 4BWLA 4YXGA 3B0PA 5DY3A 1X1ZA 3VE7A 1R47A 5CZSA 1UJPA 2B7QA 3LDVA 3PM6A 4Z0SA 2RFGA 1QPNA 4LNYA 3W1NA 4UTUA 2NWRA 1FQ0A 3L9CA 4AXKA 5LNWA 1YTKA 4JEQA 4RZ6A 3NQEA 4JDBA 1FWSA 3LHYA 3M5YA 4RKAA 3MO7A 4LS1A 1WOAA 3G1XA 2Y70A 5I3HA 3PUDA 2A6LA 3W7HA 5L9FA 2ZTKA 3O63A 1C8VA 2E5DA 1W56A 1LOLA 5DXXA 1FXPA 4M6VA 4E0CA 5KZDA 3WK0A 5F2LA 4W9TA 1H5YA 3EWYA 2G97A 1MZHA 1SFJA 3RFAA 1Z41A 3ZS4A 1F6PA 3GYEA 3M7WA 3N34A 2W0UA 4NZFA 1KM2A 2WSQA 3GNNA 3S8HA 1JRBA 2O7QA 4M7SA 2R94A 4ALDA 3GKAA 3FYOA 5D37A 2CLHA 2WSYA 4N9CA 4XBSA 4E2BA 1TPDA 1EPXA 3L5LA 1BEUA 2Y89A 3LTSA 3PBYA 4TMCA 3W86A 2H90A 3S1XA 5F2GA 3QW4B 2FIQA 3W1RA 4L4MA 4UCGA 4DEFA 5CSRA 1SO6A 3C2EA 1KFLA 5A8GA 3B0VC 2QR6A 2Q3OA 4NJGA 3TU9A 3G8EA 5FEXA 2ZRYA 2A5HA 1SO3A 3HO8A 3SJ3A 3ANYA 4N02A 5J5DA 3QRHA 3SSJA 2VENA 5HNRA 4FB7A 3TFXA 4PL1A 2B7OA 3Q2DA 3NQMA 1JUEA 3T44A 4CNNA 1VQTA 1Q45A 5LZLA 1YADA 4AH7A 1SW3A 1G7VA 3W7QA 3EWXA 4MVAA 5DCDA 3GAKA 1AW1A 2J9YA 4I7UA 1ZNNA 4ZQCA 2YYTA 2WPBA 3TW6A 4WY0F 2PE4A 2CU0A 5EY5A 1XDMA 3FEMA 3KHJA 4YLWA 5I3KA 3W2MA 2P1FA 3PBWA 3IVUA 1PCKA 1SSGA 4LTSA 3HPSA 3P82A 3PS7A 1I2NA 3HQ1A 3BLIA 2ISWA 3DBPA 1TTJA 4MZYA 1SUXA 3UWZA 1SU5A 2G96A 4C1LA 3P61A 1A5AA 2ZRUA 1XL9A 3UPBA 5D09A 3LV6A 4AF0B 2VOMA 1ZJIA 2ZZ1A 4ICNA 5EL1A 1DBTA 3VI2A 1KM6A 2GUUA 3LRLA 4X22A 5EMUA 1FX6A 3S42A 2WNQA 5CZJA 3OIXA 3S5YA 2EPHA 1TTPA 2Z1BA 4WXZA 1RZMA 3W2UA 1VH7A 1VLIA 5D2XA 4UR7A 3LERA 4Y9AA 4JX5A 4CNOA 3P8JA 4IX0A 4KKXA 2Z6IA 3KRSA 4TIMA 4D2JA 2DJLA 4JN6A 1QNVA 3ABRA 3LTPA 3STGA 1JUKA 1G4TA 2Y88A 1GVOA 3W7NA 1YXCA 4Z08A 4MFDA 4NVTA 5FEWA 3GZ3A 3UWUA 1OHLA 4PEKA 1VCVA 4P61A 2CLLA 6TIMA 4UR8A 2DZWA 4M5PA 3NPXA 4O0KA 3A5VA 1VS1A 3SR7A 5H2ZA 3FKKA 4ORMA 3NL3A 4MFEA 2C6QA 2NLIA 4HNVA 3NG3A 1SFLA 2GOUA 5K7JA 1FCVA 4GC4A 5LNVA 3HJZA 3W7KA 4RLIA 2WV8A 5IBXC 2DZXA 3O6DA 1F05A 4GUJA 5E93A 3WJXA 8TIMA 4AWUA 4MYXA 4O53A 3I7SA 5F4SA 3KVMA 4MLJA 1W54A 1XBZA 3MI2A 5C2XA 3NQ2A 1D9EA 4ML9A 2NXGA 2V81A 2NX9A 4NJKA 3BGJA 4A2SA 4MOZA 4GBUA 4I7WA 5LGXA 1W1ZA 3STCA 3NOEA 2YDAA 1K02A 5AYZA 4OQVA 4QITA 1KW1A 1T8XA 3GLCA 3P80A 4PC8A 4A21A 1W5QA 3O15A 4O1CA 3TXVA 3FYPA 3P5YA 4J9JA 3M47A 4N9DA 4IX2A 2Z6JA 3N19B 4JYEA 3CM4A 5CZ0A 3CLMA 4AHPA 3T78A 3DH7A 1OG0A 1VJIA 4WOZA 4BI5A 3LX9A 3NQ8A 2QCDA 3DU0A 3W7JA 1OFBA 2ZYFA 3KVJA 4FXSA 5BMXA 3W7DA 1K8YA 1NSJA 3CQ0A 5KZEA 4Q32A 2ZCGA 3R12A 3G22A 3LHZA 3EXSA 3CU2A 4LU0A 2A6NA 4LRSA 5D2TA 4RZ4A 2A0NA 3HGRA 4AHOA 3EX6A 1G4EA 4O14A 1EWDA 3DAQA 2BLEA 1Q6LA 3PUEA 1R2TA 3QF0A 4BFAA 3SI9A 1KLYA 3TMQA 2Z0IA 2Y63A 3L67A 3E02A 1OJXA 2TMDA 1GWJA 4UTLA 4ZQPA 2QCMA 4PL2A 4X3ZA 1AW2A 1WA3A 3RMJA 3LBMA 2GJNA 3DKJA 2ZZ2A 1L6YA 3HG2A 2V82A 4IPIA 4UNLA 4DQWA 1T96A 1SPQA 1TV5A 1SZNA 4JTLA 4LS2A 3UD6A 3E9AA 5G1YA 5FF2A 3LTYA 4H4IA 1ZHAA 5F2IA 1TO3A 2CLOA 1QDSA 4R33A 1ZAHA 4S1FA 3G1AA 4NJIA 1S3HA 3W87A 1ZAIA 1IGSA 3DFNA 4I7VA 3GDRA 2XN1A 2Q8LA 1X7FA 4ADSA 4UFHA 2VFIA 2WO5A 3RLVA 3L66A 4ADUA 3W1LA 1MO0A 1YXYA 3E0IA 5GVJA 2YSWA 4ADTA 1GVRA 1SQ7A 1VYRA 3BGGA 4FNRA 4OE7A 3EWWA 3S6DA 4GRSA 1SO5A 1OX4B 5G2WA 5AHFA 4FF7A 4NX5A 4RJEA 1PE1A 1KFEA 2CLFA 3C2RA 3M44A 5K4XA 3TSDA 3LHVA 4WZHA 3DFTA 1W5NA 3N3MA 3NO5A 3BO9A 1K7FA 5CPLA 1WX0A 3WFAA 4N6FA 2PRLA 4LT9A 3V75A 1UBSA 3AJXA 1TRIA 2P10A 1K8XA 4RCXA 1KM1A 1QFEA 5KZMA 3WK1A 3EX4A 2CLIA 5FF3A 3A5FA 4WUIA 3TR2A 4CLMA 4DELA 4UFJA 2QCFA 3O16A 3PULA 5D2VA 3OEXA 3NGJA 3TC6A 2O7SA 1Q6OA 1W5MA 4PTNA 1I2OA 3UYCA 1YDOA 4N2YA 4JICA 2R14A 3S5NA 3LGEA 2FQIA 2OT0A 3W88A 5F1UA 5HINA 3UWYA 3LLDA 3MHGA 1GTEA 4FNTA 4OGZA 4L4LA 1A5BA 2ISSA 3MBDA 4Z0JA 2CLEA 4AWTA 5K2ZA 4X2RA 5EBUA 3P67A 1H61A 3A21A 3G1SA 3MP5A 1KM3A 1YDVA 4WY0A 5AC6A 2H8ZA 4UTWA 3CT7A 1BWKA 1BWLA 4EOUA 2WQPA 3DHFA 4IXHA 4LV9A 4PODA 4DXVA 1N7KA 2DZVA 1YYAA 4Y8FA 1PL9A 4E2DA 5D05A 5CPNA 3DGRA 3A9IA 1DQWA 1A50A 1I2PA 3MI6A 2QEZA 3MHFA 4HSOA 2X1SA 5D33A 3PB2A 1TCDA 4NNBA 2YXGA 3TA6A 1S5WA 3FKRA 2RKXA 3PWAA 1OABA 4TX9A 1UCWA 3BW4A 4YCPA 3P62A 4O12A 1F76A 3RK8A 1I2QA 3W84A 2BXVA 1XUZA 4DF1A 4JDYA 2VXNA 4IQLA 2AQWA 3L5AA 4JYFA 2E6DA 4NU7A 2OCZA 1TQXA 1YXDA 4JTSA 2UV8G 1BTMA 4HIBA 3NAVA 1KM5A 1XI3A 3LRMA 3LI1A 4ZMGA 2QJGA 2QJIA 3NQFA 4FXRA 3QPZA 4WQ6A 2B7NA 2C0AA 1SZEA 3W1AA 1QR7A 5HMSA 1RQBA 2B4GA 3SZ8A 3GIYA 1F6KA 1GG0A 2A85A 1ME8A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3MJYA

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