1U83A

Psl synthase from bacillus subtilis
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
249
structure length
225
Chain Sequence
DFSLELPVRTNKPRETGQSILIDNGYPLQFFKDAIAGASDYIDFVKFGWGTSLLTKDLEEKISTLKEHDITFFFGGTLFEKYVSQKKVNEFHRYCTYFGCEYIEISNGTLPMTNKEKAAYIADFSDEFLVLSEVGSKDQSSEEWLEYIVEDMEAGAEKVITEQIVDDIISSDIDINRLIFEAPNKTLQQGFIQKIGPNVNLANIPFHDAIALETLRLGLRSDTFF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Bacillus subtilis
publication title PSL synthase from Bacillus subtilis
rcsb
molecule keywords Phosphosulfolactate synthase
total genus 79
structure length 225
sequence length 249
ec nomenclature ec 4.4.1.19: Phosphosulfolactate synthase.
pdb deposition date 2004-08-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02679 ComA (2R)-phospho-3-sulfolactate synthase (ComA)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1u83A00
1R46A 3GDTA 3JR2A 4AHPA 4NU7A 4ZQNA 3RFAA 3QPYA 3KRUA 3C6CA 1H51A 2Y85A 1GJPA 4NNCA 1OG0A 2VFGA 5C6MA 3BPWA 3DFPA 3EKZA 2W0UA 1ZENA 6TIMA 1TTJA 4BF9A 2Y63A 2NWSA 3STEA 3MYOA 3SFKA 3CM4A 2BX7A 1TTPA 1AG1O 2FB3A 3PSWA 5FEZA 3S42A 4JTLA 4R34A 2GOUA 3CHVA 4IUOA 5DXYA 3M5XA 1SZFA 1PV8A 3LRMA 4GUGA 1ADOA 3P84A 4QSHA 3NR0A 1QMLA 5TIMA 3CB8A 3PG9A 1TIMA 4JTSA 5DY3A 1XUUA 1HL2A 1LYXA 1K7EA 4HT3A 3HOJA 2E09A 1T96A 4K6AA 1BWKA 4NJKA 2J27A 5AHNA 3EX2A 1FY6A 3GNNA 2YX0A 3FJ6A 3LRKA 2V8ZA 2E6FA 1K8XA 2Y7EA 3NPXA 5K7JA 5CSRA 4CCEA 3NEVA 2ZQ0A 4K8HA 5F4WA 3NQVA 3LCIA 3LCLA 4FNUA 2YPIA 2ABAA 4TMBA 1THFD 4W9TA 4JDYA 4ZMGA 2NX3A 1XDLA 2FFCA 3LCGA 1LP6A 1NEYA 4YCOA 4LNYA 4GC4A 1L6SA 4IMGA 1G4EA 4RKAA 1YPIA 3NL6A 2XN1A 1SO3A 2H8XA 5FF4A 3IEBA 4BK9A 4MLRA 4GRSA 3W75A 3TQVA 4NNBA 3LTPA 5D05A 1KM1A 2ZRXA 4WY0B 3BGGA 4UR7A 3HF3A 3PBUA 4LVGA 1FQ0A 4M7SA 3TJXA 5K9XA 1SW7A 4Y90A 3W7DA 5LHFA 3R89A 3LM7A 3O05A 2ZA1A 3P82A 4UFLA 4H4IA 4Q32A 1FWSA 4IPJA 3IVTA 4JTFA 4ZQMA 2JKAA 2Z2UA 5AOUA 3O1NA 5F2IA 3QW3A 4RLIA 2VC6A 1ZFJA 1OF8A 1DV7A 2C3ZA 1TJRA 3KVKA 1F6KA 2A4AA 2V9DA 2YDAA 2G97A 2CWNA 1EEPA 1X1ZA 2BWGA 1XL9A 4O19A 3NDOA 3UWYA 5J5RA 1RQHA 4O16A 2NX9A 1F05A 3W7PA 1X6UA 2V2DA 5FEWA 1X1OA 3GKFA 3PVFA 4JDBA 3HPXA 3QF0A 4JEQA 2VEIA 1X7FA 3L0NA 3L5LA 3Q37A 4FX8A 3S5ZA 1LTDA 2DZUA 5F4SA 4QIUA 4UXDA 2ZRYA 3TCEA 4NZFA 3W86A 2HTMA 3NL2A 1GYLA 2G5WA 2RDWA 4RX0A 4HHPA 1GEQA 3IGSA 3GAKA 3P61A 1GG1A 3W7KA 2ZRVA 3FOKA 4WOZA 3QFEA 2ATMA 4GUJA 4O10A 5IBXA 2H6RA 5F1UA 5MHBA 1TPUA 2RDUA 4AF0B 3NPWA 5AYXA 2WNQA 1S5TA 1YTEA 2OT1A 1KTNA 3W2NA 3S5OA 3UZJA 2GJNA 3NM3A 3PWAA 1L2UA 4D2JA 2QCNA 1VC4A 3LCHA 4C1KA 5BW6A 5EA9A 2WPBA 3GR8A 3MJYA 1EWEA 1DKWA 1RD5A 1YXDA 3LHVA 4ONVA 4UFHA 3W7EA 5D38A 3L21A 5K3VA 5G1YA 5BRBA 2VEMA 3CTLA 2PCQA 3A24A 4L4MA 1MEHA 2X2GA 1TV7A 5K9DA 3PUOA 3R2GA 3W76A 2WJZA 3C2OA 4ORMA 4M7TA 1I4NA 3CPRA 3LI1A 1OF6A 3WJZA 1G7UA 3TIMA 1H7RA 2QDGA 3G1AA 4Q4KA 2A7PA 5E93A 2QUVA 4XBKA 1UCWA 3U6WA 2FPTA 4A22A 5KITA 3NM1A 1JVNA 4LT9A 4O11A 1OX5A 1RVGA 4AMAA 4QITA 3G1FA 3TSMA 3LCXA 3W1PA 4FNRA 4H6KA 4MLJA 1B4KA 1YDVA 1SUXA 4MVAA 4FX7A 1L6WA 3EEGA 3L9CA 1PVNA 1JULA 4WD0A 1A5SA 3C2FA 3QYQA 3TU9A 3LHUA 4Z1BA 3G8RA 1FCQA 3G22A 3W1RA 4JXCA 4JX4A 1QPQA 3C3NA 3N34A 2BSLA 2FLIA 4BI7A 2E77A 2A6NA 3NVTA 1KTCA 5DBUA 5DXXA 2QUUA 2BXVA 2VFHA 4O1DA 4ZL1A 1H1ZA 3H55A 1KBJA 4M6VA 3GZ3A 2ISWA 4S1FA 4DPPA 4RZ5A 1M7OA 4KWWA 1H60A 2ZBTA 3B04A 5EY5A 3FKKA 3L65A 3IVSA 3HGJA 3W73A 3BVJA 1WV2A 1V5XA 3W1MA 5TQLA 2AQWA 4E38A 3M43A 2DJLA 4UNLA 1JJKA 1BWLA 1G4TA 3PB2A 1TQXA 1LROA 1WOAA 3G1VA 3MWAA 2DJXA 4TO8A 4L4LA 3TV8A 3W85A 1JUKA 4S2BA 3KVJA 5CZTA 3TJLA 3RNDA 2JKPA 1KM3A 5A8GA 1WQ5A 1UASA 3PSVA 3BW4A 3QQ1A 3F4WA 4JGDA 3N2XA 4IOTA 4MY9A 1SO5A 3N73A 4IX2A 3EXRA 5LNRA 1KM0A 3EWZA 2AGKA 4BR1A 3PR2A 3M47A 5KSWA 5D2TA 4O1CA 3EX1A 3F03K 3W2MA 4LV9A 3VKJA 1JCMP 1T8XA 2Z6JA 1RQBA 1D9EA 2VENA 1YADA 2XN0A 4UTIA 4KFNA 4NX0A 3WJXA 4ZQCA 4B5NA 3UWUA 3A9IA 1IXQA 5G2HA 3E02A 3VCRA 1SPQA 4LOCA 1HTIA 2CZEA 1DORA 1P4CA 4HIBA 3PUDA 3NOEA 3R5EA 3MHUA 1KV8A 2EKCA 2J9ZA 2P10A 2CLKA 2WNNA 1G67A 2ZZ6A 3KOFA 3W1AA 1H5YA 2NUWA 3SR7A 2VELA 1TMHA 2A6LA 3M6YA 1W5NA 3STGA 4A2RA 4UMAA 1TPWA 1GOXA 1W3TA 1H63A 5DCDA 4LRTA 3PS7A 1W5MA 4JTHA 1I2RA 3GAYA 3MW7A 1PS9A 5K2ZA 1W8SA 5AC8A 1ONRA 2PC4A 1GVOA 3TW6A 3PBWA 1QCWA 2R14A 1ME8A 5EMUA 1ZJIA 3DAQA 3N3MA 2VEKA 3GXPA 1VCVA 4LC8A 5HR6A 1WBJA 3G18A 3QJAA 4PEKA 4O14A 3HG4A 5LNWA 2BLEA 5I3GA 3RMJA 4UTTA 1OFOA 4JYFA 4OV9A 2PRMA 4RZ6A 3FA5A 4WY0A 1WDWA 4IMEA 3KHJA 3LBCA 3PBVA 3TROA 2GPTA 2QCEA 1JCJA 3UZ5A 3QW4B 3B0UX 5SWUA 3TXVA 3EWXA 4OE7A 3MI2A 2A7NA 2X30A 4JTJA 1OFBA 1ICPA 3NL5A 3N9RA 1DBTA 1OK4A 1O4UA 1TPDA 3E9AA 4OT7A 3L67A 2ZRUA 1VHNA 3HG3A 2WKJA 1OK6A 1X8FA 4GE8A 1ZHAA 3L68A 1FXQA 3LI0A 4HPXA 2YYTA 3W7MA 2YZRA 3L2IA 1NSJA 2B7PA 2C13A 3G0UA 1A50A 4E2DA 4MYXA 5CPOA 4K7VA 4M6QA 3CC1A 3G1XA 2C1HA 2WSYA 4ZQRA 1I2NA 3TDFA 3G1SA 5DLCA 3FKRA 1VH7A 1XBVA 2ZRZA 3EB2A 4GUIA 2Y6ZA 3STFA 1KV5A 1O94A 3UWQA 3TC7A 4A2SA 4YCPA 2A5HA 3LXAA 3W7CA 4HN4A 3W1NA 3MHFA 2QCHA 4UMCA 4Q33A 3ANYA 1SO6A 3T78A 3P67A 3Q58A 2OCZA 2YCEA 4UTWA 3SECA 3MP3A 1OFQA 4PL2A 4LUIA 2NX1A 1TPEA 4DF2A 3BV4A 3QPZA 3B0VC 3CEUA 3NYZA 3OVRA 1SZNA 2B7QA 1OFDA 2JKEA 2ZDRA 3GDRA 4QM1A 2ZZ3A 2C18A 3CIWA 4AF0A 5AFDA 1Q3NA 3SGUA 3TQKA 4I9AA 1XUZA 3U2OA 4IXXA 1GQNA 3YPIA 1W56A 3USBA 3W2UA 1R30A 3FYOA 2F7FA 4Y96A 4DXVA 3UQNA 1Z42A 2YW3A 3I7SA 1KM4A 3M16A 1H7PA 3W74A 2CLOA 1QR7A 2I1OA 3LLFA 3F4NA 4EWND 2H3BA 2HMCA 3ELFA 2E68A 4N4QA 4UFJA 4X22A 2E5BA 4TIMA 5D2YA 1F2JA 4IGHA 4DO5A 2QCDA 3ZFHA 4OV4A 3W7IA 4MPQA 3ABRA 1MSSA 3DH7A 4Z1CA 1RQEA 1TYGA 2CW6A 5I3IA 3HG2A 4I7UA 3B05A 5C2XA 1PHQA 3W88A 3NQDA 1EUNA 2X1RA 3LTYA 3RF9A 2QDHA 3W71A 2X16A 4N9CA 4PFMA 3W9ZA 5F4XA 3HPSA 4JY9A 3B4UA 3I65A 4HNNA 4R53A 5E1QA 1KFEA 4MZ8A 1FWNA 3QH2A 3L5AA 1VYPX 5LNUA 3OA3A 3O6CA 1UBSA 4FIRA 3GXTA 2VFEA 4QISA 3BK0A 3EXSA 1SO4A 1YDOA 1KM2A 2XFWA 5HWJA 1IXPA 2QCLA 1TV8A 1AK5A 3CWOX 4TMCA 3A5VA 4XTIA 2V5BA 1JQXA 2ABBA 3W2LA 1OJXA 2IQTA 2HS8A 3W2JA 3WFAA 4DF0A 2QJHA 3LDVA 4RK8A 1G6CA 3P62A 2ZZ2A 4XTDA 3DFQA 1GYNA 1GWJA 4QQ3A 4LU0A 3EWUA 2C6QA 4ORIA 4DELA 1TPFA 3P74A 5G5IA 2ZZ5A 4EIVA 4NXSA 1I8JA 1VRDA 1LOLA 4O15A 4ML9A 2TYSA 4CCDA 1BEUA 2DZTA 1M5WA 1W54A 4RXFA 3IIOA 3WK2A 1ICQA 3LX9A 4CQ9A 1Q6LA 5I3HA 2TRSA 3M5YA 1HO4A 1KFBA 3PAJA 4UNKA 4E0CA 5HINA 2CZDA 3QSRA 1J2WA 3LXCA 2CLLA 3PUEA 3M5VA 3OG3A 3IRDA 4EF9A 4MY1A 1GT8A 1DQWA 3L66A 4PCFA 3QQ0A 3NAVA 3IIPA 1RR2A 4U28A 1KFKA 3CQ0A 4XKYB 4ZQOA 2PE4A 3KRZA 1LOQA 4MJMA 3S6DA 4MZYA 1P1XA 4JYDA 4O1BA 4BFAA 5EBUA 3E12A 2FIQA 3U8GA 2CZFA 2FDSA 1ME9A 4JR5A 5C55A 4O4WA 2E1DA 5L9FA 3NGJA 4HSNA 3M9YA 4OWGA 3LRLA 4ZQPA 5C54A 3M44A 3INPA 1YYAA 3T55A 3DU0A 1NVMA 2GVGA 1QFEA 2GQ8A 5G2IA 1LRNA 4HKPA 1A5CA 3W84A 3QEZA 2R8WA 3DXIA 4YMZA 3C2EA 1GG0A 2G95A 1XXXA 5LGXA 5HUOA 1J5TA 4OBTA 4CQAA 3TFCA 2QCGA 3UY7A 1ZNNA 3T40A 3W7RA 3HPZA 1WA3A 2WNZA 2J9XA 1WYIA 4KFOA 4POCA 5DY2A 1TTIA 3LHYA 2J9YA 3KX6A 2Y61A 3UPBA 4P2VA 3IIZA 3L0GA 4AAJA 2HSAA 1H7WA 2Y7DA 2C0AA 5FEPA 5FF2A 4WXYA 3LCWA 4UFKA 1NFBA 1G69A 4LVAA 4H3DA 3W1LA 2GQ9A 3C2RA 5DCBA 3B06A 1OFRA 3LXBA 1RV8A 3SIZA 2V0TA 3WK1A 1F76A 4R7JA 4WZHA 3OEXA 1U5JA 1DQXA 1F73A 4QAIA 1OFEA 5IM51 1K03A 4DF1A 2RFGA 2VXNA 3FLUA 8TIMA 1I2OA 1K8ZA 4PH6A 3GIYA 4UFIA 3MP4A 4HSOA 3UY8A 1QAPA 5D37A 1C9DA 5I3JA 4QNEA 1OVDA 1XBYA 2EPHA 4NJGA 3MBFA 2CLHA 4RXGA 5FEXA 4TX9A 1TTQA 1V7YA 3R8RA 3NQ6A 2FPVA 3MHGA 3LV6A 3P60A 1IGSA 2NXHA 3OHIA 4YXGA 1EP1A 4OGZA 4MFEA 2UV8G 4WUIA 1A53A 2R91A 7TIMA 1TPVA 3KXQA 1NAL1 3S1XA 1A5AA 1K7XA 4KWVA 5LGZA 2Y7FA 4BI6A 1JUEA 5AC6A 1KW1A 1VQTA 4JD4A 4JTEA 3PBYA 1BTMA 4LRSA 1L9WA 3OIXA 1M7PA 2ZA2A 1S5VA 5LNVA 4Z0SA 4WXZA 4GXMA 1H7XA 2FTPA 3LHZA 2YGYA 2V81A 3HGSA 2O7QA 2VOMA 2E6AA 4Z1AA 3UXDA 1TSIA 4OU1A 4FIQA 2KZHA 4ZZ9A 3TX9A 3DHDA 2FQIA 3W7GA 1JCYA 1EP3A 3CU2A 3TQ0A 3EX6A 5EKYA 4M19A 5K4XA 5LSMA 2QCMA 4JICA 1EP2A 3DFOA 3FS2A 2FB2A 3SSJA 3LCFA 2ZTJA 4UTWC 1J4EA 2Q3OA 2V30A 4JNMA 1TQJA 3KVLA 4DBEA 1H7NA 4I7VA 3SZ8A 5I3KA 2JBMA 1ZALA 1LDCA 2CFFA 1N7KA 3TSDA 5G4WA 1QPNA 4O53A 1JUBA 2V82A 4FNQA 1LRQA 1R2TA 4JS3A 4O54A 2HS6A 3DBPA 1ALDA 2CU0A 3M7WA 3NZRA 1QO5A 3N9SA 3PB0A 1SW0A 4HPJA 5LZLA 2C19A 2PRHA 4JTGA 5LNSA 5HR7A 1AL7A 4BWLC 2J6XA 3C8FA 3TH6A 1VLIA 1MEWA 3CEPA 1LZOA 2NXGA 3C52A 3QM3A 2R94A 1OYCA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4NU7 A;  4ZQN A;  3RFA A;  4AD3 A;  3QPY A;  3UG8 A;  3C6C A;  2VFG A;  3U9I A;  2X7W A;  3KW3 A;  5C6M A;  3EKZ A;  2BY1 A;  1CZ1 A;  3CQH A;  3VFC A;  3HFY A;  2XSX A;  3AMD A;  1X7I A;  5AVN A;  4HU8 A;  1TVL A;  3CM4 A;  1PWL A;  2ZUV A;  5FEZ A;  5HME A;  4NIR A;  1IGW A;  1X39 A;  3AHY A;  3L4Y A;  1PWM A;  4H8U A;  3VGF A;  3M5X A;  4LYP A;  1MRQ A;  2GWN A;  1B3Z A;  1PV8 A;  1QML A;  3PG9 A;  1TIM A;  2YKK A;  4ZTY A;  1UD4 A;  1XUU A;  3ZVH B;  3UT0 A;  3H7R A;  4K6A A;  1BWK A;  2J27 A;  3RX4 A;  1EF2 A;  5CJM A;  4QE5 A;  5TAO A;  4YJ5 A;  2HK0 A;  1CDG A;  5CSR A;  5F4W A;  1VF8 A;  2EBN A;  4DJD C;  5KEZ A;  4X63 A;  5FJI A;  3MSG A;  3PZO A;  2BNJ A;  4W9T A;  1CXI A;  1MXD A;  3Q65 A;  4GY7 A;  3LCG A;  1Y5V A;  1L6S A;  2DV0 A;  3ZLG A;  4YYF A;  1YPI A;  2XN1 A;  1SO3 A;  1Q7M A;  1GQI A;  4FLR A;  4S3F A;  2D0H A;  2BP1 A;  2X42 A;  2FTY A;  3LTP A;  3AZS A;  2ZRX A;  3OOQ A;  1S3T C;  4WY0 B;  3G2G A;  1Q6C A;  2XIO A;  4MB1 A;  1FQ0 A;  3TJX A;  1TWS A;  2NQZ A;  1V0L A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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